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中国绒山羊遗传多样性现状和系统发生关系的微卫星分析

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生物多样性 2007年第5期15卷 470-478页

作者：狄冉何晓红韩建林关伟军浦亚斌赵倩君傅宝玲马月辉中国农业科学院―国际家畜研究所畜禽与牧草遗传资源联合实验室北京畜牧兽医研究所

为了调查中国绒山羊遗传资源现状,作者应用联合国粮农组织和国际家畜研究所推荐的19对微卫星引物并结合荧光PCR技术,对9个中国地方产绒山羊群体和1个西非山羊品种进行了遗传多样性检测。14个微卫星座位在10个山羊群体中显示为高度多态,... 详细信息

为了调查中国绒山羊遗传资源现状,作者应用联合国粮农组织和国际家畜研究所推荐的19对微卫星引物并结合荧光PCR技术,对9个中国地方产绒山羊群体和1个西非山羊品种进行了遗传多样性检测。14个微卫星座位在10个山羊群体中显示为高度多态,可作为山羊遗传多样性分析的有效标记。多态信息含量和遗传杂合度等数据表明:目前中国地方产绒山羊群体的遗传多样性较为丰富,并且大部分保种场较好地保存了这些地方资源。采用非加权配对算术平均法构建的聚类图和采用主成分分析法得到的散点图均显示,中国山羊与西非山羊为不同的2类;中国产绒山羊中河谷山羊、河西绒山羊与其他山羊的遗传距离较远;其他山羊又大致分为2类:一类由辽宁绒山羊、新疆山羊、柴达木山羊、陕北山羊组成,另一类由内蒙古绒山羊组成。此研究结果为开展我国地方绒山羊种质特性研究及资源保护和利用提供了科学依据。

关键词：绒山羊微卫星遗传多样性系统发生

利用微卫星DNA标记分析巴布亚新几内亚三个地方鸡群体的遗传多样性及亲缘关系

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畜牧兽医学报 2010年第7期41卷 797-803页

作者：曾盛诚 Gariba Danbaro William Nano Sammy Doka Tau Gerega Olivier Hanotte 韩建林中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193 中国农业科学院国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室北京100193 巴布亚新几内亚理工大学农学院国际家畜研究所肯尼亚内罗毕00100

为了解巴布亚新几内亚地方鸡群体的遗传多样性和亲缘关系,本研究利用20个微卫星DNA遗传标记,对3个群体、96个个体的基因型进行了测定,估算了群体内的杂合度和近交系数(FIS)以及群体间的遗传分化系数(FST)等多样性参数;根据Nei氏标准遗... 详细信息

为了解巴布亚新几内亚地方鸡群体的遗传多样性和亲缘关系,本研究利用20个微卫星DNA遗传标记,对3个群体、96个个体的基因型进行了测定,估算了群体内的杂合度和近交系数(FIS)以及群体间的遗传分化系数(FST)等多样性参数;根据Nei氏标准遗传距离,构建群体水平的NJ树和个体水平上的无根UPGMA树。结果表明,3个群体内的平均期望(基因)杂合度介于0.665 9至0.680 6,平均FIS介于0.020至0.286,总群体水平上的遗传变异仅占5.5%;3个群体相互之间的遗传分化均达到显著水平,在个体水平的无根UPGMA树上,来源同一群体的个体会优先聚为一类。这说明巴布亚新几内亚的3个地方鸡群体的遗传多样性比较丰富,群体间的遗传分化显著,应该分别加以保护和利用。

关键词：巴布亚新几内亚地方鸡微卫星遗传多样性

无特定病原体HBK-B和HBK-Q种鸭的遗传多样性分析

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中国家禽 2008年第18期30卷 23-26页

作者：肖兵兵韩凌霞于海波司昌德徐佳曲连东韩建林中国农业科学院哈尔滨兽医研究所实验动物中心黑龙江哈尔滨150001 中国农业科学院国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室北京100194

利用18个微卫星标记对国家实验禽类种子中心保存的HBK-B和HBK-Q两个封闭鸭群进行遗传分析。试验结果表明:两个群体中各有7个位点的多态信息含量(PIC)大于0.5,18个微卫星标记的平均PIC分别为0.474和0.480,呈中度多态;校正后的等位基因丰... 详细信息

利用18个微卫星标记对国家实验禽类种子中心保存的HBK-B和HBK-Q两个封闭鸭群进行遗传分析。试验结果表明:两个群体中各有7个位点的多态信息含量(PIC)大于0.5,18个微卫星标记的平均PIC分别为0.474和0.480,呈中度多态;校正后的等位基因丰富度分别为3.56和3.54,表明这两个群体的遗传多样性基本相同。等位基因频率差异的卡方检验和两个群体间的遗传分化系数FST值显著水平的检验均证明这两个群体间的遗传分化已经达到了极显著水平(P<0.01),趋于形成两个不同的品系,但在今后的选育过程中应该对已经存在的近交加以控制。

关键词：无特定病原体 HBK鸭微卫星多态性

利用微卫星DNA标记分析高原型细毛羊的种质特性

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中国农业科学 2009年第2期42卷 669-676页

作者：罗玉柱成述儒胡江 Olivier Hanotte 韩建林甘肃农业大学动物科技学院甘肃农业大学研究测试中心国际家畜研究所中国农业科学院国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室

【目的】利用微卫星DNA遗传标记,分析中国高原型细毛羊品种间的遗传差异,为评价其种质特征、开展品种保护和遗传改良提供依据。【方法】运用15个微卫星DNA标记,以甘肃高山细毛羊和青海细毛羊为研究对象,其它9个绵羊群体为对照,分析群体... 详细信息

【目的】利用微卫星DNA遗传标记,分析中国高原型细毛羊品种间的遗传差异,为评价其种质特征、开展品种保护和遗传改良提供依据。【方法】运用15个微卫星DNA标记,以甘肃高山细毛羊和青海细毛羊为研究对象,其它9个绵羊群体为对照,分析群体遗传结构、遗传分化和种质特性。【结果】系统发育分析、主成分分析和群体遗传结构推导均得出一致的结果:即所研究的11个群体可分为3类,其中青海细毛羊和甘肃高山细毛羊聚为一类,具有较近的主成分值,群体遗传结构也较相似。【结论】青海细毛羊和甘肃高山细毛羊具有相似的遗传背景,这与他们的育种历史等一致,表明微卫星DNA标记是研究动物种质特征的可靠遗传标记之一,在未来的品种资源保护和利用中,根据系统保种理论,可将青海细毛羊和甘肃高山细毛羊按一个细毛羊品种来对待。

关键词：微卫星DNA标记种质特性甘肃高山细毛羊青海细毛羊

羊肉产品中若干动物源性成分的七重PCR检测技术应用研究

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中国畜牧兽医 2010年第9期37卷 85-90页

作者：冯海永韩建林中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部家养动物遗传资源与种质创新重点开放实验室北京100193 中国农业科学院-国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

试验建立了猪、牛、绵羊、山羊、鸡、马和牦牛种属鉴别的七重PCR体系,分析了牛、牦牛、山羊源性成分七重PCR检测的灵敏度,检测了10种市售羊肉产品中的动物源性成分。结果表明,采用常规的琼脂糖凝胶电泳可以区分157～517 bp的片段及相互... 详细信息

试验建立了猪、牛、绵羊、山羊、鸡、马和牦牛种属鉴别的七重PCR体系,分析了牛、牦牛、山羊源性成分七重PCR检测的灵敏度,检测了10种市售羊肉产品中的动物源性成分。结果表明,采用常规的琼脂糖凝胶电泳可以区分157～517 bp的片段及相互差异在41 bp以上的多重PCR扩增产物,从而实现对这7个物种的快速及准确鉴别,其中对3个物种(牛、牦牛、山羊)DNA的检测灵敏度在2.5 ng左右;所检测的10种羊肉产品中有2种并不是包装上所宣称的羊肉,而是混杂有牛肉或完全用牛肉替代。

关键词：七重PCR 羊肉产品动物源性成分种属鉴别

利用不同方法从深加工牦牛肉产品中提取基因组DNA效果的比较

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生物技术通报 2010年第10期26卷 162-167页

作者：何建文韩建林罗玉柱甘肃农业大学动物科学与技术学院兰州730070 中国农业科学院国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

为了从深加工牦牛肉产品中获得片段较大、数量较多的基因组DNA,以用于分子追溯的检测,尝试并系统地比较了异硫氰酸胍法、酚-氯仿抽提法和试剂盒提取法的提取效果。通过定量分析、凝胶电泳和PCR片段大小梯度扩增等手段,对利用3种方法提... 详细信息

为了从深加工牦牛肉产品中获得片段较大、数量较多的基因组DNA,以用于分子追溯的检测,尝试并系统地比较了异硫氰酸胍法、酚-氯仿抽提法和试剂盒提取法的提取效果。通过定量分析、凝胶电泳和PCR片段大小梯度扩增等手段,对利用3种方法提取的基因组DNA的数量和质量进行了比较。结果显示,利用酚-氯仿抽提法提取的基因组DNA质量不佳,异硫氰酸胍法和试剂盒提取法的提取效果相当,PCR可以扩增出730 bp左右的核外基因细胞色素b,而核内基因只能扩增出300bp左右的核基因DNA片段(内乳铁蛋白基因,271 bp;BoLA-DRB3基因,302 bp)。综合考虑提取时间、费用、数量和质量等各方面的因素,认为异硫氰酸胍法操作简便、快速、廉价、有效,是较好的从动物深加工肉产品中提取基因组DNA的方法。

关键词：异硫氰酸胍法酚-氯仿抽提法试剂盒方法深加工牦牛肉产品基因组DNA

应用微卫星DNA标记对BWEL-SPF鸡种群的群体遗传学分析

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中国畜牧兽医 2010年第9期37卷 106-111页

作者：肖兵兵韩凌霞牛成明司昌德韩建林中国农业科学院哈尔滨兽医研究所实验动物中心兽医生物技术国家重点实验室哈尔滨150001 中国农业科学院-国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

本研究利用14个鸡微卫星DNA标记位点,采用DNA测序仪和荧光素标记分子内标,建立了鸡分子遗传学的检测方法,对F15世代BWEL-SPF鸡种群8个家系群体内和群体间的遗传结构进行了分析。结果表明,被检位点35.7%(5/14)的基因型趋于纯合,家系内等... 详细信息

本研究利用14个鸡微卫星DNA标记位点,采用DNA测序仪和荧光素标记分子内标,建立了鸡分子遗传学的检测方法,对F15世代BWEL-SPF鸡种群8个家系群体内和群体间的遗传结构进行了分析。结果表明,被检位点35.7%(5/14)的基因型趋于纯合,家系内等位基因的变异程度显著降低。F-统计量检验结果表明,家系间的遗传分化均达到了极显著水平(P遗传变异的12.9%。

关键词：微卫星DNA标记 SPF鸡遗传变异

鸡MHC区域内微卫星LEI0258和MCW0312的遗传多态性

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畜牧与兽医 2015年第7期47卷 50-55页

作者：金丽娜韩建林甘肃农业职业技术学院甘肃兰州730020 中国农业科学院国际家畜研究所畜禽及牧草遗传资源联合实验室北京100094

主要组织相容性复合体(MHC)因具有抗病毒作用而备受抗病育种研究者的关注,应用分子标记对MHC的基因型进行测定是研究其功能的基础。本研究通过对分布于西亚、南亚和东亚的12个鸡群体378个样本,对位于MHC区域内的2个微卫星标记LEI0258和M... 详细信息

主要组织相容性复合体(MHC)因具有抗病毒作用而备受抗病育种研究者的关注,应用分子标记对MHC的基因型进行测定是研究其功能的基础。本研究通过对分布于西亚、南亚和东亚的12个鸡群体378个样本,对位于MHC区域内的2个微卫星标记LEI0258和MCW0312的基因型测定结果显示,地方群体的遗传多样性大于商业培育品种。地方群体中,西、南亚群体的遗传变异程度高于中国西北和韩国群体(东亚),其中以孟加拉(BAN)的平均多态信息含量和杂合度最高,民勤(MQ)最低。LEI0258基因座测序分析发现了35个等位基因,其中新发现了13个等位基因,分别是217、225、259、271、273、283、285、318、331、406、432、469和537;同时发现,LEI0258的两翼序列存在3个In Dels和4个SNPs。

关键词：鸡 MHC 微卫星LEI0258 微卫星MCW0312 遗传多样性

鸡MHC-B区域内复合微卫星LEI0258位点等位基因的序列变异

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甘肃农业大学学报 2010年第4期45卷 16-21,41页

作者：万君兴罗玉柱韩建林甘肃农业大学动物科学技术学院甘肃兰州730070 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所国际家畜研究所畜禽牧草遗传资源联合实验室北京100193

在对15个样品鸡MHC-B区域内复合微卫星位点LEI0258的等位基因进行基因型分析的基础上,进一步开展了等位基因PCR产物的直接测序或克隆测序,并将获得的序列与GenBank中的18条同源序列作了比较.结果表明:LEI0258位点等位基因片段大小分别为... 详细信息

在对15个样品鸡MHC-B区域内复合微卫星位点LEI0258的等位基因进行基因型分析的基础上,进一步开展了等位基因PCR产物的直接测序或克隆测序,并将获得的序列与GenBank中的18条同源序列作了比较.结果表明:LEI0258位点等位基因片段大小分别为247bp、249bp、307bp、357bp、369bp、381bp、393bp或443bp的等位基因具有不同的DNA序列或结构;上、下游共有3个in/dels和7个SNPs;由12bp和13bp组成的重复单元中也存在一定的变异,其中,HRJ23中一个13bp的重复单元由标准的"CTATGTCTTCTTT"变为"CTATATCTTCTTT",HRJ5和JT01中各有一个12bp的重复单元由标准的"CTTTCCTTCTTT"变为"CTTC-CCTTCTTT",而HRJ5、HRJ15和P22中也各有一个12bp的重复单元由标准的"CTTTCCTTCTTT"变为"CTTTTCTTCTTT".

关键词：鸡 MHC 微卫星 LEI0258 序列