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西双版纳黄瓜Cs-Psy1基因的序列特征与表达分析

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植物遗传资源学报 2016年第6期17卷 1050-1057页

作者：卢萍王柬人李锡香宋江萍邱杨王海平张晓辉沈镝中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

西双版纳黄瓜是我国特有的果肉橙黄色的黄瓜变种资源,不同种质间的β-胡萝卜素含量差异明显。PSY是胡萝卜素生物合成途径中的第1个限速酶。本文以西双版纳黄瓜为试材,分别克隆西双版纳黄瓜八氢番茄红素合成酶(Cs-PSY1)的DNA和c DNA序列... 详细信息

西双版纳黄瓜是我国特有的果肉橙黄色的黄瓜变种资源,不同种质间的β-胡萝卜素含量差异明显。PSY是胡萝卜素生物合成途径中的第1个限速酶。本文以西双版纳黄瓜为试材,分别克隆西双版纳黄瓜八氢番茄红素合成酶(Cs-PSY1)的DNA和c DNA序列,结果显示,DNA长2797 bp,包含5个内含子和6个外显子,c DNA序列长1385 bp,编码421个氨基酸。Psy1推测的氨基酸序列包含该家族的2个特征序列,保守性很高。该蛋白为不稳定蛋白,无明显疏水区,未预测到跨膜结构;系统进化分析结果显示,西双版纳黄瓜的Cs-PSY1蛋白与甜瓜的同源性较高;与栽培黄瓜深度测序材料"9930"和"GY14"的序列进行比较分析,结合115份黄瓜重测序结果,共发现5个SNP,其中2个位于起始密码子上游27 bp处和971 bp处,3个位于内含子区域。其中SNP4在重测序的19份西双版纳黄瓜中的突变率为100%,在96份栽培黄瓜中的特异性为5.3%。转录因子结合位点预测结果显示,在普通栽培黄瓜该位点处存在一个CTAG motif,在西双版纳黄瓜中该位点突变后则不存在该motif。利用实时荧光定量PCR技术分析Cs-Psy1的表达量变化趋势,结果表明,在黄瓜不同果实发育时期,该基因的表达量均呈现先上升后下降的趋势,在西双版纳黄瓜中表达量变化的差异明显,在授粉后50 d达到最大值,是果实发育初期表达量的8倍多,是同时期普通黄瓜的4倍多,而普通黄瓜表达量的总体变化相对平缓。西双版纳黄瓜果实内果皮的表达水平明显高于中果皮,最高相差约5倍,普通黄瓜差异不明显。从上述研究结果推测Psy1基因可能影响西双版纳黄瓜的β-胡萝卜素积累。

关键词：西双版纳黄瓜八氢番茄红素合成酶克隆实时荧光定量PCR 表达

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拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用

园艺学报 2011年第3期38卷 549-555页

作者：张扬勇方智远王庆彪刘玉梅杨丽梅庄木孙培田中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

根据拟南芥的叶绿体全基因组序列,搜索获得89个叶绿体基因组SSRs(cpSSRs),平均每1.736kb出现1个SSR。针对这些SSR设计cpSSR引物58对,其中32对能在甘蓝上应用。5对引物在甘蓝C300、C322和波里马油菜N478、N479间有多态性,这些片段均位于... 详细信息

根据拟南芥的叶绿体全基因组序列,搜索获得89个叶绿体基因组SSRs(cpSSRs),平均每1.736kb出现1个SSR。针对这些SSR设计cpSSR引物58对,其中32对能在甘蓝上应用。5对引物在甘蓝C300、C322和波里马油菜N478、N479间有多态性,这些片段均位于基因内含子区或基因间隔区。测序结果显示单核苷酸A/T重复数从8个到13个不等。同源性比较表明C300、N479之间的同源性大于两者与拟南芥之间的同源性。

关键词：甘蓝叶绿体SSR 波里马油菜多态性

氟唑活化酯诱导大白菜抗根肿病效果与机理初步研究

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园艺学报 2015年第4期42卷 697-705页

作者：韩之琪谢学文晋知文宋加伟柴阿丽石延霞李宝聚中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

为明确新型植物诱导抗病剂氟唑活化酯对大白菜根肿病的诱导抗病效果及抗病机理,研究了氟唑活化酯的诱导浓度、在白菜根部的运输过程以及氟唑活化酯诱导白菜后相关防御基因的表达情况。结果显示以氟唑活化酯25 mg·L-1对大白菜进行叶面... 详细信息

为明确新型植物诱导抗病剂氟唑活化酯对大白菜根肿病的诱导抗病效果及抗病机理,研究了氟唑活化酯的诱导浓度、在白菜根部的运输过程以及氟唑活化酯诱导白菜后相关防御基因的表达情况。结果显示以氟唑活化酯25 mg·L-1对大白菜进行叶面喷雾诱导时根肿病的病情指数最低。通过台盼蓝(Trypan blue)染色观察到氟唑活化酯诱导大白菜叶片后,根部对根肿菌也产生了一定的抗性。利用Real-time PCR技术检测大白菜防御相关基因的表达,发现氟唑活化酯诱导大白菜2 h后JA途径中的COI1和LOX2基因以及SA途径中的PR-1基因都有显著的过量表达,其中JA信号途径相关基因表达变化更明显。结果说明氟唑活化酯可以诱导大白菜产生系统获得抗性,两种信号传导途径都参与了抗病过程,但以JA途径为主,SA途径为辅。

关键词：大白菜氟唑活化酯根肿病诱导抗性

有效破解粮食安全问题的新思路:着力发展牧草产业

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中国农村经济 2015年第12期 63-74页

作者：王明利中国农业科学院农业经济与发展研究所

2003～2014年,中国粮食生产实现了"十一连增"。与此同时,中国农业也面临着诸如水土资源短缺、产品质量安全问题突出、生态环境压力加大、生产效率仍然不高等突出制约。传统解决粮食安全问题的思路必须更新,必须从一个全新的、更广的角... 详细信息

2003～2014年,中国粮食生产实现了"十一连增"。与此同时,中国农业也面临着诸如水土资源短缺、产品质量安全问题突出、生态环境压力加大、生产效率仍然不高等突出制约。传统解决粮食安全问题的思路必须更新,必须从一个全新的、更广的角度重新思考解决粮食安全问题之策。本丈提出,应从整个食物系统来重新定位粮食安全,当前中国粮食安全问题本质上是饲料粮的安全问题,说到底是畜产品的充足供应和质量安全问题。中国农业结构基本上每隔20年左右调整一次,从上世纪50年代中期到改革开放前是"以粮为纲"的单一结构,从1978年到1992年期间是"粮+经"的二元种植结构,从1992年到目前阶段是"粮+经+饲"的三元种植结构。目前中国农业结构又进入了一个新的调整"窗口期"。当前的"粮+经+饲"种植结构中,饲料作物种植面积占比实际上已达20%以上,但牧草种植面积占比一直徘徊在1%左右,牧草产业发展长期停滞不前。必须将牧草产业引入农业生产系统中,推进实施"粮+经+饲+草"的四元种植结构,从而达到直接或间接增加粮食产量,直接或间接降低对粮食的消耗,最终实现多元途径解决粮食安全问题的目标。

关键词：牧草产业粮食安全食物安全种植结构

基于作物模型与叶面积指数遥感影像同化的区域单产估测研究

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农业工程学报 2007年第9期23卷 130-136页

作者：杨鹏吴文斌周清波陈仲新查燕唐华俊柴崎亮介农业部资源遥感与数字农业重点开放实验室北京100081 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所北京100081 日本东京大学空间情报科学研究中心

通过对作物光合、呼吸、蒸腾、营养等一系列生理生化过程的定量模拟,作物生长模型已经被成功应用于田间尺度的作物单产研究。为了进一步将作物模型扩展应用于区域尺度,提高区域作物单产的模拟精度,该文探讨了将作物模型与多时相叶面积指... 详细信息

通过对作物光合、呼吸、蒸腾、营养等一系列生理生化过程的定量模拟,作物生长模型已经被成功应用于田间尺度的作物单产研究。为了进一步将作物模型扩展应用于区域尺度,提高区域作物单产的模拟精度,该文探讨了将作物模型与多时相叶面积指数(LAI)遥感影像同化以改善区域单产估测的方法。研究首先通过地理信息系统将美国农业部开发的"考虑气候的作物环境决策模型"——EPIC模型,扩展为空间模型。然后,通过基于Landsat TM影像差值植被指数DVI与田间观测叶面积指数构建的最优回归模型,反演了研究区域的多时相叶面积指数影像。最后通过优化算法实现了空间EPIC模型与影像信息的同化,并将系统应用于河北石家庄地区2004年冬小麦的单产估测。结果表明,通过数据同化校正部分关键参数后的空间作物模型的单产模拟精度得到有效提高,但要达到业务运行精度仍有待进一步改善。

关键词：遥感估产作物生长模型数据同化冬小麦叶面积指数植被指数

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黄瓜发芽期耐热性评价及全基因组关联分析

植物遗传资源学报 2019年第2期20卷 335-346页

作者：张松苗晗宋子超薄凯亮王烨顾兴芳张圣平中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

高温会降低作物种子活力,减慢或完全抑制发芽,是制约黄瓜生产的重要非生物胁迫之一。本研究以96份黄瓜核心种质为试材,在42℃下进行发芽试验,利用相对发芽率、相对发芽势、相对发芽指数和相对胚根长度计算出的综合评价值,对核心种质发... 详细信息

高温会降低作物种子活力,减慢或完全抑制发芽,是制约黄瓜生产的重要非生物胁迫之一。本研究以96份黄瓜核心种质为试材,在42℃下进行发芽试验,利用相对发芽率、相对发芽势、相对发芽指数和相对胚根长度计算出的综合评价值,对核心种质发芽期耐热性进行鉴定评价;并利用重测序数据,对核心种质发芽期的耐热性进行全基因组关联分析。通过鉴定,筛选出了2份耐热性极强的材料CG109和CG110,综合评价值均大于0.9。通过全基因组关联分析,检测到5个与相对发芽率关联的位点,分别是GGP4.1、GGP4.2、GGP5.1、GGP5.2和GGR6.1;2个与相对发芽势关联的位点,分别是GGV4.1和GGV5.1;2个与相对发芽指数关联的位点,分别是GGI4.1和GGI5.1;2个与相对胚根长度关联的位点,分别是GRL6.1和GRL7.1。在以上位点中,GGI4.1、GGV4.1和GGP4.1均位于Chr.4的同一区间;GGI5.1、GGV5.1和GGP5.2均位于Chr.5的同一区间。这2个区段的关联位点利用相对发芽率、相对发芽指数和相对发芽势3个指标均可检测到,由此推测该区域存在与发芽期耐热性相关的基因。

关键词：黄瓜核心种质发芽期耐热性 GWAS

山东高密地区马铃薯疮痂病菌种类及致病性鉴定

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华北农学报 2020年第S1期35卷 347-354页

作者：陈利达李磊谢学文石延霞柴阿丽李宝聚中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

为明确山东省高密地区马铃薯疮痂病的病原菌种类及其特征,2018-2019年从山东省高密市马铃薯主产区采集具有疮痂病病斑的马铃薯块茎,从病斑上共分离纯化到178个链霉菌菌株;采用薯片法、萝卜幼苗法及温室盆栽柯赫氏法则对马铃薯进行致病... 详细信息

为明确山东省高密地区马铃薯疮痂病的病原菌种类及其特征,2018-2019年从山东省高密市马铃薯主产区采集具有疮痂病病斑的马铃薯块茎,从病斑上共分离纯化到178个链霉菌菌株;采用薯片法、萝卜幼苗法及温室盆栽柯赫氏法则对马铃薯进行致病性试验,筛选到178个致病性较强的菌株。此外,将高密市5个地区所分离的马铃薯疮痂病菌株进行形态学鉴定、PCR分子鉴定和病原菌致病基因检测,之后根据16S rDNA基因的差异采用分子手段对所分离的致病菌株进行种类鉴定并构建系统发育树。结果显示:引起山东高密地区马铃薯疮痂病的病原菌主要包括4种链霉菌,分别为Streptomyces acidiscabies、Streptomyces scabies、Streptomyces luridiscabiei和Streptomyces griseoaurantiacus,与聚类分析结果相一致。其中Streptomyces acidiscabies为链霉菌优势种群且新菌株鉴定为Streptomyces griseoaurantiacus,为国内新报道病原菌,说明我国山东高密地区马铃薯疮痂病病原菌种类和分布较为复杂。

关键词：马铃薯疮痂病链霉菌分类致病性分析多样性

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实施地理标志保护促进中国东北大豆产业发展

中国农村经济 2006年第12期 25-31页

作者：王志本中国农业科学院农业经济与发展研究所

实施地理标志保护是中国加入WTO后发掘农产品比较优势的新机遇。东北地区是中国主要的大豆生产区,东北大豆是中国重要的出口贸易产品,东北大豆具有地理标志保护的内涵,实施“东北大豆”地理标志保护将对中国东北大豆产业发展产生积极的... 详细信息

实施地理标志保护是中国加入WTO后发掘农产品比较优势的新机遇。东北地区是中国主要的大豆生产区,东北大豆是中国重要的出口贸易产品,东北大豆具有地理标志保护的内涵,实施“东北大豆”地理标志保护将对中国东北大豆产业发展产生积极的支持和推进作用。

关键词：大豆 (中国)东北原产地地理标志非转基因作物

青花菜与甘蓝近缘野生种‘B2013’杂交后代对根肿病抗性的遗传分析

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园艺学报 2014年第11期41卷 2225-2230页

作者：张小丽李占省方智远李宝聚柴阿丽孙继峰杨丽梅庄木张扬勇张黎黎樊艳燕孙培田刘玉梅中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京100081

以高感根肿病的青花菜自交系‘93219’和高抗根肿病的甘蓝近缘野生种(Brassica macrocarpa Guss.)自交系‘B2013’为亲本配制的6个联合世代(P1、P2、F1、BC1、BC2和F2)群体为试材,采用主基因+多基因混合遗传模型对根肿病抗性进行了遗传... 详细信息

以高感根肿病的青花菜自交系‘93219’和高抗根肿病的甘蓝近缘野生种(Brassica macrocarpa Guss.)自交系‘B2013’为亲本配制的6个联合世代(P1、P2、F1、BC1、BC2和F2)群体为试材,采用主基因+多基因混合遗传模型对根肿病抗性进行了遗传分析。结果表明:青花菜×甘蓝近缘野生种‘B2013’后代对根肿病抗性的最适遗传模型为B-1模型,即由两对加性―显性―上位性主基因控制。BC1、BC2和F2世代主基因遗传率分别为81.22%、78.36%和80.00%,遗传变异平均值占表型变异的79.86%,环境变异平均值占表型变异的20.14%,表明抗病性以主基因遗传为主,同时受环境影响较大,应在早期世代进行选择,BC1、F2世代主基因选择效率较高。

关键词：青花菜甘蓝近缘野生种根肿病抗性主基因遗传分析