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宫颈癌生物标志物鉴定及其生物信息学

中国老年学杂志 2024年第18期 4368-4374页

作者：张诗蒙谭志容孙宇飞栗俊杰徐晓庄严深圳市前海蛇口自贸区医院中心实验室

目的使用多个在线数据库，用生物信息学方法筛选宫颈癌中的关键基因，并分析这些关键基因在宫颈癌中的作用及临床应用。方法用4个微阵列数据（GSE9750、GSE52903、GSE63514、GSE67522）得到共同差异表达基因，使用Cytoscape3.9.1得到... 详细信息

目的使用多个在线数据库，用生物信息学方法筛选宫颈癌中的关键基因，并分析这些关键基因在宫颈癌中的作用及临床应用。方法用4个微阵列数据（GSE9750、GSE52903、GSE63514、GSE67522）得到共同差异表达基因，使用Cytoscape3.9.1得到关键子模块，进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析，使用Cytoscape3.9.1得到5个关键基因，并用基于基因表达水平值的交互式分析平台（GEPIA）对关键基因表达进行验证及分析在宫颈癌分期中的作用，用实体瘤生物标志物探索数据库（BEST）对关键基因进行生存分析，用肿瘤免疫评估资源（TIMER）对关键基因进行免疫浸润分析。结果得到5个关键基因：细胞周期蛋白（CCN）A2、细胞分裂周期蛋白（CDC）45、细胞周期蛋白依赖性激酶（CDK）1、核酸外切酶（EXO）1、DNA拓扑异构酶Ⅱα（TOP2A）,GO和KEGG富集分析表明，这些关键子模块中共同表达基因主要涉及细胞周期、DNA复制、细胞分裂等方面。这5个基因在宫颈癌中表达显著上调（P<0.05）,其中，CCNA2对宫颈癌Ⅳ期具有提示作用。生存分析结果显示，CDC45与宫颈癌预后总生存率有关，CCNA2与无复发生存期较短有关（P<0.05）。免疫浸润分析结果显示，CCNA2表达与CD8+T细胞、CD4+T细胞浸润呈正相关，与NK细胞浸润呈负相关；CDK1、TOP2A与NK细胞浸润呈负相关（P<0.05）。结论 CCNA2、CDC45、CDK1、EXO1、TOP2A可能是一种潜在的与宫颈癌症预后相关的生物标志物。

关键词：宫颈癌生物标志物生物信息学

运用微流控技术分析虫草素对剪切诱导血小板聚集和活化的抑制效果

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中国药学杂志 2024年第6期59卷 541-548页

作者：高雪梅张天聪黄小静宦宣容李远重庆医科大学附属永川医院中心实验室重庆402160

目的分析虫草素对不同非生理性剪切率诱导的血小板聚集和活化的抑制效果。方法采用软光刻工艺加工聚二甲基硅氧烷-玻璃微通道芯片。收集健康志愿者枸橼酸钠抗凝全血,用钙黄绿素对血小板进行染色标记,并以虫草素体外孵育后,分别以14.7... 详细信息

目的分析虫草素对不同非生理性剪切率诱导的血小板聚集和活化的抑制效果。方法采用软光刻工艺加工聚二甲基硅氧烷-玻璃微通道芯片。收集健康志愿者枸橼酸钠抗凝全血,用钙黄绿素对血小板进行染色标记,并以虫草素体外孵育后,分别以14.7和50μL·min^(-1)流过带有0.5 mm长的80%狭窄的通道150 s,同时用荧光显微镜实时拍摄血小板在微通道表面的黏附聚集图像;用Image J分析荧光图片,以血小板表面覆盖率作为血小板聚集的量化指标。流式细胞术分析虫草素对血小板钙离子动员,单核细胞-血小板聚集体的抑制效果,并通过凝血检测和溶血实验对虫草素出血风险以及血液相容性做评估。结果虫草素可抑制剪切诱导的血小板聚集。在14.7和50μL·min^(-1)条件下,血小板聚集均可被虫草素抑制。虫草素抑制血小板钙离子动员和单核细胞-血小板聚集具有剪切力相关性,并且对外源性凝血途径和内源性凝血途径无影响,具有良好血液相容性。结论虫草素可有效抑制剪切率诱导的血小板聚集,是一种有潜力的抗血小板药物。

关键词：血小板聚集微流控技术壁剪切率虫草素

IS91的遗传特点及其与细菌耐药关系的研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第8期44卷 727-733页

作者：熊在坤陈如才赵彩冰王鹏飞昆明医科大学第二附属医院中心实验室昆明650101

细菌抗生素耐药已成为当今世界面临的严峻问题,携带耐药基因的可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)在同种或不同种细菌之间的快速传播加速了耐药性的形成,这给临床治疗细菌感染带来了巨大挑战。插入序列(insertion sequence,... 详细信息

细菌抗生素耐药已成为当今世界面临的严峻问题,携带耐药基因的可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)在同种或不同种细菌之间的快速传播加速了耐药性的形成,这给临床治疗细菌感染带来了巨大挑战。插入序列(insertion sequence,IS)是最简单的MGE,其编码一个转座酶基因且它的两侧存在反向末端重复序列。IS91家族是目前已知的26种插入序列家族成员之一,其名下现有34名家族成员。近期研究表明,IS91家族的许多成员与抗生素耐药性密切相关,因此本文将从IS91家族的发现、遗传特征、IS91与插入序列共同区(ISCR)的异同以及其与耐药和毒力基因传播的关系等方面展开综述,以期为未来细菌耐药性研究提供参考。

关键词：细菌耐药插入元件 IS91家族插入序列共同区(ISCR)

45,X/46,X,idic(Y)(q11.2)嵌合体1例胎儿的遗传学分析

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中华医学遗传学杂志 2024年第8期41卷 897-902页

作者：潘飞燕张蔚卿章卫国台州医院中心实验室临海317000 台州医院妇产科临海317000

目的探讨1例胎龄25^(+)周无创产前筛查(NIPT)提示为性染色体可能异常的胎儿的遗传学特征。方法选取2023年1月6日就诊于台州医院不孕与优生门诊的1例无创产前检测结果异常的胎儿作为研究对象,回顾性分析相关临床资料。应用NIPT、染色体... 详细信息

目的探讨1例胎龄25^(+)周无创产前筛查(NIPT)提示为性染色体可能异常的胎儿的遗传学特征。方法选取2023年1月6日就诊于台州医院不孕与优生门诊的1例无创产前检测结果异常的胎儿作为研究对象,回顾性分析相关临床资料。应用NIPT、染色体核型分析、染色体拷贝数变异测序(CNV-seq)、荧光原位杂交(FISH)和多重PCR检测对胎儿进行遗传学分析。结果孕妇孕30^(+)周的NIPT检测为X染色体单体,胎儿G显带染色体核型为45,X[59]/46,X,del(Y)(q11.2)[17],CNV-seq提示Y染色体q11.222q12区存在7.98 Mb的拷贝数缺失,p11.31q11.221区存在16.92 Mb的嵌合性拷贝数缺失,FISH提示胎儿为嵌合体型性染色体异常,且含有2个SRY基因,多重PCR检测显示AZF b+c区完全缺失,C显带显示Y染色体两端均可见一深染致密着丝粒。胎儿的染色体核型最终被确定为45,X/46,X,idic(Y)(q11.2)嵌合体。胎盘组织CNV-seq结果与NIPT一致,胎儿组织CNV-seq结果证实为45,X/46,XY嵌合体。夫妻双方外周血CNV-seq检测未见明显异常。结论联合NIPT、染色体核型分析、CNV-seq、FISH和多重PCR检测技术诊断该胎儿核型为45,X/46,X,idic(Y)(q11.2)嵌合体伴AZF b+c区缺失,为该孕妇夫妇提供了产前诊断依据。

关键词：产前诊断 45,X/46,XY嵌合体 AZF区微缺失 SRY基因

Xq22.1q22.3杂合性缺失一个家系的X染色体失活分析及产前诊断

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中华医学遗传学杂志 2024年第3期41卷 326-330页

作者：陈雪君章卫国台州医院生殖中心台州317000 台州医院中心实验室台州317000

目的分析1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系中女性X染色体失活(XCI)偏倚及逃逸情况与表型的相关性。方法回顾性分析2021年11月10日于台州医院确诊的1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系的临床资料。对该家系胎儿羊水以及孕妇夫妇的外周血样进行G... 详细信息

目的分析1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系中女性X染色体失活(XCI)偏倚及逃逸情况与表型的相关性。方法回顾性分析2021年11月10日于台州医院确诊的1个Xq22.1q22.3杂合性缺失家系的临床资料。对该家系胎儿羊水以及孕妇夫妇的外周血样进行G显带染色体分析和拷贝数变异测序(CNV-seq),结合甲基化敏感性限制性核酸内切酶HpaⅡ消化前后PCR扩增雄性激素受体基因第1外显子CAG重复序列多态性的方法检测XCI。结果孕妇与胎儿的G显带核型均为46,X,del(X)(q22),CNV-seq检测结果均为seq[hg19]del(X)(q22.1q22.3)chrX:g.100460000_105740000del,提示X染色体q22.1q22区存在5.28 Mb的拷贝数缺失,孕妇丈夫未见明显异常。XCI分析提示孕妇与胎儿的X染色体的活性比均为0∶100,携带Xq22.1q22.3缺失的X染色体完全失活,胎儿的失活染色体源自母亲。结论胎儿携带母源性失活的X染色体del(X)(q22),携带者的表型与异常的X染色体活性密切相关。通过家系XCI分析结合孕妇临床表型有助于预测Xq22.1q22.3杂合性缺失家系女性胎儿的临床表型及预后,为遗传咨询提供依据。

关键词：产前诊断 Xq22.1q22.3杂合性缺失 X染色体失活基因型临床表型

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黄唇鱼迟缓爱德华氏菌分离鉴定及药敏分析

南方水产科学 2024年第2期20卷 140-149页

作者：李敏叶毅飞李永福谢海燕李鸿超李春枝李希国李本旺陈灼均莫介化卢伟华朱燕秋张险朋东莞市动物疫病预防控制中心广东东莞523086 东莞市人兽共患病重点实验室广东东莞523086

2023年入夏以来,东莞市黄唇鱼(Bahaba taipingensis)自然保护区救护基地出现黄唇鱼发病和死亡病例,症状主要为食欲下降,体表发红、充血,眼球突出,角膜白浊溃烂,吻部溃烂;解剖后发现腹腔有大量腹水,肝肿大呈褐色。为确定其病因,针对性制... 详细信息

2023年入夏以来,东莞市黄唇鱼(Bahaba taipingensis)自然保护区救护基地出现黄唇鱼发病和死亡病例,症状主要为食欲下降,体表发红、充血,眼球突出,角膜白浊溃烂,吻部溃烂;解剖后发现腹腔有大量腹水,肝肿大呈褐色。为确定其病因,针对性制定防治措施,采集死亡病鱼的心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肠、鳃丝等组织样品。从病死鱼体内分离到一株优势菌株,命名为DG230920,通过对菌株的形态特征、生理生化特性和16S rRNA基因序列综合分析,鉴定该菌为迟缓爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)。病理组织学检测结果显示,心脏、肝脏、脾脏、肾脏和鳃均有明显的炎症反应,肠出血、黏膜上皮细胞脱落,脾淋巴细胞稀疏、内皮细胞变性坏死,肾小管变性坏死,鳃见鳃丝脱落、出血。对分离菌株进行药敏分析,结果为对环丙沙星、左氧氟沙星高度敏感,最低抑菌质量浓度仅≤0.25 mg·mL^(-1);其次是厄他培南,最低抑菌质量浓度≤0.5 mg·mL^(-1)。结果表明,黄唇鱼发病原因可能是迟缓爱德华氏菌感染,分离菌株遗传序列稳定,对临床使用的抗菌药物均为敏感。研究提示,应加强黄唇鱼迟缓爱德华氏菌感染的防治,选用敏感药物科学治疗。

关键词：黄唇鱼迟缓爱德华氏菌细菌分离鉴定病理组织切片药物敏感分析

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伴t(10;11)(q22;q23)急性髓系白血病1例并文献复习

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白血病．淋巴瘤 2024年第4期33卷 242-244页

作者：费霞张凌逸江云伟王法春陈巧云江苏大学附属人民医院中心实验室镇江212002

目的提高对伴t(10;11)(q22;q23)急性髓系白血病(AML)的认识。方法回顾性分析江苏大学附属人民医院2022年7月收治的1例伴t(10;11)(q22;q23)AML患者的临床资料及诊治经过,并复习相关文献。结果患者,女性,53岁。患者外周血全血细胞减少,骨... 详细信息

目的提高对伴t(10;11)(q22;q23)急性髓系白血病(AML)的认识。方法回顾性分析江苏大学附属人民医院2022年7月收治的1例伴t(10;11)(q22;q23)AML患者的临床资料及诊治经过,并复习相关文献。结果患者,女性,53岁。患者外周血全血细胞减少,骨髓以原始粒细胞为主,易见Auer小体。细胞遗传学常规分析发现46,XX,t(10;11)(q22;q23)[16]/46,XX[4],荧光原位杂交显示MLL基因重排。结论t(10;11)(q22;q23)异常发生率非常低,多见于AML,易合并存在其他染色体异常,伴有这种细胞遗传学异常的AML可能预后不良。

关键词：白血病,髓样,急性 t(10,11)(q22,q23) 基因重排

β-葡聚糖对不同诱导来源的小鼠骨髓树突状细胞生物学功能的影响

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 225-233页

作者：段雪含郝永哲丁骏戚春建南京医科大学附属常州市第二人民医院中心实验室常州213164

目的研究在不同诱导条件下β-葡聚糖对小鼠骨髓树突状细胞(bone marrow-derived dendritic cells, BMDCs)活化和功能的影响。方法取小鼠胫骨和腓骨的骨髓在体外分别用FMS样酪氨酸激酶3配体(FMS-like tyrosine kinase 3 ligand, Flt-3L)... 详细信息

目的研究在不同诱导条件下β-葡聚糖对小鼠骨髓树突状细胞(bone marrow-derived dendritic cells, BMDCs)活化和功能的影响。方法取小鼠胫骨和腓骨的骨髓在体外分别用FMS样酪氨酸激酶3配体(FMS-like tyrosine kinase 3 ligand, Flt-3L)、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, GM-CSF)和IL-4诱导成FL-DCs、GM-DCs, 经全葡聚糖颗粒(whole glucan particles, WGP)刺激后, 流式细胞术分析FL-DCs和GM-DCs表面分子CD40、CD80、MHCⅠ、MHCⅡ、CD8α、CD11b的表达;ELISA检测细胞上清液中IL-12p40、TNF-α、IL-6、IL-10的含量;实时荧光定量PCR检测各细胞因子及趋化因子受体的mRNA水平;OT-Ⅰ、OT-Ⅱ小鼠经磁珠分选试剂盒分选出CD8+、CD4+T细胞, 加入特异性抗原卵清蛋白(ovalbumin, OVA)与FL-DCs、GM-DCs共培养, 流式细胞术检测T细胞的增殖分化情况。结果经WGP刺激后, FL-DCs和GM-DCs中CD40、CD80、MHCⅠ、MHCⅡ、CD8α的表达均显著上调(P<0.05);细胞因子IL-12p40、TNF-α的分泌显著增多(P<0.05), 而IL-6、IL-10含量在FL-DCs、GM-DCs间存在差异;实时荧光定量PCR结果显示, WGP促进GM-DCs中趋化因子受体CXCR5和CCR7的表达(P<0.001和P<0.01), FL-DCs中CCR7的改变更为显著(P<0.000 1);在两种不同的培养方式中, WGP均能促进CD4+T细胞产生更多的IFN-γ和IL-17α(P<0.05)。结论 WGP可诱导BMDCs的成熟, 提高BMDCs对效应T细胞的活化能力, 且可促使不同诱导来源的BMDCs向不同的Th细胞分化。

关键词： β-葡聚糖树突状细胞免疫功能

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实用医学杂志 2024年第20期 2867-2873页

作者：盖林林孙维策褚锦锦徐栋花潍坊市人民医院中心实验室潍坊市中医院血管外科

目的探讨活动性肺结核患者外周血中单核-巨噬细胞M1/M2极化的变化及结核分枝杆菌ESAT6对人源THP-1细胞极化的影响。方法收集14例活动性肺结核（活动性肺结核组）和10例健康人（健康对照组）肝素钠抗凝全血和血清，采用淋巴细胞液分离... 详细信息

目的探讨活动性肺结核患者外周血中单核-巨噬细胞M1/M2极化的变化及结核分枝杆菌ESAT6对人源THP-1细胞极化的影响。方法收集14例活动性肺结核（活动性肺结核组）和10例健康人（健康对照组）肝素钠抗凝全血和血清，采用淋巴细胞液分离肝素钠全血中单个核细胞（PBMCs），通过实时-定量PCR仪检测确诊的活动性肺结核患者PBMCs中HLA-DR、CD11C、CD68、CD206、Arg-1的mRNA水平，应用流式细胞仪检测细胞因子（IL-2、IL-6、TNF-α、IFN-γ、IL-4等）的分泌情况。将人源THP-1细胞经佛波酯（PMA）诱导分化，将其变成巨噬细胞样细胞后，分为M0组、M1组、M2组、M0+ESAT6组，刺激24 h后，荧光定量PCR检测HLA-DR、CD11C、CD68、CD206、Arg-1的mRNA水平。ESAT6分别刺激THP-1 6 h、12 h、24 h后，流式技术检测细胞培养上清中相关细胞因子的水平（IL-2、IL-6、TNF-α、IL-4等）。结果与健康对照组相比，活动性肺结核组外周血PBMCs中M1极化表型分子HLA-DR、CD11C、CD68的mRNA表达水平均上调（P 0.05）。活动性肺结核组患者血清M1极化相关的促炎性细胞因子IL-2、IL-6、TNF-α、IFN-γ水平均上升（P 0.05）；但CD68 mRNA表达水平在各组之间差异无统计学意义（F=2.480,P=0.135）。细胞M2极化表型分子CD206、Arg-1 mRNA水平在各组之间差异无统计学意义（F=1.233,P=0.3597;F=6.059,P=0.068）。M1极化相关的促炎性细胞因子IL-2及抗炎性细胞因子IL-4在各组细胞培养不同时间节点均差异无统计学意义（P> 0.05）。与M0和ESAT6表型组相比，M1表型组促炎性细胞因子IL-6和TNF-α水平在培养12 h、24 h均显著升高（P 0.05）。结论活动性肺结核外周血单核-巨噬细胞向M1极化的能力增强，向M2极化的能力减弱。结核分枝杆菌ESAT6可以促进巨噬细胞向M1极化，影响肺结核病情活动及进展。

关键词：结核分枝杆菌巨噬细胞极化活动性肺结核 6KD早期分泌靶向蛋白