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髓母细胞瘤分子亚型中CD8T细胞浸润的临床病理特点

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北京大学学报(医学版) 2024年

作者：柴晓东孙子文李海爽朱靓怡刘小旦刘延涛裴斐常青北京大学基础医学院病理学系北京大学第三医院病理科北京市神经外科研究所神经病理中心

目的：研究CD8+T细胞在髓母细胞瘤(medulloblastoma， MB)各个分子亚型中的浸润特点，分析CD8+T细胞浸润与患者预后的关系以及C-X-C基序趋化因子11(C-X-C motif chemokine ligand 11)的表达及其受体CXCR3在CD8+T细胞中的表达情况，为进... 详细信息

目的：研究CD8+T细胞在髓母细胞瘤(medulloblastoma， MB)各个分子亚型中的浸润特点，分析CD8+T细胞浸润与患者预后的关系以及C-X-C基序趋化因子11(C-X-C motif chemokine ligand 11)的表达及其受体CXCR3在CD8+T细胞中的表达情况，为进一步探索MB中CD8+T细胞浸润可能的调节机制提供临床病理依据。方法：筛选2012—2019年间来自多所医学中心、具有完整临床资料的MB患者共48例(4个分子亚型各12例)，利用NanoString PanCancer IO360TM基因套餐对48例MB患者的肿瘤标本进行转录组学分析，对患者肿瘤组织的石蜡切片进行CD8免疫组织化学染色分析，验证各亚型MB中CD8+T细胞数量的差异。通过数据库生物信息学分析，探讨CD8+T细胞浸润与患者预后的关系及各种趋化因子在各亚型MB中的表达差异，并采用双重免疫荧光染色验证MB中CD8+T细胞表面CXCR3受体的表达情况，探讨CD8+T细胞浸润至肿瘤内的可能分子机制。结果：MB的WNT (wingless)亚型中的CD8+T细胞特征指数相对较高，提示WNT亚型中的CD8+T细胞数量显著高于其他三个亚型，这一现象通过CD8免疫组织化学染色方法以及R2在线数据分析平台对美国基因表达数据库Gene Expression Omnibus (GEO)进行数据挖掘得到了证实，且CD8+T细胞增多与患者的生存期呈正相关。数据库分析显示，CXCL11在WNT亚型MB中的表达量明显高于其他三个亚型。免疫荧光染色结果显示，CD8+T细胞表面存在CXCL11的受体CXCR3，提示CD8+T细胞可能通过表面受体CXCR3受CXCL11趋化至MB的微环境中。结论：CD8+T细胞在WNT亚型MB中的浸润相对多于其他亚型，其机制可能与CXCL11-CXCR3趋化因子系统的激活相关，且肿瘤内CD8+T细胞浸润较多的患者预后较好，此结果可能为MB中CD8+T细胞浸润调节机制提供有益的临床病理依据，为未来MB的免疫治疗提供新的潜在治疗靶点。

关键词：髓母细胞瘤肿瘤微环境 CD8阳性T淋巴细胞趋化因子CXCL11

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结直肠癌病理研究五十年:世界与中国

科学通报 2024年

作者：来茂德浙江大学医学院病理学与病理生理学系浙江大学医学院附属邵逸夫医院病理科

五十年来,结直肠癌病理学发展经历了组织病理学类型的确定,分子改变特征的解析,分子检测指导个体化治疗和液体活检引导动态治疗4个阶段.常规手术切除标本和内镜黏膜下剥离术/内镜黏膜下切除术标本规范的病理检查和诊断是临床治疗的基础... 详细信息

五十年来,结直肠癌病理学发展经历了组织病理学类型的确定,分子改变特征的解析,分子检测指导个体化治疗和液体活检引导动态治疗4个阶段.常规手术切除标本和内镜黏膜下剥离术/内镜黏膜下切除术标本规范的病理检查和诊断是临床治疗的基础.目前对微卫星不稳定性(microsatellite instability, MSI), ras、Braf、PIK3CA、cmet等突变, HER2扩增或突变和ALK、NTRK融合基因表达的检测,可以指导病人的个体化治疗,获得最佳的临床结果.右半结肠癌、左半结肠癌和直肠癌在发生机制、预后和药物治疗反应上不同.依据三分类详细的临床观察和分层治疗,将使结直肠癌个体化治疗更精细化.肝转移是晚期结直肠癌治疗的关键问题,转移的分子机制阐释和干预,需要多学科的共同探索.肿瘤病人的分子分层、循环肿瘤DNA (circulating tumor DNA, ctDNA)、单细胞测序和空间组学、类器官和人工智能(artificial intelligence, AI)辅助诊断应用是近期研究的热点.基于多组学方法,高频微卫星不稳定性病人的分层研究和微卫星稳定病人的转化研究,是目前亟须深入研究的课题,使更多病人从免疫治疗中获益而又避免治疗的毒性和超进展.以ctDNA检测为主要手段的液体活检,能帮助确定微小残留病变(minimal residual disease, MRD),并指导临床实施动态治疗,使晚期结直肠癌转化为一种慢性病.单细胞测序和空间组学为我们更好地认识肿瘤微环境和时空异质性提供了新的手段.类器官作为一个“活的生物银行”对测试新的治疗方法提供可能. AI技术的应用使我们看到,可以用更简便的方法来对病人进行分层,并实施个体化治疗.这种分层的基础是分子改变所呈现的形态学表型改变.因此AI辅助病理诊断和分型将使病理学进入一个新的阶段.

关键词：病理学结直肠癌分子诊断分子分型

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嵌合RNA检测和验证技术

生物化学与生物物理进展 2024年第4期51卷 797-808页

作者：王广富丁咏伟唐悦秦付军郑州大学基础医学院微生物学与免疫学系郑州450001 郑州大学医学科学院医学表观遗传学中心郑州450052 郑州大学医学科学院分子病理中心郑州450052 郑州大学医学科学院转化医学平台郑州450052 郑州大学省部共建食管癌防治国家重点实验室郑州450052 郑州大学基础医学院病理与病理生理学系郑州450001

嵌合RNA(chimeric RNA)是由来自不同基因的外显子片段组成的融合转录本。传统的嵌合RNA检测方法有染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)等,但这些技术的特异性、灵敏性和准确性较差。随着测序技术的发展,二代测序技术展现出强大的数据处... 详细信息

嵌合RNA(chimeric RNA)是由来自不同基因的外显子片段组成的融合转录本。传统的嵌合RNA检测方法有染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)等,但这些技术的特异性、灵敏性和准确性较差。随着测序技术的发展,二代测序技术展现出强大的数据处理能力,可以通过高通量序列分析来检测嵌合RNA,目前基于高通量测序的检测方法有FusionCatcher、SOAPfuse、EricScript等。目前较为常用的对检测到的嵌合RNA的验证方法有聚合酶链反应(PCR)、核糖核酸酶保护实验(RPA)、琼脂糖凝胶电泳、Sanger测序等。多种检测技术的开发使得越来越多的嵌合RNA被发现,但现有的检测技术各有优劣,主要体现于检测成本、假阳性率、检测时间等方面的差异。本文对嵌合RNA的检测方法、验证方法及各方法的优劣性进行阐述。

关键词：嵌合RNA 检测技术验证技术 RNA-Seq 生物信息学

肢端黑色素瘤CCND1基因和第11号染色体拷贝数变异的临床病理学研究

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中华病理学杂志 2024年第6期53卷 557-562页

作者：郭瑞萍杨乐源杜娟赵建芳石芳张昕苏静北京大学第三医院病理科北京大学基础医学院病理学系北京100191 北京大学第三医院延安分院延安市中医医院病理科延安716000

目的探讨肢端黑色素瘤中CCND1基因拷贝数增加与第11号染色体拷贝数之间的关系,及其与临床病理特征的联系。方法收集2018年1月至2021年8月于北京大学第三医院病理科经手术切除后诊断明确的肢端黑色素瘤标本33例。采用荧光原位杂交(fluore... 详细信息

目的探讨肢端黑色素瘤中CCND1基因拷贝数增加与第11号染色体拷贝数之间的关系,及其与临床病理特征的联系。方法收集2018年1月至2021年8月于北京大学第三医院病理科经手术切除后诊断明确的肢端黑色素瘤标本33例。采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术检测肿瘤中CCND1基因和第11号染色体着丝粒拷贝数,分析两者拷贝数变化的关系,并分析CCND1拷贝数异常与患者临床病理特征的相关性。结果33例肢端黑色素瘤患者中男性15例,女性18例,年龄范围22~86岁。63.6%(21/33)的肢端黑色素瘤患者有CCND1基因拷贝数增加,其中同时伴第11号染色体多体者占21.2%(7/33)。27.3%(9/33)的病例CCND1基因拷贝数呈低拷贝增加,其中4例(4/33,12.1%)同时伴有第11号染色体多体;36.4%(12/33)的病例CCND1基因拷贝数呈高拷贝增加,其中3例(3/33,9.1%)同时伴有第11号染色体多体。CCND1低拷贝增加组中未见CCND1/CEP11比值≥2.00者;高拷贝增加组中CCND1/CEP11比值≥2.00者共11例(11/12)。CCND1基因拷贝数增加与患者年龄、性别、组织学类型、Breslow厚度、溃疡和Clark分级无相关性(P>0.05)。结论CCND1基因拷贝数增加是肢端黑色素瘤的重要分子改变,部分CCND1拷贝数增加的肢端黑色素瘤患者可同时存在第11号染色体多体,这部分患者CCND1拷贝数增加可能是第11号染色体多体的伴随表现。

关键词：黑色素瘤病理学,临床 CCND1基因染色体,人,11对

基于Hippo/YAP通路探讨红花总黄酮对肝星状细胞活化增殖的作用机制研究

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海南医学院学报 2024年

作者：赵晓璐李明奇王映荷马月宏内蒙古医科大学基础医学院内蒙古自治区分子病理学重点实验室

目的:研究红花总黄酮（TFCTL）对肝星状细胞活化增殖的作用与机制。方法:培养对数生长期的HSC-T6细胞，用10 ng/mL的TGF-β1刺激诱导其活化，分为空白组、TGF-β组、TFCTL低浓度组（20 μg/mL）、TFCTL中浓度组（40 μg/mL）、TFCTL高... 详细信息

目的:研究红花总黄酮（TFCTL）对肝星状细胞活化增殖的作用与机制。方法:培养对数生长期的HSC-T6细胞，用10 ng/mL的TGF-β1刺激诱导其活化，分为空白组、TGF-β组、TFCTL低浓度组（20 μg/mL）、TFCTL中浓度组（40 μg/mL）、TFCTL高浓度组（60 μg/mL）；用CCK-8试剂盒和凋亡试剂盒检测红花总黄酮干预HSC-T6细胞后的增殖活性和凋亡率；免疫荧光染色法观察各组细胞中 α-SMA 、YAP表达及位置情况；RT-qPCR法检测α-SMA、Collagen Ⅰ、MST1、LATS、YAP mRNA表达水平，Western blot 检测α-SMA、Collagen Ⅰ、MST1、LATS1、p-YAP/YAP的蛋白表达量。结果:红花总黄酮可显著抑制活化的HSC-T6细胞的增殖，并促进其凋亡；RT-qPCR和Western blot检测结果发现，与空白组相比，TGF-β组中α-SMA、Collagen Ⅰ 、YAP mRNA水平和蛋白表达量显著增加（P<0.01），MST1、LATS1 mRNA水平和蛋白表达量明显降低（P<0.05）；与TGF-β组相比，TFCTL低、中、高浓度组中α-SMA、Collagen Ⅰ、YAP mRNA水平和蛋白表达量显著降低（P<0.01），MST1、LATS mRNA水平和蛋白表达量显著增加（P<0.01）；免疫荧光定量实验表明，TFCTL干预后，HSC-T6细胞中α-SMA的荧光强度逐渐降低，并促进了YAP的核转移。结论:TFCTL可能通过抑制Hippo/YAP通路各级激酶的表达，抑制肝星状细胞的活化增殖，进而减轻肝纤维化。

关键词：肝纤维化肝星状细胞红花总黄酮 Hippo/YAP通路 HSC-T6细胞

急性髓系白血病新型预后分子标志物NKX2-3的发现

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中山大学学报（医学科学版） 2024年第1期45卷 63-68页

作者：王婉頔常桃江思远侯琪金真伊吴秀丽暨南大学基础医学与公共卫生学院血液学研究所广东广州510632 暨南大学基础医学与公共卫生学院生物化学与分子生物学系广东广州510632 暨南大学基础医学与公共卫生学院病理学系广东广州510632

【目的】通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病(AML)患者的预后的分子标志物的表达,为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。【方法】从癌症基因组图谱(TCGA)生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基... 详细信息

【目的】通过分析生物信息数据库中影响急性髓系白血病(AML)患者的预后的分子标志物的表达,为进一步探索AML预后的新型分子标志物提供实验基础。【方法】从癌症基因组图谱(TCGA)生物信息数据库中的179例AML患者的预后数据进行差异性基因分析及生存分析;利用基因表达集锦(GEO)数据库中的GSE13159数据集的74例健康人(HI)骨髓标本与542例AML初发患者骨髓标本进行分析,检测差异性目的基因表达水平在AML初发患者与健康人中的差异性;收集初发18例AML患者的外周血及骨髓样本,同时收集年龄和性别匹配的20例健康志愿者的样本作为对照,采用实时荧光定量PCR验证差异基因在AML患者体内的表达水平。【结果】生物信息数据分析显示,根据R语言计算出的NK2转录因子相关基因位点3(NKX2-3)的最佳截断值0.051进行生存分析,发现与低表达NKX2-3的AML初发患者相比,高表达NKX2-3的AML初发患者总体生存率较差(P=0.0036);与HI相比,NKX2-3在AML初发组患者中显著高表达(P<0.001);实时荧光定量PCR的验证结果也证实NKX2-3-1和NKX2-3-2在AML初发组患者中高表达,且与健康人组相比有显著相关性(P=0.000,P=0.000)。【结论】NKX2-3在AML初发组患者中高表达,且高表达NKX2-3的AML患者总体生存较差;NKX2-3可能与AML临床转归与预后密切相关。

关键词：急性髓系白血病 NKX2-3 生物信息学预后基因表达相关性

幽门螺杆菌感染诱导的癌症相关成纤维细胞对胃上皮-间质转化影响的研究进展

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生理学报 2024年第4期76卷 547-560页

作者：李逸粼郑丽飞首都医科大学基础医学院北京100069 首都医科大学基础医学院生理学与病理生理学系北京100069

幽门螺杆菌是一种能够在胃黏膜中定植的革兰氏阴性杆菌。幽门螺杆菌可诱导胃部产生癌症相关成纤维细胞。幽门螺杆菌的毒力因子以及癌症相关成纤维细胞可引发上皮-间质转化,导致局部炎症、胃黏膜损伤和慢性胃炎的发生。本文重点综述了幽... 详细信息

幽门螺杆菌是一种能够在胃黏膜中定植的革兰氏阴性杆菌。幽门螺杆菌可诱导胃部产生癌症相关成纤维细胞。幽门螺杆菌的毒力因子以及癌症相关成纤维细胞可引发上皮-间质转化,导致局部炎症、胃黏膜损伤和慢性胃炎的发生。本文重点综述了幽门螺杆菌感染后癌症相关成纤维细胞介导的胃部上皮-间质转化的分子机制,为未来治疗幽门螺杆菌感染相关性胃癌的潜在分子靶点和策略提供新的见解。

关键词：幽门螺杆菌癌症相关成纤维细胞上皮-间质转化转化生长因子β PI3K-AKT

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皮肤黑色素瘤中TERT基因异常的研究进展

中华病理学杂志 2024年第7期53卷 762-766页

作者：郑雅心张昕苏静北京大学第三医院病理科北京大学基础医学院病理学系北京100191 北京大学护理学院北京100191 北京大学第三医院延安分院延安市中医医院病理科延安716000

皮肤黑色素瘤恶性程度高,基因改变复杂。端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase,TERT)是黑色素瘤中较常出现异常的基因。TERT基因在黑色素瘤中的异常主要包括TERT启动子突变和TERT扩增,前者较常见于非肢端皮肤黑色素瘤,后者... 详细信息

皮肤黑色素瘤恶性程度高,基因改变复杂。端粒酶逆转录酶(telomerase reverse transcriptase,TERT)是黑色素瘤中较常出现异常的基因。TERT基因在黑色素瘤中的异常主要包括TERT启动子突变和TERT扩增,前者较常见于非肢端皮肤黑色素瘤,后者较常见于肢端黑色素瘤。检测TERT基因异常对黑色素细胞肿瘤良恶性鉴别,黑色素瘤的预后判断均有重要价值。同时,对阐明黑色素瘤发生的分子机制,寻求新的靶向治疗手段也有一定提示意义。

关键词：皮肤黑色素瘤良恶性鉴别端粒酶逆转录酶恶性程度靶向治疗肢端

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环形RNA数据库汇总及其应用

生命科学 2024年

作者：许钊源王豫琪何璐云郑州大学第一临床医学院郑州大学基础医学院病理生理学系

环形RNA (circular RNA, circRNA)是通过反向剪接形成的闭合非编码RNA分子。它可以通过多种方式参与细胞生命活动，同时也是肿瘤等多种疾病的生物标志物和潜在治疗靶点。随着高通量测序技术的发展和circRNA研究的不断深入，circRNA信息... 详细信息

环形RNA (circular RNA, circRNA)是通过反向剪接形成的闭合非编码RNA分子。它可以通过多种方式参与细胞生命活动，同时也是肿瘤等多种疾病的生物标志物和潜在治疗靶点。随着高通量测序技术的发展和circRNA研究的不断深入，circRNA信息和功能注释不断增多。许多聚焦不同方向的circRNA数据库被建立，为circRNA研究者了解、分析、注释及研究circRNA提供了很大便利。本文收集了28个circRNA数据库并对其进行分类汇总，希望为研究者选择circRNA数据库提供一些参考和帮助。

关键词：环形RNA 环形RNA数据库信息汇总生物标志物