检索结果-南通市图书馆

SIX6基因rs10483727多态性与原发性开角型青光眼发病关联性的Meta分析和试验序贯分析

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中国循证医学杂志 2019年第3期19卷 310-317页

作者：李瑞孙金芳余小金王莉娜东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室南京210009

目的系统评价SIX6基因rs10483727多态性与原发性开角型青光眼(POAG)的相关性。方法计算机检索PubMed、Web of Science、The Cochrane Library、CNKI、WanFang Data和VIP数据库,搜集SIX6基因rs10483727多态性与POAG的病例-对照研究,检索时限均为建库至2018年12月28日。由2位评价员独立筛选文献、提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,采用Stata 12.0软件进行Meta分析。结果纳入16篇文献,17个病例-对照研究,共9886例患者和19663例对照者。Meta分析结果显示,在亚洲人群中,rs10483727多态性与POAG发病相关(P均病相关(除超显性基因模型);但非洲人群中未曾发现此相关性(P值均>0.05)。结论当前证据显示亚洲人群和高加索人群中SIX6基因的rs10483727多态性与POAG发病相关。

关键词： SIX6基因原发性开角型青光眼病例-对照研究 Meta分析试验序贯分析

应用Bootstrap方法估计加工食品中污染物的残留浓度

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卫生研究 2011年第2期40卷 198-201页

作者：岳立文闵捷王灿楠胡丹李朝赟肖珊东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室南京210009 东南大学公共卫生学院营养与食品卫生教研室

目的应用Bootstrap方法对几种常见加工食品污染物(铅)残留浓度与原料食品污染物残留浓度的比值做出估计,并与文中定义的折算系数进行比较,对两者的关系及其意义进行探讨。方法从中国2000～2006年全国农产品污染物监测数据库中筛选出常... 详细信息

目的应用Bootstrap方法对几种常见加工食品污染物(铅)残留浓度与原料食品污染物残留浓度的比值做出估计,并与文中定义的折算系数进行比较,对两者的关系及其意义进行探讨。方法从中国2000～2006年全国农产品污染物监测数据库中筛选出常见的、频数较多的几种食品,运用Bootstrap方法估计铅在加工食品与其原料食品残留浓度之间的比值。结果果汁、馒头、米粉、豆腐类等残留浓度的比值小于1,饼干、面包、豆腐干、鱼罐头残留浓度的比值基本等于1,猪肉干及皮蛋的残留浓度的比值明显超过1,这些食品残留浓度比值大多与折算系数不同。结论使用Bootstrap方法估计常见食品污染物残留浓度的比值具有可行性。加工过程对食品的污染物残留有一定影响,不能仅用稀释与浓缩解释。

关键词：食品加工方式铅 Bootstrap法食品检测

基于荧光共振能量转移技术的快速检测CA16型手足口病病原体新方法的建立及其评价

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吉林大学学报（医学版） 2020年第1期46卷 169-175页

作者：聂玮李娟曹晓炼代天聪郭潇潇刘玉申王娟李卓林吉林大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的:基于荧光共振能量转移(FRET)技术建立一种柯萨奇病毒A组16型(CA16)手足口病病原体快速检测的新方法,并对检测效果进行评价,使其达到疾病爆发流行期间大样本量检测的要求。方法:采用SDS-PAGE凝胶电脉技术和蛋白浓度定量试剂盒测定C... 详细信息

目的:基于荧光共振能量转移(FRET)技术建立一种柯萨奇病毒A组16型(CA16)手足口病病原体快速检测的新方法,并对检测效果进行评价,使其达到疾病爆发流行期间大样本量检测的要求。方法:采用SDS-PAGE凝胶电脉技术和蛋白浓度定量试剂盒测定CA16鸡卵黄抗体(CA16-IgY)纯度及蛋白水平,采用间接ELISA法检测抗体效价及特异性,采用紫外可见光谱(UV-Vis)、红外光谱(FTIR)和透射电子显微镜(TEM)等方法对所制备的金纳米粒子(AuNPs)及其生物探针(IgY-AuNPs)的尺寸、形貌和性能进行表征;基于FRET技术构建CA16检测体系,通过优化检测体系中IgY-AuNPs浓度、氯化钠(NaCl)用量和荧光恢复时间等指标,对检测方法的灵敏度、特异度和临床样本检测进行评价。结果:CA16-IgY纯度较高,抗体平均蛋白水平为12.15mg·L-1,抗体效价高达1∶128 000,特异性良好;AuNPs及IgY-AuNPs的UV-Vis、FTIR和TEM观察结果,IgY已成功标记至AuNPs表面,提示已通过静电自组装成功制备了可以特异性识别CA16的IgY-AuNPs。基于FRET技术构建CA16检测体系,体系经优化后,确定IgY-AuNPs的最佳浓度为0.52×10-3g·L-1,NaCl的最佳用量为40μL,荧光恢复最佳时间为90min,建立的检测方法的标准曲线为I525nm=15.452IgC-9.746,R2=0.993 2,检测限为1×104 PFU·mL-1,与临床检测金标准实时荧光定量PCR (qRT-PCR)法比较,一致率可达93.75%。结论:成功建立了CA16型手足口病病原体的快速检测新方法,可用于实验室和临床检测。

关键词：柯萨奇病毒A组16型荧光共振能量转移手足口病鸡卵黄抗体金纳米粒子

基于净增效益值流感疫苗成本效益系统评价与meta分析

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中国公共卫生 2019年第3期35卷 370-373页

作者：李瑞孙金芳王莉娜余小金东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室江苏南京210009

目的基于最新提出的成本效益指标净增效益值(INB)比较评价预防接种四价流感疫苗(QIV)与三价流感疫苗(TIV)的成本效益。方法检索中国知网数据库、万方数据知识服务平台、 PubMed数据库和Web of science数据库,收集1998年1月1日—2018年8... 详细信息

目的基于最新提出的成本效益指标净增效益值(INB)比较评价预防接种四价流感疫苗(QIV)与三价流感疫苗(TIV)的成本效益。方法检索中国知网数据库、万方数据知识服务平台、 PubMed数据库和Web of science数据库,收集1998年1月1日—2018年8月7日公开发表的关于QIV与TIV成本效益比较的相关文献,应用Stata/SE 12.0软件进行meta分析,估计总增量净效益(TINB)。结果最终纳入5篇英文文献,累计研究对象96 727 891人;meta分析结果显示,QIV与TIV比较,合并的TINB为308(95%CI=303～313);在剔除权重系数较小的1个研究后合并的TINB为307(95%CI=302～313),剔除前后研究的合并效益值比较接近,纳入的文献结果较为可靠。发表偏倚结果显示本研究所纳入文献可能存在发表偏倚,但因纳入的文献较少,发表偏倚的检验仍需作进一步研究。结论接种QIV与TIV相比更具有成本效益。

关键词：流感疫苗成本效益系统评价净增效益值(INB) meta分析

幽门螺杆菌ddlA基因的克隆及生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2019年第10期14卷 1119-1124,1134页

作者：何梦雅王海燕张荣光余飞艳陈帅印郗园林段广才郑州大学公共卫生学院流行病与统计学教研室

目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶A(D-alanine-D-alanine ligase A, DdlA)基因ddlA编码区,并对其进行测序和生物信息学分析。方法以MEL-Hp27菌株基因组DNA为模版,PCR扩增ddlA基因编码区;将ddlA基因与真核表达载体pcDNA3.1(+)连接,构建重组表达载体;测序获得ddlA基因序列,利用生物信息学软件对编码DdlA蛋白的理化性质、结构特点进行分析。结果 MEL-Hp27 ddlA基因的编码区长为1 044 bp,编码347个氨基酸;编码的DdlA蛋白是一种性质稳定的亲水蛋白,相对分子质量为39.61×10~3,属于D-ala-D-ala连接酶N端家族;DdlA蛋白无跨膜区和信号肽,具有磷酸化位点和O-糖基化位点;二级结构中α-螺旋占36.02%,无规卷曲Cc占42.36%,延伸链Ee占18.73%,β-转角Tt占2.88%。DdlA蛋白含有7个B淋巴细胞和15个CTL细胞相关抗原表位。结论成功克隆了Hp27 ddlA基因,构建了该基因的真核表达载体,表达的DdlA蛋白含有B、T淋巴细胞抗原表位,为研究Hp DdlA蛋白基因在Hp感染致病及防治中的作用提供了理论依据。

关键词：幽门螺杆菌 D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶A 基因克隆生物信息学

幽门螺杆菌金属蛋白酶原核表达载体的构建与重组表达及纯化

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中国病原生物学杂志 2019年第11期14卷 1273-1276,1281页

作者：王海燕何梦雅张荣光余飞艳陈帅印范清堂郗园林段广才郑州大学公共卫生学院流行病与统计学教研室

目的构建幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)金属蛋白酶(metalloprotease, Mtp)基因mtp与麦芽糖结合蛋白基因mbp融合表达载体,诱导Mtp重组表达并纯化表达产物,为Hp致病机制和疫苗研究奠定基础。方法应用PCR从Hp郑州分离株MEL-Hp27的DN... 详细信息

目的构建幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)金属蛋白酶(metalloprotease, Mtp)基因mtp与麦芽糖结合蛋白基因mbp融合表达载体,诱导Mtp重组表达并纯化表达产物,为Hp致病机制和疫苗研究奠定基础。方法应用PCR从Hp郑州分离株MEL-Hp27的DNA扩增mtp基因,经纯化回收后与克隆载体pMD19-T连接,并进行测序验证。对重组质粒pMD19-T-mtp双酶切,酶切目的片段克隆至表达载体pMAL-c2X,然后用重组质粒pMAL-mtp转化大肠埃希菌(E.coli TB1)。从大肠埃希菌重组子中提取重组质粒,进行酶切和测序鉴定。用分光光度计测定重组菌的生长曲线。用IPTG诱导mtp表达,用SDS-PAGE法分析表达产物,并用Amylose树脂预装柱纯化Mtp蛋白。结果 PCR扩增的mtp基因片段长度为621 bp,重组菌株的酶切和测序鉴定正确;重组菌生长曲线显示重组质粒的转入对受体菌的生长无显著影响;Mtp诱导表达和纯化产物的SDS-PAGE显示,Mtp表达产物为相对分子质量为66.4×10^3的水溶性融合蛋白(rMtp),纯化产物的纯度约为85.6%。结论成功构建mtp基因与麦芽糖结合蛋白mbp基合表达载体,并纯化制备了重组蛋白,为探索Mtp在Hp感染发病机制和抗Hp感染疫苗研究奠定了基础。

关键词：幽门螺杆菌金属蛋白酶基因克隆融合表达麦芽糖结合蛋白

三臂非劣效临床试验基于干预依从性的效应估计方法

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中国卫生统计 2024年第2期41卷 213-217,222页

作者：吴研鹏陈平雁吴莹复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室 200032 南方医科大学公共卫生学院生物统计学系

目的临床试验中干预不依从问题通常无法避免,分析方法不当会导致结果偏倚,非劣效研究尤其如此。本研究针对三臂非劣效临床试验,建立Bayes因果模型,实现对干预依从人群的效应估计。方法基于主分层思想,按依从性类型将试验人群分层,从而... 详细信息

目的临床试验中干预不依从问题通常无法避免,分析方法不当会导致结果偏倚,非劣效研究尤其如此。本研究针对三臂非劣效临床试验,建立Bayes因果模型,实现对干预依从人群的效应估计。方法基于主分层思想,按依从性类型将试验人群分层,从而转化为不同依从性人群的结局混合分布识别问题。通过构建Bayes模型和使用DA(data augmentation)算法,实现结局参数后验分布估计和统计推断。通过模拟研究,比较本研究提出方法与传统的意向性治疗(intention-to-treat,ITT)、遵循研究方案(per-protocol,PP)及实际接受治疗(as-treated,AT)分析的统计性能。结果当依从类型与结局相关时,传统的ITT、PP及AT分析均存在较大偏倚;本研究提出方法在依从类型与结局相关和不相关两种情况下,均能够将偏倚控制在较小的范围。结论对于存在较严重干预不依从问题的非劣效临床试验,本研究提出方法较传统分析可以更好地控制分析偏倚。

关键词：不依从三臂非劣效性临床试验 Bayes因果模型 DA算法

BBN模型在江苏居民氰戊菊酯长期膳食暴露评估中的应用

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中国卫生统计 2012年第5期29卷 661-663,666页

作者：田野闵捷刘沛王灿楠东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室 210009

目的应用贝塔二项-正态分布模型(BBN模型)对氰戊菊酯长期膳食暴露进行评估。方法利用贝塔二项分布构建阳性摄入频率模型,用正态分布构建长期阳性暴露量模型。从分布中抽样,进行MonteCarlo模拟获得氰戊菊酯的长期暴露量,并应用bootstrap... 详细信息

目的应用贝塔二项-正态分布模型(BBN模型)对氰戊菊酯长期膳食暴露进行评估。方法利用贝塔二项分布构建阳性摄入频率模型,用正态分布构建长期阳性暴露量模型。从分布中抽样,进行MonteCarlo模拟获得氰戊菊酯的长期暴露量,并应用bootstrap方法对评估结果进行不确定性分析。结果不同性别、不同年龄组人群各暴露水平的暴露量均位于95%可信区间内,暴露量百分位数能够达到稳定,BBN模型方法较好地量化了由短期调查数据得到的长期暴露量的变异性。结论 BBN模型可以较好地解决利用短期调查数据进行长期暴露量估计的问题,在评价氰戊菊酯长期膳食暴露风险中应用效果良好。

关键词： BBN模型长期膳食暴露评估氰戊菊酯

hnRNP E1对HPV16早期基因E2、E6的调控及其对宫颈癌细胞生物学功能的影响

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中华流行病学杂志 2021年第2期42卷 321-326页

作者：宋丽丁玲冯美娟李小雪高雯祁卓刘虹王铭王金桃山西医科大学公共卫生学院流行病学教研室太原030001

目的探讨hnRNP E1对HPV16早期基因E2、E6表达的调控及宫颈癌细胞生物学功能的影响。方法采用体外细胞实验方法,对HPV16阳性人宫颈鳞癌SiHa细胞株采用hnRNP E1cDNA质粒上调hnRNP E1表达,于上调前、后采用Real-time PCR和Western blot分... 详细信息

目的探讨hnRNP E1对HPV16早期基因E2、E6表达的调控及宫颈癌细胞生物学功能的影响。方法采用体外细胞实验方法,对HPV16阳性人宫颈鳞癌SiHa细胞株采用hnRNP E1cDNA质粒上调hnRNP E1表达,于上调前、后采用Real-time PCR和Western blot分别检测各组细胞HPV16 E2、E6 mRNA和蛋白表达水平,同时,应用CCK-8法和流式细胞术检测细胞增殖、周期及凋亡。采用SPSS 22.0和Graphpad Prism 7.0软件进行相关资料分析。结果随着转染时间的增加(24、48、72 h),hnRNP E1过表达组的SiHa细胞活性及处于增殖状态的细胞数逐渐减少(P统计学意义(P统计学意义(P=0.427),HPV16 E2蛋白未被检测到。结论hnRNP E1可抑制HPV16 E6的转录和翻译,进而抑制宫颈癌细胞增殖,促使凋亡,hnRNP E1可作为抑制宫颈癌变的潜在靶标。但本研究未发现hnRNP E1与HPV16 E2在SiHa细胞中的关系。

关键词：宫颈癌核内不均一性核糖核蛋白人乳头瘤病毒