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植物学教学实验室管理方法探讨——以南京农业大学生命科学学院生物实验中心植物学教学实验室为例

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高校实验室工作研究 2017年第2期 59-60页

作者：屈娅娜刘琳莉钱猛南京农业大学生命科学学院江苏南京210095

教学实验是高校教学中的一个重要环节,承担着全校相关课程的实验实习任务,能否科学、高效运行是实验室管理水平的有效反映。本文以南京农业大学生命科学学院生物实验中心植物学教学实验室为例,从实验室管理制度的建立健全、维护管理和... 详细信息

教学实验是高校教学中的一个重要环节,承担着全校相关课程的实验实习任务,能否科学、高效运行是实验室管理水平的有效反映。本文以南京农业大学生命科学学院生物实验中心植物学教学实验室为例,从实验室管理制度的建立健全、维护管理和管理人员综合能力水平的提高等三方面进行探讨,以促进实验教学交流。

关键词：实验教学植物学实验室管理

应对危机、化危为机、主动求变，做好在线教学及相关工作——以河北农业大学生命科学学院为例

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中国多媒体与网络教学学报(上旬刊) 2021年第9期 38-40页

作者：司贺龙张新杰苏亚彬赵锦陈靖冯永军张伟石中泉刘艳萌河北农业大学生命科学学院河北农业大学教务处

疫情发生以来,党中央、教育部颁发系列文件,停课不停教不停学,做好疫情防控期间高校在线教学组织与管理。学校、学院借助原有的信息化教学基础,大力改革、借助各种网络平台,保障教学工作顺利进行。在教学需求的压力下进行了系列教学改革... 详细信息

疫情发生以来,党中央、教育部颁发系列文件,停课不停教不停学,做好疫情防控期间高校在线教学组织与管理。学校、学院借助原有的信息化教学基础,大力改革、借助各种网络平台,保障教学工作顺利进行。在教学需求的压力下进行了系列教学改革,有利于深入推进我校一流本科、一流课程"双万计划",更加有助于具有高阶性、创新性、挑战度大的五大"金课"。

关键词：危机主动求变在线教学

铜绿微囊藻(Microcystis aeruginosa)群体生长与解散过程中的细菌群落变化

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湖泊科学 2025年

作者：刘佳音方道艳张玉晴王艺饶蔡元锋施丽梅李朋富吴庆龙南京大学生命科学学院中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与流域水安全重点实验室湖泊与环境国家重点实验室中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室

微囊藻藻际中生长着大量的细菌，它们影响微囊藻的生长以及藻群体的维持，在水华的生消中发挥着重要作用。在微囊藻群体的生长过程中，伴随着微囊藻群体的形成与解散，但在此过程中附生细菌群落的变化规律仍然未知。本文针对一株从太湖... 详细信息

微囊藻藻际中生长着大量的细菌，它们影响微囊藻的生长以及藻群体的维持，在水华的生消中发挥着重要作用。在微囊藻群体的生长过程中，伴随着微囊藻群体的形成与解散，但在此过程中附生细菌群落的变化规律仍然未知。本文针对一株从太湖中分离的群体铜绿微囊藻，在不同的培养温度下监测其生长和解散过程，揭示与微囊藻群体密切相关的细菌类群。结果表明：从15～30℃，该群体微囊藻展示出差异化的生长周期，温度越高群体解散越快，微囊藻群体数目达到峰值的时间越短。随着D2群体的生长，>20μm的微囊藻群体附生细菌群落从以Pseudomonadales为主转变为以Sphingomonadales为主；3～20μm的单细胞-小群体微囊藻附生细菌群落及游离细菌群落中的优势菌群均从Pseudomonadales转变为Cytophagales。Limnobacter只在游离细菌群落中相对丰度较高；Roseococcus只在>20μm的D2群体附生细菌群落中有较高的相对丰度；Porphyrobacter在游离细菌群落及3～20μm的单细胞-小群体微囊藻附生细菌群落中相对丰度较高；Mesorhizobium在3～20μm的单细胞-小群体微囊藻附生细菌群落及>20μm的D2群体附生细菌群落中有较高的相对丰度。对不同粒径及不同温度下的细菌群落进行Venn图及特异性-占有率（SPEC-OCCU）图分析发现，部分独有种及特化种只在15℃下出现，OTU669(Methylobacteriaceae)、OTU722(Brevundimonas sp.)和OTU682(Pseudoxanthobacter sp.)在所有温度下均为>20μm的D2群体附生细菌群落的特化种。网络分析结果表明，>20μm的微囊藻群体的附生细菌网络中的关键节点最多。本研究揭示了微囊藻群体生长过程中藻际细菌群落组成的变化，有助于深入了解附生细菌在微囊藻群体维持及水华中的作用。

关键词：蓝藻水华铜绿微囊藻群体细菌群落结构附着细菌游离细菌

马BMSCs成软骨细胞诱导分化及其关键lncRNAs-mRNAs的筛选分析

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中国农业大学学报 2025年第2期 94-106页

作者：赵方歆魏奥凌宇房君朱纯霄焦如月赵赟瑶韩静吴凯峰李雪琼李涛曹俊伟周欢敏张焱如刘春霞内蒙古农业大学生命科学学院/内蒙古自治区生物制造重点实验室

为进一步筛选BMSCs(Bonemarrowmesenchymalstemcells,BMSCs)成软骨细胞诱导分化中关键lncRNAs、mRNAs，本研究以马BMSCs为研究对象，对向软骨细胞诱导不同分化阶段的细胞开展全转录组测序，筛选出在BMSCs成软骨细胞分化中具有重要功能的... 详细信息

为进一步筛选BMSCs(Bonemarrowmesenchymalstemcells,BMSCs)成软骨细胞诱导分化中关键lncRNAs、mRNAs，本研究以马BMSCs为研究对象，对向软骨细胞诱导不同分化阶段的细胞开展全转录组测序，筛选出在BMSCs成软骨细胞分化中具有重要功能的lncRNAs和mRNAs，并对mRNAs和lncRNAs及其靶基因进行验证，并构建lncRNAs对BMSCs成软骨细胞分化的调控网络。结果表明：1）体外成功建立了马BMSCs系，并成功诱导分化成软骨细胞。2）对不同分化阶段的BMSCs进行高通量转录组测序后，共鉴定出3 592个lncRNAs，其中，差异高表达的lncRNAs有250个，低表达的116个，差异高表达的mRNAs有280条，低表达的105条。3）筛选并验证了5个调控马BMSCs向软骨细胞诱导分化中的潜在候选因子，包括lnc-cpm、lnc-traf3、lnc-22173、lnc-acvr2a及lnc-pde4d，以及9个对应靶标基因MDM2、TRAF3、USP25、ACVR2A、PDE4D、BCL2、WAF1、SIRT1及NRF2。4）构建了差异表达的lncRNA与mRNA互作调控网络，主要富集于Wnt信号通路、p53信号通路、MAPK及NF-κb信号通路中。综上，本研究经全转录组测序与分析，成功筛选到马BMSCs分化为软骨细胞过程中表达显著的差异基因，可为后续进一步揭示软骨细胞分化过程中lncRNAs与靶基因的互作机制奠定了必要的前期基础，为BMSCs用于软骨修复的细胞治疗提供了科学依据。

关键词：马 BMSCs 诱导分化软骨细胞 lncRNA

蓝藻-细菌互作及其对碳、氮循环的影响研究进展

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湖泊科学 2025年

作者：张玉晴刘佳音蔡元锋张民史小丽杜瑛珣苏雅玲施丽梅吴庆龙中国科学院南京地理与湖泊研究所湖泊与流域水安全重点实验室湖泊与环境国家重点实验室中国科学院大学南京大学生命科学学院中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室

藻类与细菌之间存在多种互作关系，二者间的相互作用会影响水体初级生产力、藻类群落组成、藻类之间的竞争和演替以及藻类水华的发展等。藻菌间的多种紧密互作和代谢耦联对水体中碳、氮、磷、硫等多种生源要素的循环产生影响。在淡水生... 详细信息

藻类与细菌之间存在多种互作关系，二者间的相互作用会影响水体初级生产力、藻类群落组成、藻类之间的竞争和演替以及藻类水华的发展等。藻菌间的多种紧密互作和代谢耦联对水体中碳、氮、磷、硫等多种生源要素的循环产生影响。在淡水生态系统中，蓝藻水华仍然是威胁水环境健康的重要因素，部分水体中形成了周而复始发生蓝藻水华的稳定状态。蓝藻与其附生细菌间的互作和代谢关联是蓝藻水华维持的关键，在水体碳氮循环中发挥了重要作用。本文综述了蓝藻与细菌间的互作对蓝藻生长、产毒、群体维持和多样性的影响以及影响藻菌互作的因素，综述了蓝藻藻际环境中碳氮相关功能微生物类群以及藻菌互作对水生态系统中碳氮循环的影响，分析了蓝藻群体颗粒、附着作用和环境因素(如温度、营养盐、新型污染物和铁硫磷元素等)对藻菌之间碳氮代谢关联和转化的影响及其对环境的反馈机制，并探讨了藻菌互作中碳氮转化过程与转化通量的主要研究方法，为深入了解蓝藻水华介导的藻菌互作机制和水体生源要素循环的微生物过程提供参考。

关键词：蓝藻藻菌互作碳氮循环环境因素

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转基因猪中外源基因拷贝数和整合位点的研究

生物化学与生物物理进展 2009年第12期36卷 1617-1625页

作者：孔庆然武美玲朱江格日乐其木格郇延军尹智牟彦双刘忠华东北农业大学生命科学学院哈尔滨150030

主要采用了绝对定量PCR和热不均一交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR),检测了体细胞核移植技术生产的绿色荧光蛋白转基因猪中外源基因拷贝数和整合位点,并利用旁侧PCR(Junction PCR)对整合位点进行确定,同时进一步分... 详细信息

主要采用了绝对定量PCR和热不均一交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR),检测了体细胞核移植技术生产的绿色荧光蛋白转基因猪中外源基因拷贝数和整合位点,并利用旁侧PCR(Junction PCR)对整合位点进行确定,同时进一步分析了整合位点的纯合性.结果表明,绝对定量PCR可以准确有效地检测外源基因拷贝数,标准曲线为:log2N(拷贝数)=-0.9354△Ct+3.4116(R2=0.9974,P<0.001),两只转基因猪中外源基因拷贝数分别为30.85±1.77和18.87±1.34;TAIL-PCR能成功地克隆转基因猪中外源基因整合位点,得到25条特异性条带,经BLAST比对,共获得TgInS1(1440bp)、TgInS2(1263bp)和TgInS3(1861bp)3个整合位点.以整合位点侧翼序列特异性引物与外源基因特异性引物的组合引发Junction PCR,得到预计大小的特异性片段,确定了整合位点上、下游侧翼序列的准确性.采用整合位点5′上游和3′下游侧翼序列特异性引物与外源基因特异性引物的组合,进行Junction PCR,在两只转基因猪中都得到与野生型猪一致的侧翼序列特异性引物扩增片段,表明我们获得的转基因猪都为整合位点杂合子.初步建立了绝对定量PCR和TAIL-PCR对外源基因拷贝数和整合位点检测的体系,为今后研究外源基因在转基因猪中遗传和表达的稳定性打下了基础.

关键词：转基因猪拷贝数整合位点绝对定量PCR TAIL-PCR 纯合性

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副溶血弧菌Ⅲ型分泌系统vscH基因生物学功能分析

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畜牧与兽医 2025年第1期57卷 57-65页

作者：田珅李婉君曹钰莹许立慧任建鸾汤芳戴建君薛峰南京农业大学动物健康与食品安全国际合作联合实验室江苏南京210095 中国药科大学生命科学与技术学院江苏南京210009

副溶血弧菌是一种重要的食源性病原菌。Ⅲ型分泌系统(type Ⅲ secretion system,T3SS)作为该菌的主要毒力因子之一,在致病过程中发挥重要作用。vscH位于T3SS1基因座中,功能未知。为探究vscH基因的生物学功能,通过同源重组的方法在副溶... 详细信息

副溶血弧菌是一种重要的食源性病原菌。Ⅲ型分泌系统(type Ⅲ secretion system,T3SS)作为该菌的主要毒力因子之一,在致病过程中发挥重要作用。vscH位于T3SS1基因座中,功能未知。为探究vscH基因的生物学功能,通过同源重组的方法在副溶血弧菌POR-1菌株的基础上构建vscH缺失株ΔvscH及回补株CΔvscH,比较各菌株在生物被膜形成、细胞毒性等生物学特性上的差异;应用Western blot检测T3SS1效应蛋白的分泌量及其在HeLa细胞中易位量;通过GST-Pull Down试验鉴定与VscH相互作用的T3SS1相关蛋白。结果:与POR-1菌株相比,缺失株ΔvscH在生长性能上无明显差异,但生物被膜形成能力下降,同时对HeLa细胞和CaCo-2细胞的毒性作用明显下降;vscH基因的缺失使效应蛋白VopR、VopS和胞外针结构蛋白VscI的分泌显著减少,同时使VopR和VopS在HeLa细胞内易位量显著下降;GST-Pull Down试验发现VscH与一种位于T3SS1的ATP酶VscN存在相互作用。本研究表明,vscH基因影响副溶血弧菌生物被膜形成,参与T3SS1介导的毒性作用,同时对T3SS1效应蛋白的分泌和易位发挥重要功能。

关键词：副溶血弧菌 Ⅲ型分泌系统 vscH 分泌易位

植物乳植杆菌发酵天麻酶解液的工艺优化及活性成分分析

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食品工业科技 2025年

作者：李晶晶李君翔李媛媛孔箭范伟兵靳婉君赖晶张春江杨平荣甘肃中医药大学药学院兰州大学生命科学学院甘肃农业大学动物医学院广州采芝林药业有限公司甘肃广药白云山中药科技有限公司甘肃省药品检验研究院甘肃省药品监督管理局

深层液态发酵被认为是一种提高传统中药植物化学性能与代谢的方法。本研究用响应面法优化天麻酶解工艺，筛选发酵天麻酶解液（Gastrodiaenzymatichydrolyzate，GEH）的最适宜植物乳植杆菌，单因素考察最优发酵条件，并分析发酵前后活性... 详细信息

深层液态发酵被认为是一种提高传统中药植物化学性能与代谢的方法。本研究用响应面法优化天麻酶解工艺，筛选发酵天麻酶解液（Gastrodiaenzymatichydrolyzate，GEH）的最适宜植物乳植杆菌，单因素考察最优发酵条件，并分析发酵前后活性成分的变化。研究植物乳植杆菌LZU-J-TSL6和植物乳植杆菌LZU-LJY-1Q1以1:1的比例发酵GEH，并对其理化性质、抗氧化活性和代谢组学特征进行了分析。结果表明，在液料比30:1（mL/g）、酶解时间2h、酶解温度67℃和加酶量0.5%的条件下，天麻素和对羟基苯甲醇的含量最高；在发酵时间18h、发酵温度37℃和接菌量3%(108CFU/mL)的条件下，发酵天麻酶解液（FermentedGastrodiaenzymatichydrolyzate，FGEH）中活菌数最高。此外，与未发酵GEH相比，FGEH的可滴定酸、总多糖和总酚酸含量分别提高419.35%、12.72%和32.61%，ABTS、DPPH、OH-自由基清除能力分别提高24.27%、38.96%、17.78%。中药全靶代谢组学分析表明，与GEH相比，FGEH中鉴定出N-（1-脱氧-1-果糖基）亮氨酸和龙胆三糖等56种显著上调的代谢物，天麻素和L-天冬氨酸等35种显著下调的代谢物；FGEH主要影响ABC 转运蛋白和半乳糖等KEGG通路。本研究为植物乳植杆菌发酵药食同源中药的开发提供理论依据。

关键词：天麻酶解液混菌发酵理化性质抗氧化活性全谱代谢组学

雌激素的非基因组途径在哺乳动物雌性生殖过程中的作用机制

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生物化学与生物物理进展 2010年第6期37卷 594-599页

作者：梁晓欢杨增明东北农业大学生命科学学院哈尔滨150030 厦门大学生命科学学院厦门361005

雌激素的非基因组调节模式在雌性生殖系统中广泛存在.雌激素通过基因组、非基因组及两种调节模式的整合在不同组织中行使多种生理功能.卵巢中雌激素能通过非基因组效应对卵细胞起到保护作用.子宫中雌激素对多种基因的表达都是通过非基... 详细信息

雌激素的非基因组调节模式在雌性生殖系统中广泛存在.雌激素通过基因组、非基因组及两种调节模式的整合在不同组织中行使多种生理功能.卵巢中雌激素能通过非基因组效应对卵细胞起到保护作用.子宫中雌激素对多种基因的表达都是通过非基因组模式.对雌激素非基因组效应的研究将有利于进一步了解雌激素的作用机制.

关键词：雌激素非基因组调节子宫卵巢

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