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马家柚叶绿体基因组特征及其密码子偏好性分析

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果树学报 2024年第5期41卷 824-846页

作者：尹明华余璐周佳慧刘李娜徐文萱孙美龄上饶师范学院生命科学学院上饶334001 上饶农业技术创新研究院上饶334001 上饶师范学院马家柚产业研究院上饶334001 上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室上饶334001 上饶市薯芋类作物种质保存与利用重点实验室上饶334001

【目的】为了明确马家柚叶绿体基因组结构特征及其与同属类群的系统发育关系,阐明马家柚在柑橘属中的分类地位,对马家柚叶绿体基因组的特征及其密码子的偏好性进行分析。【方法】采用DNBSEQ-T7测序平台对马家柚进行测序,采用Noveplastys... 详细信息

【目的】为了明确马家柚叶绿体基因组结构特征及其与同属类群的系统发育关系,阐明马家柚在柑橘属中的分类地位,对马家柚叶绿体基因组的特征及其密码子的偏好性进行分析。【方法】采用DNBSEQ-T7测序平台对马家柚进行测序,采用Noveplastys、CAP3、GeSeq和tRNAscan-SE软件对马家柚叶绿体基因组进行组装、注释;采用CGViewServer、MISA、REPuter、CodonW、Gview、IRscope、NADnaSP6.0软件对马家柚叶绿体基因组特征进行分析;采用MAFFT 7.0和FastTree 2.1.10软件对马家柚及其85个同科种和山小橘属3个外群种叶绿体基因组进行序列比对和建树。【结果】马家柚叶绿体基因组全长160186 bp,包括1个大单拷贝(LSC)区、1个小单拷贝(SSC)区和2个反向重复(IR)区,为典型闭合环状双链结构。马家柚叶绿体基因组共注释到133个功能基因,包括88个编码蛋白(CDS)基因、8个核糖体RNA(rRNA)基因和37个转运RNA(tRNA)基因。马家柚叶绿体基因组共检测到79个简单序列重复(SSR)和34个长序列重复(Longrepeat)。马家柚叶绿体基因组非编码区的变异程度高于基因编码区,LSC区的变异性>SSC区>IR区,SC/IR边界较为保守。马家柚叶绿体基因组平均ENC值为48.02,密码子偏好性较弱。马家柚叶绿体基因组密码子使用偏好性主要受自然选择的影响,受内部突变的影响小。马家柚叶绿体基因有10个最优密码子(AAU、UGU、AAA、UUU、GCU、GGA、CCA、ACU、CGU、AGU),均以A、U结尾。马家柚与西双版纳东试早柚(KY055833,来源地:云南)、日本夏橙(ON193075,来源地:韩国)、福建六月早蜜柚(MT527726,来源地:福建)、福建琯溪蜜柚(MN782007,来源地:福建)有亲缘关系。【结论】马家柚是一个柑橘属中较为独特的品种,该研究结果为进一步研究马家柚的遗传资源、物种资源鉴定和系统发育分析提供了理论依据。

关键词：马家柚叶绿体基因组序列特征密码子偏好性最优密码子系统发育分析

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茶树大面白叶绿体基因组特征、密码子偏好性及其系统发育分析

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茶叶科学 2024年第3期44卷 411-430页

作者：尹明华张嘉欣乐芸何凡凡黄添慧张牧彤上饶师范学院生命科学学院江西上饶334001 上饶农业技术创新研究院江西上饶334001 上饶师范学院马家柚产业研究院江西上饶334001 上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室江西上饶334001

茶树大面白(Camellia sinensis cv.‘Damianbai’)在1985年被全国农作物品种审定委员会认定为国家品种,其起源以及与其他茶树品种之间的进化关系尚不清晰。以茶树大面白为试验材料,采用高通量测序技术对茶树大面白叶绿体全基因组进行测... 详细信息

茶树大面白(Camellia sinensis cv.‘Damianbai’)在1985年被全国农作物品种审定委员会认定为国家品种,其起源以及与其他茶树品种之间的进化关系尚不清晰。以茶树大面白为试验材料,采用高通量测序技术对茶树大面白叶绿体全基因组进行测序、组装、注释,采用生物信息学软件对其叶绿体的基因组特征、系统发育和密码子偏好性进行分析。结果表明,茶树大面白叶绿体基因组全长157 129 bp,为典型的四分体结构,包括1个LSC区(86 687 bp)、1个SSC区(18 282 bp)和2个IR区(包括IRa和IRb,均为26 080 bp)。大面白叶绿体基因组共注释到135个功能基因,包括90个CDS基因;8个rRNA基因和37个tRNA基因。共检测到52个SSR和50个Longrepeat,SSR只有A/T单核苷酸重复序列,Longrepeat只存在正向重复和回文重复2种类型。茶树大面白叶绿体基因组密码子使用偏性主要受自然选择的影响,受内部突变压力的影响小。茶树大面白叶绿体基因有14个最优密码子(AAU、GAU、UGU、AAA、UAA、GCA、GCU、GGU、CCU、GUA、CGU、CUU、AGU、UCU)。茶树大面白与凤凰单丛茶白银(Camellia sinensis isolated Baiyin cultivar Phoenix Dancong Tea,OL690374)亲缘关系较近。本研究分析了大面白茶树叶绿体基因组序列特征及系统发育进化关系,为加强茶树大面白种质鉴定及其资源多样性的开发利用提供了参考依据。

关键词：茶树大面白叶绿体基因组序列特征密码子偏好性最优密码子系统发育分析

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响应面优化超声波辅助提取经烘烤预处理奇亚籽油工艺的研究

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中国粮油学报 2024年第2期39卷 125-130页

作者：何亚芬张继红余中霞方文超上饶市检验检测认证院药品检测分院上饶334000

以奇亚籽为原料,采用超声波辅助提取奇亚籽油。通过单因素设计实验研究溶剂种类、料液比、超声时间、烘烤温度、烘烤时间对奇亚籽出油率的影响。在单因素实验基础上通过响应面法优化了超声波辅助提取经烘烤预处理奇亚籽油脂的最佳工艺... 详细信息

以奇亚籽为原料,采用超声波辅助提取奇亚籽油。通过单因素设计实验研究溶剂种类、料液比、超声时间、烘烤温度、烘烤时间对奇亚籽出油率的影响。在单因素实验基础上通过响应面法优化了超声波辅助提取经烘烤预处理奇亚籽油脂的最佳工艺条件。结果表明,超声波提取奇亚籽油脂的最佳工艺条件为烘烤温度160℃,烘烤时间46 min,料液比1∶17,超声时间55 min。在最优工艺条件下,奇亚籽的出油率为(39.41±0.72)%。奇亚籽油中不饱和脂肪酸含量丰富,其中亚麻酸(C18∶3n3)质量分数最高为62.90%,亚油酸(C18∶2n6c)质量分数为18.25%。

关键词：奇亚籽油响应面法超声波辅助烘烤预处理

GdPO_(4)∶Tb^(3+)荧光粉的制备及发光性能研究

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人工晶体学报 2024年第1期53卷 107-114页

作者：孟晓燕廖云张丽蓉张雨蒙吴丽丹杨流赛上饶师范学院化学与环境科学学院上饶334001

稀土Tb^(3+)掺杂磷酸钆(GdPO_(4))绿色荧光粉是实现白光LED的潜在荧光粉,其常规水热法的制备存在反应时间较长、Tb^(3+)的掺杂量偏低等问题。本文采用水热法结合高温烧结制备了一系列Gd_(1-x)PO_(4)∶xTb^(3+)(x=0、1%、5%、11%、13%、... 详细信息

稀土Tb^(3+)掺杂磷酸钆(GdPO_(4))绿色荧光粉是实现白光LED的潜在荧光粉,其常规水热法的制备存在反应时间较长、Tb^(3+)的掺杂量偏低等问题。本文采用水热法结合高温烧结制备了一系列Gd_(1-x)PO_(4)∶xTb^(3+)(x=0、1%、5%、11%、13%、15%、17%、19%)样品,通过X射线衍射仪(XRD)、扫描电子显微镜(SEM)-能谱仪(EDS)、红外光谱仪(FT-IR)和荧光分光光度计对所得样品的相结构、形貌、元素组成、光学吸收和发光性能进行了表征。研究结果表明,所合成样品均为GdPO_(4)的纯相,属于单斜晶系独居石结构,且Tb^(3+)均匀分布在GdPO_(4)基质中引起晶格收缩。在274 nm的光激发下,GdPO_(4)∶Tb^(3+)荧光粉的最强发射峰位于545 nm处,属于Tb^(3+)的^(5)D_(4)→^(7)F_(5)跃迁,且其荧光猝灭摩尔分数高达15%,此样品(GdPO_(4)∶15%Tb^(3+))表现出优异的绿光发射和良好的热稳定性。

关键词：磷酸钆 Tb 3+掺杂水热法高温烧结发光性能绿色荧光粉

雷沙吉兰联合普拉克索治疗帕金森病患者的临床研究

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中国临床药理学杂志 2024年第15期40卷 2174-2177页

作者：程世宏林强郑俊俊上饶市立医院神经内科江西上饶334000 上饶市人民医院神经内科江西上饶334000

目的观察雷沙吉兰片联合普拉克索片治疗帕金森病患者的临床疗效及安全性。方法将帕金森病患者随机分为试验组和对照组。对照组接受普拉克索片,初始剂量为每天每次0.375 mg,后续每5~7 d增加每次0.75 mg,最终剂量为每天每次1.5 mg,对于... 详细信息

目的观察雷沙吉兰片联合普拉克索片治疗帕金森病患者的临床疗效及安全性。方法将帕金森病患者随机分为试验组和对照组。对照组接受普拉克索片,初始剂量为每天每次0.375 mg,后续每5~7 d增加每次0.75 mg,最终剂量为每天每次1.5 mg,对于病情持续控制不佳者,用药次数可调整为每天2次,每天最大剂量≤4.5 mg;试验组在对照组治疗的基础上,联合口服雷沙吉兰每天1.0 mg,qd。2组患者均治疗6个月。比较2组患者的临床疗效、炎症因子和血清学指标的水平、改良Webster症状评分,以及药物不良反应的发生情况。结果对照组入组67例,试验组入组68例,2组均无患者脱落。治疗后,试验组和对照组的总有效率分别为88.24%(60例/68例)和74.63%(50例/67例),在统计学上差异有统计学意义(P0.05)。结论雷沙吉兰片联合普拉克索片治疗帕金森病患者的临床疗效确切,其可减轻氧化应激反应和炎症反应,缓解运动症状,调节血清GABA和IGF-1表达水平,且不会明显增加药物不良反应的发生率。

关键词：甲磺酸雷沙吉兰片盐酸普拉克索片多巴丝肼片帕金森病临床疗效安全性评价