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高通量测序数据再分析在识别结直肠癌患者ERBB2扩增中的价值

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复旦学报（医学版） 2024年第2期51卷 166-171页

作者：沈敏娜张丽陈馨宁黄斐白超刚陈丽萌彭海翔周琰王蓓丽潘柏申郭玮复旦大学附属中山医院检验科上海200032 复旦大学附属中山医院厦门医院检验科厦门361015 上海市宝山区吴淞中心医院检验科上海200940 上海市老年医学中心检验科上海201104 上海顿慧医疗科技发展有限公司上海201615

目的评估未涵盖即ERBB2拷贝数变异(copynumbervariation,CNV)分析的高通量测序(highthroughput sequencing,HTS)数据再分析在识别结直肠癌患者ERBB2扩增中的价值。方法回顾性分析经病理活检确诊为结直肠癌并接受外周血cfDNA高通量测序... 详细信息

目的评估未涵盖即ERBB2拷贝数变异(copynumbervariation,CNV)分析的高通量测序(highthroughput sequencing,HTS)数据再分析在识别结直肠癌患者ERBB2扩增中的价值。方法回顾性分析经病理活检确诊为结直肠癌并接受外周血cfDNA高通量测序样本的检测数据252例。根据经免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)和/或荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)判断为ERBB2未扩增样本的HTS数据,计算17号染色体(Chr17)reads数占总reads数的比例范围,初步确定其为识别ERBB2扩增的阈值。根据初步阈值筛选可疑阳性样本,通过数字PCR、IHC和FISH进行验证。结果89例经IHC和/或FISH判定为ERBB2未扩增样本的Chr17 reads数与总reads数的比值为0.239±0.192(0.188~0.299)。以均数的1.25倍0.298作为识别ERBB2扩增的阈值分析其余163例样本数据,发现7例疑似阳性,比值为0.302~0.853。其中5例经IHC和/或FISH判定为阳性,6例经数字PCR验证为阳性,Chr17 reads与总reads数的比值与ERBB2/EIF2C1比值成正相关,相关性好(r2=0.909)。结论再分析未涵盖ERBB2 CNV分析的HTS数据可以初步识别结直肠癌患者的ERBB2扩增。

关键词：高通量测序(HTS) 数字PCR 免疫组织化学(IHC) 荧光原位杂交(FISH) 直肠癌

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智慧化急诊流水线在提升急诊检验效能与质量中的应用与探讨

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中华检验医学杂志 2024年第5期47卷 514-519页

作者：田佳乐权文强寄晓义李冬同济大学附属同济医院检验科上海200065

目的:探讨智慧化流水线在急诊检验中的应用价值。方法:收集同济大学附属同济医院急诊检验2019年6月24日至28日和2023年7月24日至28日两个时间段的各项指标数据进行回顾性研究。对智慧化流水线应用(启用气动传输装置)前后样本量的变化,... 详细信息

目的:探讨智慧化流水线在急诊检验中的应用价值。方法:收集同济大学附属同济医院急诊检验2019年6月24日至28日和2023年7月24日至28日两个时间段的各项指标数据进行回顾性研究。对智慧化流水线应用(启用气动传输装置)前后样本量的变化,和检验前周转时间(TAT)中位数和第90百分位数(P90)分别进行比较;调取并分析启用智慧化流水线自动质控前后同一批号质控品的质控相关数据;分析比较智慧化流水线自动审核规则应用前后实验室内TAT中位数和P90数;统计启用智慧化流水线基于患者样本的实时质量控制(PBRTQC)功能和基于质控品的室内质控方式对失控的检出效能。正态分布资料采用两独立样本t检验,偏态分布计量资料组间比较采用Mann-Whitney U检验进行统计分析。结果:智慧化急诊流水线气动传输装置运行后,急诊标本检验前TAT由27.1(18.0,47.7)min下降到24.3(15.2,34.9)min,差异有统计学意义(Z=-9.173,P0.05),且自动质控CV值与手工质控CV值均在允许范围内;干式生化质控品消耗由750μl/次,减少为600μl/次,使用量减少20%;质控操作时间由30 min/次降低到20 min/次,时间节省33.3%;质控人员数、人员走动距离均明显减少;PBRTQC功能的开发后质控失控检出率由0.82%提升到0.98%。启用智慧化流水线自动审核系统后实验室内TAT启用自动审核功能前的37.1(21.3,49.2)min下降到34.4(16.5,46.3)min,差异有统计学意义(Z=-10.062,P检验全程周转时间(ToTAT)和TAT分别由56.7(45.8,102.5)、37.4(21.5,49.6)min下降到53.3(42.1,98.3)、33.2(16.4,47.9)min,且差异均有统计学意义(Z=-7.176和-8.245,均P检验样本周转时间,有效提升急诊检验的质量和效率。

关键词：人工智能流水线急诊检验基于患者样本的实时质量控制全程周转时间周转时间

个体间生物学特征和采血时间对肌钙蛋白T浓度影响的研究

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中华检验医学杂志 2024年第3期47卷 259-263页

作者：林依婷周琰周佳烨张春燕王蓓丽潘柏申郭玮上海市老年医学中心检验科上海201100 复旦大学附属中山医院检验科上海200032

目的探讨性别、年龄、采血时间及季节和 cTnT 检测值变化的相关性。方法本研究选取了 2019 年 1月1日至12月31日, 复旦大学附属中山医院就诊的 3 548 例非心血管疾病的人群。收集基础资料, 包括性别、年龄、采血时间、病史、临床诊断和 ... 详细信息

目的探讨性别、年龄、采血时间及季节和 cTnT 检测值变化的相关性。方法本研究选取了 2019 年 1月1日至12月31日, 复旦大学附属中山医院就诊的 3 548 例非心血管疾病的人群。收集基础资料, 包括性别、年龄、采血时间、病史、临床诊断和 cTnT 检测结果, 最终入组了男性1 840例, 女性1 708例, 年龄分布为65(53, 75)岁。使用 Kolmogorov-Smirnov(K-S)检验评估数据分布, 其中非正态分布的数据以M(Q1, Q3)表示。使用 Mann-WhitneyU 检验比较男性与女性之间的 cTnT 浓度, 分析性别因素对cTnT检测结果的影响, 使用 Kruskal-Wallis 检验比较各性别组之间的 cTnT 水平, 分析不同采血时间、季节等因素与 cTnT 浓度的相关性。结果在 60 岁以上的人群中, 男性和女性的cTnT 浓度均随着年龄的增长而逐渐升高, cTnT 在 90 岁以上的个体中达到最高水平(男性为 0.028 ng/ml, 女性为 0.018 ng/ml)。全年龄组分析中显示, 男性cTnT 水平(0.012 ng/ml)均高于女性(0.009 ng/ml)(H=6.340, P<0.01)。不同采血时间点的 cTnT 浓度不同。在男性和女性中, cTnT 浓度在 8:00 和 13:00 达到最大值(分别为 0.013 ng/ml 和 0.012 ng/ml)。分析季节对cTnT分泌的生理性影响, 结果显示春季和冬季的cTnT 水平(0.012 ng/ml)通常高于夏、秋两季(0.010 ng/ml)。结论 cTnT 检测值与性别、年龄、采血时间和季节等因素相关。临床工作中分析cTnT检测结果时, 应综合考虑个体的性别和年龄, 以及采血时间点和季节因素的影响。

关键词：肌钙蛋白生物学因素性别年龄采血时间季节变化

液相色谱-串联质谱检测血清褪黑素方法建立和临床应用研究

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中华检验医学杂志 2024年第7期47卷 812-818页

作者：彭颖斐王真昕陈方俊秦嘉倩潘柏申王蓓丽郭玮复旦大学附属中山医院检验科上海200032

目的:建立液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)定量检测人血清褪黑素的检测方法。方法:方法学评价研究。收集2022年2月至2023年3月就诊于复旦大学附属中山医院心理医学科门诊,182例初诊睡眠障碍患者[男56例,女162例,年龄(45.51±16.31)岁]以及... 详细信息

目的:建立液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)定量检测人血清褪黑素的检测方法。方法:方法学评价研究。收集2022年2月至2023年3月就诊于复旦大学附属中山医院心理医学科门诊,182例初诊睡眠障碍患者[男56例,女162例,年龄(45.51±16.31)岁]以及182名表观健康人群[男性87名,女性95名,年龄(48.55±11.93)岁],检测两组人群血清褪黑素水平。使用液相色谱质谱系统,采用色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.8μm)进行分离。柱温35℃,流动相为0.1%的甲酸水溶液和纯乙腈,流速为0.4 ml/min梯度洗脱。以褐黑素-d4作为内标建立方法,进行方法学预验证,评价特异性和选择性、基质效应、携带污染、重复性。随后进行性能验证,评价定量下限、线性、精密度、回收率、稀释一致性和血清样本稳定性等参数。结果:褪黑素的最低定量限为1 pg/ml,检测线性范围为1~500 pg/ml(r=0.999)。日间和批内不精密度的变异系数(CV)为3.07%~6.86%,均符合小于15%的要求,加标回收率结果为105.91%~116.30%。睡眠障碍组血清褪黑素的水平明显低于健康对照组[2.00(1.00,3.28)]比[8.35(4.28,14.80)]pg/ml,P<0.001。结论:新建立的血清褪黑素LC-MS/MS检测方法分析性能符合要求,可用于检测血清中褪黑素含量。

关键词：质谱分析法液相色谱-质谱褪黑素性能验证

血清蛋白电泳筛查单克隆丙种球蛋白533989例结果分析

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中华检验医学杂志 2024年第1期47卷 65-71页

作者：沈若坚邵文琦朱晶沈逸枫潘柏申王蓓丽郭玮复旦大学附属中山医院检验科上海200032

目的比较不同性别、年龄人群间血清蛋白电泳(SPE)各区带分布差异,探讨血清蛋白电泳筛查单克隆丙种球蛋白(M蛋白)的临床应用。方法回顾性分析复旦大学附属中山医院2018年1月至2019年12月533989例SPE结果,其中住院患者435479例,为血液内... 详细信息

目的比较不同性别、年龄人群间血清蛋白电泳(SPE)各区带分布差异,探讨血清蛋白电泳筛查单克隆丙种球蛋白(M蛋白)的临床应用。方法回顾性分析复旦大学附属中山医院2018年1月至2019年12月533989例SPE结果,其中住院患者435479例,为血液内科、肾病科、脊柱外科、内分泌科及风湿免疫科患者;表观健康人群98510名,为体检健康人群。比较不同性别和年龄段(≤20、21~30、31~40、41~50、51~60、61~70、71~80、81~90、≥91岁)人群的白蛋白、α1球蛋白、α2球蛋白、β1球蛋白、β2球蛋白及γ球蛋白区带差异分布。筛选出10014例同时完成SPE和免疫固定电泳(IFE)检测的标本,分析SPE各区带及IFE不同条带类型的阳性检出率,以IFE为金标准,评价SPE方法的敏感度和特异度。结果不同性别人群的SPE各区带占比差异均无统计学意义(P均>0.05)。表观健康人群、住院患者不同年龄段白蛋白区带占比差异均有统计学意义(表观健康人群:F=5.12,P<0.05;住院患者:F=4.18,P<0.05),且均随年龄的增长而下降;γ球蛋白区带占比随年龄的增长而上升(表观健康人群:F=1.34,P<0.05;住院患者:F=1.24,P<0.05)。SPE检测M蛋白的敏感度为69%(2098/3051),特异度97%(6721/6963),与IFE法比较,M蛋白阳性检出率差异有统计学意义(χ^(2)=5049.94,P<0.05);γ球蛋白区M蛋白阳性检出率(21.11%,2114/10014)高于β球蛋白区(3.28%,328/10014)(χ^(2)=90.74,P<0.05)和β-γ球蛋白区(1.63%,163/10014)(χ^(2)=44.34,P<0.05);γ球蛋白区常见IgG及IgM型条带,其中IgG-κ型占94.1%(995/1058)、IgG-λ型占94.8%(690/728)、IgM-κ型占89.2%(222/249)、IgM-λ型占83.8%(62/74);β球蛋白区常见IgA型条带,其中IgA-κ型占49.8%(103/207)、IgA-λ型占51.6%(149/289);IgG-κ型在IFE各条带类型中M蛋白的阳性检出率[10.57%(1058/10014)]最高,IgM-λ型M蛋白的阳性检出率[0.74%(74/10014)]最低。结论随着年龄增长,SPE的白蛋白区带占比下降,γ球蛋白区带占比上升。IgG、IgM型M蛋白大多聚集于γ球蛋白区带,其中IgG型M蛋白阳性检出率较高,IgA型大多聚集于β球蛋白区带,阳性检出率较低。

关键词：血蛋白电泳免疫电泳单克隆丙种球蛋白

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非酒精性脂肪性肝病的表观遗传学研究进展

复旦学报（医学版） 2024年第2期51卷 262-267页

作者：张雅坤王蓓丽郭玮复旦大学附属中山医院检验科上海200032

非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是一种从相对良性的肝脏脂肪变性到非酒精性的脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的代谢性肝病。NASH以持续性肝损伤、炎症和肝纤维化为特征,并显著地增加了肝... 详细信息

非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)是一种从相对良性的肝脏脂肪变性到非酒精性的脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的代谢性肝病。NASH以持续性肝损伤、炎症和肝纤维化为特征,并显著地增加了肝硬化和肝细胞癌等终末期肝病的风险。目前关于NAFLD/NASH的发病机制仍不明确,但是近来该病在表观遗传学领域的研究进展给该病的发病机制提供了新的视角。本文综述了该领域近来的研究进展,为阐明NAFLD的发病机制奠定了坚实的基础,并为该病的早发现、早诊断、早治疗提供了潜在的靶点。

关键词：非酒精性脂肪性肝病(NAFLD) 表观遗传学甲基化组蛋白修饰 miRNA m6A lncRNA

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智慧检验医学实验室的现状与发展趋势

中华检验医学杂志 2024年第5期47卷 467-471页

作者：关明胡尧复旦大学附属华山医院检验科上海200040

智慧检验医学实验室的发展趋势涵盖了实验室自动化、信息管理智能化、医疗大数据分析以及人工智能医疗设备等方面。这些技术的不断发展和应用将推动检验医学实验室向更高效率、更智能化和更安全的方向发展,为提高医疗服务质量、提升患... 详细信息

智慧检验医学实验室的发展趋势涵盖了实验室自动化、信息管理智能化、医疗大数据分析以及人工智能医疗设备等方面。这些技术的不断发展和应用将推动检验医学实验室向更高效率、更智能化和更安全的方向发展,为提高医疗服务质量、提升患者满意度以及推动检验医学的高质量发展发挥重要作用。

关键词：检验医学实验室自动化人工智能

VITROS XT 3400生化检测系统急诊样本检测时间分析

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中华检验医学杂志 2024年第5期47卷 570-573页

作者：戴谦王扣琼张春燕王蓓丽潘柏申郭玮复旦大学附属中山医院检验科上海200032

目的:分析VITROS XT 3400生化检测系统急诊样本检测时间,评估其检测方法。方法:回顾性分析2020年8月至2022年7月复旦大学附属中山医院急诊检验科所有包含白蛋白(Alb)、总蛋白(TP)、丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)、肌酐(Cr)、... 详细信息

目的:分析VITROS XT 3400生化检测系统急诊样本检测时间,评估其检测方法。方法:回顾性分析2020年8月至2022年7月复旦大学附属中山医院急诊检验科所有包含白蛋白(Alb)、总蛋白(TP)、丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)、肌酐(Cr)、血尿素氮(BUN)、钙(Ca)和葡萄糖(Glu)项目的样本,计算复合干片项目配对率。采集2022年6月20—26日复旦大学附属中山医院急诊科635例患者血清样本,分别在VITROS XT 3400(复合干片)与VITROS 4600(普通干片)仪器上进行检测,比较2组样本检测时间和低、高峰时间段的样本检测时间差异,及2台仪器试剂更换与日保养时间。结果:3对复合干片项目(Alb-TP、AST-ALT、Cr-BUN)配对率均>99%;VITROS XT 3400组样本检测时间低于VITROS 4600组[(945±477)s比(1101±567)s,t=20.378,P<0.001];低、高峰时段VITROS XT 3400组样本检测时间均低于VITROS 4600组[低峰时段(n=322):(857±567)s比(905±528)s,t=13.102,P<0.001;高峰时段(n=313):(1035±400)s比(1303±492)s,t=21.876,P<0.001];VITROS XT 3400组试剂更换时间低于VITROS 4600组[(690±127)s比(869±152)s,t=11.470,P<0.001];VITROS XT 3400组日保养时间与VITROS 4600组比较,差异无统计学意义[(1771±123)s比(1765±95)s,t=0.238,P=0.834]。结论:VITROS XT 3400(复合干片)较VITROS 4600(普通干片)对急诊样本的检测速度快,能更好地缓解检测压力。

关键词：临床实验室技术周转时间生化监测复合干片

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电泳技术在检验医学中的应用与发展

中华检验医学杂志 2024年第1期47卷 4-6页

作者：王蓓丽郭玮潘柏申复旦大学附属中山医院检验科上海200032

电泳技术创建于20世纪50年代,经过这些年的发展,已经衍生出许多技术分支,在临床检验与科学研究中发挥着重要作用。自动化、智能化、微量化将推动电泳技术在辅助临床疾病诊疗与机制研究中不断发展前进。

关键词：血蛋白电泳检验医学临床实验室技术