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团头鲂选育家系亲子鉴定方法的建立

水生生物学报 2024年第8期48卷 1378-1384页

作者：王会虎任超郑国栋邹曙明上海海洋大学农业农村部团头鲂遗传育种中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

研究旨在建立一套准确、经济的团头鲂(Megalobrama amblycephala)家系鉴定体系,以期为团头鲂的遗传参数评估及基因组和分子标记育种奠定基础。精选8个高多态性的微卫星标记对二段法筛选后的228尾耐低氧快生长团头鲂“浦江2号”子代进行... 详细信息

研究旨在建立一套准确、经济的团头鲂(Megalobrama amblycephala)家系鉴定体系,以期为团头鲂的遗传参数评估及基因组和分子标记育种奠定基础。精选8个高多态性的微卫星标记对二段法筛选后的228尾耐低氧快生长团头鲂“浦江2号”子代进行亲子鉴定分析,利用CERVUS软件分析实验结果。等位基因频率分析结果显示8个微卫星标记的平均等位基因数(N_(a))为8个,平均观测杂合度(H_(o))为0.813,平均期望杂合度(H_(e))为0.775,平均多态信息含量(PIC)为0.743。亲子鉴定结果显示双亲性别已知时8个微卫星标记的累积排除概率为0.9999,说明筛选出的8个微卫星标记适用于团头鲂家系的亲子鉴定分析。当使用筛选的8个微卫星标记进行亲子鉴定时,228尾团头鲂子代中有221尾子代能找到其父母本,实际鉴定率为96.93%,这与实际记录的系谱信息一致。研究成功地为筛选后的耐低氧团头鲂个体找到父母本并划分家系,为进一步开展遗传参数的评估工作奠定了基础。

关键词：微卫星亲子鉴定累积排除概率

洋山港海域码头人工潮间带大型底栖无脊椎动物群落变化

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动物学杂志 2024年第1期59卷 37-48页

作者：张宇袁林薛俊增上海海洋大学海洋生态与环境学院上海海洋大学港航生态安全中心上海201306

洋山港是世界第一大集装箱港,自2002年开始至2017年共完成四期工程建设,期间港口建设中形成了8000余米的码头人工岸线,受港区一至四期工程的顺序建设、岛礁连接、围海造地和港口运营的远洋船舶停靠等影响,港口海域生态环境也逐步出现相... 详细信息

洋山港是世界第一大集装箱港,自2002年开始至2017年共完成四期工程建设,期间港口建设中形成了8000余米的码头人工岸线,受港区一至四期工程的顺序建设、岛礁连接、围海造地和港口运营的远洋船舶停靠等影响,港口海域生态环境也逐步出现相应变化,导致包括潮间带大型底栖无脊椎动物在内的海洋生物群落均受到相应影响。本研究于2021和2022年(第四期工程建设后)在洋山港港区二号码头与港区海域大洋山码头人工潮间带采集了大型底栖无脊椎动物,并对其群落结构与特征进行分析,同时与2009和2010年(第四期工程建设初)的历史调查资料对比,分析了第四期工程建设以来洋山港海域码头人工潮间带大型底栖无脊椎动物的群落变化。结果显示,洋山港海域码头人工潮间带大型底栖无脊椎动物种类数量由第四期工程建设前的17种增加至第四期工程建设后的28种,其中软体动物由8种增加至15种,节肢动物由7种增加至9种,腔肠动物增加至3种,环节动物增加至1种;跨海区入侵种东方小藤壶(Chthamalus challengeri)消失,而纹藤壶(Amphibalanus amphitrite)重新出现并成为优势种;洋山港人工码头潮间带大型底栖无脊椎动物群落密度最高值由第四期工程建设初的(6333.30±1495.49)ind/m^(2)增加至(6517.33±119.67)ind/m^(2),生物量最高值由第四期工程建设初的(1977.04±281.87)g/m^(2)增加至(3724.69±940.94)g/m^(2);洋山港人工码头潮间带群落生物多样性指数有所上升而大洋山人工码头下降显著。与洋山港第四期工程建设初相比,洋山港海域码头人工潮间带大型底栖无脊椎动物群落种类组成已经发生变化,群落生物多样性指数与丰度-生物量曲线(ABC曲线)分析结果均表明,目前洋山港海域生态环境处于中等污染水平。受港区运营影响,码头人工潮间带大型底栖无脊椎动物群落仍受到中等程度的干扰,群落结构不稳定。

关键词：洋山港人工潮间带码头大型底栖无脊椎动物

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海洋贝类对盐度胁迫适应机制的研究进展

水产学报 2024年第4期48卷 32-44页

作者：牛东红王宏蕾李家乐上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心

盐度是影响海洋贝类存活、生长、发育、繁殖等生命活动的关键因素，其生命活动时刻受到海洋局部环境中盐度变化的影响。对海洋贝类适应盐度胁迫机制的研究是学术界长期关注的问题。大量研究表明，盐度胁迫会对海洋贝类的生长、渗透调节... 详细信息

盐度是影响海洋贝类存活、生长、发育、繁殖等生命活动的关键因素，其生命活动时刻受到海洋局部环境中盐度变化的影响。对海洋贝类适应盐度胁迫机制的研究是学术界长期关注的问题。大量研究表明，盐度胁迫会对海洋贝类的生长、渗透调节、能量代谢和免疫反应等生物学过程产生影响。近年来，随着基因组、转录组等组学技术的发展和广泛应用，许多研究从分子水平来探讨海洋贝类适应盐度胁迫的机制。本文综述了海洋贝类在盐度胁迫过程中的调控机制，包括渗透调节、能量代谢、免疫反应，以及转录组和基因组在海洋贝类盐度胁迫机制研究中的应用，提出了广盐性海洋贝类在盐碱水领域中的开发潜力，为海洋贝类抗逆品种选育以及绿色养殖提供重要参考。

关键词：海洋贝类盐度胁迫盐碱水渗透调节能量代谢免疫反应

潮-径相互作用下甬江总氮污染的降解、扩散及分布模拟

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中国环境科学 2024年第1期44卷 344-351页

作者：陈勤思胡松王晓华刘鹏霞刘星高照诠生态环境部太湖流域东海海域生态环境监督管理局生态环境监测与科学研究中心上海200125 上海海洋大学海洋生态系统与环境实验室上海201306 浙江省海洋生态环境监测中心浙江舟山316021

基于非结构有限体积法海洋模式(FVCOM)建立了宁波—舟山海域的水动力模型,结合海域海水监测数据分析了区域内总氮浓度的分布情况及影响污染物输运的动力因素,进而采用表观降解系数方法在示踪物(DYE)模块中补充了浓度衰减机制,从而对甬... 详细信息

基于非结构有限体积法海洋模式(FVCOM)建立了宁波—舟山海域的水动力模型,结合海域海水监测数据分析了区域内总氮浓度的分布情况及影响污染物输运的动力因素,进而采用表观降解系数方法在示踪物(DYE)模块中补充了浓度衰减机制,从而对甬江入海总氮污染物在2021年丰水期条件下的降解、扩散及分布进行了模拟分析.模拟结果表明,甬江输入到宁波—舟山海域的总氮污染物是造成2021年夏季宁波市镇海区、北仑区近岸海域海水总氮浓度出现高值的重要因素.在潮汐和甬江径流的共同作用下,甬江输入到宁波—舟山海域的总氮污染物将在短期内显著影响到宁波市镇海区东部和北部海域海水质量.以2021年夏季为例,考虑降解过程后,模拟结果显示甬江输入的总氮污染物在90d内使宁波市近岸站位海水总氮浓度增加约0.7mg/L.

关键词：非结构有限体积法海洋模式(FVCOM) 示踪物(DYE) 甬江总氮表观降解系数数值模拟

海带PEPC功能区的原核重组表达及功能鉴定

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水产学报 2024年第10期48卷 42-52页

作者：秦天明金迷娜方佩佩毕燕会周志刚上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心

与其他大型海藻一样，海带同样具备无机碳浓缩机制(CCM)，以实现高光合作用效率和生产力。胞质磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)被认为是海带CCM的重要组件，但目前尚没有关于海带胞质PEPC相关研究报道... 详细信息

与其他大型海藻一样，海带同样具备无机碳浓缩机制(CCM)，以实现高光合作用效率和生产力。胞质磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC)被认为是海带CCM的重要组件，但目前尚没有关于海带胞质PEPC相关研究报道。本研究自海带配子体全长转录组数据库中筛选到一条可能位于细胞质的PEPC编码基因的cDNA全长序列。通过RT-PCR方法验证，获得SjPEPC基因的cDNA全长，为3 503 bp，包含2 850 bp的完整开放阅读框、50 bp的5'-UTR和603 bp的3'-UTR。SjPEPC编码一个含949个氨基酸残基的蛋白，相对分子质量为104.91 ku，等电点为7.31。多序列比对显示PEPC的功能位点在不同物种中高度保守，系统演化及序列结构分析表明SjPEPC属于细菌型的PEPC。选取编码SjPEPC功能区的核苷酸序列，利用同源重组技术构建了pET32aSjPEPC原核表达载体，经过诱导和纯化，得到了分子质量大小为86.3 ku的重组蛋白(rSjPEPC)，酶活性测定结果显示，rSjPEPC具有催化PEP发生羧化的活性，比活力为(9.37±0.46) U/mg prot。研究表明，PEPC在海带无机碳储存中可能具有重要功能。本研究可为进一步解析海带CCM提供了分子和生物化学证据。

关键词：海带配子体磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶原核表达酶活性测定

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黄东海海域台风浪特征分析

应用海洋学学报 2024年

作者：邱梓欣程天宇高郭平陈洁龙逢鑫上海海洋大学海洋科学与生态环境学院上海市海洋监测预报中心

紧邻长江口的黄东海海域航线密集，航运繁忙，热带气旋(tropical cyclone,TC)产生的极端海浪显著威胁船舶航行安全。本研究利用1949—2022年间影响黄东海海域的TC最佳路径数据集提取风场数据，并驱动SWAN(Simulating WAves Nearshore)... 详细信息

紧邻长江口的黄东海海域航线密集，航运繁忙，热带气旋(tropical cyclone,TC)产生的极端海浪显著威胁船舶航行安全。本研究利用1949—2022年间影响黄东海海域的TC最佳路径数据集提取风场数据，并驱动SWAN(Simulating WAves Nearshore)海浪模式，获得TC影响下的海浪数据，分析历史台风浪的发生强度、频次和空间分布等特征，探讨不同TC移动速度下的海浪不对称分布特征及危险性海浪的主要可能成因。结果表明，TC影响下，研究海域的海浪强度和出现频率呈现显著的空间差异性，海浪危险等级呈现由东南向西北海域递减的分布特征，极端台风浪的主导波向为SE向。研究海域内，东南部外海海域属于海浪高危险区，30°N以南的近海海域的海浪危险等级相对高于30°N以北的近海海域。台风浪呈现明显的不对称分布，右前侧象限的有效波高值更大、波长更长、波周期更长，同时，移动速度介于3.0～7.0m/s的中速移动TC引起的海浪场不对称性最明显。

关键词：热带气旋 SWAN模式极端海浪波要素不对称分布黄东海海域

中华绒螯蟹3种亲本规格子代的生长、肠道微生物菌群和代谢组学分析

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上海海洋大学学报 2024年第1期33卷 43-52页

作者：周振旗关伟晔谢昕洋侯鑫王军王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)繁育亲蟹规格及其子代的生产性能是产业上的热点问题。本研究应用个体生长测定法和代谢组学技术,研究了当前生产上3种主要育苗亲蟹规格(母本200~250 g,父本300~350 g;母本250~300 g,父本350~400 g;母本30... 详细信息

中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)繁育亲蟹规格及其子代的生产性能是产业上的热点问题。本研究应用个体生长测定法和代谢组学技术,研究了当前生产上3种主要育苗亲蟹规格(母本200~250 g,父本300~350 g;母本250~300 g,父本350~400 g;母本300 g以上,父本400 g以上)繁殖子代(规格A、规格B和规格C)的蜕壳与生长特性、肠道微生物菌群和肝胰腺代谢物的组成差异。结果发现:在2次个体蜕壳与生长测定中,规格C的生长性能优于其他2种规格,但3种规格子代相互间的蜕壳增重率、蜕壳间隔、肥满度、肝胰腺指数和肌肉指数均不存在显著差异。肠道菌群结果表明:α多样性指数均显示规格A低于其他2种规格,但3种规格相互间无显著差异,而主坐标分析(PCoA)显示3种规格肠道菌群在属水平上存在显著差异。肝胰腺的代谢组学分析显示,规格A与B间共有100种差异代谢物,规格B与C间共有77种差异代谢物,规格A与C间共有79种差异代谢物。对差异肠道菌群和差异代谢物进行Pearson相关性分析发现:规格A的代谢物生物喋呤与副梭菌属呈显著正相关;规格B的代谢物N-乙酰-D-甘露糖胺分别与硝基螺菌门、硝化螺菌属呈显著负相关;规格C的代谢物四氢二吡啶甲酸盐与乳酸菌属呈显著负相关。研究结果初步表明:不同亲蟹规格子代在生长性能、肠道微生物菌群和肝胰腺代谢物组成方面表现出一定差异。

关键词：中华绒螯蟹亲蟹大小蜕壳生长肠道菌群代谢组学

中华绒螯蟹Kcna基因功能及其与生长性状的关联分析

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上海海洋大学学报 2024年第3期33卷 533-542页

作者：薛磊侯鑫曾详健陈晓雯王军王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为探究中华绒螯蟹Kcna基因的结构、表达模式及生长发育中的分子功能,克隆了中华绒螯蟹Kcna(命名为Es-Kcna)基因的全长,并开展了生物信息学分析和时空表达模式研究;观察了干扰Kcna基因后中华绒螯蟹生长表型性状的变化;筛选了Es-Kcna基因... 详细信息

为探究中华绒螯蟹Kcna基因的结构、表达模式及生长发育中的分子功能,克隆了中华绒螯蟹Kcna(命名为Es-Kcna)基因的全长,并开展了生物信息学分析和时空表达模式研究;观察了干扰Kcna基因后中华绒螯蟹生长表型性状的变化;筛选了Es-Kcna基因的SNP标记并与种群地理分布、生长性状进行了关联分析。结果显示:Kcna基因位于中华绒螯蟹第46号染色体上,全长945304 bp,含有9个外显子;其中,cDNA全长2080 bp,开放阅读框1584 bp,编码527个氨基酸;原子总量为8433,分子结构式为C_(2719)H_(4210)N_(702)O_(787)S_(15),预测蛋白等电点(pI)为5.23,相对分子量为59.81 Ku。系统进化树分析显示Es-Kcna基因与三疣梭子蟹Kcna基因的亲缘关系最近。荧光定量PCR结果显示Es-Kcna基因在蜕壳前期、蜕壳间期和蜕壳后期的肌肉、心脏、肠道等6种组织中均有表达,其中以肌肉组织中的表达丰度最高。与对照组相比,干扰Kcna基因的表达后,实验组蟹的体质量、蜕壳增重率和第二步足长度显著降低;肌肉组织切片结果显示实验组步足肌肉肌纤维直径小于对照组。此外,在Es-Kcna基因的第8外显子上鉴定出1个SNP位点(A1461G),该位点在辽河野生群体显著富集GG基因型,而在长江野生群体富集AA基因型。生长性状的关联分析表明,具有AA型个体的步足长度显著长于GG型个体。本研究为Kcna基因调控中华绒螯蟹生长的分子功能和遗传育种研究提供了研究基础,并为区分长江、辽河野生中华绒螯蟹提供重要参考。

关键词：中华绒螯蟹 Kcna 基因结构 RNA干扰 SNP

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海洋平台建造甲板板识别技术研究

舰船科学技术 2024年第15期46卷 159-163页

作者：刘玉玺刘超汪磊艾伟赵渊谭程海洋石油工程股份有限公司天津300452 天津大学天津300350 国家国防科技工业局信息中心北京100143

当前自动化技术蓬勃发展,已经广泛应用到工业生产、金融、安防以及交通领域,极大地推动了包括制造业在内的众多行业的转型发展。同样的,用于海洋平台甲板片预制也在积极的进行自动化改造,想要实现甲板片预制作业自动化,如何识别甲板板... 详细信息

当前自动化技术蓬勃发展,已经广泛应用到工业生产、金融、安防以及交通领域,极大地推动了包括制造业在内的众多行业的转型发展。同样的,用于海洋平台甲板片预制也在积极的进行自动化改造,想要实现甲板片预制作业自动化,如何识别甲板板是必须要面对的问题,识别甲板板主要难点在于甲板板尺寸较大,想要准确识别大尺寸工件,需要对识别方案进行相应的设计。本文在充分了解国内外识别技术发展现状的基础上,提出了视觉识别、标签识别等方案。针对以上方案,进行了详细的优缺点对比。实现识别技术在甲板片预制作业的应用,将有效地提高车间工作效率,也将为制造业其他类似作业内容提供新的思路。

关键词：车间自动化海洋工程识别技术