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鱼菜共生系统中乳酸菌的筛选及其发酵矿化应用

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农业工程学报 2024年第11期40卷 119-127页

作者：蒋金辰徐琰斐单建军张宇雷高霞婷中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所上海200092 农业农村部水产养殖设施工程重点实验室上海200092 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

针对鱼菜共生系统固体废弃物资源化利用效率低的问题,该研究旨在筛选出抗逆性好、矿化功能强的鱼源性乳酸菌,加强鱼粪残饵的发酵矿化性能。试验从鱼菜共生系统中的生物滤料和鱼体中分离乳酸菌,并通过抗逆性及发酵矿化性能检测,筛选出2... 详细信息

针对鱼菜共生系统固体废弃物资源化利用效率低的问题,该研究旨在筛选出抗逆性好、矿化功能强的鱼源性乳酸菌,加强鱼粪残饵的发酵矿化性能。试验从鱼菜共生系统中的生物滤料和鱼体中分离乳酸菌,并通过抗逆性及发酵矿化性能检测,筛选出2株具有应用潜力的鱼粪残饵矿化菌株,经鉴定分别为乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)L1和糊精乳杆菌(Lactobacillus dextrinicus)L2。耐温性、耐酸碱性和耐盐性检测结果显示,L1表现出较好的抗逆性。在50℃时,L1存活率为96.60%,显著高于L2的存活率80.35%(P所述,乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)具有较强的抗逆性和显著的发酵矿化效果,且其最佳发酵矿化周期为3 d。该研究可为提高鱼菜共生系统固体废弃物资源化利用效率提供技术支持。

关键词：乳酸菌发酵矿化矿物盐鱼菜共生抗逆性

沉积物-水界面生物扰动对湿地甲烷排放影响研究进展

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生态学杂志 2024年

作者：陈大屡赵璐峰唐建军胡亮亮陈欣浙江大学生命科学学院上海海洋大学水产与生命学院

沉积物-水界面是湿地生态系统物质循环的重要环节，其中生物扰动对水体和沉积物之间甲烷产生、氧化和运输有着复杂的影响，成为近些年研究的热点。本文系统回顾了扰动生物类型及其扰动特征，并综述了沉积物-水界面的生物扰动如何影响湿... 详细信息

沉积物-水界面是湿地生态系统物质循环的重要环节，其中生物扰动对水体和沉积物之间甲烷产生、氧化和运输有着复杂的影响，成为近些年研究的热点。本文系统回顾了扰动生物类型及其扰动特征，并综述了沉积物-水界面的生物扰动如何影响湿地甲烷排放的研究现状，以期为湿地生态系统碳汇功能的深入研究及科学管理提供参考。目前大部分研究表明，生物扰动增加湿地甲烷排放，但不同扰动生物类型的影响程度不同。生物扰动可以通过改变沉积物有机碳分布、营养盐通量及氧化还原电位条件而影响产甲烷和甲烷氧化的微生物过程，还可以直接改变沉积物结构与孔隙度从而促进甲烷的冒泡运输。此外，扰动生物也可以通过沉积物-水界面的植被和水生生物食物链间接地影响甲烷排放。今后还应从以下几个方面加强研究：（1）多时空尺度；（2）关注扰动生物与其他生物的相互作用；（3）多学科技术融合；（4）关注气候变化下扰动生物的响应；（5）促进应用研究的发展。

关键词：甲烷沉积物生物扰动湿地冒泡甲烷氧化

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南极半岛周边海域南极磷虾栖息地适应性

水产学报 2024年第6期48卷 48-57页

作者：王嘉龙刘慧朱国平上海海洋大学海洋生物资源与管理学院上海海洋大学极地研究中心上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室极地海洋生态系统研究室上海海洋大学国家远洋渔业工程技术研究中心

南极磷虾作为南极生态系统中的关键物种，其栖息地适应性研究对可持续利用磷虾资源和了解南大洋生态系统均有重要作用。然而，不同的模型算法会导致估算的磷虾栖息地适宜性出现较大的偏差。为了探索构建磷虾栖息地指数模型的合适方法，... 详细信息

南极磷虾作为南极生态系统中的关键物种，其栖息地适应性研究对可持续利用磷虾资源和了解南大洋生态系统均有重要作用。然而，不同的模型算法会导致估算的磷虾栖息地适宜性出现较大的偏差。为了探索构建磷虾栖息地指数模型的合适方法，实验利用海表温度(sea surface temperature,SST)、海平面高度(sea surface height,SSH)、海表面叶绿素(sea surface chlorophyll,SSC)、海冰密集度(sea ice concentration,SIC)等环境因子，分别采用神经网络拟合和一元非线性拟合方法，并结合最小值法、最大值法、连乘法、算术平均法、几何平均法、加权算术平均法等算法构建磷虾栖息地适宜性指数(habitat suitability index,HSI)模型。结果显示，神经网络模型预报结果更符合磷虾实际栖息分布情况，而一元非线性拟合预测结果较为连续。最大值法和最小值法计算结果差异较大，容易引进较大的误差。连乘法的预测效果较好，算术平均法、几何平均法和加权算术平均法的预测结果相似，且较为稳定。研究表明，神经网络模型是构建南极磷虾HSI模型的合适方法。此外，使用连乘法和加权算术平均法等算法能够提高模型预测结果的准确性和稳定性，而最大值法和最小值法要慎重使用。本研究的方法和结论有助于评估类似物种在栖息地方面的适宜性，对未来磷虾资源的评估和南极生态系统管理具有启示意义。同时，该研究也为其他生态学领域中栖息地适宜性研究提供参考。

关键词：南极磷虾栖息地适应性指数神经网络一元非线性拟合南极半岛

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基于被动声学的对虾摄食行为研究进展

渔业现代化 2024年第5期51卷 1-8页

作者：刘慧仪田昌凤刘晃车轩王晓萌中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所上海200092 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

被动声学监测(Passive acoustic monitoring, PAM)技术可在对水生生物不造成干扰或损害的情况下获取水生生物的声音信息,并利用这些信息进行各种生态研究和养殖活动管理。随着对虾养殖技术的不断提高和进步,对虾的养殖密度持续增加,但... 详细信息

被动声学监测(Passive acoustic monitoring, PAM)技术可在对水生生物不造成干扰或损害的情况下获取水生生物的声音信息,并利用这些信息进行各种生态研究和养殖活动管理。随着对虾养殖技术的不断提高和进步,对虾的养殖密度持续增加,但是饲料利用率低、水质恶化等问题严重制约对虾养殖的快速发展。利用被动声学监测技术可实现智能化的自动投饲,提高饲料利用率和缓解水质恶化。文章主要阐述了对虾的摄食过程及其影响因素,总结了近年来被动声学监测技术在对虾摄食声信号的研究进展和应用情况,分析了被动声学监测技术的优缺点,并针对存在的问题提出未来的发展趋势,以期为自动投饲系统走向智能化提供参考。

关键词：被动声学监测技术对虾摄食发声信号

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臭氧对养殖水体中颗粒物的絮凝和破碎作用

水产科学 2024年第5期43卷 757-766页

作者：程翔宇刘兴国陈哲肖述文潘恒丰张旺上海海洋大学水产与生命学院上海201306 中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所上海200092

为探明臭氧对水产养殖污水中悬浮颗粒物的絮凝和破碎作用,使用不同质量浓度臭氧对循环水生物絮团对虾养殖系统中水体进行氧化处理,并对水体中的水质指标、悬浮颗粒物粒径分布变化等进行分析,试验结果显示:不同质量浓度臭氧处理使水体中... 详细信息

为探明臭氧对水产养殖污水中悬浮颗粒物的絮凝和破碎作用,使用不同质量浓度臭氧对循环水生物絮团对虾养殖系统中水体进行氧化处理,并对水体中的水质指标、悬浮颗粒物粒径分布变化等进行分析,试验结果显示:不同质量浓度臭氧处理使水体中氨氮、硝态氮含量显著升高(P<0.05),亚硝态氮含量显著下降(P<0.05);不同质量浓度臭氧处理后水体中总悬浮物含量显著下降(P<0.05),随臭氧质量浓度的增大,总悬浮物去除率逐渐升高,臭氧质量浓度为2.5mg/L时去除率最高(23.15%);臭氧输入养殖水体后,水体中悬浮颗粒物的粒径分布出现明显变化,随臭氧质量浓度增加絮凝效率逐渐升高,臭氧质量浓度为2.5mg/L时,絮凝效率最高(33.61%)。试验结果表明,臭氧能够有效去除水体中亚硝态氮,并对水体中的悬浮颗粒物有絮凝作用。建议处理养殖用水适宜的臭氧质量浓度为1.5 mg/L,适宜的作用时间为4min。

关键词：臭氧悬浮颗粒物养殖水体去除率絮凝效率

十年禁渔初期金沙江干流鱼类群落结构及物种多样性

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中国水产科学 2024年第3期31卷 286-300页

作者：王忠原朱挺兵胡飞飞龚进玲郭祉宾李学梅杨德国上海海洋大学水产与生命学院中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室

基于金沙江干流2022年5月至2023年11月6个站位(岗托、奔子栏、石鼓、攀枝花、巧家、绥江)的渔获物调查数据,分析鱼类群落组成现状、优势种特征、群落多样性的时空分布,提出金沙江干流鱼类的保护措施。研究结果显示,共采集到鱼类68种,隶... 详细信息

基于金沙江干流2022年5月至2023年11月6个站位(岗托、奔子栏、石鼓、攀枝花、巧家、绥江)的渔获物调查数据,分析鱼类群落组成现状、优势种特征、群落多样性的时空分布,提出金沙江干流鱼类的保护措施。研究结果显示,共采集到鱼类68种,隶属于4目15科48属,其中鲤形目鱼类最多(51种),占总种数的75.0%,国家级保护鱼类5种,外来鱼类7种;生态类型主要为杂食性、底栖性和定居性鱼类,分别占66.18%、44.12%和72.06%;群落优势种为鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、齐氏罗非鱼(Coptodon zillii)和长丝裂腹鱼(Schizothorax dolichonema);鱼类群落的Shannon-Wiener多样性指数(H')、Simpson多样性指数(D')、Peilou均匀度指数(J')和Margalef丰富度指数(R')的变化范围分别为1.376～2.012、0.646～0.816、0.574～0.797和1.149～2.870,经ANOVA分析检验, 4个多样性指数的时间差异不显著(P>0.05),而空间差异明显(P生物量曲线在丰度曲线上方,W统计值为正值,表明群落受到的扰动较小,但与历史记录相比,鱼类种类和生态类型均有一定变化;2022—2023年的属间-科间多样性指数(genus-familydiversityindex,G-F)由0.29降低为0.19,但物种数相对增多;聚类分析和NMDS排序分析结果表明,金沙江干流河段鱼类群落分成2组:岗托、奔子栏、石鼓为一组;巧家、攀枝花、绥江为一组;相似性百分比(SIMPER)分析表明,不同季度之间的鱼类群落物种组成差异显著,主要分歧种为张氏?(Hemicultertchangi)和中华鳑鲏(Rhodeussinensis)。作为禁渔后开展的系统调查,本研究结果可为长江禁捕效果评估提供基准。建议在加强禁渔管理的同时,监测外来种种群动态,以及开展干支流生境修复等措施保护金沙江鱼类多样性。

关键词：金沙江干流鱼类种类组成群落结构物种多样性

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葡萄TST基因家族鉴定及表达分析

西北植物学报 2024年第4期44卷 612-623页

作者：杨杰龚丽丽徐涛赵双滢杨中义吴月燕浙江万里学院生物与环境学院浙江宁波315100 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

【目的】液泡膜糖转运蛋白(TST或者TMT)是植物发育过程中发挥重要作用的一种糖转运蛋白。研究旨为探究TST基因家族在葡萄生长发育中的作用,并进一步为阐明TST基因功能提供坚实的基础。【方法】通过同源分析法从葡萄基因组中鉴定出13个TS... 详细信息

【目的】液泡膜糖转运蛋白(TST或者TMT)是植物发育过程中发挥重要作用的一种糖转运蛋白。研究旨为探究TST基因家族在葡萄生长发育中的作用,并进一步为阐明TST基因功能提供坚实的基础。【方法】通过同源分析法从葡萄基因组中鉴定出13个TST基因,对基因的结构和编码蛋白质进行生物信息学分析;用qRT-PCR技术分析‘鄞红’葡萄发育过程中不同组织的TST表达水平,并对不同时期葡萄果肉中可溶性糖含量进行相关性分析。【结果】TST基因家族分布在6条染色体上,存在3对片段重复和3对串联重复基因;根据系统发育将其分为3个亚家族,各亚家族成员结构相似;TST基因含有大量与激素、光和胁迫响应相关的顺式作用元件;TST家族蛋白质由α-螺旋和无规则卷曲组成,各亚族蛋白模型相似;VvTST在不同组织中均有表达,并存在时空表达特异性;相关性分析发现,葡萄果肉中4个VvTST基因(VIT_18s0001g12560、VIT_18s0122g00850、VIT_04s0023g01860和VIT_03s0038g03940)的表达水平与其中可溶性糖的积累呈现相似变化趋势。【结论】VvTST可能对葡萄果肉中可溶性糖积累起到至关重要的作用。

关键词： TST基因家族生物信息学表达分析可溶性糖葡萄

葡萄UBP基因家族对非生物胁迫的响应及VvUBP基因功能研究

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核农学报 2024年第1期38卷 33-45页

作者：郭雁飞徐涛陈天池陈哲杨杰龚丽丽斯昊璇吴月燕浙江万里学院生物与环境学院浙江宁波315100 上海海洋大学水产与生命学院上海201306

泛素特异蛋白酶是一个广泛存在于真核生物中且高度保守的基因家族,通过去泛素化作用调节细胞蛋白的各种生理活动。为了系统探究葡萄UBP基因家族功能,本研究运用生物信息学方法对葡萄UBP基因家族成员进行鉴定与分析,利用实时荧光定量PCR(... 详细信息

泛素特异蛋白酶是一个广泛存在于真核生物中且高度保守的基因家族,通过去泛素化作用调节细胞蛋白的各种生理活动。为了系统探究葡萄UBP基因家族功能,本研究运用生物信息学方法对葡萄UBP基因家族成员进行鉴定与分析,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析VvUBPs基因在不同非生物胁迫下的表达模式。结果表明,VvUBP基因家族包括27个成员,编码序列(CDS)长度为594~4 812 bp,编码氨基酸序列长度为197~1 603 aa。系统进化分析结果显示,UBP基因家族可分为8个亚组(GⅠ~GⅧ)。VvUBPs在茎中的表达水平相对较低,VvUBP27、VvUBP10和VvUBP23分别在卷须、花和叶中表达水平较高。外源茉莉酸甲酯(MeJA)处理可显著诱导VvUBP5、VvUBP12、VvUBP18和VvUBP27等4个基因高表达,外源水杨酸(SA)处理可显著诱导VvUBP5和VvUBP19基因高表达。VvUBP15在盐胁迫浓度0.6%时的表达量增加最明显,VvUBP6在弱光胁迫下表达显著下降以及VvUBP25在高温胁迫6 h时增幅最大。综上,VvUBP基因家族成员能够响应不同的非生物胁迫,进而提高葡萄的抗逆性。本研究结果为揭示UBP调控葡萄生长发育和抗逆胁迫机理等提供了科学依据。

关键词：葡萄 UBP基因家族生物信息学表达分析

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基于核系统酵母双杂交技术的红螯螯虾IAG互作蛋白筛选

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水生生物学报 2024年第7期48卷 1095-1101页

作者：周焕陈红林刘峰欧阳苗峰楼宝顾志敏浙江省农业科学院水生生物研究所杭州310021 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 湖州师范学院生命科学学院湖州313002

为探究胰岛素样促雄性腺激素(Insulin-like androgenic hormone,IAG)在甲壳动物性别分化过程作用的分子调控途径,挖掘与IAG蛋白存在互作关系的候选蛋白信息,研究使用红螯螯虾促雄性腺及输精管组织构建核体系酵母文库,利用酵母双杂交技... 详细信息

为探究胰岛素样促雄性腺激素(Insulin-like androgenic hormone,IAG)在甲壳动物性别分化过程作用的分子调控途径,挖掘与IAG蛋白存在互作关系的候选蛋白信息,研究使用红螯螯虾促雄性腺及输精管组织构建核体系酵母文库,利用酵母双杂交技术筛选与IAG互作的候选蛋白,并对关键候选蛋白的编码基因进行克隆与表达分析。获得初级文库容量为1.12×10^(7),次级文库容量为1.28×10^(7);成功筛选到25个阳性克隆,共注释到12个蛋白编码基因;克隆获得关键候选蛋白的编码基因muc5acl(Mucin-5AC-like)的CDS全长474bp;半定量与荧光定量表达结果表明,muc5acl在红螯螯虾的促雄性腺、精巢及输精管中特异表达,且在雄性个体促雄性腺中的表达水平显著高于间性,在输精管中的表达则相反,推测该基因可能参与雄性激素的分泌及精子运输过程,并与间性红螯螯虾的性腺发育有关。研究结果将为进一步解析IAG调控红螯螯虾间性性别形成的分子机制提供重要信息。

关键词：胰岛素样促雄性腺激素(IAG) 间性性别酵母双杂交基因表达红螯螯虾

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