检索结果-南通市图书馆

脂多糖对细菌生物被膜形成及厚壳贻贝幼虫变态的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

水产学报 2022年第11期46卷 2134-2142页

作者：吴静娴李嘉政胡晓梦丁文扬杨金龙梁箫上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室南方海洋科学与工程广东省实验室

为探究脂多糖（LPS）对海洋细菌生物被膜形成、海洋贝类幼虫变态所产生的作用，深入了解影响厚壳贻贝附着变态的因素，本实验使用不同浓度的LPS直接刺激厚壳贻贝幼虫，观察其对幼虫附着变态的直接作用；同时在海假交替单胞菌形成生物被... 详细信息

为探究脂多糖（LPS）对海洋细菌生物被膜形成、海洋贝类幼虫变态所产生的作用，深入了解影响厚壳贻贝附着变态的因素，本实验使用不同浓度的LPS直接刺激厚壳贻贝幼虫，观察其对幼虫附着变态的直接作用；同时在海假交替单胞菌形成生物被膜的过程中添加不同浓度的LPS，分析生物被膜生物学特性的变化，及变化后的生物被膜对厚壳贻贝幼虫附着变态的影响。结果显示，3种浓度的LPS均可直接诱导厚壳贻贝幼虫的变态；10.0mg/L浓度LPS处理后的生物被膜其细菌密度、膜厚度明显降低，且膜厚度降低了12.1%，胞外产物中多糖、脂类显著增加，其中代表性多糖可拉酸的含量增加了35.4%，同时其对幼虫变态的诱导作用也提高了53.3%。因而，在厚壳贻贝幼虫的附着变态过程中，LPS具有直接诱导作用，同时还可以通过调控生物被膜胞外物质，特别是可拉酸的生成，间接影响厚壳贻贝幼虫的附着变态。本研究成果对海洋细菌互作关系研究、厚壳贻贝养殖产业的改善以及海洋防污技术研发具有重要推动价值。

关键词：厚壳贻贝脂多糖海洋细菌生物被膜变态

逆转座子LINE1在Hela细胞中的表达及转录组分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

大连海洋大学学报 2019年第2期34卷 153-159页

作者：储旭周涛李文豪邢虎陈良标上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306

为研究逆转座子LINE1(简称为L1)在Hela细胞内的作用机制,对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序,通过对转录组数据进行拼接组装,对差异表达基因进行了生物信息学分析。结果表明:试验共筛选出391个差异表达基因,其中45.6%的差异表... 详细信息

为研究逆转座子LINE1(简称为L1)在Hela细胞内的作用机制,对转染L1的Hela细胞和正常细胞进行转录组测序,通过对转录组数据进行拼接组装,对差异表达基因进行了生物信息学分析。结果表明:试验共筛选出391个差异表达基因,其中45.6%的差异表达基因显著性上调,这些基因通过GO分类注释,可分为14类;通过KEGG对差异基因进行通路富集,表明差异基因主要富集在破骨细胞分化、色氨酸代谢、乙型肝炎、病毒致癌作用和可卡因成瘾等信号通路,发现了一些与细胞黏着连接、表皮相关的基因有差异性表达。研究表明,通过转录组测序,获得了丰富的关于L1在Hela细胞中表达的信息,为进一步研究L1在细胞中的作用机制供了思路和理论依据。

关键词： LINE1 Hela细胞转录组测序逆转座子

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

白皮杉醇缓解斑马鱼炎症反应的作用机制研究

中国生物工程杂志 2024年第11期44卷 11-19页

作者：刘矿袁驰颜家员祖尧上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 临港新片区海洋生物医药科技创新型平台上海201306

长期或过度的炎症反应会对人体造成严重伤害,发现小分子药物白皮杉醇(PCT)可以作为一种潜在的抗炎药物。采用活性氧(ROS)检测实验,发现在一定安全范围内,随着PCT浓度增加,对斑马鱼炎症损伤缓解作用逐渐提高,缓解程度存在剂量依赖效应,表... 详细信息

长期或过度的炎症反应会对人体造成严重伤害,发现小分子药物白皮杉醇(PCT)可以作为一种潜在的抗炎药物。采用活性氧(ROS)检测实验,发现在一定安全范围内,随着PCT浓度增加,对斑马鱼炎症损伤缓解作用逐渐提高,缓解程度存在剂量依赖效应,表明PCT具有抗氧化作用。通过中性粒细胞和巨噬细胞标记的转基因斑马鱼系Tg(coro1a:GFP;lyz:Dsred),发现PCT对CuSO4造成细胞损伤及氧化应激诱导的炎症反应的影响,使用不同浓度PCT处理CuSO4诱导的神经性炎症斑马鱼,可见斑马鱼体内迁移至脊椎神经丘部位的中性粒细胞数量明显减少,表明PCT对炎症趋化的中性粒细胞聚集到损伤部位具有修复作用。同时,qPCR检测结果证明与单独使用CuSO4处理组相比,PCT处理可显著下调白细胞介素-6(IL-6)、环氧合酶2(COX-2)及肿瘤坏死因子α(TNF-α)等炎症标志基因的表达,从而保护斑马鱼免受CuSO4诱导的炎症损伤。显示PCT在模式生物斑马鱼中具有抗炎、抗氧化作用,对未来PCT作为抗炎药物奠定了理论基础。

关键词：斑马鱼白皮杉醇抗炎硫酸铜作用机制

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

斑马鱼hoxb4a在心脏发育中的功能

上海海洋大学学报 2022年第6期31卷 1342-1350页

作者：顾叶丹王冰琦王宏杰胡沛男祖尧上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海每201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306

斑马鱼(Danio rerio)转录因子hoxb4a在心脏中的功能未见研究报道,为了阐明hoxb4a在心脏发育中的作用,利用基因沉默技术和mRNA基因过表达方法,分别在斑马鱼中敲降和过表达hoxb4a基因,发现抑制或过表达hoxb4a的胚胎在第3天出现心包腔肿大... 详细信息

斑马鱼(Danio rerio)转录因子hoxb4a在心脏中的功能未见研究报道,为了阐明hoxb4a在心脏发育中的作用,利用基因沉默技术和mRNA基因过表达方法,分别在斑马鱼中敲降和过表达hoxb4a基因,发现抑制或过表达hoxb4a的胚胎在第3天出现心包腔肿大、心脏环化异常的表型。通过原位杂交技术对野生型及hoxb4a敲降胚胎进行心肌特异基因的原位杂交染色比较,测量结果显示hoxb4a敲降胚胎的心脏环化角度增大。接着利用转基因鱼系,发现敲降hoxb4a后的胚胎存在鳃弓异常、心内膜畸形的表型。进一步使用qPCR检测hoxb4a沉默后心脏相关基因的表达量变化,结果显示hoxb4a敲降后,多数心脏发育关键基因出现显著性下调,而调控心脏腔室分化的关键基因nppa明显上调。研究表明斑马鱼hoxb4a沉默会导致心脏结构畸形、环化异常,并且调控了早期心脏发育基因的变化。研究发现hoxb4a在斑马鱼早期心脏发育中发挥了作用,并通过原位杂交及qPCR结果初步探索hoxb4a调控心脏腔室的分化及心脏环化过程,深化人们对心脏发育调控网络的认识。

关键词： hoxb4a 基因敲降心脏发育斑马鱼

基于MAXENT模型评估北部湾潮间带中国鲎和圆尾鲎稚鲎的潜在地理分布及种群保育对策

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生态学报 2019年第9期39卷 3100-3109页

作者：颜明艳李琼珍宋洁王振华王有基胡梦红水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 上海201306 海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学) 中国科学技术部上海201306 上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学) 上海201306 广西壮族自治区水产科学研究院南宁530021 天津市一瑞生物工程有限公司天津300457 上海海洋大学信息学院上海201306 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海洋大学) 上海201306

鲎具有极高的经济价值和科研意义。近年来由于过度捕捞和栖息地受损等原因,亚洲鲎种群数量正急剧下降。鲎漫长的生命周期使得鲎资源的保护和增殖迫在眉睫。生态位模型已经广泛应用于物种的潜在地理分布预测。基于实地调研数据和公开发... 详细信息

鲎具有极高的经济价值和科研意义。近年来由于过度捕捞和栖息地受损等原因,亚洲鲎种群数量正急剧下降。鲎漫长的生命周期使得鲎资源的保护和增殖迫在眉睫。生态位模型已经广泛应用于物种的潜在地理分布预测。基于实地调研数据和公开发表的北部湾中国海域中国鲎和圆尾鲎地理分布数据,运用MAXENT模型得到中国鲎和圆尾鲎在广西北部湾(中国部分)的栖息地适宜度指数(Habitat suitability index, HSI),确定了这两种稚鲎在北部湾中国海域潜在适生区。模型分析结果表明,潮间带坡度和地形指数是影响中国鲎分布的主要环境因子,而潮间带底质的有机物含量和植被指数是影响圆尾鲎分布的主要环境因子,根据研究结果建议在两种稚鲎适生区建立保护区,进行人工放流稚鲎,加强对海草和红树林的生态建设,进而促进鲎资源种群恢复和发展。

关键词：中国鲎圆尾鲎最大熵模型生境适宜性保护

Tn5表达与纯化及对ZF4细胞DNA的酶活力测试

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2020年第10期39卷 4487-4490页

作者：富伟康姜蓬垒刘玮韩兵社张俊芳上海海洋大学中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心水产科学国家级实验教学示范中心水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306

转座酶因其能够插入目的片段的能力正受到越来越多的关注,经过改造的高活性转座酶可用于标记DNA,具有较大的应用价值,如ATAC-seq(Assay for transposase-accessible chromatin using sequencing)以及TrAC-looping(Transposase-mediated analysis of chromatin looping)等染色质高级结构捕获实验,使用高活性转座酶为染色质开放区DNA或存在染色质相互作用的片段加上标记,从而分离出目的片段。天然转座酶普遍活性较低,缺乏实际应用价值,而经过改造的高活性转座酶因其可能导致的致死突变,对宿主具有较大毒性,难以制备。本研究优化了高活性转座酶Tn5的原核表达以及纯化方法,将已转化pet15b His6Tn5质粒的改良型工程菌BL21-Gold(DE3)以及毒性蛋白诱导条件进行原核表达,借助高活性转座酶Tn5带有的His tag标签进行纯化,通过Western blotting鉴定了纯化所得蛋白,并使用考马斯亮蓝染色测定了目的蛋白浓度,采取在标准反应条件下与斑马鱼ZF4细胞基因组DNA反应的方法,测试了纯化所得Tn5的活性。本研究为进一步探测ZF4细胞基因组的三维结构提供了研究基础。

关键词：转座酶 Tn5 原核表达蛋白质纯化酶活性

雪蚤抗冻蛋白HhAFP在毕赤酵母中的表达及其抗冻作用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

农业生物技术学报 2024年第12期32卷 2848-2858页

作者：钟文倩颜倩倩胡瑞芹陈良标上海海洋大学水产与生命学院上海海洋大学水产生物育种研究中心/水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/海洋生物科学国际联合研究中心

抗冻蛋白(antifreeze proteins, AFPs)是一类大分子蛋白质，可以与冰晶表面结合，以抑制冰晶的生长。毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种可以表达外源蛋白的系统，可利用甲醇作为碳源进行表达获得目的蛋白。为获得高产量的具有活性的抗冻... 详细信息

抗冻蛋白(antifreeze proteins, AFPs)是一类大分子蛋白质，可以与冰晶表面结合，以抑制冰晶的生长。毕赤酵母(Pichia pastoris)是一种可以表达外源蛋白的系统，可利用甲醇作为碳源进行表达获得目的蛋白。为获得高产量的具有活性的抗冻蛋白，选取昆虫雪蚤(Hypogastrura harveyi)抗冻蛋白(HhAFP)，通过PCR在目的基因的5'端和3'端添加XhoⅠ、XbaⅠ酶切位点，并且在目的基因3'端添加6×His标签，将目的基因通过转化的方式添加至适用于毕赤酵母表达系统的表达载体pPICZαA中，成功构建重组表达载体pPICZαA-HhAFP。将pPICZαA-HhAFP转入毕赤酵母表达菌株X-33中，于29℃培养箱培养，通过博来霉素(zeocin)和甲醇筛选出2株阳性酵母转化子。将这2株酵母菌进行诱导表达，在29℃、250 r/min、pH 6.0的条件下，使用含1%甲醇的BMM培养基培养72 h。获得的酵母上清液进行亲和层析纯化和透析浓缩，通过基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF/TOF)分析，验证该蛋白为重组蛋白HhAFP。将重组蛋白HhAFP加入细胞冻存液检测其抗冻活性，结果表明，HhAFP可以显著提高冻存细胞复苏后的存活率，减少细胞损伤。通过进一步优化HhAFP的表达条件，确定培养温度为28℃，甲醇浓度为1.5%，表达培养72 h获得的重组蛋白HhAFP可达527 mg/L。该研究为通过毕赤酵母高产量表达具有活性的抗冻蛋白、实现抗冻蛋白的产业化提供了技术途径。

关键词：抗冻蛋白冻存毕赤酵母重组表达雪蚤抗冻蛋白(HhAFP) 发酵优化

厚壳贻贝McCaspase 3-4基因的克隆及其在幼虫变态中的作用

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

水生生物学报 2022年第8期46卷 1168-1176页

作者：刘志显李嘉政梁邻利冯丹丹梁箫杨金龙竹攸汀上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 南方海洋科学与工程广东省实验室广州511458

为进一步了解细胞凋亡及其效应基因caspase-3在海洋贝类厚壳贻贝(Mytilus coruscus)变态中的作用,研究通过RACE技术克隆并鉴定了一个厚壳贻贝caspase-3基因的cDNA全长,并对该基因在幼虫变态中的作用进行了研究。碱基序列和氨基酸序列特... 详细信息

为进一步了解细胞凋亡及其效应基因caspase-3在海洋贝类厚壳贻贝(Mytilus coruscus)变态中的作用,研究通过RACE技术克隆并鉴定了一个厚壳贻贝caspase-3基因的cDNA全长,并对该基因在幼虫变态中的作用进行了研究。碱基序列和氨基酸序列特征分析显示,该基因编码的蛋白质具有典型的caspase P20和P10结构域,但核心半胱氨酸活性位点QACXG五肽保守序列发生了突变。系统进化分析结果显示该基因与无脊椎动物Caspase-3聚在一起,并与地中海贻贝(Mytilus galloprovincialis)caspase 3/7-4相似度最高,因此将其命名为McCaspase 3-4。随后,通过实时荧光定量PCR技术对该基因在成贝不同组织及幼虫变态不同时间点的表达水平进行了分析。结果显示, McCaspase 3-4在成贝外套膜和唇瓣中的表达量显著高于其他组织。肾上腺素诱导眼点幼虫变态12h后, McCaspase 3-4的表达水平出现显著上升,并在刺激24h后达到最高,表明该基因可能在幼虫变态早期发挥作用。利用RNA干扰技术敲降眼点幼虫McCaspase 3-4基因表达后的结果显示,肾上腺素对眼点幼虫变态的诱导作用显著下降,表明该基因在调控厚壳贻贝变态过程中具有重要作用。研究结果有助于理解细胞凋亡在厚壳贻贝幼虫变态中的作用及贝类变态的分子机制。

关键词：细胞凋亡 Caspase-3 组织表达幼虫变态厚壳贻贝

维普期刊数据库博看期刊

CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物学杂志 2021年第5期38卷 12-16页

作者：孟琳陈良标海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学)中国科学技术部上海201306 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 上海201306 水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 上海201306

利用CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因,获得缺失hbae1.1基因的纯合突变体,并研究缺失hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响。根据斑马鱼hbae1.1基因设计敲除靶点,并制备相应gRNA,将gRNA与Cas9蛋白以一定比例混合后通过显微注射注入斑... 详细信息

利用CRISPR/Cas9技术敲除hbae1.1基因,获得缺失hbae1.1基因的纯合突变体,并研究缺失hbae1.1基因对斑马鱼血红蛋白生成的影响。根据斑马鱼hbae1.1基因设计敲除靶点,并制备相应gRNA,将gRNA与Cas9蛋白以一定比例混合后通过显微注射注入斑马鱼受精卵一细胞期的动物极。通过T7E1核酸内切酶酶切、测序和序列比对后检测到成功敲除了hbae1.1基因,并通过与WT交配和内交,成功获得F 2代纯合突变体。将hbae1.1基因缺失的纯合突变体与野生型斑马鱼WT所产受精卵一起进行固蓝(o-Diansidine)染色,结果显示,与对照组WT相比,突变体的血红蛋白含量明显减少。研究表明,hbae1.1基因的缺失会对斑马鱼血红蛋白的生成造成一定影响。同时hbae1.1基因的研究为了解鱼类血红蛋白的发生发育提供一定基础。

关键词：斑马鱼血红蛋白 hbae1.1基因 CRISPR/Cas9 固蓝染色