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衰老对斑马鱼呼吸代谢和游泳行为的影响

上海海洋大学学报 2019年第2期28卷 200-210页

作者：高泉吕为群上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306

以模式生物斑马鱼作为实验对象,首先从躯体形态和繁殖能力上对6月龄与30月龄斑马鱼的特征进行了区分,而后分别比较了6月龄和30月龄斑马鱼在昼夜节律、应激行为和呼吸代谢方面的差异,研究衰老对斑马鱼代谢和行为的影响。结果显示:30月龄... 详细信息

以模式生物斑马鱼作为实验对象,首先从躯体形态和繁殖能力上对6月龄与30月龄斑马鱼的特征进行了区分,而后分别比较了6月龄和30月龄斑马鱼在昼夜节律、应激行为和呼吸代谢方面的差异,研究衰老对斑马鱼代谢和行为的影响。结果显示:30月龄斑马鱼脊柱弯曲,并且在产卵量、受精率、孵化率和成活率等方面均低于6月龄斑马鱼,显示出明显的衰老特征。6月龄斑马鱼昼夜间的游泳行为具有明显的节律性,与30月龄斑马鱼相比,其白天活动量大,夜晚静息,昼夜间游泳行为具有显著差异。当遭受驱逐刺激后,6月龄斑马鱼的快速游泳距离、快速游泳时间和平均游泳速度均高于30月龄斑马鱼(P 研究衰老与年轻斑马鱼的生理行为,有助于进一步理解衰老对机体生理功能的影响,并为深入探究衰老对斑马鱼代谢和行为影响的内在机制奠定基础。

关键词：斑马鱼衰老昼夜节律应激行为呼吸代谢

斑马鱼hdac10通过促进自噬提高低温胁迫下的细胞存活

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基因组学与应用生物学 2022年第3期41卷 482-493页

作者：燕晓霞季涛罗军涛韩丽洁陈静张俊芳韩兵社上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306

组蛋白去乙酰化酶10(histone deacetylase 10,HDAC10)是一种重要的表观遗传酶,在介导同源重组、调控转录等多种生物过程中发挥作用,然而其在鱼类低温胁迫中的作用尚不清楚。本研究发现低温胁迫下人(Homo sapiens)HEK-293T细胞和斑马鱼(D... 详细信息

组蛋白去乙酰化酶10(histone deacetylase 10,HDAC10)是一种重要的表观遗传酶,在介导同源重组、调控转录等多种生物过程中发挥作用,然而其在鱼类低温胁迫中的作用尚不清楚。本研究发现低温胁迫下人(Homo sapiens)HEK-293T细胞和斑马鱼(Danio rerio)ZF4细胞中hdac10的表达水平都显著提高。构建了斑马鱼hdac10过表达质粒并转染HEK-293T细胞,Western blot显示外源性斑马鱼hdac10在HEK-293T细胞中成功表达,同时发现hdac10过表达后自噬相关基因BECN1和LC3的mRNA和蛋白水平都显著上调,低温胁迫下过表达外源性hdac10的HEK-293T细胞存活率显著上升(P研究为研究鱼类在低温下的抗寒机制提供了科学依据。

关键词：低温 hdac10 斑马鱼存活率自噬

七鳃鳗KCTD基因家族成员全基因组鉴定及进化分析

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基因组学与应用生物学 2019年第6期38卷 2437-2449页

作者：邢璐璐祖尧李伟明任建峰上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

钾离子通道四聚化结构域(KCTD)蛋白基因家族是一个保守的基因家族,该家族成员的共同特征是具有一个含有BTB保守结构域的N-末端和一个可变的C-末端。KCTD基因的突变或不正常调控与人类多种疾病相关。七鳃鳗是现存最原始的脊椎动物,作为... 详细信息

钾离子通道四聚化结构域(KCTD)蛋白基因家族是一个保守的基因家族,该家族成员的共同特征是具有一个含有BTB保守结构域的N-末端和一个可变的C-末端。KCTD基因的突变或不正常调控与人类多种疾病相关。七鳃鳗是现存最原始的脊椎动物,作为联系无脊椎动物和脊椎动物之间的桥梁,在生物进化研究中占有重要地位。本研究通过对海七鳃鳗(Petromyzon marinus)和日本七鳃鳗(Lethenteron japonicum)基因组和转录组数据分析,全面系统地鉴定了海七鳃鳗和日本七鳃鳗KCTD基因家族成员,并对其基因结构特征、蛋白保守基序和基因表达模式进行了分析。在海七鳃鳗和日本七鳃鳗中分别鉴定出13个和14个KCTD基因,基因长度和外显子数目在不同KCTD基因间变化很大,KCTD蛋白中4个基序保守性显著,大多数KCTD基因呈泛表达模式,并且在胚胎发育时期明显高表达。除七鳃鳗外,对12个无脊椎动物和脊椎动物代表物种KCTD基因家族成员进行了鉴定,并对KCTD基因家族成员的进化关系进行了分析。根据进化树聚类情况,将KCTD基因家族成员分为11个亚家族。进化分析结果显示,KCTD基因家族从低等的无脊椎动物线虫和果蝇到高等的人类都存在;线虫中仅有5个成员,果蝇中有8个成员,随着物种进化程度由低到高,KCTD家族成员数目呈现增加的趋势;从爬行类开始,脊椎动物KCTD基因数目稳定在24个左右。硬骨鱼类特有的全基因组复制事件影响鱼类KCTD基因数目。本研究结果不仅丰富了七鳃鳗KCTD基因家族信息,同时也对KCTD家族基因间的进化关系进行了探究,为深入研究该家族基因功能提供了一定的依据。

关键词：七鳃鳗 KCTD基因家族基因结构表达模式进化

斑马鱼幼鱼嗜中性粒细胞对副溶血弧菌清除的动态变化

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上海海洋大学学报 2020年第2期29卷 180-188页

作者：郭欣娅季策谢子健季帆祖尧任建峰张庆华上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学中国科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 同济大学附属上海市肺科医院上海市结核病(肺)重点实验室上海200433 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是人-兽-鱼共患的致病菌,严重威胁食品安全和人类的健康。为了研究宿主嗜中性粒细胞清除细菌感染的动态变化过程,利用红色荧光蛋白标记的副溶血弧菌Vp57RFP菌株感染受精后48 h(hours post fertiliza... 详细信息

副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是人-兽-鱼共患的致病菌,严重威胁食品安全和人类的健康。为了研究宿主嗜中性粒细胞清除细菌感染的动态变化过程,利用红色荧光蛋白标记的副溶血弧菌Vp57RFP菌株感染受精后48 h(hours post fertilization,hpf)的斑马鱼(Danio rerio)幼鱼耳泡,建立局部感染模型,并以大肠杆菌(Escherichia coli)Ec01菌株为对照,系统比较了副溶血弧菌和大肠杆菌的半数致死剂量(median lethal dose,LD50)、存活曲线以及和嗜中性粒细胞相互作用的动态过程,RT-qPCR验证炎症相关基因il1b和il10在感染前后的表达量变化。结果显示副溶血弧菌和大肠杆菌感染斑马鱼幼鱼的LD50分别为7.90×10^8 CFU/mL和1.14×10^11 CFU/mL,与感染大肠杆菌相比,斑马鱼感染副溶血弧菌后招募嗜中性粒细胞的速度更快,且数量更多。RT-qPCR结果发现斑马鱼感染副溶血弧菌后在相同时间点能够激活更高的il1b和il10基因的表达,引起强烈的炎症反应。基于以上研究,我们建立的副溶血弧菌-斑马鱼幼鱼耳泡局部感染模型,为进一步研究嗜中性粒细胞清除副溶血弧菌感染的动态过程,以及深入揭示天然免疫应答机制提供了依据。

关键词：副溶血弧菌斑马鱼嗜中性粒细胞天然免疫

南极中山站伯氏肩孔南极鱼体液和肠道微生物的分离鉴定及功能分析

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大连海洋大学学报 2024年第3期39卷 429-436页

作者：邵琪翟万营蔡爽孙凤宇陈良标上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学水产生物育种研究中心上海201306 上海海洋大学大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室上海201306

为研究南极鱼体微生物的功能,对采自南极中山站附近海域的伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)体液和肠道内容物中的微生物进行筛选培养,挑选代表性菌株进行生理生化特性测定和次级代谢产物功能验证,并在活体上进行功能初探,观察在... 详细信息

为研究南极鱼体微生物的功能,对采自南极中山站附近海域的伯氏肩孔南极鱼(Trematomus bernacchii)体液和肠道内容物中的微生物进行筛选培养,挑选代表性菌株进行生理生化特性测定和次级代谢产物功能验证,并在活体上进行功能初探,观察在低温环境下其对宿主的影响。结果表明:分离获得的菌株主要分布在变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),通过16S rDNA基因序列比对发现,菌株Ignatzschineria ***11可能是一株潜在新种;伊格纳茨氏菌属(Ignatzschineria)和芽孢杆菌属(Bacillus)菌的菌液粗提物对枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis ATCC 6633)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila ATCC 35654)及金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)有明显的抑制作用;用菌株Ignatzschineria ***11和Bacillus ***117饲喂的斑马鱼在低温下存活的时间较对照组更长;肠道微生物多样性分析显示,投喂Bacillus ***117的斑马鱼肠道微生物中气单胞菌属(Aeromonas)细菌占比最高(超过60%),而投喂Ignatzschineria ***11的斑马鱼肠道微生物中弧菌属(Vibrio)为优势属。研究表明,在低温(18℃)条件下使用不同类型培养基从伯氏肩孔南极鱼体液和肠道内容物中分离出的多为变形菌门和厚壁菌门,这些菌株具有新型抗生素潜力,同时还有增强宿主耐寒的潜质,该发现为进一步探究极地细菌功能提供了新的思路。

关键词：南极伯氏肩孔南极鱼细菌分离抑菌作用低温

中国鲎血蓝蛋白提纯及其纯化物的液相色谱串联质谱分析

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水产学报 2022年第8期46卷 1499-1508页

作者：赵忠浩常雪晴王有基何锦锋台宗光朱全刚胡梦红北海市产品质量检验所上海市皮肤病医院上海海洋大学海洋生物科学国际联合研究中心上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室

为了获得高纯度的中国鲎血蓝蛋白并探究其潜在的应用价值，实验从中国鲎血淋巴中提取了血蓝蛋白，并用AKTA蛋白纯化系统进行纯化，使用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术对纯化后的血蓝蛋白进行定性分析，最后从uniprot蛋白数据库下载了2... 详细信息

为了获得高纯度的中国鲎血蓝蛋白并探究其潜在的应用价值，实验从中国鲎血淋巴中提取了血蓝蛋白，并用AKTA蛋白纯化系统进行纯化，使用液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)技术对纯化后的血蓝蛋白进行定性分析，最后从uniprot蛋白数据库下载了22条分属5个物种的血蓝蛋白的氨基酸序列，并构建了N-J系统进化树。结果显示，制备的血蓝蛋白纯度较高，从纯化后的中国鲎血蓝蛋白中鉴定到了12种血蓝蛋白的亚基，包括Hemocyanin subunitⅠ、Hemocyanin subunitⅡ、Hemocyanin subunitⅢa、Hemocyanin subunitⅢb、Hemocyanin subunitⅣ、Hemocyanin subunitⅤ、Hemocyanin subunitⅥ等。uniprot数据库显示，这些亚基最早在圆尾鲎和美洲鲎体内被发现。N-J系统进化树显示，中国鲎血蓝蛋白与圆尾鲎和美洲鲎血蓝蛋白具有高度的同源性，并且鲎科动物血蓝蛋白与凡纳滨对虾、锯缘青蟹的血蓝蛋白有较近的进化关系，这意味着可根据虾蟹血蓝蛋白的功能推测中国鲎血蓝蛋白的功能。本研究结果有助于中国鲎血蓝蛋白的功能预测和应用研究。

关键词：中国鲎血蓝蛋白纯化液相色谱串联质谱(LC-MS/MS) 进化树

增蓝剂抑制藻类生长效果及对斑马鱼的急性毒性

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中国环境科学 2013年第8期33卷 1495-1501页

作者：李岩张饮江王聪董悦刘晓培易冕何培民陈立婧上海海洋大学水产与生命学院上海201306 上海海洋大学水域环境生态上海高校工程研究中心上海201306

增蓝剂溶水后降低水下光照度,减弱入射光中370-440nm和530-680nm波段透射光.分析增蓝剂在0.1,1,5mg/L浓度及0.4,0.7,1m水深条件下,对自然水体原生藻类生长抑制效果,并测定其生物毒性.结果表明:在增蓝剂作用下水下光照度衰减明显,衰减系... 详细信息

增蓝剂溶水后降低水下光照度,减弱入射光中370-440nm和530-680nm波段透射光.分析增蓝剂在0.1,1,5mg/L浓度及0.4,0.7,1m水深条件下,对自然水体原生藻类生长抑制效果,并测定其生物毒性.结果表明:在增蓝剂作用下水下光照度衰减明显,衰减系数(k)从0.25m-1增至0.7m-1.水深为0.4,0.7m时,增蓝剂抑藻效果显著(P<0.05),0.1,1,5mg/L浓度对藻类抑制率在第6d后迅速上升,在15d后稳定在65%以上,增蓝剂在0.4m水深抑藻效果较好.当水深至1m时,21d抑藻效果较差.急性毒性试验表明,增蓝剂对斑马鱼96hLC50为442.8 mg/L.

关键词：增蓝剂抑藻光毒性

光照周期对尼罗罗非鱼幼鱼昼夜节律调节的作用

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上海海洋大学学报 2019年第2期28卷 180-189页

作者：刘曾宇周志成吕为群上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产种质资源发展与利用教学重点实验室上海201306

为了研究尼罗罗非鱼幼鱼游泳行为在不喂食时是否存在昼夜节律和光照周期的调节作用,设计了光周期为光照(L)∶黑暗(D)=12 h∶12 h,持续的黑暗(DD),持续的光照(LL),光周期为L∶D=6 h∶6 h和光周期为L∶D=2 h∶2 h。结果表明:(1)光周期为L... 详细信息

为了研究尼罗罗非鱼幼鱼游泳行为在不喂食时是否存在昼夜节律和光照周期的调节作用,设计了光周期为光照(L)∶黑暗(D)=12 h∶12 h,持续的黑暗(DD),持续的光照(LL),光周期为L∶D=6 h∶6 h和光周期为L∶D=2 h∶2 h。结果表明:(1)光周期为L∶D=12 h∶12 h时,尼罗罗非鱼具有明显的昼夜节律,昼夜节律周期为(24. 3±0. 2) h;(2)尼罗罗非鱼的昼夜节律在持续的黑暗和光照下仍然存在,分别为(25. 1±1. 1) h和(25. 6±1. 0) h;(3)光周期为L∶D=6 h∶6 h时,尼罗罗非鱼仍具有明显的昼夜节律(12. 6±0. 5) h;(4)在光周期为L∶D=2 h∶2 h时,尼罗罗非鱼的昼夜游泳行为仍具有明显的昼夜节律,节律周期为(4. 0±2. 0) h。这些结果表明,尼罗罗非鱼具有以24 h为周期的内源性生物钟,但相比与外源性光照调控,内源性的生物钟对罗非鱼的调控较弱,外源性的光照周期才是调节尼罗罗非鱼幼鱼昼夜行为节律的主要因素。

关键词：尼罗罗非鱼光照行为昼夜节律

厚壳贻贝(Mytilus coruscus)McCaspase 3-4基因的克隆及其在幼虫变态中的作用

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水生生物学报 2022年

作者：刘志显李嘉政梁邻利冯丹丹梁箫杨金龙竹攸汀上海海洋大学国家海洋生物科学国际联合研究中心上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)

细胞凋亡作为一种机体清除冗余组织和细胞的重要方式，目前已被发现在脊椎动物和昆虫变态过程中具有重要作用。然而迄今为止，细胞凋亡是否参与调控海洋贝类幼虫的变态却仍不十分清楚。为进一步了解细胞凋亡及其效应基因caspase-3在海...

细胞凋亡作为一种机体清除冗余组织和细胞的重要方式，目前已被发现在脊椎动物和昆虫变态过程中具有重要作用。然而迄今为止，细胞凋亡是否参与调控海洋贝类幼虫的变态却仍不十分清楚。为进一步了解细胞凋亡及其效应基因caspase-3在海洋贝类厚壳贻贝（Mytilus coruscus）变态中的作用，本研究通过RACE技术克隆并鉴定了一个厚壳贻贝caspase-3基因的cDNA全长，并对该基因在幼虫变态中的作用进行了研究。碱基序列和氨基酸序列特征分析显示，该基因编码的蛋白质具有典型的caspase P20和P10结构域，但核心半胱氨酸活性位点QACXG五肽保守序列发生了突变。系统进化分析结果显示该基因与无脊椎动物Caspase-3蛋白聚在一起，并与地中海贻贝（Mytilus galloprovincialis）caspase 3/7-4相似度最高，因此将该基因命名为McCaspase 3-4。随后，通过实时荧光定量PCR技术对该基因在成贝不同组织及幼虫变态不同时间点的表达水平进行了分析。分析结果显示，McCaspase 3-4 mRNA在成贝外套膜和唇瓣中的表达量显著高于其他组织。肾上腺素诱导眼点幼虫变态12h后，McCaspase 3-4 mRNA的表达水平出现显著上升，并在刺激24h后达到最高，表明该基因可能在幼虫变态早期发挥作用。利用RNA干扰技术敲降眼点幼虫McCaspase 3-4基因表达后的结果显示，肾上腺素对眼点幼虫变态的诱导作用显著下降，表明该基因在调控厚壳贻贝变态过程中具有重要作用。上述研究结果将有助于理解细胞凋亡在厚壳贻贝幼虫变态中的作用以及贝类变态的分子机制。

关键词：