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非病毒定点整合CAR-T技术的开发及其在复发难治性非霍奇金B细胞淋巴瘤临床治疗中的应用

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科学通报 2022年第34期67卷 4036-4038页

作者：魏妍妍江文正华东师范大学生命科学学院上海市调控生物学重点实验室上海200241

淋巴瘤是起源于淋巴组织的恶性肿瘤,主要可分为霍奇金淋巴瘤(Hodgkin's lymphoma,HL)和非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkins lymphoma,NHL)两大类.NHL更为多见,是一种原发于淋巴组织高复发率和高致死率的血液系统恶性肿瘤,占所有淋巴瘤80%~90%... 详细信息

淋巴瘤是起源于淋巴组织的恶性肿瘤,主要可分为霍奇金淋巴瘤(Hodgkin's lymphoma,HL)和非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkins lymphoma,NHL)两大类.NHL更为多见,是一种原发于淋巴组织高复发率和高致死率的血液系统恶性肿瘤,占所有淋巴瘤80%~90%.患者可见于各年龄,随着年龄增长,发病率也逐渐增加(中位年龄,50岁).

关键词：非霍奇金淋巴瘤血液系统恶性肿瘤高复发率淋巴组织 NHL 复发难治性定点整合

超快强激光场中纳米颗粒的电子离子发射（特邀）

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光学学报 2024年第17期 28-59页

作者：孙烽豪郑金梅杨志杰樊光琦李辉刘情操哈尔滨工业大学(威海)信息科学与工程学院哈尔滨工业大学(威海)海洋科学与技术学院哈尔滨工业大学(威海)理学院华东师范大学精密光谱科学与技术国家重点实验室

在超短强激光脉冲的作用下，纳米结构表面会产生空间和时间急剧变化的局域极端近场，引发一系列动力学过程，包括表面分子及自身分子的光电子激发，电子、离子电离和碰撞等。借助先进的速度成像谱仪等装置，能够记录并解析这些过程中的... 详细信息

在超短强激光脉冲的作用下，纳米结构表面会产生空间和时间急剧变化的局域极端近场，引发一系列动力学过程，包括表面分子及自身分子的光电子激发，电子、离子电离和碰撞等。借助先进的速度成像谱仪等装置，能够记录并解析这些过程中的光电子、离子信息。结合多种理论模型，可以深入理解纳米颗粒在强激光场下的发射动力学。这种理解不仅有助于实现纳米颗粒电离的精确调控，还为相关技术的实际应用开辟了新的可能。相关实验技术及其理论覆盖了多个学科领域，如原子、分子、凝聚态物理、化学和生物学等。综述了纳米颗粒产生、输运和诊断系统，深入分析强场-纳米颗粒体系的相关理论模型，最后总结了纳米光电子离子发射的最新研究成果，并展望未来的发展趋势。

关键词：强场电离纳米颗粒近场分布电子离子发射

草鱼不同月龄性腺组织学观察及性别特征基因cyp19a1a和amh的表达分析

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渔业科学进展 2024年

作者：祁博李胜杰杜金星肖小芳张东云朱涛雷彩霞刘志军宋红梅上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心中国水产科学研究院珠江水产研究所农业农村部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室湖州师范学院生命科学学院

为探讨草鱼(Ctenopharyngodon idella)性腺发生、性别分化及发育规律，本研究对1、2、3、4、5、6、12、24、36和48月龄草鱼性腺组织结构以及性别特征基因cyp19a1a和amh的表达差异进行了分析。组织切片结果显示，2月龄时，首次在生殖嵴... 详细信息

为探讨草鱼(Ctenopharyngodon idella)性腺发生、性别分化及发育规律，本研究对1、2、3、4、5、6、12、24、36和48月龄草鱼性腺组织结构以及性别特征基因cyp19a1a和amh的表达差异进行了分析。组织切片结果显示，2月龄时，首次在生殖嵴中观察到原始生殖细胞，标志原始性腺形成。3月龄时，雌性草鱼性腺中观察到卵巢腔和卵巢小叶。4月龄时，观察到卵原细胞，表明其在3月龄时出现解剖学分化，4月龄时出现细胞学分化。4月龄雄性草鱼在性腺中观察到输精导管，5月龄时观察到精原细胞，表明其在4月龄出现解剖学分化，5月龄出现细胞学分化。12、24、36和48月龄草鱼卵巢分别处于发育的第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ期，精巢则分别为发育的第Ⅱ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ期。荧光定量结果显示，雌性特征基因cyp19a1a在卵巢中的表达量总体呈先上升后下降再上升的趋势，2月龄时显著上调(P学资料，也为其性别调控技术研究奠定了基础。

关键词：草鱼性别分化组织切片基因表达

城镇中小规模污水处理厂碳排放分析及碳削减对策

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环境科学 2024年

作者：张翔宇范业弘朱晗彬韦政张一璠杨阿明顾敦罡何岩自然资源部大都市区国土空间生态修复工程技术创新中心上海同济环境工程科技有限公司上海嘉定新城污水处理有限公司上海复旦水务工程技术有限公司华东师范大学生态与环境科学学院上海市城市化生态过程与生态恢复重点实验室上海有机固废生物转化工程技术研究中心上海工程技术大学化学化工学院崇明生态研究院

基于2022年11座城镇中小规模污水厂全年数据，从污水处理全过程角度系统分析了3种典型工艺(AAO、MSBR和氧化沟)的碳排放，并采用偏最小二乘法结构方程模型(PLS-SEM)研究了不同进水特征(TP、TN、BOD5、COD、进水量和碳氮比)对碳排放的影... 详细信息

基于2022年11座城镇中小规模污水厂全年数据，从污水处理全过程角度系统分析了3种典型工艺(AAO、MSBR和氧化沟)的碳排放，并采用偏最小二乘法结构方程模型(PLS-SEM)研究了不同进水特征(TP、TN、BOD5、COD、进水量和碳氮比)对碳排放的影响作用.结果表明，间接碳排放占中小规模污水厂总碳排放的主导地位(69.5%)，电耗碳排放是最大的来源(43.1%)；MSBR工艺的评价碳排放强度[(0.363±0.007)kg·m-3] 低于AAO工艺[(0.439±0.099)kg·m-3]和氧化沟工艺[(0.396±0.025)kg·m-3]，具有更优的低碳运行水平.中小规模污水厂各部分碳排放强度占比依次为：生物处理(58.7%)>污泥脱水+除臭(17.9%)>深度处理(17.3%)>预处理(6.1%).其中生物处理部分分别占3种工艺的51.5%、53.9%和73.1%.另外，进水COD质量浓度和碳氮比分别对直接碳排放(N2O和CH4)有显著正向影响(路径系数为0.584和0.5)和显著负向影响(路径系数为-0.416)；进水TN、BOD5和TP质量浓度分别对间接碳排放(电耗)和间接碳排放(物耗)有显著正向影响(路径系数分别为0.078、0.537和0.5).中小规模污水厂碳削减可从碳排放强度减量、低碳运行水平优化和政府调控加强管理这3个方面进行.

关键词：污水处理厂(WWTPs) 碳排放碳核算碳削减低碳运行

紫花苜蓿生长调节因子互作因子GIF基因家族的鉴定与分析

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分子植物育种 2024年

作者：张晓捷赵美丽杨振宇王志才谷丽丽新疆农业大学草业学院新疆草地资源与生态实验室深圳兰科中心兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室华南农业大学林学与风景园林学院南方石灰岩植物研究中心上海师范大学生命科学学院植物种质资源开发协同创新中心

生长调节因子互作因子GIF(GRF-Interacting Factor)是植物中一类具有SSXT(SNH)保守结构域的共转录激活因子，与生长调节因子GRF(Growth-Regulating Factor)共同参与调节植物生长发育、生殖发育、形态结构建成和逆境胁迫响应等生理过程... 详细信息

生长调节因子互作因子GIF(GRF-Interacting Factor)是植物中一类具有SSXT(SNH)保守结构域的共转录激活因子，与生长调节因子GRF(Growth-Regulating Factor)共同参与调节植物生长发育、生殖发育、形态结构建成和逆境胁迫响应等生理过程。紫花苜蓿(Medicago sativa)是重要的牧草种类，生长发育和形态结构直接影响牧草产量。前人已研究报道了紫花苜蓿MsGRF基因家族，但对GIF基因家族仍缺乏系统了解。本研究通过生物信息学分析，对紫花苜蓿“新疆大叶”(Medicago sativa cv. ‘Xinjiang Daye’)GIF基因家族进行鉴定与分析，为探究MsGIFs的功能和苜蓿遗传改良及新品种创制奠定基础。分析结果表明，在全基因组发现MsGIF基因17个，基因大小为156～702 bp，不均匀地分布在14条染色体上，可进一步分为三个亚家族。此外，MsGIFs氨基酸序列长度在51～233 aa之间，蛋白质分子量在5773.55～24996.80 Da之间，蛋白质等电点在5.07～6.49之间，均是亲水性蛋白质，亚细胞定位预测结果表明多在细胞核，与其基因表达调控功能一致。本文还对MsGIF基因家族基因结构、蛋白质二级和三级结构、启动子顺式作用元件及物种内基因共线性关系进行分析。为探究GIF在牧草生长发育和株型建成等过程中的生物学功能提供一定的参考。

关键词：紫花苜蓿生长调节因子互作因子 GIF基因家族 GRF

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基因治疗在临床应用中的研究进展

生物工程学报 2019年第12期35卷 2295-2307页

作者：陈曦陈亮李大力华东师范大学生命科学学院上海市调控生物学重点实验室

20世纪60年代,科学家首次提出利用基因治疗治愈遗传疾病的概念。这一全新的概念性策略旨在通过将外源性遗传物质引入患者体内来获得长期的治疗效果。五十年的风雨沉浮,21世纪取得的里程碑式突破为基因治疗开启了新的篇章。文中回顾和总... 详细信息

20世纪60年代,科学家首次提出利用基因治疗治愈遗传疾病的概念。这一全新的概念性策略旨在通过将外源性遗传物质引入患者体内来获得长期的治疗效果。五十年的风雨沉浮,21世纪取得的里程碑式突破为基因治疗开启了新的篇章。文中回顾和总结了基因治疗的发展历程和重大突破,包括一些重要的临床试验和已批准上市的基因疗法,以及新兴的基因编辑技术。相对于传统疗法的独特优势,基因疗法将会成为治疗遗传疾病的重要手段,必将造福全人类。

关键词：基因治疗遗传罕见病临床试验上市药物基因组编辑技术 CRISPR/Cas9系统

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新技术能使DNA测序的成本降低多少?

科学通报 2017年第19期62卷 2042-2046页

作者：石铁流华东师范大学生命科学学院上海市调控生物学重点实验室生物信息学及计算生物学中心上海200241

1977年,Sanger及其同事发明出最早的DNA测序技术,1990年开始的人类基因组计划催生了DNA测序技术的自动化.近10多年来,新一代测序技术得到了飞速的发展,测序速度及测序通量的巨大提升使得个人基因组的测序成本急剧下降,达到了1000美元一... 详细信息

1977年,Sanger及其同事发明出最早的DNA测序技术,1990年开始的人类基因组计划催生了DNA测序技术的自动化.近10多年来,新一代测序技术得到了飞速的发展,测序速度及测序通量的巨大提升使得个人基因组的测序成本急剧下降,达到了1000美元一个全基因组的水平,从而使得DNA测序技术在生命科学研究领域以及临床医学上有着更广阔的应用前景.近来出现的第三代测序技术具有测序过程中无需PCR扩增而且产生非常长的测序片段的优势.尽管其测序的准确性只达到85%左右且成本高,但仍然显示出了较好的前景."精准医学"时代的来临将进一步促进DNA测序技术的革新,并使个人基因组测序成本进一步下降,有望使个人基因组测序成本进入百美元的时代.随着海量的测序数据的积累,如何有效地分析和解读这些测序数据面临着巨大的挑战,生物信息学在此过程中扮演着关键的角色.

关键词： DNA测序技术个人基因组测序成本新一代测序技术第三代测序技术

人工分子机器:分子尺度运动的精准化与可视化

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中国科学：化学 2024年第5期54卷 689-702页

作者：秦文煜施晨宇顾睿锐曲大辉华东理工大学结构可控先进功能材料及其制备教育部重点实验室费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心材料生物学与动态化学前沿科学中心精细化工研究所化学与分子工程学院上海200237

分子机器在自然界至关重要,其在生物过程中执行了大量复杂的功能,从而实现不同尺度的动态行为调控.受生物系统的启发,科学家致力于研究人工分子机器在分子尺度下的精准构筑和定向运动,并通过层级组装实现信号传递和功能放大,从而推动动... 详细信息

分子机器在自然界至关重要,其在生物过程中执行了大量复杂的功能,从而实现不同尺度的动态行为调控.受生物系统的启发,科学家致力于研究人工分子机器在分子尺度下的精准构筑和定向运动,并通过层级组装实现信号传递和功能放大,从而推动动态智能材料的设计发展.但如何利用新方法精准构筑复杂的人工分子机器,如何将分子尺度的运动动态进行“可视化”,以及如何在生命科学研究中发挥其功能,一直是分子机器领域的研究热点.本文基于本课题组的工作,系统介绍了人工分子机器在分子尺度的精准结构构筑、信号输出以及其在跨膜运输方面的研究.最后总结了该领域在多尺度精细化和功能化方面的挑战,并展望了分子机器在宏观智能材料领域的发展前景.

关键词：分子机器机械互锁分子分子马达光学信号表征跨膜运输

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基因编辑技术及其在疾病治疗中的研究进展

遗传 2019年第7期41卷 582-598页

作者：牛煦然尹树明陈曦邵婷婷李大力上海市调控生物学重点实验室华东师范大学生命科学学院

基因编辑是一种基于人工核酸酶的遗传操作技术,能精确地对DNA或RNA进行高效改造。基因编辑除了在基础研究、生物育种和药物筛选等方面展现了巨大前景之外,在疾病治疗(特别是基因遗传病)领域的前景与进展尤为引人注目。本文在介绍基因编... 详细信息

基因编辑是一种基于人工核酸酶的遗传操作技术,能精确地对DNA或RNA进行高效改造。基因编辑除了在基础研究、生物育种和药物筛选等方面展现了巨大前景之外,在疾病治疗(特别是基因遗传病)领域的前景与进展尤为引人注目。本文在介绍基因编辑技术的发展及其在疾病治疗中不同策略的基础上,重点围绕遗传疾病的基因治疗研究,综述了基因编辑技术(包括单碱基编辑和表观调控等技术)在血液系统、肝脏、肌肉和神经系统等疾病治疗的研究进展,并对基因编辑治疗疾病的未来发展进行了展望。

关键词：基因编辑基因治疗遗传病