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PCR荧光探针技术对结核分枝杆菌复合群及利福平耐药性检测性能的评价

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中国防痨杂志 2024年第10期46卷 1250-1258页

作者：李静姜琦江渊沈鑫上海市疾病预防控制中心结核病和艾滋病防治所上海200336 上海市预防医学科学院上海200336

目的:评价PCR荧光探针技术检测痰液样本中结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)和利福平耐药性效果,为进一步开展“结核分枝杆菌复合群及利福平耐药核酸检测试剂盒”多中心临床试验提供可行性研究数据。方法:... 详细信息

目的:评价PCR荧光探针技术检测痰液样本中结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex,MTBC)和利福平耐药性效果,为进一步开展“结核分枝杆菌复合群及利福平耐药核酸检测试剂盒”多中心临床试验提供可行性研究数据。方法:采用前瞻性研究方法,参照入组标准收集2021年12月至2022年8月上海市3家结核病定点医院肺科门诊就诊的205例初诊疑似肺结核患者的3份痰液样本(即时痰、夜间痰、晨痰),分别进行痰涂片、BACTEC MGIT 960(MGIT 960)、GeneXpert MTB/RIF(Xpert)和PCR荧光探针法检测,评价PCR荧光探针法对痰液样本中MTBC及利福平耐药性的检测效能。另对随机选取同期上海市疾病预防控制中心结核病实验室菌株库中保存的96株MTBC临床菌株(包括利福平表型耐药菌株47株和利福平表型敏感菌株49株)分别进行PCR荧光探针法和Xpert检测利福平耐药性,分析两种检测方法对利福平耐药相关基因突变的检出情况。结果:205例疑似肺结核患者中,PCR荧光探针法对MTBC的检出率为22.44%(46/205),与MGIT 960[21.95%(45/205)]、Xpert[20.98%(43/205)]和痰涂片[16.10%(33/205)]的差异均无统计学意义(χ^(2)=0.014,P=0.904;χ^(2)=0.129,P=0.719;χ^(2)=2.650,P=0.104)。以临床诊断为参照标准,PCR荧光探针法、Xpert、MGIT 960和痰涂片检测MTBC的敏感度(95%CI)分别为48.10%(36.93%~59.56%)、48.10%(36.93%~59.56%)、50.63%(39.23%~61.97%)和40.51%(29.79%~52.15%),特异度(95%CI)分别为93.65%(87.47%~97.12%)、96.03%(90.52%~98.53%)、96.03%(90.52%~98.53%)和99.21%(95.01%~99.96%),一致率分别为76.10%(156/205)、77.56%(159/205)、78.54%(161/205)和76.59%(157/205),Kappa值分别为0.453、0.482、0.507和0.446。PCR荧光探针法检测痰液样本中MTBC的涂阴和极低级别阳性样本的检出率[10.73%(19/177)]与Xpert检测结果[8.47%(15/177)]的差异无统计学意义(χ^(2)=0.793,P=0.373)。PCR荧光探针法在检出MTBC的46份样本中同时检出6份样本发生利福平耐药基因突变,突变率为13.04%(6/46);而Xpert在检出MTBC的43份样本中仅同时检出1份样本发生利福平耐药基因突变,突变率为2.33%(1/43)。在96株临床菌株中,两种分子检测方法均检测到56株菌株发生利福平耐药基因突变,除2株探针突变类型不一致外,其他探针突变类型均一致,且多发生在probe E(529~533)和FAM通道(531/533突变)。结论:以临床诊断为参照标准,PCR荧光探针法检测MTBC的效能与MGIT 960、Xpert和痰涂片基本相当,且与Xpert检测MTBC临床菌株的利福平耐药性效果一致,认为PCR荧光探针法不仅是一种等同于Xpert检测功能的新技术,还具有操作简单、价格低于Xpert、真正实现一体化和全封闭等优势。建议在临床推广过程中进一步优化PCR荧光探针法以提高MTBC检出率,并开展多中心临床试验验证研究。

关键词：分枝杆菌,结核抗药性,细菌利福平微生物敏感性试验分子诊断技术

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上海市农村肺结核病的线索调查

中华结核和呼吸杂志 1993年第2期16卷 83-84页

作者：彭靖汪钟贤 200031，上海市结核病防治中心 00031，上海市结核病防治中心

上海市在农村地区对9个县的72个乡312092人通过线索调查发现肺结核病的研究。结果表明在如此庞大的人群中有肺结核可疑症状者仅为8.21%,45岁以上人群的症状率亦仅10%。通过对8.21%的可疑者检查后发现肺结核病例233例,其中菌阳病例71例;... 详细信息

上海市在农村地区对9个县的72个乡312092人通过线索调查发现肺结核病的研究。结果表明在如此庞大的人群中有肺结核可疑症状者仅为8.21%,45岁以上人群的症状率亦仅10%。通过对8.21%的可疑者检查后发现肺结核病例233例,其中菌阳病例71例;在发现病例中60岁以上年龄组最高占总病例的64.8%,占总菌阳病例的66.2%。60岁以上男性有与无可疑症状者的发现率之比为22.4:2.4,菌阳病例为7.8:0.6。说明在广大农村地区线索调查可以有效地发现肺结核病例,并应特别重视有可疑症状的60岁以上的男性人群。

关键词：肺结核调查上海市

上海市2014-2021年肠道门诊15岁及以上感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌流行特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第3期45卷 339-346页

作者：林声郑雅旭宫霄欢肖文佳俞晓潘浩陈健上海市疾病预防控制中心传染病防治所上海200336 上海市预防医学研究院上海200336

目的了解上海市肠道门诊≥15岁感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌(DEC)流行特征,为DEC感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法采用多阶段系统抽样方法,在上海市22家监测点医疗机构的肠道门诊开展腹泻症状监测,收集病例的人口学、... 详细信息

目的了解上海市肠道门诊≥15岁感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌(DEC)流行特征,为DEC感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法采用多阶段系统抽样方法,在上海市22家监测点医疗机构的肠道门诊开展腹泻症状监测,收集病例的人口学、临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送至医疗机构所在区CDC开展DEC检测及鉴定分型,分析比较2014-2021年不同人群和季节的DEC阳性率。统计学分析采用χ^(2)检验。结果在15185例感染性腹泻病例中,DEC的总阳性率为8.05%(1222/15185)。其中男性阳性率(8.74%,684/7824)高于女性(7.31%,538/7361),15~29岁组人群阳性率最高(9.14%,335/3665),2021年阳性率最高(10.21%,83/813),以上差异有统计学意义(均P上海市感染性腹泻患者重要病原体之一,引起的感染性腹泻全年均可发生,夏秋季高发,流行型别为肠产毒性大肠埃希菌、肠黏附性大肠埃希菌和肠致病性大肠埃希菌。应针对不同年龄、不同季节和不同型别的DEC感染性腹泻采取特异性的防控措施。

关键词：哨点监测肠道门诊感染性腹泻致泻性大肠埃希菌流行特征

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结核病免疫治疗年度进展2023

中华结核和呼吸杂志 2024年第4期47卷 371-375页

作者：柯荟范琳同济大学附属上海市肺科医院结核科上海市感染性疾病(结核病)医学临床研究中心上海市结核(肺)重点实验室上海200433

结核病作为一种慢性感染性疾病,与免疫调控及免疫效应密切相关。免疫治疗作为结核病综合治疗的重要手段之一,可改善结核病的疗效、控制结核病的传播。2022年10月至2023年9月,国内外进行了多项关于结核病的免疫治疗研究,对耐多药、广泛... 详细信息

结核病作为一种慢性感染性疾病,与免疫调控及免疫效应密切相关。免疫治疗作为结核病综合治疗的重要手段之一,可改善结核病的疗效、控制结核病的传播。2022年10月至2023年9月,国内外进行了多项关于结核病的免疫治疗研究,对耐多药、广泛耐药结核的治疗提供了新的可能。宿主靶向治疗及治疗性疫苗的研究是结核病辅助治疗探索的新方向。

关键词：慢性感染性疾病免疫治疗广泛耐药结核治疗性疫苗耐多药结核病靶向治疗免疫调控

基于CT影像的深度学习模型在肺结核与非结核分枝杆菌肺病中的鉴别诊断价值

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中国防痨杂志 2024年第10期46卷 1236-1242页

作者：李文婷王丽方勇顾瑾沙巍同济大学附属上海市肺科医院结核病临床研究中心上海200433

目的:基于胸部CT影像,采用多种深度学习网络构建肺结核与非结核分枝杆菌肺病的二分类模型,并评估这些模型在两种疾病间的鉴别诊断效能。方法:对2019年10月至2022年12月在同济大学附属上海市肺科医院结核科确诊为肺结核和非结核分枝杆菌... 详细信息

目的:基于胸部CT影像,采用多种深度学习网络构建肺结核与非结核分枝杆菌肺病的二分类模型,并评估这些模型在两种疾病间的鉴别诊断效能。方法:对2019年10月至2022年12月在同济大学附属上海市肺科医院结核科确诊为肺结核和非结核分枝杆菌肺病患者的胸部CT图像进行回顾性分析。纳入研究的数据被分为肺结核组(197例)和非结核分枝杆菌肺病组(212例)。将数据集的80%分配至训练集,20%分配至测试集。采用深度学习网络(ResNeXt、ResNet、Transformer、SENet、ShuffleNet、Swin-transformer和DenseNet算法)构建二分类模型。采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)、准确率、敏感度和特异度评价模型的分类性能。在测试集中,将最优人工智能模型与3位不同年资的呼吸科(结核亚专业)医生的诊断性能进行比较。结果:ResNeXt模型、ResNet模型、Transformer模型、SENet模型、ShuffleNet模型、Swin-transformer模型、DenseNet模型在训练集中的AUC值分别为0.894、0.839、0.864、0.816、0.841、0.831、0.829;在测试集中的AUC值分别为0.826、0.816、0.817、0.811、0.784、0.771、0.735。在测试集中,最优模型ResNeXt的诊断性能(AUC值为0.826)高于中年资医生(AUC值为0.679)和低年资医生(AUC值为0.663),差异均有统计学意义(Z值分别为2.035和2.242,P值均结核和非结核分枝杆菌肺病方面展现出了理想的诊断性能。

关键词：分枝杆菌感染人工智能体层摄影术,X线计算机诊断,鉴别

PAN-TB治疗策略的实施对结核病防控的意义及挑战

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中国防痨杂志 2024年第10期46卷 1188-1192页

作者：沙巍同济大学附属上海市肺科医院结核病临床研究中心上海200433

全球耐药结核病的防控仍面临巨大挑战,PAN-TB方案是适用于所有结核病的一线方案,即确诊活动性结核病后即启动该方案,而不需要获得患者的耐药情况。推行PAN-TB方案的目的是旨在尽快启动有效治疗,降低传播,并可以大幅度减轻结核病规划管... 详细信息

全球耐药结核病的防控仍面临巨大挑战,PAN-TB方案是适用于所有结核病的一线方案,即确诊活动性结核病后即启动该方案,而不需要获得患者的耐药情况。推行PAN-TB方案的目的是旨在尽快启动有效治疗,降低传播,并可以大幅度减轻结核病规划管理的复杂性。它不仅是临床治疗方法,更是公共卫生手段。本文就PAN-TB策略的定义、方案的要求、全球的研究进展,以及对于结核病防控的意义和目前面临的挑战进行阐述,以期为中国结核病的防控提供新的思路。

关键词：结核抗结核药治疗应用方案评价

HIV/AIDS并发亚临床结核病现状研究进展

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中国防痨杂志 2024年第5期46卷 596-600页

作者：刘美君李锋复旦大学上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032 上海市公共卫生临床中心结核病研究中心上海201508

人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)双重感染一直是全球公共卫生关注的问题,也是临床诊疗工作的重点和挑战。随着人们对于结核病的认识不断完善,人们逐渐认识到亚临床... 详细信息

人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)与结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)双重感染一直是全球公共卫生关注的问题,也是临床诊疗工作的重点和挑战。随着人们对于结核病的认识不断完善,人们逐渐认识到亚临床结核病(subclinical tuberculosis,STB)在疾病谱中的重要性。笔者详细探讨了HIV/AIDS并发STB的流行现状、临床特征、筛检与诊断、治疗和预防等方面问题,旨在引起公共卫生和临床从业者的高度关注,鼓励进一步开展深入研究,提高对HIV/AIDS并发STB患者的重视,为制定降低HIV/AIDS与STB共病的措施提供科学依据。

关键词：结核 HIV感染获得性免疫缺陷综合征共病现象

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脂阿拉伯甘露聚糖抗原检测用于艾滋病病毒感染者和艾滋病患者结核病诊断的研究进展

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中华结核和呼吸杂志 2024年第5期47卷 475-480页

作者：王美霁李锋复旦大学上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032 上海市公共卫生临床中心结核病研究中心上海201508

结核病是艾滋病病毒感染者和艾滋病患者(people living with HIV/AIDS,PLWHA)死亡的主要原因,给其带来巨大的疾病负担,在PLWHA人群中早期筛查结核病,是降低传播、控制其病情发展的关键举措。脂阿拉伯甘露聚糖(lipoarabinomannan,LAM)是... 详细信息

结核病是艾滋病病毒感染者和艾滋病患者(people living with HIV/AIDS,PLWHA)死亡的主要原因,给其带来巨大的疾病负担,在PLWHA人群中早期筛查结核病,是降低传播、控制其病情发展的关键举措。脂阿拉伯甘露聚糖(lipoarabinomannan,LAM)是MTB的糖脂,可以在结核患者尿液中检测到,LAM有助于快速、准确诊断结核病。本文综述了LAM及其在PLWHA诊断中的应用与局限性,希望为PLWHA结核病的诊断提供参考依据。

关键词：脂阿拉伯甘露聚糖早期筛查结核病诊断疾病负担抗原检测 HIV/AIDS PLWHA LAM

2019-2022年上海市杨浦区视力残疾病因调查

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国际眼科杂志 2024年第8期24卷 1341-1344页

作者：冯建秀陈潞王佳朱希倩孙祖贤张梦佳王宏冯彦清姜敏敏中国上海市杨浦区眼病防治所、上海市杨浦区控江医院 200093

目的:分析2019-2022年上海市杨浦区视力残疾患者致盲和低视力的原因。方法:采用横断面研究方法,选取2019-04/2022-12于上海市杨浦区控江医院参加视力残疾评定的患者1604例为研究对象,由经过培训的医生确定视力残疾的等级和主要致盲和低... 详细信息

目的:分析2019-2022年上海市杨浦区视力残疾患者致盲和低视力的原因。方法:采用横断面研究方法,选取2019-04/2022-12于上海市杨浦区控江医院参加视力残疾评定的患者1604例为研究对象,由经过培训的医生确定视力残疾的等级和主要致盲和低视力的原因。结果:共鉴定出视力残疾患者804例,60岁及以上者占87.31%。致残病因依次为高度近视性视网膜病变(30.47%)、年龄相关性黄斑变性(23.26%)、青光眼(17.04%)和糖尿病视网膜病变(11.07%)。青光眼(36.96%)是首位致盲病因。结论:视力残疾患者以60岁及以上老年人为主,应多关注老年人,针对不同眼部疾病采取分级分类的综合防治和康复手段,早发现、早干预,减少视力残疾的发生。

关键词：视力残疾盲低视力老年人高度近视青光眼