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湖羊MSTRG.96141.1转录本表达特征分析及在卵巢颗粒细胞凋亡中调控机制

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南京农业大学学报 2024年

作者：姚晓磊王汉斌刘智琳张艳丽魏宗友南京农业大学动物科技学院太仓市畜牧兽医站

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；... 详细信息

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；低繁，Low Prolificacy FecBB，LPBB)健康优势卵泡（> 5 mm）全转录组测序数据，鉴定到差异miR-3957-3p，采用生物信息学、双荧光素酶报告等方法确定与miR-3957-3p存在靶向关系的lncRNA；在此基础上，以湖羊GC为模型，采用过表达/干扰、qRT-PCR、FSIH、细胞流式术等技术，分析其表达特征和对湖羊GC凋亡的影响。[结果]miR-3957-3p表达水平HPBB组显著低于LPBB组；lncRNA（MSTRG.96141.1）与miR-3957-3p存在靶向关系；该转录本在湖羊生殖器官中的卵巢上表达最高，HPBB组显著高于LPBB组；进一步在湖羊卵巢GC中检测到该转录本的阳性信号，且定位于GC细胞质；干扰MSTRG.96141.1上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，进而促进湖羊GC凋亡；过表达miR-3957-3p上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，下调Bcl-2基因mRNA表达水平，进而促进湖羊GC凋亡；干扰miR-3957-3p则与之相反。[结论]MSTRG.96141.1通过吸附miR-3957-3p参与调控湖羊GC凋亡，进而影响卵泡发育。而MSTRG.96141.1能否作为湖羊繁殖力的分子标记，还需要进一步探究。

关键词：湖羊卵巢颗粒细胞 MSTRG.96141.1 miR-3957-3p 细胞凋亡

15个物种Toll样受体5基因密码子使用偏好性分析

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中国畜牧兽医 2024年第1期51卷 11-22页

作者：戴开宇杨治风郭烨星张家港市畜牧兽医站张家港215600

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统... 详细信息

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统计,再基于同义密码子相对使用度(RSCU)和CDS分别进行聚类分析,推测TLR5基因发挥相似生物学功能的物种,并通过ENC-plot、Neutrality-plot和PR2-plot 3种绘图分析造成密码子偏好性现象的可能因素。【结果】9个物种TLR5基因CDS密码子第3位碱基GC含量(GC3)>0.5,14个物种有效密码子数(ENC)值>35,15个物种密码子AU偏斜度(AU skew)和GC偏斜度(GC skew)值<0;不同物种TLR5基因CDS有31个高频密码子,其中21个以G或C结尾,此外GCC、AGA、AGG和CUG表现为较高的RSCU值,为优势密码子;RSCU层次聚类和系统发育聚类结果不完全相同,但两种聚类方法均提示猪、牛和羊TLR5基因的密码子使用特点相似,鸡和绿头鸭相似,虹鳟和鲫鱼相似;ENC-plot分析发现各物种TLR5基因均分布在标准曲线下方较远位置,Neutrality-plot显示密码子第1、2位GC含量的平均值(GC12)和GC3含量呈极显著正相关(P<0.01),PR2-plot则显示密码子第3位碱基使用频率不一致。【结论】不同物种TLR5基因密码子使用模式存在偏好性现象,该现象是物种进化过程中受碱基突变和翻译选择双重影响的结果,其中碱基突变是主要影响因素。研究结果可为后续TLR5基因的生物学功能挖掘提供新的角度和理论认识。

关键词： TLR5基因密码子使用偏好性碱基突变翻译选择

基于线粒体全基因组的柴达木牛母系遗传多样性、群体结构及系统发育分析

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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2024年 1-12页

作者：魏旭东刘瑞林李瑞哲张卫忠王启辉赵海明郭卫兴许正全尕藏当周韩赟雷初朝马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海省格尔木市畜牧兽医站青海省格尔木市郭勒木德乡畜牧兽医站青海省格尔木市乌图美仁乡畜牧兽医站青海省都兰县宗加镇畜牧兽医站青海省乌兰县畜牧兽医站西北农林科技大学动物科技学院

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5... 详细信息

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5个北方黄牛品种(即蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛和安西牛)和2个国外培育品种(荷斯坦牛和日本和牛)的共129条线粒体全基因组相应序列进行综合分析,以揭示柴达木牛线粒体基因组遗传变异,明确其母系遗传多样性水平、群体遗传结构组成、母系遗传背景及与我国北方部分地方黄牛品种、国外培育品种间的遗传关系。【结果】(1)60头柴达木牛线粒体全基因组序列比对分析共发现346个多态位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点295个;根据序列间核苷酸变异共确定37种单倍型(H1～H37)。遗传多样性分析显示,柴达木牛线粒体基因组单倍型多样度为(0.981 0±0.006 0),核苷酸多样度为(0.003 3±0.000 2),提示其拥有丰富的母系遗传多样性。(2)系统发育分析表明,柴达木牛拥有普通牛和瘤牛2大母系支系,且以普通牛T支系为主,拥有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,提示柴达木牛拥有普通牛和瘤牛血统,有两个母系起源。(3)群体遗传分化分析表明,柴达木牛与蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛、日本和牛遗传分化程度均很弱,而与安西牛、荷斯坦牛达到中等遗传分化程度。(4)聚类分析显示,柴达木牛与蒙古牛聚类关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、安西牛、延边牛聚类关系相对较近,与日本和牛、荷斯坦牛聚类关系较远,其聚类结果与分化程度基本一致。【结论】柴达木牛拥有丰富的母系遗传多样性,由普通牛和瘤牛两个母系支系组成,含有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,推测其有2个母系起源。柴达木牛与蒙古牛亲缘关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、延边牛、安西牛遗传关系较近,而与日本和牛、荷斯坦牛遗传关系较远。

关键词：柴达木牛 mt DNA 母系起源群体结构

发酵饲料对乳鸽屠宰性能、器官发育及肌肉品质的影响

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中国饲料 2024年第15期 131-136页

作者：肖长峰丁梓钊吕文纬李欣侯浩宾杨长锁朱丽慧上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106

为研究“2+3”生产模式下,日粮中添加发酵饲料对乳鸽屠宰性能、内脏器官发育及肌肉品质的影响,试验选取健康、平均体重约560 g和产蛋性能相近且同期产蛋的8月龄父母代卡奴种鸽60对,随机分为对照组(C组)和试验组(F组),每组5个重复(6对种... 详细信息

为研究“2+3”生产模式下,日粮中添加发酵饲料对乳鸽屠宰性能、内脏器官发育及肌肉品质的影响,试验选取健康、平均体重约560 g和产蛋性能相近且同期产蛋的8月龄父母代卡奴种鸽60对,随机分为对照组(C组)和试验组(F组),每组5个重复(6对种鸽/重复)。C组和F组分别饲喂日粮+常规肉鸽保健砂和日粮+发酵饲料与常规肉鸽保健砂混合(1:1)的饲粮,试验周期50 d(其中预饲期7 d,试验期43 d)。结果显示:日粮中添加发酵饲料可显著提高乳鸽活体重、屠体重、屠宰率、半净膛重、半净膛率、全净膛重(P<0.01)以及胸肌重(P<0.05);F组乳鸽腺胃重、腺胃指数、肝脏重、肝脏指数、肺重、肺指数、肾脏重(P<0.01)以及脾脏重(P<0.05)均显著高于C组;饲喂发酵饲料可显著降低乳鸽胸肌肉电导率(P<0.01),提高胸肌肉L*值(P<0.01)和胸肌氨基酸成分(P<0.05)。结果表明日粮中添加发酵饲料对乳鸽屠宰性能、内脏器官发育和肉品质等方面均有显著提高,可为肉鸽养殖户提供参考和借鉴。

关键词：乳鸽发酵饲料屠宰性能器官发育肉品质

胡萝卜缨青贮替代全株玉米青贮对泌乳期文登奶山羊生产性能、乳品质、养分表观消化率、抗氧化能力及免疫功能的影响

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动物营养学报 2024年第1期36卷 438-450页

作者：李大璐林英庭丁葵英陈佳程明王金虎秦飞宇郭艺璇朱风华青岛农业大学动物科技学院青岛266109 潍坊海关潍坊261041 威海荣成市俚岛畜牧兽医站威海264317 青岛市畜牧兽医研究所青岛266100

本试验旨在探究胡萝卜缨青贮替代全株玉米青贮对文登奶山羊生产性能、乳品质、养分表观消化率、抗氧化能力及免疫功能的影响。选用体重(48.34±1.86)kg、产奶量(1.29±0.46)kg/d、产羔150 d左右的3胎文登奶山羊64只,随机分为4组,每组4... 详细信息

本试验旨在探究胡萝卜缨青贮替代全株玉米青贮对文登奶山羊生产性能、乳品质、养分表观消化率、抗氧化能力及免疫功能的影响。选用体重(48.34±1.86)kg、产奶量(1.29±0.46)kg/d、产羔150 d左右的3胎文登奶山羊64只,随机分为4组,每组4个重复,每个重复4只羊。对照组饲喂基础饲粮,试验1、2、3组分别以胡萝卜缨青贮替代基础饲粮中20%、30%、40%的全株玉米青贮。试验周期为67 d,其中预试期7 d,正试期60 d。结果显示:1)与对照组相比,试验1、3组的平均日产奶量显著提高(P<0.05);试验1组的料奶比显著降低(P<0.05),4%标准乳产量显著提高(P<0.05);试验3组的平均日采食量显著提高(P<0.05)。2)与对照组相比,试验3组乳中β-胡萝卜素含量极显著提高(P<0.01),试验2组乳中β-胡萝卜素含量显著提高(P<0.05);试验2、3组乳中维生素A与叶绿素铜钠含量极显著提高(P<0.01)。各组乳中农药残留均未检出。3)与对照组相比,3个试验组的粗蛋白质表观消化率极显著提高(P<0.01),试验1、3组的干物质表观消化率、试验1组的粗脂肪表观消化率、试验3组的中性洗涤纤维表观消化率皆显著提高(P<0.05)。4)与对照组相比,3个试验组的血清免疫球蛋白G(IgG)含量显著提高(P<0.05),超氧化物歧化酶(SOD)与谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性极显著提高(P<0.01);试验1组的血清总蛋白(TP)和球蛋白(GLB)含量显著提高(P<0.05),尿素氮(UN)与丙二醛(MDA)含量显著降低(P<0.05),总抗氧化能力(T-AOC)极显著提高(P<0.01)。综上所述,在饲粮中以胡萝卜缨青贮替代20%全株玉米青贮可提高泌乳期文登奶山羊的产奶性能、乳品质、养分表观消化率、抗氧化能力和免疫功能。

关键词：胡萝卜缨青贮文登奶山羊产奶性能乳品质养分表观消化率抗氧化能力免疫功能

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畜禽粪污资源化利用综合施策与探索

今日畜牧兽医 2024年第4期40卷 68-70页

作者：牛卫华李晓青朱亚琳阜宁县畜牧兽医站 224400 阜宁县农业农村局阜城畜牧兽医站 224400 阜宁县农业农村局开发区畜牧兽医站 224400

随着畜牧业的发展,我国的畜禽养殖量在不断增加,畜禽粪污排放量也在不断增加。在畜禽养殖业发展大大提高人们生活水平的同时,也给环境保护带来了巨大的压力,环境污染问题已成为制约畜牧业持续发展的重要因素。近年来,阜宁县政府制定了... 详细信息

随着畜牧业的发展,我国的畜禽养殖量在不断增加,畜禽粪污排放量也在不断增加。在畜禽养殖业发展大大提高人们生活水平的同时,也给环境保护带来了巨大的压力,环境污染问题已成为制约畜牧业持续发展的重要因素。近年来,阜宁县政府制定了一系列激励政策,鼓励生态健康养殖,改善畜禽养殖环境,积极探索畜禽粪污资源化利用的有效途径,有效地缓解了全县农业面源污染,从而推进畜禽养殖可持续发展。

关键词：畜禽粪污治理资源化利用

不同温湿度组合对鹅种蛋孵化效果及孵化后雏鹅体重的影响

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中国家禽 2024年第3期46卷 115-119页

作者：龚绍明王惠影王贤泽李光全刘毅王翠杨云周何大乾上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海201106

为研究不同孵化模式下温度和湿度对鹅种蛋孵化效果及雏鹅生长发育性能的影响,试验采用“单阶段”变温和“二阶段”恒温孵化模式,每种孵化模式设定两种不同的温度和湿度参数来评估其对孵化效果及雏鹅早期体重的影响。结果显示:①两种孵... 详细信息

为研究不同孵化模式下温度和湿度对鹅种蛋孵化效果及雏鹅生长发育性能的影响,试验采用“单阶段”变温和“二阶段”恒温孵化模式,每种孵化模式设定两种不同的温度和湿度参数来评估其对孵化效果及雏鹅早期体重的影响。结果显示:①两种孵化模式具有相近的总体失水率(67%),但采用较高温度的孵化方案具有更高的孵化率(P<0.05)和更短的出雏窗口期(28.5~30 d)。②“单阶段”变温孵化模式的孵化率显著高于“二阶段”恒温孵化(P<0.05)。③鹅种蛋孵化周期中,第1~4周种蛋失重率分别为2.44%、4.85%、7.72%和10.67%,呈现前期失重大、后期失重小的规律。④“二阶段”恒温孵化模式下,采用37.6℃和64%的温湿度组合所生产的雏鹅在第2~4周的体重极显著高于37.5℃和65%的温湿度组合(P<0.05)。研究表明,二阶段恒温孵化模式(37.6℃+64%)以及单阶段变温孵化模式均能产生较好的孵化效果,采用“单阶段”变温孵化模式可提高孵化率,且优化关键孵化参数还能促进雏鹅的早期生长发育。

关键词：鹅孵化温度湿度孵化率生长发育

适应肠道细胞的猪德尔塔冠状病毒对仔猪的致病性分析

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中国农业大学学报 2024年第5期29卷 56-64页

作者：石迎陶洁李本强程靖华刘惠莉上海市农业科学院畜牧兽医研究所/上海市农业遗传育种重点实验室上海201106 上海市种猪工程技术中心上海201302

为分析适应肠道细胞的猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)对仔猪的致病性,本研究首先用ST细胞分离培养的PDCoV感染IPEC-J2细胞进行适应性试验,通过间接免疫荧光试验(IFA)检测PDCoV抗原,然后绘制病毒生长曲线,最后分析适... 详细信息

为分析适应肠道细胞的猪德尔塔冠状病毒(Porcine deltacoronavirus,PDCoV)对仔猪的致病性,本研究首先用ST细胞分离培养的PDCoV感染IPEC-J2细胞进行适应性试验,通过间接免疫荧光试验(IFA)检测PDCoV抗原,然后绘制病毒生长曲线,最后分析适应IPEC-J2细胞的PDCoV对仔猪的致病性。结果表明:1)经ST细胞分离培养的PDCoV可以感染IPEC-J2细胞并出现CPE,可在细胞内检测到PDCoV抗原,PDCoV在感染IPEC-J2细胞后48 h达到增殖高峰。2)适应IPEC-J2的PDCoV对仔猪具有肠致病性,仔猪出现明显腹泻症状,甚至出现死亡;剖检可见明显的肠道病变,病理组织学显示肠上皮细胞及肠绒毛病变,并通过免疫组化对抗原进行定位,发现PDCoV广泛分布于肠道上皮细胞。3)肠道免疫细胞因子分析发现PDCoV感染仔猪后肠道I型干扰素表达上调,同时激活体内Th1和Th2型肠道细胞免疫反应,诱导感染仔猪产生免疫细胞因子发挥抗病毒作用。综上,经ST细胞分离培养的PDCoV对IPEC-J2细胞具有较强的适应性,并对仔猪产生较强的致病性。本研究为PDCoV致病机制及抗病毒免疫进一步研究奠定基础。

关键词：猪德尔塔冠状病毒 IPEC-J2细胞仔猪免疫反应致病机理

枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响

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中国饲料 2024年第16期 49-52页

作者：张明花姜道峰刘玉平平阴县畜牧事业发展服务中心山东济南250400 平阴县畜牧兽医局平阴畜牧兽医站山东济南250400

文章旨在研究枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响,试验将160头体重为(59.35±0.53)kg的育肥猪分成4组,每组4个重复,每个重复10头猪,对照组、添加Ⅰ组、添加Ⅱ组、添加Ⅲ组依次饲喂含0、500、1000、1500mg... 详细信息

文章旨在研究枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响,试验将160头体重为(59.35±0.53)kg的育肥猪分成4组,每组4个重复,每个重复10头猪,对照组、添加Ⅰ组、添加Ⅱ组、添加Ⅲ组依次饲喂含0、500、1000、1500mg/kg枯草芽孢杆菌的基础日粮。结果显示,与对照组相比,3个枯草芽孢杆菌添加组对末重、平均日增重、料重比、IgA含量、IgG含量、芽孢杆菌数、大肠杆菌数均产生显著影响(P<0.05),枯草芽孢杆菌1000mg/kg添加组和1500mg/kg添加组对乳酸杆菌数、沙门氏菌数、pH_(24h)值、剪切力、蒸煮损失率、滴水损失率均产生显著影响(P<0.05),以1000mg/kg添加剂量的影响效果最佳。表明枯草芽孢杆菌能改善育肥猪的生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质,1000mg/kg添加剂量的作用效果最优。

关键词：枯草芽孢杆菌育肥猪生长性能免疫功能肠道菌群肉品质