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一种可用于肝癌呼气信号鉴别的改进AdaBoost级联分类器

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中国生物医学工程学报 2024年第2期43卷 162-172页

作者：郝丽俊朱耿黄钢严加勇上海健康医学院医疗器械学院上海201318 上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海健康医学院附属嘉定中心医院上海市分子影像学重点实验室上海201318

为了降低呼气检测技术在肝癌筛查中的漏诊率,本研究设计一种改进的AdaBoost级联分类器,并将其应用于鉴别健康志愿者和肝癌患者的呼气信号。首先,对训练样本进行自助划分获得一组训练子集。基于该训练子集,先后利用不同的机器学习算法,采... 详细信息

为了降低呼气检测技术在肝癌筛查中的漏诊率,本研究设计一种改进的AdaBoost级联分类器,并将其应用于鉴别健康志愿者和肝癌患者的呼气信号。首先,对训练样本进行自助划分获得一组训练子集。基于该训练子集,先后利用不同的机器学习算法,采用K折交叉训练和投票法得到多个子分类器;接着,将多个子分类器加权组合得到一个改进的AdaBoost分类器;然后,再次自助划分训练样本,以新的训练子集训练得到另一个AdaBoost分类器;最后,将两个AdaBoost分类器串联形成级联分类器。测试样本送入该级联分类器后,按照级联规则,潜在的异常样本将被反复筛查。以电子鼻采集到的120名志愿者的呼气信号的Relief优化特征集为训练样本,构建改进AdaBoost级联分类器,并对40例测试样本进行鉴别。结果表明,该级联分类器可有效区分出测试组中的肝癌患者和健康人的呼气信号,平均敏感性为93.42%,明显优于传统AdaBoost级联分类器,漏诊率显著降低。此外,该级联分类器的稳定性较好,精度的变异系数仅为3.95%。可见,改进AdaBoost级联分类器可有效提升分类器对肝癌呼气信号的检测能力,对实现基于呼气检测的肝癌无创普及性筛查技术的研究具有重要意义。

关键词：肝癌呼气法检测 AdaBoost级联分类器漏诊率变异系数 Relief优化特征集

外泌体携带的非编码RNA作为竞争性内源性RNA参与创面修复的研究进展

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中华烧伤与创面修复杂志 2024年第6期40卷 594-599页

作者：杨灵璟吕叶辉林涧上海健康医学院创面防治研究所上海2201318 上海健康医学院基础医学院上海2201318 上海健康医学院附属崇明医院骨科修复重建中心上海202150

近年来,外泌体携带的非编码RNA(ncRNA)已被证明在创面修复的多个阶段中起重要的调控作用。外泌体可以将ncRNA运输到不同的靶细胞或组织中,并调节靶基因以及下游分子的表达。而竞争性内源性RNA(ceRNA)假说的提出则提示RNA可通过竞争共同... 详细信息

近年来,外泌体携带的非编码RNA(ncRNA)已被证明在创面修复的多个阶段中起重要的调控作用。外泌体可以将ncRNA运输到不同的靶细胞或组织中,并调节靶基因以及下游分子的表达。而竞争性内源性RNA(ceRNA)假说的提出则提示RNA可通过竞争共同的应答元件搭建更为精细和复杂的基因调控网。因此,该综述聚焦外泌体携带的长链ncRNA和环状RNA,并讨论它们分别作为ceRNA在创面修复的炎症、细胞增殖与组织重塑等阶段中所起的调控作用,同时归纳了外泌体携带的ncRNA作为无细胞疗法的可行性,以期为创面的临床治疗提供理论基础。

关键词：伤口愈合皮肤外泌体 RNA,长链非编码环状RNA 竞争性内源性RNA调控网络

原发性髓系肉瘤遗传学和分子学改变的临床意义

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中国实验血液学杂志 2024年第1期32卷 27-32页

作者：江亚军张春芳王红霞赵兰张飞飞韩秀华上海健康医学院附属嘉定区中心医院血液科上海201800 连云港市第一人民医院病理科江苏连云港222002 上海健康医学院附属嘉定区中心医院病理科上海201800

目的:探讨原发性髓系肉瘤遗传学和分子生物学改变的临床意义。方法:选择2010年9月-2021年12月于上海健康医学院附属嘉定区中心医院、连云港市第一人民医院诊断的14例原发性髓系肉瘤患者为研究对象,应用荧光原位杂交技术检测其AML1-ETO... 详细信息

目的:探讨原发性髓系肉瘤遗传学和分子生物学改变的临床意义。方法:选择2010年9月-2021年12月于上海健康医学院附属嘉定区中心医院、连云港市第一人民医院诊断的14例原发性髓系肉瘤患者为研究对象,应用荧光原位杂交技术检测其AML1-ETO融合、PML-RARα融合、CBFβ断裂情况,应用下一代基因测序技术检测其NPM1、CEBPA、FLT3、RUNX1、ASXL1、KIT、TP53等基因突变情况。结果:14例患者的髓系肉瘤发生于骨、乳腺、附睾、肺、胸壁、宫颈、小肠、卵巢、淋巴结、中枢神经系统等组织器官,肿瘤细胞表达MPO(13例)、CD34(7例)、CD43(8例)、CD68(7例)、CD99(8例)、CD117(6例)。4例检测出细胞遗传学异常(AML1-ETO融合3例,CBFβ断裂1例),未检出PML-RARα融合。发生AML1-ETO融合/CBFβ断裂病例的总体生存期、无白血病生存期与未发生AML1-ETO融合/CBFβ断裂者比较差异均无统计学意义(P>0.05)。分别有5例、3例、5例、3例、2例、2例和1例患者发生NPM1、CEBPA、FLT3-ITD、RUNX1、ASXL1、KIT、TP53基因突变,其中7例至少发生FLT3-ITD、RUNX1、ASXL1、TP53基因中的一个突变。发生FLT3-ITD/RUNX1/ASXL1/TP53突变患者的总体生存期、无白血病生存期均明显短于未发生突变者(P临床研究证实。

关键词：髓系肉瘤免疫组化遗传学分子生物学预后

多功能蛋白ASPP2在肿瘤发生发展中的作用

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生命科学 2024年第3期36卷 353-359页

作者：张明珠朱景怡张智宇赵健梁蓓蓓上海理工大学健康科学与工程学院上海200093 上海健康医学院药学院上海健康医学院附属嘉定中心医院上海市分子影像学重点实验室上海201318

恶性肿瘤的发生发展是一个多因素、多步骤参与的复杂过程,临床上肿瘤治疗存在复发率高且易耐药等现象,寻找肿瘤易转移、易复发及耐药的干预靶点对恶性肿瘤的诊断和治疗意义重大。多功能蛋白p53促凋亡刺激蛋白2(ASPP2)是一种单倍体不足... 详细信息

恶性肿瘤的发生发展是一个多因素、多步骤参与的复杂过程,临床上肿瘤治疗存在复发率高且易耐药等现象,寻找肿瘤易转移、易复发及耐药的干预靶点对恶性肿瘤的诊断和治疗意义重大。多功能蛋白p53促凋亡刺激蛋白2(ASPP2)是一种单倍体不足肿瘤抑制因子,自被发现以来其在肿瘤中的作用备受关注。ASPP2在多种恶性肿瘤中的表达均明显下调,且其下调水平与肿瘤晚期及不良预后相关,表明其在肿瘤发生发展中扮演重要角色。本文主要综述ASPP2在肿瘤转移、耐药和代谢等方面的研究进展,为以ASPP2为治疗靶点的研究提供理论依据。

关键词： p53促凋亡刺激蛋白2 肿瘤转移肿瘤耐药肿瘤代谢

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达格列净治疗肥胖1型糖尿病一例报道

中国糖尿病杂志 2024年第2期32卷 133-136页

作者：姚瑶杨玮薛涛陈晓鸥汤明明陈巧云张倩为索丽霞王丽华上海健康医学院附属嘉定区中心医院内分泌 201800 上海交通大学医学院附属仁济医院内分泌科

达格列净作为一种新型降糖药,因其独特的降糖机制备受关注。达格列净用于T2DM研究众多,对于东方人群中T1DM的应用较少。本文报道一例肥胖T1DM使用达格列净,为临床治疗提供新思路。

关键词：达格列净钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂肥胖糖尿病 1型

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基于轮廓绘制及填色的构造式信息隐藏算法

上海理工大学学报 2024年第3期46卷 259-270页

作者：郦姝伊郭玳豆孔平乐燕芬秦川上海理工大学光电信息与计算机工程学院上海200093 上海健康医学院附属嘉定区中心医院上海201318

基于元素映射的构造式信息隐藏算法存在因图案库泄露而导致的安全性问题,鉴于此,提出了一种新的通过含密轮廓绘制及颜色填充生成平铺图像的构造式信息隐藏算法。运用B样条曲线为多个图案轮廓建立标准结构化表示,并创建收发双方共享的标... 详细信息

基于元素映射的构造式信息隐藏算法存在因图案库泄露而导致的安全性问题,鉴于此,提出了一种新的通过含密轮廓绘制及颜色填充生成平铺图像的构造式信息隐藏算法。运用B样条曲线为多个图案轮廓建立标准结构化表示,并创建收发双方共享的标准结构化表示库和颜色库,根据秘密信息进行标准结构化表示选取、图案轮廓绘制及颜色填充操作,获得含密图案。多个离散分布的含密图案共同构成一幅含密平铺图像。实验证明,该算法对JPEG压缩、中值滤波、高斯滤波等常见图像攻击具有较强的鲁棒性,且与类似算法相比,能够抵抗更多种图像攻击。

关键词：构造式信息隐藏结构化表示 B样条曲线轮廓曲线平铺图像

肝细胞癌相关的核编码线粒体基因及临床信息的综合预后模型

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第1期44卷 1-12页

作者：克德尔亚·艾山江傅怡赖冬林邬海龙龚伟上海交通大学医学院附属新华医院普外科上海200092 上海健康医学院协同科研中心上海201318 南昌大学江西医学院第一附属医院南昌330006 上海健康医学院药学院上海201318 上海市胆道疾病研究重点实验室上海交通大学医学院胆道疾病研究所上海市胆道疾病研究中心上海200092

目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型。方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载369例HCC患者和50例肝脏正常对照的基因表达... 详细信息

目的·建立一个基于线粒体基因和临床信息的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)总生存率(overall survival,OS)的预后模型。方法·从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)下载369例HCC患者和50例肝脏正常对照的基因表达谱和临床数据。核编码的线粒体基因(nuclear encoded mitochondrial gene,NEMG)从MitoCarta3.0数据库获得。使用“DEseq2”R包和单变量Cox分析选择与HCC患者OS相关并参与氧化磷酸化、三羧酸循环和细胞凋亡通路的NEMG[(泛素细胞色素C还原酶铰链蛋白(ubiquinol cytochrome C reductase hinge protein,UQCRH)、腺苷三磷酸柠檬酸裂解酶(ATP citrate lyase,ACLY)、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶2(phosphoenolpyruvate carboxykinase 2,PCK2)、Bcl-2同源拮抗剂1(Bcl-2 homologous antagonist/killer 1,BAK1)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2-associated X protein,BAX)和Bcl-2/腺病毒E1B相互作用蛋白3样(Bcl-2/adenovirus E1B interacting protein 3-like,BNIP3L)]。应用多变量Cox回归来确定HCC OS的独立危险因素。建立一个基于独立危险因素(6个NEMG风险特征和TNM分期)的综合预后模型和预后列线图,计算中位预后评分。以中位预后评分作为分界点,将HCC患者分为高风险组和低风险组。进行Kaplan-Meier生存曲线分析,并进行对数秩检验来评估低风险组和高风险组患者OS的差异。使用“timeROC”软件包计算受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under the curve,AUC)。用基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载HCC队列(GSE14520)验证综合预后模型对1、3、5年OS的预测性能。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)在来自上海交通大学医学院附属新华医院的34例HCC临床样本中验证6-NEMG的相对表达水平。结果·ROC分析结果显示,与仅6-NEMG风险特征(1、3、5年AUC分别为0.77、0.66、0.65)或仅TNM分期(1、3、5年AUC分别为0.66、0.67、0.63)相比,该综合预后模型对1年(AUC,0.78)、3年(AUC,0.73)和5年(AUC,0.69)HCC OS显示出更好的预测性能。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示高风险组患者的OS明显比低风险组差(P=0.001)。此外,在GEO外部队列中发现该预后模型的预测性能较好(1、3、5年AUC分别为0.67、0.66、0.74),高、低风险组患者的预后差异有统计学意义(P=0.001),与TCGA数据的结果一致。在临床HCC队列中,与癌旁肝脏组织相比,除BNIP3L外,其他5个NEMG在肿瘤组织的表达水平上调或者下调。相关性分析显示,在GSE14520与临床HCC队列中预后评分与HCC肿瘤的大小和数量呈正相关。结论·构建并验证了一个将6-NEMG风险特征与TNM分期相结合的HCC预后预测模型。该模型可能有助于HCC患者的预后预测。

关键词：核编码线粒体基因肝细胞癌癌症基因组图谱(TCGA) 基因表达数据库(GEO) 总生存率

红光治疗对近视儿童等效球镜度、眼轴长度及脉络膜厚度影响的Meta分析

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山东大学耳鼻喉眼学报 2024年第3期38卷 74-81页

作者：李飏刘鸫曹文捷上海健康医学院附属嘉定区中心医院眼科

目的探讨红光治疗对于近视儿童等效球镜度、眼轴长度及脉络膜厚度的影响。方法检索PubMed、Web of Science、Cochrane Library、Embase、中国知网、万方数据库、中国生物医学文献数据库、维普网、临床试验注册中心从建库至2022年10月2... 详细信息

目的探讨红光治疗对于近视儿童等效球镜度、眼轴长度及脉络膜厚度的影响。方法检索PubMed、Web of Science、Cochrane Library、Embase、中国知网、万方数据库、中国生物医学文献数据库、维普网、临床试验注册中心从建库至2022年10月28日期间发表的关于红光治疗近视的研究。使用Cochrane手册对纳入文献进行偏倚风险评价及质量评价，并使用Revman 5.3软件进行Meta分析、STATA 12.0软件检测发表偏倚。结果共计纳入9篇文献（1 425只眼）,其中6项为随机对照试验，3项为队列研究。Meta分析显示，红光治疗对等效球镜度（spherical equivalent, SE）及眼轴（axial length, AL）增加的抑制效果好于单光镜治疗（SE:WMD=0.41, 95%CI为0.29～0.54,I2=65%,P<0.000 01;AL:WMD=-0.21, 95%CI为-026～-0.15,I2=73%,P<0.000 01）,红光治疗对脉络膜厚度（choroidal thickness, CHT）的增加优于单光镜治疗（WMD=26.05, 95%CI:22.11～29.99,I2=45%,P<0.000 01）。结论红光治疗疗效优于单光镜治疗，但长期使用不良反应仍有待进一步观察。

关键词：红光治疗近视眼轴等效球镜度脉络膜厚度 Meta分析

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食道超声心动图:从喉咙到心脏的奇妙旅程

漫科学（新健康）

漫科学（新健康） 2024年第8期 38-39页

作者：陆敏上海健康医学院附属嘉定区中心医院

心血管疾病是全球范围内导致死亡和残疾的主要原因之一。随着人口老龄化和生活方式的改变,这类疾病的发病率逐年上升。因此,准确、及时地诊断心血管疾病显得尤为重要。传统的经胸超声心动图(TTE)作为常用的心脏检查手段,虽然便捷且无创... 详细信息

心血管疾病是全球范围内导致死亡和残疾的主要原因之一。随着人口老龄化和生活方式的改变,这类疾病的发病率逐年上升。因此,准确、及时地诊断心血管疾病显得尤为重要。传统的经胸超声心动图(TTE)作为常用的心脏检查手段,虽然便捷且无创,但在某些情况下,如肥胖、肺气肿、胸廓畸形等,其成像效果可能受到限制。而食道超声心动图(TEE)则以其独特的检查路径和更高的分辨率,成为TTE的有益补充,为临床提供了更加清晰、详尽的心脏图像。

关键词：食道超声心动图心脏检查胸廓畸形心血管疾病诊断心血管肺气肿全球范围人口老龄化