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工程教育认证下“微生物学实验”课程的研究与思考

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微生物学通报 2023年第2期50卷 777-784页

作者：张霞陈峰曹阳上海交通大学生命科学技术学院上海200240

微生物学实验是生物工程专业的必修核心课程,结合学校“四位一体”育人理念,在布鲁姆教育目标体系中确立符合实验教学的课程目标,创新设计了知识、能力和思政三维课程目标。在高等教育的工程专业认证下,对连续三届“微生物学实验”课进... 详细信息

微生物学实验是生物工程专业的必修核心课程,结合学校“四位一体”育人理念,在布鲁姆教育目标体系中确立符合实验教学的课程目标,创新设计了知识、能力和思政三维课程目标。在高等教育的工程专业认证下,对连续三届“微生物学实验”课进行了持续改进,分析研究毕业指标达成度,提出了改进措施,具有实验教学研究和推广的价值。

关键词：微生物学实验教学三维目标工程认证

本科教学运行管理研究——在线教学存在问题与对策

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实验室研究与探索 2022年第12期41卷 239-243,257页

作者：林忆杉李志勇上海交通大学生命科学技术学院上海200240

在线教学在一定程度上重构了教学组织形式,与传统的课堂教学结构、教学内容、手段、方式有很大不同。在线学习者的学习态度、学习体验、学习效果是在线教学效果的重要评价指标,通过问卷调查及访谈等方式对MOOC教学、直播教学、录播教学... 详细信息

在线教学在一定程度上重构了教学组织形式,与传统的课堂教学结构、教学内容、手段、方式有很大不同。在线学习者的学习态度、学习体验、学习效果是在线教学效果的重要评价指标,通过问卷调查及访谈等方式对MOOC教学、直播教学、录播教学、在线研讨教学4种不同在线教学方式的教学效果进行了比较和分析。总结不同在线教学方式在应用中存在的线上教学资源不足、教学设计针对性不强、平台功能需完善、教学过程缺乏监督等问题,提出了加快课程资源建设,完善教学评估机制,优化平台服务能力,加强教学全过程管理等一系列针对性的解决对策,以提升不同在线教学方式的应用效果和教学质量,为在线教学的高质量运行提供参考。

关键词：在线教学教学方式调查问卷访谈

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生命起源过程的熵变是怎样的?

上海交通大学学报 2021年第S01期55卷 10-11页

作者：王嘉瑶刘晨光上海交通大学生命科学技术学院上海200240

宇宙演化是一个熵增的过程,熵增驱动了生命的产生.但生命的出现让自然的部分变得有序,可以看成是一个熵减的过程.为什么整体无序的宇宙会产生高度有序的生命呢?生命起源时的熵是怎样改变的?

关键词：熵变宇宙生命

以能力培养为导向的细胞生物学实验课程思政建设

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实验室研究与探索 2023年第2期42卷 226-230页

作者：张萍秦敏君郑有丽张霞上海交通大学生命科学技术学院上海200240 上海交通大学生命科学与技术国家级实验教学示范中心上海200240

课程思政是落实高等教育“立德树人”根本任务的重要载体。在细胞生物学实验课程中,以课程目标能力培养为导向,结合课程内容挖掘思政元素,制订该课程的思政方案;重点展示学术诚信、社会责任感、科学素养三方面的实施案例;总结实施后的... 详细信息

课程思政是落实高等教育“立德树人”根本任务的重要载体。在细胞生物学实验课程中,以课程目标能力培养为导向,结合课程内容挖掘思政元素,制订该课程的思政方案;重点展示学术诚信、社会责任感、科学素养三方面的实施案例;总结实施后的育人效果。通过对细胞生物学实验课程思政探索,为生物类相关实验课程开展课程思政提供了思路与参考。

关键词：细胞生物学实验能力培养课程思政学术诚信社会责任感科学素养

周期性高张应变通过下调PGC1α表达抑制血管平滑肌细胞线粒体生物发生

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医用生物力学 2023年第1期38卷 156-163页

作者：张守敏李之音田文浩陶雨婷齐颖新韩悦上海交通大学生命科学技术学院力学生物学研究所上海200240

目的探讨高血压背景下病理性高张应变对血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)线粒体生物发生的影响,以及PGC1α蛋白在这一过程中的作用。方法采用Flexcell-5000T体外细胞张应变加载系统对VSMCs施加频率为1.25 Hz、幅... 详细信息

目的探讨高血压背景下病理性高张应变对血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)线粒体生物发生的影响,以及PGC1α蛋白在这一过程中的作用。方法采用Flexcell-5000T体外细胞张应变加载系统对VSMCs施加频率为1.25 Hz、幅度分别为5%和15%的周期性张应变,模拟正常生理情况和高血压病理情况下的力学环境;通过蛋白免疫印迹(Western blotting)和荧光定量PCR(qPCR)方法检测正常生理和高血压病理力学条件下VSMCs的PGC1α蛋白表达,以及柠檬酸合酶和线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)拷贝数变化情况;应用PGC1α特异性激活剂ZLN005和有效干扰片段siRNA检测PGC1α表达上调或下调对柠檬酸合酶和mtDNA拷贝数的影响。结果与5%生理性周期性张应变相比,15%病理性高张应变显著抑制VSMCs的PGC1α和柠檬酸合酶的表达,mtDNA拷贝数显著降低。与对照组相比,对VSMCs转染PGC1α干扰片段siRNA或孵育PGC1α特异性激活剂ZLN005,分别下调和上调PGC1α蛋白表达,VSMCs的柠檬酸合酶表达和mtDNA拷贝数也相应地降低和增加。在加载生理性周期性张应变条件下,对VSMCs转染PGC1α干扰片段siRNA显著下调其蛋白表达;对VSMCs施加PGC1α特异性激活剂ZLN005显著上调PGC1α蛋白表达,柠檬酸合酶表达和mtDNA拷贝数也被增加。结论高血压背景下病理性周期性高张应变通过抑制VSMCs的PGC1α蛋白显著下调VSMCs的柠檬酸合酶表达和mtDNA拷贝数,进而导致VSMCs线粒体功能障碍。PGC1α可能是缓解高血压病理进程的潜在治疗靶向分子。

关键词：周期性张应变血管平滑肌细胞线粒体生物发生 PGC1α 线粒体DNA拷贝数柠檬酸合酶

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蟒河国家自然保护区硅藻植物新记录

山西大学学报(自然科学版) 2021年第1期44卷 194-198页

作者：刘琪李佳佳冯佳吕俊平南芳茹刘旭东谢树莲上海师范大学生命科学院山西大学生命科学学院

文章报道了2017年9月采自蟒河国家级自然保护区硅藻门的中国新记录3种,包括1种2变种:分别为宽腹异极藻Gomphonema tumens Kociolek&Stoerme、胀大桥弯藻孟加拉变种Cymbella turgidula var.bengalensis Keamme、线性双菱藻淡黄变种Surire... 详细信息

文章报道了2017年9月采自蟒河国家级自然保护区硅藻门的中国新记录3种,包括1种2变种:分别为宽腹异极藻Gomphonema tumens Kociolek&Stoerme、胀大桥弯藻孟加拉变种Cymbella turgidula var.bengalensis Keamme、线性双菱藻淡黄变种Surirella linearis var.helvetica(Brum)Meister。对每个新记录种的形态分类学特征进行了详细描述,为我国硅藻类分类学研究提供了一定的资料。

关键词：硅藻新记录中国蟒河国家自然保护区

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基于生态足迹的成都市可持续发展研究

生态科学 2019年第5期38卷 104-110页

作者：张鹏飞李红李萍西南交通大学生命科学院与工程学院

近年来随着环境问题的不断恶化环境可持续发展面临严峻挑战,而生态足迹方法作为一种区域可持续发展的定量度量方法,在评价生态可持续发展和生态保护方面得到了广泛的应用。利用基于修正后的生态足迹模型并结合万元GDP生态赤字、生态协... 详细信息

近年来随着环境问题的不断恶化环境可持续发展面临严峻挑战,而生态足迹方法作为一种区域可持续发展的定量度量方法,在评价生态可持续发展和生态保护方面得到了广泛的应用。利用基于修正后的生态足迹模型并结合万元GDP生态赤字、生态协调系数,分析成都市近8年来可持续发展状况。结果表明:2008—2015年人均生态足迹呈现整体下降趋势,年均减少3.64%;人均生态承载力逐年下降,年均减少2.29%;人均生态盈亏一直处于亏损状态,总体趋势向良好转变,但本质上生态赤字却越发严重;人均万元GDP生态足迹不断下降,研究区资源利用率不断提高;年均生态均衡系数为1.2415,生态系统处于不稳定状态。成都市可持续发展形势十分严峻,未来可通过提高生态承载力控制生态足迹,从而提高可持续发展能力。

关键词：生态足迹生态承载力可持续发展成都市

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细胞核与应力信号转导

医用生物力学 2022年第3期37卷 385-388页

作者：齐颖新上海交通大学生命科学技术学院力学生物学研究所上海200240

力学生物学关注力学因素在生命体发生、发展、衰老和病变过程中的重要作用,而细胞如何感知力学刺激并将力学信号转化为生物化学信号、进而调控细胞功能是力学生物学的关键科学问题。深入探讨这一问题对于了解机体生理稳态的本质、揭示... 详细信息

力学生物学关注力学因素在生命体发生、发展、衰老和病变过程中的重要作用,而细胞如何感知力学刺激并将力学信号转化为生物化学信号、进而调控细胞功能是力学生物学的关键科学问题。深入探讨这一问题对于了解机体生理稳态的本质、揭示病理重建(重塑)的机制和疾病的临床防治均具有重要的理论意义和转化价值。研究显示,细胞膜表面存在多种力学感受器(mechanosensor),受到应力(应变)刺激后通过翻译后修饰或构型变化开启细胞内级联的信号网络,将机械信号传递入细胞核调控基因转录。其中,新的力学感受器和应力信号转导机制的不断探索和发现已成为力学生物学研究的前沿和热点之一。

关键词：力学生物学病变过程力学刺激力学因素信号传递翻译后修饰构型变化力学信号

细辛苯丙素类化合物生物合成相关酶基因的挖掘及其表达分析

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天然产物研究与开发 2017年第5期29卷 735-740,782页

作者：潘磊林懋怡赵晓冰柳威刘晋杰刘忠上海交通大学药学院华东师范大学生命科学院上海200240

为了探明细辛苯丙素类化合物生物合成相关酶基因的表达水平,本研究基于实验室已构建好的细辛转录组数据库,根据基因功能注释筛选出与苯丙素类化合物生物合成相关酶基因,并推导其蛋白序列,进行生物信息学分析,同时对相关酶基因进行基因... 详细信息

为了探明细辛苯丙素类化合物生物合成相关酶基因的表达水平,本研究基于实验室已构建好的细辛转录组数据库,根据基因功能注释筛选出与苯丙素类化合物生物合成相关酶基因,并推导其蛋白序列,进行生物信息学分析,同时对相关酶基因进行基因的表达分析。本文从细辛转录组数据库中筛选出了6个酶基因,分别为pal、c4h、comt、4cl、ccr、cad。基因编码蛋白特性分析结果表明:6个酶基因所编码的蛋白属于不同的超家族。基因表达分析结果表明:6个酶基因表达量呈现相同的变化规律。对于叶、叶柄、根、根茎,6个酶基因在花期的表达量较花前期的高;同时,6个酶基因在地下部分的表达量比地上部分的高。以上结果显示6个酶基因在细辛叶、叶柄、根、根茎的表达量差异明显,但具有一定的规律性。研究的成功开展为我们进一步了解苯丙素类化合物生物合成相关酶的功能和特性打下了基础,为今后细辛活性成分的生物合成及代谢调控提供理论依据。

关键词：细辛苯丙素甲基丁香酚榄香素黄樟醚生物信息学分析实时荧光定量PCR