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多模态肺结节诊断模型的临床验证及应用价值探索

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第8期44卷 1030-1036页

作者：许万星王琳郭巧梅王薛庆娄加陶江苏大学医学院基础医学研究所镇江212013 上海交通大学医学院附属第一人民医院检验医学中心上海200080 上海交通大学医学院医学技术学院上海200025

目的·验证采用随机森林算法并基于血清代谢指纹数据、蛋白标志物癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)和Image-AI的多模态肺结节诊断模型(a multi-modal pulmonary nodule diagnosis model combined metabolic fingerprints,protein biomarker CEA and Image-AI via random forest,MPI-RF)的性能,探索其临床应用价值。方法·入组就诊于上海交通大学医学院附属胸科医院且低剂量螺旋CT表现为肺结节的患者289例,根据术后病理结果将其分为恶性结节组(n=197)和良性结节组(n=92),收集并比较2组患者的基本信息。使用电化学发光法检测2组患者术前血清CEA水平,使用基质辅助激光解吸电离质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry,MALDI-MS)检测血清代谢指纹图谱,使用CT影像人工智能模型Image-AI计算影像得分。将CEA数据、血清代谢指纹数据和影像得分整合后输入至MPI-RF中,计算每位患者的恶性概率得分。采用受试者操作特征曲线(receiver operator characteristic curve,ROC曲线)、曲线下面积(area under the curve,AUC)评估不同模型的性能并采用DeLong检验进行比较分析,包括MPI-RF在不同类型(实性、纯磨玻璃、混合磨玻璃)和大小(直径<8 mm、直径≥8 mm)的肺结节中的诊断性能,MPI-RF与Mayo Clinic模型、美国退伍军人管理局(veterans administration,VA)模型、Brock模型的诊断性能比较,以及MPI-RF与肺部影像报告和数据系统(lung imaging reporting and data system,Lung-RADS)在良恶性结节中的诊断性能比较。结果·MPI-RF在肺结节良恶性鉴别中具有良好的诊断性能(AUC=0.887,95%CI 0.848~0.925,灵敏度为81.22%,特异度为83.70%);其中,MPI-RF对实性结节的AUC为0.877 (95%CI 0.820~0.934),混合磨玻璃结节的AUC为0.858 (95%CI 0.771~0.946),纯磨玻璃结节的AUC为0.978 (95%CI 0.923~1.000)。对于直径<8 mm的结节,MPI-RF的AUC为0.840 (95%CI 0.716~0.963);直径≥8 mm的结节,其AUC为0.891 (95%CI 0.849~0.933)。与现有模型对比的结果显示,MPI-RF的诊断性能优于Mayo Clinic模型、VA模型、Brock模型(均P=0.000);与Lung-RADS比较,MPI-RF在总样本、不同类型结节中的诊断性能均较优(均P=0.000)。结论·MPI-RF是性能优良的良恶性肺结节鉴别诊断模型,具有潜在的临床应用价值。

关键词：机器学习肺腺癌代谢组学多模态模型肺结节

宫内心脏介入治疗胎儿危重型先天性心脏病5例报告

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临床儿科杂志 2024年第1期42卷 35-39页

作者：蔡蕾裔赵莉晴王磊焦先婷张拥军武育蓉朱泓夏红萍孙锟陈笋上海交通大学医学院附属新华医院儿心脏中心上海200092 上海交通大学医学院附属新华医院宫内儿科疾病诊治中心上海200092 上海交通大学医学院附属新华医院新生儿科上海200092

目的探索胎儿心脏介入治疗(FCI)对于胎儿危重型先天性心脏病的可行性及短期疗效。方法纳入2018年8月至2022年5月在宫内诊治中心进行FCI的所有患儿的临床资料,包括围产期至出生后基本信息、FCI手术信息、胎儿超声心动图信息等,追踪病例... 详细信息

目的探索胎儿心脏介入治疗(FCI)对于胎儿危重型先天性心脏病的可行性及短期疗效。方法纳入2018年8月至2022年5月在宫内诊治中心进行FCI的所有患儿的临床资料,包括围产期至出生后基本信息、FCI手术信息、胎儿超声心动图信息等,追踪病例至出生后3月,分析FCI技术的可行性、有效性及安全性。结果纳入胎儿7例,其中5例实施FCI手术,手术成功率100%(5/5),包括2例重度主动脉瓣狭窄(CAS)和3例室间隔完整型肺动脉闭锁(PA/IVS)。手术时的中位孕周为29^(+2)(28^(+6)~32^(+4))周。5例胎儿FCI术后的超声心动图指标均获得明显改善。5例胎儿均足月出生,中位出生胎龄39^(+2)(38~39^(+4))周。生后2例CAS患儿行外科主动脉瓣成形术,3例PA/IVS患儿完成经皮肺动脉瓣球囊扩张术。1例心功能不全CAS患儿于新生儿期死亡,4例随访中,预后良好。结论FCI是一项安全、有效的技术,有望改善危重型先天性心脏病的预后。

关键词：胎儿心脏介入治疗主动脉瓣狭窄室间隔完整型肺动脉闭锁先天性心脏病

间接法探索早产儿和足月儿先天性肾上腺皮质增生症的筛查临界值

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中华实用儿科临床杂志 2024年第3期39卷 182-186页

作者：郭静田国力朱之星周卓纪伟张潇分王燕敏上海市儿童医院上海交通大学医学院附属儿童医院新生儿筛查中心上海200040 上海市儿童医院上海交通大学医学院附属儿童医院生物医学信息研究中心上海200040

目的分析间接法建立的先天性肾上腺皮质增生症(CAH)筛查指标血17-羟基孕酮(17-OHP)在早产儿与足月儿临界值的差异及可靠性。方法横断面研究。回顾性分析2019年1月至2022年12月在上海市儿童医院新生儿筛查中心接受CAH筛查的210285例新生... 详细信息

目的分析间接法建立的先天性肾上腺皮质增生症(CAH)筛查指标血17-羟基孕酮(17-OHP)在早产儿与足月儿临界值的差异及可靠性。方法横断面研究。回顾性分析2019年1月至2022年12月在上海市儿童医院新生儿筛查中心接受CAH筛查的210285例新生儿的资料,其中早产儿14312例,足月儿195973例。采用全自动荧光分析仪测定滤纸干血片上的17-OHP水平。分析早产儿和足月儿血17-OHP水平的分布情况及统计学指标。采用Kolmogorov-Smirnov检验进行正态性分布检验。通过Box-Cox将偏态分布数据转换为近似正态分布。用四分位间距(Turkey)法剔除离群值。采用R语言编程绘制累计频率分布图,并以单边第99.5百分位数值作为筛查临界值。将筛查临界值分别与厂商说明书给定的临界值和实验室临界值进行相对偏差比较。并与参考变化值(RCV)进行比较。结果据实验室现有临界值得出早产儿初筛阳性率为26.76‰,确诊4例,患病率为1∶3578;足月儿初筛阳性率为0.79‰,确诊11例,患病率为1∶17816。采用间接法建立CAH筛查临界值:早产儿为20.35 nmol/L,足月儿为10.78 nmol/L。该临界值与厂商说明书给定的临界值和实验室临界值的相对偏差均高于RCV。依据该筛查临界值,美国疾病预防控制中心室间质量评价计划的13批65份样本的阴性、阳性符合率均达100%;回顾性分析210285例新生儿,确诊CAH阳性患儿17-OHP水平均高于此筛查临界值。应用此筛查临界值早产儿假阳性率降低59.79%。结论采用间接法分别建立早产儿、足月儿CAH筛查临界值,具有可行性,可提高筛查的工作效率,为临床提供更好的诊断依据。

关键词：肾上腺皮质增生症先天性间接法临界值新生儿疾病筛查早产儿

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“生物样本资源”专辑序言

中国科学：生命科学 2024年第6期54卷 969-970页

作者：陈竺上海交通大学医学院附属瑞金医院上海200025

21世纪是生命科学和医学的世纪.人类生物样本库既是医学基础和临床研究与生物医药转化产业化的重要基石,也是维护国家生物安全的战略性资源.生物样本库的高水平设计、标准化建设和合理化使用是其高质量发展的关键要素.同时,包括人工智... 详细信息

21世纪是生命科学和医学的世纪.人类生物样本库既是医学基础和临床研究与生物医药转化产业化的重要基石,也是维护国家生物安全的战略性资源.生物样本库的高水平设计、标准化建设和合理化使用是其高质量发展的关键要素.同时,包括人工智能在内的现代信息技术也将给人类生物样本库赋能,为生物样本库及数据产品等新质生产力的健康可持续发展发挥至关重要的作用.

关键词：生物样本库医学基础现代信息技术人工智能生命科学生物医药数据产品战略性资源

同方期刊数据库

临床衰弱指数对急性心肌梗死患者在院心脏康复后远期预后的预测价值

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第5期44卷 599-605页

作者：刘雨婷俞莞琦洪雯康桑李歆旎旦增曲央肖活源潘静薇上海交通大学医学院附属第六人民医院心内科上海200233 上海交通大学医学院附属第六人民医院康复医学科上海200233

目的·探讨临床衰弱指数(Clinical Frailty Scale,CFS)对急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者在院心脏康复(cardiac rehabilitation,CR)后远期预后的预测价值。方法·序贯纳入2020年5月至2022年5月在上海交通大学医学院附属第六人民医院心脏中心接受诊治的501例AMI患者。采集患者基本临床信息,制定分级在院CR方案。根据患者出院前的CFS等级将患者分为3组,即正常(norm)组、脆弱(vulnerable)组和衰弱(frail)组,比较3组患者1年主要心血管事件率,包括全因死亡率及心力衰竭(心衰)再住院率。采用Logistic回归分析研究影响主要心血管事件率的危险因素,通过受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线分析各危险因素对主要心血管事件率的预测价值,建立最佳风险预测模型。结果·AMI患者在院CR后衰弱程度与高龄、B型利钠肽前体峰值(peak pro-B-type natriuretic peptide,peak proBNP)呈正比,与性别差异呈反比(P<0.05)。随患者衰弱程度增加,两种事件率均增高;其中全因死亡率(分别为2.6%、5.6%、15.2%)的组间差异有统计学意义(P=0.002),心衰再住院率(分别为19.6%、22.2%、24.2%)的组间差异无统计学意义。两两比较,frail组全因死亡率显著高于norm组(P=0.004),但vulnerable组与norm组的差异无统计学意义。CFS分级能够敏感预测AMI患者1年后的全因死亡风险(β=1.89,OR=6.61,P=0.001),且叠加CFS分级的风险模型预测效应最佳(AUC=0.845,P=0.000)。结论·接受在院CR的AMI患者出院前进行CFS分级,有助于识别1年内全因死亡风险较高的人群。

关键词：急性心肌梗死在院心脏康复临床衰弱指数主要心血管事件率全因死亡

SAE1与SAE2蛋白相互作用肽抑制剂的多种体外筛选体系的构建与评价

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上海交通大学学报（医学版） 2024年第5期44卷 567-575页

作者：胡晨阳陆绍永杨秀岩上海交通大学基础医学院药物化学与生物信息学中心上海200025

目的·构建用于发现小泛素样修饰蛋白(small ubiquitin-like modifier,SUMO)的活化酶亚基1(SUMO-activating enzyme subunit 1,SAE1)与亚基2(SUMO-activating enzyme subunit 2,SAE2)相互作用的肽抑制剂的多种体外筛选体系,并对不同筛选体系的优势与不足进行评价。方法·将编码SAE1和SAE2的目的基因分别插入pET-28a载体以构造原核蛋白表达质粒,在大肠埃希菌中表达并纯化人源SAE1和SAE2蛋白;利用纯化的蛋白先后构建等温滴定量热检测(isothermal titration calorimetry,ITC)实验、荧光偏振(fluorescence polarization,FP)实验、表面等离子共振(surface plasmon resonance,SPR)实验和基于SAE酶活的荧光实验等多种筛选体系。尝试利用不同的筛选体系检测候选多肽的抑制活性,基于检测结果,从灵敏度、稳定性、检测通量和检测成本等维度评价各筛选体系的优缺点与适用性。结果·经ITC测得SAE1和SAE2蛋白在体外相互作用的解离常数(K_(d))为0.96μmol/L,并将活性最好的多肽PEPT7改造为FP实验的示踪剂(tracer),但同SAE2的亲和力无法满足FP的要求;SPR测得SAE1和SAE2相互作用的K_(d)值为1.13μmol/L,与ITC数据接近;基于SAE酶活的荧光实验筛选得到抑制活性最强的多肽HP1B[半数抑制浓度(half-maximalinh ibitory concentration,IC_(50))达15.72μmol/L],SPR进一步确定其同SAE1的亲和力为34.4μmol/L。结论·尝试构建并比较了多种常见的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)抑制剂的筛选体系。其中,ITC的检测通量低,且难以准确评估结合热不显著的低亲和力多肽;FP体系的可行性高度依赖于示踪剂同靶点蛋白之间的强亲和力,同样无法用于低亲和力多肽的筛选与优化;SPR检测的灵敏度高,但检测成本较高;酶活实验兼具高灵敏度、稳健性、高通量和可接受的检测成本,是最适宜的筛选方法。

关键词： SUMO活化酶亚基1 SUMO活化酶亚基2 多肽抑制剂药物筛选等温滴定量热检测实验荧光偏振实验表面等离子共振实验基于酶活的荧光实验

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基于SQL数据库的医院财务管理信息平台

兵工自动化 2024年第2期43卷 23-27页

作者：傅仁上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心上海200127

为提升医院财务信息的管理能力,利用信息化技术建立医院财务信息一体化平台,采用统一的数据库对财务信息数据进行统一存储和处理。对基于信息一体化的医院财务信息一体化平台的架构进行设计,基于结构化查询语言(structured query langua... 详细信息

为提升医院财务信息的管理能力,利用信息化技术建立医院财务信息一体化平台,采用统一的数据库对财务信息数据进行统一存储和处理。对基于信息一体化的医院财务信息一体化平台的架构进行设计,基于结构化查询语言(structured query language,SQL)技术建立财务网上报销系统,对医院财务报销业务流程进行分析,以SQL Server 2005为后台数据库,实行客户/服务器(browser/server,B/S)模式的医院财务报销流程。实验结果表明:该系统对多用户并发的单业务响应时间信息化的医院财务管理信息平台提供参考。

关键词：医院财务管理报销系统信息平台 SQL数据库

急性心肌梗死患者心脏运动康复依从动机的质性研究

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军事护理 2024年第1期41卷 23-26页

作者：许莉王喜益陈菡芬卜军杨艳上海交通大学医学院附属仁济医院护理部上海200127 上海交通大学护理学院上海200025 上海交通大学医学院附属仁济医院心内科

目的探究急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)行经皮冠状动脉介入(percutaneous coronary intervention,PCI)治疗患者心脏运动康复的依从动机,为提升患者运动康复参与及行为改变提供建议和依据。方法采用描述性质性研究,通... 详细信息

目的探究急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)行经皮冠状动脉介入(percutaneous coronary intervention,PCI)治疗患者心脏运动康复的依从动机,为提升患者运动康复参与及行为改变提供建议和依据。方法采用描述性质性研究,通过目的抽样法选取2021年7月至2022年1月在上海某三级甲等医院复诊的29例AMI患者进行半结构式深度访谈,其中18例来源于心脏康复中心、11例来源于随访门诊。采用内容分析法整理访谈资料。结果共提炼3个主题和9个亚主题:患者的运动体验(康复获益感、风险感知),患者的心理状态(悲观、恐惧、积极心态)和社会支持(家庭依恋及支持、专业指导及支持、同伴交流及支持、物理资源及支持)。结论护理人员应重视AMI行PCI治疗患者的运动体验、心理状态及社会支持情况,以提高患者心脏运动康复依从动机。

关键词：急性心肌梗死心脏运动康复依从动机质性研究

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生活方式与孕期女性焦虑合并抑郁状况的关联

环境与职业医学 2024年第3期41卷 235-242页

作者：郑佳琦黄理瑶张妍沈梦碧王筱金李红刘志伟田英雷晓宁高宇上海交通大学医学院公共卫生学院环境与健康系上海200025 上海交通大学医学院附属国际和平妇幼保健院上海200025 上海交通大学医学院临床研究中心生物统计教研室上海200025 上海大学理学院数学与应用数学系上海200444 上海健康医学院医疗器械学院数据科学与大数据技术系上海200135

[背景]焦虑和抑郁是孕期女性最常见的心理健康问题。两者通常共病发生,并可能导致严重的不良母婴结局。[目的]评估上海地区女性孕期生活方式与焦虑合并抑郁(CAD)状况的关联。[方法]本研究基于中国国家出生队列(CNBC)辅助生殖技术子代胚... 详细信息

[背景]焦虑和抑郁是孕期女性最常见的心理健康问题。两者通常共病发生,并可能导致严重的不良母婴结局。[目的]评估上海地区女性孕期生活方式与焦虑合并抑郁(CAD)状况的关联。[方法]本研究基于中国国家出生队列(CNBC)辅助生殖技术子代胚胎源性疾病子队列,采用《焦虑自评量表》(SAS)和《抑郁流调量表》(CES–D)分别在孕早、中、晚期评估孕妇的CAD患病率。使用自制问卷、《匹兹堡睡眠质量指数》(PSQI)和《食物摄入频率问卷》(FFQ)收集孕妇的一般人口学资料及各孕期睡眠状况、营养摄入和运动状况等生活方式信息。分别采用二元逻辑回归模型和广义线性混合模型(GLMM)分析孕早、中、晚期生活方式(睡眠状况、营养摄入、运动状况)与孕妇CAD状况(是/否)的横向和纵向关联。[结果]本研究共纳入2876例孕妇,在孕早、中、晚期的CAD患病率分别为10.6%(305例)、3.6%(103例)、5.5%(159例)。逻辑回归分析结果显示,以睡眠状况良好为参照,孕早、中、晚期睡眠状况不佳均与CAD患病率增加存在统计学关联,OR(95%CI)分别为2.817(1.845~4.301)、2.840(1.855~4.347)、9.316(5.835~14.876)。以摄入频率=7次·周^(-1)为参照,孕早期蛋类摄入频率≤3次·周^(-1)(OR=2.025,95%CI:1.197~3.425)及孕晚期摄入频率4~6次·周^(-1)(OR=1.896,95%CI:1.117~3.216)、≤3次·周^(-1)(OR=1.906,95%CI:1.082~3.357)均会增加CAD的患病风险(P3次·周^(-1)为参照,孕中期从不或几乎不运动(OR=2.218,95%CI:1.220~4.035)均会增加CAD的患病风险(P上海地区女性孕早、中、晚期CAD患病率呈U形分布,孕早期最高,孕中期最低。孕期较差的睡眠状况,蔬菜、蛋类、奶类摄入频率和运动频率不足等不良生活方式均可能增加CAD的患病风险。及时对孕期生活方式进行干预和调整,将有助于降低孕期女性发生心理健康问题的风险,进一步提升母婴健康水平。

关键词：焦虑合并抑郁心理健康生活方式孕妇孕早期孕中期孕晚期