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基于生信分析和动力学模拟鉴定阿尔茨海默病免疫标志物及靶向药食同源中药预测

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中草药 2024年第8期55卷 2667-2683页

作者：梁朋朋王雅乐黄海李桂云吴红彦上海中医药大学深圳医院广东深圳518004

目的分析阿尔茨海默病(Alzheimer’s,AD)免疫相关的生物标志物、发病机制、免疫浸润水平和潜在的靶向药食同源中药。方法从GEO数据库中下载GSE5281、GSE132903数据集的表达谱,获得AD差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)... 详细信息

目的分析阿尔茨海默病(Alzheimer’s,AD)免疫相关的生物标志物、发病机制、免疫浸润水平和潜在的靶向药食同源中药。方法从GEO数据库中下载GSE5281、GSE132903数据集的表达谱,获得AD差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。采用加权共表达算法鉴定出AD重要模块基因,再从Imm Port Portal数据库获取免疫相关基因(immune-related genes,IRGs),将这些基因取交集得到免疫重要差异基因;随后应用最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)及机器学习-支持向量机递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)方法进行分析,筛选出AD共同的免疫相关标志物,并通过基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探索生物途径。然后,通过受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线来评估其鉴别能力,并在GSE122063数据集中进行验证。此外,建立临床列线图和曲线进行临床应用评估。基于转录样本中不同细胞类型相对丰度算法(cell-type identification by estimating relative subsets of RNA transcripts,Cibersort)和单样本基因集富集分析(single-sample gene set enrichment analysis,ss GSEA)进行免疫细胞浸润分析。最后,运用Coremine Medical、Herb数据库进行中药和成分分析,并进行分子对接和动力学模拟。结果共筛选出1360个DEGs和富半胱氨酸和甘氨酸的蛋白质1(cysteine and glycine rich protein 1,CSRP1)、胶质纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP)、白细胞介素4受体(interleukin 4 receptor,IL4R)、生长抑素(somatostatin,SST)、人核因子-κB抑制蛋白α(nuclear factor-kappa B inhibitor alpha,NFKBIA)5个生物标志物。GO分析显示AD与神经系统发育和细胞发育的正向调节高度相关;KEGG和GSEA富集结果显示AD与B细胞受体信号通路、糖胺聚糖生物合成途径等通路最为密切。免疫浸润分析显示AD脑组织内巨噬细胞、记忆B细胞、中心记忆CD8 T细胞等比例上升,初始CD4+T细胞、活化的CD8+T细胞、效应记忆CD8+T细胞比例下降,B2M、CD40等检查位点有明显差异。潜在靶向中药有人参、当归、厚朴花等82种,四气五味以温、寒、平、辛、苦、甘为主,归经以肝、肺、脾、胃经为主,功效以清热、活血、补虚居多。分子对接和动力学模拟显示20(S)-原人参二醇与标志物对接稳定。结论通过多种方法筛选出了AD的生物标志物,通过富集分析得到了AD相关的生物过程及信号通路,阐释了免疫相关机制,人参、当归、厚朴花等药食同源类中药有望成为AD新药开发的重要来源,为AD发病机制、临床治疗、药物研发提供新的思路。

关键词：阿尔茨海默病加权共表达分析机器学习免疫浸润生物标志物人参当归厚朴花 20(S)-原人参二醇

针药复合麻醉在肺切除手术中应用的系统评价和Meta分析

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中国针灸 2024年第1期44卷 109-122页

作者：孙粼希魏绪强王珂叶子周嘉上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院针麻临床研究室上海200437 上海中医药大学研究生院上海201203

目的:评价针药复合麻醉在肺切除手术应用中的临床价值及安全性。方法:计算机检索PubMed、EMbase、Cochrane Library、Web of Science、中国生物医学文献数据库(SinoMed)、中国期刊全文数据库(CNKI)、维普资讯中文期刊服务平台(VIP)、万... 详细信息

目的:评价针药复合麻醉在肺切除手术应用中的临床价值及安全性。方法:计算机检索PubMed、EMbase、Cochrane Library、Web of Science、中国生物医学文献数据库(SinoMed)、中国期刊全文数据库(CNKI)、维普资讯中文期刊服务平台(VIP)、万方数据知识服务平台(Wanfang)、***、http://***/中关于针药复合麻醉在肺切除手术中应用的随机对照试验(RCT),检索时间从各数据库建库至2022年7月12日。采用Cochrane风险偏倚工具评估纳入文献的方法学质量,采用RevMan5.4进行Meta分析。结果:纳入33篇RCT,总样本量为2 526例。Meta分析结果示:与常规麻醉比较,针药复合麻醉患者术中生命体征较平稳,术中芬太尼用量减少[SMD=-3.73,95%CI (-5.28,-2.18),Z=4.72,P研究间异质性较大,结局指标选用差异性较大,仍需采用大样本、高质量、符合国际规范的临床试验方案,进一步明确其临床价值及安全性,为临床提供可靠的循证证据。

关键词：肺切除手术针药复合麻醉系统评价 Meta分析

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慢性肾衰竭风险预测模型构建的研究进展

中华预防医学杂志 2024年第5期58卷 690-697页

作者：周凌薇刘庆中杨烁慧上海中医药大学附属市中医医院放射科上海200071 上海中医药大学附属市中医医院检验科上海200071

慢性肾脏疾病(CKD)为全球主要的公共健康问题。当CKD进展到肾功能衰竭时,患者需要选择肾脏替代治疗(KRT)或保守治疗(姑息治疗或非透析治疗)。近年来有关慢性肾功能衰竭风险预测模型的研究不断发展,这些模型通过人口学指标、临床指标和... 详细信息

慢性肾脏疾病(CKD)为全球主要的公共健康问题。当CKD进展到肾功能衰竭时,患者需要选择肾脏替代治疗(KRT)或保守治疗(姑息治疗或非透析治疗)。近年来有关慢性肾功能衰竭风险预测模型的研究不断发展,这些模型通过人口学指标、临床指标和实验室数据等来预测CKD进展到肾功能衰竭并且需要KRT的可能性。本文将详细阐述CKD进展到慢性肾衰竭的风险预测模型研究进展,希望有助于慢性肾衰竭预防策略的制定。

关键词：慢性肾脏疾病预测模型慢性肾功能衰竭透析肾移植

淫羊藿苷调节酸性微环境减轻绝经后老年骨质疏松性疼痛

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中国组织工程研究 2024年第28期28卷 4461-4468页

作者：薛春阳王秀会上海中医药大学上海市201203

背景:前期研究已证明,淫羊藿苷在促进骨形成和抑制骨吸收方面具有重要作用,但其对骨质疏松介导的骨痛产生的影响尚未见报道。目的:探讨淫羊藿苷减轻绝经后老年性骨质疏松性骨痛的可能机制。方法:①动物实验:将200只C57BL/6小鼠随机分为4... 详细信息

背景:前期研究已证明,淫羊藿苷在促进骨形成和抑制骨吸收方面具有重要作用,但其对骨质疏松介导的骨痛产生的影响尚未见报道。目的:探讨淫羊藿苷减轻绝经后老年性骨质疏松性骨痛的可能机制。方法:①动物实验:将200只C57BL/6小鼠随机分为4组:假手术组、模型组、模型+淫羊藿苷组,模型+碳酸酐酶Ⅱ抑制剂组。除假手术组外,其余各组摘除小鼠卵巢建立绝经后骨质疏松模型。模型+淫羊藿苷组在造模后第2天灌胃淫羊藿苷,每2周进行1次疼痛行为学实验并取材,持续20周。microCT检测股骨骨量、苏木精-伊红染色及TRAP染色检测破骨细胞活性、免疫荧光染色检测神经元形态及相关离子通道表达。②细胞实验:提取小鼠骨髓来源的破骨细胞前体细胞,在体外使用RANKL/M-CSF体系诱导分化为破骨细胞并添加不同浓度淫羊藿苷(1,10μmol/L)干预。采用抗酒石酸酸性磷酸酶染色检测破骨细胞分化,采用鬼笔环肽染色检测破骨细胞肌动蛋白环,采用骨板吸收实验检测破骨细胞噬骨功能,采用pH计检测体系pH值,采用Western Blot检测破骨细胞分化相关蛋白表达。此外,提取小鼠背根神经节来源神经细胞并用淫羊藿苷处理,采用CCK8检测神经元活性,采用降钙素基因相关肽染色检测神经元形态。结果与结论:①与模型组相比,模型+淫羊藿苷组小鼠骨密度更高,骨组织中抗酒石酸酸性磷酸酶阳性破骨细胞较少,神经元活性降低,神经元瞬时受体电位香草酸亚型1通道及碳酸酐酶Ⅱ表达减少;模型+淫羊藿苷组小鼠相对于模型组对疼痛的敏感性降低。②淫羊藿苷在体外有抑制破骨细胞分化及噬骨能力,且在相对无毒的pH范围内增强背根神经节神经元的活性,抑制背根神经节中降钙素基因相关肽的表达,并可抑制背根神经节中瞬时受体电位香草酸亚型1离子通道的表达。③结果表明淫羊藿苷通过对破骨细胞的作用调节酸性微环境可减轻绝经后骨质疏松症介导的骨痛。

关键词：淫羊藿苷骨质疏松疼痛酸性微环境破骨细胞分化神经元

经鼻入脑纳米递药策略及其治疗脑部疾病研究进展

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药学学报 2024年

作者：先鹏邹灵辉倪淑婷刘梅胡凯莉上海中医药大学中药学院上海中医药大学交叉科学研究院上海中医药大学产业发展中心

血脑屏障限制了大部分药物的脑部递送，影响了中枢神经系统疾病的治疗。经鼻给药可通过嗅觉和三叉神经等通路让药物绕过血脑屏障直接到达脑部，从而在减轻药物降解和避免肝首过效应的同时提高药物治疗效果。随着纳米技术的兴起，将... 详细信息

血脑屏障限制了大部分药物的脑部递送，影响了中枢神经系统疾病的治疗。经鼻给药可通过嗅觉和三叉神经等通路让药物绕过血脑屏障直接到达脑部，从而在减轻药物降解和避免肝首过效应的同时提高药物治疗效果。随着纳米技术的兴起，将纳米制剂结合经鼻给药途径有望实现更好的脑靶向与脑部疾病治疗效果。本综述归纳了经鼻入脑各通路的特点，总结了外泌体、液晶等近年来新型经鼻入脑纳米制剂的研究情况，讨论了聚焦超声技术等提高入脑效率的新策略，回顾了近年来经鼻入脑纳米制剂在治疗脑部疾病方面的研究，分析了现阶段的研究困境并展望了其未来临床应用的前景。

关键词：经鼻给药血脑屏障脑靶向纳米递药脑部疾病

猫爪草对甲状腺滤泡状癌细胞上皮间充质转化的调控作用

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辽宁中医杂志 2024年

作者：朱小雨贡翊斐王小平邓佳琳上海中医药大学附属市中医医院上海中医药大学

目的：通过体内外研究，初步探讨猫爪草（RTR）对人甲状腺滤泡状癌-238细胞（FTC-238）上皮间充质转化（EMT）的调控作用，从而探讨其对甲状腺滤泡状癌的抑癌作用。方法：体外研究，设置对照组和猫爪草醇提取物低、中、高浓度组，作用于... 详细信息

目的：通过体内外研究，初步探讨猫爪草（RTR）对人甲状腺滤泡状癌-238细胞（FTC-238）上皮间充质转化（EMT）的调控作用，从而探讨其对甲状腺滤泡状癌的抑癌作用。方法：体外研究，设置对照组和猫爪草醇提取物低、中、高浓度组，作用于FTC-238细胞24h。Cell Counting Kit-8（CCK-8）检测其对细胞增殖的作用；划痕和Transwell实验观察其对细胞迁移和侵袭的影响。体内研究构建FTC-238裸鼠肿瘤模型，分为正常对照组、阴性对照组、猫爪草中药组，分别干预 3周，实时荧光定量PCR法（qRT-PCR）检测E-cadherin和N-cadherin基因的表达。Western blot和免疫组化检测E-cadherin、N-cadherin蛋白的表达。结果：CCK-8显示与对照组相比，猫爪草各浓度组细胞的存活率均显著下降（P＜0.05）。Transwell和划痕实验显示，与对照组相比，各浓度组细胞的侵袭与迁移能力均下降。猫爪草中药可抑制肿瘤瘤体的生长。qRT-PCR显示，猫爪草各浓度组E-cadherin基因的表达量均升高（P＜0.05）；N-cadherin基因的表达量呈下降的趋势（P＜0.05）。E-cadherin蛋白的表达上调，其中高浓度组蛋白表达量为（3.44±0.58），P=0.012；中（P=0.002）、高浓度（P＜0.01）猫爪草可显著抑制N-cadherin蛋白的表达，其蛋白表达量分别为（0.63±0.06）、（0.41±0.13）。结论：猫爪草可抑制FTC-238细胞的活性、侵袭和迁移能力，抑制肿瘤的生长，与逆转上皮间充质转化有关。

关键词：猫爪草甲状腺滤泡状癌FTC-238 上皮间充质转化 E-cadherin N-cadherin 抑瘤作用侵袭与迁移荷瘤裸鼠

祛湿化瘀方抑制Wnt3a/β-catenin/VEGF信号通路保护肠道血管屏障治疗实验性NAFLD的机制研究

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中华中医药杂志 2024年第5期39卷 2485-2490页

作者：吕胜王欣辛鑫胡义扬孙沁梅冯琴上海中医药大学附属曙光医院/上海中医药大学肝病研究所上海201203 上海中医药大学附属曙光医院科技实验中心上海201203 肝肾疾病病证教育部重点实验室上海201203

目的:通过观察祛湿化瘀方对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)小鼠回肠肠道血管屏障功能的影响,揭示祛湿化瘀方治疗NAFLD的机制。方法:(1)采用高脂高糖(HFHC)饮食模型,C57BL/6J小鼠随机分为正常组,HFHC饮食模型组,祛湿化瘀方低、高剂量组,12周... 详细信息

目的:通过观察祛湿化瘀方对非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)小鼠回肠肠道血管屏障功能的影响,揭示祛湿化瘀方治疗NAFLD的机制。方法:(1)采用高脂高糖(HFHC)饮食模型,C57BL/6J小鼠随机分为正常组,HFHC饮食模型组,祛湿化瘀方低、高剂量组,12周末开始给药,直至18周末;(2)检测小鼠肝组织甘油三酯(TG),血清生化指标;HE染色观察肝组织、回肠病理;油红O染色观察肝组织脂质;免疫荧光观察回肠质膜相关蛋白1(PV-1)的表达;Western Blot检测肝脏LBP和回肠Wnt3a、p-β-catenin、VEGF的表达。结果:与正常组比较,模型组小鼠肝组织TG,血清ALT、AST活性,肝组织NAS评分,血清TG、TC、LDL-C、空腹血糖、空腹胰岛素、HOMA-IR显著升高(P<0.01),祛湿化瘀方干预后各项指标均显著降低(P<0.05,P<0.01)。模型组小鼠肝组织HE染色显示肝细胞轮廓肿胀、形态不规则,脂肪变性、气球样变及炎性细胞浸润多见;回肠HE染色显示回肠组织结构受到破坏,可见绒毛顶部少量细胞脱落;肝组织油红O染色显示肝细胞轮廓变大变圆,细胞质中可见大量脂滴;回肠PV1免疫荧光结果显示PV1表达显著升高(P<0.01);Western Blot结果显示肝脏LBP、回肠Wnt3a、p-β-catenin/β-catenin、VEGF表达显著升高(P<0.05,P<0.01);祛湿化瘀方干预后肝组织、回肠病理均改善,肝细胞中脂滴明显变小,回肠PV1表达显著降低(P<0.05),肝脏LBP、回肠Wnt3a、p-β-catenin/β-catenin、VEGF表达显著降低(P<0.05,P<0.01)。结论:祛湿化瘀方可通过抑制回肠中Wnt3a/β-catenin/VEGF信号通路,下调PV1的表达,保护肠道血管屏障的功能,改善NAFLD。

关键词：非酒精性脂肪性肝病肠血管屏障祛湿化瘀方机制 Wnt3a/β-catenin/VEGF信号通路

基于转录组学探讨黑逍遥散调控PI3K/Akt通路改善肝郁型失眠大鼠学习记忆能力的作用机制

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中国实验方剂学杂志 2024年

作者：刘佳敏王雅乐黄海李悦樊欣梁朋朋张世昭艳梅李桂云吴红彦上海中医药大学深圳医院

目的：基于转录组学探讨黑逍遥散调控磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路改善肝郁型失眠大鼠学习记忆能力的作用机制。方法：选取雄性8周龄SD大鼠60只，随机分为空白组，模型组，黑逍遥散低、中、高剂量组(3.82、7.65、... 详细信息

目的：基于转录组学探讨黑逍遥散调控磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路改善肝郁型失眠大鼠学习记忆能力的作用机制。方法：选取雄性8周龄SD大鼠60只，随机分为空白组，模型组，黑逍遥散低、中、高剂量组(3.82、7.65、15.30 g·kg-1)和右佐匹克隆组(0.09 mg·kg-1)，每组10只。除空白组外，其余各组采用慢性束缚、夹尾刺激和腹腔注射对氯苯丙氨酸（PCPA）多因素诱导肝郁型失眠大鼠模型。各给药组按相应剂量灌胃给药，1次/d，连续14 d。以戊巴比妥钠协同睡眠试验、旷场试验、Morris水迷宫试验测试大鼠的睡眠量、抑郁样行为及学习记忆能力；酶联免疫吸附测定法（ELISA）检测海马组织5-羟色氨（5-HT）、γ-氨基丁酸（GABA）、脑源性神经营养因子（BDNF）、胶质细胞系来源的神经营养因子（GDNF）、一氧化氮（NO）含量；苏木素-伊红（HE）染色观察海马组织病理改变；原位末端标记法（TUNEL）观察海马神经元凋亡情况。采用转录组学测序技术检测模型组与空白组、黑逍遥散中剂量组与模型组海马组织的差异表达基因，对交集基因进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析，并对富集到的关键基因及信号通路进行验证。实时荧光定量聚合酶链式反应（Real-time PCR）检测海马组织磷酸酶及张力蛋白同源基因（PTEN）、B细胞淋巴瘤-2（Bcl-2）样蛋白11（Bcl2l11）、丝裂原活化蛋白激酶1（Mapk1）mRNA表达情况，蛋白免疫印迹法（Western blot）检测海马组织磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）、磷酸化（p）-PI3K、蛋白激酶B（Akt）、p-Akt、Bcl-2，Bcl-2相关X蛋白（Bax）、切割型胱天蛋白酶-3（cleaved Caspase-3）蛋白表达情况。结果：与空白组比较，模型组大鼠体质量降低，睡眠潜伏期延长，睡眠时间缩短（P<0.01）；大鼠呈现明显抑郁样行为，学习记忆能力降低；海马组织中5-HT、GABA、NO、BDNF、GDNF含量均降低（P<0.01）；海马CA1区细胞排列紊乱，细胞形态不规则，细胞数量减少，胞核深染、固缩，空泡变性增加，细胞凋亡率升高（P<0.01）。与模型组比较，黑逍遥散高、中剂量组大鼠体质量升高，睡眠潜伏期缩短，睡眠时间延长（P<0.05，P<0.01）；大鼠抑郁样行为，学习记忆能力明显改善；海马组织中5-HT、GABA、NO、BDNF、GDNF的含量增加（P<0.05，P<0.01）；海马CA1区的病理损伤有所改善，海马神经元凋亡下调（P<0.01）。转录组学测序结果表明，黑逍遥散可能通过PTEN、Bcl2l11、Mapk1等关键mRNA调控PI3K/Akt信号通路而发挥治疗作用，验证结果显示，与空白组比较，模型组大鼠海马组织中PTEN、Bcl2l11、Mapk1 mRNA表达水平均升高（P<0.01），p-PI3K、p-Akt、Bcl-2的蛋白表达水平均降低（P<0.01），PTEN、Bax、cleaved Caspase-3蛋白表达水平均升高（P<0.01）；与模型组比较，黑逍遥散高、中剂量组PTEN、Bcl2l11、Mapk1 mRNA表达水平降低（P<0.01），p-PI3K、p-Akt、Bcl-2蛋白表达水平升高（P<0.01），PTEN、Bax、cleaved Caspase-3蛋白表达水平降低（P<0.05，P<0.01）。结论：黑逍遥散可能通过下调PTEN、Bcl2l11、Mapk1等关键基因的表达，调控PI3K/Akt信号通路发挥抗凋亡作用而改善肝郁失眠大鼠的学习记忆能力。

关键词：黑逍遥散肝郁型失眠学习记忆能力转录组学测序差异基因磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路

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中医药促进慢性创面修复研究进展

中国中西医结合杂志 2024年第2期44卷 250-256页

作者：雷春明单玮上海中医药大学研究生院上海200032 上海中医药大学附属龙华医院中医外科上海200032

慢性难愈性创面俗称慢性溃疡,是指不同病因诱发的经过治疗4周以上仍未愈合也无明显愈合倾向,不能通过正常有序及时的修复达到解剖和功能完整的创面[1],是一种临床常见的外科疾病,特点是病程迁延不愈且容易复发[2]。慢性创面主要包括临... 详细信息

慢性难愈性创面俗称慢性溃疡,是指不同病因诱发的经过治疗4周以上仍未愈合也无明显愈合倾向,不能通过正常有序及时的修复达到解剖和功能完整的创面[1],是一种临床常见的外科疾病,特点是病程迁延不愈且容易复发[2]。慢性创面主要包括临床中的糖尿病溃疡、创伤性溃疡、动/静脉性溃疡、感染性溃疡和压疮等。慢性创面由于原发疾病比较复杂,创面病程长,因此往往病情迁延难愈、反复发作,不仅会对患者造成生理和心理的负担.

关键词：慢性溃疡慢性创面创伤性溃疡静脉性溃疡糖尿病溃疡外科疾病原发疾病压疮