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15个物种Toll样受体5基因密码子使用偏好性分析

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中国畜牧兽医 2024年第1期51卷 11-22页

作者：戴开宇杨治风郭烨星张家港市畜牧兽医站张家港215600

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统... 详细信息

【目的】探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素。【方法】综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使用模式进行计算和统计,再基于同义密码子相对使用度(RSCU)和CDS分别进行聚类分析,推测TLR5基因发挥相似生物学功能的物种,并通过ENC-plot、Neutrality-plot和PR2-plot 3种绘图分析造成密码子偏好性现象的可能因素。【结果】9个物种TLR5基因CDS密码子第3位碱基GC含量(GC3)>0.5,14个物种有效密码子数(ENC)值>35,15个物种密码子AU偏斜度(AU skew)和GC偏斜度(GC skew)值<0;不同物种TLR5基因CDS有31个高频密码子,其中21个以G或C结尾,此外GCC、AGA、AGG和CUG表现为较高的RSCU值,为优势密码子;RSCU层次聚类和系统发育聚类结果不完全相同,但两种聚类方法均提示猪、牛和羊TLR5基因的密码子使用特点相似,鸡和绿头鸭相似,虹鳟和鲫鱼相似;ENC-plot分析发现各物种TLR5基因均分布在标准曲线下方较远位置,Neutrality-plot显示密码子第1、2位GC含量的平均值(GC12)和GC3含量呈极显著正相关(P<0.01),PR2-plot则显示密码子第3位碱基使用频率不一致。【结论】不同物种TLR5基因密码子使用模式存在偏好性现象,该现象是物种进化过程中受碱基突变和翻译选择双重影响的结果,其中碱基突变是主要影响因素。研究结果可为后续TLR5基因的生物学功能挖掘提供新的角度和理论认识。

关键词： TLR5基因密码子使用偏好性碱基突变翻译选择

基于线粒体全基因组的柴达木牛母系遗传多样性、群体结构及系统发育分析

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西北农林科技大学学报(自然科学版) 2024年 1-12页

作者：魏旭东刘瑞林李瑞哲张卫忠王启辉赵海明郭卫兴许正全尕藏当周韩赟雷初朝马志杰青海大学畜牧兽医科学院青海省高原家畜遗传资源保护与创新利用重点实验室农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室青海省格尔木市畜牧兽医站青海省格尔木市郭勒木德乡畜牧兽医站青海省格尔木市乌图美仁乡畜牧兽医站青海省都兰县宗加镇畜牧兽医站青海省乌兰县畜牧兽医站西北农林科技大学动物科技学院

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5... 详细信息

【目的】从全线粒体基因组水平探究柴达木牛的母系遗传多样性、群体结构及与其他黄牛品种间的遗传关系。【方法】采用全基因组重测序技术对60头柴达木牛进行重测序,获取每个个体的线粒体全基因组全序列,并从Gen Bank下载已公布的我国5个北方黄牛品种(即蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛和安西牛)和2个国外培育品种(荷斯坦牛和日本和牛)的共129条线粒体全基因组相应序列进行综合分析,以揭示柴达木牛线粒体基因组遗传变异,明确其母系遗传多样性水平、群体遗传结构组成、母系遗传背景及与我国北方部分地方黄牛品种、国外培育品种间的遗传关系。【结果】(1)60头柴达木牛线粒体全基因组序列比对分析共发现346个多态位点,其中单一多态位点51个,简约信息位点295个;根据序列间核苷酸变异共确定37种单倍型(H1～H37)。遗传多样性分析显示,柴达木牛线粒体基因组单倍型多样度为(0.981 0±0.006 0),核苷酸多样度为(0.003 3±0.000 2),提示其拥有丰富的母系遗传多样性。(2)系统发育分析表明,柴达木牛拥有普通牛和瘤牛2大母系支系,且以普通牛T支系为主,拥有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,提示柴达木牛拥有普通牛和瘤牛血统,有两个母系起源。(3)群体遗传分化分析表明,柴达木牛与蒙古牛、西藏牛、哈萨克牛、延边牛、日本和牛遗传分化程度均很弱,而与安西牛、荷斯坦牛达到中等遗传分化程度。(4)聚类分析显示,柴达木牛与蒙古牛聚类关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、安西牛、延边牛聚类关系相对较近,与日本和牛、荷斯坦牛聚类关系较远,其聚类结果与分化程度基本一致。【结论】柴达木牛拥有丰富的母系遗传多样性,由普通牛和瘤牛两个母系支系组成,含有T1、T2、T3、T4、I1和I2共6种亚单倍型组,推测其有2个母系起源。柴达木牛与蒙古牛亲缘关系最近,与西藏牛、哈萨克牛、延边牛、安西牛遗传关系较近,而与日本和牛、荷斯坦牛遗传关系较远。

关键词：柴达木牛 mt DNA 母系起源群体结构

日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响

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中国饲料 2024年第8期 25-28页

作者：刘平平于鹏杰王霞诸城市密州畜牧兽医站山东潍坊262200

为探索日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响,试验将600羽1日龄的白羽肉鸡随机分成4组,分为对照组(基础日粮)、试验Ⅰ组(基础日粮+0.2%黄芪多糖)、试验Ⅱ组(基础日粮+0.4%黄芪多糖)和试验Ⅲ组(基础... 详细信息

为探索日粮中添加黄芪多糖对肉仔鸡生产性能、脏器指数、屠宰性能及肌肉品质的影响,试验将600羽1日龄的白羽肉鸡随机分成4组,分为对照组(基础日粮)、试验Ⅰ组(基础日粮+0.2%黄芪多糖)、试验Ⅱ组(基础日粮+0.4%黄芪多糖)和试验Ⅲ组(基础日粮+0.6%黄芪多糖),每组3个重复,每个重复50羽鸡,试验周期42?d。结果显示,与对照组相比,日粮添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡平均日增重、平均日采食量、肌胃指数、胸肌率、腿肌率、瘦肉率、肌肉pH值、肉色和粗蛋白质含量均显著提高(P <0.05);日粮中添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡料重比、皮脂厚、失水率和粗脂肪含量均显著降低(P <0.05);添加0.2%、0.4%和0.6%黄芪多糖的肉仔鸡死亡淘汰个体数明显减少。以上结果表明,黄芪多糖不仅能提高肉仔鸡的生产性能、屠宰性能及肌肉品质,而且还能促进肉仔鸡的肌胃发育,在本试验条件下,黄芪多糖的最佳使用量为0.4%。

关键词：黄芪多糖肉仔鸡生产性能脏器指数屠宰性能肌肉品质

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规模养殖场生物安全体系建设

中国动物保健 2024年第3期26卷 74-75页

作者：樊平王引张秋桐蓝田县孟村镇畜牧兽医站西安710500 蓝田县普化镇畜牧兽医站西安710500 蓝田县安村镇畜牧兽医站西安710500

规模养殖场生物安全体系建设是实现畜牧业高质量发展的关键环节。伴随着畜牧养殖业规模的持续扩大,各类畜禽疫病的发生和影响也在持续增加,这不仅会给人们的生产和生活带来较大的负面影响,也会给我国的经济效益的增长带来一定阻碍。造... 详细信息

规模养殖场生物安全体系建设是实现畜牧业高质量发展的关键环节。伴随着畜牧养殖业规模的持续扩大,各类畜禽疫病的发生和影响也在持续增加,这不仅会给人们的生产和生活带来较大的负面影响,也会给我国的经济效益的增长带来一定阻碍。造成疫病发生的原因,主要是养殖场内外的一些生物致病因素,例如病原微生物、寄生虫等,导致养殖场出现大范围、大规模的暴发疫病,这给畜牧业的健康发展和食品安全造成了一定影响。想要对疫情的发展和扩散进行有效的防控,就必须要对疫情进行跟踪,并在此基础上构建一套完整、科学、规范的技术性防护体系。从而推动我国畜禽养殖业的规模化发展,为我国畜牧业的发展提供科学依据。

关键词：规模养殖场生物安全体系建设

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养羊业发展趋势及针对性防疫措施

中国动物保健 2024年第4期26卷 87-88页

作者：王引张秋桐樊平蓝田县普化镇畜牧兽医站西安710500 蓝田县安村镇畜牧兽医站西安710500 蓝田县孟村镇畜牧兽医站西安710500

随着畜牧业的不断发展,养羊业逐渐由传统放牧饲养向舍饲模式转变,由小型散养模式不断向规模化集中饲养模式转变,基层畜牧兽医工作者需要顺应时代发展趋势采取针对性措施进行防疫;对此,本文从把控引种关,切断传播途径,保护易感羊群和提... 详细信息

随着畜牧业的不断发展,养羊业逐渐由传统放牧饲养向舍饲模式转变,由小型散养模式不断向规模化集中饲养模式转变,基层畜牧兽医工作者需要顺应时代发展趋势采取针对性措施进行防疫;对此,本文从把控引种关,切断传播途径,保护易感羊群和提升综合生物安全管理水平等角度详述了羊常见疫病的防控措施,以期为大家带来帮助。

关键词：养羊业发展趋势疫病防控

枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响

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中国饲料 2024年第16期 49-52页

作者：张明花姜道峰刘玉平平阴县畜牧事业发展服务中心山东济南250400 平阴县畜牧兽医局平阴畜牧兽医站山东济南250400

文章旨在研究枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响,试验将160头体重为(59.35±0.53)kg的育肥猪分成4组,每组4个重复,每个重复10头猪,对照组、添加Ⅰ组、添加Ⅱ组、添加Ⅲ组依次饲喂含0、500、1000、1500mg... 详细信息

文章旨在研究枯草芽孢杆菌对育肥猪生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质的影响,试验将160头体重为(59.35±0.53)kg的育肥猪分成4组,每组4个重复,每个重复10头猪,对照组、添加Ⅰ组、添加Ⅱ组、添加Ⅲ组依次饲喂含0、500、1000、1500mg/kg枯草芽孢杆菌的基础日粮。结果显示,与对照组相比,3个枯草芽孢杆菌添加组对末重、平均日增重、料重比、IgA含量、IgG含量、芽孢杆菌数、大肠杆菌数均产生显著影响(P<0.05),枯草芽孢杆菌1000mg/kg添加组和1500mg/kg添加组对乳酸杆菌数、沙门氏菌数、pH_(24h)值、剪切力、蒸煮损失率、滴水损失率均产生显著影响(P<0.05),以1000mg/kg添加剂量的影响效果最佳。表明枯草芽孢杆菌能改善育肥猪的生长性能、免疫功能、肠道菌群和肉品质,1000mg/kg添加剂量的作用效果最优。

关键词：枯草芽孢杆菌育肥猪生长性能免疫功能肠道菌群肉品质

湖羊MSTRG.96141.1转录本表达特征分析及在卵巢颗粒细胞凋亡中调控机制

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南京农业大学学报 2024年

作者：姚晓磊王汉斌刘智琳张艳丽魏宗友南京农业大学动物科技学院太仓市畜牧兽医站

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；... 详细信息

[目的]本文旨在探究长链非编码RNA（long no-coding RNA，lncRNA）MSTRG.96141.1转录本表达特征及参与湖羊卵巢颗粒细胞凋亡（granulosa cell，GC）的调控机制。[方法]挖掘课题组前期高低繁湖羊(高繁，High prolificacy FecBB，HPBB；低繁，Low Prolificacy FecBB，LPBB)健康优势卵泡（> 5 mm）全转录组测序数据，鉴定到差异miR-3957-3p，采用生物信息学、双荧光素酶报告等方法确定与miR-3957-3p存在靶向关系的lncRNA；在此基础上，以湖羊GC为模型，采用过表达/干扰、qRT-PCR、FSIH、细胞流式术等技术，分析其表达特征和对湖羊GC凋亡的影响。[结果]miR-3957-3p表达水平HPBB组显著低于LPBB组；lncRNA（MSTRG.96141.1）与miR-3957-3p存在靶向关系；该转录本在湖羊生殖器官中的卵巢上表达最高，HPBB组显著高于LPBB组；进一步在湖羊卵巢GC中检测到该转录本的阳性信号，且定位于GC细胞质；干扰MSTRG.96141.1上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，进而促进湖羊GC凋亡；过表达miR-3957-3p上调BAX基因mRNA表达水平和BAX:Bcl-2比率，下调Bcl-2基因mRNA表达水平，进而促进湖羊GC凋亡；干扰miR-3957-3p则与之相反。[结论]MSTRG.96141.1通过吸附miR-3957-3p参与调控湖羊GC凋亡，进而影响卵泡发育。而MSTRG.96141.1能否作为湖羊繁殖力的分子标记，还需要进一步探究。

关键词：湖羊卵巢颗粒细胞 MSTRG.96141.1 miR-3957-3p 细胞凋亡

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丁酸在反刍动物中的应用研究进展

吉林畜牧兽医 2024年第10期 139-141页

作者：孙静海晏县畜牧兽医站

近年来，抗生素的滥用在食品安全领域引发了许多问题，人们开始关注使用抗生素添加剂所带来的潜在风险。丁酸作为一种绿色、安全、环保的添加剂具有广阔的应用前景。丁酸是一种短链脂肪酸，存在于反刍动物的胃部和盲肠中。它对反刍动物... 详细信息

近年来，抗生素的滥用在食品安全领域引发了许多问题，人们开始关注使用抗生素添加剂所带来的潜在风险。丁酸作为一种绿色、安全、环保的添加剂具有广阔的应用前景。丁酸是一种短链脂肪酸，存在于反刍动物的胃部和盲肠中。它对反刍动物具有多种促进作用，包括促进生长发育、提高体重和毛色光亮度、改善消化功能、提高饲料利用率和产奶量、增强抗氧化和免疫功能，以及调节肠道微生物群落平衡等。本文综述了丁酸在反刍动物生产中的应用，旨在为进一步研究和应用丁酸提供思路。

关键词：丁酸反刍动物饲料应用

日粮中DDGS替代玉米对犏雌牛产奶量、乳品质及瘤胃发酵的影响

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中国饲料 2024年第4期 121-124页

作者：张振环李思源靖远县畜牧兽医技术服务中心五合畜牧兽医工作站甘肃靖远730600 兰州新区秦川镇畜牧兽医站甘肃兰州730000

文章旨在研究日粮中DDGS替代玉米对犏雌牛产奶量、乳品质及瘤胃发酵的影响。试验选取60头胎次相同、产奶量和泌乳天数相近的犏雌牛,随机分为3组,每组20头。其中对照组参考《犏牛养殖技术规程》(DB62/T 2550-2022)配制精饲料,其余2组分... 详细信息

文章旨在研究日粮中DDGS替代玉米对犏雌牛产奶量、乳品质及瘤胃发酵的影响。试验选取60头胎次相同、产奶量和泌乳天数相近的犏雌牛,随机分为3组,每组20头。其中对照组参考《犏牛养殖技术规程》(DB62/T 2550-2022)配制精饲料,其余2组分别采用30%、60%DDGS替代精饲料中的玉米。试验为期40 d,期间3组犏雌牛均采用舍饲,自由饮水,自由采食粗饲料。结果表明:(1)在相同试验天数条件下,第1、10天各组犏雌牛平均日产奶量均无显著差异(P>0.05),第20、30、40天30%DDGS组犏雌牛平均日产奶量显著高于对照组和60%DDGS组(P<0.05)。(2)与对照组相比,30%DDGS组乳糖率显著提高8.60%(P<0.05),乳蛋白率显著提高5.90%(P<0.05),总固形物显著提高6.12%(P<0.05)。(3)与对照组相比,30%DDGS组、60%DDGS组氨态氮、乙酸浓度及乙丙比均显著提高(P<0.05),丙酸浓度显著降低(P<0.05)。结论:采用30%DDGS替代精饲料中的玉米能提高犏雌牛的产奶量,并且起到改善乳品质和瘤胃发酵的效果。

关键词： DDGS 玉米犏雌牛产奶量乳品质瘤胃发酵