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野生稻CBF/DREB1转录因子的鉴定与生物信息学分析

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草业学报 2024年第6期33卷 126-144页

作者：霍晨敏袁敏张宝文王瑞菊河北经贸大学生物科学与工程学院河北石家庄050061 分子细胞生物学教育部重点实验室河北省细胞生物学基础学科研究中心河北省细胞信号与环境适应协同创新中心河北省分子细胞生物学重点实验室河北师范大学生命科学学院河北石家庄050024 华北理工大学生命科学学院河北唐山063210

低温冷害是限制栽培稻地域分布和产量的重要因素之一,严重影响我国的粮食安全。以CBF/DREB1为核心的C-重复结合因子-冷调节基因(CBF-COR)途径是水稻适应低温的重要信号传导途径。基于稻属9种植物的全基因测序结果和隐马尔可夫模型(HMM)... 详细信息

低温冷害是限制栽培稻地域分布和产量的重要因素之一,严重影响我国的粮食安全。以CBF/DREB1为核心的C-重复结合因子-冷调节基因(CBF-COR)途径是水稻适应低温的重要信号传导途径。基于稻属9种植物的全基因测序结果和隐马尔可夫模型(HMM)搜索,共鉴定出71个CBF/DREB1基因序列。所有基因均无内含子,由单个外显子组成。大部分DREB1s呈弱酸性,所有DREB1s亲水性平均值1,受到正选择压力。旁系同源基因之间启动子顺式元件种类和数量差异较大,直系同源基因的启动子顺式元件种类和数量很相似。对日本晴、93-11和东乡野生稻7 d幼苗4℃冷处理2 h的实时荧光定量PCR分析发现早期冷响应基因可分为激活型(DREB1A/1B/1C/1E/1F/1G/1H)和抑制型(DREB1D/1I/1J)。在日本晴、93-11和东乡野生稻冷激活型基因中,DREB1B/1G/1H均是冷处理后响应最快的一级冷响应因子,且启动子均含有至少一个拷贝的CAMTA转录因子结合元件CM2(CCGCGT)。OrDREB1B/1C/1E/1F/1G/1H在东乡野生稻4℃冷处理4 h后的表达量均高于栽培稻同源基因的表达量。9种稻属植物的CBF/DREB1基因亚家族的分子进化分析结果为低温抗性基因的挖掘和利用提供了前期基础。

关键词：野生稻 CBF/DREB1 保守基序选择压力启动子分析

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雌激素受体在卵巢癌中作用的研究进展

生命科学 2024年第8期36卷 1049-1056页

作者：应桃赵越中国医科大学第一临床学院沈阳110001 中国医科大学生命科学学院卫生部细胞生物学重点实验室教育部医学细胞生物学重点实验室染色质生物学研究室沈阳110122

雌激素受体(estrogen receptor,ER)是核受体超家族的重要成员,主要以雌激素依赖的方式介导下游靶基因的表达,并受到辅助调节因子和非编码RNA等的调控。诸多研究揭示,ERs介导的基因表达调控在上皮性卵巢癌和卵巢颗粒细胞瘤的发生与发展... 详细信息

雌激素受体(estrogen receptor,ER)是核受体超家族的重要成员,主要以雌激素依赖的方式介导下游靶基因的表达,并受到辅助调节因子和非编码RNA等的调控。诸多研究揭示,ERs介导的基因表达调控在上皮性卵巢癌和卵巢颗粒细胞瘤的发生与发展中起到重要作用,特别是子宫内膜样卵巢癌。本文主要综述了近年来新发现的辅助调节因子与非编码RNA在ERs介导转录调控中的作用、ERs的靶基因以及ERs在子宫内膜异位症向其相关卵巢癌进展过程中的作用。本文旨在进一步总结ERs的生物学功能及其在上述类型的卵巢癌发病机制中的作用,并为开发新的内分泌治疗策略提供思路与启示。

关键词：雌激素受体卵巢癌基因转录调控辅助调节因子

酶介导的邻近细胞标记方法探究细胞间相互作用

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第4期40卷 424-432页

作者：沙昱彤李景超易文浙江大学生命科学学院生物化学研究所肿瘤与干细胞生物学实验室杭州310058

细胞-细胞相互作用(cell-cell interactions,CCIs)可以通过细胞表面蛋白质、聚糖、脂质等介导的细胞间突触形成而发生,以维持机体稳态和调控生理功能。这些CCIs是复杂的,涉及许多不同的细胞表面和细胞内分子的参与。随着基础研究和转化... 详细信息

细胞-细胞相互作用(cell-cell interactions,CCIs)可以通过细胞表面蛋白质、聚糖、脂质等介导的细胞间突触形成而发生,以维持机体稳态和调控生理功能。这些CCIs是复杂的,涉及许多不同的细胞表面和细胞内分子的参与。随着基础研究和转化医学的不断发展,如何准确识别细胞间相互作用并对其进行表征和定量,引起了广泛关注。近年来,研究CCIs的技术手段不断推陈出新,而邻近标记是一种十分有前景的研究细胞间相互作用的化学生物学方法。目前,主要有两种类型的标记策略。一种是依赖基因工程操作,在“诱饵”细胞表面表达外源酶,通过其与相邻细胞上的受体底物的直接结合,以便发生细胞间邻近标记。另一种是使用酶或小分子催化剂(例如光催化剂),通过基因工程重组表达或借助化学(化学酶)方法将它们偶联在“诱饵”细胞表面,在适当的刺激或激活后,靶向递送感兴趣的标记分子,实现邻近标记。其中,酶介导的邻近细胞标记方法在检测和表征CCIs上具有重要的应用价值。该综述将标记过程中涉及有酶参与的方法定义为酶介导的邻近细胞标记方法,这种方法的一个明显优势是,由于酶和受体底物之间直接的物理接触或酶催化产生高反应活性标记分子而实现小的标记半径范围。该综述旨在归纳与总结近年来开发的酶介导的邻近细胞标记方法的原理、优缺点及现有应用。

关键词：细胞-细胞相互作用酶介导的邻近细胞标记方法邻近标记方法

英语霸权视角下对中国科技期刊建设意识引导的思考

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编辑学报 2024年第1期36卷 18-24页

作者：任滢滢《厦门大学学报(自然科学版)》编辑部厦门361005

针对目前中国科技期刊意识形态工作多局限于期刊编校或编辑部制度建设的现象,本文以英语霸权为切入点对中文期刊建设展开讨论,旨在为科技期刊的意识形态工作开辟一个新视角。通过分析中国科技期刊建设面临的英语霸权现象,以及其对出版... 详细信息

针对目前中国科技期刊意识形态工作多局限于期刊编校或编辑部制度建设的现象,本文以英语霸权为切入点对中文期刊建设展开讨论,旨在为科技期刊的意识形态工作开辟一个新视角。通过分析中国科技期刊建设面临的英语霸权现象,以及其对出版领域相关制度和经济良性发展的危害,提出中国科技期刊建设中应警惕强化英语霸权导向,加强文化自信的意识形态引导。办刊人应立足本国利益统一思想,自立自强发展中国科技期刊,做强做优中文科技期刊,提升中国期刊的国际影响力,抢占国际学术话语权。

关键词：英语霸权中国科技期刊意识形态语言经济学意识引导文化自信

N^(6)-甲基化腺苷修饰在乳腺癌中的研究进展

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生命科学 2024年第3期36卷 343-352页

作者：马唯吴宇丹张红艳李彦姝中国医科大学口腔医学院沈阳110122 中国医科大学护理学院沈阳110122 中国医科大学生命科学学院分子细胞生物学教研室教育部医学细胞生物学重点实验室暨卫健委细胞生物学重点实验室沈阳110122

表观遗传学在乳腺癌的恶性进展中起到重要作用,其中N^(6)-甲基化腺苷(m^(6)A)修饰是最丰富的RNA修饰,参与调节乳腺癌细胞恶性行为的通路及癌细胞所处的肿瘤微环境。同时,乳腺癌发病率居于我国女性恶性肿瘤首位,近年来首次发病年龄趋于... 详细信息

表观遗传学在乳腺癌的恶性进展中起到重要作用,其中N^(6)-甲基化腺苷(m^(6)A)修饰是最丰富的RNA修饰,参与调节乳腺癌细胞恶性行为的通路及癌细胞所处的肿瘤微环境。同时,乳腺癌发病率居于我国女性恶性肿瘤首位,近年来首次发病年龄趋于年轻化,是严重危及我国女性健康的疾病之一。然而,乳腺癌早期治疗预后较好。当晚期出现转移后,患者5年生存率差。m^(6)A作为一种可能用于乳腺癌早筛的生物标志物及新的药物治疗靶点,给乳腺癌的早期治疗提供了新的研究方向。本文系统地综述了m^(6)A修饰相关因子及其在乳腺癌恶性行为中发挥的调控作用,并列出现已知的一些靶向药物和潜在的早筛方法,为乳腺癌的诊断、治疗、监测提供新的思路。

关键词： N^(6)-甲基化腺苷乳腺癌信号通路药物

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PRMT1在消化系统肿瘤中的作用

中国生物化学与分子生物学报 2024年第4期40卷 526-533页

作者：郭大金谭圆圆金艳花延边大学医学院细胞生物学与医学遗传学教研室吉林延吉133002

蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)是蛋白质精氨酸甲基转移酶家族中的一员,通过将甲基从S-腺苷-L-甲硫氨酸转移到末端胍基氮原子以甲基化精氨酸残基,催化精氨酸残基的单甲基化和不对称二甲基化。研究发现,PRMT1位于细胞核和细胞质内,参与... 详细信息

蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)是蛋白质精氨酸甲基转移酶家族中的一员,通过将甲基从S-腺苷-L-甲硫氨酸转移到末端胍基氮原子以甲基化精氨酸残基,催化精氨酸残基的单甲基化和不对称二甲基化。研究发现,PRMT1位于细胞核和细胞质内,参与哺乳动物转录调节、信号转导和DNA损伤修复等过程,并通过多种方式影响肿瘤的增殖、凋亡、转移及耐药等生物学过程,在恶性肿瘤的发生过程中发挥着十分重要的作用。此外,PRMT1还是多种癌症预后不良的生物标志物,其抑制剂能够抑制部分肿瘤的生长。PRMT1与肿瘤的生物学特性密切相关,影响癌症患者的预后。本文主要就PRMT1在消化系统肿瘤中不同的作用靶点以及参与的信号通路做一综述,并简要概括PRMT1抑制剂联合治疗策略,以期为消化系统肿瘤的临床治疗及预后提供新思路。

关键词：蛋白质精氨酸甲基转移酶1 甲基化肿瘤联合治疗

区域绿色创新能力的驱动模式及其内在机制:基于绿色创新生态系统视角

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改革 2024年第4期 93-107页

作者：李璐张怀英吉首大学学报编辑部吉首大学商学院

以中国30个省份为研究样本,采用组态思维和模糊集定性比较分析方法,基于绿色创新生态系统视角,探讨环境、资源、主体对区域绿色创新能力的联动效应以及互动匹配模式所蕴含的运行机制。研究发现:绿色创新主体是促进区域高水平绿色创新能... 详细信息

以中国30个省份为研究样本,采用组态思维和模糊集定性比较分析方法,基于绿色创新生态系统视角,探讨环境、资源、主体对区域绿色创新能力的联动效应以及互动匹配模式所蕴含的运行机制。研究发现:绿色创新主体是促进区域高水平绿色创新能力提升的必要条件;区域高绿色创新能力的背后逻辑是由多重因素并发且协同匹配形成的多种不同路径,主要包括政府支持下的主体双轮驱动型、金融环境缺失下的技术主体弥补型、环境规制下的产学研促进型三种驱动模式。促进区域绿色创新均衡化稳步发展,应持续推进企业主体、市场导向、政府支持的绿色创新体系建设,大力培育以绿色技术、绿色项目、绿色产业为目标的政产研学战略联盟,加大绿色创新体制机制的精准化创设和协同化推进力度。

关键词：绿色创新绿色创新生态系统驱动模式联动效应

开放科学背景下学术期刊同行评议各方主体权利义务及其辩证关系研究

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科技与出版 2024年第5期 114-120页

作者：龚梦月江南大学《Systems Microbiologyand Biomanufacturing》编辑部江苏无锡214122 江南大学《食品与生物技术学报》编辑部江苏无锡214122

同行评议为科学研究提供了可证实或证伪的信赖基础,编辑、审稿人和作者三个角色在同行评议实践中紧密联系、不可或缺。开放科学背景下,同行评议过程的创新发展充满机遇和挑战,各方主体的权利义务发生了变化。虽然关于编辑、审稿人权利... 详细信息

同行评议为科学研究提供了可证实或证伪的信赖基础,编辑、审稿人和作者三个角色在同行评议实践中紧密联系、不可或缺。开放科学背景下,同行评议过程的创新发展充满机遇和挑战,各方主体的权利义务发生了变化。虽然关于编辑、审稿人权利义务的描述性研究不胜枚举,但是各主体在同行评议过程中权利义务的辩证关系亟待厘清。本文结合同行评议的时序演变,分别从编辑、审稿人、作者的角度切入系统界定其权利义务范畴,分析其辩证关系,梳理三者面对的挑战,探讨相应对策和未来发展趋势。

关键词：同行评议权利义务编辑作者审稿人

中国特色科技期刊评价体系的成效、意义与建议

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科技与出版 2024年第4期 39-47页

作者：涂鹏秦明阳邓履翔中南大学《铁道科学与工程学报》编辑部长沙410075 中南大学《中南大学学报(自然科学版)》编辑部长沙410083 中南大学《交通安全与环境(英文)》编辑部长沙410083

为了研究中国特色科技期刊评价体系带来的成效,以《国际期刊预警名单(2020)》《铁路运输领域高质量科技期刊分级目录》和《重要影响力中文期刊目录清单》为研究对象,通过文献计量学方法分析其对国内(或者机构)论文发表量的影响,评价其... 详细信息

为了研究中国特色科技期刊评价体系带来的成效,以《国际期刊预警名单(2020)》《铁路运输领域高质量科技期刊分级目录》和《重要影响力中文期刊目录清单》为研究对象,通过文献计量学方法分析其对国内(或者机构)论文发表量的影响,评价其带来的积极导向作用与效果,并给出未来发展建议。文章提出:中国特色科技期刊评价体系从三个层面发挥了立竿见影的效果:明显遏制了中国在预警期刊上“灌水”猛涨的趋势,引导我国科技论文在正面期刊上发表,推动中外科技期刊“同质等效使用”,这有利于我国参与全球学术评价治理、扶植本土科技期刊繁荣发展,重塑科技期刊和科学研究风清气正的发展新生态。中国特色科技期刊评价体系需要坚持“综合量化评价和学术本质评价相结合、外部专业评价与内部自主评价相结合、扶植正面期刊与打击预警期刊相结合”,未来需要进一步推广“国家方案”、完善“行业方案”和落实“企业方案”。

关键词：科技期刊评价改革学术治理学术评价权预警期刊分级目录