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基于中断时间序列分析评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响

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郑州大学学报（医学版） 2024年第4期59卷 459-463页

作者：李言言李鑫潇张冰洁薛晨路王永斌新乡医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新乡453003

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数... 详细信息

目的:使用中断时间序列分析方法评估河南省新冠病毒感染疫情防控对手足口病流行趋势的影响。方法:从河南省卫生健康委员会法定报告传染病系统中收集2013年1月至2022年9月手足口病发病数据。用河南省2013年1月至2019年6月手足口病发病数据构建ARIMA预测模型,用2019年7月至2019年12月数据验证模型的预测效果。以该模型预测的2020年1月至2022年9月(疫情防控期间)手足口病发病数据为预测值,同期报告数据为真实值,采用阶跃变化、脉冲变化两种评价方法,分析疫情防控对手足口病发病的影响。结果:ARIMA(0,1,1)(0,1,1)12模型的MA1=0.43(t=3.14,P病发病数阶跃变化为-3471(95%CI为-11794~4852)例,估计的脉冲变化为每月9210(95%CI为3153~15268)例。结论:新冠病毒感染疫情防控降低了河南省手足口病发病水平。

关键词：中断时间序列分析自回归综合移动平均模型新冠病毒感染疫情手足口病河南省

TRAF1/C5和TNF-α基因多态性与结核病易感性分析

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中华疾病控制杂志 2024年第2期28卷 138-145页

作者：吴山客骆嘉泽廖寅谦张开漩胡宽邹频昂汪保国曾转萍广东药科大学公共卫生学院流行病学教研室广州510310

目的分析肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated factor 1,TRAF1)/补体5(complement component 5,C5)rs10818488和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)rs1800629基因多态性、环境因素及其交互作用对结核病(tuberculosis,TB)易感性的影响。方法选取TB多发家庭中TB确诊患者作为TB病例组,当地社区同期体检的健康志愿者作为健康对照(healthy controls,HC)组,与TB组有血缘关系且共同居住者组成家庭密切接触(healthy household contacts,HHC)组。采用logistic回归分析模型分析基因型和环境因素与TB的关联,叉生分析结合logistic回归分析模型分析基因与环境交互作用。结果年龄>45岁(χ^(2)=7.90,OR=2.28,95%CI:1.28~4.04,P=0.005)、吸烟(χ^(2)=15.27,OR=4.70,95%CI:2.16~10.22,P病风险。吸烟(χ^(2)=13.94,OR=3.58,95%CI:1.83~7.01,P室环境卫生较差(χ^(2)=15.31,OR=3.20,95%CI:1.79~5.73,P病风险。TRAF1/C5 rs10818488位点中,携带AG基因型(共显性及超显性模型)、GG基因型(共显性模型)和AG-GG基因型(显性模型)增加HHC组和HC组患TB风险。TNF-αrs1800629位点与TB易感性暂未显示存在关联。分析基因与环境交互作用,在TB组和HHC组间,TRAF1/C5 rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟存在协同作用;而在TB组和HC组间,rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟和居室环境卫生较差存在协同作用,与居住地存在相乘交互作用,均使TB发病风险提高。结论TRAF1/C5 rs10818488位点的基因多态性可能与TB发病风险有关,且其与吸烟、居住地、居室环境卫生存在交互作用,共同影响TB的易感性。

关键词：肿瘤坏死因子受体相关蛋白1 补体5 肿瘤坏死因子-α 基因多态性结核病

睡眠质量低下与创伤患者创伤后应激障碍的发生相关

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南方医科大学学报 2024年第6期44卷 1166-1172页

作者：袁萍胡秀莉漆国佳代秀褚相远陈卫航石修权遵义医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室贵州遵义563006 习水县人民医院公共卫生科贵州遵义564600

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,... 详细信息

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,226例完成PTSD调查评估。采用PSQI量表结合智能手环睡眠监测评估患者创伤前后睡眠质量;采用PCL-C量表随访测评PTSD发生情况。结果创伤患者1个月后PTSD检出率为19.47%,3个月后PTSD检出率为17.61%。在睡眠质量方面,PTSD患者创伤前PSQI量表评分显著增高(P<0.001),其中患者PTSD发生前睡眠异常检出率为72.73%。在创伤后(入院7 d内)睡眠质量监测方面,PTSD患者评分降低,夜间清醒次数增多(P<0.05)。在创伤1个月与3个月后睡眠质量方面,PTSD患者PSQI量表评分均高于非PTSD人群(P<0.05)。结论创伤患者中创伤前睡眠质量差者更容易发生PTSD。

关键词：创伤创伤后应激障碍睡眠障碍影响因素

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肺腺癌ceRNA调控网络构建及AFAP1-AS1功能验证

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中国胸心血管外科临床杂志 2024年第4期31卷 576-584页

作者：王会新李倩侯晓雯史新竹冯旭沈阳医学院公共卫生学院统计教研室沈阳110034 沈阳医学院公共卫生学院流行病学教研室沈阳110034

目的基于生物信息学方法构建肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,并分析肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1(actinfilament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1)在LUAD中的功能机制,以期为LUAD治疗靶点研究提供新的方向。方法从基因表达综合性基因库(GEO)中下载LUAD的基因芯片,并使用GEO2R在线软件筛选LUAD与正常组织之间具有差异表达的lncRNA和mRNA,并通过在线数据库预测其靶基因,构建ceRNA网络,并进行富集分析。在细胞实验中,对AFAP1-AS1进行基因敲除并构建siRNA,通过细胞转染法转染LUAD细胞A549。用CCK8、Transwell、划痕实验和流式细胞术实验检测细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的能力。结果在LUAD的芯片中共鉴定出6个差异表达lncRNA和494个差异表达的mRNA。ceRNA网络共涉及6个lncRNA、22个miRNA和55个mRNA。富集分析发现mRNA与癌症相关通路有关。在细胞实验中,敲除AFAP1-AS1可抑制细胞增殖、侵袭和迁移,且AFAP1-AS1促进细胞凋亡。结论本研究构建了一个lncRNA介导的ceRNA网络,这可能有助于进一步研究LUAD的作用机制。此外,通过细胞实验,本研究发现AFAP1-AS1有潜力作为LUAD的治疗靶点。

关键词：生物信息学肺腺癌竞争性内源RNA 长链非编码RNA 肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1

基于WGCNA和机器学习筛选帕金森病免疫相关关键基因

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中南大学学报（医学版） 2024年第2期49卷 207-219页

作者：黄一铭王爱民王凤琳徐雅琪张文婧石福艳王素珍山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053

目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用。然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限。本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expres... 详细信息

目的:在帕金森病的发病过程中,免疫系统的异常激活和炎症反应起着重要作用。然而,目前对于免疫相关关键基因在帕金森病发生和发展中的具体作用和作用机制的了解仍然有限。本研究旨在通过加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)和机器学习筛选帕金森病免疫相关关键基因。方法:从基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库下载基因芯片数据,采用WGCNA筛选出与帕金森病相关的重要基因模块;将重要模块中的基因导出,绘制帕金森病重要相关基因与免疫相关基因的韦恩图,从而筛选出帕金森病免疫相关基因。采用基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)深入分析免疫相关基因的功能及参与的信号通路。通过R语言的CIBERSORT包进行免疫细胞浸润分析。采用生物信息学方法和3种机器学习方法[最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、随机森林(random forest,RF)和支持向量机(support vector machine,SVM)]对筛选出的帕金森病免疫相关基因进行进一步筛选研究,绘制4种方法筛选的差异表达基因的韦恩图,筛选交集基因即中心节点(hub node,hub)基因。通过STRING数据库搜索帕金森病hub基因的下游蛋白质,绘制蛋白质互作网络图。结果:筛选出帕金森病重要模块基因中与免疫相关的基因218个,其中45个为上调基因,50个为下调基因。富集分析结果显示218个基因主要在免疫系统对外来物反应和病毒感染通路富集。免疫浸润分析结果表明,CD4^(+)T细胞、NK细胞、CD8^(+)T细胞、B细胞在帕金森病患者样本中的浸润百分率较高,静息NK细胞、静息CD4^(+)T细胞在帕金森病患者样本中显著浸润。4种方法筛选出的hub基因为ANK1基因。交集基因蛋白质互作网络分析结果显示,ANK1基因翻译表达的11个蛋白质主要参与信号转导、铁稳态调节及免疫系统激活等功能。结论:通过WGCNA和机器学习方法,筛选出帕金森病免疫相关关键基因ANK1,该基因可能成为帕金森病诊断和治疗的候选靶点。

关键词：加权基因共表达网络分析机器学习帕金森病免疫 ANK1基因

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Klotho蛋白与充血性心力衰竭的关联及炎症的介导作用

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郑州大学学报（医学版） 2024年第5期59卷 639-645页

作者：曹青青宋宇郇昌盛贾泽鑫高倩王重建毛振兴侯建刘晓田霍文倩郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院流行病学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院计算机与卫生统计学教研室郑州450001

目的:探讨Klotho蛋白与充血性心力衰竭(CHF)的关联及炎症的介导作用。方法:选取美国国家健康与营养调查2007-2016年的10762例研究对象(男5240例,女5522例),根据Klotho蛋白的四分位数将研究对象分为4组(Q1、Q2、Q3、Q4组),采用Logistic... 详细信息

目的:探讨Klotho蛋白与充血性心力衰竭(CHF)的关联及炎症的介导作用。方法:选取美国国家健康与营养调查2007-2016年的10762例研究对象(男5240例,女5522例),根据Klotho蛋白的四分位数将研究对象分为4组(Q1、Q2、Q3、Q4组),采用Logistic回归模型分析Klotho蛋白及炎症生物标志物与CHF的关系,采用广义线性模型分析Klotho蛋白与炎症生物标志物的关联,中介分析用于评估炎症生物标志物在Klotho蛋白与CHF关联中的中介效应。结果:Klotho蛋白可降低CHF风险(OR=0.695,95%CI为0.513~0.942),且在男性中更显著(OR=0.604,95%CI为0.406~0.898)。炎症生物标志物在Klotho蛋白与CHF的关联中具有中介效应,其中中性粒细胞计数与淋巴细胞计数比值的中介作用最大,在总人群和男性中分别为11.93%和9.92%,中介效应β(95%CI)分别为-0.047(-0.078~-0.026)和-0.050(-0.093~-0.021)。结论:高水平的Klotho蛋白、低水平的炎症生物标志物可降低CHF风险。炎症生物标志物部分介导了Klotho蛋白对CHF的保护作用。

关键词： Klotho蛋白充血性心力衰竭炎症生物标志物中介作用

河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联及体力活动的影响

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郑州大学学报（医学版） 2024年第2期59卷 205-211页

作者：贾泽鑫宋宇王冕郇昌盛曹青青高倩毛振兴王重建霍文倩郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院计算机与卫生统计学教研室郑州450001 郑州大学公共卫生学院流行病学教研室郑州450001

目的:探讨河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联,并分析体力活动对这种关系的影响。方法:从“河南省农村队列研究”中选取9 069人为研究对象,根据出生日期分为胎儿期饥荒暴露组和非饥荒暴露组。采用国际体力活动问卷(IPAQ)... 详细信息

目的:探讨河南省农村居民胎儿期饥荒暴露与成年期肥胖的关联,并分析体力活动对这种关系的影响。方法:从“河南省农村队列研究”中选取9 069人为研究对象,根据出生日期分为胎儿期饥荒暴露组和非饥荒暴露组。采用国际体力活动问卷(IPAQ)评估体力活动水平,计算总体力活动值。采用Logistic回归模型分析胎儿期饥荒暴露与不同类型肥胖的关系,采用线性回归模型分析胎儿期饥荒暴露与肥胖指标[BMI、腰围(WC)、腰高比(WHtR)、腰臀比(WHR)]的关系,采用广义线性模型分析体力活动对胎儿期饥荒暴露与肥胖关系的影响。结果:胎儿期饥荒暴露与以WC、WHR和WHtR定义的肥胖均有关联,OR(95%CI)值分别为1.23(1.07~1.40)、1.41(1.23~1.61)和1.26(1.09~1.45),而且在女性中的关联更强;胎儿期饥荒暴露与肥胖指标WC、WHR和WHtR也存在类似的正关联关系。胎儿期饥荒暴露对肥胖及肥胖相关指标的不利影响随体力活动水平的升高而降低。结论:河南省农村居民胎儿期饥荒暴露增加成年期肥胖风险,适当的体力活动可在一定程度上减轻这一风险。

关键词：饥荒肥胖体力活动农村居民河南省

短期大气颗粒物暴露和MTNR1B基因多态性对甘油三酯-葡萄糖指数影响的家系研究

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北京大学学报（医学版） 2024年第3期56卷 375-383页

作者：郭煌达彭和香王斯悦侯天姣李奕昕章涵宇王梦莹武轶群秦雪英唐迅李劲陈大方胡永华吴涛北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系北京100191 北京大学公共卫生学院营养与食品卫生学系北京100191 重大疾病流行病学教育部重点实验室(北京大学) 北京100191

目的:利用北京房山家系队列研究资料,探索短期大气颗粒物(particulate matter,PM)暴露和褪黑素受体1B(melatonin receptor 1B,MTNR1B)基因多态性对甘油三酯-葡萄糖(triglyceride-glucose,TyG)指数的影响。方法:纳入来自北京市房山区9个... 详细信息

目的:利用北京房山家系队列研究资料,探索短期大气颗粒物(particulate matter,PM)暴露和褪黑素受体1B(melatonin receptor 1B,MTNR1B)基因多态性对甘油三酯-葡萄糖(triglyceride-glucose,TyG)指数的影响。方法:纳入来自北京市房山区9个乡镇的先证者及其亲属作为研究对象,使用混合线性模型评估短期PM暴露和MTNR1B基因rs10830963位点多态性与TyG指数的关联,进一步利用最大似然法进行基因-环境交互作用分析,探索rs10830963位点多态性在PM与TyG指数关联中的效应修饰作用。结果:共纳入来自2084个家系的4395名参与者,研究对象平均年龄(58.98±8.68)岁,女性占比53.90%。关联分析结果显示,PM 2.5浓度每升高10μg/m 3,TyG指数升高0.017(95%CI:0.007~0.027),而PM 10每升高10μg/m 3,TyG指数升高0.010(95%CI:0.003~0.017),且关联均存在滞后效应。此外,rs10830963位点与TyG指数存在阳性关联。每增加一个风险等位基因G,TyG指数升高0.040(95%CI:0.004~0.076)。与CC基因型携带者相比,GG基因型携带者的TyG指数高0.079(95%CI:0.005~0.152)。未发现该位点多态性与PM暴露的交互作用具有统计学意义。结论:PM 2.5和PM 10短期暴露与较高的TyG指数相关,MTNR1B基因的rs10830963位点G等位基因与TyG指数升高相关联。

关键词：颗粒物吸入暴露甘油三酯-葡萄糖指数 MTNR1B基因家系研究

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临床研究中混杂偏倚控制的原则和方法

中华内科杂志 2024年第8期63卷 734-738页

作者：徐博雅高银燕宋金璐吴心音中南大学湘雅公共卫生学院流行病与卫生统计学系长沙410015 湖南省临床流行病学重点实验室长沙410015

混杂偏倚是影响临床研究结果真实性的重要原因之一,需进行科学合理地控制。混杂偏倚的控制应贯穿临床研究设计和资料分析的全过程,针对已测量、未测量和无法测量混杂,存在不同的混杂控制方法。为进一步促进混杂控制在临床研究中的规范性... 详细信息

混杂偏倚是影响临床研究结果真实性的重要原因之一,需进行科学合理地控制。混杂偏倚的控制应贯穿临床研究设计和资料分析的全过程,针对已测量、未测量和无法测量混杂,存在不同的混杂控制方法。为进一步促进混杂控制在临床研究中的规范性,提高临床研究的方法学质量,满足临床实践和医学决策的需要,本文从混杂偏倚的定义和识别入手,梳理和归纳了临床研究中混杂偏倚控制的原则和方法。

关键词：混杂偏倚临床研究偏倚控制