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基于生物信息学分析及机器学习方法筛选早发型子痫前期的特征基因及相关免疫细胞浸润分析

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中华围产医学杂志 2024年第1期27卷 51-61页

作者：武紫彤郑媛媛丁新首都医科大学附属北京妇产医院(北京妇幼保健院)产科北京100026

目的通过生物信息学分析及机器学习方法探索早发型子痫前期(early-onset pre-eclampsia, EOSP)的特征基因及相关免疫细胞浸润分析。方法在基因表达综合(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库中, 以"early-onset pre-eclampsia"为检索词,... 详细信息

目的通过生物信息学分析及机器学习方法探索早发型子痫前期(early-onset pre-eclampsia, EOSP)的特征基因及相关免疫细胞浸润分析。方法在基因表达综合(Gene Expression Omnibus, GEO)数据库中, 以"early-onset pre-eclampsia"为检索词, 检索EOSP与正常妊娠的胎盘组织mRNA序列。采用R语言对芯片数据进行背景校正、标准化、汇总和探针质量控制, 下载注释包进行ID转换, 提取表达矩阵, 使用limma软件包分析去除批次效应后的元数据中EOSP与正常妊娠之间差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)。通过支持向量机递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination, SVM-RFE)分析和LASSO回归模型识别特征基因。通过计算受试者工作特征曲线的曲线下面积(area under the curve, AUC)分析特征基因的诊断能力。然后回顾性收集2022年1月1日至2023年2月28日在首都医科大学附属北京妇产医院分娩的15例EOSP及15例正常妊娠孕产妇的胎盘组织, 应用实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白质印迹法验证特征基因的表达情况, 并在验证集中进一步验证。最后, 使用CIBERSORT分析EOSP中免疫细胞浸润的相对比例。组间差异分析采用t检验。结果共检索获得3个基因数据集, 包括GSE44711(EOSP与正常妊娠各8例)、GSE74341(EOSP与正常妊娠分别为7例和5例)及GSE190639(EOSP与正常妊娠各13例), 合并GSE44711和GSE74341数据集后共筛选出了29个DEGs, 其中包括27个上调及2个下调的基因。GO富集分析结果显示这29个DEGs主要参与促性腺激素分泌、女性妊娠、调控内分泌过程、内分泌激素分泌及激素分泌的负调节过程。通过LASSO回归算法及SVM-RFE算法联合分析共筛选出8个特征基因, 分别为EBI3、HTRA4、TREML2、TREM1、NTRK2、ANKRD37、CST6及ARMS2;定量逆转录聚合酶链反应和蛋白质印迹法验证特征基因的表达差异均有统计学意义(P值均<0.05, CST6除外)。Logistic回归分析结果显示, TREML2、ANKRD37、NTRK2、TREM1、HTRA4、EBI3及ARMS2的AUC(95%CI)分别为0.979(0.918~1.000)、0.969(0.897~1.000)、0.969(0.892~1.000)、0.979(0.918~1.000)、0.990(0.954~1.000)、0.990(0.954~1.000)、0.903(0.764~1.000)。免疫细胞浸润结果显示EOSP胎盘组织中的M2巨噬细胞的浸润比例显著低于对照组(0.167±0.074与0.462±0.091, P=0.002), 但单核细胞和嗜酸性粒细胞的浸润比例明显高于对照组(0.201±0.004与0.085±0.006, 0.031±0.001与0.001±0.000, P值均<0.05);特征基因与浸润性免疫细胞之间的相关性分析结果显示7个特征基因与免疫细胞之间密切相关(P值均<0.05)。结论通过生物信息学分析及机器学习方法筛选出7个对于EOSP的早期诊断具有重要意义的特征基因, 为后续子痫前期的预防及治疗提供了新的研究靶点和依据。

关键词：早发型子痫前期计算生物学机器学习基因表达细胞微环境巨噬细胞

孕妇及其子代ERAP-1基因多态性与子痫前期发生的相关性

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中华妇产科杂志 2024年第6期59卷 434-439页

作者：马翠刘晓巍郑媛媛张为远首都医科大学附属北京妇产医院北京妇幼保健院产科北京100026

目的:探讨孕妇及其子代内质网氨基肽酶1(ERAP-1)基因多态性与子痫前期(PE)发生的相关性。方法:采用病例对照研究方法,选择2018年10月至2021年10月于首都医科大学附属北京妇产医院住院分娩、发病孕周0.05)。多因素logistic回归分析结果显... 详细信息

目的:探讨孕妇及其子代内质网氨基肽酶1(ERAP-1)基因多态性与子痫前期(PE)发生的相关性。方法:采用病例对照研究方法,选择2018年10月至2021年10月于首都医科大学附属北京妇产医院住院分娩、发病孕周妇51例作为观察对象(PE组),选择同期正常分娩孕妇48例作为对照组。采集孕妇分娩前的静脉血和胎儿娩出后5 min内的脐血,采用二代测序技术检测孕妇及其子代ERAP-1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点。使用单因素分析和多因素logistic回归分析对两组所有检测的SNP位点及基因型进行分析,筛选有意义的SNP位点及基因型。结果:(1)单因素分析筛选出孕妇ERAP-1基因的目的SNP位点共计13个,其中,96096828、96121524、96121715、96122260、96122281位点的基因型分布在PE组与对照组之间的差异均有统计学意义(P均妇发生PE的风险是基因型为TT孕妇的2.002倍(95%CI为0.687~5.831,P=0.020)。(2)单因素分析筛选出子代ERAP-1基因的目的SNP位点共4个,4个位点的基因分布在PE组与对照组之间的差异均无统计学意义(P均>0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,96121406位点基因型为AA的子代发生PE的风险是基因型为GG子代的0.236倍(95%CI为0.055~1.025,P=0.016)。结论:ERAP-1基因在孕妇96121524位点基因型为TC、在子代96121406位点基因型为GG可能是PE发生的影响因素。

关键词：子痫前期氨肽酶类次要组织相容性抗原多态性单核苷酸

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孕早期血压与子代发生先天性心脏病的关联

中华医学杂志 2024年第26期104卷 2431-2437页

作者：张恩婕刘瑞霞岳文涛高屾苏少飞祝惠萍刘建辉谢双华张玥阴赪宏首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院中心实验室北京首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院科技处北京首都医科大学公共卫生学院北京

目的分析孕妇孕早期血压与子代先天性心脏病(CHD)发生风险的关联。方法本研究为前瞻性队列研究, 选择2018年2月至2020年12月在首都医科大学附属北京妇产医院、深圳市妇幼保健院及成都市妇女儿童中心医院参加"中国出生人口队列"研究的孕... 详细信息

目的分析孕妇孕早期血压与子代先天性心脏病(CHD)发生风险的关联。方法本研究为前瞻性队列研究, 选择2018年2月至2020年12月在首都医科大学附属北京妇产医院、深圳市妇幼保健院及成都市妇女儿童中心医院参加"中国出生人口队列"研究的孕妇作为研究对象。采用电子数据采集系统收集基线和随访信息。采用logistic逐步回归模型, 分析孕妇孕早期血压相关指标(收缩压、舒张压、平均动脉压以及脉压)与子代CHD发生风险的关联。采用限制性立方样条曲线, 分析孕妇孕早期血压与子代CHD发生风险的剂量反应关系。结果共纳入研究对象55 552名, 首都医科大学附属北京妇产医院、深圳市妇幼保健院及成都市妇女儿童中心医院分别纳入31 038、15 375及9 139名;所有孕妇年龄为(31.3±4.0)岁, 子代CHD发生率为0.78%(435例)。多因素logistic回归模型分析结果显示, 孕妇孕早期较高的收缩压(OR=1.01, 95%CI:1.00～1.02)、舒张压(OR=1.01, 95%CI:1.00～1.03)、平均动脉压(OR=1.02, 95%CI:1.00～1.03)均与子代发生CHD相关(均P妇孕早期收缩压、舒张压以及平均动脉压均与子代CHD的发生风险存在正向关联。

关键词：血压先天性心脏病孕期队列研究

孕妇围孕期风险因素暴露与子代发生尿道下裂或隐睾的关联

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中华医学杂志 2024年第26期104卷 2424-2430页

作者：谢双华岳文涛张恩婕高屾苏少飞郝永秀张玥刘建辉阴赪宏刘瑞霞首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院中心实验室北京首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院科技处北京首都医科大学公共卫生学院北京

目的探讨孕妇围孕期风险因素暴露与子代尿道下裂或隐睾发生的关联。方法前瞻性选取2018年2月至2020年12月在首都医科大学附属北京妇产医院研究中心参加"中国出生人口队列"研究且分娩男性新生儿的孕妇为研究对象。所有研究对象于孕6～13+... 详细信息

目的探讨孕妇围孕期风险因素暴露与子代尿道下裂或隐睾发生的关联。方法前瞻性选取2018年2月至2020年12月在首都医科大学附属北京妇产医院研究中心参加"中国出生人口队列"研究且分娩男性新生儿的孕妇为研究对象。所有研究对象于孕6～13+6周入组, 采用问卷调查收集围孕期危险因素信息, 通过超声检查和出生时临床查体获取尿道下裂或隐睾结局信息。采用多因素logistic回归模型分析发生尿道下裂或隐睾的相关因素。结果共纳入15 833例孕妇, 年龄为(31.81±3.84)岁, 其子代诊断为尿道下裂或隐睾为113例(尿道下裂42例, 隐睾69例, 尿道下裂及隐睾2例), 发生率为7.14‰。多因素logistic回归分析结果显示, 既往出生缺陷孕育史(OR=3.01, 95%CI:1.09～8.35)、孕前患乙型肝炎(OR=4.74, 95%CI:1.10～20.42)、胎儿生长受限(OR=4.02, 95%CI:2.10～7.68)、孕前开始服用复合维生素(OR=1.98, 95%CI:1.12～3.52)和很少在家烹饪(OR=2.17, 95%CI:1.23～3.82)是子代发生尿道下裂或隐睾的相关因素(均P妇围孕期BMI≥28 kg/m2、患乙型肝炎、既往出生缺陷孕育史、胎儿生长受限、孕前开始服用复合维生素和很少在家烹饪与子代尿道下裂或隐睾发生相关。

关键词：尿道下裂隐睾危险因素队列研究

基于裸鼠模型研究HI-TOPK-032对卵巢癌细胞增殖能力的调控作用

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首都医科大学学报 2024年第4期45卷 609-615页

作者：唐帆邓梦琪苗劲蔚首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院妇瘤科北京100006

目的探讨T-LAK细胞源蛋白激酶/PDZ连接激酶(T-LAK cell-originated protein kinase/PDZ-binding-kinase,TOPK/PBK)在卵巢癌中的表达情况以及TOPK/PBK抑制剂HI-TOPK-032对卵巢癌细胞增殖的影响。方法利用基于基因表达水平值的交互式分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)数据库分析TOPK/PBK在卵巢癌与正常卵巢组织中的表达差异。噻唑蓝法(methyl thiazolyl tetrazolium,MTT)细胞活力和增殖检测实验及平板克隆实验分析HI-TOPK-032对OVCAR3及SKOV3细胞增殖能力的影响,构建卵巢癌裸鼠皮下瘤模型验证HI-TOPK-032对卵巢癌瘤体生长能力的影响。结果与正常卵巢组织相比,卵巢癌中TOPK/PBK的表达显著升高(P瘤实验也表明HI-TOPK-032处理组瘤体质量[(0.670±0.450)g vs(1.514±0.358)g]和体积[(0.418±0.171)cm^(3) vs(0.973±0.262)cm^(3)]均显著小于对照组。结论TOPK/PBK在卵巢癌中高表达,TOPK/PBK抑制剂HI-TOPK-032可抑制卵巢癌细胞增殖。这一发现提示TOPK/PBK可能成为卵巢癌的一个新的治疗靶点。

关键词：卵巢癌 HI-TOPK-032 T-LAK细胞源蛋白激酶/PDZ连接激酶细胞增殖

褪黑素对子宫内膜异位症病灶抑制作用的研究进展

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海军军医大学学报 2024年第9期45卷 1083-1088页

作者：寿鹤君段华首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院妇科微创中心北京100006

子宫内膜异位症是指子宫内膜腺体及间质在宫腔外的部位种植或生长,其病理机制包括免疫炎性改变、氧化应激、上皮-间质转化及新生血管生成等。子宫内膜异位症好发于育龄期女性,严重影响患者的生殖健康和生活质量,目前主要通过手术及长期... 详细信息

子宫内膜异位症是指子宫内膜腺体及间质在宫腔外的部位种植或生长,其病理机制包括免疫炎性改变、氧化应激、上皮-间质转化及新生血管生成等。子宫内膜异位症好发于育龄期女性,严重影响患者的生殖健康和生活质量,目前主要通过手术及长期药物管理进行治疗。褪黑素是一种内源性吲哚胺类激素,通过作用于不同的信号转导通路发挥抗氧化、抗炎、调节免疫功能和促进细胞凋亡等多种生理功能,在癌症、心血管疾病、神经系统疾病等疾病的治疗中备受关注。近年来研究发现褪黑素可通过抑制雌激素合成、拮抗血管生成等作用抑制子宫内膜异位症的发展,并能有效缓解盆腔疼痛。本文就褪黑素在子宫内膜异位症中作用的研究进展进行综述,以期为子宫内膜异位症的药物治疗提供新的思路。

关键词：子宫内膜异位症褪黑素氧化应激血管生成雌激素

北京市青少年生存质量现状与健康认知和健康行为的关系

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中国儿童保健杂志 2024年第6期32卷 687-691,696页

作者：鲍成臻高丽丽韩历丽首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院北京100026

目的了解北京市青少年生存质量现况,探索健康认知、健康行为对生存质量的影响,为提升其生存质量提供依据。方法采用多阶段整群抽样方法,于2020年4—5月在北京市随机抽取10~19岁青少年,采用现况调查法调查其基本情况、生存质量、健康认... 详细信息

目的了解北京市青少年生存质量现况,探索健康认知、健康行为对生存质量的影响,为提升其生存质量提供依据。方法采用多阶段整群抽样方法,于2020年4—5月在北京市随机抽取10~19岁青少年,采用现况调查法调查其基本情况、生存质量、健康认知、健康行为等情况,通过多元线性回归分析探索青少年生存质量的影响因素。结果在6098份有效问卷中,生存质量平均分为88.15±13.26,生理功能、情感功能、社会功能和学校功能4个维度的平均分分别为89.46±13.93、84.49±20.45、91.60±14.87和86.26±15.27,女生各维度平均分低于男生,普高生各维度平均分低于小学、初中和职高生(P北京市青少年生存质量相对较高,并受到多种健康认知、健康行为因素的影响,需要探索适合青少年的干预模式以更进一步提高其生存质量。

关键词：青少年生存质量健康认知健康行为

宫颈癌筛查质量控制技术规范(DB11/T 2137—2023)

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中华肿瘤杂志 2024年第4期46卷 269-273页

作者：首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院韩历丽不详首都医科大学附属北京妇产医院北京妇幼保健院保健部北京100026

一、范围,本文件规定了宫颈癌筛查的基本要求、筛查流程、筛查技术要求和质量控制要求本文件适用于医疗机构开展宫颈癌筛查二、规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件... 详细信息

一、范围,本文件规定了宫颈癌筛查的基本要求、筛查流程、筛查技术要求和质量控制要求本文件适用于医疗机构开展宫颈癌筛查二、规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

关键词：宫颈肿瘤筛查质量控制标准

完全型轮状胎盘的超声特征及其与不良妊娠结局相关性研究

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中国超声医学杂志 2024年第9期40卷 1051-1053页

作者：国家杰王莉马雪松鲁红艳吴青青玄英华赵友萍首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院超声科首都医科大学附属北京妇产医院/北京妇幼保健院产科

目的探讨完全型轮状胎盘产前超声征象、临床特点及对妊娠结局的影响。方法回顾性研究单胎活产的完全型轮状胎盘病例的产前超声表现及临床资料，对比同时期非轮状胎盘的179 213例病例孕妇围产期并发症及胎儿预后等。结果病例组共44例... 详细信息

目的探讨完全型轮状胎盘产前超声征象、临床特点及对妊娠结局的影响。方法回顾性研究单胎活产的完全型轮状胎盘病例的产前超声表现及临床资料，对比同时期非轮状胎盘的179 213例病例孕妇围产期并发症及胎儿预后等。结果病例组共44例，其中小于胎龄儿(SGA)、胎盘早剥及早产发生率均比对照组增高，差异有统计学意义(P<0.05)。22例产前诊断的完全型轮状胎盘病例中，11例胎盘增厚，16例胎盘边缘隆起，5例出现胎盘架；回顾漏诊病例的超声图像，4例胎盘增厚。16例完全型轮状胎盘进行病理检查，其中14例符合母体血管灌注不良的病理改变。结论完全型轮状胎盘增加SGA、胎盘早剥及早产风险，产前超声筛查具有重要意义。

关键词：完全型轮状胎盘胎盘架 SGA 胎盘早剥