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下田菊叶片转录组测序及生物信息学分析

分子植物育种 2024年

作者：夏铭泽唐慧琳张欣伟李彦潍坊医学院药学院潍坊医学院中医学院

为全面挖掘下田菊(Adenostemma lavenia)转录组信息，本研究采用二代高通量测序技术对下田菊叶片开展转录组测序，并进行生物信息学分析。结果表明，下田菊叶片转录组共获得131 591个Transcripts和75 944个Unigene，总长度分别为96 550 ... 详细信息

为全面挖掘下田菊(Adenostemma lavenia)转录组信息，本研究采用二代高通量测序技术对下田菊叶片开展转录组测序，并进行生物信息学分析。结果表明，下田菊叶片转录组共获得131 591个Transcripts和75 944个Unigene，总长度分别为96 550 108 bp和45 780 071 bp。与多个数据库进行比对，发现共75 944个基因获得注释，其中含40 352个(53.13%) NR数据库注释信息；39 171个(51.58%) GO数据库注释信息；23 668个(31.17%) KOG数据库Unigene功能分类信息；4 037个(5.32%) KEGG数据库代谢通路注释信息。对其SSR和SNP进行检测，发现共有4 185个SSR位点，其中优势基元为三核苷酸重复，长度大于20 bp的SSR有1 127条，表明其SSR具有较高的多态性潜能；在SNP中，共有9 278个位点，其中颠换类型明显低于转换类型。本研究可为下田菊EST-SSR分子标记的开发和药用活性成分的生物合成途径提供理论依据，为其植物资源开发与利用提供科学依据。

关键词：下田菊转录组功能基因注释 SSR SNP

基于中药超分子探究甘草配伍石膏与CaSO·2HO的汤剂相态、物质形态和晶型状态差异

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中国中药杂志 2024年

作者：张瑶芝皮雯敏谭心如徐冉王旭许明阳黄雪梅王鹏龙北京中医药大学中药学院&中医学院

以甘草-石膏药对为研究对象，运用中药超分子化学研究矿物药石膏与其主要成分CaSO4·2H2O分别配伍植物药甘草的差异性，以初步探讨临床配伍应用石膏的科学内涵。采用马尔文粒度仪、扫描电子显微镜、电导率仪观察并测定石膏、CaSO4·2H2... 详细信息

以甘草-石膏药对为研究对象，运用中药超分子化学研究矿物药石膏与其主要成分CaSO4·2H2O分别配伍植物药甘草的差异性，以初步探讨临床配伍应用石膏的科学内涵。采用马尔文粒度仪、扫描电子显微镜、电导率仪观察并测定石膏、CaSO4·2H2O及二者分别与甘草共煎后水煎液的微观形貌、粒径、电导率等物理指标；运用电感耦合等离子体发射光谱仪检测甘草-石膏、甘草-CaSO4·2H2O中的无机金属元素，采用等温滴定量热仪量化石膏、CaSO4·2H2O与甘草间的相互作用，利用傅里叶变换红外光谱仪分析甘草-石膏、甘草-CaSO4·2H2O的特征吸收峰变化，结合X-射线衍射仪测定2种配伍组合的晶体结构、物相组成；进一步以甘草酸代替甘草，分别与石膏、CaSO4·2H2O的药材/水煎液冻干粉进行共煎，以XRD结果进行验证分析。结果表明CaSO4·2H2O虽为石膏主要成分，但二者单煎液以及与甘草的共煎液存在明显不同，具体表现在：①CaSO4·2H2O与石膏药材的微观形貌均为无定形纤维状，但二者单煎液的粒径、电导率差异明显；②电镜下，甘草-CaSO4·2H2O的形貌不规则，甘草-石膏的形貌呈均匀纳米级颗粒；③甘草-CaSO4·2H2O、甘草-石膏的粒径、电位、电导率等结果差别较大，且较单煎结果趋势不一致；④甘草-石膏较甘草-CaSO4·2H2O间的分子结合能力、官能团结构变化程度更强；⑤CaSO4·2H2O与石膏单煎液冻干粉的晶型差别明显，且二者与甘草共煎液的冻干粉晶型也明显不同。引起上述差异的原因是石膏具有较CaSO4·2H2O更丰富的微量元素，甘草酸代替甘草分别与石膏和CaSO4·2H2O的共煎物XRD结果进一步证明了石膏中微量元素对中药超分子形成的重要性，该研究初步揭示配伍矿物药石膏与CaSO4·2H2O对汤剂相态、物质形态和晶型状态的影响，为中医临床合理使用石膏提供依据。

关键词：矿物药石膏甘草 CaSO ·2H O 微量元素中药超分子

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“五气经天”天文学内涵新解

中华中医药杂志 2024年第9期39卷 4544-4548页

作者：熊为锋邓嘉帅贺娟北京中医药大学中医学院北京102401 重庆中医药学院中医学院重庆402760

文章尝试从天文学角度探索“五气经天”的客观性。首先通过天文软件Stellarium进行星象模拟,发现每年冬至平旦的五星天象与《黄帝内经》所述来年岁运所应五星颇为吻合,说明冬至平旦是运气理论沿用天文历法进行天象观测的重要时点,认为... 详细信息

文章尝试从天文学角度探索“五气经天”的客观性。首先通过天文软件Stellarium进行星象模拟,发现每年冬至平旦的五星天象与《黄帝内经》所述来年岁运所应五星颇为吻合,说明冬至平旦是运气理论沿用天文历法进行天象观测的重要时点,认为冬至平旦观测到五星在天空中的呈现情况即是“五气经天”的客观天文学依据,从新的角度诠释了“五气经天”的天文学内涵。

关键词：五气经天冬至平旦五星五运天文历法

黄精乌鸡膏营养组分及其对不同免疫状态小鼠肠道黏膜形态和免疫性能的影响

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食品与发酵工业 2024年第13期50卷 55-63,71页

作者：张敏冯景刘喆李玉龙陕西中医药大学基础医学院陕西咸阳712046

为探究黄精乌鸡膏(jellied black-bone chicken with rhizoma polygonati,JBR)营养组分及免疫调控作用,该研究采用代谢组方法检测了JBR营养和功能性物质组成状况,用于探讨其潜在生物学调节作用,进而分析了JBR对不同免疫状态C57BL/6小鼠... 详细信息

为探究黄精乌鸡膏(jellied black-bone chicken with rhizoma polygonati,JBR)营养组分及免疫调控作用,该研究采用代谢组方法检测了JBR营养和功能性物质组成状况,用于探讨其潜在生物学调节作用,进而分析了JBR对不同免疫状态C57BL/6小鼠体重、肠道黏膜形态及免疫性能的影响。结果表明,相比普通乌鸡膏,JBR中多种必须氨基酸和功能性物质含量显著提高,KEGG通路分析显示JBR具有调控营养代谢和免疫性能的潜在作用。动物试验结果显示,JBR可显著改善环磷酰胺处理及脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)攻毒导致的小鼠肠黏膜损伤,因此可对环磷酰胺导致的小鼠体重降低产生显著缓解效应。此外,JBR可抑制环磷酰胺+LPS攻毒导致的脾脏NF-κB高表达,并可降低环磷酰胺+LPS处理导致的脾脏和血清TNF-α高表达,抑制免疫抑制小鼠的急性炎症反应并缓解炎症导致的脾脏组织损伤,脾淋巴细胞增殖活性、外周血半数溶血值和NK细胞活力等免疫指标均显示JBR可显著提高免疫抑制小鼠的免疫功能,并可改善LPS攻毒导致的免疫异常。JBR具有调控营养代谢和免疫性能作用,可显著改善免疫抑制小鼠的小肠黏膜组织形态和免疫性能,有利于免疫抑制小鼠更好的应对LPS诱导的脾脏急性炎症反应,缓解急性炎症导致的脾脏损伤。

关键词：黄精乌鸡膏代谢组 C57BL/6小鼠肠道黏膜形态免疫功能

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益生菌促进伤口愈合的作用机制的研究进展

生物医学工程学杂志 2024年第3期41卷 635-640页

作者：董嘉利王雪静柏歌研王东陕西中医药大学临床医学系陕西咸阳712046 陕西中医药大学医学科研实验中心陕西咸阳712046 西藏民族大学医学院陕西咸阳712082

伤口愈合缓慢是目前临床上较为棘手的问题,国内多采用抗生素和磺胺嘧啶银等较为传统的方法来治疗皮肤伤口,但其不恰当的使用存在诸多弊端,如导致伤口的慢性化和病原体的耐药性等。有研究表明,与机体存在共生关系的微生物可对皮肤伤口产... 详细信息

伤口愈合缓慢是目前临床上较为棘手的问题,国内多采用抗生素和磺胺嘧啶银等较为传统的方法来治疗皮肤伤口,但其不恰当的使用存在诸多弊端,如导致伤口的慢性化和病原体的耐药性等。有研究表明,与机体存在共生关系的微生物可对皮肤伤口产生有益影响,因此如何开发并利用益生菌来促进伤口愈合已然成为了一项新的研究方向。本文根据国内外有关益生菌疗法的相关文献,阐述了益生菌是如何通过局部伤口和肠道来发挥其促愈合作用的,并且还提到了部分相对成熟的益生菌产品和临床试验,旨在为国内进一步开展益生菌疗法及其产品研发提供相关依据。

关键词：益生菌慢性伤口伤口愈合肠道益生菌作用机制

醒脾胶囊调节5-HT-RhoA/ROCK2通路干预脾虚腹泻型肠易激综合征大鼠的机制

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中国实验方剂学杂志 2024年

作者：王港崔伶雯刘相凝朱镕鑫黄明月孙颖焦伯阳王然李春北京中医药大学中医学院中药学院

目的：探讨醒脾胶囊（XPC）在治疗脾虚腹泻型肠易激综合征（IBS-D）中的功效，并阐明其潜在的分子机制。方法：采用番泻叶给药联合约束应激和游泳疲劳连续14 d制备大鼠脾虚IBS-D模型。取10只SPF级健康大鼠作为正常组；将造模成功后的SP... 详细信息

目的：探讨醒脾胶囊（XPC）在治疗脾虚腹泻型肠易激综合征（IBS-D）中的功效，并阐明其潜在的分子机制。方法：采用番泻叶给药联合约束应激和游泳疲劳连续14 d制备大鼠脾虚IBS-D模型。取10只SPF级健康大鼠作为正常组；将造模成功后的SPF级大鼠随机分为模型组、匹维溴铵组(1.5 mg·kg-1)和XPC低、高剂量组(0.135、0.54 g·kg-1)，每组10只。正常组与模型组大鼠灌胃蒸馏水，其余各组灌胃相应药液，每天1次，连续14 d。每日观测大鼠体质量和粪便情况，记录粪便Bristol评分；采用酶联免疫吸附测定法（ELISA）检测血清和结肠组织中5-羟色胺（5-HT）水平；利用透射电子显微镜观察结肠微绒毛和紧密连接等细微结构；通过检测苏木素-伊红（HE）染色法、免疫组织化学法和蛋白免疫印迹法（Western blot）评价结肠屏障完整性、检测肠道运动及相关通路蛋白的表达情况。结果：与正常组比较，模型组大鼠体质量下降和稀便率、稀便级及Bristol评分升高均十分显著（P<0.01），HE染色结果模型组见结肠黏膜层明显充血、水肿，提示其不完整，电镜结果提示结肠屏障结构致密度和完整性下降，微绒毛脱落与消失，紧密连接处发生明显增宽，结肠组织紧密连接蛋白Occludin、Claudin-5表达下调（P<0.01），血清和结肠组织中5-HT含量升高（P<0.01），小肠推进率明显上升（P<0.01），结肠组织收缩蛋白RhoA、ROCK2表达及MLC20的磷酸化程度均上调（P<0.01）。与模型组比较，各治疗组腹泻及其伴随症状和结肠组织的病理表现有不同程度缓解；其中，高剂量的XPC可有效缓解腹泻并促进结肠黏膜结构恢复整齐致密同时有效减轻充血水肿，显著上调Occludin、Claudin-5表达（P<0.01），降低血清和结肠组织中5-HT含量（P<0.01），显著减缓小肠推进率（P<0.01），明显下调结肠组织收缩蛋白RhoA、ROCK2表达及MLC20的磷酸化程度（P<0.01）。结论：XPC可有效缓解脾虚腹泻症状并调节脑肠肽的分泌。其特色主要体现在从肠道黏膜保护与抑制肠道平滑肌收缩2个方面缓解脾虚D-IBS，其机制与调控5-HT-RhoA/ROCK2通路表达密切相关。

关键词：腹泻型肠易激综合征醒脾胶囊 5-羟色胺(5-HT) RhoA/ROCK2途径

小细胞外囊泡在乳腺癌诊断与治疗中的研究进展

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中国生物工程杂志 2024年第4期44卷 54-66页

作者：王尚志章瑾杨明睿闫滨山东中医药大学药学院济南250355 山东中医药大学中医学院济南250355

小细胞外囊泡(small extracellular vesicles,sEVs)是一类具有脂质双层膜结构的细胞外囊泡,能够参与细胞间通讯,是一种良好的药物递送载体。小细胞外囊泡中的微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circR... 详细信息

小细胞外囊泡(small extracellular vesicles,sEVs)是一类具有脂质双层膜结构的细胞外囊泡,能够参与细胞间通讯,是一种良好的药物递送载体。小细胞外囊泡中的微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)、环状RNA(circRNA)和蛋白质等多种成分参与调控肿瘤发生发展的重要机制,能够反映细胞的生理状态与功能状态,且大量存在于患者的血浆、尿液、唾液中,对小细胞外囊泡进行分析和检测可能成为肿瘤诊断的新型手段。除了作为肿瘤诊断的生物标志物,小细胞外囊泡还通过其内容物或作为特异性药物递送载体来调控肿瘤细胞的侵袭转移、机体耐药、细胞因子分泌表达与免疫应答,发挥其抗肿瘤作用。总结近五年来小细胞外囊泡中RNA(miRNA、lncRNA、circRNA)与蛋白质作为乳腺癌诊断的生物标志物以及在乳腺癌治疗中的潜力的相关研究,阐述小细胞外囊泡作为新型诊断与治疗方法的优势与不足,为小细胞外囊泡在乳腺癌诊疗领域的临床应用提供参考。

关键词：小细胞外囊泡外泌体乳腺癌生物标志物递送载体诊疗

大蒜素调节TLR4/MyD88/NF-κB通路改善ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化作用

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中草药 2024年第19期55卷 6636-6644页

作者：徐天舒张芸阳柴王静尹纪元王丽丽刘斌郭淑贞张东伟北京中医药大学中医学院北京中医药大学中药学院

目的基于Toll样受体4（Toll-like receptor 4,TLR4）/髓样分化因子88（myeloid differentiation factor 88,MyD88）/核因子-κB（nuclear factor-κB,NF-κB）通路探讨大蒜素对动脉粥样硬化小鼠的作用及其机制。方法 24只ApoE-/-小鼠随机分为模型组、阿托伐他汀（2.6 mg/kg）组和大蒜素（20 mg/kg）组，每组8只，给予高脂饲料喂养8周。另取8只C57BL/6N野生型小鼠作为对照组，给予普通饲料喂养。给予药物干预9周后，利用油红O染色观察小鼠主动脉斑块面积，苏木素-伊红（hematoxylin-eosin,HE）染色观察小鼠肝脏病理变化；利用生化法检测小鼠血清总胆固醇（total cholesterol,TC）、三酰甘油（triglycerides,TG）、高密度脂蛋白胆固醇（high density lipoprotein cholesterol,HDL-C）、低密度脂蛋白胆固醇（low density lipoprotein cholesterol,LDL-C）水平及天冬氨酸氨基转移酶（aspartate aminotransferase,AST）、丙氨酸氨基转移酶（alanine aminotransferase,ALT）、碱性磷酸酶（alkaline phosphatase,ALP）活性，检测肝脏TC、TG、游离胆固醇（free cholesterol,FC）水平；利用ELISA法检测小鼠血清25-羟基胆固醇（25-hydroxycholesterol,25-HC）、白细胞介素-6（interleukin-6,IL-6）、IL-1β、肿瘤坏死因子-α（tumor necrosis factor-α,TNF-α）水平；利用Western blotting检测肝脏中胆固醇25羟化酶（cholesterol25 hydroxylase,CH25H）、TLR4、NF-κB、磷酸化NF-κB（phosphorylated NF-κB,p-NF-κB）、MyD88、IL-1β蛋白表达。结果大蒜素能显著抑制高脂饮食诱导的ApoE-/-小鼠主动脉斑块形成和肝脏的脂肪变性（P<0.01），降低血清TC、TG、LDL-C、non-HDL-C、25-HC、IL-6、IL-1β、TNF-α水平以及动脉粥样硬化指数（P<0.05、0.01）。此外，大蒜素能降低肝脏TC、TG和FC水平（P<0.01），抑制肝脏中CH25H、TLR4、MyD88、p-NF-κB和IL-1β蛋白表达（P<0.05、0.01）。结论大蒜素通过改善脂质代谢和抑制炎症反应，进而抑制动脉粥样硬化小鼠主动脉的脂质斑块沉积，其作用机制可能与降低肝脏CH25H水平以及抑制TLR4/MyD88/NF-κB通路有关。

关键词：大蒜素动脉粥样硬化炎症反应胆固醇25羟化酶 TLR4/MyD88/NF-κB通路

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基于推理修正的中医舌诊重要性研究思路

北京中医药大学学报 2024年第9期47卷 1223-1228页

作者：窦嘉乐黄慧雯吴彤贾春华北京中医药大学中医学院北京100029 浙江中医药大学基础医学院陕西中医药大学基础医学院

以往中医舌诊研究多聚焦于发展源流、临床应用及其客观化,未能重视“舌诊在中医诊断中为何重要”这一基本问题,忽略了中医诊断过程中医家大脑思维活动的主导地位。因此,应用现代认知神经科学技术,从实证研究视角探讨舌诊信息对中医诊断... 详细信息

以往中医舌诊研究多聚焦于发展源流、临床应用及其客观化,未能重视“舌诊在中医诊断中为何重要”这一基本问题,忽略了中医诊断过程中医家大脑思维活动的主导地位。因此,应用现代认知神经科学技术,从实证研究视角探讨舌诊信息对中医诊断思维的影响,可能为未来舌诊研究开辟一条新的路径。本文提出联合应用眼动追踪和事件相关电位技术,借鉴认知心理学中文本阅读推理修正的实验范式,采集被试在中医病案阅读过程中因舌象信息变化而诱发推理修正产生的眼动及脑电波数据。该方法可以实现同步观测被试阅读过程中的关注区域及脑电波信号,经数据统计分析,为“舌诊在中医诊断中为何重要”提供认知科学证据。该研究思路融合了中医学与认知科学的理论、技术与方法,对中医认知思维研究的发展具有重要意义。

关键词：舌诊推理修正眼动追踪事件相关电位