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结核分枝杆菌潜伏抗原Rv2628的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2024年第6期19卷 685-689,694页

作者：王思萌王文涛王延霞张钧泽姜吉亮付玉荣李猛伊正君山东第二医科大学医学检验学院山东潍坊261053 山东第二医科大学基础医学院

目的运用生物信息学的方法分析结核分枝杆菌潜伏相关蛋白Rv2628的结构与功能。方法自NCBI网站获取Rv2628蛋白的基本信息;利用Protparam、ProtScale预测Rv2628蛋白的理化性质、亲疏水性;应用Signal 6.0 Server、TMHMM Server V.2.0、NLSt... 详细信息

目的运用生物信息学的方法分析结核分枝杆菌潜伏相关蛋白Rv2628的结构与功能。方法自NCBI网站获取Rv2628蛋白的基本信息;利用Protparam、ProtScale预测Rv2628蛋白的理化性质、亲疏水性;应用Signal 6.0 Server、TMHMM Server V.2.0、NLStradamus、PSORTb预测Rv2628蛋白的信号肽、跨膜区域、核定位信号及亚细胞定位;使用NetNGlyc1.0、NetPhos Server v.3.1预测Rv2628蛋白的糖基化位点及磷酸化位点;利用SOPMA分析Rv2628蛋白的二级结构,使用SWISS-MODEL对其进行三级结构同源建模;使用ABCpred、SYFPEITHI预测Rv2628蛋白的相关抗原表位;利用MEGA构建Rv2628蛋白的分子进化树;使用STRING数据库预测与Rv2628蛋白可能发生互作的蛋白;使用autodock实现Rv2628蛋白与化合物的分子对接。结果Rv2628基因全长363 bp,由120个氨基酸构成,分子式为C575H906N178O168S4,等电点(pI)为9.09;Rv2628蛋白亚细胞定位于细胞质,无跨膜结构、信号肽及糖基化位点,存在12个磷酸化位点,包括6个苏氨酸、5个丝氨酸和1个酪氨酸磷酸化位点;该蛋白的二级结构以α-螺旋(41.67%)、无规则卷曲(35.83%)为主;Rv2628蛋白含有10个B细胞、6个Th细胞和6个CTL候选表位,三级结构同源建模的GMQE为0.72;苯基香豆素化合物10可以稳定的与Rv2628蛋白结合并发挥抑制作用;此外,Rv2628蛋白可能与Rv1733c、rip3、hrp1、devR、hspX等蛋白存在相互作用,参与结核分枝杆菌潜伏休眠的过程,诱导Th1免疫反应。结论Rv2628蛋白为亲水性蛋白,存在多个磷酸化位点并能够与多种蛋白相互作用,具有高度免疫原性,包含多个优势B细胞、T细胞抗原表位,可作为结核病诊断的候选蛋白。

关键词：结核分枝杆菌 Rv2628 潜伏性相关抗原生物信息学分析

基于蛋白质组学探讨Ppp3cb和Ppm1g在NHE1基因敲除模型鼠海马组织中的表达

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陆军军医大学学报 2024年第11期46卷 1244-1253页

作者：马鹏飞杨攀郑乾张祥明屠秋霞张春林叶兰冯占辉贵州医科大学临床医学院贵阳550000 贵州医科大学基础医学院:分子医学工程研究中心贵阳550025 贵州医科大学基础医学院生物教研室贵阳550025

目的通过NHE1基因敲除模型鼠的海马组织差异蛋白质组学分析,发现并明确Ppp3cb和Ppm1g的表达特征。方法①选取6只2周龄NHE1基因敲除模型鼠作为模型组,同周龄野生型小鼠6只作为对照组,采用琼脂糖凝胶电泳检测其基因型;应用旷场实验和强迫... 详细信息

目的通过NHE1基因敲除模型鼠的海马组织差异蛋白质组学分析,发现并明确Ppp3cb和Ppm1g的表达特征。方法①选取6只2周龄NHE1基因敲除模型鼠作为模型组,同周龄野生型小鼠6只作为对照组,采用琼脂糖凝胶电泳检测其基因型;应用旷场实验和强迫游泳实验对模型组和对照组小鼠进行行为学评估,并按照Racine评分标准对模型鼠进行癫痫发作分级;②通过串联质谱分析技术对模型组和对照组的海马组织进行差异蛋白筛选,基因本体论(Gene Ontology Analysis,GO)分析差异蛋白并进行注释和富集,蛋白网络数据库(search tool for the retrieval of interesting genes,STRING)分析差异蛋白之间的蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI);③应用qPCR和Western blot检测Ppp3cb和Ppm1g的转录和翻译水平,应用免疫组织化学技术分别观察其在组织中的表达量。结果①模型组小鼠NHE1基因未见表达,旷场实验中模型鼠的运动总距离较对照组减少(P=0.0073),跨越的格子数比对照组显著减少(P<0.0001)。强迫游泳实验结果显示,模型鼠不动的时间明显延长(P<0.0001);②以表达倍数(FC)≥1.2倍且P<0.05为筛选标准,检测到海马组织中845个差异表达的蛋白质点,其中有9个蛋白表达上调,7个蛋白表达下调。其中Ppp3cb下调,Ppm1g上调。GO功能注释结果表明,NHE1敲除后,分子功能(MF)富集在蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性的差异最显著,细胞成分(CC)富集在质膜部分的差异蛋白数量最多,生物过程(BP)富集在负向调节生物过程、免疫系统过程的差异蛋白数量最多。STRING分析显示差异蛋白Ppp3cb和Slc9a1直接作用,Ppm1g通过Ppp3cb和Slc9a1间接作用,Ppp3cb和Ppm1g之间相互作用。③Ppp3cb的转录和翻译水平减少,在组织中的表达量下降,而Ppm1g转录和翻译水平增加,在组织中的表达量上升(P<0.05)。结论本研究确定了NHE1基因敲除小鼠海马组织中差异蛋白Ppp3cb表达下调,而Ppm1g表达上调,为进一步研究Ppp3cb和Ppm1g参与癫痫发病机制提供了依据。

关键词： NHE1基因敲除癫痫海马蛋白质组学 Ppp3cb Ppm1g

蛋白-O-岩藻糖基转移酶1在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

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现代预防医学 2024年第12期51卷 2248-2252+2304页

作者：王晓慧李明泰高绿叶郝艳龙冯雪飞翟元芳郭艳琳山西医科大学基础医学院病理教研室山西医科大学基础医学院解剖教研室

目的探讨非小细胞肺癌中蛋白-O-岩藻糖基转移酶1的表达及其临床意义，为非小细胞肺癌的诊断和治疗提供参考依据。方法通过TCGA、UALCAN数据库和免疫组化技术探讨POFUT1 mRNA和POFUT1蛋白在非小细胞肺癌的表达情况。提取TCGA数据库的... 详细信息

目的探讨非小细胞肺癌中蛋白-O-岩藻糖基转移酶1的表达及其临床意义，为非小细胞肺癌的诊断和治疗提供参考依据。方法通过TCGA、UALCAN数据库和免疫组化技术探讨POFUT1 mRNA和POFUT1蛋白在非小细胞肺癌的表达情况。提取TCGA数据库的临床数据，采用Kaplan-Meier法进行生存分析，采用COX比例风险回归模型分析POFUT1 mRNA表达水平对非小细胞肺癌患者预后的影响。结果 POFUT1 mRNA和POFUT1蛋白在肺腺癌和肺鳞癌组织中均高表达(均P<0.05)。肺腺癌中POFUT1 mRNA的表达水平与临床分期相关(P<0.001),肺鳞癌中POFUT1 mRNA的表达与肿瘤直径相关(P<0.001)。COX回归分析结果显示，POFUT1 mRNA高表达(P=0.012)、肿瘤直径、临床分期、淋巴结转移与肺腺癌患者预后相关(均P<0.001),临床Ⅲ-Ⅳ期是肺腺癌患者独立危险因素。肿瘤直径(P=0.001)、临床Ⅲ-Ⅳ期(P=0.006)和POFUT1 mRNA高表达(P=0.049)与肺鳞癌患者预后相关，肿瘤直径大于5cm和POFUT1高表达是肺鳞癌患者独立危险因素。生存分析结果显示POFUT1高表达的非小细胞肺癌患者生存率显著低于低表达患者。结论 POFUT1在非小细胞肺癌组织中高表达，且其高表达与患者不良预后相关，可作为非小细胞肺癌预后评估的生物标志物。

关键词：非小细胞肺癌 POFUT1 生物信息学免疫组织化学预后

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高校研究生学生干部培养存在问题及对策研究

锦州医科大学学报（社会科学版） 2024年第2期22卷 97-99页

作者：常艺锦锦州医科大学基础医学院辽宁锦州121002

研究生学生干部作为研究生中的一支重要力量,在班级事务管理、良好学风建设以及学生服务活动等方面都发挥着十分重要的作用。高校加强对研究生学生干部的培养,可以增强他们的号召力和胜任力,培养他们的服务意识和服务精神,让他们以饱满... 详细信息

研究生学生干部作为研究生中的一支重要力量,在班级事务管理、良好学风建设以及学生服务活动等方面都发挥着十分重要的作用。高校加强对研究生学生干部的培养,可以增强他们的号召力和胜任力,培养他们的服务意识和服务精神,让他们以饱满的工作热情协助老师开展日常管理工作。因此,高校要积极探索新的工作思路和方法,建立有效的研究生学生干部培养体系。

关键词：高校研究生学生干部培养路径

大蒜素对2型糖尿病大鼠肾脏AGEs/PKC/p66shc通路的影响

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锦州医科大学学报 2024年第4期45卷 26-30页

作者：牛丽伟李铭涵崔明宇锦州医科大学医疗学院锦州医科大学基础医学院辽宁锦州121000

目的以腹腔注射链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)建立2型糖尿病肾病大鼠模型,探究大蒜素对2型糖尿病大鼠肾脏的保护作用及其机制。方法将30只SD雄性大鼠正常对照组(Control)、糖尿病肾病模型组(Model)、低剂量大蒜素保护组(DT10)、中剂... 详细信息

目的以腹腔注射链脲佐菌素(streptozotocin,STZ)建立2型糖尿病肾病大鼠模型,探究大蒜素对2型糖尿病大鼠肾脏的保护作用及其机制。方法将30只SD雄性大鼠正常对照组(Control)、糖尿病肾病模型组(Model)、低剂量大蒜素保护组(DT10)、中剂量大蒜素保护组(DT20)、高剂量大蒜素保护组(DT40)5组,利用试剂盒检测肌酐、微量白蛋白、丙二醛的水平以及超氧化物歧化酶的活性。HE、PAS染色观察大鼠肾脏形态学变化。Western Blot检测相关蛋白的表达。结果与模型组相比,大蒜素保护组的肌酐、微量白蛋白、丙二醛的水平明显下降(P<0.05),超氧化物歧化酶的活性明显升高(P<0.05)。HE、PAS染色结果显示,肾组织显微结构改善、肾间质糖原沉积物减少。Western Blot结果显示,与模型组相比,大蒜素保护组的AGEs、p-PKC、p66shc的水平明显降低(P<0.05)。结论大蒜素对糖尿病大鼠肾脏具有一定的保护作用,这种保护作用的机制可能与其调控AGEs/PKC/p66shc信号通路有关。

关键词：糖尿病肾脏病大蒜素晚期糖基化终产物蛋白激酶C

β-1,3-半乳糖基转移酶2对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制

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中国医科大学学报 2024年第8期53卷 736-740页

作者：马丰源刁赫古岳卢连生范莉婕王鹏锦州医科大学口腔医学院口腔修复科辽宁锦州121000 锦州医科大学第一附属医院放射科辽宁锦州121000 锦州医科大学第一附属医院传染科辽宁锦州121000 锦州医科大学基础医学院神经生物学教研室辽宁省神经退行性疾病重点实验室辽宁锦州121000

目的探讨β-1,3-半乳糖基转移酶2(B3galt2)对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制。方法将成年雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组(Sham组)、大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型组、MCAO模型+慢病毒载体对照... 详细信息

目的探讨β-1,3-半乳糖基转移酶2(B3galt2)对脑缺血损伤模型小鼠脑损伤的作用及其机制。方法将成年雄性C57BL/6J小鼠随机分为假手术组(Sham组)、大脑中动脉栓塞(middle cerebral artery occlusion,MCAO)模型组、MCAO模型+慢病毒载体对照组(LV-GFP组)、MCAO模型+慢病毒载体过表达B3galt2组(LV-B3galt2组),每组6只。各组小鼠于脑缺血24 h后进行神经功能缺损评分和旋转棒实验,采用2,3,5-三氨基苯甲四氮唑染色测定脑梗死体积,采用尼氏染色法观察各组小鼠脑缺血半影区神经元数量,检测各组小鼠脑组织中氧化应激相关因子水平。结果与Sham组比较,MCAO模型组小鼠脑梗死体积增大,神经功能缺损明显(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显减少,活性氧(ROS)和丙二醛(MDA)水平明显升高(均P<0.05),超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽(GSH)水平明显降低(均P<0.05);与MCAO模型组比较,LV-B3galt2组小鼠脑梗死体积减小,神经功能明显改善(P<0.05),脑缺血区神经元数量明显增加,ROS和MDA水平明显降低(均P<0.05),SOD和GSH水平明显升高(均P<0.05)。结论B3galt2过表达可以减轻脑缺血损伤模型小鼠脑损伤,其作用机制可能是通过抑制氧化应激反应实现的。

关键词： β-1,3-半乳糖基转移酶2 脑缺血损伤模型小鼠脑损伤

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医学本科生“学研创用”创新创业能力培养模式研究

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卫生职业教育 2024年第18期42卷 1-4页

作者：田晶单颖刘卓杨宝玲张轶博陶晓莉刘霞锦州医科大学基础医学院辽宁锦州121000

对高校医学本科生“学研创用”创新创业能力培养模式进行探索,建立以“学”为出发点,“研”为提升点,“创”为落脚点,“用”为转化点,将学、研、创、用四者有机融合的新型培养模式。通过激发医学本科生的学习兴趣、组织参加学术活动和... 详细信息

对高校医学本科生“学研创用”创新创业能力培养模式进行探索,建立以“学”为出发点,“研”为提升点,“创”为落脚点,“用”为转化点,将学、研、创、用四者有机融合的新型培养模式。通过激发医学本科生的学习兴趣、组织参加学术活动和科研创新实践、培养科研创新意识等,逐步提升其创新创业能力。

关键词：医学本科生 “学研创用” 创新创业能力培养模式

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利用小鼠结肠类器官预测化疗药物肠道不良反应的研究

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中国肿瘤临床 2024年第9期51卷 447-453页

作者：雷颖徐恩伟白中元康克清白雪亮崔巍山西医科大学基础医学院太原市030001 山西省肿瘤医院病理科山西医科大学第一临床医学院

目的:利用小鼠结肠类器官预测化疗药物肠道不良反应,为部分化疗不耐受的患者寻求更为安全的替代方式,并探究类器官预测肠道不良反应的临床应用潜能。方法:本研究将正常小鼠结肠隐窝细胞进行3D培养;制备结肠组织和类器官石蜡切片,分别进... 详细信息

目的:利用小鼠结肠类器官预测化疗药物肠道不良反应,为部分化疗不耐受的患者寻求更为安全的替代方式,并探究类器官预测肠道不良反应的临床应用潜能。方法:本研究将正常小鼠结肠隐窝细胞进行3D培养;制备结肠组织和类器官石蜡切片,分别进行苏木精-伊红染色和免疫组织化学染色(CDX2、Ki67和CK19);使用5种化疗药物处理结肠类器官,并检测细胞活性以研究药物的肠道不良反应;分析本研究与临床实际用药引起的胃肠不良反应发生率的一致性。结果:结肠类器官与结肠组织在组织学特征上高度一致;正常结肠类器官对于不同化疗药物的耐受性存在差异;IC50表明,卡培他滨对小鼠结肠类器官的杀伤力最小,而脂质体紫杉醇的杀伤力最强;将临床用药浓度纳入考虑标准后发现,白蛋白紫杉醇和脂质体紫杉醇的类器官抑制率存在明显差异;临床试验结果显示,白蛋白紫杉醇、表柔比星、卡培他滨和环磷酰胺Ⅲ/Ⅳ级腹泻发生率与对应类器官抑制率较为一致。结论:结合临床用药剂量,建议优先选择白蛋白紫杉醇,避免使用脂质体紫杉醇,以提高化疗耐受性。本研究表明正常结肠类器官可用于预测多数化疗药物相关严重腹泻的发生。

关键词：类器官结直肠肠道不良反应化疗

着丝粒蛋白H在肾上腺皮质癌的表达及对肾上腺皮质癌细胞活力和迁移的影响

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中国病理生理杂志 2024年第3期40卷 404-410页

作者：邹存茹王丹张玉刘呈悦蒋荷坪何文玺张鑫源苏文霞山东第二医科大学基础医学院山东潍坊261053 山东第二医科大学附属医院病理科山东潍坊261031 山东第二医科大学临床医学院山东潍坊261053

目的:研究着丝粒蛋白H(CENP-H)在肾上腺皮质癌(ACC)的表达,分析其与疾病进展和预后的关系;探索敲减CENP-H表达对ACC细胞活力和迁移的影响。方法:应用GEPIA2数据库分析CENP-H在76例ACC患者和128例健康对照中的mRNA表达,并分析其在不同肿... 详细信息

目的:研究着丝粒蛋白H(CENP-H)在肾上腺皮质癌(ACC)的表达,分析其与疾病进展和预后的关系;探索敲减CENP-H表达对ACC细胞活力和迁移的影响。方法:应用GEPIA2数据库分析CENP-H在76例ACC患者和128例健康对照中的mRNA表达,并分析其在不同肿瘤分期的表达及与预后的相关性;运用UALCAN数据库进一步分析CENP-H在ACC不同肿瘤分期的mRNA表达及与预后的相关性;采用免疫组织化学染色检测CENP-H蛋白在ACC和正常肾上腺石蜡切片的表达。构建敲减CENP-H表达的siRNA(siCENP-H),将人ACC细胞系H295R分为siCENP-H组和siNC组;CCK-8实验检测细胞活力的变化,划痕实验检测细胞迁移能力的变化,Western blot实验检测CENP-H、p-ERK1/2、t-ERK1/2、p-P38、t-P38、p-JNK1/2和t-JNK1/2蛋白水平。结果:CENP-H在ACC中表达较健康对照显著升高,且与肿瘤分期和预后显著相关;CENP-H蛋白在ACC组织中的表达水平显著高于正常肾上腺;敲减CENP-H后,H295R细胞活力和迁移能力较对照组显著降低,p-P38和p-JNK1/2蛋白水平显著降低,以p-JNK1/2的降低尤为显著。结论:CENP-H在ACC中高表达;敲减CENP-H表达能抑制ACC细胞活力和迁移,其机制可能与抑制P38和JNK信号通路的活化有关。

关键词：肾上腺皮质癌着丝粒蛋白H 细胞活力细胞迁移 MAPK信号通路