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转录组和代谢组联合分析桑葚发育过程中可溶性糖和有机酸代谢的变化

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果树学报 2024年第4期41卷 690-702页

作者：张若彤李蒙齐一鸣王晓萍孙志超承德医学院蚕业研究所河北承德067000

【目的】探究桑葚发育过程中可溶性糖和有机酸代谢及转录表达水平,揭示桑葚品质形成的分子机制。【方法】以青果期(W1)、转色期(W2)、成熟期(W3)白色桑葚为试验材料,分别测定3个阶段可溶性糖和有机酸含量及转录组变化,并基于转录组与代... 详细信息

【目的】探究桑葚发育过程中可溶性糖和有机酸代谢及转录表达水平,揭示桑葚品质形成的分子机制。【方法】以青果期(W1)、转色期(W2)、成熟期(W3)白色桑葚为试验材料,分别测定3个阶段可溶性糖和有机酸含量及转录组变化,并基于转录组与代谢组联合分析揭示调控可溶性糖和有机酸代谢的分子机制。【结果】共检测到64种代谢物,其中有机酸52种、可溶性糖12种。分析发现,蔗糖、葡萄糖和D-果糖为桑葚中主要可溶性糖类物质,苹果酸、柠檬酸和琥珀酸为桑葚中主要有机酸类物质。转录组测序共获得58.65 Gb Clean Data,差异基因分析发现W3 vs W1组获得的差异基因数量最多为9098个。而KEGG富集分析表明,W2 vs W1和W3 vs W2组中差异基因富集到与糖酸代谢相关的通路,主要为淀粉和蔗糖代谢及三羧酸循环通路,在W2 vs W1组中有52个上调的差异基因富集到淀粉和蔗糖代谢,27个上调的差异基因富集到柠檬酸循环,在W3 vs W2组中有27个上调的差异基因富集到淀粉和蔗糖代谢。代谢组和转录组关联分析表明,NINV、HK、CS、ACO、MDH和ICDH是桑葚糖酸积累的关键调控基因。荧光定量分析(qRTPCR)表明,关键调控基因在不同发育时期表达上调,与转录组中表达趋势一致。【结论】基因NINV、HK、CS、ACO、MDH和ICDH在桑葚成熟中可溶性糖和有机酸的合成与代谢中具有重要调控作用,初步揭示了桑葚口感变化的生物学基础。

关键词：桑葚代谢组转录组可溶性糖有机酸

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转铁蛋白受体功能性配体在肿瘤靶向药物递送中的应用

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中国现代应用药学 2024年第3期41卷 408-414页

作者：于家乐赵桂琴李松涛承德医学院中药研究所河北承德067000

化疗药物由于对肿瘤缺乏选择性而产生不同程度的不良反应,其临床应用受到了一定的限制。转铁蛋白受体(transferrin receptor,TfR)在多种肿瘤细胞和肿瘤相关血管过表达,而在正常细胞低表达,是肿瘤靶向递药系统的作用靶点之一。以对TfR具... 详细信息

化疗药物由于对肿瘤缺乏选择性而产生不同程度的不良反应,其临床应用受到了一定的限制。转铁蛋白受体(transferrin receptor,TfR)在多种肿瘤细胞和肿瘤相关血管过表达,而在正常细胞低表达,是肿瘤靶向递药系统的作用靶点之一。以对TfR具有特异性高亲和作用的配体修饰药物载体或偶联抗肿瘤药物,有望实现TfR过表达肿瘤的靶向治疗。本文综述了近年来TfR功能性配体在肿瘤靶向药物递送中的应用进展,以期为TfR靶向药物递送系统的研究提供思路。

关键词：转铁蛋白受体功能性配体肿瘤靶向递药

创面修复机制研究领域的热点和演化趋势的可视化分析

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中华烧伤与创面修复杂志 2024年第5期40卷 433-442页

作者：赵久红吕叶辉雷翊涵上海健康医学院创面防治研究所上海201318 上海健康医学院基础医学院上海201318 上海健康医学院药学院上海201318

目的探讨创面修复机制研究领域的热点和演化趋势。方法该研究为文献计量学研究。检索Web of Science数据库核心合集中建库至2023年12月26日发表的符合入选标准的与创面修复机制研究相关的英文文献,统计年度发文量及其引文量并分析变化... 详细信息

目的探讨创面修复机制研究领域的热点和演化趋势。方法该研究为文献计量学研究。检索Web of Science数据库核心合集中建库至2023年12月26日发表的符合入选标准的与创面修复机制研究相关的英文文献,统计年度发文量及其引文量并分析变化趋势。根据前述年度发文量再次检索Web of Science数据库核心合集中该领域发文增长迅速转折年份的前5年至2023年12月31日的相关文献,统计发文总量并计算年度发文增长率,并根据年度发文量趋势线预测2024年该领域发文量。采用CiteSpace 6.2.R4软件对第2次检索文献进行可视化分析,包括来源期刊、引用文献及关键词情况,探讨创面修复机制研究现状和热点的演变过程。结果第1次检索共获取3992篇创面修复机制研究相关文献,其中2015—2023年,年度发文量及其引文量均增加迅速。第2次检索时限设置为2011年1月1日—2023年12月31日,该时段共发文3206篇,平均年度发文增长率为13.30%,根据该阶段的发文趋势线预测2024年该领域发文量可达500篇。第2次检索文献发表在717种期刊上,发文量排前10位的期刊[占总发文量的18.75%(601/3206)]的研究方向主要为创伤、分子、中药药理及干细胞,主要出版国家为英国、美国等,影响因子>5的期刊有7本,属于中国科学院分区Q1区或Q2区的期刊有6本。第2次检索文献的引用文献的关键词共形成906个节点及9大聚类(Q=0.64,S=0.82)。第2次检索文献的引用文献在2006—2015年期间的主要聚类为#2基质金属蛋白酶和#3转化生长因子β1,在2016—2023年期间的主要聚类为#1巨噬细胞极化、#4间充质干细胞、#6抗菌、#7植物提取。其中,2021—2023年期间,第2次检索文献的引用文献的聚类#1巨噬细胞极化、#4间充质干细胞、#6抗菌和#7植物提取的共现关系最为密切。对被引值、中介中心值及Sigma值排前5位的第2次检索文献的引用文献的分析显示,巨噬细胞及炎症调控对创面修复的影响、成纤维细胞对创面修复的影响以及生长因子和细胞因子对创面修复的影响是主要研究方向。第2次检索文献的关键词共形成636个节点,7个聚类:#0抗菌、#1间充质干细胞、#2细胞迁移、#3创面修复、#4外泌体、#5负压伤口治疗及#6糖尿病足溃疡(Q=0.59,S=0.80)。第2次检索文献在2016—2023年主要聚集于聚类#0抗菌、#1间充质干细胞和#4外泌体,在2015年前主要聚集于聚类#2细胞迁移和#3创面修复。第2次检索文献的关键词共形成110个突现关键词(以下简称突现词),突现强度排前10位的突现词依次为小鼠、基因表达、皮肤损伤、上皮细胞、信号通路、生物材料、外泌体、分子对接、水凝胶、巨噬细胞极化,其开始年和结束年的时限均不同。其中2021—2023年的高强度突现词为水凝胶(属于聚类#0抗菌)、外泌体(属于聚类#1间充质干细胞)、分子对接(属于聚类#0抗菌)、巨噬细胞极化(属于聚类#0抗菌)。结论未来,创面修复机制研究的发展仍会处于稳步阶段;该领域研究热点已经从生长因子及创面修复生理过渡到了抗菌及干细胞方向;该领域的未来研究方向可能为利用分子对接技术和网络药理学筛查促创面修复的药物并研究其深层机制、外泌体对巨噬细胞极化的调控以及水凝胶通过抗菌功效促进创面愈合的机制。

关键词：文献计量学时空聚类分析研究热点热点演化未来趋势可视化分析创面修复

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TRPML1激动剂ML-SA5对铀暴露人肾近端小管上皮细胞的促排解毒作用及机制

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中华放射医学与防护杂志 2024年第7期44卷 549-554页

作者：张洪静王睿云王毅斐张旭霞陈红红复旦大学上海医学院放射医学研究所上海200032

目的探究溶酶体Ca^(2+)通道瞬时受体电位粘脂蛋白1(TRPML1)激动剂ML-SA5通过促进溶酶体胞吐促进醋酸铀酰暴露的人肾近端小管上皮HK-2细胞内铀的排出及减轻铀致细胞损伤的作用及机制。方法将HK-2细胞分为空白对照组(Ctrl组)、ML-SA5组(M... 详细信息

目的探究溶酶体Ca^(2+)通道瞬时受体电位粘脂蛋白1(TRPML1)激动剂ML-SA5通过促进溶酶体胞吐促进醋酸铀酰暴露的人肾近端小管上皮HK-2细胞内铀的排出及减轻铀致细胞损伤的作用及机制。方法将HK-2细胞分为空白对照组(Ctrl组)、ML-SA5组(M组)、Vacuolin-1组(V组)、ML-SA5+Vacuolin-1组(M+V组)、单纯铀染毒组(U组)、铀染毒+ML-SA5组(U+M组)、铀染毒+Vacuolin-1组(U+V组)和铀染毒+ML-SA5+Vacuolin-1组(U+M+V组),分别给予0和300μmol/L醋酸铀酰暴露24 h后加入ML-SA5和/或溶酶体胞吐抑制剂Vacuolin-1作用0.5 h。采用免疫荧光法检测溶酶体相关膜蛋白-1(LAMP-1)在细胞质膜的定位情况,ICP-MS检测细胞内铀含量,免疫荧光法检测肾损伤分子1(KIM-1)蛋白表达,Calcein-AM/PI双染色法检测细胞死亡率,免疫荧光法检测转录因子EB(TFEB)的亚细胞定位、LAMP-1及TRPML1蛋白表达,采用溶酶体LysoTracker荧光探针检测溶酶体数量。结果与Ctrl组相比,U组细胞质膜定位的LAMP-1蛋白、细胞KIM-1蛋白表达、细胞死亡率明显增加(t=12.86、18.86、38.53,P所抵消;ML-SA5还可明显提高负载铀HK-2细胞的TFEB核转位(t=9.20,P<0.05)、TFEB下游靶基因LAMP-1及TRPML1蛋白表达(t=3.05、3.17,P<0.05)以及LysoTracker标记的溶酶体数量(t=3.13,P<0.05)。结论TRPML1激动剂ML-SA5通过刺激溶酶体胞吐,促进负载铀的HK-2细胞内铀排出及降低铀致细胞损伤/死亡,与其激活TFEB上调溶酶体生物发生和TRPML1蛋白表达有关。

关键词：铀 TRPML1 ML-SA5 溶酶体胞吐 HK-2细胞

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高温合金熔化焊的研究现状及发展趋势

工程科学学报 2024年第6期46卷 1065-1076页

作者：孙元秦鑫冬王诗洋侯星宇张洪宇谢君于金江中国科学院金属研究所沈阳110016 辽宁大学稀散元素化学研究所沈阳110036

综述了高温合金熔化焊的研究进展.对电弧焊、电子束焊和激光焊等常见高温合金熔化焊工艺技术的优势和应用范围进行了阐述;介绍了常见的焊接裂纹类型,并对凝固裂纹、晶界液化裂纹、应变时效裂纹和失塑裂纹的形成机理及影响因素进行了概... 详细信息

综述了高温合金熔化焊的研究进展.对电弧焊、电子束焊和激光焊等常见高温合金熔化焊工艺技术的优势和应用范围进行了阐述;介绍了常见的焊接裂纹类型,并对凝固裂纹、晶界液化裂纹、应变时效裂纹和失塑裂纹的形成机理及影响因素进行了概括总结;此外,从热输入、材料的成分和微观结构以及焊接残余应力等方面探讨了提高熔化焊焊接性的主要技术方法.由于母材合金成分和组织结构与焊接性能密切相关,在未来的发展中,应加强对新兴高温合金和传统不可焊高温合金等的成分设计,此外,也应关注焊接工艺技术的完善以及焊前和焊后处理方法的改进,协同提高高温合金的焊接性能,促进高温合金熔化焊的广泛应用.

关键词：高温合金熔化焊焊接工艺焊接裂纹焊接性

面向医学大模型的体系化人工智能框架构建与应用

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北京邮电大学学报 2024年第4期47卷 98-104页

作者：罗妍刘宇炀李晓瑛刘辉中国医学科学院北京协和医学院医学信息研究所北京100020

大语言模型具有强大的自我学习和理解能力,在医学领域具有巨大的发展潜力与应用价值。目前医学领域大语言模型的预训练数据量大、算力成本高、缺乏规范化标准与指标体系,极大地限制了大语言模型的扩展与应用。为解决上述问题,提出一种... 详细信息

大语言模型具有强大的自我学习和理解能力,在医学领域具有巨大的发展潜力与应用价值。目前医学领域大语言模型的预训练数据量大、算力成本高、缺乏规范化标准与指标体系,极大地限制了大语言模型的扩展与应用。为解决上述问题,提出一种面向医疗全流程服务场景的体系化人工智能框架,通过知识分解和动态资源管理方法完成模型简化分解和原生网络构建实现模型的弹性部署和灵活配置,在一定程度上降低了大语言模型对算力资源的依赖;引入区块链技术保障医疗数据的安全可信。通过引入体系化人工智能概念构建了面向医学领域的体系化人工智能框架,期望促进医学大语言模型的快速落地与持续健康发展。

关键词：体系化人工智能大语言模型知识分解原生网络

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多来源机构规范文档的融合研究

数据分析与知识发现 2024年第5期8卷 29-37页

作者：范云满陈颖唐小利中国医学科学院医学信息研究所北京100020

【目的】有效利用现有机构规范文档,解决多来源机构规范文档的遴选、评价以及文档间缺少映射、关系冗余等问题。【方法】以调研、梳理已有机构规范文档及相关研究为基础,构建包含元数据收集及分析、元数据框架融合、关系融合、别名融合... 详细信息

【目的】有效利用现有机构规范文档,解决多来源机构规范文档的遴选、评价以及文档间缺少映射、关系冗余等问题。【方法】以调研、梳理已有机构规范文档及相关研究为基础,构建包含元数据收集及分析、元数据框架融合、关系融合、别名融合、构建机构规范文档数据模型、融合结果验证6个步骤的融合模型,对多来源机构规范文档实现融合,并利用Dimensions、Scopus、Web of Science的部分机构数据进行验证。【结果】利用多种指标评估模型的融合效果,在一、二、三级机构中F1值达到0.97以上且Dimensions的融合贡献度最大;构建了包含5128个机构的规范文档。【局限】机构关系只考虑上下级关系,关系之间循环引用以及机构规范名如何选取等问题尚未深入研究;只选取三个来源的部分机构进行验证,在更大数据集上的泛化性能有待进一步验证。【结论】本模型对多来源数据库的机构规范文档的融合是有效的。

关键词：机构规范文档融合元数据框架融合多来源规范文档科研实体规范

W1302对大鼠急性缺血性脑卒中模型脑保护作用研究

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药学学报 2024年第9期59卷 2539-2544页

作者：徐少锋李江蔡杰冯楠张咪王玲王伟平黄海洪王琰王晓良中国医学科学院北京协和医学院药物研究所

硝酸2-（4-甲基噻唑-5-基）乙酯盐酸盐（W1302）是含硝基的氯美噻唑衍生物,它是一种既有一氧化碳（carbon monoxide, NO）供体又具有弱γ-氨基丁酸A型（γ-aminobutyric acid type A, GABAA）受体的变构调节激动作用的新型脑保护剂。当... 详细信息

硝酸2-（4-甲基噻唑-5-基）乙酯盐酸盐（W1302）是含硝基的氯美噻唑衍生物,它是一种既有一氧化碳（carbon monoxide, NO）供体又具有弱γ-氨基丁酸A型（γ-aminobutyric acid type A, GABAA）受体的变构调节激动作用的新型脑保护剂。当前研究采用大脑中动脉缺血再灌注（transient middle cerebral artery occlusion, tMCAO）脑损伤大鼠模型,评价W1302对缺血性脑卒中的治疗作用,并探索其潜在的作用机制。本实验经过中国医学科学院药物研究所实验动物管理和使用委员会的审查批准（伦理审查表号No. 620、632、5013）。研究结果显示:灌胃给予1、3、10 mg·kg-1剂量的W1302,可显著减少缺血2 h再灌24 h大鼠脑梗死体积,且疗效优于200 mg·kg-1丁基苯酞;显著增加血液和脑组织中NO水平,提高再灌后脑血流量和脑内三磷酸腺苷（adenosine triphosphate, ATP）含量;明显抑制脑组织炎症因子包括肿瘤坏死因子α （tumor necrosis factor-α, TNF-α）、白细胞介素-1β （interleukin-1β, IL-1β）的表达;抗脑缺血时间窗可达缺血后120～180 min。这些研究结果证明, W1302可通过增加NO释放,扩张血管、增加脑血流量,改善脑组织能量供应,升高ATP水平,抑制神经炎症,发挥其对tMCAO脑卒中模型大鼠的保护作用,从而为W1302治疗缺血性脑卒中的临床应用提供理论支持。

关键词：脑卒中硝酸2-(4-甲基噻唑-5-基)乙酯盐酸盐一氧化氮供体 GABAA受体激动剂神经炎症

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对映选择性炔丙基胺化及相关串联反应合成α-叔乙炔胺和氮杂环

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有机化学 2024年第5期44卷 1699-1700页

作者：黄柑霖桂敬汉中国科学院上海有机化学研究所上海200032

手性α-叔胺及相关氮杂环广泛存在于药物、生物活性化合物及农用化学品中,作为一类重要的结构单元,它们在有机合成与药物研发中备受关注^([1]).尽管手性α-仲胺的不对称合成已经取得诸多进展,α-叔胺由于较大的空间位阻以及取代基团的... 详细信息

手性α-叔胺及相关氮杂环广泛存在于药物、生物活性化合物及农用化学品中,作为一类重要的结构单元,它们在有机合成与药物研发中备受关注^([1]).尽管手性α-仲胺的不对称合成已经取得诸多进展,α-叔胺由于较大的空间位阻以及取代基团的相似性,目前其对映选择性合成仍然缺乏简便高效的方法.

关键词：不对称合成氮杂环串联反应生物活性化合物农用化学品对映选择性取代基团药物研发