检索结果-南通市图书馆

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

百蕊草苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与表达分析

分子植物育种 2021年

作者：张文香杨再琴潘柔柔罗倩倩吴超曹剑锋贵州师范学院生物科学学院药用植物技术研究所

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase， PAL)是百蕊草(Thesium chinense Tuz.)中黄酮类成分合成调节的关键基因，为了解百蕊草PAL (TcPAL)基因编码蛋白的理化性质和表达模式，以百蕊草茎和叶部位为主要材料，采用逆转录PCR (RT-...

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase， PAL)是百蕊草(Thesium chinense Tuz.)中黄酮类成分合成调节的关键基因，为了解百蕊草PAL (TcPAL)基因编码蛋白的理化性质和表达模式，以百蕊草茎和叶部位为主要材料，采用逆转录PCR (RT-PCR)法扩增其PAL基因，获得该基因的编码序列(CDS)，并进行生物信息学分析；利用荧光定量(qRT-PCR)技术检测PAL基因在不同组织部位的表达模式。结果显示，扩增后的PAL的CDS全长为1 674 bp，编码557个氨基酸，分子量为64.10 kDa，等电点为6.06。其编码蛋白是一类稳定的亲水性蛋白，含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化位点，二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主，具有典型的苯丙氨酸和组氨酸解氨酶保守结构域。空间结构模型显示其为同型四聚体，每个单体由3个结构域组成，其保守结构域含有PAL酶家族的保守序列和 Ala-Ser-Gly三肽活性中心。荧光定量结果显示TcPAL基因在百蕊草叶和茎中表达较高，根中表达较少。本研究为深入研究TcPAL基因参与百蕊草黄酮类物质合成和积累的分子机制提供理论依据。

关键词：

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

锌硒配施对水稻汞的阻隔效应

生物技术通报 2024年第6期40卷 143-151页

作者：黄秋刘静秦樊鑫罗帮林罗林李宛蔚徐安琪贵州师范大学生命科学学院贵阳550025 贵州师范大学西南喀斯特山地生物多样型保护国家林业和草原局重点实验室贵阳550025 贵州师范大学贵州省植物生理与发育重点实验室贵阳550025 西南大学资源环境学院北碚400715

【目的】研究锌硒配施对土壤-水稻体系中水稻富集转运汞的影响,探讨锌硒配施对水稻汞的阻隔效应,为汞污染土壤安全利用提供参考。【方法】选取贵州铜仁碧江区某矿区汞污染土壤,以水稻品种川康优727为研究对象,采用盆栽试验,测定水稻生... 详细信息

【目的】研究锌硒配施对土壤-水稻体系中水稻富集转运汞的影响,探讨锌硒配施对水稻汞的阻隔效应,为汞污染土壤安全利用提供参考。【方法】选取贵州铜仁碧江区某矿区汞污染土壤,以水稻品种川康优727为研究对象,采用盆栽试验,测定水稻生长发育特征以及土壤有效汞和水稻各器官汞含量。【结果】锌硒配施使土壤中有效汞含量显著降低了45%-75.2%,低浓度硒与锌配施使土壤有效汞含量降低75.2%;锌硒配施使水稻各器官汞降低了15.2%-92.3%,其中,籽粒汞含量的降幅效果最好(87.6%-92.3%)。除高浓度硒和高低浓度锌配施促进了水稻汞从根到籽粒转运外,锌硒配施对水稻富集与转运汞的阻隔效果均优于锌、硒单施,锌硒配施使水稻汞从根到籽粒的富集系数降低了88%-92%,低浓度硒与高低浓度锌配施对水稻汞从根到籽粒的转运系数分别降低了69.2%和61.5%。【结论】锌硒配施对水稻汞的阻隔效应显著,有效缓解了汞对水稻生长发育的毒害作用。

关键词：汞锌硒转运系数富集系数

马缨杜鹃MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2018年第22期16卷 7248-7254页

作者：张文香王自布钱长江黄娟贵州师范学院生物科学学院贵阳550018 贵州师范学院药用植物生物技术研究所贵阳550018 贵州师范大学荞麦产业技术研究中心贵阳550001

MYB基因是一类大的转录因子家族,广泛参与植物的各种生命活动,但是杜鹃中关于此类转录因子的研究甚少,为杜鹃的分子育种提供基因资源,本研究在全基因组范围对马缨杜鹃MYB基因进行鉴定与分析。以马缨杜鹃基因组数据为基础,通过本地blast... 详细信息

MYB基因是一类大的转录因子家族,广泛参与植物的各种生命活动,但是杜鹃中关于此类转录因子的研究甚少,为杜鹃的分子育种提供基因资源,本研究在全基因组范围对马缨杜鹃MYB基因进行鉴定与分析。以马缨杜鹃基因组数据为基础,通过本地blast和HMMER search,全面鉴定MYB转录因子,通过MEME、HMMSCAN以及blastn比对,去除不含MYB结构域或者MYB结构域不完整的序列,以及冗余序列,通过Weblogo在线工具对R2和R3的保守基序进行分析,通过MEGA6分析了马缨杜鹃与拟南芥2R-MYB基因的进化关系。得到4条3R-MYB基因、81条2R-MYB基因、85条1R-MYB基因,保守基序分析发现马缨杜鹃MYB基因的R2和R3结构域具有典型的保守色氨酸残基和3个α螺旋结构,进化树分析将马缨杜鹃2R-MYB基因分为了29个亚组,基因复制分析发现有两对基因是复制关系。本研究获得的MYB基因序列和进化树分析,为马缨杜鹃甚至杜鹃属植物的MYB基因的功能研究提供了科学依据。

关键词：马缨杜鹃 MYB 全基因组生物信息学

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

藏药翁布对溃疡性结肠炎的作用机制研究

天然产物研究与开发 2024年第2期36卷 206-217页

作者：李新蕊陈海娟高禹涵徐丽青海师范大学生命科学学院青海省青藏高原药用动植物资源重点实验室高原科学与可持续发展研究院西宁810008

基于网络药理学、分子对接和实验验证,探讨藏药翁布(Myricaria germanica)治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用及机制。采用UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术对翁布原植物化学成分进行快速分析;基于网络药理学预测和筛选翁... 详细信息

基于网络药理学、分子对接和实验验证,探讨藏药翁布(Myricaria germanica)治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用及机制。采用UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS技术对翁布原植物化学成分进行快速分析;基于网络药理学预测和筛选翁布治疗UC的核心成分、靶基因和主要通路,并对核心成分和靶点进行分子对接验证;通过葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium salt,DSS)诱导UC小鼠模型,观察翁布对UC小鼠的治疗作用。筛选出翁布治疗UC活性成分23种,作用于111个共同靶点;PPI网络分析显示AKT1、TNF、CASP3等可能是核心靶点;GO生物过程主要涉及炎症反应、免疫反应等;KEGG信号通路主要涉及MAPK信号通路、TNF信号通路等;分子对接显示核心靶点TNF、CASP3等与核心活性成分结合良好;翁布可以改善DSS诱导的UC小鼠的结肠长度和结肠黏膜损伤,降低结肠和血清中TNF-α和IL-6的含量。翁布通过大黄酸、异鼠李素、鞣花酸、蟛蜞菊内酯和去甲蟛蜞菊内酯等化合物调节TNF-α、PTGS2等靶点发挥治疗UC的作用。

关键词：翁布溃疡性结肠炎 UHPLC-Q-Exactive-Orbitrap-MS 网络药理学分子对接

猕猴桃AcSWEET基因家族的鉴定与表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物科学学报 2024年第5期42卷 612-623页

作者：郑帅韩世明郑浩徐明苑馨予董家琦钟彩虹张琼中国科学院武汉植物园/中国科学院猕猴桃产业技术工程实验室武汉430074 六盘水师范学院生物科学与技术学院贵州六盘水553004 陕西省农村科技开发中心西安710054 中国科学院大学北京100049

SWEET(Sugars will eventually be exported transporters)是近年来在植物中发现的一组糖转运蛋白,在植物生长、发育和非生物及生物胁迫响应等多种生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法对猕猴桃(Actinidia chinensis Pla... 详细信息

SWEET(Sugars will eventually be exported transporters)是近年来在植物中发现的一组糖转运蛋白,在植物生长、发育和非生物及生物胁迫响应等多种生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法对猕猴桃(Actinidia chinensis Planch.)AcSWEET基因家族进行了鉴定,共获得29个AcSWEET基因,并对其氨基酸数量、相对分子量、等电点、不稳定系数、亚细胞定位、亲水指数进行了分析。结果显示:29个基因编码的氨基酸数目为680~906个;分子量范围为7.531~101.266 kDa,等电点在6.95~9.90,多数蛋白为定位于细胞膜的疏水性蛋白,具有1~2个MtN3结构域或PQ-loop结构域。此外,AcSWEET基因的外显子数量在4~6个,系统进化分析结果表明猕猴桃AcSWEET基因家族被分为4个亚族,同一亚族基因具有相似的内含子、外显子以及保守基序。表达模式分析结果表明,这些基因在果实不同发育时期具有表达特异性。推测AcSWEET26、AcSWEET7、AcSWEET15和AcSWEET13可能参与猕猴桃的蔗糖转运和积累。

关键词：猕猴桃 SWEET基因基因家族基因表达分析

维普期刊数据库博看期刊

参薯金属硫蛋白基因DaMT2a的克隆与表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2024年第8期22卷 2456-2463页

作者：黄亚成任东立鲁明秋曾林黄东益刘林娅六盘水师范学院生物科学与技术学院六盘水553000 海南大学热带作物学院海口570100

金属硫蛋白属于一类富含半胱氨酸,能够与重金属离子结合的低分子量蛋白质,在植物抗逆过程中起着重要作用。本研究从参薯中克隆了一个金属硫蛋白基因,命名为DaMT2a (与金属硫蛋白MT2a同源),序列分析显示克隆获得的金属硫蛋白基因的c DNA... 详细信息

金属硫蛋白属于一类富含半胱氨酸,能够与重金属离子结合的低分子量蛋白质,在植物抗逆过程中起着重要作用。本研究从参薯中克隆了一个金属硫蛋白基因,命名为DaMT2a (与金属硫蛋白MT2a同源),序列分析显示克隆获得的金属硫蛋白基因的c DNA长度为540 bp,包含了3个外显子和2个内含子,编码79个氨基酸,具有金属硫蛋白基因家族的保守结构域。进化树分析表明DaMT2a属于金属硫蛋白Type2类成员。利用实时荧光定量PCR技术研究了其在正常组织及胁迫条件下的表达特性。结果表明DaMT2a主要在参薯的茎和雄花中大量表达,机械伤害可显著上调DaMT2a基因表达,高温处理则明显下调DaMT2a基因表达,乙烯利和脱落酸处理上调DaMT2a基因的表达。本研究为参薯抗逆相关金属硫蛋白基因的筛选和功能鉴定提供了参考依据。

关键词：参薯金属硫蛋白基因克隆表达分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

冷水花抗菌活性成分研究

中国药学杂志 2014年第23期49卷 2069-2072页

作者：甘秀海梁志远姜金仲贵州师范学院化学与生命科学学院贵阳550018 贵州师范学院药用植物研究所贵阳550018

目的研究冷水花的抗菌活性成分。方法基于抗菌活性测试,利用硅胶、葡聚糖凝胶LH-20及重结晶等方法分离冷水花提取物的化学成分,并根据理化性质和光谱数据鉴定化合物的结构。结果从冷水花乙醇提取物的乙酸乙酯抗菌活性部位中分离鉴定了9... 详细信息

目的研究冷水花的抗菌活性成分。方法基于抗菌活性测试,利用硅胶、葡聚糖凝胶LH-20及重结晶等方法分离冷水花提取物的化学成分,并根据理化性质和光谱数据鉴定化合物的结构。结果从冷水花乙醇提取物的乙酸乙酯抗菌活性部位中分离鉴定了9个化合物,分别为豆甾-4-烯-3-酮(1),胆甾醇(2),豆甾醇(3),豆甾-7-烯-3β-醇(4),大黄素(5),芹菜素(6),木犀草素(7),木犀草苷(8)和大波斯菊苷(9)。抗菌活性跟踪测试显示化合物8、9对所试菌株的抑制活性均高于阳性对照药剂庆大霉素。结论以上化合物均为首次从该植物中分离得到,其中化合物8、9具有明显的抗菌活性。

关键词：冷水花抗菌活性大波斯菊苷豆甾-4-烯-3-酮豆甾-7-烯-3β-醇

‘红阳’猕猴桃金属硫蛋白基因AcMT2的克隆、表达分析及功能鉴定

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2024年

作者：刘林娅杨那罗宇璇何斌赵艳妹宋姝熠黄亚成猕猴桃资源开发与利用重点实验室六盘水师范学院生物科学与技术学院

本研究以‘红阳’猕猴桃为实验材料，克隆了1个金属硫蛋白基因，命名为AcMT2，并对其进行生物信息学分析和功能鉴定。该基因的cDNA全长362 bp，包含一个237 bp的开放阅读框，编码了78个氨基酸，具有典型的金属硫蛋白保守结构域，属于金... 详细信息

本研究以‘红阳’猕猴桃为实验材料，克隆了1个金属硫蛋白基因，命名为AcMT2，并对其进行生物信息学分析和功能鉴定。该基因的cDNA全长362 bp，包含一个237 bp的开放阅读框，编码了78个氨基酸，具有典型的金属硫蛋白保守结构域，属于金属硫蛋白基因家族Type2类成员。组织表达分析显示，AcMT2在雄花、树皮、根、雌花和果实中表达量较高。丁香假单胞菌侵染一段时间后，AcMT2在树皮中显著下调，在叶片中先稍微下调后显著上调。在果实中，赤霉素和膨大剂(CPPU)显著下调AcMT2的表达水平，脱落酸先下调后上调其表达，乙烯利对其表达水平影响不大。在大肠杆菌中过表达AcMT2，结果表明AcMT2能够提高大肠杆菌对NaCl、CuCl2、ZnCl2和H2O2的耐受性，且对高温胁迫的存活率更高。本研究结果为‘红阳’猕猴桃中金属硫蛋白基因的筛选和功能阐述奠定基础。

关键词： ‘红阳’猕猴桃 AcMT2 基因克隆表达分析功能鉴定

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于单分子实时测序的金花茶全长转录组分析

分子植物育种 2024年第21期 7031-7039页

作者：刘合霞姚金双刘雨谢心怡耿晓姗李博周兴文玉林师范学院生物与制药学院福建工程学院建筑与城乡规划学院

金花茶是中国特有植物，是培养黄色山茶花的珍贵种质资源，具有重要的观赏价值和药用价值。金花茶全长转录组测序数据有助于筛选出调控花色合成的基因，但是金花茶的全长转录组数据仍然缺乏。因此，本研究利用单分子实时测序技术对金花... 详细信息

金花茶是中国特有植物，是培养黄色山茶花的珍贵种质资源，具有重要的观赏价值和药用价值。金花茶全长转录组测序数据有助于筛选出调控花色合成的基因，但是金花茶的全长转录组数据仍然缺乏。因此，本研究利用单分子实时测序技术对金花茶花芽、花蕾以及盛开的花进行混合样品的全长转录组测序。测序结果表明，在28.2 Gb的原始测序数据中，共生成了179 645个全长非嵌合序列(FLNC)，从中获得了45 372个高质量的全长转录本(Isoform)。对获得的全长转录本进行可变剪切分析及长链非编码RNA预测，鉴定出了7 752个可变剪接事件和1 730个长链非编码RNA序列；在基因注释分析中，NR、Swiss-Prot、KOG和KEGG数据库分别注释了43 348、36 909、29 452和42 163条转录本，检测到了1 787个转录因子。GO注释及KEGG代谢通路分析表明，金花茶的花芽、花蕾、开放花朵等组织的基因表达谱主要与次生代谢物质合成、细胞功能以及细胞组分合成有关。本研究提供了大量的全长转录本序列，为今后金花茶的分子生物学和遗传学研究奠定了基础。

关键词：金花茶单分子实时测序可变剪切长非编码RNA