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家养牦牛和野血牦牛空肠、盲肠及粪便微生物组成差异化分析

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中国畜牧杂志 2024年第7期60卷 125-132页

作者：洛桑顿珠张强平措占堆孙光明次旦央吉巴桑旺堆西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850000 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000

为比较藏西北高原野血牦牛和家养牦牛肠道及粪便菌群组成的差异,本试验分别选取体重、体况相近且健康无病的1周岁野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),于2021年10月屠宰取空肠、盲肠内容物和粪便样品,测定微生物多样性指标。结果表明:(1... 详细信息

为比较藏西北高原野血牦牛和家养牦牛肠道及粪便菌群组成的差异,本试验分别选取体重、体况相近且健康无病的1周岁野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),于2021年10月屠宰取空肠、盲肠内容物和粪便样品,测定微生物多样性指标。结果表明:(1)与家养牦牛相比,野血牦牛空肠中,门水平放线菌门(Actinobacteria)相对丰度降低(P牦牛相比,野血牦牛盲肠中,门水平蓝藻门(Cyanobacteria)相对丰度升高(P牦牛相比,野血牦牛粪便中,门水平拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度升高(P牦牛对高海拔寒冷地区的适应能力强于家养牦牛,家养牦牛和野血牦牛肠道和粪便的菌群组成存在差异。

关键词：野血牦牛家养牦牛肠道粪便微生物多样性

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牦牛源A型产气荚膜梭菌的分离鉴定及生物学特性研究

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中国畜牧兽医 2024年第1期51卷 229-241页

作者：王冬经吴金措姆曾江勇西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850009 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850009

【目的】2023年4月至2023年5月,西藏拉萨市多地出现牦牛严重腹泻、便血甚至死亡的现象。试验旨在确定牦牛腹泻的病原菌并研究其生物学特性,以期为该地区牦牛腹泻病的防治提供参考。【方法】采集新鲜牦牛腹泻粪便样品进行厌氧培养,通过... 详细信息

【目的】2023年4月至2023年5月,西藏拉萨市多地出现牦牛严重腹泻、便血甚至死亡的现象。试验旨在确定牦牛腹泻的病原菌并研究其生物学特性,以期为该地区牦牛腹泻病的防治提供参考。【方法】采集新鲜牦牛腹泻粪便样品进行厌氧培养,通过培养特性及染色镜检进行初步鉴定;对可疑阳性菌株进行生化特性、多重PCR毒素基因分型及cpe、netB、cpb2毒素鉴定,并进行cpa、cpb2、16S rRNA基因的遗传进化分析、部分分离株生长曲线测定及动物致病性试验;采用K-B法测定分离株的体外药物敏感性,统计不同分离株的多重耐药结果。【结果】从样品中分离纯化得到8株分离菌,在厌氧培养基中生长旺盛,在TSC培养基、5%脱纤维绵羊血平板、卵黄琼脂培养基上均呈现与产气荚膜梭菌相似的典型菌落,革兰染色为紫色大杆菌,初步判定为产气荚膜梭菌,命名为XZ-1~XZ-8。分离株生化检测结果与产气荚膜梭菌相符;分离株均携带cpa和cpb2基因,为A型产气荚膜梭菌;16S rRNA基因分析结果显示,8株分离株与产气荚膜梭菌参考株的相似性为97.3%~100%,在系统进化树中处于同一分支,而与屎肠球菌、大肠杆菌参考株处于不同分支;分离株cpa和cpb2基因存在一定的变异性。生长曲线显示,3株分离株(XZ-1、XZ-4、XZ-7)生长规律基本一致,其中0~4 h为迟缓期,4~8 h为对数期,8~22 h为稳定期,22 h后开始进入衰亡期。动物致病性试验结果显示,分离株对昆明小鼠具有较强的致病性。分离株对苯唑西林、红霉素、氯霉素、氧氟沙星、米诺环素、头孢哌酮、利福平及罗红霉素敏感,对青霉素、哌拉西林、羧苄西林、麦迪霉素、头孢曲松等22种药物均存在不同程度的耐药性,存在多重耐药性,其中XZ-7株耐药数量多达11种,6重以上耐药的菌株占75.0%。【结论】本研究成功从拉萨严重腹泻、血便牦牛粪样中分离出8株A型产气荚膜梭菌,分离株对小鼠具有较强的致病性,对青霉素、哌拉西林、羧苄西林等药物存在不同程度的耐药性。研究结果为该地区牦牛腹泻病防控提供了参考依据。

关键词：牦牛产气荚膜梭菌分离鉴定生长曲线动物致病性耐药性

接种乳酸菌对全株玉米青贮饲料有氧稳定性和霉菌毒素含量的影响

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动物营养学报 2024年

作者：梁宇成王文博原现军蔡欣宇齐博康鲍宇红西藏自治区农牧科学院草业科学研究所南京农业大学草业学院饲草调制与加工贮藏研究所省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

本试验以前期筛选获得的具有潜在抑菌和脱毒活性的副干酪乳杆菌LS2（Lactobacillus paracasei LS2）、植物乳杆菌S6-2（Lactiplantibacillus plantarum S6-2）和干酪乳杆菌GD2-1（Lactobacillus casei GD2-1）3株乳酸菌为研究对象,探讨其对全株玉米青贮饲料有氧稳定性和霉菌毒素的影响。试验将田间遭受霉菌侵染（FI组）和霉菌未侵染（NFI组）全株玉米分别进行以下接种剂处理:1)未接种乳酸菌对照（CON处理）;2)接种副干酪乳杆菌LS2（LS2处理）;3)接种植物乳杆菌S6-2（S6-2处理）;4)接种干酪乳杆菌GD2-1（GD2-1处理）。青贮180 d后开窖,将各组青贮饲料暴露于空气中4 d,期间动态取样分析全株玉米青贮饲料的发酵参数、化学组分、微生物数量和霉菌毒素含量。结果表明:1)无论是否遭受霉菌侵染,LS2处理有氧暴露4 d后全株玉米青贮饲料pH最低;NFI组中LS2处理乳酸和乙酸含量最高。2)NFI组S6-2和GD2-1处理酵母菌和霉菌数量在有氧暴露第2天时快速上升,之后GD2-1处理保持稳定,而S6-2处理略有下降;FI组各处理酵母菌和霉菌数量在有氧暴露期间整体呈现上升趋势。3)田间霉菌侵染显著提高了全株玉米青贮饲料黄曲霉毒素B1（AFB1）含量（P<0.05）,各乳酸菌接种剂处理显著降低了AFB1含量（P<0.05）,GD2-1处理降低了玉米赤霉烯酮含量（P<0.05）,而GD2-1处理显著降低了呕吐毒素含量（P<0.05）。4)无论是否遭受霉菌侵染,LS2处理均维持了最长的有氧稳定时间,有氧稳定性显著高于其他处理（P<0.05）。综上所述,青贮饲料有氧暴露后,田间霉菌侵染使全株玉米青贮饲料品质进一步下降并导致有氧腐败提前;无论是否遭受霉菌侵染,接种副干酪乳杆菌LS2的全株玉米青贮饲料在有氧暴露期间始终保持着较高的乳酸和乙酸含量,并维持了最高的有氧稳定性。

关键词：全株玉米青贮乳酸菌有氧稳定性霉菌毒素

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硒对六个青稞品种种子萌发及吸收转运的影响

核农学报 2024年第7期38卷 1385-1397页

作者：高雪李安庆冉黄丹妮卓玛孙媛媛西藏自治区农牧科学院农业资源与环境研究所/省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850002 贵州师范大学生命科学学院/贵州省植物生理与发育调控重点实验室贵州贵阳550001

为探明不同价态硒对青稞(Hordeum vulgare *** Hook.f.)种子萌发、生长及其吸收转运硒的影响,本研究以6个青稞品种为研究对象,通过种子萌发试验,研究不同价态(Se^(6+)和Se^(4+))和不同浓度水平(0~5.0 mg·L^(-1)和0~40 mg·L^(-1))对青... 详细信息

为探明不同价态硒对青稞(Hordeum vulgare *** Hook.f.)种子萌发、生长及其吸收转运硒的影响,本研究以6个青稞品种为研究对象,通过种子萌发试验,研究不同价态(Se^(6+)和Se^(4+))和不同浓度水平(0~5.0 mg·L^(-1)和0~40 mg·L^(-1))对青稞种子萌发指标的影响;利用加权隶属函数法对不同价态和不同浓度硒水平下青稞种子的萌发能力进行综合评价;通过水培试验研究青稞对硒的吸收转运。结果表明,随着硒浓度的升高,6个青稞品种种子的发芽势、发芽率、发芽指数和活力指数呈先增加后减小趋势。加权隶属函数值(D值)结果表明,Se^(6+)和Se^(4+)浓度在0~1.0 mg·L^(-1)范围内可促进青稞种子萌发。与Se^(6+)对青稞种子生长的影响不同,当Se^(4+)浓度大于1.0 mg·L^(-1)时,Se^(4+)对胚芽和胚根的抑制作用更为明显。Se^(6+)处理青稞地上部分硒含量高于Se^(4+)处理,6个青稞品种对Se^(6+)的吸收量约为对Se^(4+)吸收量的1.39~4.21倍,以山青9号地上部分硒吸收量最高。6个青稞品种对Se^(6+)的转运系数在0.671~3.342之间;除藏青3000对Se^(6+)的转运系数小于1外,其他5个青稞品种对Se^(6+)的转运系数在1.503~3.342之间,均大于1,而对Se^(4+)的转运系数在0.192~0.319之间,均小于1。本研究结果可为西藏青稞硒生物强化提供理论依据。

关键词：青稞硒价态种子萌发吸收转运

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牦牛不同发育时期卵巢全基因组甲基化谱分析

南京农业大学学报 2024年

作者：张楠黄慈王会王嘉博柴志欣岳炳霖蔡欣钟金城姜辉信金伟王吉坤西南民族大学青藏高原研究院青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室四川省重点实验室西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室

[目的]雌牦牛性成熟晚是影响牦牛繁殖率的重要原因之一，通过分析不同发育时期牦牛卵巢的全基因组DNA甲基化差异，筛选出调控卵巢卵泡发育的差异甲基化基因，为研究表观遗传在牦牛卵巢组织生长发育过程中的作用提供数据基础。[方法]分... 详细信息

[目的]雌牦牛性成熟晚是影响牦牛繁殖率的重要原因之一，通过分析不同发育时期牦牛卵巢的全基因组DNA甲基化差异，筛选出调控卵巢卵泡发育的差异甲基化基因，为研究表观遗传在牦牛卵巢组织生长发育过程中的作用提供数据基础。[方法]分别选取0.5岁幼年、2.5岁初情期和4.5岁性成熟的牦牛各3头，采用全基因组重亚硫酸盐测序法，检测分析不同发育时期牦牛卵巢组织的全基因组DNA甲基化谱。[结果]牦牛卵巢组织中，甲基化位点以CpG序列类型为主，其甲基化水平明显高于CHG和CHH类型。CpG序列在CDS区、内含子和3′UTR的甲基化水平高于基因下游2kb、基因上游2kb和5′UTR。对比三个年龄组的甲基化位点，并统计出三种类型的差异甲基化区域数量共计4 233（0.5 vs 2.5）、7 302（2.5 vs 4.5）和1 133（0.5 vs 4.5）个，其中CpG序列的差异甲基化区域分别对应334（0.5 vs 2.5）、640（2.5 vs 4.5）和371（0.5 vs 4.5）个差异甲基化基因。经过重亚硫酸盐测序法对测序结果的进一步验证，结果与全基因组重亚硫酸盐测序数据变化趋势一致。对CpG序列的差异甲基化基因进行GO和KEGG富集分析，结果显示有显著富集到包括卵母细胞减数分裂、剪接体通路、Hippo信号通路、催产素信号通路、GnRH信号通路、Wnt信号通路、钙信号通路和Rap1信号通路等与卵巢卵泡发育相关的通路（P牦牛卵巢卵泡发育相关的基因作为候选基因（P牦牛卵巢全基因组甲基化谱，筛选出调控卵巢卵泡发育的候选基因，为进一步研究DNA甲基化对牦牛卵巢生长发育的调控机制提供基础。

关键词：牦牛卵巢 DNA甲基化全基因组重亚硫酸盐测序繁殖性状

牦牛源表皮葡萄球菌的分离鉴定和生物学特性研究

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中国兽医杂志 2024年第8期60卷 69-73页

作者：邹明昊马弘财王冰艺樊世杰吴庆侠曾江勇西藏农牧学院动物科学学院西藏林芝860000 西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850009 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850009

为了解西藏拉萨地区牦牛源表皮葡萄球菌的携带情况,本试验随机采集了26份拉萨地区牦牛鼻拭子样品,采用细菌分离纯化和形态学鉴定、生化鉴定以及16S rDNA测序和同源性比对分析对分离菌株进行鉴定;选取19种常用抗生素,利用K-B药敏纸片扩... 详细信息

为了解西藏拉萨地区牦牛源表皮葡萄球菌的携带情况,本试验随机采集了26份拉萨地区牦牛鼻拭子样品,采用细菌分离纯化和形态学鉴定、生化鉴定以及16S rDNA测序和同源性比对分析对分离菌株进行鉴定;选取19种常用抗生素,利用K-B药敏纸片扩散法对分离菌株进行药敏试验;检测四环素类耐药基因tet(M)和tet(K),林可胺类、氯霉素类、截短侧耳素类、恶唑烷酮类、链阳霉素A类多药耐药基因cfr,β-内酰胺类耐药基因mecA和酰胺醇类耐药基因fexA五种耐药基因,研究分离菌株的耐药性;进行攻毒试验,检测分离菌株的致病性。结果显示,分离得到1株表皮葡萄球菌,命名为LZ-1;LZ-1对氨苄西林、青霉素和红霉素耐药,对多黏菌素B、头孢他啶和克林霉素中介,对头孢曲松、四环素和新霉素等13种抗生素敏感;共检测出tet(M)、tet(K)和mecA三种耐药基因;该菌株对小鼠致病性不强。结果表明,本试验分离出1株牦牛源表皮葡萄球菌,有一定的耐药性,可为其防治提供一定的参考。

关键词：表皮葡萄球菌致病性耐药性

野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性的比较分析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第10期 102-109,116页

作者：洛桑顿珠平措占堆张强孙光明索朗多吉巴多巴桑旺堆西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所拉萨850004 省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室拉萨850000 阿里地区改则县农业农村局西藏改则县859200

为了比较野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物组成的差异,试验选取年龄、体重相近且健康的野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),分别为野血牦牛组和家养牦牛组,两组屠宰后采集瘤胃液,测定瘤胃发酵参数(氨态氮、尿素氮、总氮、微生... 详细信息

为了比较野血牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物组成的差异,试验选取年龄、体重相近且健康的野血牦牛和家养牦牛各10头(公母各半),分别为野血牦牛组和家养牦牛组,两组屠宰后采集瘤胃液,测定瘤胃发酵参数(氨态氮、尿素氮、总氮、微生物蛋白和挥发性脂肪酸),并基于细菌16S rDNA基因序列比较分析两组瘤胃微生物组成的差异。结果表明:野血牦牛组瘤胃液中总氮含量、微生物蛋白质量浓度极显著高于家养牦牛组(P牦牛组差异不显著(P>0.05);总挥发性脂肪酸浓度和正丁酸摩尔百分比极显著低于家养牦牛组(P牦牛组(P牦牛组(P牦牛组(P牦牛组差异不显著(P>0.05)。两组瘤胃共有1 963个核心操作性分类单元(operational taxonomic units,OTUs),野血牦牛组和家养牦牛组特有的OTUs分别为18 542个和16 514个。在门水平上,两组的优势菌门均为拟杆菌门(Bacteroidete)和厚壁菌门(Firmicutes),二者占微生物总数的98%以上。在属水平上,野血牦牛组瘤胃中的优势菌属(相对丰度>2%)包括普氏菌属1(Prevotella_1)、细菌F082(Bacterium F082)、理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae_R-7_group)、拟杆菌目BS11肠道群(Bacteroidales_BS11_gut_group)和瘤胃球菌科NK4A214群(Ruminococcaceae_NK4A214_group),相对丰度分别为24.50%、14.68%、12.88%、6.50%、2.77%和2.70%;家养牦牛组瘤胃中的优势菌属分别为理研菌科RC9肠道群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、克里斯滕森菌科R-7群(Christensenellaceae_R-7_group)、瘤胃球菌科NK4A214(Ruminococcaceae_NK4A214_group)、琥珀酸菌(Succiniclasticum)、细菌F082(Bacterium F082)和拟杆菌目RF16群(Bacteroidales_RF16_group),相对丰度分别为22.69%、13.87%、10.46%、6.93%、4.07%和3.96%。在门水平上,野血牦牛组瘤胃中拟杆菌门(Bacteroidete)相对丰度显著高于家养牦牛组(P牦牛组(P牦牛组瘤胃中普氏菌属1(Prevotella_1)相对丰度极显著高于家养牦牛组(P牦牛组(P牦牛组(P牦牛组(P牦牛和家养牦牛瘤胃发酵参数及微生物多样性存在明显差异;野血牦牛瘤胃中拟杆菌门相对丰度更高,对非纤维植物多糖和蛋白质的消化能力更强;而家养牦牛瘤胃厚壁菌门相对丰度更高,对纤维类物质的消化能力更强。

关键词：牦牛野血牦牛家养牦牛瘤胃发酵参数微生物多样性

不同被毛颜色成年斯布牦牛生长性能比较及分子育种潜力分析

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中国饲料 2024年第5期 32-38页

作者：朱勇阮鹏程俄广鑫信金伟张强陈晓英曹涵文姜辉鲜莉莉陆东祥张成福省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850002 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850009 西南大学动物科学技术学院重庆400716

斯布牦牛作为我国青藏高原重要牦牛资源,其种质资源特性挖掘与遗传改良提升对西藏牦牛产业提质增效具有重要意义。本研究旨在通过挖掘不同被毛颜色斯布牦牛类群成年阶段生长性能特点,明确重要经济性状相关联候选标记的优势基因型分布,... 详细信息

斯布牦牛作为我国青藏高原重要牦牛资源,其种质资源特性挖掘与遗传改良提升对西藏牦牛产业提质增效具有重要意义。本研究旨在通过挖掘不同被毛颜色斯布牦牛类群成年阶段生长性能特点,明确重要经济性状相关联候选标记的优势基因型分布,评估斯布牦牛分子育种潜力。结果显示:5~7岁龄黑色斯布牦牛的管围及体高指标均极显著(P 0.05)。然而,棕色牦牛各年段的成年体重均值略优于黑色群体。另外,5个分布于ACSL1、MyoD1及TMEM18基因的已知与牦牛生长和泌乳等经济性状相关的标记在两个斯布牦牛类群中均存在较高比例的优势基因型,特别是TMEM18_C4447T和MyoD1_C1710T位点。两个斯布牦牛群体内各位点均未显著偏离哈代温伯格平衡(P> 0.05),表明斯布牦牛群体在历史上尚未经历强烈的关于经济性状的人工选择。本研究明确了不同被毛颜色斯布牦牛成年生长特性,解析了一系列经济性状相关遗传标记在斯布牦牛种群内的育种潜力,为探索斯布牦牛适时出栏技术及提升斯布牦牛选育进程提供了理论参考。

关键词：斯布牦牛被毛颜色生长性能遗传标记优势基因型

斯布牦牛线粒体D_Loop区域遗传多样性研究

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中国饲料 2024年第11期 27-32页

作者：朱勇俄广鑫信金伟陈晓英张强曹涵文姜辉陆东祥张成福省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室西藏拉萨850000 农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所西藏拉萨850000 西南大学动物科学技术学院重庆400416

作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值。本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性。结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loo... 详细信息

作为我国西藏重要的牦牛国家遗传资源代表性品种,斯布牦牛对藏区畜牧业经济发展具有不可替代价值。本研究旨在利用线粒体D_Loop区域遗传变异评估不同被毛颜色的斯布牦牛类群遗传多样性。结果显示:在全部152个个体内的768 bp长度的D_Loop区域中,共发现57个多态位点,构建获得51个D_Loop单倍型,单倍型多样性(Hd)分布为0.893(黑色)~0.944(棕色),全部单倍型归属于两大系统发育分支,有12个D_Loop单倍型为两群体间共享单倍型。两群体Tajima'D和Fu's D参数均为不显著(P>0.05)且群体间遗传分歧不显著(F_(ST)=0.00409,P>0.05)。总体而言,斯布牦牛群体母系遗传多样性丰富,种群近期历史上未出现群体扩张,不同被毛颜色斯布牦牛遗传背景无显著差异。该研究对进一步明确斯布牦牛种群关系及群体遗传多样性保护提供数据支撑。

关键词：斯布牦牛线粒体DNA 遗传多样性系统发育