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基于Nanopore测序技术的非洲猪瘟病毒全基因组测序方法建立

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畜牧兽医学报 2024年第5期55卷 2080-2089页

作者：周扬吴炜姿曹伟胜王福广许秀琼钟文霞吴立炀叶健卢受昇广东省动物疫病预防控制中心广州510230 华南农业大学兽医学院广州510642

非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)引起的一种高度传染性和致死性疫病,近年来给我国生猪产业的健康发展造成了沉重打击。ASFV庞大的基因组导致人们难以及时掌握流行毒株的全基因组序列。本研究旨在利用Nanopore三代测序技术建立一种... 详细信息

非洲猪瘟(ASF)是由非洲猪瘟病毒(ASFV)引起的一种高度传染性和致死性疫病,近年来给我国生猪产业的健康发展造成了沉重打击。ASFV庞大的基因组导致人们难以及时掌握流行毒株的全基因组序列。本研究旨在利用Nanopore三代测序技术建立一种简便可靠的ASFV全基因组测序方法。设计覆盖ASFV全基因组的31对引物并分为4个引物池对样本进行扩增,通过Nanopore测序技术对扩增产物进行测序,进一步优化相关生物信息学分析方法,最终成功建立了ASFV全基因组测序方法。应用该方法成功从某环境拭子样本中获取一株全长为189 416 bp的ASFV全基因组测序。经一代测序验证表明,在B646L、EP402R、E183L、MGF_360-12L、MGF_505-3R和I177L等关键基因及部分变异位点上,本方法结果与一代测序结果一致性100%;在全基因组水平上,本方法结果与二代测序结果一致性为99.94%。此外,在这项研究中,采用Nanopore测序技术发现了NP1450L基因与NP419L基因间区存在56 bp的重复序列插入(通过一代测序技术进行了验证),但是二代测序未能发现这一显著的变异特征。本研究成功建立了基于Nanopore技术的ASFV全基因组测序方法,该方法具有良好的简便性和可靠性,为当前ASF的防控和分子流行病学研究提供了一个重要手段。

关键词： Nanopore测序非洲猪瘟病毒生物信息学分析

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钦州市钦南区动物疫病预防控制中心兽医实验室通过考核验收

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广西畜牧兽医 2012年第3期28卷 192-192页

作者：陈永莲钦州市钦南区动物疫病预防控制中心 535000

近日,经广西壮族自治区动物疫病预防控制中心专家组考核,钦州市钦南区动物疫病预防控制中心兽医实验室顺利通过考核验收。

关键词：动物疫病预防兽医实验室控制中心钦南区钦州市核验广西壮族自治区专家组

广东省东莞市生猪及其产品质量安全信息化监管模式

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中国动物检疫 2024年第9期41卷 45-49页

作者：杨振波潘杰李小军林其明赖笑娴刘烺钟亮宁东莞市动物疫病预防控制中心

为解决猪肉产品消费环节与生猪养殖环节信息脱钩的问题,东莞市以数字喷码技术为基础,探索建立了生猪及其产品质量安全信息化监管模式,打通了从生猪养殖到猪肉产品消费各环节的信息关联,实现了生猪屠宰及肉产品质量安全可追溯和全产业链... 详细信息

为解决猪肉产品消费环节与生猪养殖环节信息脱钩的问题,东莞市以数字喷码技术为基础,探索建立了生猪及其产品质量安全信息化监管模式,打通了从生猪养殖到猪肉产品消费各环节的信息关联,实现了生猪屠宰及肉产品质量安全可追溯和全产业链智慧监管。经东莞市2个生猪屠宰场及4个农贸市场试点证实,该模式可行有效,既节省了屠宰加工企业经营成本,又提高了肉产品价值,同时也提高了监管机构监管效率,使动物检疫行为更加规范,动物疫病防控能力得到增强,保障了东莞市猪肉肉产品质量卫生安全。东莞市的全过程信息化监管模式为其他地区的生猪产品信息化监管提供了借鉴。

关键词：畜禽产品质量安全智慧监管数字喷码技术信息化

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犊牛腹泻的治疗与预防措施

河南畜牧兽医 2024年第14期45卷 25-26页

作者：崔小君温书香河南省动物疫病预防控制中心河南郑州450008 漯河市动物疫病预防控制中心

犊牛腹泻是目前牛场多发疾病之一,具有发病率高和死亡率高的特点,给养牛生产带来严重危害,影响牛场经济效益。犊牛腹泻的病因复杂多样,主要包括病原微生物感染、饲喂不当、环境管理不善和应激等因素。为有效治疗和预防犊牛腹泻,该文全... 详细信息

犊牛腹泻是目前牛场多发疾病之一,具有发病率高和死亡率高的特点,给养牛生产带来严重危害,影响牛场经济效益。犊牛腹泻的病因复杂多样,主要包括病原微生物感染、饲喂不当、环境管理不善和应激等因素。为有效治疗和预防犊牛腹泻,该文全面介绍了病因,给出有针对性的治疗和预防措施,以期为犊牛腹泻的防治提供参考。

关键词：犊牛腹泻病因治疗预防

1株高致病性基因2型猪流行性腹泻病毒毒株的分离鉴定

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畜牧与兽医 2024年第10期56卷 94-100页

作者：罗毅徐发荣徐莹张乐乐王郁捷尹灵丹刘平黄中国农业大学动物医学院北京100193 北京市动物疫病预防控制中心北京102600

为了研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行毒株的生物学特性,采集仔猪临床腹泻病料进行病毒分离,结果显示,接种病料的Vero细胞连续盲传3代后可观察到明显的细胞病变,通过间接免疫荧光试验确定导致细胞病变的病毒为PEDV,毒株命名为JMS。通过RT... 详细信息

为了研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行毒株的生物学特性,采集仔猪临床腹泻病料进行病毒分离,结果显示,接种病料的Vero细胞连续盲传3代后可观察到明显的细胞病变,通过间接免疫荧光试验确定导致细胞病变的病毒为PEDV,毒株命名为JMS。通过RT-PCR扩增JMS毒株S基因并进行系统进化树分析发现,JMS属于GⅡb基因型。采用500 TCID50(半数组织细胞感染量)的剂量对3日龄仔猪进行攻毒发现,攻毒仔猪表现出严重的临床症状,并在48 h内死亡,致死率为100%。对仔猪剖检和病理组织切片检查发现,攻毒仔猪肠壁变薄,绒毛结构破损、变短甚至脱落。综上,本研究分离到1株高致病性PEDV毒株,为后续探究PEDV流行毒株生物学特性以及相关疫苗研发奠定了基础。

关键词：猪流行性腹泻病毒 GⅡb型高致病性

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2021―2022年川渝部分地区PRRSV分子流行病学及ORF5遗传特征分析

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中国兽医学报 2024年第3期44卷 437-444页

作者：赵自亮左妤祺赵康燕方思颖程钟坤崔羽丹朱桓奕倪兴维徐婷婷刘霞赵光伟西南大学动物医学院重庆荣昌402460 贵州省动物疫病预防控制中心贵州贵阳550008

为了解我国川渝地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况及分子特征,本试验以RT-PCR方法对2021―2022年间收集的来自川渝地区的临床样本进行PRRSV检测,并进一步对阳性样本的O... 详细信息

为了解我国川渝地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行情况及分子特征,本试验以RT-PCR方法对2021―2022年间收集的来自川渝地区的临床样本进行PRRSV检测,并进一步对阳性样本的ORF5基因进行测序分析,探究其流行现状以及遗传变异情况。结果显示,川渝两地PRRSV阳性率为20.5%(40/195),其中四川PRRSV阳性率为18.1%(15/83),重庆为22.3%(25/112)。对其中23份阳性样本的ORF5基因分析显示,所获PRRSV均为基因Ⅱ型,包含谱系1、3、5和8,以NADC30类毒株为主;其中四川地区毒株与上海、辽宁、湖南等地区毒株存在较近的亲缘关系,重庆地区与当地毒株的同源性较高;与目前临床中使用的疫苗毒株比较,发现23株临床样本ORF5序列中有3个B细胞表位和1个T细胞表位与疫苗株存在较大差异。本试验结果表明PRRSV感染在川渝部分地区仍较为严重,美洲型NADC30类毒株是当前流行的优势毒株,且与疫苗株存在一定的变异,该结果对川渝地区PRRSV的防控具有借鉴意义。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒分子流行病学 ORF5基因遗传变异分析

湖南常德山羊源莫尼茨绦虫的鉴定及遗传多样性研究

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中国动物传染病学报 2024年

作者：张建超彭禄庭聂厚湘任杰谭笑若刘晓恒郑娇妹刘伟徐波浏阳市动物疫病预防控制中心湖南农业大学动物医学院长沙市动植物疫病预防控制中心湖南农业大学公共管理与法学院

本研究以湖南省常德市采集的11条山羊源莫尼茨绦虫为实验对象，首先对虫体形态进行观察，然后采用PCR法扩增其线粒体pcox1和pnad1基因序列，并进行测序及遗传多样性分析。形态学结果显示虫体成乳白色，分为头节、幼节、成节和体节。测... 详细信息

本研究以湖南省常德市采集的11条山羊源莫尼茨绦虫为实验对象，首先对虫体形态进行观察，然后采用PCR法扩增其线粒体pcox1和pnad1基因序列，并进行测序及遗传多样性分析。形态学结果显示虫体成乳白色，分为头节、幼节、成节和体节。测序结果分析显示pcox1和pnad1基因种内高度保守，与扩展莫尼茨绦虫同源性较高，与其他绦虫差异较大。系统进化分析显示11条莫尼茨绦虫与扩展莫尼茨绦虫分离株聚类形成同一分支，与贝氏莫尼茨绦虫处于不同分支。11条山羊源莫尼茨绦虫为扩展莫尼茨绦虫，pcox1和pnad1基因均可作为莫尼茨绦虫的遗传分子标记。

关键词：山羊莫尼茨绦虫 pcox1 pnad1 虫种鉴定遗传多样性

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禽流感流行特点及综合防控措施

中国动物保健 2024年第10期 38-39页

作者：马媛杜敏李娅张伟周显珍王乔平孙艳平麒麟区动物疫病预防控制中心昆明市动物疫病预防控制中心麒麟区农业农村综合服务中心曲靖市动物疫病预防控制中心

我国的养禽业是最早的农业活动之一，同时，我国也是世界上最早饲养家禽的国家之一。养禽业是畜牧业的重要组成部分，相比较于饲养猪、牛、羊等大家畜，具有生产周期短、饲料转化率高、投资少、利润高等优点。近年来，非洲猪瘟等外来动... 详细信息

我国的养禽业是最早的农业活动之一，同时，我国也是世界上最早饲养家禽的国家之一。养禽业是畜牧业的重要组成部分，相比较于饲养猪、牛、羊等大家畜，具有生产周期短、饲料转化率高、投资少、利润高等优点。近年来，非洲猪瘟等外来动物疫病频发，许多养殖户为了规避风险，纷纷开始投资养禽，导致禽类养殖户逐年增多，养殖规模逐步扩大，养殖密度也随之增大，这在增加养殖户利润的同时也带来了一些负面的影响，禽流感防控难度也不断加大，防控压力与日俱增。本文对禽流感的流行特点及综合防控措施进行思考总结，供参考。

关键词：禽流感流行特点综合防控措施

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关于畜牧养殖过程中传染性疾病的防治研究

畜牧兽医科技信息 2024年第8期 14-16页

作者：阿正杨罗忠贵巍山县动物疫病预防控制中心

畜牧养殖产业作为支撑国民经济的重要组成部分，逐渐朝着科学化、规模化、系统化的方向发展，但目前传染性疾病对转型速度仍存在着严重的负面影响，解决该问题迫在眉睫。本文在清晰认知畜牧业传染性疾病防控现状的基础上，综合全面地探... 详细信息

畜牧养殖产业作为支撑国民经济的重要组成部分，逐渐朝着科学化、规模化、系统化的方向发展，但目前传染性疾病对转型速度仍存在着严重的负面影响，解决该问题迫在眉睫。本文在清晰认知畜牧业传染性疾病防控现状的基础上，综合全面地探究、分析大量的数据资料，通过抓住常见疫病类型的特点，提出一系列具体的防治措施，如做好饲养环境控制管理、健全牲畜疫病病检体系、更新配套养殖设备设施、实施精准诊断对症下药等。

关键词：畜牧养殖传染性疾病防治

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