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苏山猪和巴克夏猪全基因组ROH检测和选择信号分析

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畜牧兽医学报 2024年

作者：戴超辉崔乐康李辉赵为民付言峰李碧侠王学敏廖超陈彦羽包文斌程金花江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室/江苏省农业种质资源保护与利用平台扬州大学动物科学与技术学院南京瑞源生物技术有限公司

旨在明确苏山猪群体和巴克夏猪群体的遗传变异位点和多态信息，本研究首先对43个苏山猪样本和21个巴克夏猪样本进行DNA提取，然后利用“中芯一号”50KSNP芯片对DNA的SNP位点进行检测；使用Plink软件对SNP位点进行主成分分析；使用Detect... 详细信息

旨在明确苏山猪群体和巴克夏猪群体的遗传变异位点和多态信息，本研究首先对43个苏山猪样本和21个巴克夏猪样本进行DNA提取，然后利用“中芯一号”50KSNP芯片对DNA的SNP位点进行检测；使用Plink软件对SNP位点进行主成分分析；使用DetectRUNS 软件包对样本进行全基因组ROH检测；选用3种方法（ROH、CLR和iHS）对选择信号进行分析。本研究总共鉴定到苏山猪42 282个SNPs 位点和巴克夏猪27 718个SNPs 位点。其中，苏山猪和巴克夏猪均被划分为3个家系。本研究在苏山猪中共检测到2 071个ROH片段，FROH平均值为0.096。巴克夏猪中共检测到1 853个ROH片段，FROH平均值为0.199。在苏山猪和巴克夏猪群体中分别检测到4个和40个高频ROH区域，分别注释到8个和103个基因，通过富集分析鉴定了50个显著的候选基因。另外，通过ROH、CLR和iHS共3种选择信号分析方法，对苏山猪和巴克夏猪的选择信号区域进行了鉴定，发现有42个基因可能受到选择。本研究初步揭示了苏山猪和巴克夏猪的基因组SNP图谱，并通过高频ROH分析和选择信号检测鉴定到一些可能影响猪的生长发育、肉质、营养和一般抗病力的基因，为苏山猪和巴克夏猪的选育利用提供了理论基础。

关键词：猪 ROH CLR iHS 选择信号

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沼液兼养培养微藻潜力及不同有机碳源影响

农业环境科学学报 2024年第6期43卷 1411-1420页

作者：管会博韩挺张茹菊叶小梅张应鹏奚永兰江苏大学环境与安全工程学院江苏镇江212013 江苏省农业科学院畜牧研究所南京210014 农业农村部种养结合重点实验室南京210014

利用沼液培养微藻可在收获藻生物质的同时回收碳、氮、磷养分,是沼液资源化利用极具潜力的途径。与光合自养相比,兼养培养可实现藻生物量快速积累,且对光、碳利用灵活,与透光性不佳的沼液相性较好,但目前缺乏相关研究论证其可行性。本... 详细信息

利用沼液培养微藻可在收获藻生物质的同时回收碳、氮、磷养分,是沼液资源化利用极具潜力的途径。与光合自养相比,兼养培养可实现藻生物量快速积累,且对光、碳利用灵活,与透光性不佳的沼液相性较好,但目前缺乏相关研究论证其可行性。本文首先选取了小球藻Chlorella sp.、蛋白核小球藻Chlorella pyrenoidosa、栅藻Scenedesmus sp.,以葡萄糖为碳源利用猪粪沼液对3株微藻进行了兼养培养。结果显示,兼养策略可在大幅强化藻生物量积累的同时协同提升沼液污染物去除。其中,Chlorella pyrenoidosa展现出最佳的生物量及养分去除优势,培养7 d生物量可达1.51 g·L^(-1),为光合自养的6.12倍,沼液COD、氨氮、总氮、总磷去除率较自养分别提高了20、36、41个和32个百分点。本研究进一步考察了具备两种典型碳代谢路径的有机碳源(葡萄糖-三羧酸循环,乙酸钠-乙醛酸循环)对Chlorella pyrenoidosa沼液兼养培养的影响,发现葡萄糖相较于乙酸钠更适宜作为沼液兼养培养的有机碳源,且葡萄糖浓度与利用效率呈负相关,1 g·L^(-1)葡萄糖浓度条件下Chlorella pyrenoidosa具有最高的单位有机碳生物量产率。此外,兼养微藻通过代谢葡萄糖可协同提升光合性能,使PSⅡ最大量子产量、实际量子产量、调节性能量耗散量子产量等维持较高水平,既弥补了沼液弱透光下光能不足,也强化了持续光照后的光系统损伤恢复机制。因此,本研究认为以添加1 g·L^(-1)葡萄糖的沼液兼养培养Chlorella pyrenoidosa是克服沼液养藻光衰减等不利因素,强化微藻生物量产量及养分回收效率的有效方式,在畜禽养殖场沼液生物消纳与资源化利用方面有较好的应用前景。

关键词：微藻沼液兼养葡萄糖乙酸钠

杂交导入巴克夏血统对苏紫猪生长育肥性状的影响分析

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畜牧与兽医 2024年第8期56卷 21-25页

作者：付言峰廖超王学敏涂枫李碧侠程金花江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室/江苏省畜禽精准育种工程研究中心/江苏省食品质量安全重点实验室/江苏省农业种质资源保护与利用平台江苏南京210014 南京农业大学动物科技学院江苏南京210095

为了探讨含不同巴克夏猪(巴克夏)血统含量(0、25%、50%)的苏紫猪生长育肥性状有无显著改善,选取68头不同类型的苏紫猪,初始体重在30 kg左右,采用全自动种猪生产性能测定系统进行分批次测定。结果显示:试验共获得130700条有效采食和称重... 详细信息

为了探讨含不同巴克夏猪(巴克夏)血统含量(0、25%、50%)的苏紫猪生长育肥性状有无显著改善,选取68头不同类型的苏紫猪,初始体重在30 kg左右,采用全自动种猪生产性能测定系统进行分批次测定。结果显示:试验共获得130700条有效采食和称重数据,深入分析后发现不同巴克夏血统含量的苏紫猪达相关体重的日龄不同,达60 kg和90 kg体重日龄均为含50%巴克夏血统苏紫猪最大,显著大于无巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。30~60 kg生长阶段的日增重,含25%巴克夏血统和无巴克夏血统苏紫猪显著高于含50%巴克夏血统苏紫猪(P<0.05);30~90 kg和30~110 kg生长阶段的日增重,均为无巴克夏血统苏紫猪最高,显著高于含50%巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。30~90 kg和30~100 kg生长阶段的料重比,均为含50%巴克夏血统苏紫猪最低,且显著低于含25%巴克夏血统和无巴克夏血统苏紫猪(P<0.05)。结论:杂交导入巴克夏血统对苏紫猪的生长速度提升不显著,但对其料重比的改善显著,其中含25%巴克夏血统的苏紫猪生长性能比较均衡,未来可以进行优先培育。

关键词：猪生长育肥性能杂交导入

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苏紫猪血清细胞因子含量对育肥性状的影响

江苏农业科学 2024年第3期52卷 201-206页

作者：付言峰程金花廖超戴超辉涂枫王学敏江苏省农业科学院畜牧研究所江苏南京210014 南京农业大学动物科技学院江苏南京210014 农业部种养结合重点实验室/江苏省畜禽精准育种工程研究中心/江苏省食品质量安全重点实验室/江苏省农业种质资源保护与利用平台江苏南京210014

为研究育肥期苏紫猪血清中细胞因子含量对育肥性状的影响,本研究选取18头苏紫猪进行生长育肥测定,然后屠宰采集血样,进行CCL4、IL-6和FGF-2这3种细胞因子的检测,同时统计其日龄、体质量、瘦肉率和皮下脂肪,分析两者之间的关系。结果发现... 详细信息

为研究育肥期苏紫猪血清中细胞因子含量对育肥性状的影响,本研究选取18头苏紫猪进行生长育肥测定,然后屠宰采集血样,进行CCL4、IL-6和FGF-2这3种细胞因子的检测,同时统计其日龄、体质量、瘦肉率和皮下脂肪,分析两者之间的关系。结果发现,CCL4、IL-6和FGF-2的标准曲线拟合度分别为0.9963、0.9958、0.9953,均非常接近于1,说明后面检测的结果可信度高。育肥期苏紫猪血清中,IL-6含量最高,其次为CCL4含量,FGF-2含量最低(P研究提示,优质猪血清细胞因子含量对育肥性状有较大的影响,其中,育肥期IL-6和CCL4含量可反映出猪瘦肉率的高低,有利于猪高瘦肉率性状的高效选育。

关键词：苏紫猪趋化因子C-C配体4 成纤维细胞生长因子2 生长育肥

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导入巴克夏血统苏紫猪生长曲线拟合研究

中国畜牧杂志 2024年第6期60卷 138-142页

作者：廖超程金花李娟赵为民李辉戴超辉付言峰江苏省农业科学院畜牧研究所农业部种养结合重点实验室江苏省畜禽精准育种工程研究中心江苏省食品质量安全重点实验室江苏省农业种质资源保护与利用平台江苏南京210014 南京农业大学动物科技学院江苏南京210095

为了解导入巴克夏血统后苏紫猪(后称苏紫猪)的生长发育规律,从而提高苏紫猪的生长性能和饲养管理水平,本研究选取62头苏紫猪进行体重监测,并对产生的40 700条有效数据进行生长性能分析。利用3种非线性模型(Gompertz、Logistic和Bertalan... 详细信息

为了解导入巴克夏血统后苏紫猪(后称苏紫猪)的生长发育规律,从而提高苏紫猪的生长性能和饲养管理水平,本研究选取62头苏紫猪进行体重监测,并对产生的40 700条有效数据进行生长性能分析。利用3种非线性模型(Gompertz、Logistic和Bertalanffy)对苏紫猪进行生长曲线拟合分析。结果发现:在100日龄之前公猪和母猪群体的体重差异不显著,100日龄以后公猪的体重显著大于母猪,且差距逐渐变大,在160日龄后差异极显著;Gompertz模型对苏紫猪的拟合效果均优于Bertalanffy和Logistic模型;在Gompertz模型下,苏紫猪公猪和母猪的拐点日龄及拐点体重分别是140.36 d、80.41 kg和123.3 d、56.61 kg。本研究结果表明运用Gompertz模型可预测苏紫猪的生长拐点,为其精准饲养和选育提供参考依据。

关键词：苏紫猪生长曲线生长拐点拟合

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大型连体猪舍臭气多级处理系统

中国畜牧业 2024年第9期 45-46页

作者：王学敏廖超程金花李碧侠徐小波付言峰涂枫江苏省农业科学院畜牧研究所、农业农村部种养结合重点实验室、江苏省农业种质、资源保护与利用平台、江苏省畜禽精准育种工程研究中心

近年来,随着农业产业化和城市化的迅猛发展,中国规模化养猪业迅速崛起,成为畜牧业领域的重要支柱。规模化养猪业在我国畜牧业生产中具有重要作用,不仅是农村经济的支柱产业,也是农业现代化进程中不可或缺的一部分,在国家农业和经济发展... 详细信息

近年来,随着农业产业化和城市化的迅猛发展,中国规模化养猪业迅速崛起,成为畜牧业领域的重要支柱。规模化养猪业在我国畜牧业生产中具有重要作用,不仅是农村经济的支柱产业,也是农业现代化进程中不可或缺的一部分,在国家农业和经济发展中发挥着至关重要的作用。随着我国社会经济的迅速发展,规模化养猪业也面临着新的机遇和挑战,其中之一是与猪场臭气排放相关的环境问题。目前,社会大众对环保的重视程度不断提高,环境保护相关法规也在不断完善,因此,养殖业臭气排放问题日益受到广泛关注。

关键词：农业现代化进程农业产业化支柱产业规模化养猪业环境保护畜牧业城市化养殖业

熟化垫料部分替代化肥对水稻–多花黑麦草轮作生产力、土壤肥力和重金属含量的影响

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土壤 2024年第4期56卷 742-749页

作者：张文洁许能祥丁成龙李青丰内蒙古农业大学草原与资源环境学院呼和浩特010011 江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室南京210014

探讨熟化垫料部分替代化肥对长江中下游地区水稻–多花黑麦草轮作系统生产力、土壤肥力和重金属含量的影响,为长江中下游地区有机肥合理施用及其风险评估提供科学依据。采用连续2年的大田小区试验,以猪发酵床熟化垫料不同比例替代化肥:... 详细信息

探讨熟化垫料部分替代化肥对长江中下游地区水稻–多花黑麦草轮作系统生产力、土壤肥力和重金属含量的影响,为长江中下游地区有机肥合理施用及其风险评估提供科学依据。采用连续2年的大田小区试验,以猪发酵床熟化垫料不同比例替代化肥:不施肥对照(CK)、单施化肥(T1)、熟化垫料替代25%化肥氮(T2)、熟化垫料替代50%化肥氮(T3)、熟化垫料替代75%化肥氮(T4)、单施熟化垫料(T5),分析在相等施氮量条件下熟化垫料替代化肥对水稻–多花黑麦草轮作系统作物地上生物量、氮素利用率、土壤理化性质以及重金属含量的影响。研究结果表明,与对照相比,各施肥处理均能不同程度地提高水稻籽粒、水稻秸秆、多花黑麦草产量及地上部周年总产量。在不同比例熟化垫料替代处理中,随着熟化垫料替代比例的增加,作物产量表现为降低的趋势。相对于T1处理,T2处理的水稻–多花黑麦草轮作系统地上部周年生物产量连续两年分别提高5.88%和6.40%,T3处理差异不显著,T4和T5处理显著降低。随着熟化垫料施用比例的增加,水稻–多花黑麦草轮作系统作物年总产量呈先增加后降低趋势,其中T4和T5处理的周年地上部总产量第2年比第1年分别增加11.49%和20.34%。施肥显著影响轮作系统作物的氮素吸收量、利用率和偏生产力。相比于T1处理,T2处理第1年和第2年轮作系统地上部氮素吸收量分别增加9.387%和7.59%,氮素利用率分别提高14.66%和10.14%,偏生产力分别提高7.58%和5.94%;T3处理与T1处理差异不显著;但T4和T5处理3个指标均显著降低。相比于T1处理,耕层0~20 cm土壤p H、有机质、速效钾和有效磷含量随着熟化垫料替代比例的增加表现为升高的趋势。相比于T1处理,T3、T4和T5处理的土壤有机质含量,分别增加33.98%、46.23%和47.09%,有效磷含量分别增加49.11%、67.15%和73.87%,速效钾含量分别增加23.36%、36.77%和55.24%(2年均值)。熟化垫料施用造成了土壤Cu和Zn的富集,但对土壤Cd含量影响不显著,同一施肥处理土壤中的Cu、Zn和Cd含量,第1轮作年低于第2轮作年,但含量均在土壤环境质量农用地土壤污染风险管控标准(GB15618—2018)范围内。2年4季定位试验表明,熟化垫料替代25%~50%化肥为长江中下游地区水稻–多花黑麦草轮作生产值得推荐的化肥减量增效模式。

关键词：水稻–多花黑麦草轮作熟化垫料产量氮素利用率土壤肥力重金属

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黑水虻高密度养殖料温监测预警策略研究

环境昆虫学报 2024年第5期46卷 1083-1093页

作者：宋瑜叶小梅孔祥平王聪马秋琴朱飞杜静江苏大学农业工程学院江苏镇江212013 江苏省农业科学院畜牧研究所农业农村部种养结合重点实验室江苏省有机固体废弃物资源化协同创新中心南京210014

采用实验室盒养方式,在高密度投虫工况下,考察不同深度料温、不同料温监测方式以及不同监测点位等因素对黑水虻Hermetia illucens转化鸡粪原料过程中料温监测效果的影响,以期优选出更有效的黑水虻养殖料温监测预警策略。结果表明,黑水... 详细信息

采用实验室盒养方式,在高密度投虫工况下,考察不同深度料温、不同料温监测方式以及不同监测点位等因素对黑水虻Hermetia illucens转化鸡粪原料过程中料温监测效果的影响,以期优选出更有效的黑水虻养殖料温监测预警策略。结果表明,黑水虻养殖物料表面温度明显高于其余深度,随着物料深度增加呈逐渐降低趋势,并且各深度料温与表面料温呈正相关关系(P中心点平均料温明显高于四周,可作为黑水虻养殖料温高温预警的主要监测点。该研究结果为后续研究料温调控策略和黑水虻养殖环境智能控制系统提供了科学依据。

关键词：鸡粪黑水虻高密度养殖料温预警策略

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黑水虻养殖虫料分离方法及设备的研究进展

黑龙江畜牧兽医 2024年第12期 23-28页

作者：宋瑜叶小梅孔祥平郭亭王聪王莉朱飞杜静江苏大学农业工程学院江苏镇江212013 江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室/江苏省有机固体废弃物资源化协同创新中心南京210014

黑水虻(Hermetia illucens L.)是一种资源昆虫,其幼虫可将有机废弃物转化成高价值饲料蛋白,常被用于处理畜禽粪便、厨余垃圾等,同时也可杀灭废弃物中的致病菌,阻止其在食物链中传播,黑水虻这些特性为有机废弃物高效无害化处理和高值资... 详细信息

黑水虻(Hermetia illucens L.)是一种资源昆虫,其幼虫可将有机废弃物转化成高价值饲料蛋白,常被用于处理畜禽粪便、厨余垃圾等,同时也可杀灭废弃物中的致病菌,阻止其在食物链中传播,黑水虻这些特性为有机废弃物高效无害化处理和高值资源化转化提供了新方向。目前,在黑水虻幼虫和养殖基料分离方面存在分离效率低、成本高、缺少自动化分离设备等问题,严重制约了黑水虻养殖产业的发展。笔者对目前国内外有关黑水虻虫粪分离方法(包括光照分离法、氧气分离法、饵料诱捕法、加热分离法、风机筛分法、机械振动筛分法、离心力筛分法、人工筛分法)及分离设备在实际生产中的应用现状进行了综述,探讨和分析了黑水虻幼虫分离收集过程中面临的主要问题、分离意义及未来研究方向,以期为我国大规模黑水虻养殖中的分离收集工艺技术改进和设备研制提供参考。

关键词：黑水虻虫料分离方法分离设备研究进展