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基于生物信息学构建胃癌免疫相关LncRNA预后风险模型

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中国免疫学杂志 2024年第6期40卷 1203-1209页

作者：姜华基丁蔚谭玉林壮麟奚诚徐逸昕王一波徐学忠江苏大学附属武进医院徐州医科大学武进临床学院普外科常州213017

目的:基于生物信息学筛选出新的胃癌预后免疫相关LncRNAs,进一步构建免疫相关LncRNAs预后风险模型,以期作为胃癌早期诊断及判断预后状态的新指标。方法:从多重数据平台中下载胃癌转录组数据及相应的临床预后资料,运用生物信息学方法筛... 详细信息

目的:基于生物信息学筛选出新的胃癌预后免疫相关LncRNAs,进一步构建免疫相关LncRNAs预后风险模型,以期作为胃癌早期诊断及判断预后状态的新指标。方法:从多重数据平台中下载胃癌转录组数据及相应的临床预后资料,运用生物信息学方法筛选出胃癌免疫相关LncRNAs。采用Cox回归分析筛选胃癌免疫预后相关LncRNAs,确定具有独立预后意义的免疫预后相关LncRNAs构建预后风险模型,计算每例患者的风险评分,根据截断值将患者分为低风险组和高风险组,采用Kaplan-Meier分析法进行生存分析并绘制生存曲线,绘制列线图并进行内部验证,同时单因素和多因素Cox回归分析风险评分和临床病理特征与胃癌患者生存预后的关系。结果:通过Cox回归分析确定3个免疫预后相关LncRNAs(UCA1、MIR4435-1HG、RP11-617F23.1),并构建预测评分模型,根据预后评分将患者分为高风险组和低风险组,生存曲线显示两组患者预后差异有统计学意义(P<0.05),多因素Cox回归分析风险评分为胃癌预后的独立危险因素,列线图内部验证显示可信度良好。结论:胃癌中免疫相关的LncRNAs与胃癌患者预后显著相关,基于其构建的预测评分模型可以有效预测预后,可作为其独立的预后生物标志物。

关键词：胃癌 LncRNA 免疫预后

基于天冬氨酸转氨酶-血小板计数比的列线图模型对肝细胞癌射频消融治疗后复发的预测价值

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介入放射学杂志 2024年第1期33卷 38-43页

作者：季亚香奚静刘春艳吴萍章晓兰宋蒨江苏大学附属武进医院(徐州医科大学武进临床学院)超声科江苏常州213000 江苏大学附属武进医院(徐州医科大学武进临床学院)介入科江苏常州213000

目的探讨天冬氨酸转氨酶-血小板计数比值指数(aspartate aminotransferase-platelet ratio index,APRI)与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)射频消融(radiofrequency ablation,RFA)治疗后肿瘤复发的关系。方法纳入2017年1月至2020年12月江苏大学附属武进医院初诊为HCC并接受RFA治疗的患者204例。采用受试者工作特征(receiver operation characteristics,ROC)曲线确定APRI的最佳截断值。绘制Kaplan-Meier曲线计算高、低APRI组患者的无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)。Cox回归分析RFA后HCC复发的独立预测因素,并选择显著变量构建列线图模型。通过一致性指数(concordance index,C-index)和校正曲线评价列线图模型对HCC复发的预测能力。结果RFA治疗后HCC复发率为57.4%(117/204)。APRI预测HCC复发的最佳截断值为0.501,曲线下面积(area under curve,AUC)为0.678(95%CI:0.603~0.752)。高APRI组(≥0.501)121例,低APRI组(<0.501)83例,高APRI与患者低RFS显著相关(χ^(2)=12.929,P<0.01)。Cox回归分析证实,肿瘤数目(HR=1.541,95%CI:1.039~2.286,P=0.031)、肿瘤最大直径(HR=1.461,95%CI:1.011~2.112,P=0.044)、血清AFP(HR=2.286,95%CI:1.576~3.318,P<0.01)和APRI(HR=1.873,95%CI:1.257~2.790,P=0.002)是HCC复发的独立风险因素。基于以上4个因素构建预测RFA治疗后HCC复发的列线图模型,C-index为0.769(95%CI:0.676~0.862),预测1年、2年和3年RFS的AUC分别为0.707、0.719和0.707。校正曲线展示模型预测与实际复发风险之间具有良好一致性。结论基于APRI与肿瘤生物学特征的列线图模型对HCC复发具有良好预测能力。

关键词：肝细胞癌射频消融天冬氨酸转氨酶-血小板计数比值指数复发列线图

左室达峰时间对心功能不全患者起搏术后左心功能中远期预后的影响及其预测价值

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临床心血管病杂志 2024年第1期40卷 26-32页

作者：梁晓芳罗培培宋艳斌薛社亮王娟凤伟祥李文华江苏大学附属武进医院心血管内科、徐州医科大学武进临床学院江苏常州213017 江苏大学附属武进医院消化内科、徐州医科大学武进临床学院

目的:探讨刺激至左室达峰时间(sti-LVAT)对心力衰竭(心衰)患者起搏术后左心功能中远期预后的影响。方法:回顾性分析我院2019年1月—2023年5月收治的具有高心室起搏比例的起搏器植入患者89例。根据起搏部位分为左束支区域起搏(LBBAP)组(4... 详细信息

目的:探讨刺激至左室达峰时间(sti-LVAT)对心力衰竭(心衰)患者起搏术后左心功能中远期预后的影响。方法:回顾性分析我院2019年1月—2023年5月收治的具有高心室起搏比例的起搏器植入患者89例。根据起搏部位分为左束支区域起搏(LBBAP)组(42例)、右室间隔部起搏(RVSP)组(13例)和右室心尖部起搏(RVAP)组(34例)。比较3组的基线资料、术中电生理参数和术后6个月左心功能等相关指标的差异。结果:术中LBBAP组起搏QRS宽度最窄,其次是RVSP组和RVAP。术中3组的单极阻抗有显著差异(P=0.005)。与基线相比,LBBAP组术后6个月左室舒张末期内径(LVEDD)、左房内径(LAD)和N末端B型脑钠肽前体(NT-proBNP)均显著下降[LVEDD:(48.12±6.51) mm vs (50.45±7.96) mm,P=0.001;LAD:(40.05±5.92) mm vs (42.02±7.20) mm,P=0.002;NT-proBNP:219.50(89.75,472.50) pg/mL vs 1 166.50(683.75,2 125.00) pg/mL,P=0.001],左室射血分数(LVEF)显著升高[(62.95±4.99)%vs (58.31±9.36)%,P<0.001];RVAP组术后6个月LAD显著增加[(42.82±5.24) mm vs (41.06±5.59) mm,P=0.009],LVEF则显著下降[(56.91±7.18)%vs (60.38±7.13)%,P=0.041];RVSP组术后6个月的LVEDD、LAD和LVEF则变化不明显。术中发现,LBBAP组sti-LVAT最短[(74.45±12.90) ms],其次是RVSP组[(94.69±11.00) ms]和RVAP组[(100.21±11.44) ms],3组间差异明显(P<0.001)。线性回归分析显示,sti-LVAT与术后6个月的ln(NT-proBNP)、LVEDD和LAD水平呈正相关(r=0.674、0.512、0.400,均P<0.001),与6个月的LVEF呈负相关(r=-0.510,P<0.001)。多元线性回归分析显示,sti-LVAT可正向预测术后6个月NT-proBNP(b=0.051,β=0.646,P<0.001)和LVEDD值(b=0.157,β=0.423,P<0.001)。结论:LBBAP可显著改善心衰患者起搏术后的左心功能,减轻心室重构;sti-LVAT对高心室起搏比例的心衰患者术后6个月的左心功能有较好的预测价值。

关键词：左束支区域起搏右室心尖部起搏右室间隔部起搏左室达峰时间左心功能心室重构

m^(6)A调控细胞自噬和铁死亡途径影响肿瘤细胞生长

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第9期40卷 1222-1229页

作者：李名杨陶爽李国辉江苏大学生命科学学院生物科学系江苏镇江212013 江苏大学附属武进医院乳腺外科江苏常州213164

N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是RNA中腺苷酸(A)第6位N上发生的甲基化,是真核生物mRNA中最丰富的表观转录组学修饰。m^(6)A修饰不仅能调控胞内基因组转录水平,也直接影响癌基因、抑癌基因和多种非编码RNA(ncRNA)的表达水平,与肿瘤的发生、发... 详细信息

N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是RNA中腺苷酸(A)第6位N上发生的甲基化,是真核生物mRNA中最丰富的表观转录组学修饰。m^(6)A修饰不仅能调控胞内基因组转录水平,也直接影响癌基因、抑癌基因和多种非编码RNA(ncRNA)的表达水平,与肿瘤的发生、发展直接相关;另外,m^(6)A修饰也能调控细胞自噬和铁死亡代谢途径中相关基因的表达水平,从而调控细胞自噬和铁死亡等胞内代谢途径,其调控异常直接影响肿瘤细胞的增殖或者死亡。本文主要对m^(6)A修饰调控细胞自噬和铁死亡途径相关基因的表达,及其与肿瘤发生、发展相关的基因表达调控,促进或抑制体内肿瘤细胞的生长进行综述,不仅为进一步揭示肿瘤的发生、发展机制提供参考,也为肿瘤治疗提供新的靶标提供科学依据。

关键词： N6-甲基腺苷细胞自噬铁死亡肿瘤

尘螨皮下免疫治疗应用于儿童过敏性哮喘疗效与安全性的前瞻性随机对照研究

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中国当代儿科杂志 2024年第6期26卷 559-566页

作者：王雅妮鲁思琪陈海李玉勤卢红艳朱慧常明江苏大学附属医院儿科江苏镇江212001

目的探讨尘螨皮下免疫治疗(subcutaneous immunotherapy,SCIT)应用于儿童过敏性哮喘的疗效和安全性。方法采用前瞻性随机对照研究,将98例尘螨过敏哮喘患儿按随机数字表法分为对照组和SCIT组,每组49例。对照组吸入激素治疗;SCIT组除吸... 详细信息

目的探讨尘螨皮下免疫治疗(subcutaneous immunotherapy,SCIT)应用于儿童过敏性哮喘的疗效和安全性。方法采用前瞻性随机对照研究,将98例尘螨过敏哮喘患儿按随机数字表法分为对照组和SCIT组,每组49例。对照组吸入激素治疗;SCIT组除吸入激素治疗外,加用3年标准化SCIT。比较两组治疗前、治疗后6个月、治疗后1年、治疗后2年、治疗后3年外周血嗜酸性粒细胞百分比、视觉模拟评分、总用药评分、哮喘控制测试评分/儿童哮喘控制测试评分、呼出气一氧化氮和肺功能的差异。记录注射后不良反应,评估SCIT的安全性。结果与治疗前相比,SCIT组3年后外周血嗜酸性粒细胞百分比、视觉模拟评分、总用药评分和呼出气一氧化氮显著下降,肺功能显著改善,哮喘控制水平更佳(P<0.05);与对照组相比,SCIT组3年后各评估指标改善较对照组更明显(P<0.05)。共完成2744次注射,发生局部不良反应157次(5.72%),全身不良反应4次(0.15%),无严重全身不良反应发生。结论 SCIT是一种有效、安全的儿童过敏性哮喘治疗方法。

关键词：皮下免疫治疗过敏性哮喘疗效安全性儿童

遗忘型轻度认知障碍个体的结构网络改变及其与阿尔茨海默病发病的预测研究

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中华老年医学杂志 2024年第9期43卷 1143-1148页

作者：李洋王冉超杜睿徐宇浩谢恺沈宇马科杰蔡玉娇李月峰江苏大学附属宜兴医院宜兴214205 江苏大学附属医院镇江212001

目的探究遗忘型轻度认知障碍(aMCI)个体的结构网络改变及其与阿尔茨海默病(AD)发病的相关性。方法前瞻性收集100例aMCI个体以及25名与之年龄、性别相匹配的健康对照者作为研究对象。所有受试者入组后均接受系统的MRI扫描和相关临床量表... 详细信息

目的探究遗忘型轻度认知障碍(aMCI)个体的结构网络改变及其与阿尔茨海默病(AD)发病的相关性。方法前瞻性收集100例aMCI个体以及25名与之年龄、性别相匹配的健康对照者作为研究对象。所有受试者入组后均接受系统的MRI扫描和相关临床量表评估,随后进行长达3年的纵向随访(每6个月1次)。根据随访期内是否发生AD,所有aMCI受试者被分为稳定型aMCI组以及进展型aMCI组。采用中文版简易精神状态检查量表(MMSE)、蒙特利尔认知评估量表(MoCA)、临床痴呆评定量表(CDR)以及听觉词语学习测试(AVLT)评估受试者的整体精神及认知状况。基于Pearson相关分析探究受试者的脑结构网络属性与认知改变的相关性。构建Logistic回归模型探究aMCI个体脑结构网络属性对于AD的预测效能。结果与稳定型aMCI组相比,进展型aMCI组表现出全局效率(P=0.002)、局部效率(P=0.007)、feeder连接(P=0.003)、local连接(P=0.008)以及右侧楔前叶节点效率(P=0.010)的降低。相关分析显示基线时全局效率(r=0.604,P=0.002)、feeder连接(r=0.513,P=0.012)和楔前叶节点效率(r=0.504,P=0.014)与进展型aMCI组的AVLT延迟评分相关。Logistic回归模型显示全局效率、feeder连接和右侧楔前叶节点效率可以预测未来AD的发生,并且具有良好的预测效能(均P<0.05,AUC联合=0.797,95%CI:0.684~0.884,敏感度=73.91,95%CI:51.6~89.8,特异度=76.60,95%CI:62.0~87.7)。结论在已经出现aMCI的个体中,存在全局效率、feeder连接或者右侧楔前叶节点效率改变的个体在未来更容易发展为AD,这些指标有望成为新的临床干预靶点。

关键词：遗忘型轻度认知障碍阿尔茨海默病结构网络预测

人工智能算法在癌症相关微RNA研究中的应用进展

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浙江大学学报（医学版） 2024年第2期53卷 231-243页

作者：鲁洪宇张佳曹一鑫吴书铭魏渊殷润婷江苏大学药学院江苏镇江212013 江苏大学附属医院肿瘤内科江苏镇江212013

微RNA(miRNA)是一类通过不完全碱基互补配对实现后转录调控作用的小分子非编码RNA,其往往在癌症患者的病灶和外周血中表达失调。近年来,基于人工智能算法如机器学习和深度学习的模型逐渐应用于miRNA生物信息学研究。与传统的生物信息学... 详细信息

微RNA(miRNA)是一类通过不完全碱基互补配对实现后转录调控作用的小分子非编码RNA,其往往在癌症患者的病灶和外周血中表达失调。近年来,基于人工智能算法如机器学习和深度学习的模型逐渐应用于miRNA生物信息学研究。与传统的生物信息学工具比较,基于人工智能算法的miRNA靶点预测工具准确度更高,并实现了miRNA亚细胞定位和亚细胞重分布的预测,进一步深化了科研人员对miRNA的认识。此外,人工智能算法在临床模型构建的应用也显著提升了miRNA生物标志物的挖掘效率。本文总结了近年来人工智能算法在miRNA靶点预测、亚细胞定位和生物标志物挖掘的应用,并探讨了机器学习和深度学习对癌症相关miRNA研究的潜在价值。

关键词：微RNA 机器学习深度学习靶点预测亚细胞分布临床预测模型综述

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SARMs在肌少症治疗中的机制与进展

中国骨质疏松杂志 2024年第5期30卷 775-780页

作者：袁瑾方玲娜李翀江苏省江苏大学江苏镇江212000 江苏大学附属昆山医院江苏苏州215300

肌少症(sarcopenia)是当前一类严重影响老年人的日常行为能力和生活质量的疾病。因其发病率逐年增多,近些年各专家对于肌少症的研究也逐步深入。肌少症的治疗方法和治疗药物的研究备受关注,其中,选择性雄激素受体调节剂(selective andro... 详细信息

肌少症(sarcopenia)是当前一类严重影响老年人的日常行为能力和生活质量的疾病。因其发病率逐年增多,近些年各专家对于肌少症的研究也逐步深入。肌少症的治疗方法和治疗药物的研究备受关注,其中,选择性雄激素受体调节剂(selective androgen receptor modulators,SARMs)是一大研究热点,本篇综述的主要目的是探讨SARMs在肌少症的发生发展中的作用机制、研究和临床进展,以便于未来能更快更好地应用于临床治疗。

关键词：肌少症选择性雄激素受体调节剂雄激素雄激素受体

维奈克拉方案治疗复发/难治性急性髓系白血病的临床研究

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中国肿瘤临床 2024年第7期51卷 348-353页

作者：雷芳费小明杨元林季艳萍余先球汤郁江苏大学附属医院血液科江苏省镇江市212001 江苏大学附属医院风湿科江苏省镇江市212001

目的:评价维奈克拉(venetoclax,VEN)快速剂量递增、最长治疗时间为14天,联合低剂量阿糖胞苷(low-dose cytarabine,LDAC)方案挽救治疗复发/难治性急性髓系白血病(relapsed/refractory acute myeloid leukemia,R/RAML)的安全性和有效性。方法:回顾性分析2018年10月至2023年11月于江苏大学附属医院接受VEN+LDAC方案挽救治疗的16例R/R AML患者,所有患者既往均未接受过含VEN方案治疗。该方案VEN的剂量第1天为200 mg,其后均为400 mg固定剂量;LDAC 20 mg/m^(2)/d皮下注射。患者在治疗第8天复查骨髓,根据骨髓增生情况决定总疗程为10天还是14天。所有患者均不给予VEN单药治疗。有治疗反应的患者采用相同方案维持直到疾病进展或移植。结果:本研究纳入的R/R AML患者,中位随诊时间为27.5个月。治疗期间未发生有临床表现的肿瘤溶解综合症(tumor lysis syndrome,TLS)。治疗后总反应率(overall response rate,ORR)为68.75%,其中4例达完全缓解(complete response,CR),1例达血液学未恢复的完全缓解(CR with incomplete hematologic recovery,CRi),6例达部分缓解(partial response,PR)。达最佳疗效的治疗周期中位数为1个周期。中位总生存期(overall survival,OS)为5.8(0.5~47.2)个月,中位无进展生存期(progression-free survival,PFS)为22.2(7.3~42.9)个月。发生的不良反应主要为3~4级的血液学不良事件和感染。结论:本研究根据治疗第8天骨髓复查结果调整用药天数的VEN+LDAC方案,对于既往没有接受过含VEN方案治疗的R/R AML患者有较好的安全性和有效率。即使14天的VEN+LDAC治疗也是安全的。

关键词：维奈克拉低剂量阿糖胞苷复发/难治性急性髓系白血病