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宫颈癌源外泌体差异表达miRNA筛选及其关键靶基因的生物信息学分析

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中国临床研究 2024年第10期37卷 1567-1572页

作者：娄邵升曹玲玲欧阳云珊吾米丹·阿不都热合曼林晨新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学研究生学院新疆乌鲁木齐830000

目的筛选宫颈癌细胞系(SiHa/HeLa)与正常宫颈上皮细胞系(H8)培养上清外泌体中miRNA表达差异,并通过生物信息分析确定靶基因。方法培养宫颈癌细胞系(SiHa/HeLa)与正常宫颈上皮细胞系(H8),收集细胞培养的上清液,超速离心法提取外泌体,透... 详细信息

目的筛选宫颈癌细胞系(SiHa/HeLa)与正常宫颈上皮细胞系(H8)培养上清外泌体中miRNA表达差异,并通过生物信息分析确定靶基因。方法培养宫颈癌细胞系(SiHa/HeLa)与正常宫颈上皮细胞系(H8),收集细胞培养的上清液,超速离心法提取外泌体,透射电镜(TEM)观察外泌体的形态,蛋白质印迹实验鉴定外泌体标志蛋白。将提取的外泌体进行miRNA高通量测序,分别得出SiHa和H8外泌体中差异的miRNA,HeLa和H8外泌体中差异的miRNA,取二者交集。对于所得到的交集miRNA进行靶基因预测并进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果TEM观察到外泌体呈典型的杯状结构,大小30~200 nm,蛋白质印迹实验显示所提取样本有外泌体标志蛋白的表达。测序结果显示HeLa与H8源外泌体表达差异的miRNA有235个,SiHa与H8源外泌体表达差异的miRNA有249个,两种细胞系源外泌体中表达差异的miRNA有166个。GO生物功能分析显示,宫颈癌细胞外泌体miRNA的差异主要分布于细胞核、胞质、囊泡和细胞骨架等,蛋白质结合主要在金属离子结合、转移酶活性、核苷酸结合等环节发生作用,主要参与RNA聚合酶Ⅱ对转录的调控、DNA模板、磷酸化作用、细胞周期等生物功能。KEGG通路富集分析显示,宫颈癌相关通路与代谢途径、肿瘤的发病途径、轴突导向、PI3K-Akt、钙离子、Rap1、Ras等信号通路的调控相关。结论miR-335-5p、miR-660、miR-155-5p、miR-339-5p、miR-345-3p等miRNA在宫颈癌源外泌体中差异表达,这些差异表达的miRNA通过代谢途径、肿瘤的发病途径、轴突导向、PI3K-Akt、钙离子、Rap1、Ras等信号通路在宫颈癌的进展中发挥关键作用。

关键词：宫颈癌外泌体微小RNA 靶基因生物信息分析

唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素在细菌感染性疾病中的研究进展

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中国人兽共患病学报 2024年第8期40卷 790-795页

作者：何月月朱玥洁樊羿辰殷郑伟史娟张峰波丁剑冰新疆医科大学基础医学院乌鲁木齐830011 新疆医科大学第一附属医院乌鲁木齐830011

唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素(sialic acid-binding immunoglobulin-like lectins,Siglecs)在大多数白细胞上表达,并且在免疫细胞信号传导中起关键作用。最近的研究表明,许多细菌通过唾液酸(sialic acid,Sia)与Siglecs的相互作用来调... 详细信息

唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素(sialic acid-binding immunoglobulin-like lectins,Siglecs)在大多数白细胞上表达,并且在免疫细胞信号传导中起关键作用。最近的研究表明,许多细菌通过唾液酸(sialic acid,Sia)与Siglecs的相互作用来调控宿主免疫应答,影响疾病的发生发展。深入了解细菌致病机制对于破译潜在的有效治疗靶点和帮助人类管理细菌感染性疾病十分重要。本文就Siglecs的结构、生物学功能以及其在细菌感染性疾病中的研究进展作简要综述。

关键词： Siglecs 细菌感染免疫逃逸唾液酸

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布鲁氏菌病疫苗新进展及其佐剂的应用

中国人兽共患病学报 2024年第8期40卷 796-806页

作者：史娟朱玥洁殷郑伟何月月张峰波新疆医科大学第一附属医院乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院乌鲁木齐830011

布鲁氏菌病是严重危害人类健康和畜牧业发展的人兽共患传染病之一,疫苗接种已成为预防和控制布鲁氏菌感染的有效方法之一,市场上已有不少动物用的减毒活疫苗,但是目前尚无人用疫苗。伴随着基因工程和分子生物信息学研究的不断深入,各种... 详细信息

布鲁氏菌病是严重危害人类健康和畜牧业发展的人兽共患传染病之一,疫苗接种已成为预防和控制布鲁氏菌感染的有效方法之一,市场上已有不少动物用的减毒活疫苗,但是目前尚无人用疫苗。伴随着基因工程和分子生物信息学研究的不断深入,各种亚单位疫苗应运而生,例如DNA疫苗、多表位疫苗、重组蛋白疫苗和载体疫苗。疫苗佐剂是针对不同免疫应答需要而研发出来的,本文将对布鲁氏菌病疫苗的研究进展进行综述,同时参考目前常用的疫苗佐剂进行介绍,以期能够对后续疫苗的研发提供新的思路。

关键词：布鲁氏菌疫苗佐剂

人巨细胞病毒UL95抗原表位肽段测定在SLE诊断中的意义

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中华检验医学杂志 2024年第9期47卷 1042-1051页

作者：胡亚徐臣玉强薇章慧娣冯方方温州医科大学附属第一医院肾内科温州325000 温州医科大学基础医学院温州325000 温州医科大学第一临床医学院温州325000 温州医科大学基础医学院形态教学实验中心温州325000

目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)UL95基因的优势B细胞表位肽段在诊断系统性红斑狼疮(SLE)疾病中的临床意义,以及SLE患者血浆中UL95特异性抗体水平和临床指标的相关性,以期找到SLE疾病的辅助诊断指标。方法采用非随机对照研究,分析HCMV UL95... 详细信息

目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)UL95基因的优势B细胞表位肽段在诊断系统性红斑狼疮(SLE)疾病中的临床意义,以及SLE患者血浆中UL95特异性抗体水平和临床指标的相关性,以期找到SLE疾病的辅助诊断指标。方法采用非随机对照研究,分析HCMV UL95基因序列特征及其多态性,并利用生物信息学分析并化学合成UL95优势B细胞表位短肽,将UL95合成短肽作为包被抗原,ELISA法检测97例SLE患者及35名健康对照者(HC)血浆中UL95的特异性抗体水平,ROC曲线分析UL95短肽抗体对于SLE的诊断价值,Pearson相关性检验分析UL95特异性抗体水平与SLE患者临床指标的相关性。结果UL95基因核苷酸序列相似性为92.9%~100%,氨基酸序列相似性为92.1%~100%,序列高度保守,具有同源性。多种参数综合预测得到可能优势B细胞表位6个,分别命名为(Bp1、Bp2、Bp3、Bp4、Bp5、Bp6)。ELISA结果显示SLE患者血浆中的UL95特异性抗体水平(0.35±0.12)高于HC组(0.28±0.10)(t=3.091,P=0.002)。区分SLE和HC的ROC曲线下面积为0.703,敏感度为54.6%,特异度为88.6%。此外中高活动亚组(SLEDAI≥4)的UL95特异性抗体水平(OD值)(0.36±0.10)高于低活动亚组(SLEDAI<4分)(0.30±0.07)(t=‒2.055,P=0.044)。UL95特异性抗体水平和临床指标总免疫球蛋白G、总免疫球蛋白M呈正相关,与补体C3、补体C4、血小板呈负相关。结论UL95的抗体水平与狼疮疾病活动度有关,UL95的Bp1(10~21)肽段对SLE辅助诊断有重要意义,有望成为一种新的参考指标。

关键词：巨细胞病毒红斑狼疮,系统性抗原,B细胞

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3型固有淋巴细胞在慢性炎症性疾病中的作用

中国免疫学杂志 2024年第9期40卷 2006-2010,F0004页

作者：徐峥于明凯张峰波丁剑冰新疆医科大学基础医学院免疫学教研室乌鲁木齐830011 新疆医科大学第一附属医院乌鲁木齐830054

3型固有淋巴细胞(ILC3)分化于淋巴祖细胞,在机体内分布广泛,是连接固有免疫和适应性免疫的桥梁。既往研究认为ILC3主要参与肠道免疫调节,而最新研究表明除在肠道疾病中的作用外,ILC3还参与多种慢性炎症性疾病发生发展。本文就ILC3在慢... 详细信息

3型固有淋巴细胞(ILC3)分化于淋巴祖细胞,在机体内分布广泛,是连接固有免疫和适应性免疫的桥梁。既往研究认为ILC3主要参与肠道免疫调节,而最新研究表明除在肠道疾病中的作用外,ILC3还参与多种慢性炎症性疾病发生发展。本文就ILC3在慢性炎症性疾病中的作用进行综述。

关键词： 3型固有淋巴细胞细胞因子免疫调节慢性炎症性疾病

多囊卵巢综合征患者外周血PD-1、PD-L1表达水平及其与细胞因子相关性研究

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中华生殖与避孕杂志 2024年第5期44卷 480-487页

作者：韩锐巩晓芸朱玥洁李奇凤叶尔登切切克丁剑冰腊晓琳新疆医科大学第一附属医院产前诊断科乌鲁木齐830054 新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心乌鲁木齐830054 新疆儿科研究所乌鲁木齐830054 新疆医科大学基础医学院免疫教研室乌鲁木齐830000

目的探讨多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)患者外周血程序性细胞死亡蛋白1(programmed cell death protein 1,PD-1)和其配体PD-L1表达水平与细胞因子相关性。方法利用GEO数据库中GSE54248数据集筛选出PCOS中差异表达PD-1/PD-L1通路相关基因,对其进行GO和KEGG通路富集分析。采用病例对照研究,选取2022年1月至2023年6月期间在新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心就诊的105例PCOS患者(记为PCOS组)和109例非PCOS患者(记为对照组)作为研究对象,利用QBPlex流式高通量多因子检测技术检测两组外周血PD-L1、PD-L2、PD-1和细胞因子表达水平。采用Pearson法进行相关性分析。结果PCOS组患者外周血中PD-1水平[2.890(0.020,4.540)ng/L]显著低于对照组[3.370(2.460,4.360)ng/L,P=0.008];PD-L1水平[9.820(8.860,10.880)ng/L]显著低于对照组[10.410(9.700,11.160)ng/L,P=0.001];PD-L2表达水平在两组间差异无统计学意义(P>0.05)。在GSE54248数据集筛选出26个差异表达基因,主要富集在PD-1/PD-L1通路、1型T辅助细胞(T helper cell 1,Th1)和2型T辅助细胞(T helper cell 2,Th2)分化、参与炎症反应的细胞因子的产生等通路。与对照组相比较,PCOS组患者外周血中白细胞介素(interleukin,IL)-5、IL-9、IL-25、IL-10、生长刺激表达基因2(growth stimulation expressed gene 2,ST-2)和颗粒酶B(Granzyme B)浓度显著降低,IL-8、IL-1RA和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)浓度显著升高,差异均具有统计学意义(均P<0.05)。PD-1与IL-1RA、ST-2和TNF-α水平呈正相关(r=0.270,P=0.005;r=0.213,P=0.029;r=0.291,P=0.003),与IL-9、IL-25和Granzyme B水平呈负相关(r=-0.322,P<0.001;r=-0.211,P=0.031;r=-0.369,P<0.001)。PD-L1与IL-9、IL-25和Granzyme B水平呈正相关(r=0.254,P=0.009;r=0.330,P<0.001;r=0.340,P<0.001),与IL-10水平呈负相关(r=-0.373,P=0.009)。结论PCOS患者外周血PD-1和PD-L1下调表达,可能与Th1/Th2细胞因子失衡相关,是治疗PCOS的潜在分子生物标志物。

关键词：多囊卵巢综合征程序性细胞死亡蛋白1 程序性细胞死亡蛋白配体1 细胞因子

单能量去金属伪影算法在心脏起搏器中去伪影效果评价

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中国医学计算机成像杂志 2024年第2期30卷 186-190页

作者：胡亚辉吴月张新伟栗岩邢艳新疆医科大学基础医学院乌鲁木齐830011 新疆医科大学第一附属医院影像中心

目的:研究单能量去金属伪影(SEMAR)算法在心脏起搏器植入术后的去伪影效果,探讨其对无导线起搏器与有导线起搏器改善图像质量的效果对比。方法:前瞻性收集心脏起搏器植入术后行冠状动脉CT血管成像(CCTA)患者的图像,进行两次容积重建:一... 详细信息

目的:研究单能量去金属伪影(SEMAR)算法在心脏起搏器植入术后的去伪影效果,探讨其对无导线起搏器与有导线起搏器改善图像质量的效果对比。方法:前瞻性收集心脏起搏器植入术后行冠状动脉CT血管成像(CCTA)患者的图像,进行两次容积重建:一次使用自适应迭代算法重建(非SEMAR组);一次使用自适应迭代算法联合SEMAR算法重建(SEMAR组)。在金属伪影覆盖面积最大的层面,高、低密度伪影区的右冠状动脉及周围脂肪组织等划取感兴趣区(ROI),记录CT值和标准差以计算伪影指数(AI)对图像进行客观评价,由2名高年资放射科医师采取双盲法对图像质量行主观评价,并采用Kappa检验评估观察者间的一致性。结果:共计32例心脏起搏器植入术后患者被纳入评价。2名阅片者主观评分一致性良好(κ=0.92)。SEMAR组比非SEMAR组主观评分高(P0.05)。结论:SEMAR算法能够有效减少心脏起搏器金属伪影,改善图像质量,其在无导线起搏器中改善图像质量的效果优于有导线起搏器。

关键词：心脏起搏器冠状动脉周围脂肪组织单能量去金属伪影算法伪影指数计算机体层成像

miR⁃21⁃5p靶向BNC2调控食管癌的恶性生物行为的研究

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海南医学院学报 2024年第16期30卷 1236-1245页

作者：邓雨函阳梦吴振华李卉热则耶·麦麦提祖农孙晓宏新疆医科大学附属肿瘤医院新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学中心实验室新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830011

目的:探讨miR-21-5p靶向肌成纤维细胞的身份转录因子(BNC2)调控食管癌(esophageal cancer,ESCA)细胞增殖、迁移、侵袭机制。方法:应用实时定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,qRT-PCR)方法检测食管癌组织中miR-21-5P和BNC2的相对表达量并用统计学分析其是否存在表达差异。用miR-21-5p mimics和miR-21-5P inhibitor和阴性对照(NC包括mimcs NC、inhibitor NC)分别转染ECA109、KYSE30两个食管癌细胞系后,进行细胞功能试验CCK8,Transwell等实验方法观察当miR-21-5p过表达或敲低时细胞的增殖、迁移和侵袭能力是否受到影响。通过生物信息学方法预测分析miR-21-5P的靶基因并通过双荧光素酶实验、qRT-PCR和Western blot实验验证miR-21-5p与靶向基因的负向调控关系。结果:qRT-PCR结果显示,相对于癌旁组织,BNC2在食管癌组织中的表达量显著性降低,而miR-21-5P则显著性升高,CCK8、Transwell实验结果显示,当miR-21-5P过表达时,细胞的增殖、迁移和侵袭能力增强,反之细胞功能受到抑制。也就是说,miR-21-5P在食管恶性肿瘤中起着促癌基因的功能作用。通过生物信息学方法预测miR-21-5P的靶基因为BNC2,双荧光素酶实验结果表明miR-21-5P与野生型BNC2′-UTR靶向结合,qRT-PCR和WB实验结果表示在食管癌细胞中,当miR-21-5P过表达时,BNC2的表达量降低,当miR-21-5P被敲低时,BNC2的表达量升高。这些结果显示miR-21-5P与BNC2存在靶向关系。结论:在食管癌中,miR-21-5p直接靶向BNC2,其调节作用可能从而导致癌症的增殖迁移和侵袭作用。

关键词：食管癌 miR⁃21⁃5P BNC2 预后肿瘤微环境

融入BOPPPS的混合式教学模式在医学免疫学中的应用

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中国免疫学杂志 2024年

作者：吴瑗赵汉宁赵祖国冯胜军米娜广东医科大学基础医学院

在信息快速发展的新时代，线上线下混合式教学模式将是今后教学模式发展的一个新方向。BOPPPS教学模式包括导入（B）、学习目标(O)、前测(P)、参与式学习(P)、后测(P)、总结(S)等六个模块。本文将BOPPPS理念融入到医学免疫学线上线下混... 详细信息

在信息快速发展的新时代，线上线下混合式教学模式将是今后教学模式发展的一个新方向。BOPPPS教学模式包括导入（B）、学习目标(O)、前测(P)、参与式学习(P)、后测(P)、总结(S)等六个模块。本文将BOPPPS理念融入到医学免疫学线上线下混合式教学过程中，依托“超星学习通”平台，将教学分为课前、课中、课后三个阶段，BOPPPS的前3个模块导入、学习目标、前测放在课前线上进行，后3个模块参与式学习、后测、总结则融合在课中线下课堂及课后线上开展。在教学过程中注重以学生为中心，师生全程交流互动，极大地提高了教学质量，可为后疫情时代医学院校开展混合式教学提供参考。

关键词：医学免疫学混合式教学 BOPPPS