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柯萨奇病毒A组19型VP1蛋白生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2024年第3期19卷 249-256,262页

作者：杨亚文冯琳琳陶玲徐银兰徐鹏卫晋乐飞吴卫东新乡医学院公共卫生学院河南新乡453003 新乡医学院三全学院医学检验学院郑州大学公共卫生学院

目的分析柯萨奇病毒A组19型(coxsackievirus A19,CVA-19)VP1蛋白的理化性质、结构功能并预测其线性B细胞表位和T细胞表位。方法应用ProtParam分析CVA-19 VP1蛋白的理化性质;ProtScale预测其亲疏水性;使用SignalP 6.0、DeepTMHMM、NetPhos-3.1和Motif Scan分别预测CVA-19 VP1蛋白的信号肽、跨膜结构域、磷酸化位点和脂酰化位点;利用NetCGlyc-1.0、NetNGlyc-1.0和NetOGlyc-4.0分别预测CVA-19 VP1蛋白的C-甘露糖基化位点、N-糖基化位点和O-N-乙酰半乳糖胺(N-acetylgalactosamine,GalNAc)(粘蛋白型)糖基化位点;通过SOPMA和SWISS-MODEL在线工具分别预测CVA-19 VP1蛋白的二级结构和三级结构;使用网络服务器IEDB、Bepipred 3.0、ABCpred和SVTMrip联合预测其线性B细胞表位;应用IEDB和SYFPEITHI综合预测其T细胞表位。结果CVA-19 VP1蛋白的分子质量为33.099 ku,等电点为5.84,不稳定系数为37.50,总平均亲水性为-0.185,是一种稳定的亲水性蛋白,无信号肽、跨膜区和脂酰化位点。预测该蛋白含有30个可能的磷酸化位点、1个N-糖基化位点和7个O-GalNAc(粘蛋白型)糖基化位点,但无C-甘露糖基化位点。CVA-19 VP1蛋白的二级结构中,α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占24.66%、24.32%、2.70%和48.31%,以无规则卷曲为主。预测出该蛋白有6个潜在优势线性B细胞表位、3个潜在优势细胞毒性T淋巴细胞表位和9个潜在优势辅助性T细胞表位。结论用生物信息学方法预测CVA-19 VP1蛋白为稳定的亲水性蛋白,含有多个潜在的优势线性B细胞表位和T细胞表位,为进一步鉴定其线性表位奠定了基础,有助于CVA-19的抗体制备和疫苗研发。

关键词：柯萨奇病毒A组19型 VP1蛋白抗原表位生物信息学

基于岗位胜任力的CBL法教学在研究生课程中的应用与实践

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医学动物防制 2024年第4期40卷 406-409页

作者：晁灵赵香梅梁海燕梁真真李玉春宋杰新乡医学院公共卫生学院河南新乡453003

目的了解岗位胜任力为导向的案例教学(case-based learning,CBL)法教学在研究生课程中的教学应用效果及满意度评价,探讨其在研究生教学中的应用价值。方法以河南省某医学院校2022级全日制医学研究生为研究对象,于2022年09月—2022年12... 详细信息

目的了解岗位胜任力为导向的案例教学(case-based learning,CBL)法教学在研究生课程中的教学应用效果及满意度评价,探讨其在研究生教学中的应用价值。方法以河南省某医学院校2022级全日制医学研究生为研究对象,于2022年09月—2022年12月分别对公共卫生专业和临床医学专业研究生采用基于岗位胜任力的CBL法教学以及传统线上教学,并对不同教学方法授课满意程度及教学效果进行评价。结果两组学生对CBL法教学总体满意度稍低于传统线上教学,差异无统计学意义(Z=-0.475,P>0.05)。各分项满意度如课程时间安排、设计形式、难易程度等两组学生,差异无统计学意义(Z=-0.365、-0.998、-0.506,P>0.05);教学效果方面CBL法教学平均成绩为(88.89±3.20)分,传统线上教学平均成绩为(85.80±6.65)分,差异有统计学意义(t=2.231,P=0.029)。结论采用岗位胜任力为导向的CBL法教学能够提高学生学习成绩,有助于培养学生解决实际问题的能力。

关键词：岗位胜任力案例教学公共卫生教学模式形成性评价

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基于肠道菌群调节的膳食纤维影响抑郁的研究

食品与发酵工业 2024年第9期50卷 307-313,329页

作者：白丽程晓宇许嘉乾余婕尹季忠黄涛崔晟轩刘辉解瑞宁乔艺潍坊医学院公共卫生学院山东潍坊261053 济宁医学院公共卫生学院山东济宁272000

由于工作和生活压力的增加,抑郁症的患病率也在逐年上升。肠道菌群作为人体的隐形器官,在人体生命健康中发挥着重要作用,近年来已成为生命科学领域的研究热点。随着对肠道菌群研究的不断深入,越来越多的证据表明:肠道菌群可以通过肠-脑... 详细信息

由于工作和生活压力的增加,抑郁症的患病率也在逐年上升。肠道菌群作为人体的隐形器官,在人体生命健康中发挥着重要作用,近年来已成为生命科学领域的研究热点。随着对肠道菌群研究的不断深入,越来越多的证据表明:肠道菌群可以通过肠-脑轴来改善抑郁症状。膳食纤维作为一种独特的植物多糖,可有效调节肠道菌群紊乱,其在协调宿主-微生物群串扰中的关键作用已被证实。该文综述了膳食纤维对肠道菌群和抑郁症影响的证据,重点研究了膳食纤维干预肠道菌群改善抑郁症的机制,以期为抑郁症的预防及辅助治疗提供新的思路和参考。

关键词：膳食纤维抑郁症肠道菌群短链脂肪酸色氨酸

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藜麦麸皮黄酒和普通黄酒的品质比较

食品工业科技 2024年第6期45卷 254-264页

作者：姜学敏张虹高慧蔡雨情赵雷薛鹏潍坊医学院公共卫生学院山东潍坊261053 潍坊医学院公共卫生检测检验中心山东潍坊261053

为探究加入藜麦麸皮是否会对发酵黄酒的物质组成、风味及其生物活性产生影响。利用传统自制陈伏曲发酵黄酒,设置普通黄酒组和藜麦麸皮黄酒组,利用原子吸收分光光度计测定两组酒样当中的重金属含量,采用液相色谱-质谱联用技术(High-Perfo... 详细信息

为探究加入藜麦麸皮是否会对发酵黄酒的物质组成、风味及其生物活性产生影响。利用传统自制陈伏曲发酵黄酒,设置普通黄酒组和藜麦麸皮黄酒组,利用原子吸收分光光度计测定两组酒样当中的重金属含量,采用液相色谱-质谱联用技术(High-Performance Liquid Chromatography Mass Spectrometer,HPLC-MS)和气相色谱-质谱联用技术(Gas Chromatography-Mass Spectrometer,GC-MS)分析比较两组黄酒的基本理化指标、差异化合物和风味物质,并对黄酒的抗氧化活性进行分析。结果表明,藜麦麸皮黄酒中的总皂苷以及总酚酸含量明显优于普通黄酒,且铅含量低于普通黄酒,两组黄酒中均未检测到黄曲霉毒素B1。两种黄酒中共有48种差异化合物,其中数量最多的为醇类和酰胺类物质,均为10种,其次为酸类物质4种以及糖类物质2种。GC-MS测得挥发性物质共有19种,直接进样有12种,顶空进样有12种,利用外标法一共标定出四种物质,在普通黄酒中的物质为甲酸丁酯、乙酸和丁酸含量分别为5.10±1.10、4.40±1.70、10.80±2.20μg/mL。在藜麦麸皮黄酒中的物质为甲酸丁酯、正丁醇、乙酸和丁酸含量分别是9.00±1.80、7.40±2.10、4.50±1.00、9.50±2.10μg/mL。抗氧化活性方面,藜麦麸皮黄酒和普通黄酒的Fe2+螯合率分别为45.79%和6.51%,酪氨酸酶抑制率分别为94.84%和71.11%,藜麦麸皮黄酒要明显优于普通黄酒。自制藜麦麸皮黄酒和普通黄酒相比,酒体中非挥发性物质以及挥发性的风味物质含量上升,抗氧化性提高。

关键词：黄酒藜麦麸皮差异化合物挥发性风味物质抗氧化活性

富马酸二甲酯通过Nrf2/HO-1信号通路缓解细颗粒物对雌性大鼠胎盘的氧化损伤

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中国生物化学与分子生物学报 2024年第2期40卷 231-239页

作者：李江珂董恩恒张丰泉张俊强伍源新乡医学院公共卫生学院新乡市大气污染健康效应与干预重点实验室河南新乡453003

近年来,已有大量的流行病学调查证实,孕产妇暴露于PM_(2.5)可能导致妊娠并发症和不良妊娠结局的风险增加。本研究旨在探讨孕前PM_(2.5)暴露对大鼠胎盘的损伤及富马酸二甲酯(dimethyl fumarate,DMF)对其调控机制。40只6周龄SPF级雌性SD大... 详细信息

近年来,已有大量的流行病学调查证实,孕产妇暴露于PM_(2.5)可能导致妊娠并发症和不良妊娠结局的风险增加。本研究旨在探讨孕前PM_(2.5)暴露对大鼠胎盘的损伤及富马酸二甲酯(dimethyl fumarate,DMF)对其调控机制。40只6周龄SPF级雌性SD大鼠,随机分为对照组(生理盐水)、低剂量PM_(2.5)组(1.5 mg/kg PM_(2.5))、高剂量PM_(2.5)组(7.5 mg/kg PM_(2.5))、DMF对照组(生理盐水+50 mg/kg DMF)和DMF干预组(7.5 mg/kg PM_(2.5)+50 mg/kg DMF)。大鼠每2 d染毒1次,共持续40 d。经PM_(2.5)暴露后,高剂量PM_(2.5)组胎鼠数量、胎鼠平均体长、超氧化物歧化酶(SOD)活性和总抗氧化能力(T-AOC)、白细胞介素-10(IL-10)含量明显低于对照组(P<0.05);丙二醛(MDA)含量高于对照组(P<0.05);经DMF处理后,DMF干预组的T-AOC含量显著高于高剂量PM_(2.5)组(P<0.01),能够明显缓解PM_(2.5)诱导的氧化损伤作用。H&E染色结果显示,暴露组胎盘组织迷路区血细胞有不同程度的减少,高剂量PM_(2.5)组血管脉络不清晰,DMF干预组胎盘迷路区的血细胞明显增多,血管脉络清晰整齐。Western印迹结果显示,低剂量PM_(2.5)组和高剂量PM_(2.5)组核因子E2相关因子(Nrf2)、血红素加氧酶1(HO-1)蛋白质水平低于对照组(P<0.01),与高剂量PM_(2.5)组相比,DMF干预组的Nrf2、HO-1蛋白质含量明显增高(P<0.05)。综上所述,DMF可能通过Nrf2/HO-1信号通路缓解孕前PM_(2.5)对胎盘造成的氧化损伤,提高机体的抗氧化能力。

关键词：细颗粒物富马酸二甲酯胎盘氧化损伤

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不同程度小于胎龄儿发生的影响因素分析

中国当代儿科杂志 2024年第3期26卷 262-268页

作者：张懿敏邵树铭于晨张晓蕊刘峥李洋洋秦炯北京大学人民医院儿科北京100044 新乡医学院河南新乡453003 北京大学公共卫生学院北京100191

目的探讨不同程度小于胎龄儿(small for gestational age,SGA)发生的影响因素,为早期识别重度SGA的发生提供依据。方法回顾性收集2018年1月—2022年12月北京大学人民医院产科出生的新生儿及其母亲围产期资料。新生儿分为重度SGA组(出生... 详细信息

目的探讨不同程度小于胎龄儿(small for gestational age,SGA)发生的影响因素,为早期识别重度SGA的发生提供依据。方法回顾性收集2018年1月—2022年12月北京大学人民医院产科出生的新生儿及其母亲围产期资料。新生儿分为重度SGA组(出生体重低于同胎龄同性别婴儿的第3百分位数)、轻度SGA组(出生体重≥第3百分位数且轻度SGA组>非SGA组(P<0.0125);重度SGA组与轻度SGA组新生儿窒息比例均大于非SGA组(P<0.0125)。有序多分类logistic回归分析显示:母孕前消瘦(OR=1.838)、母孕前肥胖(OR=3.024)、体外受精-胚胎移植(OR=2.649)、妊娠合并子痫前期(OR=1.743)、妊娠合并结缔组织病(OR=1.795)、脐带绕颈(OR=1.213)、羊水少(OR=1.848)、宫内生长受限(OR=27.691)等均与发生更严重的SGA有关(P<0.05);孕母为经产妇(OR=0.457)更倾向于不发生严重的SGA(P<0.05)。结论母孕前消瘦、母孕前肥胖、体外受精-胚胎移植、妊娠合并子痫前期、妊娠合并结缔组织病、羊水少、脐带绕颈、宫内生长受限与更严重的SGA发生密切相关;孕母为经产妇是发生严重SGA的保护因素。

关键词：小于胎龄儿危险因素体重指数经产妇新生儿

中国居民1990—2019年乙型病毒性肝炎及其危险因素所致疾病负担变化趋势分析

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中国公共卫生 2024年第5期40卷 593-597页

作者：张敏张裕晓江山佳美梁雅丽黄月娥皖南医学院公共卫生学院

目的分析中国居民1990—2019年乙型病毒性肝炎（乙肝）及其危险因素所致疾病负担的变化趋势，为乙肝的预防控制提供参考依据。方法收集2019年全球疾病负担研究（GBD 2019）中1990—2019年中国居民乙肝疾病负担及其危险因素相关数据，... 详细信息

目的分析中国居民1990—2019年乙型病毒性肝炎（乙肝）及其危险因素所致疾病负担的变化趋势，为乙肝的预防控制提供参考依据。方法收集2019年全球疾病负担研究（GBD 2019）中1990—2019年中国居民乙肝疾病负担及其危险因素相关数据，采用乙肝标化发病率、标化患病率、标化死亡率和标化伤残调整寿命年（DALYs）率等指标进行描述性分析，并采用Joinpoint回归模型分析中国居民1990—2019年乙肝及其吸烟、饮酒、吸毒和高体质指数4种危险因素所致疾病负担的变化趋势。结果中国居民1990—2019年乙肝标化发病率、标化患病率、标化死亡率和标化DALYs率均呈下降趋势（AAPC=–2.29%、–2.13%、–3.82%和–3.98%，均P <0.001），分别从1990年的2 725.98/10万、12 239.53/10万、24.67/10万和793.38/10万下降至2019年的1 397.31/10万、6 566.12/10万、8.07/10万和247.71/10万，下降速度虽快于全球居民但乙肝标化发病率、标化患病率、标化死亡率和标化DALYs率水平仍高于全球居民；不同性别居民乙肝标化发病率(AAPC男性=–2.14%和AAPC女性=–2.49%)、标化患病率(AAPC男性=–2.04%和AAPC女性=–2.26%)、标化死亡率(AAPC男性=–3.48%和AAPC女性=–4.82%)、标化DALYs率(AAPC男性=–3.63%和AAPC女性=–5.15%)整体均呈下降趋势（均P <0.001），且男性居民疾病负担高于女性居民；与1990年相比，2019年归因于吸烟、饮酒、吸毒和高体质指数的乙肝标化死亡率和标化DALYs率均呈下降趋势（均P <0.01），标化死亡率的变化率分别为–62.20%、–62.01%、–44.44%和–18.18%，标化DALYs率的变化率分别为–63.90%、–63.54%、–47.71%和–18.76%。结论中国居民1990—2019年乙肝疾病负担虽有下降但仍高于全球居民，对吸烟、饮酒、吸毒和高体质指数的男性居民仍需重点加以关注。

关键词：乙型病毒性肝炎(乙肝) 危险因素疾病负担变化趋势中国居民

基于关系融合和双向扩散模型的药物与靶标关系预测方法研究

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数据分析与知识发现 2024年第2期8卷 155-167页

作者：张云秋黄麒霏朱祥吉林大学公共卫生学院长春130021

【目的】提出了一种新的药物与靶标关系预测方法来提升预测性能。【方法】进一步丰富网络的语义信息,采用SNF、AVG和MAX方法分别对药物相似性网络和靶标相似性网络中的多种语义关系进行融合。基于关系融合后的相似性网络和已知的药物-... 详细信息

【目的】提出了一种新的药物与靶标关系预测方法来提升预测性能。【方法】进一步丰富网络的语义信息,采用SNF、AVG和MAX方法分别对药物相似性网络和靶标相似性网络中的多种语义关系进行融合。基于关系融合后的相似性网络和已知的药物-靶标互作网络构建双向扩散模型,以实现药物与靶标关系预测。【结果】实证研究表明,本文方法相较于主流的预测方法在AUC值指标上分别提升了2.2%和12.8%。并且通过对预测结果进行文献回溯,预测分数排在前10、20和30位的药物-靶标关系对中,可以分别在文献中找到3、8和11对药物-靶标的相关线索与证据。另外,SNF的融合效果最优,能够最大程度提高预测的性能。【局限】未融合药物或靶标客观属性上的相似性,如药物的化学结构或靶标的序列结构相似性,并且针对新药物和新靶标关系发现的冷启动问题仍待解决。【结论】本文提出的预测方法具有一定的优越性和有效性,可以为药物重定位以及其他生物医学实体的关系预测相关研究提供参考。

关键词：药物靶标机器学习 SNF

多色免疫组织化学技术在肿瘤标志物分析中的研究进展

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分析化学 2024年第3期52卷 313-322页

作者：杨马骏杨超杰贺月赵灿冀海伟王琦秦玉岭吴丽南通大学公共卫生学院

多色免疫组织化学（Multiplex immunohistochemistry, mIHC）技术是一种新型多靶点病理组织染色、成像及分析技术。该技术通过在单张组织切片上检测多种生物标志物的表达水平及空间分布，实现对细胞的表型、组成、形态及细胞间相互作用... 详细信息

多色免疫组织化学（Multiplex immunohistochemistry, mIHC）技术是一种新型多靶点病理组织染色、成像及分析技术。该技术通过在单张组织切片上检测多种生物标志物的表达水平及空间分布，实现对细胞的表型、组成、形态及细胞间相互作用机理的全面解析。近年来，mIHC技术被成功应用于肿瘤免疫研究领域，为肿瘤的诊断和治疗开辟了新的途径。本文从近年开发的mIHC检测技术出发，针对不同类型mIHC技术的检测原理及其特点进行了详细阐述，重点讨论了新型mIHC检测技术在肿瘤标志物及肿瘤微环境检测等领域中的应用，并对mIHC在肿瘤免疫诊断和治疗领域的应用前景和发展趋势进行了展望。

关键词：多色免疫组织化学荧光多色标记肿瘤诊断循环荧光成像评述