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茄科作物基因组内源病毒元件的分析鉴定

园艺学报 2024年第1期51卷 190-202页

作者：陈汝豪孟繁烨杨曼华陈家茹邹莹宋波涛马恢聂碧华果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室/农业农村部马铃薯生物学与生物技术重点实验室/华中农业大学园艺林学学院武汉430070 恩施土家族苗族自治州农业科学院/湖北恩施中国南方马铃薯研究中心湖北恩施445000 河北省张家口市农业科学院河北张家口075000

利用6个茄科物种的35个公开基因组数据进行了茄科基因组内源性病毒元件(endogenous viralelement,EVE)的挖掘。结果发现,主要来源于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)等共17种疑似的植物EVE。其中,烟草脉明病毒(tobacco vein clearing v... 详细信息

利用6个茄科物种的35个公开基因组数据进行了茄科基因组内源性病毒元件(endogenous viralelement,EVE)的挖掘。结果发现,主要来源于花椰菜花叶病毒科(Caulimoviridae)等共17种疑似的植物EVE。其中,烟草脉明病毒(tobacco vein clearing virus,TVCV)序列以大片段的形式普遍存于几乎所有收集的茄科植物基因组中,含量大约在0.01%~0.32%,片段平均长度范围为500~2300 bp,序列数量范围为200~5000条。以马铃薯DM1-3基因组为例分析这些TVCV内源序列的分布和组成,发现内源性TVCV序列在马铃薯DM 1-3的12条染色体上分散排布,平均每条染色体上有57条序列;这些内源病毒序列与TVCV基因组比对,虽然它们无法覆盖TVCV完整基因组序列,但是能够覆盖完整的编码区。进一步通过RT-PCR和原位杂交定位,验证了TVCV在马铃薯材料中的存在和分布。

关键词：茄科作物马铃薯基因组内源病毒元件烟草脉明病毒

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砜嘧磺隆在土壤中的动态消解规律

中国马铃薯 2024年第1期38卷 71-76页

作者：张等宏肖春芳王甄高剑华闫雷沈艳芬湖北恩施中国南方马铃薯研究中心湖北恩施445000 恩施土家族苗族自治州农业科学院湖北恩施445000

“薯/玉/豆”带状复合种植技术中,由于作物栽培时间和生育期不一致导致田间杂草管理难度较大,符合该技术的除草剂鲜有报道。砜嘧磺隆杀草谱广、选择性好,可较好应用到该技术中。为准确评价砜嘧磺隆在土壤中的残留动态,明确其在“薯/玉/... 详细信息

“薯/玉/豆”带状复合种植技术中,由于作物栽培时间和生育期不一致导致田间杂草管理难度较大,符合该技术的除草剂鲜有报道。砜嘧磺隆杀草谱广、选择性好,可较好应用到该技术中。为准确评价砜嘧磺隆在土壤中的残留动态,明确其在“薯/玉/豆”带状复合种植技术中应用的安全性,采用室内模拟试验,应用高效液相色谱法测定砜嘧磺隆在土壤中的残留。25%砜嘧磺隆水分散粒剂在施药量为0.5~2.0 mg/kg时,在土壤中半衰期为7.70~9.50 d,9.50 d内降解量为初始沉降剂量一半,在施药42 d后土壤残留量为0.0018~0.0090 mg/kg。为确保安全使用砜嘧磺隆,最大限度减轻除草剂造成的药害,施用砜嘧磺隆9.50 d后再栽培其他作物相对安全。

关键词：砜嘧磺隆残留动态高效液相色谱法半衰期土壤

致病疫霉PITG＿02860基因沉默及功能鉴定

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农业生物技术学报 2024年第6期32卷 1404-1414页

作者：王娜张杨倩谭晨徐裴罗展宏高建莉唐唯刘晶云南师范大学生命科学学院云南师范大学马铃薯科学研究院云南英茂现代农业有限公司文山州农业科学院

交配型是卵菌重要性状，致病疫霉(Phytophthora infestans)效应子PITG＿02860和A1交配型性状分离连锁。为进一步探索PITG＿02860基因功能，本研究首先改良了致病疫霉原生质体转化技术，以碗豆汁培养72 h的菌丝，采用复合酶(裂解酶, 10 m... 详细信息

交配型是卵菌重要性状，致病疫霉(Phytophthora infestans)效应子PITG＿02860和A1交配型性状分离连锁。为进一步探索PITG＿02860基因功能，本研究首先改良了致病疫霉原生质体转化技术，以碗豆汁培养72 h的菌丝，采用复合酶(裂解酶, 10 mg/m L;纤维素酶, 5 mg/m L)于26℃裂解45 min，原生质体制备率最高，为(31.5±2.36)个/μL；原生质体在黑麦培养基上再生率可达(3.34±0.20)%。依托该转化系统，以载体p TOR-m RFP为骨架，构建PITG＿02860基因沉默载体并转化致病疫霉88069菌株，对2个阳性沉默子进行功能验证，发现与野生型相比，沉默子有性生殖产生的卵孢子数量显著下降且卵孢子畸形率显著增高(P马铃薯(Solanum tuberosum)叶片致病能力显著降低(P马铃薯的重要毒性功能基因。本研究为明确致病疫霉有性生殖发生和解析致病疫霉对马铃薯的毒性机制提供了新思路。

关键词：致病疫霉原生质体转化基因沉默有性生殖

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恩施州马铃薯脱毒种薯产业化发展对策

湖北农业科学 2013年第22期52卷 5421-5422,5442页

作者：朱云芬程群李卫东沈艳芬徐怡恩施州农业科学院中国南方马铃薯研究中心农业部华中薯类观测实验站湖北恩施445002

围绕湖北省恩施土家族苗族自治州马铃薯(Solanum tuberosum L.)脱毒种薯产业的发展现状,详细分析了该产业在发展过程中出现的主要问题,并提出了相应的发展对策。

关键词：马铃薯(Solanum tuberosum L ) 脱毒种薯现状问题对策

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恩施州马铃薯连年增产原因及潜力分析

中国马铃薯 2001年第1期15卷 34-36页

作者：刘介民余柏胜袁明山覃大吉田恒林刘胜军舒荣春刘绍喜中国南方马铃薯研究中心湖北恩施445000 湖北恩施州农业局湖北恩施445000

1 前言湖北恩施土家族苗族自治州,位于鄂西南,属武陵山区,跨东经108°23′12″～110°38′08 ″,北纬29°7′10″～31°24′13″,东邻宜昌,南界湘西,西连重庆,北接神农架林区。海拔高度66.8～3032 m,为典型的立体农业。随着海拔升高,... 详细信息

1 前言湖北恩施土家族苗族自治州,位于鄂西南,属武陵山区,跨东经108°23′12″～110°38′08 ″,北纬29°7′10″～31°24′13″,东邻宜昌,南界湘西,西连重庆,北接神农架林区。海拔高度66.8～3032 m,为典型的立体农业。随着海拔升高,气候越趋冷凉,马铃薯种植面积也越大。全州马铃薯栽培面积在11.6万hm2左右,95%以上是与玉米套种。马铃薯产量占夏粮产量的75%,占全年粮食产量的1/4。马铃薯的丰歉直接关系到稳定解决农民的温饱和养殖业、加工业的发展，故此在农业生产上和农民生活中占有重要的地位。

关键词：马铃薯增产原因增产潜力恩施州脱毒种薯晚疫病防治育芽带薯移栽施肥良种推广

马铃薯脱毒种薯标准化生产技术研究——Ⅰ.不同密度栽培对块茎大小、单株结薯及产量的影响

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中国马铃薯 2001年第5期15卷 302-304页

作者：黄大恩田恒林田祚茂吴承金唐春风牟仁斌李大春南方马铃薯研究中心湖北恩施445000 恩施州太山庙马铃薯原种场

试验利用高海拔地区的气候特点和土壤肥沃疏松条件 ,将“鄂马铃薯 3号”脱毒试管苗直接进入田间土床培育 ,在高密植栽培条件下 ,生产标准种薯。经 9个处理的试验结果表明 :随着种植密度的增加 ,单位面积上的块茎数、无效薯增加 ,大薯率... 详细信息

试验利用高海拔地区的气候特点和土壤肥沃疏松条件 ,将“鄂马铃薯 3号”脱毒试管苗直接进入田间土床培育 ,在高密植栽培条件下 ,生产标准种薯。经 9个处理的试验结果表明 :随着种植密度的增加 ,单位面积上的块茎数、无效薯增加 ,大薯率降低。3～ 5 0 g结薯率最佳处理是F、H和C ,分别占83 5 0 %、83 81%和 84 5 0 % ;10 ～ 30 g结薯率最佳处理是E和F ,分别占总数的 4 3 96 %和 4 6 86 % ,产量最佳处理是E和F ,分别为 15 0 0kg/ 6 6 7m2 和 15 83kg/ 6 6 7m2 ,各处理间差异达极显著水平。单位面积结薯数与单位面积移栽株数呈极显著正相关 ,y =196 6 6 + 0 98x(r=0 98 ) ;单株结薯数与单位面积移栽株数呈极显著负相关 ,y=2 89- 0 0 0 2 2x(r =- 0 81 )。

关键词：鄂马铃薯3号脱毒试管苗马铃薯脱毒种薯标准化栽培密度块茎单株结薯产量

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小薯专用品种‘华薯16号’的结薯特性

中国马铃薯 2024年第1期38卷 38-44页

作者：王颖李晨曦夏军辉骆俊婷于斌武尹鑫宋波涛赵喜娟果蔬园艺作物种质创新与利用全国重点实验室/农村农业部马铃薯生物学与生物技术重点实验室华中农业大学湖北武汉430070 恩施州农业发展服务中心湖北恩施445000 湖南农业大学农学院湖南长沙410128

‘华薯16号’是小薯专用品种,具有小薯率高、食味优等诸多优良特性,明确其结薯特性有利于提高‘华薯16号’产量和品质。小薯品种‘华薯16号’和常规品种‘华薯1号’为试验材料,重点观测单株块茎数、主茎数、单株块茎鲜重等指标动态变化... 详细信息

‘华薯16号’是小薯专用品种,具有小薯率高、食味优等诸多优良特性,明确其结薯特性有利于提高‘华薯16号’产量和品质。小薯品种‘华薯16号’和常规品种‘华薯1号’为试验材料,重点观测单株块茎数、主茎数、单株块茎鲜重等指标动态变化。相比‘华薯1号’,小薯品种‘华薯16号’干物质积累延后,植株更繁茂;整个生育期内‘华薯1号’和‘华薯16号’单株平均结薯数分别为5个和18个,‘华薯16号’单株结薯数较多原因是其具有较多主茎数。‘华薯16号’生育期长,为提高小薯率可适当提前收获。

关键词：马铃薯结薯特性小薯结薯数华薯16号

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马铃薯组织间组成型和特异型表达基因的鉴定

云南师范大学学报（自然科学版） 2024年第3期44卷 20-26页

作者：王荣艳普金罗有卫谢文娟王娟祝光涛云南师范大学生命科学学院马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点试验室云南昆明650500 云南农业大学植物保护学院云南昆明650201 德宏州农业技术推广中心云南德宏678400

马铃薯是重要的粮食作物,而块茎不仅是收获器官也是主栽四倍体品种的繁殖器官,近年来逐渐兴起的二倍体杂交育种通过实生种子进行繁殖,使得研究其花和果实发育变得尤为重要.因此,鉴定马铃薯不同组织组成型和组织特异表达的基因对马铃薯... 详细信息

马铃薯是重要的粮食作物,而块茎不仅是收获器官也是主栽四倍体品种的繁殖器官,近年来逐渐兴起的二倍体杂交育种通过实生种子进行繁殖,使得研究其花和果实发育变得尤为重要.因此,鉴定马铃薯不同组织组成型和组织特异表达的基因对马铃薯基因功能和遗传改良具有重要意义.通过分析二倍体马铃薯自交系A6-26和E4-63不同组织(花、块茎、根、果实、叶和茎)的转录组数据,筛选到12个组成型表达基因,同时筛选了一批花、果实和薯块中特异表达的基因,并利用GO分析和KEGG富集分析对这些基因进行了功能分析.

关键词：马铃薯组成表达特异表达

转录组分析初步揭示脂质代谢在增强马铃薯***耐冻中的作用

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云南师范大学学报（自然科学版） 2024年第3期44卷 27-34页

作者：郑昊吉王玺尧吴玺袁力赵强彪高建莉郭磊祝光涛云南师范大学生命科学学院马铃薯科学研究院云南省马铃薯生物学重点实验室云南昆明650500 中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518000 文山州农业科学院云南文山663000

马铃薯(Solanum tuberosum L.)是全球最重要的块茎类粮食作物.全球极端气候的频发及马铃薯种植区域的扩大,使得马铃薯易受极端气候灾害的影响,其中冻害是马铃薯生产中常见的气候灾害之一.栽培马铃薯不耐霜冻,冻害一旦发生严重影响马铃... 详细信息

马铃薯(Solanum tuberosum L.)是全球最重要的块茎类粮食作物.全球极端气候的频发及马铃薯种植区域的扩大,使得马铃薯易受极端气候灾害的影响,其中冻害是马铃薯生产中常见的气候灾害之一.栽培马铃薯不耐霜冻,冻害一旦发生严重影响马铃薯的生产.通过对低温敏感和低温耐受的两种不同马铃薯材料进行低温处理,转录组测序,检测到的22717个基因中有7522个差异表达基因(DEGs),KEGG富集分析表明脂质代谢的DEGs被特异性富集,进一步分析发现磷酸乙醇胺胞苷转移酶1(PECT1)、过氧化物酶体3-酮酰辅酶A硫酰酶3(PKT3)、甾醇甲基转移酶2(SMT2)、甾醇甲基转移酶3(SMT3)和长链酰基-CoA合成酶8(LACS8)等5个脂质代谢途径中关键酶的编码基因在低温处理后表达量上调,与抗寒性高度相关.

关键词：马铃薯抗寒性转录组脂质代谢