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基于网络药理学及实验验证探讨胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础及作用机制

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药物资讯 2024年第2期13卷 56-67页

作者：赵桂玉秦艺文戴文娟陈广玲吴黎川韦金锐广西大学医学院广西南宁广西中医药大学广西中医药科学实验中心广西南宁

目的探究胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础及作用机制。方法利用CCK-8及transwell实验检测胃宁颗粒对胃癌细胞增殖及迁移的影响;通过液相色谱–质谱联用及蛋白质组技术分别获得胃宁颗粒活性成分及差异表达蛋白;通过网络药理学及Cytoscape 3.... 详细信息

目的探究胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础及作用机制。方法利用CCK-8及transwell实验检测胃宁颗粒对胃癌细胞增殖及迁移的影响;通过液相色谱–质谱联用及蛋白质组技术分别获得胃宁颗粒活性成分及差异表达蛋白;通过网络药理学及Cytoscape 3.9.1软件构建胃宁颗粒活性成分–靶点–胃癌网络;利用GO/KEGG开展富集分析;利用分子对接阐明关键核心靶点与活性成分的相互作用。结果共筛选出胃宁颗粒治疗胃癌有效成分23个,作用靶点19个;PI3K-Akt及凋亡通路可能是胃宁颗粒治疗胃癌的主要作用通路;VEGFA、BCL2L1及CDK4可能是胃宁颗粒治疗胃癌的关键靶点。结论刺芒柄花素、槲皮素、莪术二酮可能是胃宁颗粒治疗胃癌的物质基础,与调控VEGFA、BCL2L1及CDK4信号通路有关。

关键词：胃宁颗粒胃癌网络药理学分子对接作用机制

基于渐进式生成对抗网络的农作物病虫害细粒度分类

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中国农机化学报 2024年第3期45卷 156-162,218,F0002页

作者：邓昀冯琦尧牛照文康燕萍桂林理工大学信息科学与工程学院广西桂林541004 广西嵌入式技术与智能系统重点实验室广西桂林541004

随着深度学习应用的普及和飞速发展,基于深度学习的图像识别方法广泛应用于农作物病虫害领域,但大部分的神经网络重视识别准确率的提高,却忽略神经网络庞大的参数计算量。为解决这个问题,基于渐进式生成对抗网络判别器模型和卷积注意力... 详细信息

随着深度学习应用的普及和飞速发展,基于深度学习的图像识别方法广泛应用于农作物病虫害领域,但大部分的神经网络重视识别准确率的提高,却忽略神经网络庞大的参数计算量。为解决这个问题,基于渐进式生成对抗网络判别器模型和卷积注意力模块,提出一种改进的渐进式生成对抗网络判别器CPDM网络模型对农作物病虫害进行识别。通过对渐进式生成对抗网络判别器网络结构的调整,采用均衡学习率、像素级特征向量归一化和卷积注意力模块增强CPDM网络模型的特征提取能力,提高对真实图片的识别准确率。试验在PlantVillage数据集上进行,将该模型与VGG16、VGG19和ResNet18进行比较,得到TOP-1准确率分别为99.06%、96.50%、96.65%、98.86%,分别提高2.56%、2.41%、0.2%,且参数量仅为8.2 M。试验证明提出的CPDM网络模型满足在保证分类准确率的基础上,有效控制神经网络参数计算量的目的。

关键词：农作物病虫害渐进式生成对抗网络卷积注意力模块细粒度分类

miR-15b-5p通过下调BDNF/TrkB/PSD95表达参与PD中抑郁样行为发生

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中华神经医学杂志 2024年第7期23卷 649-658页

作者：罗汉将吴城荔朱金勇陈敏桂林医学院附属医院神经科学实验室广西神经系统疾病临床医学研究中心广西脑与认知神经科学重点实验室桂林541001

目的探讨miR-15b-5p参与PD中抑郁样行为发生的机制。方法(1)将18只C57BL/6N小鼠按随机数字表法分为PD组、干预组及对照组,每组6只。PD组小鼠通过脑立体定位仪将0.25 mg/kg鱼藤酮注射至右侧纹状体以制备PD模型,干预组小鼠接受0.25 mg/kg... 详细信息

目的探讨miR-15b-5p参与PD中抑郁样行为发生的机制。方法(1)将18只C57BL/6N小鼠按随机数字表法分为PD组、干预组及对照组,每组6只。PD组小鼠通过脑立体定位仪将0.25 mg/kg鱼藤酮注射至右侧纹状体以制备PD模型,干预组小鼠接受0.25 mg/kg鱼藤酮及miR-15b-5p抑制物慢病毒注射,对照组小鼠注射等体积PBS。4周后进行旷场实验及转棒实验评价小鼠的运动能力,进行糖水偏好实验及强迫游泳实验评价小鼠的抑郁样行为表现,然后提取小鼠黑质及纹状体中相关蛋白及miRNAs,进行Western blotting实验、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)实验以及免疫荧光染色实验检测相关指标[miR-15b-5p、酪氨酸羟化酶(TH)、脑源性神经营养因子(BDNF)、原肌球蛋白受体激酶B(TrkB)、突触后密度蛋白95(PSD95)]。(2)将100 nmol/L miR-15b-5p模拟物/抑制物序列及各自阴性对照序列分别转染至6孔板上SH-SY5Y细胞中(分别命名为miR-15b-5p模拟物组、miR-15b-5p模拟物对照组及miR-15b-5p抑制物组、miR-15b-5p抑制物对照组),48 h后进行Western blotting实验及qRT-PCR实验,以检测BDNF、TrkB、PSD95蛋白及miR-15b-5p表达改变。(3)将100 ng BDNF 3'端非编码区(3'-UTR)野生型或突变型荧光素酶报告载体质粒以及100 nmol/L miR-15b-5p模拟物/抑制物序列及各自阴性对照序列共转染至24孔板上SH-SY5Y细胞中,得到相应8组细胞,48 h后进行荧光素酶报告载体活性检测实验,以检测各组细胞的荧光素酶活性。结果(1)与对照组相比,PD组小鼠的运动速度明显减慢、落棒潜伏期明显缩短、糖水偏好百分比明显降低、不动时间明显增加;与PD组相比,干预组小鼠的运动速度明显提高、落棒潜伏期明显延长、糖水偏好百分比明显升高,不动时间明显减少;差异均有统计学意义(P<0.05)。(2)与miR-15b-5p模拟物对照组比较,miR-15b-5p模拟物组细胞中miR-15b-5p表达明显升高,BDNF、TrkB、PSD95表达明显降低(100.00±5.75 vs.66.79±5.90;100.00±5.95 vs.84.46±5.77;100.00±7.02 vs.80.43±3.25);与miR-15b-5p抑制物对照组比较,miR-15b-5p抑制物组细胞中miR-15b-5p表达明显降低,BDNF、TrkB、PSD95表达明显升高(100.00±6.81 vs.119.90±5.66;100.00±2.88 vs.110.10±4.15;100.00±2.19 vs.124.60±11.69);差异均有统计学意义(P<0.05)。与对照组相比,PD组小鼠黑质中miR-15b-5p表达明显增加,TH、BDNF、TrkB、PSD95表达明显降低(100.00±9.20 vs.63.60±12.80;100.00±9.88 vs.71.95±10.00;100.00±5.16 vs.70.37±8.43;100.00±7.01 vs.68.12±10.22),BDNF荧光强度明显降低(100.00±12.99 vs.48.23±12.58);与PD组相比,干预组小鼠黑质中miR-15b-5p表达明显降低,TH、BDNF、TrkB、PSD95表达明显升高(63.60±12.80 vs.90.69±9.84;71.95±10.00 vs.93.31±4.50;70.37±8.43 vs.88.11±4.10;68.12±10.22 vs.89.59±5.93),BDNF荧光强度明显升高(48.23±12.58 vs.83.65±10.52);差异均有统计学意义(P<0.05)。(3)与BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p模拟物对照组比较,BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p模拟物组细胞中荧光素酶活性明显降低(100.00±5.07 vs.90.59±1.75);与BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p抑制物对照组比较,BDNF 3'-UTR野生型+miR-15b-5p抑制物组细胞中荧光素酶活性明显升高(100.00±5.08 vs.152.20±31.87);差异均有统计学意义(P<0.05)。结论miR-15b-5p通过下调BDNF/TrkB/PSD95表达参与PD中抑郁样行为发生。

关键词：帕金森病抑郁 miR-15b-5p 脑源性神经营养因子突触可塑性

城市街道景观色彩对游客情感感知影响——基于街景图像的研究

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地球信息科学学报 2024年第2期26卷 514-529页

作者：齐子吟李君轶贺哲杨喜平陕西师范大学地理科学与旅游学院西安710119 陕西省旅游信息科学重点实验室西安710119

街道是城市旅游的重要吸引物,探讨街道景观色彩特征对游客情感感知的影响,对城市街道景观合理规划和布局具有重要的参考价值。本研究以西安市主要建成区为案例地,运用全卷积神经网络(FCN)和随机森林(RF)算法,构建街景图像情感感知数据集... 详细信息

街道是城市旅游的重要吸引物,探讨街道景观色彩特征对游客情感感知的影响,对城市街道景观合理规划和布局具有重要的参考价值。本研究以西安市主要建成区为案例地,运用全卷积神经网络(FCN)和随机森林(RF)算法,构建街景图像情感感知数据集,基于街景图像利用机器学习对街道景观的色彩特征进行提取,构建色彩量化指标并将其进行空间可视化;最后,运用随机森林回归算法探讨街道景观色彩特征与游客情感感知之间的关系,并得出最佳色彩特征参数。结果表明:(1)游客情感感知具有明显的空间分布格局,美丽和活泼情感由中心区域向外逐渐增加,安全和富有在主城区外二环以内区域得分较高,无聊在该范围内则较低,压抑情感由中心区域向外逐渐降低,游客在非惯常环境中的情感感知与居民在惯常环境中的情感感知在空间分布上具有一定的同质性;(2)街道景观色彩特征与游客情感感知呈现出复杂的非线性关系。色彩复杂度对美丽和活泼的影响小于色彩协调度,对无聊、压抑、安全、富有的影响大于色彩协调度,当色彩复杂度取值为0.86,色彩协调度取值为0.84时,游客在六个维度可以获得较好的情感感知;(3)一般情况下,街道景观色彩特征越显著,越能够带给游客较好的情感感知。研究在理论上印证了环境色彩越协调,游客体验感越好这一结论;在方法上,丰富了街景大数据和机器学习方法在旅游情感领域的应用。本研究为城市管理者了解游客的街道景观视觉偏好以及优化街道景观设计提供参考。

关键词：城市街道街景图像色彩特征情感感知机器学习 GIS 全卷积神经网络随机森林

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内窥环境下多光谱血氧饱和度检测

光学学报 2024年第2期44卷 246-253页

作者：章昶威邹鸿博齐伟明朱文武王立强袁波浙江大学光电信息科学与工程学院浙江杭州310027 浙江省医疗器械审评中心浙江杭州310009 之江实验室类人感知研究中心浙江杭州311100

采用蒙特卡罗模拟技术对血管组织在可见光波段的多光谱成像进行建模仿真,通过分析不同血氧饱和度下血液后向散射功率的绝对值、相对值、绝对差值和对比度,并考虑可能的干扰因素,优选出适合内窥环境下使用的450 nm、525 nm、630 nm和660 ... 详细信息

采用蒙特卡罗模拟技术对血管组织在可见光波段的多光谱成像进行建模仿真,通过分析不同血氧饱和度下血液后向散射功率的绝对值、相对值、绝对差值和对比度,并考虑可能的干扰因素,优选出适合内窥环境下使用的450 nm、525 nm、630 nm和660 nm 4个成像波段。基于4个优选的成像波段展开了血氧饱和度检测的实验验证。在血管仿体组织上的实验结果表明,在95%的置信水平下,血氧饱和度的检测偏差为1.24%。研究结果验证了利用四波段进行内窥组织血氧饱和度检测的可行性。

关键词：医用光学多光谱成像内窥镜血氧饱和度蒙特卡罗仿真

MEBT/MEBO通过调控TXNIP/NLRP3/Caspase-1信号通路促进糖尿病创面愈合

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海南医学院学报 2024年

作者：姚明哲竺仕林李文武杨雅量葛星月唐乾利右江民族医学院研究生院右江民族医学院附属医院生命科学与临床医学研究中心广西中医药大学/广西中医药科学实验中心

目的:探讨湿润暴露疗法/湿润烧伤膏（Moist exposed burn therapy/Moist exposed burn ointment， MEBT/MEBO）对糖尿病创面中TXNIP/NLRP3/Caspase-1信号通路表达的影响。方法:将48只Wistar雄性大鼠随机平均分为对照组、模型组、美宝组... 详细信息

目的:探讨湿润暴露疗法/湿润烧伤膏（Moist exposed burn therapy/Moist exposed burn ointment， MEBT/MEBO）对糖尿病创面中TXNIP/NLRP3/Caspase-1信号通路表达的影响。方法:将48只Wistar雄性大鼠随机平均分为对照组、模型组、美宝组和贝复新组。其中对照组构建急性创面模型，其余组构建糖尿病创面模型。随后美宝组和贝复新组分别采用湿润烧伤膏和重组牛碱性成纤维生长因子进行换药，对照组及模型组采取生理盐水进行换药。通过HE染色、免疫荧光法及实时荧光定量PCR检测观察各组创面第3、7、14天愈合情况及TXNIP、NLRP3及Caspase-1表达情况。结果:（1）治疗第3天，对照组创面愈合率高于模型组，且具有差异性（P<0.05）；治疗第7、14天，对照组、美宝组和贝复新组创面愈合率高于模型组(P<0.05)。（2）治疗第3、7、14天，对照组、美宝组和贝复新组的TXNIP、NLRP3表达量低于模型组（P<0.05）：治疗第3、7、14天，对照组和美宝组的Caspase-1表达量低于模型组（P<0.05）。结论:MEBT/MEBO可通过抑制TXNIP/NLRP3/Caspase-1通路表达，减轻糖尿病创面的炎症反应，从而促进糖尿病创面的愈合。

关键词：湿润暴露疗法/湿润烧伤膏(MEBT/MEBO) 糖尿病创面 TXNIP NLRP3 Caspase-1

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一个单参数随机拟牛顿算法

应用数学 2024年第3期37卷 706-717页

作者：袁功林莫中宇罗珍华广西大学数学与信息科学学院广西南宁530004 广西大学广西应用数学中心广西南宁530004

本文设计一个单参数随机拟牛顿算法,证明该算法的收敛性并分析了复杂性,对非凸经验风险最小化问题进行数值实验,验证了算法的有效性和竞争性。

关键词：单参数随机拟牛顿收敛性复杂性非凸

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基于熵的微阵列数据特征选择

广西大学学报（自然科学版） 2024年第3期49卷 637-643页

作者：邓蕊欣李达金德泉广西大学数学与信息科学学院广西南宁530004

针对基于熵的特征加权算法忽略了数据集内在特性对特征重要性的影响,导致特征选择效果不佳的问题,提出一种改进的基于熵的特征加权算法,根据信息熵计算特征维度的重要性权重,通过引入交叉验证实现不同数据集的阈值学习,确定用于度量特... 详细信息

针对基于熵的特征加权算法忽略了数据集内在特性对特征重要性的影响,导致特征选择效果不佳的问题,提出一种改进的基于熵的特征加权算法,根据信息熵计算特征维度的重要性权重,通过引入交叉验证实现不同数据集的阈值学习,确定用于度量特征重要性的最佳阈值参数,并基于该阈值对数据集进行特征选择。在微阵列数据集上的数值实验结果表明:相比于原算法,所提算法能够减少更多的维度,且特征子集用于分类得到的准确率与原算法基本持平甚至有所提高,说明改进的算法是可行和有效的。

关键词：特征选择微阵列数据分类信息熵交叉验证

氮添加对红锥不同序级细根形态和化学性状的影响

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植物生态学报 2024年第1期48卷 103-112页

作者：舒韦维杨坤马俊旭闵惠琳陈琳刘士玲黄日逸明安刚明财道田祖为中国林业科学研究院热带林业实验中心广西凭祥532600 广西友谊关森林生态系统国家定位观测研究站广西凭祥532600

细根作为植物养分获取和能量运输的重要器官,是根系中最活跃和最敏感的部分,其功能属性沿环境梯度的变化规律能够反映植物对资源的利用策略及对环境变化的适应性。该研究旨在解析不同氮(N)添加水平对红锥(Castanopsishystrix)细根形态... 详细信息

细根作为植物养分获取和能量运输的重要器官,是根系中最活跃和最敏感的部分,其功能属性沿环境梯度的变化规律能够反映植物对资源的利用策略及对环境变化的适应性。该研究旨在解析不同氮(N)添加水平对红锥(Castanopsishystrix)细根形态、化学性状的影响,探究红锥细根对短期N添加的可塑性,为阐明和预测全球气候变化背景下植物根系生理功能变化提供理论支撑。2020年1月,在红锥林内设置4个N添加水平样地:对照(CK,0 kg·hm^(-2)·a^(-1))、低氮(LN,50 kg·hm^(-2)·a^(-1))、中氮(MN,100 kg·hm^(-2)·a^(-1))、高氮(HN,150 kg·hm^(-2)·a^(-1)),每个处理3个重复。利用挖掘法挖取红锥根系,测定其1-5级根在不同N添加水平处理下细根比根长(SRL)、比表面积(SRA)、组织密度(RTD)、平均直径(RD)和化学计量的变化。结果表明,与CK相比,MN、HN显著降低了土壤pH,HN显著增加了土壤硝态氮(NO_(3)^(-)-N)和全磷(P)含量;N添加显著增加了1级细根的碳(C)含量;HN显著增加了2级细根C含量;MN和HN显著增加了1、2级细根的N含量,但显著降低了2级细根的C:N;不同N添加水平下细根的SRL、SRA、RTD和RD均无显著差异。因此短期N添加主要影响细根的元素含量及其化学计量比,而未显著影响细根的形态性状,这些结果将有助于理解南亚热带地区森林地下养分循环以及碳固存对全球环境变化的响应。

关键词：根序氮添加细根形态性状可塑性