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基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析

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南方医科大学学报 2024年第3期44卷 605-616页

作者：梁一豪赖颖君袁燕文袁炜张锡波张拔山卢志锋南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)检验科广东东莞523059 南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)消化内科广东东莞523059 南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)病理科广东东莞523059

目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和... 详细信息

目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。

关键词：胃癌基因芯片生物信息学分析差异表达基因分子标志物

IgA肾病预后的影响因素及相关评估模型的研究进展

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中华肾脏病杂志 2024年第6期40卷 499-505页

作者：唐天威叶智明李锐钊广东省心血管病研究所广东省人民医院广东省医学科学院广州510080 广东省人民医院肾内科南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)广州510080 广东省人民医院赣州医院(赣州市立医院)肾内科赣州341000

IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)是最常见的原发性肾小球疾病,也是肾脏病患者进展至终末期肾病的主要原因。多项临床、病理、人口学指标及近年来研究者们发现的新型指标在IgAN预后评估中扮演着重要角色。综合多项指标建立预后评估模型来... 详细信息

IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)是最常见的原发性肾小球疾病,也是肾脏病患者进展至终末期肾病的主要原因。多项临床、病理、人口学指标及近年来研究者们发现的新型指标在IgAN预后评估中扮演着重要角色。综合多项指标建立预后评估模型来早期识别疾病进展风险高的患者具有重要临床意义。该文综述了IgAN患者预后的影响因素及相关评估模型的研究进展。

关键词：肾小球肾炎,IgA 预后危险因素评估模型

早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的相关因素分析及转移风险评估

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中国普通外科杂志 2024年第7期33卷 1192-1198页

作者：徐国栋李冰黄绮国广东省揭阳市人民医院乳腺中心广东揭阳522000

背景与目的:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,腋窝淋巴结转移是乳腺癌预后的重要指标。前哨淋巴结活检(SLNB)是一种检测早期乳腺癌腋窝淋巴结转移状态的新方法,当前哨淋巴结(SLN)阳性时临床上需将非前哨淋巴结(NSLN)清扫,避免腋窝淋巴结... 详细信息

背景与目的:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,腋窝淋巴结转移是乳腺癌预后的重要指标。前哨淋巴结活检(SLNB)是一种检测早期乳腺癌腋窝淋巴结转移状态的新方法,当前哨淋巴结(SLN)阳性时临床上需将非前哨淋巴结(NSLN)清扫,避免腋窝淋巴结癌组织残留。但是临床实践中笔者发现,SLN阳性患者中只有部分NSLN阳性,而由于缺乏可预判NSLN是否阳性的手段,通常选择无差别将NSLN切除。这种做法使得部分患者丧失保留NSLN机会,增加患者创伤导致患侧肢体功能受限以及远期淋巴水肿的发生。因此,本研究分析早期乳腺癌患者的临床病理特征,筛选出影响NSLN转移的危险因素,并建立对应的预测模型,希望获得可靠预测NSLN转移风险的工具,为将来部分NSLN转移低风险患者豁免NSLN切除提供依据。方法:选取140例在广东省揭阳市人民医院就诊的早期乳腺癌且术中病理活检提示SLN阳性的患者,以7∶3按照随机数字表法将其分为训练集(98例)和验证集(42例)。将训练集患者分为NSLN阳性组(30例)和NSLN阴性组(68例)。经单因素及多因素Logistic回归分析影响早期乳腺癌患者NSLN转移的因素,构建预测模型评估NSLN转移风险,绘制拟合优度曲线及ROC曲线评估模型的价值。结果:多因素Logistic回归分析显示,年龄(OR=3.106,95%CI=1.387~6.956)、肿瘤直径>2 cm(OR=2.889,95%CI=1.427~5.847)、脉管癌栓(OR=3.147,95%CI=1.490~6.646)及人表皮生长因子受体2(HER-2)阳性(OR=3.051,95%CI=1.306~7.128)为影响早期乳腺癌发生NSLN转移的因素(均P2 cm、脉管癌栓及HER-2阳性是影响早期乳腺癌NSLN转移的因素,以此构建的预测模型具有较好的区分度及有效性,可作为临床评估NSLN转移风险发生的有效工具。

关键词：非前哨淋巴结早期乳腺癌影响因素预测模型

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镇痛分娩——准妈妈的福音

家庭生活指南 2024年第1期 65-66页

作者：陈颖诗广东省东莞市人民医院

产妇在分娩过程中，由于子宫收缩会使腰骶部、会阴部出现强烈的疼痛症状，加上产妇面对分娩时存在恐惧、紧张的心理，心理负担较重。在产妇生产过程中采用镇痛分娩的方式能取得良好效果，不仅能减轻患者的疼痛感，还能节省产妇体力，加...

产妇在分娩过程中，由于子宫收缩会使腰骶部、会阴部出现强烈的疼痛症状，加上产妇面对分娩时存在恐惧、紧张的心理，心理负担较重。在产妇生产过程中采用镇痛分娩的方式能取得良好效果，不仅能减轻患者的疼痛感，还能节省产妇体力，加快产程。下面对产妇镇痛分娩的相关知识进行介绍，为孕产妇提供一些参考。

关键词：

心电动力学图对急性冠脉综合征患者早期诊断的价值

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中华危重病急救医学 2024年第3期36卷 266-272页

作者：龚秀冰顾亚楠蒋湘粤窦清理深圳市宝安区人民医院急诊科广东深圳518000 广东省清远市人民医院重症医学科广东清远511500

目的探讨由心电图(ECG)数据通过径向基函数(RBF)神经网络学习获得的心电动力学图(CDG)对急性冠脉综合征(ACS)患者早期诊断的价值。方法采用回顾性分析方法,选择2021年10月至2022年9月于深圳市宝安区人民医院急诊科就诊的以胸痛为主要首... 详细信息

目的探讨由心电图(ECG)数据通过径向基函数(RBF)神经网络学习获得的心电动力学图(CDG)对急性冠脉综合征(ACS)患者早期诊断的价值。方法采用回顾性分析方法,选择2021年10月至2022年9月于深圳市宝安区人民医院急诊科就诊的以胸痛为主要首发症状的患者,根据出院诊断结果分为ACS组和非ACS组。收集患者的基线资料,包括性别、年龄、吸烟史、冠心病家族史及高血压、糖尿病、高脂血症、血管粥样硬化病史;记录患者入急诊科后首份12导联ECG,对其进行心电动力学分析生成CDG。绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线),分析CDG及ECG对ACS和非ST段抬高急性冠脉综合征(NSTE-ACS)的早期诊断价值,计算敏感度、特异度、ROC曲线下面积(AUC)及其95%可信区间(95%CI)。观察并分析3例ECG正常的ACS患者的CDG和冠脉造影结果;对ECG正常但CDG阳性的非ACS患者进行30 d心血管不良事件随访。结果共纳入384例胸痛患者,其中ACS患者169例,非ACS患者215例。ACS组男性比例(87.0%比53.0%)、吸烟史比例(37.9%比12.1%)及高血压(46.2%比22.3%)、糖尿病(24.3%比7.9%)、高脂血症(55.0%比14.0%)、血管粥样硬化病史比例(22.5%比2.3%)均明显高于非ACS组(均P<0.05)。ROC曲线显示,CDG诊断ACS的AUC高于ECG〔AUC(95%CI):0.88(0.66~0.76)比0.71(0.84~0.92)〕,敏感度分别为92.8%、78.6%,特异度分别为83.3%、64.2%;CDG诊断NSTE-ACS的AUC高于ECG〔AUC(95%CI):0.85(0.80~0.90)比0.63(0.56~0.69)〕,敏感度分别为87.1%、61.3%、特异度分别为83.3%、64.2%。3例ECG正常的ACS患者的CDG均呈散乱无序状态,冠脉造影检查均提示冠脉主要分支存在≥70%的狭窄。215例非ACS患者中,有20例ECG正常但CDG表现为阳性的患者,随访结果显示,其中有3例在30 d内发生ST段抬高心肌梗死(STEMI),2例在30 d内发生不稳定型心绞痛(UA)。结论CDG在早期诊断ACS患者方面具有较高的价值,有望成为急诊科早期诊断ACS的重要手段。

关键词：急性冠脉综合征心电动力学图神经网络学习人工智能心电图

2014-2020年广东省不同年龄段结核病患者耐药特征及应对防治策略

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实用医学杂志 2024年第5期40卷 702-707页

作者：卓文基魏然陈燕梅陈珣珣余美玲郭卉欣梁鸿迪梁静赖晓宇广东省结核病控制中心广州510630 东莞市第六人民医院广东东莞523129

目的探究2014-2020年广东省期间各年龄段结核病患者的耐药特征与应对防治策略。方法以2014-2020年广东省32个结核病耐药监测点中,确诊结核病患者的39 048株结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis, MTB)临床分离株为研究对象,回顾... 详细信息

目的探究2014-2020年广东省期间各年龄段结核病患者的耐药特征与应对防治策略。方法以2014-2020年广东省32个结核病耐药监测点中,确诊结核病患者的39 048株结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis, MTB)临床分离株为研究对象,回顾性分析耐药结核病患者及实验室相关资料,并以年龄、地区进行分组,探讨MTB临床分离株对药物的耐药性趋势、耐药结核病(包括单耐药结核病(monodrug-resistant tuberculosis, MR-TB)、多耐药结核病(poly-resistant tuberculosis, PDR-TB)、耐多药结核病(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)和广泛耐药结核病(extensively drug-resistant tuberculosis, XDRTB)的发病率差异,以及MTB临床分离株对重点药物(利福平和氧氟沙星)的耐药情况。结果 2014-2020年广东省32个结核病耐药监测点患者MTB临床分离株对9种抗结核药物在不同年度间、不同年龄段间的耐药率差异均无统计学意义(均P> 0.05)。MTB临床分离株的单耐药率、多耐药率、耐多药率、广泛耐药率和总耐药率分别为14.46%、5.16%、4.58%、1.29%。儿童组患者MTB临床分离株单耐药率(15.4%)高于青壮年组及老年组;青壮年组(5.0%)和老年组(5.0%)患者MTB临床分离株耐多药率高于儿童组患者;老年组患者MTB临床分离株广泛耐药率(2.1%)高于儿童组及青壮年组,差异均有统计学意义(P 广东省耐药结核病的流行趋势平缓。但在特定人群(如儿童和老年人)中,耐药结核病的发病率较高,且珠三角地区的耐药结核病发病率和重点药物耐药率均高于广东省其他地区,值得进一步关注和采取防控策略。

关键词：结核病耐多药结核病抗结核药物珠三角地区结核病防控

华为云ModelArts平台驱动的AI辅助诊断系统在宫颈液基细胞学非典型病变检出中的应用研究

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西安交通大学学报（医学版） 2024年第5期45卷 851-858页

作者：温永琴张若愚李先蕾许华徐咏强南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)病理科/东莞市临床病理重点实验室广东东莞523000

目的探索并验证基于华为云ModelArts平台构建的深度学习模型在宫颈液基细胞学(liquid-based cytology,LBC)非典型细胞诊断中的应用价值,并评估其对不同诊断经验医师的辅助效果。方法回顾性分析2020年东莞市人民医院1044例宫颈脱落细胞... 详细信息

目的探索并验证基于华为云ModelArts平台构建的深度学习模型在宫颈液基细胞学(liquid-based cytology,LBC)非典型细胞诊断中的应用价值,并评估其对不同诊断经验医师的辅助效果。方法回顾性分析2020年东莞市人民医院1044例宫颈脱落细胞学标本,采用华为云ModelArts平台开发的人工智能(artifical intelligence,AI)辅助诊断系统与初级、中级、高级医师进行诊断比对,计算灵敏度、特异度、精确率、符合率、曲线下面积(area under the curve,AUC)等指标,评估AI系统的诊断效能及其对不同年资医师的辅助诊断效果。采用McNemar检验比较AI系统与人工诊断的差异。结果在1044例宫颈脱落细胞学标本中,AI系统在非典型细胞检出的灵敏度和特异度分别为98.96%和89.15%,均高于初级医师(81.95%和91.81%)。AI系统的总体诊断精确率为93.68%,显著高于初级医师(87.26%,P<0.001)。AI辅助可显著提高初级医师的诊断性能,灵敏度从80.1%提升至96.5%,特异度从85.6%提升至92.3%。结论本研究构建的AI辅助宫颈细胞学诊断系统性能优越,尤其能显著提高初级医师的诊断水平,具有良好的临床应用前景。

关键词：宫颈癌液基细胞学(LBC) 非典型鳞状细胞深度学习华为云ModelArts 创新应用辅助诊断

入院前使用二甲双胍对糖尿病合并脓毒症患者临床结局的影响

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中国全科医学 2024年第9期27卷 1034-1041页

作者：何宇福佟文英王芳李丽霞何俊冰邵义明广东医科大学附属东莞第一医院重症医学科广东省东莞市523940 广东医科大学研究生院广东省湛江市524000 广东省揭阳市人民医院揭阳市医学科研中心实验室 522000

背景越来越多的证据表明,入院前使用二甲双胍可降低糖尿病合并脓毒症患者的死亡率,然而,二甲双胍对糖尿病合并脓毒症患者临床结局的影响仍存在争议,因此,有必要对现有研究进行系统回顾和荟萃分析,进一步评估二甲双胍是否有利于改善糖尿... 详细信息

背景越来越多的证据表明,入院前使用二甲双胍可降低糖尿病合并脓毒症患者的死亡率,然而,二甲双胍对糖尿病合并脓毒症患者临床结局的影响仍存在争议,因此,有必要对现有研究进行系统回顾和荟萃分析,进一步评估二甲双胍是否有利于改善糖尿病合并脓毒症患者死亡率等临床结局。目的系统评价入院前使用二甲双胍对糖尿病合并脓毒症患者死亡率、初始血浆乳酸水平和器官功能障碍等的影响。方法计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of Science、Scopus、中国生物医学文献服务系统、万方数据知识服务平台、中国知网以及其他数据库中二甲双胍对糖尿病合并脓毒症患者临床结局影响的相关中、英文文献,试验组(MET组)为入院前使用二甲双胍的糖尿病合并脓毒症的成年患者,对照组(NM组)为入院前未使用二甲双胍的糖尿病合并脓毒症的成年患者,检索时限为数据库建立至2023-03-15。由2名研究人员筛选、提取数据及评价文献质量后,采用RevMan 5.3软件进行Meta分析。结果本研究共纳入12篇文献,共12320例糖尿病合并脓毒症患者,纳入文献的纽卡斯尔-渥太华量表(NOS)评分为7~8分。Meta分析结果显示:MET组患者死亡率(OR=0.61,95%CI=0.46~0.80,P<0.001)、血管升压药的使用率(OR=0.83,95%CI=0.69~0.98,P=0.03)低于NM组;MET组与NM组患者初始血浆乳酸水平(MD=0.31,95%CI=-0.12~0.75,P=0.16)、血清肌酐水平(MD=-0.81,95%CI=-0.48~0.13,P=0.25)、初始血糖水平(MD=32.94,95%CI=-10.12~76.01,P=0.13)、机械通气(OR=0.90,95%CI=0.77~1.06,P=0.23)比较,差异无统计学意义。结论入院前使用二甲双胍可以降低糖尿病合并脓毒症患者的死亡率,并可减少相应患者血管升压药的使用率,为二甲双胍可降低糖尿病合并脓毒症患者死亡率提供了全新的证据。但对于糖尿病合并脓毒症患者能否降低脓毒症严重程度评分以及减少去甲肾上腺素最大剂量仍有待进一步的研究。

关键词：糖尿病脓毒症二甲双胍临床结局死亡率器官功能障碍 Meta分析

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老年腰椎巨大痛风石1例报道

中国脊柱脊髓杂志 2024年第8期34卷 894-896页

作者：李伟龙陈嘉裕刘展亮朱思哲广东省梅州市人民医院脊柱外科 514000

痛风是因血尿酸水平过高导致尿酸结晶在关节内沉积引发的一种疾病[1]。痛风石是痛风的特征性临床表现,常见于耳廓、跖趾、指尖、掌指、肘等关节[2];与周围关节痛风比较,脊柱痛风相对较罕见[3]。目前我国的痛风患病率为1%~3%,且逐步年轻... 详细信息

痛风是因血尿酸水平过高导致尿酸结晶在关节内沉积引发的一种疾病[1]。痛风石是痛风的特征性临床表现,常见于耳廓、跖趾、指尖、掌指、肘等关节[2];与周围关节痛风比较,脊柱痛风相对较罕见[3]。目前我国的痛风患病率为1%~3%,且逐步年轻化,男女比例为15∶1,超过50%的痛风患者超重或肥胖[4]。我院收治了1例老年腰椎巨大痛风石患者,采用非内固定手术治疗取得较好的临床效果,报道如下。

关键词：尿酸结晶痛风患者痛风石血尿酸水平关节内腰椎患病率老年