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SARS-CoV-2 S蛋白主要结构与突变及S蛋白引起疾病的潜在机制

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中国免疫学杂志 2024年第4期40卷 857-861页

作者：刘兴健张锐钢广东医科大学基础医学院生理学教研室湛江524002

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)对人类生命健康构成威胁,备受研究者的关注。研究发现,病毒的刺突蛋白(S蛋白)被认为是病毒感染的关键结构蛋白,该蛋白与靶细胞受体结合导致组织器官发生炎症反应。因此研究S蛋白引起疾病的潜... 详细信息

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)对人类生命健康构成威胁,备受研究者的关注。研究发现,病毒的刺突蛋白(S蛋白)被认为是病毒感染的关键结构蛋白,该蛋白与靶细胞受体结合导致组织器官发生炎症反应。因此研究S蛋白引起疾病的潜在机制对于疾病的治疗至关重要,然而病毒的演变进化给研究工作增加了一定的难度。本文总结了SARS-CoV-2 S蛋白的主要结构以及从Alpha到Omicron突变,及其引起多种疾病的潜在机制,从而为疾病的预防和治疗提供参考。

关键词： SARS-CoV-2 S蛋白 ACE2 呼吸道炎症

基于剪接因子SRSF9在头颈部鳞状细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第2期50卷 379-391页

作者：刘玉婷喻莹黎桂珍史沁雪李彬彬广东医科大学基础医学院病理生理学教研室广东东莞523808 广东医科大学第二临床医学院广东东莞523808

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30... 详细信息

目的:基于生物信息学方法分析富含丝氨酸/精氨酸的剪接因子9(SRSF9)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达情况、临床意义以及与肿瘤免疫浸润的关系,并探讨其作用机制。方法:利用癌症基因图谱(TCGA)数据库、基因表达综合(GEO)数据库中GSE30784和GSE13601数据集、临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)数据库、基因表达交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier plotter数据库分析SRSF9在HNSCC中的表达及与患者临床病理特征和预后的关系;利用cBioPortal数据库分析SRSF9基因变异情况;应用ESTIMATE算法和肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库评估SRSF9表达与肿瘤微环境和肿瘤免疫细胞浸润的关系;利用LinkedOmics数据库分析SRSF9在HNSCC中的共表达基因及其调控通路;基于TCGA SpliceSeq数据库分析HNSCC中SRSF9调控的可变剪接事件,并对靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:TCGA数据库、GEO数据库中GSE30784和GSE13601数据集分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA表达水平较癌旁正常组织明显升高(P<0.01);CPTAC数据库分析,与正常组织比较,HNSCC组织中SRSF9蛋白表达水平明显升高(P<0.001)。TCGA数据库分析,SRSF9 mRNA表达与HNSCC患者病理分级(P=0.004)和HPV感染(P=0.031)有关联。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库分析,HNSCC组织中SRSF9 mRNA高表达均与患者总生存期(OS)较差相关[风险比(HR)=1.40,P=0.019;HR=1.55,P=0.003]。cBioPortal数据库分析,HNSCC中SRSF9基因拷贝数变异(CNV)占26.85%,其CNV与SRSF9 mRNA表达水平呈正相关关系(r=0.44,P<0.001)。ESTIMATE算法分析,SRSF9 mRNA高表达组基质评分和免疫评分均较SRSF9 mRNA低表达组低(P<0.001),肿瘤纯度则高于SRSF9 mRNA低表达组(P<0.001)。TIMER数据库分析,SRSF9 mRNA表达水平与CD4+T淋巴细胞浸润呈正相关关系(r=0.186,P<0.001),而与B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞和树突状细胞浸润呈负相关关系(r=-0.269,P<0.001;r=-0.353,P<0.001;r=-0.304,P<0.001)。SRSF9共表达基因富集分析,核糖体、剪接体和代谢通路等相关基因上调,而黏着斑、细胞因子和细胞黏附分子等相关基因下调。SRSF9相关可变剪接靶基因主要涉及脂类代谢、胰高血糖素和紧密连接等通路。结论:SRSF9在HNSCC中呈高表达,且与患者预后不良和肿瘤微环境免疫细胞浸润相关,可成为HNSCC诊断、预后评估和治疗的潜在分子靶标。

关键词：头颈部鳞状细胞癌富含丝氨酸/精氨酸剪接因子9 可变剪接肿瘤免疫生物信息学

自噬相关基因ATG8在酵母细胞时序性寿命调控中的作用

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微生物学通报 2024年

作者：杨晓迪袁頔崔晓静华伟邓雁文陈亚芹崔红晶广东省医学免疫与分子诊断重点实验室广东医科大学医学技术学院广东医科大学第二临床医学院广东医科大学附属东莞第一医院广东医科大学基础医学院

[背景] 自噬在调控细胞寿命和衰老过程中起着至关重要的作用，本课题组前期研究发现缺失自噬相关基因ATG8缩短酵母细胞复制性寿命，但有关其在寿命调控中的作用机制尚未明了。[目的]研究自噬相关基因ATG8在酵母细胞寿命调控中的作用及... 详细信息

[背景] 自噬在调控细胞寿命和衰老过程中起着至关重要的作用，本课题组前期研究发现缺失自噬相关基因ATG8缩短酵母细胞复制性寿命，但有关其在寿命调控中的作用机制尚未明了。[目的]研究自噬相关基因ATG8在酵母细胞寿命调控中的作用及可能机制。[方法]基于基因同源重组原理构建ATG8基因过表达酵母菌株(ATG8 OE)，检测ATG8基因缺失(atg8Δ)酵母菌株和ATG8 OE酵母菌株的时序性寿命(chronological lifespan，CLS)，生长曲线仪检测各菌株的增殖速率，流式细胞仪检测各菌株的活性氧(reactive oxygen species，ROS)含量，实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR， RT-qPCR)检测各菌株的氧化应激相关基因转录水平，比色法检测各菌株的细胞凋亡关键酶胱天蛋白酶3 (Caspase-3)活性。[结果]缺失ATG8 基因缩短酵母时序性寿命，减弱细胞增殖速率；且细胞内ROS含量增多，氧化应激相关基因表达下调，Caspase-3酶活性升高；ATG8 OE菌株时序性寿命和细胞增殖能力无明显变化，活性氧含量下降，氧化应激相关基因表达上调，Caspase-3酶活性无明显变化。[结论]自噬相关基因ATG8在调控酵母细胞时序性寿命和氧化应激反应中具有一定作用。

关键词：酿酒酵母 ATG8 氧化应激时序性寿命

结合网络药理学和体外实验探究半边旗抑制鼻咽癌的机制

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海南医学院学报 2024年

作者：谭靖怡胡莹莹陈妹王燊陈雅娟马泽欣翁逸珊叶晓霞吴民华广东医科大学药学院广东医科大学基础医学院广东医科大学第一临床医学院

目的: 本文拟通过网络药理学结合体外实验探究半边旗(Pteris semipinnata L，PsL) 的抗鼻咽癌作用及其机制，为后续研究提供依据。方法: 根据文献获得半边旗主要活性成分，在PharmMapper数据库获取半边旗主要成分相关基因，并从GeneCard... 详细信息

目的: 本文拟通过网络药理学结合体外实验探究半边旗(Pteris semipinnata L，PsL) 的抗鼻咽癌作用及其机制，为后续研究提供依据。方法: 根据文献获得半边旗主要活性成分，在PharmMapper数据库获取半边旗主要成分相关基因，并从GeneCard、OMIM、PharmGkb、TTD和CTD数据库获取鼻咽癌疾病基因。将药物与疾病的交集基因导入至String平台构建蛋白互作(PPI)网络，通过PPI网络筛选出核心靶点。结合生物信息学对核心靶点进行分析，将筛选出的核心靶点与半边旗成分进行分子对接并将结合能低的对接结果进行可视化。同时进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用半边旗提取物作用于鼻咽癌Hone1细胞，采用CCK-8方法检测细胞增殖；Calcein/PI荧光染色检测细胞活性；Annexin V-FITC流式双染检测细胞凋亡，并使用Western blot检测蛋白激酶B（AKT）、磷酸化AKT(p-AKT)、非受体型酪氨酸蛋白激酶（SRC）蛋白表达的变化。结果: 获得半边旗与鼻咽癌交集基因共115个。其中，SRC、MAPK1以及RHOA 可能是鼻咽癌治疗的关键靶点。生物信息学分析结果显示SRC在鼻咽癌中异常高表达，分子对接结果显示β－胡萝卜苷、芦丁和芹菜素－7－O－β－D－吡喃葡萄糖苷与SRC的结合能较低。富集结果分析表明半边旗可调节PI3K-AKT信号通路。体外实验结果显示半边旗水提取物可抑制鼻咽癌Hone1细胞增殖及活性，并促进Hone1细胞凋亡。半边旗水提取物可明显下调SRC和p-AKT蛋白的表达。结论: 半边旗可通过负向调控SRC-AKT信号通路抑制鼻咽癌细胞的增殖、促进其凋亡。

关键词：半边旗鼻咽癌网络药理学 SRC-AKT信号通路

敲除PAMM基因对小鼠白色和棕色脂肪组织基因表达的影响

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中国病理生理杂志 2024年第4期40卷 697-705页

作者：孙雪荣徐明锋吴洪福梁杰吴志远陈露珠和文奕李伟玲张之炜刘新光史玉仓广东医科大学广东省医学分子诊断重点实验室衰老研究所广东东莞523808 广东医科大学生理学教研室广东湛江524023 广东医科大学生理学教研室广东东莞523808 广东医科大学附属医院整形外科广东湛江524001 广东医科大学药学院广东东莞523808 广东医科大学医学技术学院广东东莞523808 广东医科大学第二临床医学院广东东莞523808

目的:巨噬细胞集落刺激因子诱导单核细胞活化的类过氧化物酶2(peroxiredoxin-like 2 activated in M-CSF stimulated monocytes,PAMM)是一种具有抗炎、抗氧化功能的蛋白,在脂肪组织中高表达,本文拟利用基因敲除小鼠,探究PAMM对白色和棕... 详细信息

目的:巨噬细胞集落刺激因子诱导单核细胞活化的类过氧化物酶2(peroxiredoxin-like 2 activated in M-CSF stimulated monocytes,PAMM)是一种具有抗炎、抗氧化功能的蛋白,在脂肪组织中高表达,本文拟利用基因敲除小鼠,探究PAMM对白色和棕色脂肪组织形态及基因表达等的影响,以期为其功能研究提供新思路。方法:利用CRISPR-Cas9等技术构建PAMM基因敲除(knockout,KO)小鼠,用野生型(wild-type,WT)小鼠作为对照。收集腹股沟皮下白色脂肪组织(inguinal adipose tissue,IAT)和背部棕色脂肪组织(brown adipose tissue,BAT),通过HE染色观察组织形态,利用RNA-seq和RT-qPCR检测相关基因的表达。结果:通过基因组PCR及测序,证明基因敲除小鼠构建正确。敲除PAMM后IAT和BAT形态无明显变化,但E2F靶点、未折叠蛋白反应等基因集在IAT或BAT中富集。比较WT和KO小鼠组织,发现33个基因的变化趋势在IAT和BAT中保持一致;而仅在IAT中出现变化的基因,分布在胞外、胞膜等部位,参与免疫和趋化反应等,与钙信号通路等相关;仅在BAT中出现变化的基因,分布在胞外基质、胞核等部位,参与葡萄糖稳态、生物节律等过程。RT-qPCR检测钙通路及生物节律相关基因,变化趋势与测序结果类似。本文还观察了敲除PAMM对IAT和BAT之间差异表达基因的影响,发现WT和KO小鼠BAT/IAT的差异基因和通路大多相同,但也有部分基因和通路发生了变化。结论:PAMM敲除对IAT和BAT的形态结构无明显影响,但显著影响了二者的基因表达及相关信号通路,还可能影响IAT和BAT之间的相互作用。

关键词：白色脂肪组织棕色脂肪组织 PAMM基因基因敲除

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内质网应激反应在PMT1基因调控酿酒酵母细胞寿命和自噬中的作用

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微生物学报 2024年

作者：崔晓静袁頔杨晓迪张恒恒管文斌王俊芳庞晓飞崔红晶广东省医学免疫与分子诊断重点实验室广东医科大学附属东莞第一医院检验医学科广东医科大学医学技术学院广东医科大学第二临床医学院广东医科大学基础医学院山东省第二人民医院儿科

【目的】研究内质网应激反应在酿酒酵母蛋白O-甘露糖基转移酶-1 (protein O-mannosyltransferase-1， pmt1)基因调控细胞寿命和自噬中的作用。【方法】基于基因同源重组的原理，构建双基因缺失菌株(pho8Δ60 pmt1Δ)；在光学显微镜下计... 详细信息

【目的】研究内质网应激反应在酿酒酵母蛋白O-甘露糖基转移酶-1 (protein O-mannosyltransferase-1， pmt1)基因调控细胞寿命和自噬中的作用。【方法】基于基因同源重组的原理，构建双基因缺失菌株(pho8Δ60 pmt1Δ)；在光学显微镜下计数PMT1基因缺失酵母菌株(pmt1Δ)在衣霉素(内质网应激诱导剂)培养条件下的母细胞产生子代细胞的数量，统计菌株的复制性寿命；通过酶标仪检测pho8Δ60 pmt1Δ菌株在SD-N培养中(自噬诱导培养基)的碱性磷酸酶活性；通过Western blotting检测在衣霉素培养条件下细胞自噬标签Atg8蛋白的表达水平；通过RT-qPCR检测在衣霉素培养条件下pmt1Δ菌株中自噬相关基因ATG1和ATG8的表达情况。【结果】在衣霉素培养条件下，pmt1Δ菌株的复制性寿命缩短38.6%，差异有统计学意义；PMT1基因缺失酵母菌株的碱性磷酸酶活性上升；随衣霉素浓度增加，pmt1Δ菌株中融合蛋白GFP-Atg8和游离GFP蛋白的表达水平逐渐升高；在衣霉素培养条件下，pmt1Δ菌株中ATG1和ATG8基因表达上调。【结论】内质网应激反应减弱了PMT1基因缺失酵母细胞复制性寿命，增强了细胞自噬活性。

关键词：酿酒酵母衣霉素内质网应激自噬 PMT1

丙酸钠缓解鼠柠檬酸杆菌诱导的小鼠结肠炎效果优于混合短链脂肪酸

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中国药科大学学报 2024年

作者：李莹莹王柳怡王思瑾杨一文辛菲李俐纪巧荣徐州医科大学滕州市中心人民医院徐州医科大学基础医学院病理生理学教研室徐州医科大学基础医学院临床与实验病理学实验室

对比探究丙酸钠与混合短链脂肪酸对鼠柠檬酸杆菌（Citrobacter rodentium， C.r.）感染引起的结肠炎的干预效果及作用机制。小鼠灌胃C.r.诱导结肠炎模型，通过C.r.生长监测、组织病理学分析、qPCR分析、肠道通透性检测、流式细胞术等研... 详细信息

对比探究丙酸钠与混合短链脂肪酸对鼠柠檬酸杆菌（Citrobacter rodentium， C.r.）感染引起的结肠炎的干预效果及作用机制。小鼠灌胃C.r.诱导结肠炎模型，通过C.r.生长监测、组织病理学分析、qPCR分析、肠道通透性检测、流式细胞术等研究丙酸钠和混合短链脂肪酸对小鼠肠道感染的不同影响。结果显示，丙酸钠较混合短链脂肪酸更能有效抑制C.r.的生长。动物实验结果发现，丙酸钠较混合短链脂肪酸明显减少了小鼠感染后的体重下降及肠道细菌排出量。同时，丙酸钠较混合短链脂肪酸有效缓解了C.r.感染所致的结肠炎性浸润、上皮细胞结构破坏和杯状细胞数量减少等病理表现，且丙酸钠明显增加了抗菌肽白介素-17（interleukin-17， IL-17）、再生胰岛衍生蛋白3γ（regenerating islet derived protein 3 gamma， Reg3γ）水平。此外，丙酸钠降低肠道通透性表现优于混合短链脂肪酸，并明显诱导感染后T辅助细胞17（T helper cell 17， Th17）、调节性T细胞（regulatory T cell， Treg）分化。研究结果表明，丙酸钠较混合短链脂肪酸明显缓解C.r.感染诱导的结肠炎症反应，机制可能与其抑制C.r.生长并增强肠道抗感染功能有关。预期结果可为结肠炎提供更安全有益的治疗策略及科学依据。

关键词：丙酸钠短链脂肪酸鼠柠檬酸杆菌结肠炎

淀粉样前体蛋白胞内结构域对阿尔茨海默病模型小鼠神经发生和学习记忆的影响

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中山大学学报（医学科学版） 2024年第5期45卷 683-693页

作者：蒋梅邓栩邱子雄崔晓军付媛广东医科大学基础医学院东莞市干细胞与再生组织工程重点实验室广东东莞523808 喀什大学医学院基础医学教研室新疆喀什844000

【目的】探讨淀粉样前体蛋白胞内结构域(AICD)对阿尔茨海默病(AD)模型动物神经发生、学习记忆的影响。【方法】本研究使用免疫荧光染色检测AICD转基因小鼠来源的体外培养的神经前体细胞(NPCs)、胚胎大脑皮质、成年海马齿状回(DG)中增殖... 详细信息

【目的】探讨淀粉样前体蛋白胞内结构域(AICD)对阿尔茨海默病(AD)模型动物神经发生、学习记忆的影响。【方法】本研究使用免疫荧光染色检测AICD转基因小鼠来源的体外培养的神经前体细胞(NPCs)、胚胎大脑皮质、成年海马齿状回(DG)中增殖和分化的细胞数目;水迷宫实验检测老年AICD转基因小鼠对学习记忆能力影响;生物信息学预测和分析潜在的分子机制。【结果】免疫荧光染色结果显示AICD转基因模型体外NPCs、胚胎皮质、海马DG区域的神经干细胞和神经元数量减少(P实验依据。

关键词：淀粉样前体蛋白胞内结构域阿尔茨海默病神经发生学习记忆网络药理学

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PD-L1在肺部炎症性疾病中的研究进展

生理学报 2024年第2期76卷 346-352页

作者：黎阿果蔡爱华李浩甲黄绮颖涂永生广州医科大学广东省蛋白质修饰与降解重点实验室广州511436 广州医科大学第二临床学院广州511436 广州医科大学第三临床学院广州511436 广州医科大学基础医学院生理学教研室广州511436

程序性死亡配体1(programmed death-ligand 1,PD-L1)在维持正常组织中枢和外周免疫耐受、介导肿瘤免疫逃逸以及维持抗炎和促炎反应平衡方面具有重要意义。炎症反应在肺部炎症性疾病中发挥了重要作用。本文综述了PD-L1在急性肺损伤、慢... 详细信息

程序性死亡配体1(programmed death-ligand 1,PD-L1)在维持正常组织中枢和外周免疫耐受、介导肿瘤免疫逃逸以及维持抗炎和促炎反应平衡方面具有重要意义。炎症反应在肺部炎症性疾病中发挥了重要作用。本文综述了PD-L1在急性肺损伤、慢性阻塞性肺疾病、哮喘、特发性肺纤维化等肺部炎症性疾病中的研究进展和潜在的临床价值。

关键词：程序性死亡配体1 急性肺损伤慢性阻塞性肺疾病哮喘特发性肺纤维化