检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生态流行病学研究设计与统计分析策略

中华疾病控制杂志 2022年第10期26卷 1152-1160页

作者：薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 国家健康医疗大数据研究院济南250003

大数据生态流行病学理论范式阐明了一个更全面的生态流行病学视角,承认和捕捉现实世界和虚拟世界中的众多健康决定因素具有等级镶嵌和交互博弈的复杂网络特征。在这种镶嵌分层相互作用及其网络博弈的复杂背景下,传统的基于独立随机假设... 详细信息

大数据生态流行病学理论范式阐明了一个更全面的生态流行病学视角,承认和捕捉现实世界和虚拟世界中的众多健康决定因素具有等级镶嵌和交互博弈的复杂网络特征。在这种镶嵌分层相互作用及其网络博弈的复杂背景下,传统的基于独立随机假设的传统流行病学抽样调查方法、传统分析流行病学和实验流行病学设计策略及统计分析方法,均面临巨大挑战。取而代之的是,系统动力学模型、网络分析及网络动力学模型、多智能体系统模型以及未来需要发展的生态流行病学超图因果推断模型。从而,由新理论范式、新设计策略和新统计方法,构成了大数据生态流行病学理论方法体系。

关键词：生态流行病学系统动力学模型网络分析及网络动力学模型多智能体系统模型超图因果推断模型

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

大数据生态流行病学理论模型诠释

中华疾病控制杂志 2022年第10期26卷 1129-1136页

作者：薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 国家健康医疗大数据研究院济南250003

当今,数字技术作为一种新型的健康决定因素,它改变了社会、经济、城市和家庭,进而又影响了人类健康;人类进入了一个全新的数字虚拟世界。由此,在大数据生态流行病学理论范式中,现实世界生态流行病学模型与虚拟世界生态流行病学模型,组... 详细信息

当今,数字技术作为一种新型的健康决定因素,它改变了社会、经济、城市和家庭,进而又影响了人类健康;人类进入了一个全新的数字虚拟世界。由此,在大数据生态流行病学理论范式中,现实世界生态流行病学模型与虚拟世界生态流行病学模型,组成既相对独立又相互博弈交互的共同体,它们均以表观遗传为中介,在以基因组为核心的多组学因素、现实世界健康决定因素、虚拟世界健康决定因素间相互博弈和相互依赖;由此形成了众多镶嵌层级内健康决定因素交互博弈的生态流行病学新病因论框架。现实世界与虚拟世界两个生态流行病学模型,通过同一数字健康模型,以数字技术作为“双刃剑”角色而发挥作用。

关键词：生态流行病学模型现实世界生态流行病学模型虚拟世界生态流行病学模型

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

大数据生态流行病学理论模型

中华疾病控制杂志 2022年第10期26卷 1124-1128页

作者：薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 国家健康医疗大数据研究院济南250003

当今大数据、人工智能时代背景下,生态流行病学既进入快速发展和应用阶段,又在理论范式、设计策略和统计方法等方面,面临诸多发展瓶颈;必须提出适于数字化智能时代的生态流行病学新理论范式、新设计策略和新统计方法。为此,本文创建了... 详细信息

当今大数据、人工智能时代背景下,生态流行病学既进入快速发展和应用阶段,又在理论范式、设计策略和统计方法等方面,面临诸多发展瓶颈;必须提出适于数字化智能时代的生态流行病学新理论范式、新设计策略和新统计方法。为此,本文创建了既相对独立又相互依赖的“现实世界”与“虚拟世界”中众多镶嵌层级内健康决定因素交互博弈的大数据生态流行病学模型;创立了现实和虚拟两个世界中,均以表观遗传为中介在现实世界、虚拟世界的健康决定因素、以基因组为核心的多组学因素间交互博弈的生态流行病学新病因模型;并在同一数字健康模型下,通过“同一健康”和“数字健康”两个赋能关键,“个体-种群-生态系统”一体化的三个视角,“公民参与、教育、环境、人类-动物健康保健和数字健康”五个维度之间的交互博弈,实现了生态流行病学范式的数字化转型;而数字技术是这一数字化转型的催化剂和始作俑者。这种生态流行病学新理论范式及其新设计与分析策略的系统科学方法(系统动力学模型、网络分析及网络动力学模型、多智能体系统模型以及超网络因果推断模型),共同构成了大数据生态流行病学的理论方法体系。

关键词：大数据生态流行病学范式数字化转型系统科学理论方法体系

基于生态健康的绿色植被指数数据采集及边缘计算

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华疾病控制杂志 2022年第10期26卷 1167-1173页

作者：贾贤杰刘超季晓康薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 国家健康医疗大数据研究院济南250003 蚌埠医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室蚌埠233030

目的在健康医疗大数据时代,更快、更精准地获取环境绿地暴露水平数据,助力对绿色植被暴露与健康的研究。方法利用Python设计一套能够进行自动化采集绿色植被指数的技术流程和程序。同时以国家健康医疗大数据平台为依托,对边缘计算在绿... 详细信息

目的在健康医疗大数据时代,更快、更精准地获取环境绿地暴露水平数据,助力对绿色植被暴露与健康的研究。方法利用Python设计一套能够进行自动化采集绿色植被指数的技术流程和程序。同时以国家健康医疗大数据平台为依托,对边缘计算在绿色植被指数采集应用进行探究和展望。结果该程序的运行极大缩短了对植被指数的处理时间,并且与传统专业软件获取的结果比较,具有较高的一致性,r>0.99。结论基于边缘计算的绿色植被指数的自动化采集可为国内绿色植被暴露与健康的研究提供技术支持。

关键词： Python 绿色植被指数边缘计算

基于下一代测序的污水中人星状病毒分子流行病学研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国公共卫生 2023年第11期39卷 1475-1479页

作者：赵云纪峰林小娟刘尧徐爱强陶泽新温红玲山东大学齐鲁医学院公共卫生学院微生物检验学系济南250012 山东省疾病预防控制中心济南250014

目的了解生活污水中人星状病毒(HAstV)的型别分布及遗传多样性。方法2018年1月—2019年6月在山东省济宁市按季度采集6份生活污水样本,通过阴离子膜吸附洗脱法进行浓缩后,提取核酸,进行ORF2完整编码区的RT-PCR扩增及扩增产物下一代测序,... 详细信息

目的了解生活污水中人星状病毒(HAstV)的型别分布及遗传多样性。方法2018年1月—2019年6月在山东省济宁市按季度采集6份生活污水样本,通过阴离子膜吸附洗脱法进行浓缩后,提取核酸,进行ORF2完整编码区的RT-PCR扩增及扩增产物下一代测序,对产生的干净数据使用CLC Genomics Workbench 12.0软件de novo组装后,进行基因定型、同源性比较和系统发生学分析。结果检测地区生活污水中HAstV的检出率为100%,共获得HAstV序列43条,分属9种基因型,分别为HAstV-1、HAstV-2、HAstV-3、HAstV-4、HAstV-5等经典型和MLB1、VA1、VA2、VA3等新型HAstV,其中HAstV-5(47.53%)占比最高;基于ORF2完整编码区的系统发生学显示山东株与国内外其他参考株在一些分支上聚集在一起,表明不同型别在世界不同地区的传播。结论本研究证实了基于NGS的环境监测有助于提高对HAstV遗传多样性的认识。

关键词：人星状病毒下一代测序环境监测

ARIMA、ARIMAX、NGO-LSTM模型在山东省聊城市结核病发病数预测中的应用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国防痨杂志 2023年第12期45卷 1177-1185页

作者：孙明浩段雨琪郑良于胜男程传龙左慧陈鸣李秀君山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系济南250012 聊城市传染病医院公共卫生科聊城252000

目的:通过比较差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型、具有外生回归变量的差分自回归移动平均(autoregressive integrated moving average with exogenous regressors,ARIMAX)模型和结合北方苍鹰优化(Northern goshawk optimization,NGO)算法的长期短期记忆(long short-term memory,LSTM)神经网络模型确定预测山东省聊城市结核病发病数的最佳模型。方法:收集聊城市2011年1月至2018年12月结核病月发病数据,分别构建ARIMA、ARIMAX和NGO-LSTM模型,评估3种模型在预测2018年结核病发病数的表现。结果:ARIMA模型、考虑月平均相对湿度(滞后1个月)与最低温度(滞后2个月)的多变量ARIMAX模型和NGO-LSTM模型对2018年结核病发病数预测的平均绝对百分比误差分别为9.293%、8.419%、5.820%,平均绝对误差分别为19.282、16.997、13.119,均方根误差分别为23.773、22.191、16.297。结论:在3种模型中,NGO-LSTM模型对聊城市结核病月发病数的预测效果最好,为结核病预警系统的建立提供了一种新思路,可为有关部门针对结核病的预防及控制决策提供科学依据。

关键词：结核时间模型统计学预测

维普期刊数据库博看期刊

基于贝叶斯网络不确定性推理的肺癌风险预测模型

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

山东大学学报（医学版） 2023年第4期61卷 86-94页

作者：钟璐薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系山东济南250012 山东大学健康医疗大数据研究院山东济南250002

目的将贝叶斯网络与Cox模型相结合,预测包含缺失协变量的个体的肺癌发病风险。方法研究使用的数据来自于英国生物样本库,采用单因素Cox回归分析筛选与肺癌发病相关的预测因素;基于识别出的肺癌潜在预测因素,应用上述联合模型建立个体化... 详细信息

目的将贝叶斯网络与Cox模型相结合,预测包含缺失协变量的个体的肺癌发病风险。方法研究使用的数据来自于英国生物样本库,采用单因素Cox回归分析筛选与肺癌发病相关的预测因素;基于识别出的肺癌潜在预测因素,应用上述联合模型建立个体化肺癌风险预测模型;从鉴别和校准两方面评价模型的预测性能。结果建立的预测模型具有较好的鉴别和校准能力,训练和验证队列的AUC分别为0.854(95%CI:0.836~0.870)和0.885(95%CI:0.871~0.897)。结论本研究构建了基于贝叶斯网络和Cox模型的肺癌风险预测模型;该模型具有良好的鉴别和校准能力,能有效预测肺癌发病高危人群;联合模型在存在缺失预测因子的情况下提供了一种有效的风险预测方法,可为肺癌预防控制提供理论支撑。

关键词：肺癌风险预测模型贝叶斯网络 Cox模型缺失数据

基于下一代测序技术分析临沂市污水中肠道病毒的遗传多样性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

病毒学报 2023年第6期39卷 1561-1569页

作者：韩咏霖张晓纪峰林小娟温红玲陶泽新山东大学齐鲁医学院公共卫生学院微生物检验学系济南250014 山东省疾病预防控制中心济南250014

本研究通过环境污水监测和下一代测序(Next generation sequencing,NGS)技术来了解临沂市肠道病毒(Enterovirus,EV)的型别分布和遗传特征,为肠道病毒病的防控提供科学依据。我们从2019年1月至2021年12月,在山东省临沂市兰山区污水处理... 详细信息

本研究通过环境污水监测和下一代测序(Next generation sequencing,NGS)技术来了解临沂市肠道病毒(Enterovirus,EV)的型别分布和遗传特征,为肠道病毒病的防控提供科学依据。我们从2019年1月至2021年12月,在山东省临沂市兰山区污水处理厂按月采集污水标本,使用阴离子膜吸附洗脱法对标本进行浓缩,接种RD、HEp-2、L20B细胞进行EV分离和型别鉴定;同时,提取污水浓缩液核酸,进行VP1部分编码区的RT-PCR扩增和扩增产物的NGS,分析不同EV型别的读序构成,并使用Mega 11.0和BioEdit 7.0进行序列分析。3年中共采集污水样本34份,其中从23份中分离到EV 257株,鉴定为8个型别;28份污水浓缩液核酸的RT-PCR反应呈阳性,通过NGS共检出29个EV型别,分别属于EV-A(8)、EV-B(15)、EV-C(6)。其中柯萨奇病毒B3型(Coxsackievirus B3,CVB3)、埃可病毒11型、CVA16型为读序数最多的3种血清型,分别占总读序数的24.5%、23.1%和8.2%,同时还检出肠道病毒A76型、A89型、A90型等3种新型EV,以及EV-A71、CVA4、CVA6、CVA10、CVA24等传统病毒分离方法难以从污水中检测到的型别。系统发生学分析显示国内的新型病毒与国外分离株的亲缘关系较远。由此我们得出结论,基于NGS技术的环境污水监测是探索EV区域性流行的敏感且有效的手段。临沂环境污水中存在多种肠道病毒的共循环,具有高度的遗传多样性。

关键词：肠道病毒环境监测下一代测序遗传变异多样性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分布式循证因果数据融合方法进展

中华疾病控制杂志 2022年第10期26卷 1174-1179,1223页

作者：李洪凯徐东海刘青季晓康薛付忠山东大学齐鲁医学院公共卫生学院生物统计学系国家健康医疗大数据研究院济南250003 山东健康医疗大数据管理中心济南250000

为了实现大样本量和多样化的研究人群分析,整合来自多个异质来源的数据库已经变得越来越流行。本文综述了整合多个不同人群下的不同设计的数据库在因果推理方法方面的进展。尤其是随机临床试验与外部信息相结合的研究进展以及将观察性... 详细信息

为了实现大样本量和多样化的研究人群分析,整合来自多个异质来源的数据库已经变得越来越流行。本文综述了整合多个不同人群下的不同设计的数据库在因果推理方法方面的进展。尤其是随机临床试验与外部信息相结合的研究进展以及将观察性研究和历史对照相结合的方法。此外,针对单一样本缺乏相关混杂变量信息,也可以应用两样本孟德尔随机化方法控制未知的混杂因素从而推断因果关系。这种分布式数据设计具有有效性和真实世界数据研究的安全性。

关键词：数据融合因果推断混杂因素