检索结果-南通市图书馆

牛脂肪沉积相关基因EGR1的克隆、生物信息学及时空表达特性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧杂志 2024年

作者：刘源贺丽霞刘爽杨梦丽丁晓玲冯兰盛辉汪书哲白雪楚洪恩马云宁夏大学动物科技学院宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室

本研究以固原黄牛为研究对象，旨在探究牛EGR1基因在脂肪细胞分化过程和不同组织的时空表达特性，分析EGR1蛋白结构和功能。通过生物信息学软件分析EGR1蛋白的理化性质、二级结构、结构域、亚细胞定位、蛋白互作，分析启动子结合位点与... 详细信息

本研究以固原黄牛为研究对象，旨在探究牛EGR1基因在脂肪细胞分化过程和不同组织的时空表达特性，分析EGR1蛋白结构和功能。通过生物信息学软件分析EGR1蛋白的理化性质、二级结构、结构域、亚细胞定位、蛋白互作，分析启动子结合位点与CpG岛，构建不同物种间EGR1蛋白的同源进化树。利用RT-PCR扩增EGR1基因CDS区，RT-qPCR分析EGR1基因在脂肪细胞分化过程中和不同组织中的表达特性，从公共数据库下载163种组织的RNA-Seq数据分析。生物信息学分析发现，牛EGR1基因编码542个氨基酸，二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成，主要定位于细胞核中，少量在细胞质中；具有108个磷酸化位点、137个O-糖基化位点和3个N-糖基化位点，与EGR2、PPARG、NABI、NAB2、TP53等蛋白存在互作关系，氨基酸序列与水牛最接近；预测到15个不同的启动子区域和3个CpG岛；成功克隆出牛EGR1基因的CDS区全长（1 629 bp）。组织表达谱检测显示，EGR1 mRNA在犊牛脾脏组织中表达量最高，背最长肌表达量最低；在成年牛脾脏组织中的表达量最高，肾脏中的表达量最低；在犊牛和成年牛肝脏、肾周脂肪组织中表达量差异显著。EGR1基因在牛脂肪细胞分化过程中的时序表达中，以0 d mRNA表达量作为对照，发现其在分化0.5 h后表达量下降，在分化第4天表达量升高，且第4天表达量最高。本研究表明EGR1可能在脂肪沉积过程中发挥重要作用。

关键词：固原黄牛 EGR1 转录因子脂肪沉积

单细胞转录组测序技术在精子发生研究中的应用进展

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国畜牧兽医 2024年 4400-4409页

作者：马媛金昊延王娜娜李颀菡张令锴宁夏大学动物科技学院宁夏回族自治区反刍动物分子与细胞育种重点实验室

精子发生是在哺乳动物睾丸内通过一系列细胞分化和发育,最终形成精子的过程,在时间和空间上具有高度异质性。随着生物信息学的不断更新与发展,以往研究大多依赖于对各种细胞类型的RNA进行分析。然而,从睾丸中分离每一种细胞类型是非常... 详细信息

精子发生是在哺乳动物睾丸内通过一系列细胞分化和发育,最终形成精子的过程,在时间和空间上具有高度异质性。随着生物信息学的不断更新与发展,以往研究大多依赖于对各种细胞类型的RNA进行分析。然而,从睾丸中分离每一种细胞类型是非常大的挑战,因此在转录组水平上对于不同类型的睾丸生殖细胞的研究相对较少。近年来,由于科技的进步和发展,单细胞转录组测序(scRNA-Seq)技术已推出多种测序平台,其使用范围和场景不断扩大,在神经、肿瘤、免疫、生长发育和疾病等领域广泛应用,研究对象主要涉及人、模式生物及家畜。该技术可高效捕获睾丸内单个细胞,进行高通量测序分析,获取其转录组水平信息,精细描述其细胞类型,揭示细胞异质性,并推测其发育轨迹。目前,scRNA-Seq已经开始从家畜生殖细胞的角度对家畜精子发生相关机制进行更深入的探究,以此进一步研究家畜精子发生的相关过程。因此,作者在阐述scRNA-Seq技术方法的基础上,总结论述了其在牛、羊和猪等家畜精子发生领域中的应用进展,为家畜精子发生的研究提供理论基础。

关键词：单细胞转录组测序精子发生家畜

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

染色质三维构象在精子发生中的研究进展

中国畜牧杂志 2024年第9期60卷 71-78页

作者：金昊延李颀菡马媛王娜娜胡亚美马云张令锴宁夏大学动物科技学院宁夏回族自治区反刍动物分子与细胞育种重点实验室

染色质是调节生物体遗传的重要物质，是维持细胞有序表达基因及蛋白质的重要载体。随着科学技术的不断进步，许多研究通过染色质构象捕获技术（High-Through Chromosome Conformation Capture,Hi-C）对染色质内部结构进行解析，对染色... 详细信息

染色质是调节生物体遗传的重要物质，是维持细胞有序表达基因及蛋白质的重要载体。随着科学技术的不断进步，许多研究通过染色质构象捕获技术（High-Through Chromosome Conformation Capture,Hi-C）对染色质内部结构进行解析，对染色质区室、染色质疆域等有了更清晰的认识。在哺乳动物的精子发生过程中，染色质结构的改变对基因调控等起到了重要作用。精子发生是精原细胞增殖分化形成精子的过程，包括精原细胞的自我更新与分化、精母细胞的减数分裂以及精细胞的变形。本文主要阐述染色质三维构象捕获技术及其衍生技术、染色质的层级结构、精子发生过程中染色质三维构象变化的前沿进展，为精子发生的机制研究提供新思路。

关键词：精子发生染色质构象捕获三维基因组学

奶牛代谢病发病机制解析及植物提取物的防控作用

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国饲料 2024年第11期 8-14页

作者：马莉花王娜娜马学虎徐晓锋马云马燕芬宁夏大学动物科技学院宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室宁夏银川750021

奶牛在养殖过程中易患各种疾病,极大的制约了养殖业的发展。植物提取物具有天然、绿色、毒副作用小等优点,引起了饲料行业的广泛关注。植物提取物作为一种来源广泛且含有生物碱、皂苷、单宁和多糖等多种生物活性物质的饲料添加剂,具有... 详细信息

奶牛在养殖过程中易患各种疾病,极大的制约了养殖业的发展。植物提取物具有天然、绿色、毒副作用小等优点,引起了饲料行业的广泛关注。植物提取物作为一种来源广泛且含有生物碱、皂苷、单宁和多糖等多种生物活性物质的饲料添加剂,具有抗氧化、抗应激、提高免疫力、改善肠道健康等特殊生物调控作用,在奶牛养殖方面具有广阔的应用前景。本文围绕植物提取物对奶牛常见疾病的调控进行综述,旨在为植物提取物在奶牛疾病方面的研究和实际生产中的应用提供参考。

关键词：奶牛疾病植物提取物胃肠道菌群氧化应激

奶牛乳房炎相关IFNE基因的克隆、表达及功能研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

西南农业学报 2024年第2期37卷 420-428页

作者：王正兴罗仍卓么王晋鹏包斌武王兴平宁夏大学动物科技学院银川750021 宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室银川750021

【目的】研究干扰素ε(Interferon epsilon,IFNE)基因在奶牛乳腺上皮细胞(Bovine mammary epithelial cells,bMECs)炎症中的表达模式及其潜在的分子功能。【方法】通过PCR和测序技术得到IFNE基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并... 详细信息

【目的】研究干扰素ε(Interferon epsilon,IFNE)基因在奶牛乳腺上皮细胞(Bovine mammary epithelial cells,bMECs)炎症中的表达模式及其潜在的分子功能。【方法】通过PCR和测序技术得到IFNE基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并采用生物信息学方法分析IFNE基因及其蛋白质特性;利用RNAi和qPCR技术检测IFNE、干扰素β(Interferon beta,IFNB)、干扰素κ(Inter⁃feronκ,IFNK)、半胱天冬酶3(Cystathione aspartase 3,CASP3)、半胱天冬酶9(Cystathione aspartase 9,CASP9)等基因在脂多糖(Li⁃popolysaccharide,LPS)诱导bMECs炎症反应中的表达量。【结果】IFNE基因的CDS长度为582 bp,可编码由193个氨基酸组成的具有亲水性且不稳定的非分泌蛋白。与对照组(0 h)相比,在LPS诱导3、6、12和24 h的bMECs中白细胞介素⁃6(Interleukin⁃6,IL⁃6)和白细胞介素⁃1β(Interleukin⁃1β,IL⁃1β)的表达量均显著上调(P细胞介素⁃8(Interleukin⁃8,IL⁃8)的表达量极显著上调(P细胞模型。在炎症细胞模型构建成功的基础上,采用qPCR检测bMECs内IFNE基因的表达量结果表明,与对照组(0 h)相比,IFNE基因在LPS诱导bMECs 3、6、12和24 h的表达量均极显著上调,且在诱导6 h的表达量最高。RNAi实验结果表明,干扰IFNE可使得炎症性bMECs内的IL⁃8、IFNB、IFNK和白细胞介素⁃10受体亚基β(Interleu⁃kin⁃10 receptor subunitβ,IL⁃10RB)基因的表达量均显著上调,IL⁃6、IL⁃1β、CASP3、CASP9和BAD基因的表达量均呈极显著上调。【结论】IFNE基因在LPS诱导的bMECs炎症反应中的表达量极显著上调,干扰IFNE基因可通过调控IL⁃6、IL⁃8、IL⁃1β、IFNB、IF⁃NK、CASP3和CASP9等基因的表达而缓解bMECs炎症反应,为奶牛乳房炎的分子治疗和抗乳房炎分子育种奠定理论基础。

关键词：奶牛乳腺上皮细胞 IFNE 生物信息学分析乳房炎

共培养体系下牛骨骼肌细胞对脂肪细胞的调控作用研究

同方期刊数据库博看期刊评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国农业科学 2024年第18期 3704-3718页

作者：杨东梅张久盘宋雅萍宋小雨姜超马云魏大为宁夏大学动物科技学院/宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室宁夏农林科学院动物科学研究所

【目的】大理石纹是衡量肉品质的重要指标之一，由牛骨骼肌细胞与牛脂肪细胞共同发育形成。通过最大程度模拟体内肉质形成过程中牛骨骼肌细胞和脂肪细胞互作效应，建立体外两种细胞共培养体系，探究共培养体系下牛骨骼肌细胞分泌和代谢... 详细信息

【目的】大理石纹是衡量肉品质的重要指标之一，由牛骨骼肌细胞与牛脂肪细胞共同发育形成。通过最大程度模拟体内肉质形成过程中牛骨骼肌细胞和脂肪细胞互作效应，建立体外两种细胞共培养体系，探究共培养体系下牛骨骼肌细胞分泌和代谢因子对脂肪细胞的调控作用。【方法】采用组织块法和酶消化法分别分离牛脂肪细胞和骨骼肌细胞。利用表型鉴定法和标志基因表达谱鉴定法共同鉴定所分离细胞的纯度和分化潜能，进一步构建牛骨骼肌细胞和牛脂肪细胞条件培养基交换共培养体系以及Transwell共培养体系，通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qPCR)、EdU染色和油红O染色等方法检测共培养条件下牛骨骼肌细胞分泌和代谢产物对脂肪细胞增殖和分化的影响。【结果】成功构建了两种牛骨骼肌细胞与脂肪细胞的共培养体系。条件培养基交换共培养下，牛脂肪细胞增殖标志基因PCNA、CDK2、CCNE2和CCND1的表达极显著下调（P细胞增殖标志基因CCND1的表达显著下调（P细胞分泌和代谢产物可通过抑制脂肪细胞增殖标志基因PCNA、CDK1、CDK2、CCNE2和CCND1以及成脂标志基因PPARγ、FABP4、C/EBPβ和LPL的表达抑制牛脂肪细胞的增殖与分化。以上研究结果可为进一步探究肉牛肌内脂肪沉积的分子机制提供技术支撑。

关键词：牛脂肪细胞骨骼肌细胞共培养细胞互作

PPP5C 基因调控牛脂肪细胞增殖、分化的功能研究

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

畜牧兽医学报 2024年

作者：冯兰冯雪马玉林张令锴马燕芬魏大为马云宁夏大学动科学院宁夏反刍动物分子细胞育种重点实验室

旨在探究PPP5C基因在牛脂肪细胞增殖、分化过程中的作用。本研究以固原固原黄牛为研究对象，在牛前体脂肪细胞中进行PPP5C基因功能缺失和功能获得性试验，利用qRT-PCR、EdU、CCK-8和流式细胞术检测候选标志基因的mRNA表达水平和细胞增... 详细信息

旨在探究PPP5C基因在牛脂肪细胞增殖、分化过程中的作用。本研究以固原固原黄牛为研究对象，在牛前体脂肪细胞中进行PPP5C基因功能缺失和功能获得性试验，利用qRT-PCR、EdU、CCK-8和流式细胞术检测候选标志基因的mRNA表达水平和细胞增殖活力，甘油三酯（TG）检测、油红O、BODIPY和Nilered染色结果为脂肪细胞分化过程中脂滴蓄积情况提供表型数据支撑。结果表明，相比对照组，干扰PPP5C基因显著上调增殖标志基因（CDK1、CDK2和PCNA）mRNA表达量（P细胞活力显著上升（P细胞从S期向G2期的转变（P细胞中TG含量显著增多（P细胞表型数据结果提示干扰PPP5C会促进牛前体脂肪细胞分化，脂滴蓄积增多。而PPP5C基因的功能获得性试验结果恰好与之相反。综上，干扰PPP5C基因后促进牛前体脂肪细胞增殖和分化，过表达PPP5C基因后抑制牛前体脂肪细胞增殖和分化，提示PPP5C基因可能在牛前体脂肪细胞增殖和分化过程中作为负调控因子发挥作用。本研究为进一步探究PPP5C基因调控牛脂肪沉积分子机制提供基础数据。

关键词： PPP5C 牛前体脂肪细胞分化增殖流式细胞术

围产期饲粮中添加蛋氨酸羟基类似物异丙酯和N-氨甲酰谷氨酸对奶牛产奶性能和血浆代谢组的影响

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

动物营养学报 2024年第7期36卷 4375-4387页

作者：刘乐何丽丽马楠樊希雅刘帅王琨王玲宁夏大学动物科技学院银川750021 宁夏回族自治区畜牧站银川750002

本试验旨在研究围产期饲粮中添加蛋氨酸羟基类似物异丙酯(HMBi)和N-氨甲酰谷氨酸(NCG)对奶牛产奶性能、血浆差异代谢物和代谢通路的影响。选择年龄、胎次、体况、上一胎次产奶量及预产期相接近的围产期母牛100头,随机分为2组,每组50头... 详细信息

本试验旨在研究围产期饲粮中添加蛋氨酸羟基类似物异丙酯(HMBi)和N-氨甲酰谷氨酸(NCG)对奶牛产奶性能、血浆差异代谢物和代谢通路的影响。选择年龄、胎次、体况、上一胎次产奶量及预产期相接近的围产期母牛100头,随机分为2组,每组50头。对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂基础饲粮+30 g/d的HMBi+20 g/d的NCG。试验期为42 d,其中围产前期21 d,围产后期21 d。结果表明:与对照组相比,试验组产后第21天产奶量显著提高(P细胞数差异不显著(P>0.05);试验组奶牛血浆代谢组中有17个代谢物上调,15个代谢物下调,主要富集在亚油酸代谢、维生素的消化和吸收代谢、丙酮酸代谢、维生素B 6代谢、不饱和脂肪酸的生物合成等代谢途径。由此可见,围产期饲粮中添加HMBi和NCG可以提高奶牛产奶量和乳脂产量,降低乳尿素氮含量,增强机体抗氧化能力和免疫能力,改善机体脂质代谢,缓解能量负平衡。

关键词：奶牛围产期蛋氨酸羟基类似物异丙酯 N-氨甲酰谷氨酸产奶性能血浆代谢组

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

固原黄牛不同部位肌肉组织代谢组学分析

畜牧兽医学报 2024年第4期55卷 1565-1578页

作者：王中波刘爽贺丽霞冯雪杨梦丽汪书哲刘源冯兰丁晓玲冀国尚杨润军张路培马云宁夏大学动物科技学院宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室银川750021 吉林大学动物科学学院长春130000 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193

旨在探究与固原黄牛肉风味形成相关的关键代谢物、代谢途径和酶,为深入解析固原黄牛肉肉品组成提高肉品质量奠定基础。本研究选用同一生长条件下,24月龄的6头健康雄性固原黄牛作为研究对象,利用非靶向代谢组学技术对眼肉、肩肉和臀肉3... 详细信息

旨在探究与固原黄牛肉风味形成相关的关键代谢物、代谢途径和酶,为深入解析固原黄牛肉肉品组成提高肉品质量奠定基础。本研究选用同一生长条件下,24月龄的6头健康雄性固原黄牛作为研究对象,利用非靶向代谢组学技术对眼肉、肩肉和臀肉3个组进行代谢物分析鉴定,通过主成分分析、偏最小二乘法判别分析和聚类分析筛选差异代谢物,并对筛选结果进行富集分析。随后,利用FELLA分析调控不饱和脂肪酸合成代谢相关的途径以及潜在的关键代谢物,同时对差异代谢物进行WGCNA分析。代谢物分析结果显示,固原黄牛眼肉、肩肉和臀肉3个组共鉴定出689个代谢物,其中脂质和类脂分子占比32.08%,脂肪酸类代谢物49种,聚类分析肩肉组和臀肉组样本聚为一类,眼肉组样本单独为一类。N6,N6,N6-三甲基-L-赖氨酸(N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine)和麦芽三糖(maltotriose)是眼肉、肩肉和臀肉组与组之间共同的差异代谢物,二者含量均在眼肉最高。KEGG通路分析显示,差异代谢物主要富集在不饱和脂肪酸生物合成、嘌呤代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等代谢通路。通过WGCNA分析筛选出与3个肌肉部位相关的模块,并鉴定出了各模块中的关键代谢物。本研究通过对固原黄牛不同部位肌肉组织进行代谢组学分析,鉴定到与肉品质差异和风味形成相关的10种关键代谢物和17种关键酶,为今后探究固原黄牛肉风味形成的分子调控机制和分子育种提供理论基础,同时也为其他肉牛的品质性状育种提供参考。

关键词：固原黄牛非靶向代谢组学风味不饱和脂肪酸分子育种