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基于GEO数据库线粒体脑肌病伴高乳酸血症和卒中样发作芯片数据的生物信息学分析

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中国现代神经疾病杂志 2020年第4期20卷 347-353页

作者：许谦高阳李蕾严峻王礼玲任桃杰徐州医科大学盐城临床学院神经内科 224000 徐州医科大学盐城临床学院转化医学中心 224000

目的从分子水平探讨线粒体脑肌病伴高乳酸血症和卒中样发作(MELAS)的可能发病机制和临床表现。方法自GEO数据库中获取野生型细胞系和高表达mtDNA A3243G位点突变细胞系的芯片信息,采用R语言程序分析获得差异表达基因,行GO富集分析和KEG... 详细信息

目的从分子水平探讨线粒体脑肌病伴高乳酸血症和卒中样发作(MELAS)的可能发病机制和临床表现。方法自GEO数据库中获取野生型细胞系和高表达mtDNA A3243G位点突变细胞系的芯片信息,采用R语言程序分析获得差异表达基因,行GO富集分析和KEGG通路富集分析并通过多组芯片的两两比较筛选出共同的差异表达基因,蛋白质相互作用网络分析关键调控基因与MELAS发病机制和临床症状之间可能的关联。结果自GEO数据库中筛选获得563个差异表达基因,250个基因表达上调、313个基因表达下调;GO富集分析显示,差异表达基因的主要功能是细胞外基质(ECM)粘附的生物学过程;KEGG通路富集分析包括磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用通路、转化生长因子-β(TGF-β)信号通路、ECM受体相互作用通路等。STRING数据库筛选出GNG2、SDC2、ANXA1、FN1、TNC、CYR61、IGFBP3、LTBP1、SERPIND1共9个关键基因。3组芯片进行两两比较筛选出PAMR1、GLRX5、SNCA等共同的差异表达基因。结论ECM粘附的生物学过程以及PI3K-AKT信号通路、TGF-β信号通路、ECM受体相互作用通路均参与线粒体能量代谢过程,可能与MELAS的发病机制有关;GNG2、TNC、LTBP1、PAMR1、GLRX5、SNCA等作为关键基因可能与MELAS的临床表现有关。

关键词： MELAS综合征基因蛋白质阵列分析计算生物学

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改性墨鱼黑色素的制备及体外磁共振成像性能

功能材料 2019年第11期50卷 11019-11023页

作者：彭晓阳陈安琪孙菁华张瑞平山西医科大学转化医学研究中心太原030000 山西医科大学医学影像学太原030000 山西大医院影像科太原030000

从新鲜墨鱼的墨囊中提取黑色素(MNP),对其进行PEG官能化并加载过量Mn^2+,制备一种水溶性磁共振成像(MRI)对比剂MNP-PEG-Mn纳米粒。采用透射电子显微镜(TEM)和马尔文粒度分析仪对MNP-PEG-Mn纳米粒的形貌、粒径以及zeta电位进行表征,并进... 详细信息

从新鲜墨鱼的墨囊中提取黑色素(MNP),对其进行PEG官能化并加载过量Mn^2+,制备一种水溶性磁共振成像(MRI)对比剂MNP-PEG-Mn纳米粒。采用透射电子显微镜(TEM)和马尔文粒度分析仪对MNP-PEG-Mn纳米粒的形貌、粒径以及zeta电位进行表征,并进一步通过cell counting kit-8(CCK8)检测法测试其细胞毒性,最后进行体外弛豫性能测试。结果表明,MNP-PEG-Mn纳米粒为分散性好的球形颗粒,粒径为240 nm左右,zeta电位为-20.2 mV;CCK8检测法数据显示Hep2细胞与MNP-PEG-Mn孵育24 h后存活率均达到80%以上,说明其没有明显的毒副作用,生物安全性好;体外MRI结果可以看出,随着Mn^2+浓度的增加,图像呈现明显的T1信号,与临床对比剂钆双胺相比,MNP-PEG-Mn纳米粒体外成像效果显著增强,其弛豫率r1达到37.09 mM^-1/s,远高于钆双胺的5.248 mM^-1/s。

关键词：墨鱼黑色素水溶性 MRI对比剂弛豫性能生物安全性

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面部脂肪移植血管栓塞的防治进展

实用医学杂志 2020年第4期36卷 429-433页

作者：郑志芳黄文华南方医科大学基础医学院人体解剖学国家重点学科广东省医学3D打印应用转化工程技术研究中心广州510515

面部脂肪移植是面部年轻化的主要技术之一。作为一项日新月异的技术,面部脂肪移植却因可能导致血管栓塞,而让整形外科医生手术时充满着敬畏、如履薄冰,也让不少求美者望而却步。脂肪栓塞一旦发生,后果严重,治疗十分困难。因此对如何防... 详细信息

面部脂肪移植是面部年轻化的主要技术之一。作为一项日新月异的技术,面部脂肪移植却因可能导致血管栓塞,而让整形外科医生手术时充满着敬畏、如履薄冰,也让不少求美者望而却步。脂肪栓塞一旦发生,后果严重,治疗十分困难。因此对如何防治脂肪移植引起血管栓塞的方法进行综述很有必要,希望本综述能对脂肪移植的临床工作有参考价值。

关键词：面部整形脂肪移植脂肪栓塞血管栓塞预防与治疗

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中华实验外科杂志 2017年第11期34卷 1847-1850页

作者：关红亚刘嘉王亚东尚国伟王义生连鸿凯曹巍李月白郑州大学附属郑州中心医院转化医学中心 450007 郑州大学附属郑州中心医院骨科 450007 郑州大学基础医学院生物化学与分子生物学系 450001 郑州大学第一附属医院骨科河南省高等学校临床医学重点学科开放实验室450052

目的检测长链非编码RNA（lncRNA）结肠癌相关转录物2（CCAT2）在人骨肉瘤中的表达并观察其对人骨肉瘤MG63细胞增殖、侵袭和凋亡能力的影响。方法采用实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR）检测20例人骨肉瘤患者癌组织及癌旁组织CCAT2的表达... 详细信息

目的检测长链非编码RNA（lncRNA）结肠癌相关转录物2（CCAT2）在人骨肉瘤中的表达并观察其对人骨肉瘤MG63细胞增殖、侵袭和凋亡能力的影响。方法采用实时定量聚合酶链反应（RT-qPCR）检测20例人骨肉瘤患者癌组织及癌旁组织CCAT2的表达和人骨肉瘤MG63细胞与正常成骨细胞hFOB1.19的CCAT2表达。合成针对CCAT2的特异性小干扰RNA（si-CCAT2），通过脂质体介导，将其转染入MG63细胞，实验分为空白对照组、小干扰RNA（siRNA）-NC组、siRNA-1组和siRNA-2组，后利用RT-qPCR技术检测4组细胞中CCAT2的表达量，验证siRNA沉默效果；细胞计数试剂盒（CCK-8）、Transwell实验和流式细胞术分别检测细胞的增殖、侵袭和凋亡能力。结果CCAT2在人骨肉瘤组织和正常组织中的相对表达水平为2.448±1.013和1.551±0.769，两者差异有统计学意义（t＝3.295，P＝0.002）；在MG63细胞和hFOB1.19细胞的相对表达水平为2.357±0.157和1.329±0.498，两者差异有统计学意义（t＝2.566，P＝0.020）。沉默细胞中CCAT2后，与NC组（1.064±0.092）和空白对照组（1.076±0.135）比较，siRNA-1和siRNA-2组CCAT2表达量（0.499±0.030、0.519±0.097）明显下降（tsiRNA-1组＝7.248，PsiRNA-1组＝0.002；tsiRNA-2组＝5.814，PsiRNA-2组＝0.004）。降低CCAT2的表达后，MG63细胞增殖活性明显下降，siRNA-1组和siRNA-2组平均细胞侵袭个数为（40.00±2.00）、（38.67±2.08）个，较NC组[（65.00±3.61）个]和空白对照组[（65.33±3.51）个]明显减少（tsiRNA-1组＝10.857，PsiRNA-1组＝0.001；tsiRNA-2组＝11.314，PsiRNA-2组＝0.000）；细胞凋亡能力[（44.76±2.49）%、（46.53±2.66）%]较NC组[（5.01±0.20）%]和空白组[（5.43±0.47）%]明显增加（tsiRNA-1组＝26.832，PsiRNA-1组＝0.000；tsiRNA-2组＝26.370，PsiRNA-2组＝0.000）。结论lncRNA CCAT2在人骨肉瘤组织和细胞中表达上调，抑制CCAT2的表达可显著抑制MG63细胞的增殖和侵袭，促进细胞的凋亡。

关键词：长链非编码RNA 骨肉瘤结肠癌相关转录物2 增殖侵袭

KRAS对T⁃ALL细胞株增殖及凋亡的影响

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中国实验血液学杂志 2022年第4期30卷 1040-1048页

作者：柳梓杨舒逸傅国苏虹宇朱丹曾腊梅马德禹邹琳重庆医科大学附属儿童医院临床分子医学中心国家儿童健康与疾病临床医学研究中心儿童发育疾病研究教育部重点实验室儿科学重庆市重点实验室重庆400014 上海交通大学附属儿童医院临床研究中心上海交通大学医学院儿童感染免疫与重症医学研究院上海200062

目的:探讨RAS蛋白家族在维持T⁃ALL细胞株体外生长中的功能。方法:纯化T⁃ALL细胞株DNA,利用PCR法扩增3个RAS基因(KRAS、NRAS、HRAS)的编码区。经T⁃A克隆后,Sanger法对KRAS、NRAS、HRAS基因编码区测序。将siRNA克隆到pSEH⁃361载体,在HEK⁃2... 详细信息

目的:探讨RAS蛋白家族在维持T⁃ALL细胞株体外生长中的功能。方法:纯化T⁃ALL细胞株DNA,利用PCR法扩增3个RAS基因(KRAS、NRAS、HRAS)的编码区。经T⁃A克隆后,Sanger法对KRAS、NRAS、HRAS基因编码区测序。将siRNA克隆到pSEH⁃361载体,在HEK⁃293T细胞中与pAMPHO和pVSVG一起包装成逆转录病毒,随后感染T⁃ALL细胞。qRT⁃PCR和Western blot检测基因表达情况。利用Annexin V⁃PE/7⁃AAD染色T⁃ALL细胞,流式细胞术检测细胞凋亡情况。利用Hoechst 33258染色T⁃ALL细胞,流式细胞术检测细胞周期分布情况。经抗体染色,荧光显微镜观察cleaved⁃Caspase 3蛋白的表达。结果:在T⁃ALL细胞株中,除Loucy和P12⁃ICH细胞KRAS基因发生c.6187G>A(***12D)突变,其余RAS基因均未发现错义突变。除PEER细胞(IC_(50)=47.916μmol/L)外,泛RAS抑制剂Compound 3144对其它T⁃ALL细胞均有一定杀伤作用。同样,除PEER细胞(IC_(50)=94.2265μmol/L)外,Tipifarnib可诱导多种T⁃ALL细胞凋亡。抑制KRAS表达后,T⁃ALL细胞凋亡明显,细胞周期阻滞。结论:KRAS蛋白维持T⁃ALL细胞株体外生长,是治疗T⁃ALL的潜在药物靶点。

关键词： RAS 急性T淋巴细胞白血病细胞增殖细胞凋亡

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光谱学与光谱分析 2020年第11期40卷 3579-3584页

作者：杨超朱朕李静孙运恒欧阳雪岩王佳唯黄骞丁罡王耀晟姜峰新华医院崇明分院癌痛转化研究所上海202150 上海大学生命科学学院/医学院上海200436 上海国际医学中心肿瘤科上海201318 河南省人民医院河南郑州450003 仁济医院上海市肿瘤研究所上海200032

疼痛是肿瘤患者最常见的症状之一,长期以来,临床肿瘤治疗过程中对于疼痛症状的控制仍然不能得到足够的重视。疼痛促进肿瘤的作用机制也尚未得到全面的解析。Substance P(SP)作为介导疼痛的神经肽在癌痛患者血清中高表达。通过同步辐射... 详细信息

疼痛是肿瘤患者最常见的症状之一,长期以来,临床肿瘤治疗过程中对于疼痛症状的控制仍然不能得到足够的重视。疼痛促进肿瘤的作用机制也尚未得到全面的解析。Substance P(SP)作为介导疼痛的神经肽在癌痛患者血清中高表达。通过同步辐射显微红外光谱成像对SP刺激后的肿瘤细胞进行红外光谱采集分析,以期揭示疼痛促进肿瘤的可能机制。结果显示在乳腺癌细胞系MDA-MB-231, MCF-7及肺癌细胞系A549, SPCA-1中,反映蛋白质二级结构的酰胺Ⅰ在1 655 cm^-1附近的吸收峰发生蓝移,说明SP刺激肿瘤细胞可能引起肿瘤细胞蛋白质二级结构的改变。在MDA-MB-231和A549细胞系中,光谱1 500~1 600 cm^-1波段和1 600~1 700 cm^-1中酰胺Ⅰ吸收峰和酰胺Ⅱ吸收峰也显著下降,说明在这两种细胞系中,肿瘤细胞的蛋白质表达也出现明显降低。A549细胞系中,光谱1 070~1 090cm^-1区段和1 230~1 250cm^-1中磷酸二酯基团的正反伸缩振动峰位蓝移,表明疼痛介质SP刺激A549细胞系还影响了该细胞系核酸的结构,提示SP可能引起肿瘤细胞抑癌基因的损伤及癌基因的激活。同步辐射显微红外光谱通过对单一肿瘤细胞的光谱成像分析,揭示了持续性疼痛症状通过神经递质的释放影响肿瘤细胞的生物学活性,可能是通过改变肿瘤细胞内蛋白质及核酸的结构实现的。光谱学结果显示,疼痛等不良症状的存在,疼痛相关物质的释放可能影响肿瘤细胞内蛋白质结构和表达及肿瘤细胞核酸变化,对肿瘤的治疗产生不利影响。提示在临床肿瘤治疗过程中,不仅需要重视对肿瘤细胞的杀灭,更需重视对周边症状的对症控制。

关键词：同步辐射显微红外光谱成像 P物质乳腺癌肺癌

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煤显微组分分子结构模型的量子化学研究

燃料化学学报 2004年第3期32卷 282-286页

作者：孙庆雷李文陈皓侃李保庆山东省科学院分析测试中心山东济南250014 中国科学院山西煤炭化学研究所煤转化国家重点实验室山西太原030001

采用分子力学和半经验量子化学方法,研究了神木煤显微组分的分子结构模型,比较了镜质组和惰质组分子模型的能量构成、不同类型键的键长和键裂解能。研究结果表明,扭转能和范德华能是分子中的主要作用力,取代基对体系能量有明显影响,烷... 详细信息

采用分子力学和半经验量子化学方法,研究了神木煤显微组分的分子结构模型,比较了镜质组和惰质组分子模型的能量构成、不同类型键的键长和键裂解能。研究结果表明,扭转能和范德华能是分子中的主要作用力,取代基对体系能量有明显影响,烷基取代基使体系能量增加,而苯基取代基使体系能量降低;脂肪C—C键长比芳香C—C键长长,说明脂肪C—C在受热过程中比芳香C—C更容易断裂分解。对各键裂解能的计算结果表明,Car—Cal键的裂解能高于Cal—Cal,Car—O醚键的裂解能高于Cal—O醚键。而惰质组结构模型中除C—O醚键外,各键的裂解能均高于镜质组,说明惰质组结构模型比镜质组有较高的热稳定性。

关键词：煤显微组分分子力学半经验计算量子化学

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环化酶抑制剂在提高番茄红素产量中的应用

食品与生物技术学报 2021年第6期40卷 25-31页

作者：陈鑫张洪发高娜吴愚胥欣茹王俊晓赵越超王燕龙济宁医学院山东省出生缺陷研究与转化协同创新中心山东济宁272013 艾美科健(中国)生物医药有限公司山东济宁272073

番茄红素是一类重要的天然红色色素,具有很强的抗炎、抗癌、抗氧化能力,目前已经广泛应用于食品、保健品、医疗等行业。在番茄红素生成过程中,环化酶抑制剂可以阻断番茄红素环化为β-胡萝卜素,从而大幅提高番茄红素产量。近年来环化酶... 详细信息

番茄红素是一类重要的天然红色色素,具有很强的抗炎、抗癌、抗氧化能力,目前已经广泛应用于食品、保健品、医疗等行业。在番茄红素生成过程中,环化酶抑制剂可以阻断番茄红素环化为β-胡萝卜素,从而大幅提高番茄红素产量。近年来环化酶抑制剂在细菌、酵母、霉菌、藻类及高等植物中均得到广泛应用。作者综述了环化酶抑制剂的种类及其对不同生物番茄红素产量的影响,并对其未来的应用前景和研究方向进行了展望。

关键词：环化酶抑制剂胺类化合物含氮杂环化合物番茄红素类胡萝卜素

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钛网修补材料对幼羊颅骨生长发育的影响研究

中华神经外科杂志 2020年第12期36卷 1273-1279页

作者：张晓璐杨扬文平李丹霞赵志军邵国杨军张春阳内蒙古科技大学包头医学院第一附属医院神经外科 014010 包头医学院神经外科疾病研究所(转化医学) 014010 内蒙古自治区骨组织再生与损伤修复工程技术中心包头014010 内蒙古自治区低氧转化医学重点实验室包头014010 首都医科大学宣武医院低氧适应转化医学北京重点实验室北京100053 北京大学第三医院神经外科 100191

目的探讨钛网对幼羊颅骨生长发育的影响。方法按随机数字表法将健康雌性小尾寒羊分为3组,分别为钛网组(n=3)、钛钉组(n=3)及假手术组(n=3)。钛网组将标准钛网以矢状缝为中线垂直覆盖于幼羊颅骨上,并在固定点(a、b、c、d、e、f)植入钛钉... 详细信息

目的探讨钛网对幼羊颅骨生长发育的影响。方法按随机数字表法将健康雌性小尾寒羊分为3组,分别为钛网组(n=3)、钛钉组(n=3)及假手术组(n=3)。钛网组将标准钛网以矢状缝为中线垂直覆盖于幼羊颅骨上,并在固定点(a、b、c、d、e、f)植入钛钉固定;钛钉组仅在固定点植入钛钉;假手术组仅切开头皮至骨膜不做任何处理。术后30 min及随后每6个月评估3组的神态和行动能力、采食行为及反刍行为。术前及术后24个月检测3组实验羊头围。手术中植入钛钉后和术后24个月对3组实验羊行头颅CT扫描,并测量钛网组和钛钉组的钛钉间距。手术植入钛钉后和术后24个月采用游标卡尺测量钛网组和钛钉组的钛钉间距。术后24个月处死3组实验羊后,测量其脑重量和脑容积。结果3组幼羊手术均成功,且均无死亡。术后30 min及术后6、12、18、24个月时,3组实验羊神态和行动能力、采食行为及反刍行为的差异均无统计学意义(均P>0.05)。3组实验羊手术前、后比较,头围均增加(均P0.05)。通过CT和游标卡尺测量的结果均显示,手术时,钛网组和钛钉组每两颗钛钉间距的差异均无统计学意义(均P>0.05);术后24个月时,钛钉组的钛钉间距bc、de、af、ad、ae、fb、fc、ce、bd、be均较钛网组增大(均P0.05)。钛钉组术后24个月时,钛钉间距bc、de、af、ad、ae、fb、fc、ce、bd、be均较手术时增大(均P0.05)。结论将钛网固定于幼羊颅骨并不影响其生长发育,且对其行为学和大脑容积也无显著影响;同时发现固定钛网的钛钉随颅骨的生长滑行移动,无钛网限制的钛钉随颅骨生长而"随波逐流"。

关键词：颅骨骨发育儿童钛网绵羊