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基于红景天苷对三阴性乳腺癌关键差异基因作用机制的生物信息学和分子对接技术分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 759-769页

作者：朱紫嘉陈霞崔曼文继红王苹宋东吉林大学第一医院乳腺外科吉林长春130021 吉林大学基础医学院药理学系吉林长春130021 吉林大学第一医院普通妇一科吉林长春130021 吉林大学第一医院耳鼻咽喉-头颈外科吉林长春130021

目的:通过生物信息学和网络药理学方法探讨红景天苷治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的作用机制,阐明其产生治疗作用的主要靶点和信号通路。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取数据集GSE45827,利用R软件包GSEABase进行基因集富集分析(GSEA),采... 详细信息

目的:通过生物信息学和网络药理学方法探讨红景天苷治疗三阴性乳腺癌(TNBC)的作用机制,阐明其产生治疗作用的主要靶点和信号通路。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获取数据集GSE45827,利用R软件包GSEABase进行基因集富集分析(GSEA),采用limma R软件包寻找相邻正常组织和TNBC组织之间的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,将DEGs与药物靶点结合,导入基因/蛋白相互作用检索搜查工具String数据库,形成蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。使用MCODE插件对PPI网络进行功能模块筛选,对SCORE值排名前2位的关键模块基因再次进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析。将2次KEGG富集分析所得通路与转录组数据GSEA富集分析结果取交集,获得红景天苷治疗TNBC的作用通路。使用CytoHubba插件计算出关键模块中最大团中心性(MCC)评分前10位的关键节点基因,即为核心基因。应用AutoDock Vina 1.1.2和PyMOL 2.3.0软件完成分子对接。结果:KEGG与GSEA富集分析的结果取交集得到13条共同通路,涉及细胞周期、细胞衰老和p53信号通路等。GO功能富集分析结果中所涉及的有丝分裂、核分裂和姐妹染色单体分离等生物学过程与细胞周期有密切关联,与KEGG富集分析结果一致。SCORE值排名第1位的关键模块中包含5个红景天苷药物作用靶点,分别为重组人细胞周期蛋白A2(CCNA2)、细胞周期检查点激酶1(CHEK1)、驱动蛋白家族成员11(KIF11)、DNA拓扑异构酶2(TOP2A)和胸腺嘧啶酸合酶(TYMS),将上述蛋白与红景天苷进行分子对接,结果均表现出很强的结合能力(结合能<-7.0 kcal·mol^(-1))。结论:红景天苷的紧密结合靶标位于TNBC的DEGs关键功能模块中,可以与CCNA2蛋白结合产生直接的调控作用,与KIF11、TOPA2、CHEK1和TYMS蛋白结合可针对TNBC的关键节点基因产生间接的调控作用,红景天苷有可能成为TNBC的临床治疗药物。

关键词：红景天苷三阴性乳腺癌生物信息学网络药理学分子对接

lncRNA H19和IGF2基因在乳腺癌组织中的表达水平及印记状态

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吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 1109-1115页

作者：魏雪文雪谢潇王月媛黄丹杨明吉林大学第一医院普外科中心乳腺外科吉林长春130021 吉林大学第一医院肿瘤中心器官再生与移植教育部重点实验室吉林长春130061

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)H19和胰岛素样生长因子2(IGF2)基因在乳腺癌组织中的表达水平,分析其印记状态。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测乳腺癌组织及癌旁组织中H19和IGF2 mRNA表达水平,分析H19和IGF2 mRNA在乳腺癌组... 详细信息

目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)H19和胰岛素样生长因子2(IGF2)基因在乳腺癌组织中的表达水平,分析其印记状态。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测乳腺癌组织及癌旁组织中H19和IGF2 mRNA表达水平,分析H19和IGF2 mRNA在乳腺癌组织及癌旁组织中的表达差异,利用单核苷酸多态性(SNP)区分等位基因表达情况(纯合或杂合),基因组DNA中IGF2(ApaⅠ位点)或H19(AluⅠ位点)为杂合则进行印记分析,确定H19和IGF2在乳腺癌组织中的印记状态,即印记保持(MOI)或印记丢失(LOI)。分析乳腺癌组织中H19和IGF2表达与分子分型的关系。结果:RT-qPCR法检测,乳腺癌组织中H19和IGF2 mRNA表达水平高于癌旁组织(P乳腺癌患者癌组织中H19 mRNA表达水平均高于癌旁组织(P乳腺癌组织中均存在LOI,IGF2的LOI发生率为36.7%,高于H19的LOI发生率(4.3%)。RT-qPCR法检测,IGF2 LOI组乳腺癌组织中IGF2 mRNA表达水平明显高于IGF2 MOI组(P乳腺癌组织中H19和IGF2 mRNA表达水平明显高于癌旁组织,IGF2的LOI发生率高于H19的LOI发生率,IGF2的LOI可能是乳腺癌发病的关键因素之一。

关键词：乳腺肿瘤长链非编码RNA H19 胰岛素样生长因子2 印记丢失单核苷酸多态性

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半胱氨酰tRNA合成酶2在金黄色葡萄球菌感染的奶牛乳腺上皮细胞中的作用

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吉林农业大学学报 2024年

作者：萨其拉梁巧李娜李丰阳雷连成吉林大学动物医学学院吉林大学白求恩第一医院

为探讨半胱氨酰tRNA合成酶2（Cysteinyl-tRNA synthetase 2， CARS2）在金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus， S. aureus）感染奶牛乳腺上皮细胞（MAC-T）中的作用，采用shRNA敲降CARS2，通过平板菌落计数法检测S. aureus对MAC-T细胞的黏附、侵袭和其在胞内的存活能力；流式细胞术检测S. aureus感染MAC-T后活性氧（ROS）的释放水平；qRT-PCR和ELISA技术检测S. aureus感染MAC-T细胞后IL-1β、IL-6、TNF-α的mRNA和蛋白表达水平；Western blotting检测S. aureus感染后对MAC-T细胞自噬的影响。结果显示：敲降CARS2不影响S. aureus向MAC-T细胞的黏附和侵袭（p ＞ 0.05），但却显著提高了其胞内存活能力（p ＜ 0.01），同时下调ROS的释放（p ＜ 0.05）；另外，敲降CARS2显著降低了S. aureus感染后炎性细胞因子IL-1β、IL-6和TNF-α的表达（p ＜ 0.05），下调细胞自噬（p ＜ 0.05）。结果表明：CARS2可能通过调控ROS和细胞自噬水平，抑制S. aureus在MAC-T细胞内的存活，CARS2可能是奶牛乳腺炎潜在的调控靶点。

关键词：半胱氨酰-tRNA合成酶2 金黄色葡萄球菌活性氧细胞自噬奶牛乳腺上皮细胞

抗体-IL-2耦联物纳米药物对多发性硬化的作用及机制

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中国老年学杂志 2024年第21期 5298-5300页

作者：王楚衡王晓爽安晶杨秋蓉李蕴潜韩雪梅吉林大学白求恩第一医院神经外科吉林大学中日联谊医院神经内科一病区

目的探究抗体-白细胞介素（IL）-2耦联物纳米药物（aT-IL2C NPs）对多发性硬化（MS）的作用及机制。方法建立MS经典动物模型实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型，小鼠出现明显症状时随机分为磷酸盐缓冲液（PBS）、抗TIGIT单克隆抗体... 详细信息

目的探究抗体-白细胞介素（IL）-2耦联物纳米药物（aT-IL2C NPs）对多发性硬化（MS）的作用及机制。方法建立MS经典动物模型实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型，小鼠出现明显症状时随机分为磷酸盐缓冲液（PBS）、抗TIGIT单克隆抗体（aTIGIT）+IL-2/抗IL-2单克隆抗体免疫复合物（JES6-1）、aTIGIT NPs+IL-2/JES6-1 NPs及aT-IL2C NPs组，分别在免疫后第10、12、14天进行静脉注射。监测各组临床评分及体质量变化。在免疫后第28天，进行脊髓组织快固兰染色，检测脊髓组织中免疫细胞水平及IL-10、转化生长因子（TGF）-β、IL-4、IL-17A、IL-22和IL-23水平。结果与对照组相比，aT-IL2C NPs组神经功能缺损评分显著降低（P<0.05）。aT-IL2C NPs组髓鞘白质染色均匀完整，脊髓组织CD4+T细胞中调节性T细胞（Treg）的频率显著增加，CD4+T细胞中Th17细胞显著降低，巨噬细胞/小胶质细胞频率显著降低脊髓组织IL-10、TGF-β和IL-4水平显著增加，IL-17A、IL-22和IL-23水平显著降低（均P<0.05）。结论 aT-IL2C NPs可能通过重塑Treg/Th17细胞平衡，降低疾病严重程度，为MS治疗提供新策略。

关键词：抗体-白细胞介素(IL)-2耦联物纳米药物多发性硬化调节性T细胞巨噬细胞/小胶质细胞

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青少年百草枯中毒后肺移植1例并文献复习

器官移植 2024年第1期15卷 112-117页

作者：孟凡杰张岩蔡宏飞孟凡宇王瑞崔有斌陈静瑜李洋吉林大学白求恩第一医院胸外科长春130021 南京医科大学附属无锡人民医院肺移植中心

目的总结百草枯中毒患者中毒后移植时机以及相关处理措施对预后的影响。方法回顾性分析1例百草枯中毒行双肺移植术治疗患者的临床资料,总结分析该例患者的临床表现、辅助检查以及诊治经过。结果1例17岁青少年在摄入25%百草枯20~30 mL后... 详细信息

目的总结百草枯中毒患者中毒后移植时机以及相关处理措施对预后的影响。方法回顾性分析1例百草枯中毒行双肺移植术治疗患者的临床资料,总结分析该例患者的临床表现、辅助检查以及诊治经过。结果1例17岁青少年在摄入25%百草枯20~30 mL后出现恶心、呕吐、咳嗽伴全身乏力入院。患者经对症支持治疗后,氧饱和情况无改善,肺部纤维化持续进展,遂在体外膜肺氧合(ECMO)辅助下行序贯双侧肺移植。经术后康复治疗,并积极防治并发症,患者于术后50 d出院。结论百草枯中毒后的移植时机可选择在肝肾功能开始恢复时,围手术期主动、有针对性地预防潜在致病性细菌感染,以及早期康复训练有助于改善肺移植受者的预后。

关键词：肺移植百草枯中毒肺纤维化呼吸衰竭体外膜肺氧合感染过客淋巴细胞综合征支气管狭窄

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阻塞性睡眠呼吸暂停基于不同特征的不同亚型异质性分析

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中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2024年第3期59卷 284-288页

作者：王亚茹于丹李爽于心陆李亚刘岩吉林大学白求恩第二医院耳鼻咽喉头颈外科吉林130041

阻塞性睡眠呼吸暂停(obstructive sleep apnea,OSA)是一种复杂多样的疾病,表现为睡眠期间上呼吸道部分或完全塌陷引起的反复呼吸暂停和低通气。近年来,根据解剖结构、并发症、临床症状、多导睡眠监测等不同因素,研究人员通过不同的分类... 详细信息

阻塞性睡眠呼吸暂停(obstructive sleep apnea,OSA)是一种复杂多样的疾病,表现为睡眠期间上呼吸道部分或完全塌陷引起的反复呼吸暂停和低通气。近年来,根据解剖结构、并发症、临床症状、多导睡眠监测等不同因素,研究人员通过不同的分类方式,尝试将患者划分为不同的亚型,这些亚型可以为OSA患者的潜在病因和治疗效果提供有价值的信息,更好地理解其异质性,促进个体化治疗。需要注意的是,在利用亚型分类进行临床管理和研究时,需要考虑亚型的准确性、可重复性、临床实用性以及不同分类标准下亚型的相互联系。确保包括不同种族、性别和年龄群体的患者样本,以更好地反映OSA的异质性,是推进亚型分类研究的重要目标。

关键词：阻塞性睡眠呼吸暂停反复呼吸暂停睡眠期间多导睡眠监测个体化治疗临床实用性低通气分类方式

折叠皮瓣在梨状窝癌喉功能重建及梨状窝成形术中的应用及探讨

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中华耳鼻咽喉头颈外科杂志 2024年第8期59卷 844-849页

作者：庞英娜许承弼金春顺赵雪吉林大学白求恩第二医院耳鼻咽喉头颈外科长春130041

目的应用折叠皮瓣修复梨状窝癌手术部分喉及部分下咽缺损,并观察其喉功能重建及下咽梨状窝成形后的临床疗效。方法回顾性分析2020年1月至2023年4月吉林大学白求恩第二医院收治,采用折叠岛状皮瓣修复的10例梨状窝癌病例,均为男性,年龄42... 详细信息

目的应用折叠皮瓣修复梨状窝癌手术部分喉及部分下咽缺损,并观察其喉功能重建及下咽梨状窝成形后的临床疗效。方法回顾性分析2020年1月至2023年4月吉林大学白求恩第二医院收治,采用折叠岛状皮瓣修复的10例梨状窝癌病例,均为男性,年龄42~68岁。本组首选治疗方案均为手术治疗,颈淋巴清扫及气管切开后,行喉部分切除+下咽病变切除,取制备好的皮瓣进行折叠修复(9例选取颏下瓣,1例选取锁骨上皮瓣),重建恢复喉及下咽的生理性解剖结构,其中重点重建的结构是披裂、杓状会厌襞及梨状窝。随访并总结临床疗效。结果10例患者术后喉与咽腔结构重建良好,皮瓣全部成活,无咽瘘发生。术后2周患者均正常经口进食,无明显呛咳;其中4例患者完成吞咽功能评估,无误吸或仅产生少量误吸。患者术后均行放疗。术后随访时间为5.4~41.4个月,无肿瘤复发或死亡。喉镜示8例患者新喉口宽敞,满足拔管条件,其中7例患者已拔除气管套管,1例堵管观察中;2例患者因皮瓣较厚,新喉口略狭窄。患者术后均保留发音功能。结论折叠岛状皮瓣可恢复喉及下咽的生理性解剖结构,可用于喉功能重建及梨状窝成形。

关键词：下咽肿瘤岛状皮瓣修复外科手术

基于生物信息学分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达及临床意义

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中国老年学杂志 2024年第1期44卷 15-21页

作者：李娜曹状程显斌向新胡雪王思佳吉林省医疗急救指挥中心吉林长春130021 吉林大学第二医院甲状腺外科吉林大学中日联谊医院胃肠结直肠外科吉林大学中日联谊医院乳腺外科吉林省人民医院烧伤整形外科

目的探讨PRD-BF1和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族在甲状腺癌中的表达及与甲状腺癌患者预后的关系,对部分家族成员在甲状腺癌中的作用机制进行初步分析。方法运用UALCAN数据库分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达;UALCAN数据库分析PRDM家族与... 详细信息

目的探讨PRD-BF1和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族在甲状腺癌中的表达及与甲状腺癌患者预后的关系,对部分家族成员在甲状腺癌中的作用机制进行初步分析。方法运用UALCAN数据库分析PRDM家族在甲状腺癌中的表达;UALCAN数据库分析PRDM家族与甲状腺癌预后的关系;StarBase和HMDD数据库分析与PRDM家族成员相互作用的上游miRNA;StarBase数据库分析与PRDM家族成员相互作用的下游靶基因;DAVID数据库对PRDM家族成员相互作用的下游靶基因进行生物学功能注释。结果PRDM1、PRDM3在甲状腺癌组织中表达水平明显高于正常组织(P<0.05)。PRDM2、PRDM4、PRDM5、PRDM6、PRDM8、PRDM10、PRDM11、PRDM15、PRDM16在甲状腺癌组织中表达水平明显低于正常组织(P<0.05)。PRDM6、PRDM11、PRDM12、PRDM16与甲状腺癌的患者预后高度相关(P<0.05)。在甲状腺癌中与PRDM6相关并具有统计学意义的miRNA为hsa-miR-20a-5p、hsa-miR-625-5p(P<0.05)。对与PRDM6相关的下游靶基因预测并进行生物学功能注释,PRDM6可通过与靶基因的作用参与DNA损伤修复等生物学过程。结论PRDM家族的表达与甲状腺癌相关,部分家族成员的表达与甲状腺癌预后及临床病理特征密切相关。PRDM家族成员PRDM6可通过与上游miRNA及下游靶基因的相互作用,参与甲状腺癌的发生发展。PRDM家族,特别是PRDM6,可能成为甲状腺癌诊治的新靶点。

关键词： PRD-BF1和RIZ同源结构域蛋白(PRDM)家族生物信息学分析甲状腺癌

腔镜辅助下行乳腺癌切除后斜行带蒂腹直肌肌皮瓣即刻乳房再造术

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中华整形外科杂志 2024年第9期40卷 985-991页

作者：宋达疆张天怡王志远刘旭李赞王晓珍中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院湖南省肿瘤医院肿瘤整形外科长沙410008 哈尔滨医科大学附属第一医院乳腺外科哈尔滨150001 中南大学湘雅医学院附属肿瘤医院湖南省肿瘤医院超声诊断中心长沙410008 吉林大学第一医院普外中心乳腺外科长春130021

目的探讨在腔镜技术辅助下完成乳腺癌病灶切除, 以斜行带蒂腹直肌肌皮瓣即刻再造乳房的临床价值及治疗效果。方法回顾性分析2023年5至9月湖南省肿瘤医院收治的乳腺癌切除后以斜行带蒂腹直肌肌皮瓣即刻再造乳房的患者资料。手术方法:首... 详细信息

目的探讨在腔镜技术辅助下完成乳腺癌病灶切除, 以斜行带蒂腹直肌肌皮瓣即刻再造乳房的临床价值及治疗效果。方法回顾性分析2023年5至9月湖南省肿瘤医院收治的乳腺癌切除后以斜行带蒂腹直肌肌皮瓣即刻再造乳房的患者资料。手术方法:首先采用腔镜技术通过侧胸切口完成腋窝前哨淋巴结活检和乳腺癌皮下腺体切除术, 然后制备去表皮的单侧斜行带蒂腹直肌肌皮瓣, 直视下分离腹直肌肌蒂表面的皮下隧道, 进一步在腔镜辅助下分离腹直肌肌蒂到乳房深面的皮下隧道, 转移斜行带蒂腹直肌肌皮瓣再造乳房。术后观察皮瓣成活情况, 出院后加强抗瘢痕治疗和功能康复锻炼, 对再造乳房外形、供受区切口瘢痕情况、腹壁功能、肿瘤复发及转移情况等进行随访。结果共纳入8例女性单侧乳腺癌患者, 年龄27~52岁, 平均41.7岁;体重指数为19.1~22.5 kg/m^(2);均为早期乳腺癌。术中切除乳房组织平均质量为245 g(220~285 g), 侧胸切口长度为6.9~9.5 cm, 平均7.7 cm, 3例采用同侧、5例采用对侧斜行带蒂腹直肌肌皮瓣再造乳房, 皮瓣长(20.4±0.7) cm、宽(10.8±1.5) cm、厚(5.4±0.9) cm, 皮瓣切取体积为19.7 cm×9.2 cm×4.4 cm~21.2 cm×11.8 cm×5.9 cm。所有皮瓣血运良好, 无需额外吻合血管, 全部顺利成活。术后随访8~10个月, 平均8.7个月, 再造乳房外形良好, 质地满意, 无皮瓣挛缩变形, 与健侧乳房外形基本对称;皮瓣供区及乳房受区切口愈合良好, 仅遗留线性瘢痕, 腹壁功能无明显影响。随访期间患者均未见肿瘤复发或转移。结论腔镜技术有助于最大程度地保留乳房皮肤组织的完整性, 减少瘢痕, 同时可协助分离皮下隧道便于带蒂腹直肌肌皮瓣转位再造乳房;对于乳房中等偏小且下腹部皮下组织量较富裕的患者, 制备单侧斜行带蒂腹直肌肌皮瓣再造乳房可获得较好的效果, 且不会额外增加供区损伤, 在提高手术安全性的同时明显降低手术难度。

关键词：乳腺肿瘤腔镜技术腹直肌肌皮瓣乳房再造