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2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第2期36卷 130-136页

作者：师悦耿梦杰周升陈曦孙军玲田雪莹徐红李昱郑灿军传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室、中国疾病预防控制中心北京102206 山东省疾病预防控制中心广西壮族自治区南宁市疾病预防控制中心

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病... 详细信息

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病学方法对病例地区、时间、人群分布及报告和诊断机构进行分析。结果 2010—2022年全国累计报告钩端螺旋体病病例4 559例,年均报告351例;报告病例数从2010年的679例下降至2018年的158例。四川省、云南省、广东省、湖南省、福建省、浙江省、广西壮族自治区、安徽省、江西省和贵州省累计报告钩端螺旋体病病例4 276例,占全国病例总数的93.79%;其中云南省近年病例数大幅下降,浙江省、广东省报告病例数明显增加。2010—2020年河南省无钩端螺旋体病病例报告,但2021、2022年分别报告5例和2例;2010—2017年陕西省仅报告1例病例,但自2018年起连续5年有病例报告。全国全年均有钩端螺旋体病病例报告,以8—10月为发病高峰,各省发病高峰存在差异;男性病例多于女性,男女性别比为2.3∶1;病例中位年龄50岁(四分位间距:23岁),以51~60岁组报告病例数占比最高(23.21%)。2010—2022年我国钩端螺旋体病报告病例中,确诊病例占53.28%,确诊病例占比从2010年的35.05%上升至2022年的61.66%。综合医院、疾病预防控制机构、基层卫生机构和其他卫生机构钩端螺旋体病报告病例数占比分别为67.22%(2 937例)、20.44%(893例)、7.23%(316例)、5.10%(223例)。2010—2022年全国钩端螺旋体病报告病例病死率为1.07%,男性病死率高于女性(1.39%vs.0.36%;χ^(2)=9.52,P=0.002)。结论2010—2022年我国钩端螺旋体病处于低水平流行状态,南方地区为主要流行区,各流行省份病例流行病学特征存在差异。陕西省、河南省等省份近年持续有病例报告,需加强关注。建议各地加强钩端螺旋体病监测,提升病例诊治能力,因地制宜开展防控工作。

关键词：钩端螺旋体病流行病学特征地区分布时间分布人群分布诊断监测中国

2017-2022年全国斑疹伤寒流行特征分析

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疾病监测 2024年第5期39卷 565-570页

作者：张云飞韩玲师悦田雪莹徐红耿梦杰滕中秋阚飙秦天中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室北京102206 山东省疾病预防控制中心山东济南250014 南宁市疾病预防控制中心广西南宁530023

目的分析我国2017—2022年斑疹伤寒流行特征,为制定斑疹伤寒防控策略提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统收集全国各省(自治区、直辖市)2017—2022年斑疹伤寒监测个案数据,运用描述流行病学方法进行... 详细信息

目的分析我国2017—2022年斑疹伤寒流行特征,为制定斑疹伤寒防控策略提供科学依据。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统收集全国各省(自治区、直辖市)2017—2022年斑疹伤寒监测个案数据,运用描述流行病学方法进行分析。结果2017—2022年全国每年报告病例数(发病率)分别为929例(0.07/10万)、971例(0.07/10万)、1173例(0.08/10万)、1069例(0.08/10万)、1310例(0.09/10万)、1291例(0.09/10万),报告病例数及发病率呈波动增加趋势。2017—2022年每年有22~24个省份[309~342个县(区)]报告病例,主要分布于云南、广东、四川、安徽、湖北、山东、广西、湖南、河北9个省份(自治区),9个省份(自治区)每年合计报告病例数占全国病例数比例波动于85.56%~91.14%,其中云南、安徽、湖北省每年报告病例数及占全国报告病例数比例均呈增加趋势,山东省呈下降趋势。全国每年报告病例居前10位县(区)合计报告病例数(占全国病例数比例)分别为293例(31.53%)、284例(29.25%)、332例(28.30%)、400例(37.42%)、579例(44.20%)、636例(49.26%)。职业分布主要为农民、学生、散居儿童及幼托儿童,每年占报告病例数的比例分别波动于61.04%~65.60%、10.71%~15.43%、7.67%~9.80%。男女性别比波动于0.86∶1~1.02∶1之间。每年报告病例均以40~64岁年龄组病例占比最高,波动于38.54%~43.69%。结论2017—2022年每年报告斑疹伤寒病例数居前的省份均为云南、安徽、广东、广西、四川、湖北、湖南、河北、山东9省份(自治区),每年合计报告病例数占全国病例数均在85.00%以上,云南、湖北、安徽省每年报告病例数呈增加趋势。病例高度散发与局部高发并存。应动态开展疫情分析、风险评估及预警,加强重点地区、重点人群综合防控措施,进一步降低居民感染风险。

关键词：斑疹伤寒流行特征风险评估防控策略

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1例输入性类鼻疽的病原学诊断及溯源分析

中国人兽共患病学报 2024年第1期40卷 76-81页

作者：杨红霞王春雨王洋郝瑞娥赵启玉郑霄山西省疾病预防控制中心重点传染性疾病预防与诊治山西省重点实验室太原030012 山西省人民医院太原030012 太原市疾病预防控制中心太原030032 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206

目的对1例输入性类鼻疽患者进行病原学诊断及溯源分析,为山西省类鼻疽防控提供科学依据。方法患者血培养阳性,分离菌株鉴定为泰国伯克霍尔德菌。采用生化试验及微生物质谱仪进行菌株鉴定,核酸提取后进行全基因组测序,分析MLST型和耐药... 详细信息

目的对1例输入性类鼻疽患者进行病原学诊断及溯源分析,为山西省类鼻疽防控提供科学依据。方法患者血培养阳性,分离菌株鉴定为泰国伯克霍尔德菌。采用生化试验及微生物质谱仪进行菌株鉴定,核酸提取后进行全基因组测序,分析MLST型和耐药基因携带情况,同时构建系统进化树。结果此次分离株经生化试验及微生物质谱仪检测均鉴定为类鼻疽伯克霍尔德菌,MLST型为ST366,全基因测序分析与海南省3个分离株进化亲缘关系较近,同源性较高。结论此例类鼻疽病例经分子溯源分析及流行病学调查确定为海南省输入,提示医疗机构及疾控部门应加强对类鼻疽的认识,提高诊疗能力。

关键词：类鼻疽类鼻疽伯克霍尔德菌 MLST分型全基因测序分子溯源

基于多种机器学习算法的人血浆辐射敏感脂质代谢物模型探索

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中华放射医学与防护杂志 2024年第6期44卷 457-463页

作者：陈琦赵骅蔡恬静高义哲高玲刘青杰中国疾病预防控制中心辐射防护与核安全医学所辐射防护与核应急中国疾病预防控制中心重点实验室北京100088 湖北省疾病预防控制中心传染病防治所急性传染病预防控制部武汉430079

目的通过脂质组学方法联合机器学习(ML)多种算法,探索人外周血辐射敏感脂质代谢物分类模型。方法收集2023年3—9月北京市某综合医院准备接受骨髓移植的25例白血病放射治疗病例,照射前和照射后外周血样本97份,其中对照组24份,为照射前血... 详细信息

目的通过脂质组学方法联合机器学习(ML)多种算法,探索人外周血辐射敏感脂质代谢物分类模型。方法收集2023年3—9月北京市某综合医院准备接受骨髓移植的25例白血病放射治疗病例,照射前和照射后外周血样本97份,其中对照组24份,为照射前血液样本;辐射组73份,为4、8、12 Gy照射剂量下的24、25和24份血液样本。采用基于超高效液相色谱-串联质谱(UPLC⁃MS/MS)平台的靶向脂质组学方法,分析辐射组与对照组差异脂质。线性回归筛选0~12 Gy的剂量范围内辐射剂量响应脂质。采用5种机器学习方法构建训练集辐射分类模型,验证集进行模型的验证和评价。结果与对照组相比,辐射组敏感的脂质代谢物中62个脂质浓度变化差异有统计学意义(t=-4.91~4.74,P<0.05),包括鞘磷脂(SM)、胆固醇酯(CE)、神经酰胺(Cer)、磷脂酰肌醇(PI)、己糖神经酰胺(HexCer)、溶血磷脂酰胆碱(LysoPC)、醚磷脂酰胆碱(PCO)、磷脂酰乙醇胺(PE)、溶血磷脂酰乙醇胺(LysoPE)这9大类。在0~12 Gy的剂量范围内,筛选出20种具有良好剂量反应的脂质代谢物,包括11个SM,7个CE,1个Cer和1个PI。决策树(DT)、支持向量机(SVM)、轻量梯度增强机(Light GBM)、随机森林(RF)、K最邻近(KNN)这5种机器学习训练模型拟合均较好(F1=0.69~1.00),灵敏度较高。通过评价验证指标,辐射分类判定效果最好的模型为随机森林(灵敏度1.00、准确率0.72、F1值0.80)。结论通过靶向脂质组学分析,发现人类样本中辐射响应的脂质代谢物和辐射剂量响应的脂质。机器学习方法中的RF模型可以为探索人类辐射脂质代谢物模型提供新的思路。

关键词：电离辐射脂质组学机器学习随机森林

一起由艾伯特埃希菌引起的学校聚集性疫情流行病学及病原学特征分析

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疾病监测 2024年

作者：黄世旺刘倩倪志敏俞骅王毅意田瑞高艺潇熊衍文方叶珍中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室杭州市上城区疾病预防控制中心杭州市疾病预防控制中心

目的了解2023年2月浙江杭州某学校发生的一起聚集性腹泻疫情的流行病学及病原学特征。方法对该起聚集性疫情开展流行病学调查，并采集腹泻患者肛拭子、食品留样及环境样品进行病原体快速筛查和分离鉴定，对分离的病原菌进行药敏试验... 详细信息

目的了解2023年2月浙江杭州某学校发生的一起聚集性腹泻疫情的流行病学及病原学特征。方法对该起聚集性疫情开展流行病学调查，并采集腹泻患者肛拭子、食品留样及环境样品进行病原体快速筛查和分离鉴定，对分离的病原菌进行药敏试验和全基因组测序分析。结果本次聚集性疫情共造成22人出现腹泻、腹痛、呕吐等胃肠道症状。从6例腹泻患者肛拭子中分离到eae基因阳性菌株，经进一步鉴定确证为艾伯特埃希菌。6株菌对26种抗生素均敏感，核心基因组的多位点序列分型（cgMLST）进化分析显示6株菌单独聚为一簇，且菌株间cgSNP差异仅在0～1之间。结论这起学校聚集性腹泻疫情是由艾伯特埃希菌引起，为中国首次报道由艾伯特埃希菌引起的聚集性疫情。

关键词：艾伯特埃希菌肠致病性大肠埃希菌聚集性疫情 eae基因全基因组测序

新疆维吾尔自治区阿克苏地区艾滋病抗病毒治疗失败人群耐药及分子网络分析

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病毒学报 2024年第4期40卷 862-868页

作者：黄永迪王凤英王吉亮金涛赵燕艳李虎阮玉华廖玲洁邢辉倪明健新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 阿克苏地区疾病预防控制中心阿克苏843000 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心传染病预防控制国家重点实验室北京102206

了解新疆维吾尔自治区阿克苏地区艾滋病抗病毒治疗失败人群耐药及分子网络特征情况。收集2020⁃2021年新疆维吾尔自治区阿克苏地区6个县接受抗病毒治疗超过6个月且HIV⁃1病毒载量≥1000拷贝/mL的人群血样,获得HIV⁃1 pol基因区序列,使用MEG... 详细信息

了解新疆维吾尔自治区阿克苏地区艾滋病抗病毒治疗失败人群耐药及分子网络特征情况。收集2020⁃2021年新疆维吾尔自治区阿克苏地区6个县接受抗病毒治疗超过6个月且HIV⁃1病毒载量≥1000拷贝/mL的人群血样,获得HIV⁃1 pol基因区序列,使用MEGA 5.02软件构建系统进化树判定毒株亚型,利用美国斯坦福大学耐药数据库进行耐药判定,运用HyPhy 2.2.1软件和Cytoscape 3.2.1软件进行HIV分子网络分析。研究获得HIV⁃1 pol区基因序列817条,毒株亚型以CRF07_BC为主,占99.1%(810/817)。HIV⁃1耐药率为58.5%(478/817),非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)类耐药率为53.0%(433/817),核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)耐药率为18.8%(154/817),蛋白酶抑制剂(PI)耐药率为7.8%(64/817)。多因素Logistic回归模型分析结果显示,治疗前CD4+T淋巴细胞计数为350~499个/μL发生耐药的风险是<350个/μL的0.61倍(95%CI:0.41~0.91)、初始治疗方案含洛匹那韦/利托那韦(LPV/r)二线治疗方案的耐药风险是含替诺福韦(TDF)一线治疗方案的0.27倍(95%CI:0.12~0.61)、开始抗病毒治疗年份在2018⁃2020年耐药发生风险是<2018年的0.62倍(95%CI:0.44~0.87)。按1.5%基因距离阈值构建分子网络,入网率为49.1%(401/817),发现分子簇26个,其中96.2%(25/26)的簇中有耐药突变位点。男性入网风险高于女性。提示阿克苏地区艾滋病抗病毒治疗失败人群耐药率较高,耐药株在分子网络中成簇出现,应加强抗病毒治疗和随访管理质量,减少耐药发生及毒株传播。

关键词：人免疫缺陷病毒抗病毒治疗病毒抑制失败耐药分子网络

我国布鲁氏菌病重点地区高风险职业人群个人防护用品使用及影响因素分析

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中华流行病学杂志 2024年第3期45卷 379-384页

作者：王哲林胜红刘新荣于爱枝木合塔·艾山杰恩斯·巴衣到列提李瑞卿梁新望侯碧桥王艺菲刘才兄张翠红王丽萍杭州市疾病预防控制中心传染病防制所杭州310021 微生物流行病研究所病原与生物安全国家重点实验室北京100071 大同市疾病预防控制中心大同037056 霍城县疾病预防控制中心伊犁835299 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 伊犁哈萨克自治州疾病预防控制中心伊犁835099 大同市阳高县疾病预防控制中心大同038199 大同市左云县疾病预防控制中心大同037599 大同市浑源县疾病预防控制中心大同037499 中国疾病预防控制中心传染病管理处/传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调... 详细信息

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调查。结果共调查高风险职业人群2384人,个人防护用品规范使用率为20.13%(480/2384),手套、口罩、胶鞋和工作服4种主要个人防护用品的使用率分别为38.26%(912/2384)、31.80%(758/2384)、32.01%(763/2384)和30.87%(736/2384)。不同年龄、职业、文化程度、地区的人群不同防护用品的使用率和规范使用率的差异有统计学意义(均P重点地区高风险职业人群4种主要个人防护用品使用率均不高,规范使用率低,不同地区差异很大,与防治计划目标差距较大,亟需向高风险职业人群发放防护用品,并开展易于接受的个人防护使用的宣教活动,加强各地经验交流和沟通。

关键词：布鲁氏菌病高风险职业人群个人防护用品规范使用健康教育

江苏省3个城市疱疹性咽峡炎流行病学与病原学特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 977-982页

作者：樊欢李明阳石平曹子轩许倩嵇红江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所国家卫生健康委员会肠道病原微生物重点实验室南京210009 南通市疾病预防控制中心急性传染病防制科南通226001 无锡市疾病预防控制中心急性传染病防制科无锡214023 盐城市疾病预防控制中心急性传染病防制科盐城224001 苏州市疾病预防控制中心急性传染病防制科苏州215026

目的分析江苏省3个城市疱疹性咽峡炎(HA)流行病学与病原学特征,为江苏省HA的精准防控提供参考依据。方法选择无锡市、苏州市和盐城市的3家监测哨点医院,2018年5月至2022年12月定期从医院住院管理系统分年龄段收集HA的就诊和住院病例的... 详细信息

目的分析江苏省3个城市疱疹性咽峡炎(HA)流行病学与病原学特征,为江苏省HA的精准防控提供参考依据。方法选择无锡市、苏州市和盐城市的3家监测哨点医院,2018年5月至2022年12月定期从医院住院管理系统分年龄段收集HA的就诊和住院病例的相关信息。采用RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测,并对主要流行株的衣壳蛋白VP1编码基因序列进行测序分析、基因亚型的鉴别和系统进化分析。结果无锡市、苏州市和盐城市的HA就诊病例数为57709例,是同期报告的手足口病例数的1.76倍(57709/32831);HA住院占比为1.35%(781/57709),住院占比逐年呈上升趋势(χ^(2)=62.79,P市、江西省、云南省、天津市等)毒株的遗传距离和亲缘关系较为接近。结论HA疾病负担较重,12~59月龄组是HA发病的重点人群,流行高峰为5-7月。HA病原多样化,以肠道病毒A组为主。HA流行株具有较低的型内分化,未发现新的进化分支。建议将HA纳入手足口病监测工作或法定传染病。

关键词：疱疹性咽峡炎流行病学特征肠道病毒基因型

2009-2021年全国5岁以下儿童发热伴出疹症候群病原构成及流行特征分析

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疾病监测 2024年第6期39卷 681-687页

作者：林帆郭玉清李开明吴彦霖李柏松郑亚明崔爱利王丽萍中国疾病预防控制中心传染病管理处传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 重庆市疾病预防控制中心重庆400042 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的了解我国5岁以下儿童发热伴出疹症候群(RFS)的病原构成及流行特征,为儿童出疹性传染病的诊疗和和科学防控提供参考。方法基于国家传染病监测技术平台RFS监测数据,监测病原包括肠道病毒、麻疹病毒、风疹病毒、水痘–带状疱疹病毒、... 详细信息

目的了解我国5岁以下儿童发热伴出疹症候群(RFS)的病原构成及流行特征,为儿童出疹性传染病的诊疗和和科学防控提供参考。方法基于国家传染病监测技术平台RFS监测数据,监测病原包括肠道病毒、麻疹病毒、风疹病毒、水痘–带状疱疹病毒、登革病毒、人细小病毒B19、埃博拉病毒、寨卡病毒、人疱疹病毒6型、EB病毒、A组链球菌、伤寒、副伤寒沙门菌、伯氏疏螺旋体和立克次体。采用描述性流行病学方法分析2009—2021年全国5岁以下儿童RFS病原构成及流行特征。结果我国5岁以下儿童RFS患者以病毒感染为主,主要是肠道病毒(85.78%)、麻疹病毒(10.03%)和水痘-带状疱疹病毒(1.45%),合计占比为97.26%,风疹病毒等其余病原在2018—2021年占比有所增加。2009—2021年肠道病毒优势血清型从肠道病毒A组71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)转换为柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)和柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)。RFS总体病原检出率在1~2岁年龄组(70.53%)高于其他年龄组(χ2=292.336,P<0.001),南方地区(71.12%)高于北方地区(65.35%)(χ2=305.946,P<0.001);肠道病毒在1~2岁年龄组患儿、南方地区检出率较高,麻疹病毒在<1岁患儿、北方地区检出率较高,水痘–带状疱疹病毒在北方地区检出率较高。RFS总体病原在春夏季检出率高于秋冬季(χ2=295.060,P<0.001),其中肠道病毒夏秋季高发,麻疹病毒冬春季高发,水痘–带状疱疹病毒冬季高发,3种病毒南、北方地区季节性分布峰有所差异。结论2009—2021年全国5岁以下儿童RFS患儿以病毒感染为主,尤其以肠道病毒、麻疹病毒和水痘–带状疱疹病毒感染较为常见,RFS患儿病原体感染呈现多样化趋势,肠道病毒优势血清型发生转变,应持续加强对儿童RFS病原谱的监测。

关键词：发热伴出疹症候群 5岁以下儿童病原学和流行病学特征