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2009-2020年我国轮状病毒腹泻流行特征和基因型变化趋势

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中华流行病学杂志 2024年第4期45卷 506-512页

作者：唐必成孙军玲高峰王丽萍郑亚明李中杰中国疾病预防控制中心传染病管理处/传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 中国医学科学院北京协和医学院群医学与公共卫生学院北京100730

目的了解2009-2020年我国全人群腹泻患者中轮状病毒感染者的流行特征和基因型变化趋势,为进一步开展腹泻监测和防控提供科学依据。方法资料来源于国家科技重大专项传染病监测技术平台信息管理系统的我国28个省份252家哨点医院腹泻症候... 详细信息

目的了解2009-2020年我国全人群腹泻患者中轮状病毒感染者的流行特征和基因型变化趋势,为进一步开展腹泻监测和防控提供科学依据。方法资料来源于国家科技重大专项传染病监测技术平台信息管理系统的我国28个省份252家哨点医院腹泻症候群监测数据,采用描述性流行病学方法分析2009-2020年轮状病毒腹泻病例在不同气候带地区、人群以及时间的分布特点及A组轮状病毒腹泻病例的基因分型特征和变化趋势。结果2009-2020年共对114606例腹泻病例进行轮状病毒检测,轮状病毒阳性率为19.1%(21872/114606),阳性病例以A组轮状病毒为主(98.2%,21471/21872)。轮状病毒阳性率较高的年份分别为2009年(36.9%,2436/6604)和2010年(30.6%,5130/16790),2011-2017年在14.0%~18.0%之间变化,2018年小幅上升(20.3%,2211/10900),之后两年连续下降(15.5%,2262/14611和9.5%,470/4963)。男性(20.2%,13660/67471)的轮状病毒阳性率明显高于女性(17.4%,8212/47135);<5岁婴幼儿的轮状病毒阳性率最高(28.4%,18261/64300),是成年人的4倍以上。中温带、暖温带及亚热带地区的轮状病毒阳性率于12月至次年2月达高峰,而高原寒带存在2个高峰,分别出现在11月至次年1月及5-6月。2009-2020年A组轮状病毒优势基因型由G3P[8]、G1P[8]逐步发展为G9P[8]。结论2009-2020年我国轮状病毒感染总体呈现下降趋势,呈明显的季节性流行,各年龄组人群阳性率差异较大,儿童腹泻仍是重点关注的问题,需进一步加强轮状病毒疫苗的接种,持续开展流行特征和基因型变化的监测。

关键词：腹泻轮状病毒流行特征基因型

核苷(酸)类似物联合聚乙二醇干扰素治疗慢性乙型肝炎实现临床治愈的影响因素分析

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中华临床感染病杂志 2024年第2期17卷 126-132页

作者：胡晓宇季佳李兰娟浙江大学医学院附属第一医院传染病重症诊治全国重点实验室杭州310003

目的探究核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogues,NAs]联合聚乙二醇干扰素(pegylated interferon,Peg IFN)α-2a治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)实现临床治愈的影响因素。方法收集2013年1月1日至2023年12月1日在浙江大学医学院附属第一医院感染科门诊就诊并接受NAs与Peg IFNα-2a联合治疗≥48周的141例CHB患者临床资料,并进行回顾性分析。根据疗效分为临床治愈组(n=45)和临床未治愈组(n=96),通过多因素Logistic回归分析临床治愈的影响因素。结果多因素分析显示,基线HBsAg1 lg IU/mL(OR=0.114,95%CI 0.027~0.484,P=0.003)、使用经治策略(OR=0.351,95%CI 0.128~0.960,P=0.041)是预测联合治疗疗效的影响因素。结论经治策略疗效优于初治策略,治疗基线HBsAg水平<1500 IU/mL的病例相较基线水平高者更有希望获得临床治愈,基础疗程建议为48周,并可在48周时根据HBsAg下降程度评估是否延长治疗时间。

关键词：慢性乙型肝炎核苷(酸)类似物聚乙二醇干扰素α-2a 临床治愈

BRACO-19和TMPyP4在HBV-1.3mer质粒感染模型对HBV转录和复制的抑制作用

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中国病原生物学杂志 2024年第9期19卷 999-1003,1008页

作者：马海洋贺丽娜吕树娟余莉安徽医科大学基础医学院微生物学教研室安徽合肥230032 动物源性传染病安徽省重点实验室

目的探讨G-四链体小分子配体BRACO-19和TMPyP4对乙型肝炎病毒转录和复制的影响。方法利用含有HBV全基因组1.3倍复制子(HBV 1.3-mer)质粒转染HepG2细胞感染模型,BRACO-19和TMPyP4分别作用48 h,酶联免疫吸附试验检测上清表面抗原(HBsAg)和... 详细信息

目的探讨G-四链体小分子配体BRACO-19和TMPyP4对乙型肝炎病毒转录和复制的影响。方法利用含有HBV全基因组1.3倍复制子(HBV 1.3-mer)质粒转染HepG2细胞感染模型,BRACO-19和TMPyP4分别作用48 h,酶联免疫吸附试验检测上清表面抗原(HBsAg)和e抗原(HBeAg)表达水平,实时荧光定量PCR检测细胞内HBV Total RNA、3.5kbRNA以及DNA表达水平,将HBV DNA用plasmid SafeTMATP-Dependent DNase 37℃作用3 h后,定量PCR检测病毒cccDNA的表达;QGRS Mapper软件分析HBV推定的四链体形成序列(putative quadruplex-forming sequences,PQS),并在HBV 1.3-mer质粒DNA上设计PQS区域上下游引物及非PQS区域对照引物,两种小分子配体分别作用HBV 1.3-mer质粒DNA,qPCR stop试验分别定量PQS和非PQS区域DNA扩增水平,1%琼脂糖凝胶电泳可视化验证。结果20μmol/L BRACO-19和TMPyP4作用HepG2转染模型显著抑制HBsAg和HBeAg的表达水平,HBV的Total RNA、3.5 kb RNA、DNA和cccDNA水平相较于对照组均显著下调。通过不同浓度BRACO-19和TMPyP4作用HBV质粒DNA,qPCR stop试验发现随着BRACO-19和TMPyP4药物浓度递增可以显著抑制DNA聚合酶在基因组中三个HBV PQS区域的扩增。结论小分子配体BRACO-19和TMPyP4均能抑制HBV转染模型中的转录和复制,HBV基因存在富含鸟嘌呤的四链体形成序列,BRACO-19和TMPyP4特异性阻滞DNA聚合酶在HBV的PQS区域复制延伸。

关键词：乙型肝炎病毒 BRACO-19 TMPyP4 PCR stop assay

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发热伴出疹症候群监测预警研究进展

中华流行病学杂志 2024年第3期45卷 455-463页

作者：林帆郭玉清吴彦霖李开明郑亚明王丽萍中国疾病预防控制中心传染病管理处/传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

目的对发热伴出疹症候群(RFS)监测预警研究进行系统综述,为我国RFS监测与防控提供参考。方法以“发热”“出疹”“监测”以及“fever”“rash”“surveillance”为中英文检索词并补充其自由词,系统检索中国知网、万方数据知识服务平台、... 详细信息

目的对发热伴出疹症候群(RFS)监测预警研究进行系统综述,为我国RFS监测与防控提供参考。方法以“发热”“出疹”“监测”以及“fever”“rash”“surveillance”为中英文检索词并补充其自由词,系统检索中国知网、万方数据知识服务平台、PubMed、Web of Science数据库,语种限定为中文及英文,对纳入文献信息进行摘录整理及汇总描述。结果共纳入36篇文献,中英文分别为21篇和15篇。RFS病原学监测共19篇,病原体主要包括麻疹病毒、水痘-带状疱疹病毒、风疹病毒、肠道病毒、人类B19病毒、登革病毒、A组链球菌、伤寒/副伤寒沙门菌、人疱疹病毒、腮腺炎病毒和腺病毒;重大活动/突发自然灾害监测8篇,监测时段集中在2010-2015年,包括运动会、世界博览会、地震、热带风暴和宗教集会等;异常病例/聚集性疫情监测预警8篇,以国外研究为主,监测症候群范围广,监测场所为医疗机构,主要依靠《国际疾病分类》第九版(ICD-9)编码或患者主诉中诊断及症状进行自动判别预警;仅1篇针对预测研究,为蒙古国开展的基于传染病监测数据预测研究。36篇文献的分析方法包括描述性分析法、基于时间的预警模型(如回归分析法、固定阈值法、休哈特控制图法及累积和控制图法)和时间序列分析方法。结论未来RFS监测体系方向应聚焦已知病原和可能的未知病原监测预警相结合的模式,可进一步完善预警系统设计,实现无感化病例监测与早期预警,应用当下的信息抓取技术和智能建模方法,提高RFS监测预警的敏感度和特异性。

关键词：发热伴出疹症候群监测预警系统综述

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全球脑膜炎球菌多糖结合疫苗研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第4期44卷 304-316页

作者：徐娟严冬山徐丽李杰邵祝军中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

流行性脑脊髓膜炎(流脑)是由脑膜炎球菌感染引起的急性中枢神经系统性疾病,具有发病不确定性、起病急、进展快、致死和致残率均较高等特点,疾病负担重。脑膜炎球菌常定植在人的鼻咽部,国际上通常将脑膜炎球菌引起的一系列疾病,如败血症... 详细信息

流行性脑脊髓膜炎(流脑)是由脑膜炎球菌感染引起的急性中枢神经系统性疾病,具有发病不确定性、起病急、进展快、致死和致残率均较高等特点,疾病负担重。脑膜炎球菌常定植在人的鼻咽部,国际上通常将脑膜炎球菌引起的一系列疾病,如败血症、关节炎、脑膜炎、肺炎和心包炎等疾病统称为脑膜炎球菌病(meningococcal diseases)。至今接种疫苗是控制和预防该病最经济有效的措施之一。脑膜炎球菌分为12种血清群,目前全球均面临多菌群流行和变迁的威胁,为给人群提供更广更全的保护,多联多价脑膜炎球菌疫苗已成为研发和使用主力军。脑膜炎球菌疫苗的研发先后经历从单价到多价,从多糖到多糖结合疫苗的过程。脑膜炎球菌多糖结合疫苗在提升免疫原性、诱导免疫记忆和降低带菌率等方面具有明显优势。国际上首款四价和五价脑膜炎球菌多糖结合疫苗分别于2005年和2023年上市,我国首款四价脑膜炎球菌多糖结合疫苗于2021年底获批上市。本综述将系统梳理脑膜炎球菌多糖结合疫苗的研究进展,以期为我国脑膜炎球菌多糖结合疫苗的应用、脑膜炎球菌病的防控策略制定提供参考。

关键词：脑膜炎球菌病多糖结合疫苗安全性免疫原性持久性

群体感应调控子AphA对河弧菌Ⅵ型分泌系统VflT6SS2的调控研究

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中华流行病学杂志 2024年第4期45卷 566-573页

作者：程倩韩雨黄元铭冀赛森李杰刁保卫梁未丽传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR... 详细信息

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR和启动子-lux融合冷光系统检测野生株和ΔaphA中VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇代表基因tssB2、hcp(tssD2)和vgrG(tssI2)以及群体感应调控子HapR的mRNA相对表达量和启动子活性。采用定点突变实验结合启动子活性测定确定AphA在tssD2b启动子区的调控结合位点;采用电泳迁移率位移测定(EMSA)确定AphA与hapR启动子的结合。结果ΔaphA中tssB2、hcp(tssD2)、vgrG(tssI2)和hapR的mRNA相对表达量及Hcp蛋白的表达分泌明显高于野生株。VflT6SS2核心基因簇、tssD2a、tssI2a和hapR的启动子活性在ΔaphA中均高于野生株,而tssD2b启动子活性则低于野生株。tssD2a和tssD2b的启动子序列分析显示-335 bp~-229 bp区差异较大,在tssD2b中该区域存在2个潜在AphA结合位点,将其中的保守位点ATG替换为CGA,tssD2b启动子活性明显降低。EMSA结果显示,AphA与hapR启动子直接结合。结论AphA在转录水平直接抑制hapR的表达,间接参与对VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇的调控。AphA对tssD2a和tssD2b呈现相反的调控模式,AphA可直接与tssD2b启动子区(-335 bp~-229 bp)结合正向调控tssD2b的表达。

关键词：河弧菌群体感应调控子 Ⅵ型分泌系统转录调控

基于标本核酸的肺炎支原体基因分型荧光PCR方法的建立和应用

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第8期44卷 653-659页

作者：张倚玮刘立雍何利华孟凡亮顾瑞雪龚杰李少丽赵飞中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206 首都儿科研究所转化医学研究室北京100020

目的建立一种基于临床标本核酸的肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)核酸检测及基因分型方法。方法通过基因组学比对,选取Mp Genotype 1型和Genotype 2型菌株特异性靶序列设计合成引物和探针,建立Mp双荧光探针PCR检测分型方法,同时... 详细信息

目的建立一种基于临床标本核酸的肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,Mp)核酸检测及基因分型方法。方法通过基因组学比对,选取Mp Genotype 1型和Genotype 2型菌株特异性靶序列设计合成引物和探针,建立Mp双荧光探针PCR检测分型方法,同时评价该方法的特异度、准确度、检测限和重复性。采用建立的荧光PCR方法对临床标本核酸进行检测,并与已报道的荧光PCR方法进行比对。结果对与Mp种属关系相近的其他种支原体以及常见呼吸道细菌、病毒等18种病原体的核酸进行检测,结果显示均无交叉反应;对90份Mp核酸的检测及分型的准确度为100%。该方法对于Genotype 1型和Genotype 2型Mp检测限均为1.0拷贝/μl的核酸样本,组内、组间重复性实验变异系数均小于2.5%。对88份临床标本核酸的检测中,与已报道的荧光PCR方法RepMp1体系的检测结果相比,Kappa值为0.675,P值为0.267,显示出高度的一致性。结论本研究所建立的Mp核酸检测及基因分型方法敏感度和特异度高,分型准确,可应用于各级省市疾控系统对Mp的监测与防控,促进Mp防控体系的完善,增强监测能力,对Mp的预警预测具有重要意义。

关键词：肺炎支原体 MGB探针分型实时荧光PCR

中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析基因型多态性

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 990-996页

作者：张慧娟张恩民贺金荣李伟魏建春传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编... 详细信息

目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编号和命名,分析不同来源菌株MLVA基因型的分布特征,同时通过Bionumerics软件绘制聚类图,分析不同基因型间的遗传关系。结果MLVA15分型可将533株中国炭疽芽胞杆菌分为4群91个基因型,其中54个基因型为中国独有的基因型。新命名的基因型MLVA15-CHN1~MLVA15-CHN6广泛分布于中国不同地区、不同年代和宿主,其余基因型具有地区和年代特征性。结论本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库,掌握了MLVA基因型分布特征及其遗传多态性,为中国炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。

关键词：炭疽芽胞杆菌基因分型多位点可变数目串联重复序列分析遗传多态性

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质谱技术在核酸检测分析中的研究进展

中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 98-106页

作者：赵欣肖迪传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

质谱技术是一种基于质谱仪设备检测物质分子量的谱学技术方法。质谱类型众多、功能各异,在各个学科领域中广泛用于科学研究与应用技术开发。近年来,质谱技术在核酸检测分析中显现出巨大的潜力,尤其是基于基质辅助激光解吸电离飞行时间... 详细信息

质谱技术是一种基于质谱仪设备检测物质分子量的谱学技术方法。质谱类型众多、功能各异,在各个学科领域中广泛用于科学研究与应用技术开发。近年来,质谱技术在核酸检测分析中显现出巨大的潜力,尤其是基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的核酸检测分析技术,因其快速、高通量、准确等特性而成为研究热点。采用质谱技术进行核酸研究,突出表现在对单核苷酸多态性、基因突变、DNA甲基化及DNA拷贝数变异的检测分析。本文对质谱技术在核酸检测中的研究与应用进行阐述,以期为基于质谱的新型核酸检测技术的开发与应用提供参考。

关键词：质谱 DNA甲基化单核苷酸多态性 DNA拷贝数变异多重PCR-质谱微测序