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链霉菌HKIB0006中Collismycin A葡萄糖酸修饰产物的发现

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微生物学通报 2024年

作者：吉火伍来赵子康陈媛曹明明张雅琼云南中医药大学民族医药学院云南中医药大学中药学院中国科学院昆明植物研究所

【背景】2，2′-联吡啶类天然产物是一类由放线菌产生的抗菌化合物，抑制真菌活性显著，结构特征为包含2，2′-联吡啶片段。该类化合物未发现经后修饰的失活产物，其自抗性机制尚未明确。【目的】通过分离纯化并鉴定2，2′-联吡啶类化... 详细信息

【背景】2，2′-联吡啶类天然产物是一类由放线菌产生的抗菌化合物，抑制真菌活性显著，结构特征为包含2，2′-联吡啶片段。该类化合物未发现经后修饰的失活产物，其自抗性机制尚未明确。【目的】通过分离纯化并鉴定2，2′-联吡啶类化合物的后修饰产物，测试其抗真菌活性，评价后修饰对抗真菌活性的影响，初步探求2，2′-联吡啶类化合物存在的自我保护机制。【方法】利用纸片扩散法筛选对真菌有拮抗能力的放线菌并分离纯化该菌株；通过基因组测序及分析对其进行鉴定；利用硅胶柱色谱、高效液相色谱等手段分离纯化目标化合物，通过核磁共振波谱和质谱鉴定其结构；测定目标化合物抗真菌活性；最后通过序列比对来分析推测糖基转移酶。【结果】在链霉菌HKIB0006(Streptomyces sp. HKIB0006)中鉴定了两个2，2′-联吡啶类化合物。其中一个为新结构11-O-gluconicacid-collismycin A(1)，为已知抗生素collismycin A(2)的11位葡萄糖酸修饰产物，实验表明1的抗真菌活性消失。【结论】通过对链霉菌HKIB0006的次级代谢产物研究发现了一个新结构11-O-gluconicacid-collismycin A(1)，为collismycin A(2)的葡萄糖酸修饰产物。活性测试发现葡萄糖酸修饰导致2的抗菌活性丧失，推测葡萄糖酸修饰可能是2，2′-联吡啶类化合物的一种自抗性机制，该修饰可能是HKIB0006在与2长期共存中进化出的自我保护策略之一。

关键词：链霉菌 2,2′-联吡啶类化合物抗菌活性糖基转移酶

基于MaxEnt模型的单花荠生境适宜性分析及其分布变化

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第5期48卷 173-180页

作者：李瑞兰樊锦雅赵倩李廷菊王成辉丁荣古锐钟世红成都中医药大学民族医药学院成都中医药大学药学院西南民族大学药学院

【目的】探讨影响单花荠（Pegaeophyton scapiflorum）分布的主导气候因子，模拟其潜在适宜分布区，为单花荠的野生资源调查与保护提供合理依据。【方法】基于单花荠在中国的88个分布点数据和8个环境因子数据，运用最大熵（MaxEnt）模... 详细信息

【目的】探讨影响单花荠（Pegaeophyton scapiflorum）分布的主导气候因子，模拟其潜在适宜分布区，为单花荠的野生资源调查与保护提供合理依据。【方法】基于单花荠在中国的88个分布点数据和8个环境因子数据，运用最大熵（MaxEnt）模型预测在当前气候模式和RCP 2.6、RCP 4.5和RCP 8.5等3种未来气候变化模式下到2050年和2070年我国单花荠潜在适生区的变化情况，综合分析影响单花荠分布的主要环境因子及其适宜范围。【结果】（1）模型精度较高，AUC值为0.887。预测显示当代单花荠潜在适生区主要分布在青藏高原地区，总适生区面积约310万km2,含高适生区约80.81万km2。（2）地形地貌、温度和降水是影响单花荠分布的主要环境因子，其中分别以海拔、等温性和年平均降水量的影响最大。（3）在不同气候变化模式下，到2050年和2070年我国单花荠的适生区面积相对当前缩减24%～28%,高适生区降级成中适生区或低适生区，将表现为明显缩减甚至面临消失，且分布重心有向西、向高海拔区域偏移的趋势。【结论】研究结果可为单花荠野生资源的保护与可持续开发利用及人工栽培提供重要的参考依据。

关键词：野生植物资源单花荠最大熵(MaxEnt)模型潜在适生区青藏高原

来源：博看期刊

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滇黄精全长转录组测序及生物信息学分析

药学学报 2024年第6期59卷 1864-1872页

作者：米琪赵艳丽徐萍于梦雯张萱涂振华李春华郑国伟陈佳云南中医药大学中药学院云南昆明650500 云南中医药大学民族医药学院云南昆明650500 贡山县农业农村局农业综合发展服务中心云南怒江傈僳族自治州673500

本文通过PacBio Sequel平台对滇黄精根茎进行全长转录组测序,并对测序结果进行生物信息学分析,旨在为滇黄精基因功能的研究提供参考。最终测得polymerase reads为1120485个,总数据共77.73 GB。在NR数据库中,有41864个同源序列比对到5个... 详细信息

本文通过PacBio Sequel平台对滇黄精根茎进行全长转录组测序,并对测序结果进行生物信息学分析,旨在为滇黄精基因功能的研究提供参考。最终测得polymerase reads为1120485个,总数据共77.73 GB。在NR数据库中,有41864个同源序列比对到5个物种;有40506个在KOG数据库得到注释,根据其功能分为26类;有69060个得到GO注释,分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类的32个功能组;有45779个注释到KEGG数据库的145条代谢途经中,其中鉴定与多糖合成有关的转录本在糖酵解/糖异生代谢通路中有127条,淀粉和蔗糖代谢通路有144条,氨基酸糖和核苷酸糖代谢通路有85条,果糖和甘露糖代谢通路有69条;此外还检测到1781个转录因子,分布在37个转录因子家族中;检测到了180293个SSR位点,其中以单碱基重复占比最多,占所有碱基重复类型的30.48%,最少的是五碱基重复,仅为单碱基重复的0.14%。本研究结果为丰富滇黄精基因组信息,探索其有效成生物合成途径提供重要的数据支持。

关键词：滇黄精全长转录组种质资源多糖合成

机器学习在食品风味领域的研究进展与未来趋势

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食品科学 2024年第10期45卷 28-37页

作者：陈靓阳佳红田星湖南中医药大学药学院湖南长沙410208 湖南中医药大学湖南省中医药民族医药国际联合实验室湖南长沙410208

随着生活水平不断提高,人们除了关心食物是否美味外,其健康要素和良好风味的结合也越来越受到重视。食品风味成分不仅是影响食品感官品质的重要因素,也是影响食品营养水平的关键指标。目前,传统方法对食品风味成分进行分析及预测费时费... 详细信息

随着生活水平不断提高,人们除了关心食物是否美味外,其健康要素和良好风味的结合也越来越受到重视。食品风味成分不仅是影响食品感官品质的重要因素,也是影响食品营养水平的关键指标。目前,传统方法对食品风味成分进行分析及预测费时费力,且无法处理大量数据。相比之下,机器学习是人工智能的核心,在区分差异性以及寻找共同性上具有传统分析技术难以比拟的优势,在食品风味分析领域已取得了良好的应用。基于此,本文围绕机器学习在食品风味领域的研究现状,介绍常用的机器学习方法的原理和优点,及其在食品风味预测及调节中的最新应用与前景。重点探讨现代智能感官检测技术结合机器学习在食品风味分析领域研究的优势与未来趋势,以期为食品风味分析与预测领域研究提供新思路和理论基础。

关键词：机器学习食品风味风味分析与预测智能感官检测技术研究进展

大血藤对溃疡性结肠炎的治疗作用及基于GEO芯片联合网络药理学的机制探讨

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中国现代应用药学 2024年第3期41卷 332-340页

作者：徐锋余漂杜琳霖曾倩王君义吴红梅王祥培贵州中医药大学药学院贵阳550025 贵州民族大学民族医药学院贵阳550025

目的明确大血藤抗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用,并探讨其作用机制。方法以葡聚糖硫酸钠诱导UC小鼠模型评价大血藤抗UC作用;依据中国知网和PubMed网站获取大血藤的成分,SwissTargetPrediction数据库筛选成分靶点,GEO基因... 详细信息

目的明确大血藤抗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用,并探讨其作用机制。方法以葡聚糖硫酸钠诱导UC小鼠模型评价大血藤抗UC作用;依据中国知网和PubMed网站获取大血藤的成分,SwissTargetPrediction数据库筛选成分靶点,GEO基因芯片提取UC差异基因,构建大血藤“成分-靶点-疾病”网络,筛选核心靶点后,进行蛋白互作与聚类分析、生物过程及通路富集分析,并以分子对接和文献初步验证网络分析的可靠性。结果大血藤能显著改善UC小鼠的疾病活动指数评分、结肠缩短和结肠组织病理变化,具有良好的抗UC作用;网络分析发现大血藤抗UC核心成分包括(+)-Dihydroguaiaretic acid、Isorhapontigenin和Pinosylvin等,核心靶点EGFR、STAT1、LCK等63个,通过调节PI3K-Akt信号通路和癌症蛋白聚糖等多条免疫抗炎和抗肿瘤相关的信号通路,影响氨基酸修饰,激酶活性调节,细胞反应和氧化应激等生物过程抗UC。分子对接和文献表明所构建网络可靠性较高。结论大血藤有良好的抗UC作用,其机制可能与调节肠道免疫炎症及细胞增殖、分化与迁移等密切相关,具备多成分、多靶点、多途径的特点。

关键词：大血藤溃疡性结肠炎 GEO芯片网络药理学分子对接作用机制

热驯化对高温胁迫下灯盏花生理生化特性的影响

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作物杂志 2024年

作者：徐洪高徐萍罗文秀陆尤涂振华张萱陈艺春郑国伟杨颖翠陈佳云南中医药大学中药学院怒江润丰农业科技服务有限公司云南中医药大学民族医药学院

为研究热驯化后的灯盏花抗高温胁迫能力是否有提升以及相应的生理响应，以灯盏花为供试材料，（36.0±0.5）℃热驯1 d的灯盏花为试验组，22 ℃正常生长的为对照组，比较（48.0±0.5）℃高温胁迫前、胁迫4 h后及（36.0±0.5）℃恢复3 h后... 详细信息

为研究热驯化后的灯盏花抗高温胁迫能力是否有提升以及相应的生理响应，以灯盏花为供试材料，（36.0±0.5）℃热驯1 d的灯盏花为试验组，22 ℃正常生长的为对照组，比较（48.0±0.5）℃高温胁迫前、胁迫4 h后及（36.0±0.5）℃恢复3 h后3个时段的各生理生化指标及胁迫4 h后的受害指数。结果表明热驯化处理的灯盏花高温胁迫（HS）后经（36.0±0.5）℃恢复3 h后电导率和丙二醛含量降低，相对含水量升高，而对照组恢复后与高温胁迫后比较无显著变化，失去了恢复能力，同时高温胁迫期间热驯组的灯盏花的光合色素（叶绿素）以及脯氨酸、可溶性糖、可溶性蛋白等渗透调节物含量均高于对照组，以上结果表明热驯化处理后能够缓解高温对灯盏花的伤害，提高了灯盏花的抗高温胁迫能力。

关键词：灯盏花热驯化高温胁迫生理生化特性

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大叶山楝中二萜类化学成分及其抗炎活性研究

中草药 2024年第14期55卷 4656-4662页

作者：陈彦伍秦天丽吴石丽蒋华夷何红平云南中医药大学中药学院云南昆明650500

目的研究大叶山楝Aphanamixis polystachya枝叶的化学成分及其抗炎活性。方法采用硅胶、C18反相硅胶、Sephadex LH-20凝胶及MCI等多种柱色谱技术进行分离纯化,根据理化性质结合波谱数据鉴定化合物结构。采用脂多糖(lipopolysaccharide,L... 详细信息

目的研究大叶山楝Aphanamixis polystachya枝叶的化学成分及其抗炎活性。方法采用硅胶、C18反相硅胶、Sephadex LH-20凝胶及MCI等多种柱色谱技术进行分离纯化,根据理化性质结合波谱数据鉴定化合物结构。采用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的RAW 264.7巨噬细胞炎症模型,对化合物进行抗炎活性评价。结果从大叶山楝枝叶中分离得到11个二萜类化合物,分别鉴定为(4S)-4-[(E)-11-(15,15-dimethyl-14-oxo-14,15-dihydrofuran-12-yl)-11,18-dihydroxy-7-methyloct-6-en-5-yl]-3-methyl-1(4H)-furanone(1)、nemoralisin B(2)、aphapolin A(3)、nemoralisin G(4)、nemoralisin J(5)、nemoralisin I(6)、nemoralisin H(7)、nemoralisin D(8)、nemoralisin A(9)、aphanamene B(10)和反式植醇(11)。化合物11对LPS诱导的RAW 264.7细胞内NO的生成有微弱抑制作用,其半数抑制浓度(median inhibition concentration,IC50)值为428.7μmol/L。结论化合物1为新化合物,命名为陵水暗罗素O(nemoralisin O);化合物3、8和11为首次从大叶山楝中分离得到;化合物11显示出微弱的抗炎活性。

关键词：大叶山楝二萜抗炎活性陵水暗罗素O 反式植醇 aphapolin A nemoralisin D

昆明杯冠藤与青羊参叶绿体基因组特征比较及系统发育分析

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药学学报 2024年第3期59卷 764-774页

作者：耿应敏周兴乾张体操郑兰平云南中医药大学中药学院云南昆明650500

昆明杯冠藤和青羊参隶属于夹竹桃科鹅绒藤属,是重要的药用植物。本研究对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组进行测序、组装,并对两者叶绿体基因组的结构特征及其系统发育位置进行了分析。结果表明,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组均具有... 详细信息

昆明杯冠藤和青羊参隶属于夹竹桃科鹅绒藤属,是重要的药用植物。本研究对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组进行测序、组装,并对两者叶绿体基因组的结构特征及其系统发育位置进行了分析。结果表明,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组均具有典型的四分体结构,注释到133个基因,两者总GC含量接近。密码子偏好性分析显示,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组中相对同义密码子使用度略有不同,但差异不大,且在密码子第3位有强烈的A或U偏好。在两者叶绿体基因组中分别检测到91个和103个简单重复序列,以A/T类型重复占比最大。核苷酸多态性分析显示,鹅绒藤属叶绿体基因组共有间区序列的核苷酸多态性值高于共有基因序列,基于共有间区序列的高变区设计了一对引物可对昆明杯冠藤和青羊参进行鉴别。系统发育分析表明,昆明杯冠藤和地梢瓜亲缘关系最近,青羊参、白首乌和隔山消在鹅绒藤属中形成稳定的单系分支,三者亲缘关系较近。对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组特征及其系统发育的比较分析将为两种植物的物种鉴定及鹅绒藤属植物的遗传多样性和系统进化研究奠定理论基础。

关键词：鹅绒藤属叶绿体基因组系统发育高通量测序 DNA条形码

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不同种属大鼠糖尿病视网膜病变模型比较研究

中药药理与临床 2024年

作者：左祥铎梅敉佳刘晓兰徐翔段俊华李学芳邱斌李静平云南中医药大学中药学院

目的：探究链脲佐菌素（STZ）诱导的两个种属大鼠糖尿病视网膜病变（DR）模型之间的差异。方法：健康成年雄性SPF级SD和BN大鼠，采用小剂量多次腹腔注射STZ诱发糖尿病模型，另设SD和BN正常对照组，10 只/组。实验全程观察各组动物一般... 详细信息

目的：探究链脲佐菌素（STZ）诱导的两个种属大鼠糖尿病视网膜病变（DR）模型之间的差异。方法：健康成年雄性SPF级SD和BN大鼠，采用小剂量多次腹腔注射STZ诱发糖尿病模型，另设SD和BN正常对照组，10 只/组。实验全程观察各组动物一般状态变化，每周测血糖、体质量等生理指标，4、8、12 周进行光学相干断层扫描技术(OCT)及荧光素钠血管造影(FFA)检测，HE染色检查大鼠视网膜组织病理变化。结果：相较SD大鼠，BN大鼠成模率高，死亡率低。随着病程的进展，两种属大鼠与正常对照组比较，模型对照组血糖明显升高、体质量降低；FFA结果显示，BN大鼠视网膜出现明显荧光素钠渗漏现象；OCT结果显示，BN大鼠模型对照组视网膜厚度增长缓慢，这与HE结果相应，且HE结果可知两种属大鼠模型对照组神经节细胞(RGCs)减少，视网膜各层细胞均出现不同程度损伤且排列紊乱，视网膜整体厚度逐渐变薄。结论：STZ诱导的DR模型，BN大鼠较SD大鼠模型成模率高、死亡率低；由于BN大鼠视网膜特有色素层，则OCT和FFA检测成像及HE切片效果均明显优于SD大鼠，其在病理变化方面与人类DR具有相同或相似的特征，更适宜用做DR发病和药物作用机制研究的动物模型。

关键词：大鼠糖尿病视网膜病变模型斯泼累格·多雷大鼠棕色挪威大鼠