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新疆四种荒漠跳鼠肠道菌群多样性与功能的比较

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生态学杂志 2024年第1期43卷 234-243页

作者：迪拉拉·托留程继龙夏霖杨维康杨奇森中国科学院新疆生态与地理研究所乌鲁木齐830011 中国科学院动物研究所北京100101 中国科学院大学北京100049

肠道菌群是维持机体健康的重要组成部分,了解动物肠道菌群多样性有助于认识和理解动物的生态学适应。已有报道表明荒漠沙鼠肠道微生物有助于其对荒漠环境的适应,但对于广泛分布于荒漠环境的跳鼠的肠道微生物群落结构、多样性的研究尚不... 详细信息

肠道菌群是维持机体健康的重要组成部分,了解动物肠道菌群多样性有助于认识和理解动物的生态学适应。已有报道表明荒漠沙鼠肠道微生物有助于其对荒漠环境的适应,但对于广泛分布于荒漠环境的跳鼠的肠道微生物群落结构、多样性的研究尚不明确。本研究以栖息于新疆荒漠地区的跳鼠科(Dipodidae)为对象,采用16S rRNA高通量测序技术对荒漠跳鼠4个亚科的代表物种三趾跳鼠(Dipus sagitta)、五趾跳鼠(Orientallactage sibirica)、长耳跳鼠(Euchoreutes naso)和三趾心颅跳鼠(Salpingotus kozlovi)的肠道微生物进行分析。共获得1557065条有效序列,发现2708个ASV,归属于20个门、50个纲、71个目、142个科和336个属。Alpha多样性指数中,长耳跳鼠和三趾心颅跳鼠组的ACE指数和Chao1指数显著低于其他两组,而Shannon指数和Simpson指数在4组样品中无显著差异。主坐标分析(PCoA)结果表明,4种跳鼠的肠道菌群结构具有显著差异。LEfSe分析表明,4种跳鼠肠道菌群共有10个显著差异的细菌菌属,其中大部分归属拟杆菌门,并且PICRUSt分析显示4种跳鼠肠道微生物具有相似的功能,主要参与宿主的代谢过程。本研究揭示了4种荒漠跳鼠的肠道菌群特征,为进一步研究荒漠跳鼠肠道微生物群落结构形成与生理生态适应提供基础资料。

关键词：荒漠跳鼠肠道菌群 16S rRNA 细菌多样性新疆

绵羊源荚膜血清D型多杀性巴氏杆菌的生物学特性及2种候选疫苗的免疫效果评价

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畜牧与兽医 2024年第4期56卷 108-116页

作者：汪阳张凌金映红汪萍薛晶梁芊芊李晓卓郑启铭刘文锴韩翔舒夏俊新疆农业大学动物医学学院新疆乌鲁木齐830000 农业农村部草食动物疫病防控重点实验室(部省共建) 新疆乌鲁木齐830000 新疆畜牧科学院兽医研究所/动物临床医学研究中心新疆乌鲁木齐830000 石河子大学动物科技学院新疆石河子832061

旨在研究新疆绵羊源荚膜血清D型多杀性巴氏杆菌(PmD)的生物学特性,探索其灭活疫苗与OmpH重组疫苗对小鼠的免疫保护效果,为防控新疆地区绵羊巴氏杆菌病提供参考。采用细菌分离鉴定、PCR鉴定、药敏试验、耐药与毒力基因检测、致病性试验... 详细信息

旨在研究新疆绵羊源荚膜血清D型多杀性巴氏杆菌(PmD)的生物学特性,探索其灭活疫苗与OmpH重组疫苗对小鼠的免疫保护效果,为防控新疆地区绵羊巴氏杆菌病提供参考。采用细菌分离鉴定、PCR鉴定、药敏试验、耐药与毒力基因检测、致病性试验等方法初步明确PmD的生物学特性;并通过最佳灭活条件和佐剂筛选、安全性试验、原核表达等方法制备PmD灭活疫苗与PmD-OmpH重组疫苗,采取小鼠攻毒保护试验评价2种疫苗的免疫效力。结果:从绵羊肺脏中分离出1株PmD,药敏试验显示,该菌为7重耐药菌,未检测到耐药基因;毒力基因检测显示,该菌具有12种毒力基因(exbB、exbD、hgbA、tonB、fimA、Oma87、OmpH、Psl、sodA、sodC、tbpA、toxA);致病性较强,对小鼠的最小致死菌量为2.2×105 CFU;灭活疫苗和重组疫苗对相同血清型菌株攻毒的保护率分别为80%和10%;灭活疫苗对血清型A、F和未知菌株攻毒保护率分别为0、20%和0,而重组疫苗的保护率则全为0。本研究发现1株强耐药、强毒力的绵羊源PmD,灭活疫苗对同种血清型菌株的保护性远高于重组疫苗,发病地区羊场可采用同种血清型灭活疫苗进行预防和控制绵羊巴氏杆菌病,对多价疫苗和新型疫苗的研制还有待进一步发掘。

关键词：绵羊荚膜血清D型多杀性巴氏杆菌生物学特性灭活疫苗 OmpH蛋白重组疫苗

补喂赖氨酸和苏氨酸对放牧条件下泌乳母马血液生化指标的影响

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畜牧与兽医 2024年第1期56卷 20-25页

作者：钟明彬经宏鑫袁景成梁润飞高博坤张城铭马壮阿布都沙拉木·艾合麦提夏津巴特李晓斌新疆农业大学动物科学学院新疆乌鲁木齐830052 新疆肉乳用草食动物营养实验室新疆乌鲁木齐830052

通过给放牧条件下泌乳母马补饲赖氨酸和苏氨酸,探究其对泌乳母马血液生化指标的影响,为氨基酸调控泌乳期母马的健康提供参考依据。选择产驹日期相近(5月份),年龄7~9岁,胎次4~5胎,平均体重(428.00±33.42)kg,泌乳30 d的伊犁马母马24匹,... 详细信息

通过给放牧条件下泌乳母马补饲赖氨酸和苏氨酸,探究其对泌乳母马血液生化指标的影响,为氨基酸调控泌乳期母马的健康提供参考依据。选择产驹日期相近(5月份),年龄7~9岁,胎次4~5胎,平均体重(428.00±33.42)kg,泌乳30 d的伊犁马母马24匹,随机分为4个组,每组6匹,分别为对照组、试验Ⅰ组、试验Ⅱ组和试验Ⅲ组。在相同的放牧条件下(放牧时间、饮水时间、挤奶时间和放牧草场完全相同),对照组不进行任何氨基酸补喂,试验Ⅰ组每匹马补饲赖氨酸40 g/d+苏氨酸20 g/d,试验Ⅱ组每匹马补饲赖氨酸60 g/d+苏氨酸40 g/d,试验Ⅲ组每匹马补饲赖氨酸80 g/d+苏氨酸60 g/d。整个补饲期为120 d,定期采集母马血液,测定相关生化指标。结果:在蛋白质代谢方面,试验Ⅰ~Ⅲ组母马血液中总蛋白和白蛋白含量均显著低于对照组(P0.05),但试验Ⅱ组Fe^(2+)含量最高,与其他3组有显著或极显著差异。综上,在放牧条件下给泌乳母马补饲赖氨酸和苏氨酸可降低其血液中葡萄糖、甘油三酯含量以及谷草转氨酶和谷丙转氨酶的活力,提高总胆红素、无机磷、Mg^(2+)和Fe^(2+)的含量,促进泌乳母马的健康,以每匹泌乳母马摄入60 g/d的赖氨酸和40 g/d的苏氨酸效果最佳。

关键词：泌乳母马赖氨酸苏氨酸血液生化指标

一株可裂解耐黏菌素大肠杆菌噬菌体的分离鉴定及全基因组分析

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中国农业大学学报 2024年第2期29卷 131-140页

作者：贾旭晨肖天石朱晓林郝智慧新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052 中国农业大学动物医学院/兽医公共卫生安全全国重点实验室北京100193

为研究耐黏菌素大肠杆菌的噬菌体治疗方法,本研究以耐黏菌素大肠杆菌为宿主菌,采用双层琼脂平板法从山东烟台某养鸡场污水样中分离纯化得到裂解性噬菌体SDYTW1-F1-2-2。通过透射电镜观察,最佳感染复数,一步生长曲线,温度稳定性,酸碱度... 详细信息

为研究耐黏菌素大肠杆菌的噬菌体治疗方法,本研究以耐黏菌素大肠杆菌为宿主菌,采用双层琼脂平板法从山东烟台某养鸡场污水样中分离纯化得到裂解性噬菌体SDYTW1-F1-2-2。通过透射电镜观察,最佳感染复数,一步生长曲线,温度稳定性,酸碱度稳定性等生物学特性测定,并对其进行全基因组测序分析。结果表明:1)噬菌体SDYTW1-F1-2-2噬菌斑呈现透亮,外周无晕圈,形态学观察显示其具有可伸缩性尾鞘。2)生物学特性分析表明,噬菌体最佳感染复数为0.1,潜伏期为50 min,爆发期为40 min,爆发量为(331±9)PFU/cell。在温度4~40℃,pH为4~12的环境下,噬菌体活性较为稳定。3)通过噬菌体全基因组测序及核酸类型鉴定显示,该噬菌体基因组全长为74752 bp,双链DNA,GC含量42.1%。在噬菌体基因组中共鉴定出121个编码蛋白(CDS),包括结构组成、DNA代谢与复制和包装以及细菌裂解相关的功能基因,发现一个tRNA基因,且未检测到如stx-1等致病性基因和mcr-1等耐药基因相关的基因。综上,噬菌体SDYTW1-F1-2-2裂解谱较宽,具有良好的酸碱性、热稳定性以及安全性。本研究为后续开展针对耐黏菌素大肠杆菌的噬菌体治疗研究提供依据。

关键词：裂解性噬菌体耐黏菌素大肠杆菌全基因组

新疆和田地区于田县牛源环形泰勒虫种群基因型及遗传多样性分析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第12期 74-82页

作者：弓超温丽翠李建龙张毅韩俊成王菊梅王梓浠郭庆勇新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

为探究新疆和田地区于田县牛源环形泰勒虫种群的基因型分布及遗传多样性,试验首先从该县10个乡镇(阿羌乡、喀尔克尔乡、科克亚乡、木尕拉镇、斯也克乡、先拜巴扎镇、英巴格乡、加依乡、奥依托格拉克乡、阿日希乡)采集疑似环形泰勒虫病... 详细信息

为探究新疆和田地区于田县牛源环形泰勒虫种群的基因型分布及遗传多样性,试验首先从该县10个乡镇(阿羌乡、喀尔克尔乡、科克亚乡、木尕拉镇、斯也克乡、先拜巴扎镇、英巴格乡、加依乡、奥依托格拉克乡、阿日希乡)采集疑似环形泰勒虫病患牛血液样本共443份,提取基因组DNA后对牛源环形泰勒虫Tams1基因进行PCR检测,统计10个乡镇牛源环形泰勒虫的阳性样本数及阳性率;然后在发现阳性样本的乡镇中,每个乡镇随机选取2个阳性样本进行测序,将测序结果进行同源性分析并与参考序列共同构建NJ系统发育树,分析基因型;最后对于田县环形泰勒虫种群进行遗传多样性分析。结果表明:在443份牛血液样本中,有93份样本环形泰勒虫检测结果为阳性,阳性率为20.99%;10个乡镇中有9个乡镇牛源环形泰勒虫检测结果为阳性,阳性率在10.45%~45.45%之间,其中阿羌乡阳性率最高,加依乡未检出。18株环形泰勒虫Tams1基因序列的核苷酸相似性为76.0%~100%,同乡镇的2个阳性样本之间的核苷酸相似性为91.0%~100%;这18株牛源环形泰勒虫在NJ系统发育树中未全部聚为一支,一些虫株甚至与其他国内外参考毒株表现出了更近的亲缘关系,但均为G1基因型。于田县G1基因型环形泰勒虫种群多态性位点数为119个,核苷酸多样性为0.053,平均核苷酸差异数为28.95个,单倍型数为12个,单倍型多样性为0.895,Tajima’s D值和Fu and Li’s F值均小于0。说明于田县G1基因型环形泰勒虫种群具有较高的遗传多样性且正在发生扩张。

关键词：牛环形泰勒虫 Tams1基因遗传进化分析遗传多样性

FKBP 5基因对绵羊卵泡颗粒细胞功能的影响

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畜牧兽医学报 2024年第9期55卷 3947-3956页

作者：古丽米热·阿布都热依木张欣如吴阳升陈莹汪立芹徐新明黄俊成林嘉鹏农业农村部草食家畜遗传育种与繁殖重点实验室乌鲁木齐830011 新疆动物生物技术重点实验室乌鲁木齐830011 新疆畜牧科学院生物技术研究所乌鲁木齐830011

旨在探讨FKBP 5在绵羊卵巢颗粒细胞(GCs)中的潜在功能。本研究从乌鲁木齐市华凌屠宰场的20个2岁左右处于性成熟阶段的阿勒泰羊卵巢中分离GCs。将试验分为4组:GC(空白对照)、GC+NC(转染siRNA-NC)、GC+si FKBP 5(转染siRNA-FKBP5)、GC+si ... 详细信息

旨在探讨FKBP 5在绵羊卵巢颗粒细胞(GCs)中的潜在功能。本研究从乌鲁木齐市华凌屠宰场的20个2岁左右处于性成熟阶段的阿勒泰羊卵巢中分离GCs。将试验分为4组:GC(空白对照)、GC+NC(转染siRNA-NC)、GC+si FKBP 5(转染siRNA-FKBP5)、GC+si FKBP 5+LH(促黄体生成素处理转染siRNA-FKBP5)。利用细胞免疫荧光检测FKBP5蛋白在GCs中的定位。通过EdU、Tunel和Western blot检测其对细胞增殖、凋亡的影响;通过Western blot检测其对AKT和ERK信号通路的影响;通过ELISA检测其对E2、P4水平的影响。结果表明,FKBP5表达于GCs细胞质中。FKBP 5表达量随着LH浓度不断升高;5 IU·mL-1 LH作用4 h,FKBP 5表达较高(P<0.001)。干扰FKBP 5后显著抑制了细胞增殖,并显著降低PCNA蛋白表达量(P<0.001);显著促进了细胞凋亡,增加了BAX的表达并减少了Bcl-2的表达(P<0.001);显著抑制了GCs中AKT和ERK信号通路的激活以及E2和P4的分泌(P<0.001)。LH处理部分改善了干扰FKBP 5对GCs的影响(P<0.05)。本研究结果表明,FKBP 5影响绵羊GCs的增殖、凋亡、AKT和ERK信号通路以及E2和P4的分泌,其功能受LH的影响。这些结果为进一步研究FKBP5在绵羊卵泡发育中的作用提供了理论依据。

关键词： FKBP 5 颗粒细胞细胞增殖凋亡 AKT和ERK信号通路类固醇

宿主蛋白Rab11a对牛病毒性腹泻病毒复制的影响

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中国动物传染病学报 2024年第4期32卷 32-38页

作者：权冉葛丽娟陈俊贞袁圆圆付强史慧君新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

为了探索宿主蛋白Rab11a在感染牛病毒性腹泻病毒(BVDV)后,对细胞增殖的影响。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建Rab11a基因稳定敲除的MDBK细胞株,设计靶向Rab11a基因的向导RNA表达载体,采用Western blot检测Rab11a基因敲除后的蛋白表达情... 详细信息

为了探索宿主蛋白Rab11a在感染牛病毒性腹泻病毒(BVDV)后,对细胞增殖的影响。通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建Rab11a基因稳定敲除的MDBK细胞株,设计靶向Rab11a基因的向导RNA表达载体,采用Western blot检测Rab11a基因敲除后的蛋白表达情况;使用实时荧光定量qPCR、免疫荧光染色试验、Reed-Muench法等技术检测BVDV感染Rab11a KO细胞后病毒RNA水平、双链RNA(dsRNA)积累水平、病毒滴度及致细胞病变(CPE)情况等。Western blot检测结果显示,成功构建出Rab11a基因敲除的细胞Rab11a KO;Rab11a基因敲除显著抑制BVDV 5'UTR mRNA和dsRNA水平的积累,感染36 h后,Scramble细胞明显有大量细胞病变,出现皱缩、碎裂、形成空泡后脱落等现象,Rab11a KO细胞的CPE现象明显低于Scramble细胞;在BVDV感染细胞12 h后,与Scramble细胞相比,Rab11a KO细胞的病毒滴度显著性降低,结果证明了敲除MDBK细胞的Rab11a基因对BVDV在胞内复制起到抑制作用。本研究结果为了解宿主蛋白Rab11a与BVDV的相互作用,以及Rab11a对病毒的复制增殖的作用提供了新的科学依据。

关键词： Rab11a 牛病毒性腹泻病毒 CRISPR/Cas9 复制

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和田地区鹅源致病性大肠杆菌的血清群、致病性与耐药性研究

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中国动物传染病学报 2024年第3期32卷 110-118页

作者：程雪梅肖海侠王芋丹王一霖白怡馨苏战强佟盼盼新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

为了查明新疆和田地区鹅场发生的以腹泻为主要症状,以肝周炎和心包炎为主要病理变化的疾病是否由大肠杆菌引发,本研究无菌采集23份病死鹅内脏样本,采用常规细菌分离鉴定、PCR方法进行大肠杆菌鉴定,对分离菌的O血清群、致病性及耐药情况... 详细信息

为了查明新疆和田地区鹅场发生的以腹泻为主要症状,以肝周炎和心包炎为主要病理变化的疾病是否由大肠杆菌引发,本研究无菌采集23份病死鹅内脏样本,采用常规细菌分离鉴定、PCR方法进行大肠杆菌鉴定,对分离菌的O血清群、致病性及耐药情况进行分析。结果显示,共分离到23株大肠杆菌,血清群包括O18(21.74%)、O78(13.04%)、O2(8.70%)和O1(4.35%),12株(52.17%)血清群未明。主要携带的毒力基因包括irp2(95.65%)、iucD(73.91%)、fyuA(17.39%)和astA(8.70%),分离株对小鼠具有致病性。23株大肠杆菌对四环素的耐药率为100%,氯霉素、环丙沙星、氨苄西林、左氧氟沙星、哌拉西林、复方新诺明、链霉素和头孢噻肟的耐药率在60.87%~95.65%,对多黏菌素B均敏感。共检测出12种耐药基因,tetA、tetG、cml 1、bla_(TEM)、sul1、aac、bla_(CTX-M-1)的检出率在43.48%以上,bla SHV、bla_(CTX-M-9)、tetE、aadA1的检出率在4.35%~30.43%,未检到bla CTX-M-2。本研究确定和田地区鹅场腹泻、肝周炎和心包炎为大肠杆菌感染所致,血清型较为复杂,耐药性严重。

关键词：腹泻大肠杆菌血清群致病性耐药性

英纯血马蹄病与血液指标和肠道菌群组成的相关性研究

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中国畜牧兽医 2024年第5期51卷 2198-2209页

作者：卢冲卢亚宾付涵缪荣浩买占海况玲新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

【目的】研究马患蹄病与血液指标和肠道微生物菌群组成之间的关系。【方法】根据临床检查挑选6匹(12±3)岁龄患蹄病的英国纯血母马为试验组(S组),另选6匹体重、年龄相近的英纯血健康母马作为对照组(C组),对试验马进行3 d的临床检查及评... 详细信息

【目的】研究马患蹄病与血液指标和肠道微生物菌群组成之间的关系。【方法】根据临床检查挑选6匹(12±3)岁龄患蹄病的英国纯血母马为试验组(S组),另选6匹体重、年龄相近的英纯血健康母马作为对照组(C组),对试验马进行3 d的临床检查及评估。采集两组马颈静脉血及直肠粪便,进行血常规、血液生化指标检测;采用16S rRNA测序法检测马肠道菌群的组成。【结果】临床检查发现,S组马均有跛行,蹄甲变形等症状。血常规检测结果显示,两组马血液中各指标均差异不显著(P>0.05),其中S组马血液中白细胞数和中性粒细胞数均高于正常范围,血红蛋白浓度低于正常范围。血液生化指标检测结果显示,与C组相比,S组马血液中甘油三酯、总蛋白、尿素、肌酐含量等呈现上升趋势,白蛋白、总胆红素等指标呈现下降趋势(P>0.05)。16S rRNA测序结果显示,在门分类水平上,与C组相比,S组马肠道菌群中迷踪菌门(Elusimicrobia)相对丰度显著降低(P<0.05),SR1菌相对丰度极显著降低(P<0.01);在属分类水平上,与C组相比,S组马肠道菌群中魏斯氏菌属(Weissella)、土微菌属(Pedomicrobium)、海洋杆菌属(Pontibacter)、库特氏菌属(Kurthia)相对丰度显著增加(P<0.05),埃希氏菌属(Escherichia)、韧皮部杆菌属(Candidatus_Endomicrobium)、微小杆菌属(Microvirga)、消化球菌属(Peptococcus)、普雷沃氏菌属(Prevotella)相对丰度显著降低(P<0.05)。两组马肠道菌群之间存在显著差异的菌种共10种。【结论】马发生蹄病后体内会出现炎症反应,造成肝肾功能受到损伤、肠道菌群物种丰度发生改变,同时消化能力降低。研究结果为进一步探索肠道菌群-代谢紊乱与马蹄病的关系奠定了基础,为通过调控肠道菌群防治马蹄病的发生提供了线索。

关键词：英纯血马蹄病血液指标肠道菌群