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外周血白细胞SLC45A4和AHSP基因甲基化与乳腺癌关系的病例对照研究

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中华疾病控制杂志 2024年第1期28卷 56-63页

作者：付庆臻李大鹏符金铭刘宇鹏孙鸿儒张磊张显玉庞达赵亚双哈尔滨医科大学公共卫生学院流行病学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院乳腺外科哈尔滨150081

目的探究外周血白细胞溶质载体家族45成员4(solute carrier family 45 member 4,SLC45A4)和α血红蛋白稳定蛋白(αhemoglobin stabilizing protein,AHSP)基因甲基化与乳腺癌发病的关系。方法通过差异甲基化分析等方法在GSE51032、GSE104942和GSE89093数据集中筛选与乳腺癌发病潜在相关的基因。采用病例对照研究,纳入545例乳腺癌患者和524例非乳腺癌对照作为研究对象。使用MethylTarget靶向测序检测目标基因甲基化并分析其与乳腺癌的关系。结果本研究共筛选出4个基因,控制混杂因素后,SLC45A4和AHSP高甲基化与乳腺癌关系的ORadj分别为0.218(95%CI:0.158~0.299)和0.535(95%CI:0.384~0.741)。在不同亚组中SLC45A4高甲基化与乳腺癌的关联仍有统计学意义,ORadj最高为0.427(95%CI:0.270~0.679),最低为0.153(95%CI:0.085~0.274),而AHSP高甲基化仅在管腔A型(Luminal A)、管腔B型(Luminal B)、雌激素受体阳性(estrogen receptor+,ER+)和≤60岁年龄组中与乳腺癌的关联有统计学意义。异质核糖核酸蛋白C(heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C,HNRNPC)甲基化与乳腺癌的关系与公共数据结果相反,ORadj为0.747(95%CI:0.569~0.980),锌指蛋白425(zinc finger protein 425,ZNF425)甲基化与乳腺癌的关联无统计学意义(P=0.158)。结论外周血白细胞SLC45A4和AHSP基因高甲基化可能是乳腺癌发病的保护因素。

关键词：乳腺癌甲基化溶质载体家族45成员4 α血红蛋白稳定蛋白

TRPV1对肝细胞性肝癌生物学行为的影响及可能的机制预测

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中华疾病控制杂志 2024年第6期28卷 691-701页

作者：韦丽铃刘美良李德远杨钰肖苏洋黎婵华吴思黔宋安华曾小云广西医科大学公共卫生学院南宁530021 广西医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健学教研室南宁530021 广西医科大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学教研室南宁530021

目的明确瞬时受体电位香草醛亚家族1(transient receptor potential vanilloid 1,TRPV1)在肝细胞性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及与预后的关系,探讨其对HCC细胞生物学行为的影响。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、基因型组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)及基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)验证TRPV1在HCC中的表达及与预后的关系。通过CCK-8实验、划痕实验、Transwell实验、流式细胞术检测TRPV1对HCC细胞增殖、迁移、侵袭和细胞周期的影响,蛋白质印迹法(western blot,WB)检测细胞周期调节蛋白激酶4(cyclin-dependent kinase 4,CDK4)、细胞周期素依赖激酶6(cyclin-dependent kinase 6,CDK6)的表达,裸鼠皮下成瘤实验检测肿瘤增殖能力。最后,构建TRPV1共表达网络并进行富集分析。结果TCGA、GTEx和GEO数据库中,TRPV1在HCC组织中表达水平均下调(均P<0.001),且与患者总生存时间更短有关(P=0.032),受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积为0.91。过表达TRPV1可抑制HCC细胞增殖、迁移和侵袭能力,阻滞细胞周期进展,CDK4和CDK6蛋白表达水平下降(均P<0.05),敲低TRPV1则相反(均P<0.05)。稳定过表达TRPV1后裸鼠皮下瘤体体积减小(P=0.015),质量减轻(P=0.033),Ki-67蛋白阳性表达水平下调(P=0.010)。TRPV1共表达基因主要参与核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)剪接、细胞周期蛋白结合、细胞增殖等过程。结论TRPV1抑制了HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并阻滞细胞周期的进程,在HCC中发挥抑癌作用,为HCC预后分析、治疗提供了新方向。

关键词： TRPV1 肝癌增殖迁移细胞周期

心血管疾病中高风险人群颈动脉粥样硬化的识别:基于机器学习的预测模型及验证

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中国全科医学 2024年第30期27卷 3763-3771页

作者：刘忠典许琪陈伊静覃玲巧陈淑萍唐薇婷钟秋安广西医科大学公共卫生学院流行病学教研室广西壮族自治区南宁市530021

背景颈动脉粥样硬化(CAS)常被视为心血管疾病(CVD)的预警信号,其诊断技术颈动脉多普勒超声检查没有被纳入公共卫生服务项目,同时弗雷明汉风险评分(FRS)存在着评估CAS风险准确性不足的情况,不利于基层医疗人员识别CAS。目前,关于机器学... 详细信息

背景颈动脉粥样硬化(CAS)常被视为心血管疾病(CVD)的预警信号,其诊断技术颈动脉多普勒超声检查没有被纳入公共卫生服务项目,同时弗雷明汉风险评分(FRS)存在着评估CAS风险准确性不足的情况,不利于基层医疗人员识别CAS。目前,关于机器学习方法识别FRS中高风险人群CAS的研究依然缺乏。目的运用机器学习方法构建FRS中高风险人群CAS的预测模型,比较其判别效能,筛选出性能最优的模型,以期辅助基层医疗人员更简便更准确地识别CAS。方法采用方便抽样法,选取2019—2021年和2023年在广西壮族自治区柳州市两乡镇的674例当地居民作为研究对象。收集相关信息,并采集空腹血样、尿样检测生化指标。采用FRS评估CVD发生风险;运用颈动脉超声诊断CAS。将2019—2021年517例研究对象按照8∶2的比例随机分为训练集和验证集,训练集用于构建Logistic回归、随机森林(RF)、支持向量机(SVM)、极端梯度增强(XGBoost)模型和梯度增强决策树(GBDT)模型,验证集用于内部验证;2023年157例研究对象作为测试集,用于外部验证。通过Lasso回归分析筛选特征变量,运用灵敏度、特异度、准确度、F1值和曲线下面积(AUC)评价判别效能,外部验证采用AUC值评价最优模型泛化能力,并通过Shapley Additive exPlanation(SHAP)方法探讨影响最优模型识别CAS的重要变量。结果通过Lasso回归,筛选出15个非零特征变量:年龄、BMI、收缩压(SBP)、吸烟、饮酒、高血压、总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇、C-反应蛋白(CRP)、空腹血糖、载脂蛋白B(ApoB)、脂蛋白a(LPA)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)、AST/丙氨酸氨基转移酶、尿微量白蛋白肌酐比值。构建的Logistic回归、RF、SVM、XGBoost模型和GBDT模型的AUC值均较高,其中GBDT模型的判别性能最优,其灵敏度、特异度、准确度、F1值和AUC分别是0.7551、0.8364、0.7981、0.7789、0.8349,外部验证AUC为0.7940。SHAP方法发现年龄、SBP、CRP、LPA、ApoB是影响GBDT模型识别CAS排名前5的因素。结论基于机器学习识别CAS的Logistic回归、RF、SVM、XGBoost模型和GBDT模型均显示出较高的判别性能,其中GBDT模型综合判别效能最佳,同时具有较强的泛化能力。

关键词：心血管疾病颈动脉粥样硬化机器学习弗雷明汉风险评分识别预测

北京市医务人员猴痘认知及接诊意愿的影响因素

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中华疾病控制杂志 2024年第4期28卷 402-408,442页

作者：张烨王炳懿孟晗韩柏慧吴钶姜晓红付雷雯张伟杰李倩许志远杨媛王佳琦齐啸邹华春北京市朝阳区疾病预防控制中心流行病和地方病控制科北京100021 中山大学公共卫生学院(深圳)流行病学教研室深圳518107 北京大学公共卫生学院全球卫生学系北京100191 复旦大学公共卫生学院流行病学系上海200032

目的旨在了解北京市医务人员对猴痘的认知水平及对猴痘患者的接诊意愿,分析其现状及影响因素,为制定相应策略提供科学依据。方法在2023年7月24日―8月2日,采用方便抽样法对北京市医务人员进行问卷调查,调查内容主要包括个人基本信息、... 详细信息

目的旨在了解北京市医务人员对猴痘的认知水平及对猴痘患者的接诊意愿,分析其现状及影响因素,为制定相应策略提供科学依据。方法在2023年7月24日―8月2日,采用方便抽样法对北京市医务人员进行问卷调查,调查内容主要包括个人基本信息、对猴痘的认知、接诊猴痘患者的意愿。采用多因素logistic回归分析模型分析影响医务人员猴痘认知水平和接诊意愿的因素。结果共回收2148份有效问卷,被调查者平均年龄(36.76±9.08)岁。83.10%的医务人员在本次调查之前了解过猴痘,82.45%的医务人员愿意接诊猴痘患者。多因素logistic回归分析模型分析结果显示,年龄为41~室的(OR=0.73,95%CI:0.57~0.94)医务人员认知水平较低(均P室医务人员接诊意愿高于(OR=1.51,95%CI:1.08~2.15)重点科室(均P<0.05)。结论北京市医务人员对猴痘具有较高的认知水平,有部分医务人员不愿接诊猴痘患者。需加强医务人员的职业防护培训及心理干预,避免医务人员感染,消除接诊顾虑,提高接诊意愿。

关键词：猴痘认知水平医务人员

骨关节炎软骨细胞中hsa-miR-3202的生物信息分析与功能验证

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中国组织工程研究 2025年第12期29卷 2458-2465页

作者：张佳琪刘艳虹梁慧婷周晶晶王雅雯许憬瑜李煜爽雷立健胡晓琴山西医科大学公共卫生学院流行病学教研室山西省太原市030001

背景:软骨细胞增殖与凋亡的失衡在骨关节炎发生发展中起着重要作用,已有研究发现hsa-miR-3202参与调节多种细胞的增殖和凋亡过程,然而尚未有研究探讨hsa-miR-3202与骨关节炎的相关性。目的:探讨hsa-miR-3202在骨关节炎软骨细胞中的表达... 详细信息

背景:软骨细胞增殖与凋亡的失衡在骨关节炎发生发展中起着重要作用,已有研究发现hsa-miR-3202参与调节多种细胞的增殖和凋亡过程,然而尚未有研究探讨hsa-miR-3202与骨关节炎的相关性。目的:探讨hsa-miR-3202在骨关节炎软骨细胞中的表达及其对软骨细胞增殖与凋亡能力的影响。方法:①通过生物信息分析筛选骨关节炎软骨细胞中差异表达的microRNA,基于国内外研究现状,选择hsa-miR-3202进行后续研究,采用GO功能富集和KEGG通路富集对其进行靶基因预测。②选择对数生长期的人正常软骨细胞系C28/I2,随机分4组培养:正常组加入普通培养基培养24 h,更换普通培养基培养6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖组加入含脂多糖的培养基培养24 h,更换普通培养基培养6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖+NC组加入含脂多糖的培养基培养24 h,加入has-miR-3202 mimics对照转染6 h,更换普通培养基继续培养;脂多糖+hsa-miR-3202 mimics组加入含脂多糖的培养基培养24 h,加入has-miR-3202 mimics转染6 h,更换普通培养基继续培养。继续培养48 h后,采用RT-qPCR检测细胞hsa-miR-3202表达,流式细胞术检测细胞凋亡;继续培养0-72 h,采用CCK-8检测细胞增殖活力。结果与结论:①生物信息分析结果显示,hsa-miR-3202表达在骨关节炎软骨细胞中显著下调;GO功能富集与KEGG通路富集结果显示,hsa-miR-3202靶基因功能与细胞生长、凋亡密切相关。②体外细胞实验结果显示,与正常组比较,脂多糖组软骨细胞hsa-miR-3202表达与细胞增殖能力下降(P病的发生和发展。

关键词： has-miR-3202 骨关节炎生物信息学软骨细胞炎症细胞增殖细胞凋亡老年人

三臂非劣效临床试验基于干预依从性的效应估计方法

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中国卫生统计 2024年第2期41卷 213-217,222页

作者：吴研鹏陈平雁吴莹复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室 200032 南方医科大学公共卫生学院生物统计学系

目的临床试验中干预不依从问题通常无法避免,分析方法不当会导致结果偏倚,非劣效研究尤其如此。本研究针对三臂非劣效临床试验,建立Bayes因果模型,实现对干预依从人群的效应估计。方法基于主分层思想,按依从性类型将试验人群分层,从而... 详细信息

目的临床试验中干预不依从问题通常无法避免,分析方法不当会导致结果偏倚,非劣效研究尤其如此。本研究针对三臂非劣效临床试验,建立Bayes因果模型,实现对干预依从人群的效应估计。方法基于主分层思想,按依从性类型将试验人群分层,从而转化为不同依从性人群的结局混合分布识别问题。通过构建Bayes模型和使用DA(data augmentation)算法,实现结局参数后验分布估计和统计推断。通过模拟研究,比较本研究提出方法与传统的意向性治疗(intention-to-treat,ITT)、遵循研究方案(per-protocol,PP)及实际接受治疗(as-treated,AT)分析的统计性能。结果当依从类型与结局相关时,传统的ITT、PP及AT分析均存在较大偏倚;本研究提出方法在依从类型与结局相关和不相关两种情况下,均能够将偏倚控制在较小的范围。结论对于存在较严重干预不依从问题的非劣效临床试验,本研究提出方法较传统分析可以更好地控制分析偏倚。

关键词：不依从三臂非劣效性临床试验 Bayes因果模型 DA算法

膳食炎症指数与中老年人认知障碍发生风险的Meta分析

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中华疾病控制杂志 2024年第2期28卷 209-214,220页

作者：王丽丽赵海峰山西医科大学公共卫生学院营养与食品卫生学教研室太原030001

目的系统评价膳食炎症指数(dietary inflammatory index,DII)与中老年人认知障碍发生风险的关系。方法检索中国知网、万方、维普、生物医学文献、PubMed、Science Direct、Springer、Cochrane Library、Embase等数据库从建库至2022年6... 详细信息

目的系统评价膳食炎症指数(dietary inflammatory index,DII)与中老年人认知障碍发生风险的关系。方法检索中国知网、万方、维普、生物医学文献、PubMed、Science Direct、Springer、Cochrane Library、Embase等数据库从建库至2022年6月20日发表的关于DII与中老年人认知障碍的文献,按照纳入、排除标准严格筛选。采用纽卡斯尔-渥太华(Newcastle-Ottawa scale,NOS)量表及美国卫生保健质量和研究机构(Agency for Healthcare Research and Quality,AHRQ)推荐的横断面研究质量评价量表评估筛选后的文献质量,采用Revman 5.4软件和Stata 15.1软件进行Meta分析,随机效应模型汇总OR值和95%CI。结果共纳入7项研究,包含15428名参与者。Meta分析显示,与最低位数DII相比,最高位数DII与中老年人认知障碍风险增加相关(OR=1.62,95%CI:1.27~2.05,P<0.01),尤其是在使用FFQ调查膳食数据(OR=1.46,95%CI:1.21~1.77,P=0.17)及计算能量调整后的DII的研究(OR=1.71,95%CI:1.26~2.33,P=0.07)中。结论与抗炎饮食相比,高促炎饮食可能与中老年人认知障碍的风险增加有关,受纳入研究数量和质量的限制,未来仍需更多高质量研究予以验证。

关键词：膳食炎症指数认知障碍 Meta分析

睡眠质量低下与创伤患者创伤后应激障碍的发生相关

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南方医科大学学报 2024年第6期44卷 1166-1172页

作者：袁萍胡秀莉漆国佳代秀褚相远陈卫航石修权遵义医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室贵州遵义563006 习水县人民医院公共卫生科贵州遵义564600

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,... 详细信息

目的阐明创伤患者睡眠质量及创伤后应激障碍(PTSD)临床流行病学特征,系统分析睡眠质量对创伤住院患者PTSD发生的作用,为PTSD患者的临床早期识别提供参考。方法收集256例于2021年10月~2022年11月在遵义市4所综合医院招募创伤住院患者,226例完成PTSD调查评估。采用PSQI量表结合智能手环睡眠监测评估患者创伤前后睡眠质量;采用PCL-C量表随访测评PTSD发生情况。结果创伤患者1个月后PTSD检出率为19.47%,3个月后PTSD检出率为17.61%。在睡眠质量方面,PTSD患者创伤前PSQI量表评分显著增高(P<0.001),其中患者PTSD发生前睡眠异常检出率为72.73%。在创伤后(入院7 d内)睡眠质量监测方面,PTSD患者评分降低,夜间清醒次数增多(P<0.05)。在创伤1个月与3个月后睡眠质量方面,PTSD患者PSQI量表评分均高于非PTSD人群(P<0.05)。结论创伤患者中创伤前睡眠质量差者更容易发生PTSD。

关键词：创伤创伤后应激障碍睡眠障碍影响因素

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病毒宏基因组学在蜱媒病毒研究中的应用进展

中华疾病控制杂志 2024年第3期28卷 357-360页

作者：孙世伟陆振华龙泳邵中军空军医科大学公共卫生学院特殊作业环境危害评价与控制教育部重点实验室流行病学教研室西安710032 包头医学院公共卫生学院包头014000

蜱是广泛分布于全球的专性吸血体外寄生虫,是世界上最主要的病媒生物之一,携带的病原体涵盖了细菌、病毒、螺旋体等。其中以蜱媒病毒为主要的虫媒病毒之一,给人类和动物的健康带来了极大的威胁。病毒宏基因组学是近年来基于宏基因组学... 详细信息

蜱是广泛分布于全球的专性吸血体外寄生虫,是世界上最主要的病媒生物之一,携带的病原体涵盖了细菌、病毒、螺旋体等。其中以蜱媒病毒为主要的虫媒病毒之一,给人类和动物的健康带来了极大的威胁。病毒宏基因组学是近年来基于宏基因组学兴起的病毒研究技术,它的出现为研究已知和未知病毒及其多样性提供了有力支持,给病毒研究带来了全新的技术手段和思路。本文综述了病毒宏基因组学在蜱媒病毒研究中的进展,以期为蜱媒病毒研究提供参考依据。

关键词：蜱蜱媒病毒宏基因组学高通量测序