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脱色希瓦氏菌S12非特异性偶氮还原酶基因表达及特性

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微生物学报 2009年第10期49卷 1323-1331页

作者：陈杏娟许玫英李光飞孙国萍中国科学院南海海洋研究所广州510301 广东省微生物研究所广州510070 广东省菌种保藏与应用重点实验室广东省微生物应用新技术公共实验室广州510070 中国科学院研究生院北京100049

【目的】对脱色希瓦氏菌S12(Shewanella decolorationisS12)的acpD基因(登录号EF198254)及其表达活性进行研究。【方法】采用DNAMAN软件对该基因进行序列分析。利用PCR技术克隆含原有启动子的目的基因,与pGM-T载体连接后转化仅有微弱偶... 详细信息

【目的】对脱色希瓦氏菌S12(Shewanella decolorationisS12)的acpD基因(登录号EF198254)及其表达活性进行研究。【方法】采用DNAMAN软件对该基因进行序列分析。利用PCR技术克隆含原有启动子的目的基因,与pGM-T载体连接后转化仅有微弱偶氮还原活性的大肠杆菌TOP10(Escherichia coliTOP10)中进行表达。通过分光光度法测定偶氮染料的还原活性。【结果】序列分析表明,该基因编码198个氨基酸残基组成的多肽,与希瓦氏菌ANA-3(***-3)的NAD(P)H-醌氧化还原酶基因(登录号CP000469)、奥柰达希瓦氏菌MR-1(Shewanella oneidensisMR-1)的acpD基因(登录号AE014299)编码多肽的氨基酸序列同源性分别高达97%和96%,与***109中FMN依赖的NADH-偶氮还原酶(登录号NP-415930)氨基酸序列同源性为61%。它们在蛋白质二级结构排列上非常相似,尤其在活性中心FMN的结合位点(L7、L11环和L3环)上十分保守。同时,acpD基因在*** TOP10中的表达赋予了重组菌高效的偶氮还原活性。重组菌完整细胞能快速还原低极性无磺酸基团的甲基红,却不能对强极性多磺酸基团的苋菜红脱色;而当使用细胞粗酶液排除细胞膜屏障以后,强极性多磺酸基团的苋菜红亦能被高效还原。实验中还发现,该酶需要以NADH为电子供体,FMN的添加可显著提高其偶氮还原活性,而氧气的存在则明显抑制其活性。【结论】在***10中表达的偶氮还原酶定位在重组菌胞内,在体内或体外条件下都具有很强的还原不同极性偶氮染料的活性。脱色希瓦氏菌S12的acpD基因表达产物是一种非特异性的FMN依赖型的NADH-偶氮还原酶。该酶以NADH为电子供体,通过FMN结合位点的活性中心把电子传递给偶氮染料,最终实现染料的还原脱色。

关键词：非特异性偶氮还原酶 FMN依赖的NADH-偶氮还原酶脱色希瓦氏菌S12 偶氮还原

四种红曲菌各自固有的分子生物学和生物化学特性

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微生物学杂志 2007年第1期27卷 69-71页

作者：郭芳李钟庆中国科学院微生物研究所菌种保藏中心北京100080

对白色红曲菌、火红色红曲菌、烟灰色红曲菌和橙色红曲菌各自固有的核糖体内转录间隔区(ITS)rDNA序列和生物化学特性进行了研究。rDNA ITS测序结果显示,橙色红曲菌与火红色红曲菌相同,而白色红曲菌与灰色红曲菌相同,这两组经序列比对仅... 详细信息

对白色红曲菌、火红色红曲菌、烟灰色红曲菌和橙色红曲菌各自固有的核糖体内转录间隔区(ITS)rDNA序列和生物化学特性进行了研究。rDNA ITS测序结果显示,橙色红曲菌与火红色红曲菌相同,而白色红曲菌与灰色红曲菌相同,这两组经序列比对仅有2个碱基不同。从生物化学特性来看,作为分类指标,似乎有物种属(genus)的共性也有个体(株)质的差异或量的差异。

关键词：分子生物学特性 ITS序列生物化学特性

种特异性PCR快速检测奶粉中阪崎肠杆菌研究

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微生物学通报 2007年第6期34卷 1192-1197页

作者：叶应旺吴清平郭伟鹏张菊梅董晓晖中国科学院南海海洋研究所广州510301 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广州510070

阪崎肠杆菌是一种目前认为以奶粉为传播媒介的食源性条件致病菌,通过α-1,4-葡萄糖苷酶基因和ompA基因分别设计引物ESF-ESR和ESSF-ESSR,进行单重和双重PCR方法研究,结果显示所有阪崎肠杆菌菌株PCR扩增均为阳性,阴性对照均未扩增出目的片... 详细信息

阪崎肠杆菌是一种目前认为以奶粉为传播媒介的食源性条件致病菌,通过α-1,4-葡萄糖苷酶基因和ompA基因分别设计引物ESF-ESR和ESSF-ESSR,进行单重和双重PCR方法研究,结果显示所有阪崎肠杆菌菌株PCR扩增均为阳性,阴性对照均未扩增出目的片段;纯菌单重PCR灵敏度分别为102cfu/mL和101cfu/mL,双重PCR灵敏度为103cfu/mL;在有或无其他细菌存在时,人工污染阪崎肠杆菌模拟样品单重PCR检测灵敏度分别为103cfu/mL和102cfu/mL,双重PCR检测灵敏度为104cfu/mL;实际样品检测显示PCR方法与传统方法具有很好的一致性。结果表明:该PCR方法具有很好的种特异性和灵敏度,能够克服奶粉中杂菌对快速检测阪崎肠杆菌造成的干扰,减少以保守序列来设计引物导致假阳性结果的出现,可以较好地应用于奶粉中阪崎肠杆菌的检测与鉴定。

关键词：阪崎肠杆菌 α-1 4-葡萄糖苷酶基因 ompA基因奶粉

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剑叶凤尾蕨配子体发育的研究

植物学通报 2005年第5期22卷 566-571页

作者：张开梅石雷李东中国科学院植物研究所中国科学院研究生院北京100039

剑叶凤尾蕨(Pterisensiformis)是凤尾蕨科(Pteridaceae)凤尾蕨属(Pteris)多年生常绿草本植物,具有较高的观赏和药用价值。但是,目前对其繁殖过程还缺乏了解,限制了剑叶凤尾蕨资源的开发利用。本文报道了成功地采用混合土培养剑叶凤尾蕨... 详细信息

剑叶凤尾蕨(Pterisensiformis)是凤尾蕨科(Pteridaceae)凤尾蕨属(Pteris)多年生常绿草本植物,具有较高的观赏和药用价值。但是,目前对其繁殖过程还缺乏了解,限制了剑叶凤尾蕨资源的开发利用。本文报道了成功地采用混合土培养剑叶凤尾蕨的孢子,并系统地观察记录其孢子萌发及配子体发育过程。剑叶凤尾蕨的孢子呈褐色,赤道面观豆形,极面观三角形,单裂缝。播种1周左右孢子萌发,萌发类型为书带蕨型,配子体发育为水蕨型。播种3周左右发育为片状体。幼原叶体不对称,成熟原叶体裸露,无毛状体,呈心脏形。播种5周左右开始有性器官出现,精子器由3细胞组成,成熟颈卵器颈部由4列细胞组成,4层细胞高。原叶体受精后1个月内即可观察到从原叶体上生成的幼胚。该研究为园艺学研究提供了用孢子人工繁殖剑叶凤尾蕨的方法,也为分子生物学、遗传学和蕨类植物系统学研究提供了基础。

关键词：剑叶凤尾蕨孢子萌发配子体发育凤尾蕨属剑叶系统学研究细胞组成分子生物学原叶体草本植物

嗜冷和冷育微生物的研究 Ⅲ.地丝霉属一新种,光滑地丝霉

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菌物学报 1989年第1期 47-50+84-86页

作者：李钟庆崔存起中国科学院微生物研究所中国科学院微生物研究所北京

在研究食品冷库中嗜冷微生物区系时,获得很多冷育型真菌。地丝霉和金孢菌类在这些菌中占优势。其中一菌在PYE上于18℃培养14天,菌落白色,厚毡状,中央常有淡黄色渗出液滴,菌落直径33mm,背面浅黄褐色,有辐射沟纹,老后仍为白色。菌丝分隔,... 详细信息

在研究食品冷库中嗜冷微生物区系时,获得很多冷育型真菌。地丝霉和金孢菌类在这些菌中占优势。其中一菌在PYE上于18℃培养14天,菌落白色,厚毡状,中央常有淡黄色渗出液滴,菌落直径33mm,背面浅黄褐色,有辐射沟纹,老后仍为白色。菌丝分隔,直径1.0—2.0μm。该菌有明显的分生孢子梗,直立,宽度1.0—2.0μm,长10—25(—35)μm,无色或淡黄色,分生孢子梗具分枝,由分枝产分生孢子。分生孢子无色或淡黄色,顶端者为梨形、倒卵形或楔状,间生者矩椭圆形或桶状,1.5—2.5×2.5—3.5(—4.0)μm,光滑、1—3成链。该菌生长温度范围为0—25℃,最适温度为18℃,30℃不生长。此菌产生果胶酶,但是不分解角朊。该菌从冷库中生霉的蒜苗上分离得。其特征与Carmichael(1962),Domsch等(1980)所订正的金孢菌属(Chrysosporium Corda)中各种,以及Sigler和Carmichael(1976),Oorschot(1980)所订正的地丝霉属(Geomyces Traaen)中各种均有显著的差异,而其性状符合地丝霉属的特征集要。故命名为光滑地丝霉Geomyces laevis *** et Cui。模式:菌株AS 3.4605为模式菌株,保藏在中国科学院微生物研究所菌种保藏研究室;模式标本HMAS No.54875保存在该研究所真菌标本室。

关键词：地丝霉属金孢菌属光滑地丝霉毡毛状地丝霉毡毛状变种毡毛状地丝霉微糙变种毡毛状地丝霉葡萄酒红变种

华南三种粉褶蕈模式标本新观察到的特征(英文)

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菌物学报 2007年第3期26卷 468-469页

作者：李传华李泰辉沈亚恒中国科学院华南植物园广州510650 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广州510070

Recently,decades of Entoloma specimens deposited in the Herbarium of Microbiology Institute of Guangdong (HMIGD) have been *** them,3 types were found to possess some

关键词：华南粉褶蕈模式标本特征近杯伞状粉褶蕈橙黄粉褶蕈泡状囊体粉褶蕈

二氧化氯对脱氧核糖核苷三磷酸和质粒DNA的作用

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微生物学通报 2008年第8期35卷 1224-1229页

作者：韦明肯吴清平王大鹏吴军林张菊梅中国科学院南海海洋研究所广州510301 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广州510070

以75mmol/L的二氧化氯作用于脱氧核糖核苷三磷酸dCTP、dTTP、dGTP、dATP混合物(浓度均为100μmol/L),液相色谱显示它们在260nm波长处的峰面积分别下降了54.23%±2.08%、66.25%±3.32%、55.47%±0.23%、59.59%±3.27%。纯化质粒被二氧化氯作用后电泳条带未出现明显弥散和拖尾现象。45mmol/L以上二氧化氯能彻底抑制质粒DNA的PCR模板活性,150mmol/L的二氧化氯才能使纯化质粒的转化率降至对照组的0.20%±0.20%。实验证明二氧化氯对DNA具有损伤作用,这种损伤可能与嘧啶碱和嘌呤碱的共轭双键被破坏有关。

关键词：二氧化氯质粒高效液相色谱模板活性转化率

中国微生物资源研究现状及未来发展态势分析（英文）

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微生物学报 2018年第12期58卷 2123-2133页

作者：吴林寰刘柳孙清岚刘斌于建荣徐萍陈方陈云伟李祯祺施慧琳周宇光马俊才中国科学院微生物研究所北京100101 世界微生物数据中心北京100101 中国科学院科技促进发展局北京100864 中国科学院上海生命科学信息中心上海210031 中国科学院成都文献情报中心成都610041 中国普通微生物菌种保藏中心北京100101 微生物资源前期开发国家重点实验室北京100101

【目的】微生物资源由于其对于生命科学基础研究和生物经济的重要价值,一直是全球生物技术竞争的战略重点。中国目前已经成为在生命科学研究领域最有影响力的国家之一,每年发表的论文数量居全球第二位。通过微生物资源的保藏和利用的分... 详细信息

【目的】微生物资源由于其对于生命科学基础研究和生物经济的重要价值,一直是全球生物技术竞争的战略重点。中国目前已经成为在生命科学研究领域最有影响力的国家之一,每年发表的论文数量居全球第二位。通过微生物资源的保藏和利用的分析能够一定程度反映我国微生物研究的整体状况和进展,并进一步反映生命科学研究和生物产业的发展趋势。【方法】本文通过分析我国微生物资源保藏、文献、专利等数据,阐述了我国微生物资源的保藏和利用现状,并同相关国家进行了比较,基于此分析,为我国微生物资源挖掘与利用提供战略方向和建议。【结论】近年来,我国建立了微生物资源国家平台,每年发表论文数量居全球第二位,申请和授权专利数量居全球第一位,充分反映了我国微生物资源研究及其在生物产业的应用现状。我国正在形成一个微生物资源保藏、研究和应用的完整体系,为我国乃至全球的生物经济的发展提供支撑。

关键词：微生物资源保藏中心研究评价

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中国一新记录种--黑顶小皮伞

菌物学报 2008年第5期27卷 768-770页

作者：邓春英李泰辉中国科学院华南植物园广州510650 广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室广州510070

最近作者在检查中国科学院昆明植物研究所隐花植物标本馆（HKAS）小皮伞属Marasmius Fr.的标本时,发现了二份具大型子实体的标本,经鉴定它们与采自美国的黑顶小皮伞***（Peck）Halling等模式标本（HKAS 39834）在宏观和微观特征上一致,... 详细信息

最近作者在检查中国科学院昆明植物研究所隐花植物标本馆（HKAS）小皮伞属Marasmius Fr.的标本时,发现了二份具大型子实体的标本,经鉴定它们与采自美国的黑顶小皮伞***（Peck）Halling等模式标本（HKAS 39834）在宏观和微观特征上一致,为中国的新记录种。颜色对照采用Kornerup ＆ Wanscher（1978）的颜色手册描述。现描述如下：

关键词：中国科学院新记录种小皮伞植物标本馆昆明植物研究所微观特征子实体颜色