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茶多酚对嗜水气单胞菌致病力的抑制作用

中国食品学报 2024年第1期24卷 21-30页

作者：张德福闫天慧励建荣杨秋红艾晓辉董靖渤海大学食品科学与工程学院辽宁锦州121013 中国水产科学研究院长江水产研究所武汉420223

针对嗜水气单胞菌污染水产品所致动物感染和消费者食源性疾病等问题,筛选能够抑制嗜水气单胞菌致病力的天然产物茶多酚。溶血试验表明茶多酚对气溶素溶血活性具有直接抑制作用,通过荧光热漂移和七聚体形成试验分析其作用机制。结果表明... 详细信息

针对嗜水气单胞菌污染水产品所致动物感染和消费者食源性疾病等问题,筛选能够抑制嗜水气单胞菌致病力的天然产物茶多酚。溶血试验表明茶多酚对气溶素溶血活性具有直接抑制作用,通过荧光热漂移和七聚体形成试验分析其作用机制。结果表明,茶多酚虽在128μg/mL以下不抑制嗜水气单胞菌的生长,但能在1~8μg/mL直接抑制其主要毒力蛋白气溶素的溶血活性。荧光热漂移和七聚体试验发现,茶多酚通过与气溶素直接结合,降低了气溶素七聚体的形成并抑制其活性。细胞试验结果表明,4~8μg/mL茶多酚能对气溶素导致的人肺癌上皮细胞死亡具有显著的保护作用。此外,50 mg/kg茶多酚治疗可使斑点叉尾鮰嗜水气单胞菌感染模型的存活率提高至60%。综上,茶多酚通过直接与气溶素结合,抑制气溶素形成功能性七聚体而降低其活性,从而显著降低嗜水气单胞菌的体内、外致病力。研究结果提示茶多酚可作为抗生素替代或辅助药物用于治疗嗜水气单胞菌相关感染。

关键词：嗜水气单胞菌气溶素茶多酚抗毒力水产品

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长期稻虾轮作对稻田土壤细菌群落的影响

生态学杂志 2024年

作者：彭亮代梨梨陶玲张辉朱建强李谷长江大学农学院中国水产科学研究院长江水产研究所

为探究长期稻虾轮作对稻田土壤理化性质及细菌群落结构的影响，基于化学分析方法和16S rRNA扩增子高通量测序技术，研究了水稻单作与4年、8年和21年稻虾轮作稻田土壤理化性质及细菌群落结构，并对细菌群落结构与土壤理化性质之间的关系... 详细信息

为探究长期稻虾轮作对稻田土壤理化性质及细菌群落结构的影响，基于化学分析方法和16S rRNA扩增子高通量测序技术，研究了水稻单作与4年、8年和21年稻虾轮作稻田土壤理化性质及细菌群落结构，并对细菌群落结构与土壤理化性质之间的关系进行了分析。结果显示，相较于水稻单作模式，稻虾轮作稻田土壤总磷含量提高37.01%～54.33%（P研究表明，稻虾轮作增加了稻田土壤总磷含量，降低了土壤速效磷含量，长期稻虾轮作没有改变土壤细菌群落的多样性，但却改变了细菌不同门类的相对丰度。本研究可为阐释稻虾轮作模式对稻田土壤细菌群落的影响机制提供科学依据。

关键词：稻虾轮作年限细菌群落土壤理化性质

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稻虾种养对土壤有机碳组成和酶活性的影响

上海海洋大学学报 2024年

作者：彭亮郝柳柳代梨梨陶玲张辉李谷朱建强长江大学农学院中国水产科学研究院长江水产研究所

为探究稻虾种养对土壤有机碳稳定性和酶活性的影响，于2021年和2022年以“深两优3117”水稻（Oryza sativa）和克氏原螯虾（Procambarus clarkii）为材料，开展了稻虾轮作模式与水稻单作模式的对比试验，分析了土壤有机碳组成、活性... 详细信息

为探究稻虾种养对土壤有机碳稳定性和酶活性的影响，于2021年和2022年以“深两优3117”水稻（Oryza sativa）和克氏原螯虾（Procambarus clarkii）为材料，开展了稻虾轮作模式与水稻单作模式的对比试验，分析了土壤有机碳组成、活性有机碳组分和碳氮磷转化相关酶活性。结果显示，相较于水稻单作模式，试验期间稻虾种养模式土壤LOC I含量显著提高25.86%～39.13%，土壤MBC含量显著提高96.54%～105.73%，土壤POC含量显著提高92.24%～132.32%（P<0.05），而土壤β-XYS活性显著降低29.35%～59.74%，ACP活性显著降低41.64%～59.12%（P<0.05），而NAG活性较水稻单作稻田显著升高29.04%～98.86%（P<0.05）。Pearson分析显示，土壤LOC I、ROC、MBC和POC与pH、TN和TOC呈显著正相关（P<0.05），DOC和C/N与pH和TN显著负相关（P<0.05）。稻虾种养模式通过增加土壤pH和总氮含量，降低β-XYS和ACP活性，提高土壤NAG活性，增加了土壤活性有机碳组分含量。

关键词：稻虾种养土壤有机碳组成酶活性

环境DNA技术发展及其在长江流域水生生态学领域的应用研究进展

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海洋渔业 2024年第1期46卷 119-128页

作者：赵娜杨刚吴祖立宋超熊敏思赵峰张涛中国水产科学研究院东海水产研究所上海200090

长江流域鱼类资源丰富、生物多样性高。近年来,受人为干扰、环境变化等因素影响,鱼类资源急剧衰退,全面了解该流域水生生态学信息、进行长江大保护迫在眉睫。随着分子生物学技术的发展,环境DNA技术应运而生,其相比于传统调查方式更加高... 详细信息

长江流域鱼类资源丰富、生物多样性高。近年来,受人为干扰、环境变化等因素影响,鱼类资源急剧衰退,全面了解该流域水生生态学信息、进行长江大保护迫在眉睫。随着分子生物学技术的发展,环境DNA技术应运而生,其相比于传统调查方式更加高效、灵敏,应用领域更广;该技术的灵敏性使其非常适合于检测濒危物种、低密度物种入侵、瞬时和隐秘物种的存在,特别是当检测低密度物种的采样工作难以控制时,其敏感性、简便性和降低危害性的优势愈加显现出来。因此,该技术已被广泛应用于食品微生物、生物监测、群落生态学、古环境、保护生物学和生物入侵等领域的研究。介绍了环境DNA定义、发展史、研究方法与优劣势,在此基础上概述了其在长江流域水生生态学领域的应用研究进展,最后展望了环境DNA技术与环境RNA技术相结合的技术革新以及新一代测序手段、大数据及机器智能技术多技术结合助力该领域研究的前景,以期为长江流域持续性生态学监测提供借鉴和参考。

关键词：环境DNA 长江流域生态学

西藏水生生物资源与环境本底状况调查（2017—2021）

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水产学报 2024年

作者：刘明典朱峰跃朱挺兵李雷王琳刘香江朱仁刘飞岑祥胡飞飞金星袁立来霍斌何德奎刘海平徐玮彤龚进玲王鹏丁放杨瑞斌张驰杜红春陈中祥曹坤扎西拉姆刘绍平段辛斌杨德国贾银涛李应仁李大鹏马波牟振波陈大庆中国水产科学研究院长江水产研究所国家农业科学重庆观测实验站中国水产科学研究院黑龙江水产研究所中国水产科学研究院华中农业大学中国科学院水生生物研究所西藏自治区农牧科学院水产科学研究所

为了全面了解西藏水生生物资源和生态环境本底状况，中国水产科学研究院（长江水产研究所，黑龙江水产研究所，资源环境研究中心）、华中农业大学、中国科学院水生生物研究所和西藏农牧科学院水产科学研究所联合对西藏雅鲁藏布江、怒江... 详细信息

为了全面了解西藏水生生物资源和生态环境本底状况，中国水产科学研究院（长江水产研究所，黑龙江水产研究所，资源环境研究中心）、华中农业大学、中国科学院水生生物研究所和西藏农牧科学院水产科学研究所联合对西藏雅鲁藏布江、怒江、澜沧江、巴松错、哲古错、错那、错鄂（三江四湖）的鱼类种类组成、鱼类资源量、渔业生态环境等开展了系统调查。调查结果显示：①2017—2021年西藏三江四湖采集到鱼类53种，隶属于2目5科24属，其中土著鱼45种，外来鱼6种，杂种鱼2种；②基于数量和生物量，雅鲁藏布江上游鱼类优势种包括拉萨裸裂尻鱼、双须叶须鱼、异齿裂腹鱼和尖裸鲤，中游鱼类优势种包括异齿裂腹鱼、巨须裂腹鱼、拉萨裸裂尻鱼、拉萨裂腹鱼，加查至桑日江段国家二级保护动物尖裸鲤和黑斑原鮡的重量占比均显著下降，下游鱼类优势种包括弧唇裂腹鱼、西藏墨头鱼、黄斑熠鮡、墨脱裂腹鱼、平鳍裸吻鱼，怒江鱼类优势种包括裸腹叶须鱼、热裸裂尻鱼、怒江裂腹鱼，澜沧江鱼类优势种主要为光唇裂腹鱼和澜沧裂腹鱼，巴松错鱼类优势种包括异齿裂腹鱼和巨须裂腹鱼，哲古错鱼类优势种包括异尾高原鳅、高原裸鲤和拉萨裸裂尻鱼，错那和错鄂鱼类优势种均为热裸裂尻鱼和异尾高原鳅；③外来物种主要分布在雅鲁藏布江中游；④西藏三江四湖水质基本符合渔业水质标准，雅鲁藏布江上游水域总氮和总磷的浓度均低于中游和下游。调查结果说明2017—2021年西藏三江四湖调查到的土著鱼物种数（45种）占西藏历史上土著鱼物种数（72种）的62.50%，异齿裂腹鱼和拉萨裸裂尻鱼是雅鲁藏布江上游和中游均有的优势种，雅鲁藏布江中游加查至桑日江段濒危物种尖裸鲤和黑斑原鮡的重量占比均显著下降；外来物种主要分布在雅鲁藏布江中游；三江四湖水质基本符合渔业水质标准。此次调查为西藏渔业资源与保护、特色资源可持续利用和生态环境可持续发展提供了重要的科技支撑。

关键词：鱼类资源种类组成优势种环境西藏

eDNA监测空间分辨率量化方法研究——以长江中游干流平水期为案例

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长江流域资源与环境 2024年第4期33卷 855-869页

作者：杨海乐许兰馨周琼刘志刚吴金明中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室湖北武汉430223

eDNA监测技术有助于提高水生生物种类组成监测和种群健康监测的效率,而eDNA监测的空间分辨率未量化阻碍了常态化系统化eDNA监测的实施。为了量化eDNA监测的空间分辨率,探索建立了一个基于流域生物信息流分析框架和eDNA监测空间分辨率概... 详细信息

eDNA监测技术有助于提高水生生物种类组成监测和种群健康监测的效率,而eDNA监测的空间分辨率未量化阻碍了常态化系统化eDNA监测的实施。为了量化eDNA监测的空间分辨率,探索建立了一个基于流域生物信息流分析框架和eDNA监测空间分辨率概率化表述的量化方法,并在长江中游开展了案例研究。2020年6月(平水期)在长江中游设置30个采样断面,断面间隔在30 km左右,开展eDNA采样,进行高通量测序(原核生物用16S rRNA基因扩增子测序、真核生物用线粒体COI基因扩增子测序),根据流域生物信息流分析框架计算eDNA所能监测到的生物信息输移的量化特征,确定eDNA监测空间分辨率(系列)值及其可信度、覆盖度。结果显示长江中游平水期,eDNA监测原核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为27 km(可信度为84.18%),监测真核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为6 km(可信度为41.38%),达到80%以上覆盖度对应的空间分辨率为13 km(可信度为50.64%);监测原核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为58 km(覆盖度为82.30%),监测真核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为78 km(覆盖度为38.61%),达到80%以上可信度对应的空间分辨率为50 km(覆盖度为49.70%)。研究结果可为其它eDNA监测空间分辨率估算工作提供方法借鉴,为长江中游eDNA监测断面设置提供量化参考。

关键词：环境DNA监测空间分辨率可信度与覆盖度流域生物信息流流域生态学

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基于环境DNA的长江中华鲟分布特征探究

环境工程技术学报 2024年第1期14卷 71-78页

作者：周权杜浩王洁邵芸闫振广环境基准与风险评估国家重点实验室中国环境科学研究院中国水产科学研究院长江水产研究所

中华鲟(Acipenser sinensis)是我国长江流域的旗舰物种,在长江十年禁渔的大背景下,研究中华鲟无损化检测技术具有重要意义。环境DNA(eDNA)技术是一种环境友好型生物监测技术,可以在不直接观察或捕获生物体的情况下对物种进行检测。从文... 详细信息

中华鲟(Acipenser sinensis)是我国长江流域的旗舰物种,在长江十年禁渔的大背景下,研究中华鲟无损化检测技术具有重要意义。环境DNA(eDNA)技术是一种环境友好型生物监测技术,可以在不直接观察或捕获生物体的情况下对物种进行检测。从文献中筛选出可以用于检测中华鲟eDNA的特异性引物,于2020年9月在长江中下游选取4个中华鲟常出现的区域,进行各断面立体式采样;提取16个点位的e DNA,使用筛选得到的引物对中华鲟进行eDNA的检测,以探究中华鲟的分布特征。结果显示,成功筛选到1组可以检测中华鲟eDNA的引物,使用该引物成功检测到包括中华鲟在内的长江4种鲟类的eDNA,共计测得约300万条鲟类序列。依据测序结果分析不同断面检测到的中华鲟eDNA的差异,发现宜昌江段断面的中华鲟eDNA最多,洞庭湖口断面最少,且表层和底层水体的中华鲟eDNA检出也有显著差异。筛选得到的引物可以用于中华鲟eDNA的检测,中华鲟e DNA的检测结果与中华鲟的历史调查和洄游特征较为吻合。不同水深条件中华鲟eDNA的检出量有显著差异,表明在今后的调查中采用混合或者立体采样可以更加全面地进行中华鲟eDNA的检测。

关键词：中华鲟特异性引物环境DNA 操作分类单元长江

野生、驯养和养殖硬刺松潘裸鲤肌肉营养成分分析与评价

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大连海洋大学学报 2024年

作者：张嘉祺喻亚丽路珂褚志鹏金佳利李大鹏马宝珊中国水产科学研究院长江水产研究所华中农业大学水产学院竹溪县农业农村局

为探究硬刺松潘裸鲤(Gymnocypris potanini firmispinatus) 在不同生长背景下的肌肉营养情况，以促进其人工养殖和饲料开发，本研究中通过采集野生、驯养和养殖的硬刺松潘裸鲤，测定其鱼体肌肉的常规营养成分、氨基酸和脂肪酸组成与含... 详细信息

为探究硬刺松潘裸鲤(Gymnocypris potanini firmispinatus) 在不同生长背景下的肌肉营养情况，以促进其人工养殖和饲料开发，本研究中通过采集野生、驯养和养殖的硬刺松潘裸鲤，测定其鱼体肌肉的常规营养成分、氨基酸和脂肪酸组成与含量，对其营养价值进行比较和评价。结果表明：养殖组的水分含量显著高于野生组和驯养组，粗脂肪含量显著低于野生组和驯养组(P研究表明，硬刺松潘裸鲤肌肉富含Lys、EPA和DHA等营养物质，是一种优质蛋白源，其中，养殖硬刺松潘裸鲤肌肉在氨基酸营养评价、PUFA含量方面更具优势，而野生硬刺松潘裸鲤在EAA、DAA含量方面更具优势。

关键词：硬刺松潘裸鲤营养成分人工养殖氨基酸脂肪酸

基于高通量测序技术的长江口刀鲚春季食性分析

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水生态学杂志 2024年

作者：王敏黄晓荣冯广朋宋超刘若晖孙金辉崔培天津农学院中国水产科学研究院东海水产研究所

探究不同规格刀鲚的食性特征及差异，可为长江口刀鲚物种保护、资源增殖以及人工养殖提供参考依据。2023年5月在长江口水域设置10个站位采集刀鲚（Coilia nasus）样品，利用高通量测序技术分析2种不同规格（以200 mm为临界点）刀鲚的食... 详细信息

探究不同规格刀鲚的食性特征及差异，可为长江口刀鲚物种保护、资源增殖以及人工养殖提供参考依据。2023年5月在长江口水域设置10个站位采集刀鲚（Coilia nasus）样品，利用高通量测序技术分析2种不同规格（以200 mm为临界点）刀鲚的食性特征，运用UPARSE软件进行OUT物种分类学注释并分析其群落组成，运用Mothur软件进行Alpha和Beta多样性分析。结果表明：小规格刀鲚（≤200mm）摄食30种饵料生物，主要以浮游动物、浮游植物、虾类为食；大规格刀鲚（>200mm）摄食12种饵料生物，主要以浮游动物、虾类、蟹类为食；2种不同规格刀鲚的饵料生物组成不存在显著性差异（P>0.05），胃部均存在大量宫脂属（Hysterothylacium）线虫。

关键词：刀鲚高通量测序技术宫脂属线虫食性长江口