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基于生物信息学的克罗恩病中炎症相关关键基因的筛选及验证

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中国医科大学学报 2024年第4期53卷 324-331页

作者：于明鑫杨爱明中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院消化内科北京100730

目的应用生物信息学方法筛选并验证炎症相关基因在克罗恩病(CD)中的表达情况。方法分别从基因表达综合(GEO)数据库和分子特征数据库(Msigdb)下载CD数据集(GSE193677、GSE66407和GSE179285)和炎症反应相关基因(IRGs)。利用GSE193677数据... 详细信息

目的应用生物信息学方法筛选并验证炎症相关基因在克罗恩病(CD)中的表达情况。方法分别从基因表达综合(GEO)数据库和分子特征数据库(Msigdb)下载CD数据集(GSE193677、GSE66407和GSE179285)和炎症反应相关基因(IRGs)。利用GSE193677数据集进行单样本基因集富集分析(ssGSEA),明确CD和健康对照人群中免疫细胞和炎症水平;然后利用DESeq2方法于CD数据集进行基因差异表达分析,以|log2FC|≥1且校正P<0.05标准筛选获得CD患者和健康样本之间的差异表达基因(DEGs)。DEGs和IRGs取交集获得炎症相关差异表达基因(IRDEGs)。对IRDEGs进行基因本体(GO)和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析。利用Cytoscape软件的cyto-Hubba插件筛选确定关键IRDEGs。利用GSE66407和GSE179285数据集对CD组与健康对照组、炎症组及非炎症组关键IRDEGs的表达进行验证。结果GSE193677数据集中ssGSEA分析表明,CD患者炎症细胞表达明显高于健康对照(P<0.001),免疫细胞中树突状细胞(P<0.001)、中性粒细胞(P<0.001)和巨噬细胞(P<0.05)水平等也明显上调。通过差异表达分析获得450个DEGs,其中378个上调,72个下调。将DEGs和IRGs(200个)取交集,获得24个IRDEGs。GO和KEGG富集分析显示IRDEGs在T细胞增殖、CXCR受体通路、丝氨酸蛋白抑制剂、IL-17信号等通路中显著富集。PPI分析和Cytoscape筛选确定了7个关键IRDEGs,包括IL1A、SELE、CXCL11、CSF3、CXCL9、CXCL10和CCL7。7个关键IRDEGs均在不同程度上与临床病情活动度呈正相关(均P<0.05)。验证结果显示,GSE66407数据集中,CD组和炎症组IL1A、SELE、CXCL11、CXCL9、CXCL10和CCL7表达均明显上调(均P<0.01);GSE179285数据集中,CD组SELE、CXCL11、CSF3、CXCL9、CXCL10和CCL7表达均高于健康对照组(均P<0.01),炎症组7个关键IRDEGs表达水平均高于非炎症组(均P<0.05)。结论本研究明确了炎症相关基因在CD中的表达情况;确认了IL1A、SELE、CXCL11、CSF3、CXCL9、CXCL10和CCL77个关键IRDEGs,为CD的临床诊治提供了有利支持。

关键词：克罗恩病炎症反应差异表达基因生物信息学

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与时代同行助力心力衰竭规范化诊治能力提升

中华心血管病杂志 2024年第3期52卷 231-234页

作者：许顶立韩雅玲张抒扬南方医科大学南方医院心内科器官衰竭防治国家重点实验室广州510515 北部战区总医院心血管内科沈阳110016 中国医学科学院北京协和医院心内科北京100730

《中国心力衰竭诊断和治疗指南2024》在本期全文刊出。该指南的制定遵循了传承和更新的原则,对2018年以来心力衰竭领域的新共识和有循证医学证据的诊治方法进行了全面介绍和更新。该文总结了新指南的更新要点。

关键词：心力衰竭指南中国诊断治疗

经胸超声心动图检查规范化应用中国专家共识(2024版)

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中华超声影像学杂志 2024年第1期33卷 1-13页

作者：中华医学会超声医学分会超声心动图学组国家超声诊断专业医疗质量控制中心专家委员会谢明星姜玉新张丽马春燕不详华中科技大学同济医学院附属协和医院超声医学科武汉430022 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院超声科北京100730 华中科技大学同济医学院附属协和医院中国医科大学附属第一医院

为推动超声心动图规范化临床应用,进一步提升超声心动图的诊断水平,特别是在我国超声心动图检查设备和从业人员分布不均衡的现状下,需建立适合我国国情的经胸超声心动图检查的评价标准,在参考国际成熟报告体系标准基础之上[1,2,3,4,5,6]... 详细信息

为推动超声心动图规范化临床应用,进一步提升超声心动图的诊断水平,特别是在我国超声心动图检查设备和从业人员分布不均衡的现状下,需建立适合我国国情的经胸超声心动图检查的评价标准,在参考国际成熟报告体系标准基础之上[1,2,3,4,5,6],推行超声心动图标准化存图及结构化报告,达成专家共识。中华医学会超声医学分会超声心动图学组及国家超声诊断专业医疗质量控制中心专家委员会结合国内外指南、共识和最新研究进展,结合我国国情制定了经胸超声心动图规范化应用专家共识。本共识主要目的是:明确经胸超声心动图检查室基本构成,推荐超声心动图检查流程,规范超声检查报告书写格式与内容,以期推动和提高我国经胸超声心动图检查的规范化应用,从而助力国家分级诊疗政策有效实施。同时,本共识将有助于监测经胸超声心动图检查的各项质控指标,使超声心动图检查水平得以持续改进,特别是在不同医疗单位之间,以期达到经胸超声心动图报告相互认可的目的。本共识的实施亦将有助于提升临床医生解读超声心动图报告的能力。

关键词：超声心动图检查经胸超声心动图医疗质量控制中华医学会分级诊疗质控指标临床医生超声医学

中国直肠癌侧方淋巴结转移诊疗专家共识(2024版)

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中华胃肠外科杂志 2024年第1期27卷 1-14页

作者：中国医师协会内镜医师分会腹腔镜外科专业委员会中国医师协会结直肠肿瘤专业委员会腹腔镜专业委员会中华医学会外科学分会结直肠外科学组中国抗癌协会结直肠肿瘤整合康复专业委员会中国医疗保健国际交流促进会结直肠病分会王自强孟文建杨旭洋魏明天刘骞张明光胡茜玥周总光王锡山张忠涛池畔不详四川大学华西医院中国医学科学院肿瘤医院首都医科大学附属北京友谊医院福建医科大学附属协和医院

侧方淋巴结是中低位直肠癌常见的转移部位, 亦是术后局部复发的主要原因。目前国际上针对直肠癌侧方转移的诊断、治疗尚存争议。本共识在《中国直肠癌侧方淋巴结转移诊疗共识(2019版)》的基础上, 结合国内外最新研究成果, 国内42位结直... 详细信息

侧方淋巴结是中低位直肠癌常见的转移部位, 亦是术后局部复发的主要原因。目前国际上针对直肠癌侧方转移的诊断、治疗尚存争议。本共识在《中国直肠癌侧方淋巴结转移诊疗共识(2019版)》的基础上, 结合国内外最新研究成果, 国内42位结直肠癌研究领域的专家针对直肠癌侧方淋巴结转移的诊断、治疗策略、随诊以及复发处理4个方面进行修订, 提出18条侧方淋巴结诊疗相关共识, 并采用美国预防医学工作组的评价标准进行等级推荐, 旨在进一步规范直肠癌侧方淋巴结转移的诊断标准及治疗策略。在本共识中未解决的相关问题, 尚需进一步临床实践, 并积极开展高质量的临床研究逐步探索和解决。

关键词：直肠肿瘤,中低位侧方淋巴结转移侧方淋巴结清扫新辅助治疗专家共识

基于FAERS数据库的药物相关急性肾损伤信号挖掘

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医药导报 2024年

作者：谢昊周洁如戴睿许治清孙雯娟陈罡赵彬杜小莉中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院药剂科天津中医药大学中药学院中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院临床药理研究中心中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院肾内科

目的对药物相关急性肾损伤（AKI）信号进行挖掘与分析，总结潜在风险药物，为临床安全用药提供参考。方法检索美国食品药品监督管理局不良事件报告系统（FAERS）中2004年1月—2023年9月AKI报告，采用比例失衡法探究药物与AKI之间的关系... 详细信息

目的对药物相关急性肾损伤（AKI）信号进行挖掘与分析，总结潜在风险药物，为临床安全用药提供参考。方法检索美国食品药品监督管理局不良事件报告系统（FAERS）中2004年1月—2023年9月AKI报告，采用比例失衡法探究药物与AKI之间的关系，并分析人口学信息、发生时间和患者结局。结果从1253个药物中筛选出AKI信号药物159个，其中，抗微生物药物49个（30.82%），包括35个抗菌药物和14个抗病毒药物，抗肿瘤药物33个（20.75%），降压药25个（15.72%）。药物相关AKI发生人群中，老年人居多，男女比为124:100。抗菌药物相关AKI发生时间中位数均≤8d，第三四分位数均≤21d。利伐沙班和阿司匹林的死亡报告占比较高，分别为33.03%和31.44%。结论AKI风险药物较多，临床应用时应保持谨慎，注意监测肾功能。老年人是药物相关AKI的高危人群，男性多于女性。对于抗菌药物，前21 d是重点监测时期；对于需长期服用的药物，应规律监测。

关键词：急性肾损伤药物警戒信号挖掘美国食品药品监督管理局不良事件报告系统

经导管主动脉瓣置换术CT检查技术中国专家共识

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中华放射学杂志 2024年第4期58卷 365-374页

作者：中国医师协会放射医师分会心血管学组国家心血管病专业质控中心心血管影像质控专家工作组中国研究型医院学会心血管影像专业委员徐磊宋光远吴永健吕滨王辉张楠姚晶韩磊任心爽王墨扬侯阳不详首都医科大学附属北京安贞医院医学影像科北京100029 首都医科大学附属北京安贞医院瓣膜介入中心北京100029 中国医学科学院北京协和医学院国家心血管病中心阜外医院心内科北京100037 中国医学科学院北京协和医学院国家心血管病中心阜外医院放射影像科北京100037 中国医学科学院阜外医院放射影像科中国医科大学附属盛京医院放射科

经导管主动脉瓣置换术(transcatheter aortic valve replacement,TAVR)已成为老年主动脉瓣狭窄患者的一线治疗手段。准确的影像学评估是TAVR手术成功的基础与关键,CT影像已经成为拟定手术策略参考的“金标准”。本共识总结了TAVR术前及... 详细信息

经导管主动脉瓣置换术(transcatheter aortic valve replacement,TAVR)已成为老年主动脉瓣狭窄患者的一线治疗手段。准确的影像学评估是TAVR手术成功的基础与关键,CT影像已经成为拟定手术策略参考的“金标准”。本共识总结了TAVR术前及术后CT检查的患者准备、数据采集与图像重建、对比剂使用及图像质量评价,旨在规范TAVR相关CT检查方案,促进TAVR在我国规范、快速发展。

关键词：体层摄影术,X线计算机经导管主动脉瓣置换术专家共识

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增加胰腺癌风险的药物研究进展

中国医院药学杂志 2024年

作者：谢昊姜琳许治清周洁如赵彬中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院药剂科中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院内科天津中医药大学中药学院

胰腺癌预后差，致死率高，居全球癌症死因第六。高龄、吸烟、肥胖、慢性胰腺炎、2型糖尿病以及家族史为其高危因素。流行病学研究发现某些药物或增加胰腺癌风险。该综述总结了具有流行病学研究证据的潜在风险药物最新研究进展，包括胰... 详细信息

胰腺癌预后差，致死率高，居全球癌症死因第六。高龄、吸烟、肥胖、慢性胰腺炎、2型糖尿病以及家族史为其高危因素。流行病学研究发现某些药物或增加胰腺癌风险。该综述总结了具有流行病学研究证据的潜在风险药物最新研究进展，包括胰岛素、胰岛素促泌剂、胰高血糖素样肽-1类似物、二肽基肽酶-4抑制剂、噻唑烷二酮类药物、二甲双胍、质子泵抑制剂、雷尼替丁、青霉素、磺胺类抗生素和钙通道阻滞剂，并探讨了潜在致癌机制，以期为临床安全用药提供参考，为后续研究提供思路。

关键词：胰腺癌危险因素致癌作用药物警戒

间质性肺疾病冷冻肺活检标本病理诊断中国专家共识

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中华结核和呼吸杂志 2024年第8期47卷 704-715页

作者：中国医师协会呼吸医师分会呼吸病理工作组中华医学会病理学分会胸部疾病学组冯瑞娥朱翔杨子萱孟凡青冯安宁张声黄慧不详中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科北京100730 北京大学医学部北京大学第三医院华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院南京大学医学院附属南京鼓楼医院福建医科大学附属第一医院中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院

经支气管冷冻肺活检(TBLC)已用于间质性肺疾病(ILD)的病理诊断,TBLC较外科肺活检标本小,病理诊断难度增大,业内缺乏关于TBLC病理诊断ILD的指导性共识/指南,为更好指导病理医师做好TBLC标本ILD的病理诊断,中国医师协会呼吸医师分会呼吸... 详细信息

经支气管冷冻肺活检(TBLC)已用于间质性肺疾病(ILD)的病理诊断,TBLC较外科肺活检标本小,病理诊断难度增大,业内缺乏关于TBLC病理诊断ILD的指导性共识/指南,为更好指导病理医师做好TBLC标本ILD的病理诊断,中国医师协会呼吸医师分会呼吸病理工作组、中华医学会病理学分会胸部疾病学组共同组织专家讨论及制定本共识。共识制定小组在文献复习的基础上结合临床实践,收集临床问题,经多次会议讨论及专家投票(Delphi法)形成本共识。共识总结了TBLC标本送检、评价、常见人为假象,提出TBLC标本的诊断原则、诊断流程、各主要病理改变对应的ILD类型以及主要鉴别诊断,并形成14条专家推荐意见,供临床诊断及多学科讨论参考。

关键词：间质性肺疾病中国医师协会病理医师 Delphi法病理诊断肺活检胸部疾病诊断原则

非小细胞肺癌新辅助免疫治疗的预后影响因素:病理淋巴结转移程度与原发灶缓解程度

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首都医科大学学报 2024年第4期45卷 649-653页

作者：徐源梁乃新刘洪生中国医学科学院北京协和医院胸外科北京100730

目的探讨新辅助免疫治疗后病理淋巴结转移情况及原发灶缓解程度对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者预后的影响。方法回顾性分析40例接受新辅助免疫治疗后行手术切除的NSCLC患者的临床病理资料。评估病理淋巴结分期(N... 详细信息

目的探讨新辅助免疫治疗后病理淋巴结转移情况及原发灶缓解程度对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者预后的影响。方法回顾性分析40例接受新辅助免疫治疗后行手术切除的NSCLC患者的临床病理资料。评估病理淋巴结分期(N1/N2)和原发灶缓解程度[完全缓解(pathological complete response,pCR)/主要缓解(major pathological response,MPR)/非客观缓解(non-objective response,non-OR)]与无进展生存期(progression-free survival,PFS)的关系,并构建预后风险分层模型。结果病理淋巴结分期和原发灶缓解程度单独考虑时,与PFS无显著相关性,且两者无显著交互作用。对于N1患者,pCR/MPR的PFS优于non-OR(P=0.038);对于N2患者,原发灶缓解程度与PFS无显著相关性。将患者分为低危组(N1+pCR/MPR)和高危组(N1+non-OR/N2),两组PFS差异显著(P=0.003)。结论新辅助免疫治疗后,病理淋巴结转移程度和原发灶缓解程度是NSCLC预后的关键影响因素。基于两者的预后风险分层模型有助于指导个体化治疗决策,但仍需前瞻性研究验证。

关键词：非小细胞肺癌新辅助免疫治疗病理淋巴结转移原发灶缓解预后

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