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药用植物长春花wrky转录因子的鉴定及表达谱分析

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生物工程学报 2013年第6期29卷 785-802页

作者：杨致荣王兴春薛金爱孟令芝李润植山西农业大学分子农业与生物能源研究所山西太谷030801 山西农业大学文理学院山西太谷030801 山西农业大学生命科学学院山西太谷030801

wrky是调控植物生长发育和逆境胁迫反应等生命活动的一个转录因子大家族。然而,有关药用植物长春花Crwrky转录因子的种类和功能却知之甚少。从26 009个长春花蛋白中鉴定出47个Crwrky转录因子。依据wrky结构域和系统进化,将Crwrky分为G1... 详细信息

wrky是调控植物生长发育和逆境胁迫反应等生命活动的一个转录因子大家族。然而,有关药用植物长春花Crwrky转录因子的种类和功能却知之甚少。从26 009个长春花蛋白中鉴定出47个Crwrky转录因子。依据wrky结构域和系统进化,将Crwrky分为G1、G2和G3三大类群。表达谱数据分析表明,长春花Crwrky基因的表达具有器官特异性。47个Crwrky基因的表达谱可分为3种表达模式:第1类型主要在花、甲基茉莉酸甲酯(MeJA)或酵母提取物(YE)处理的原生质体中高表达;第2类型主要在茎和毛状根中高表达;第3类型在根、茎、叶、幼苗和MeJA处理的毛状根中高表达。进一步用实时定量PCR检测了16个代表性Crwrky基因在不同器官、MeJA处理原生质体和毛状根中的表达模式,检测结果与上述数字基因表达谱数据基本一致。约1/3以上Crwrky基因的表达受MeJA和YE的调控,暗示它们可能参与萜类吲哚生物碱的合成和逆境胁迫反应。为进一步解析长春花wrky转录因子的功能和萜类吲哚生物碱合成调控的网络奠定了基础。

关键词： wrky 萜类吲哚生物碱表达谱生物信息学长春花

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番茄低温响应wrky转录因子的鉴定和分析

植物生理学报 2021年第6期57卷 1349-1362页

作者：王艺璇孟庆伟马娜娜北京林业大学水土保持学院水土保持与荒漠化防治重点实验室北京100083 山东农业大学生命科学学院作物生物学国家重点实验室山东泰安271018

番茄(Solanum lycopersicum)是一种典型的冷敏感蔬菜作物,在生产中极易遭受低温的伤害。wrky转录因子在植物的生物及非生物胁迫响应中发挥着重要作用,但其低温响应机制并不清楚。本文着重分析了番茄wrky家族在低温胁迫下的表达模式和潜... 详细信息

番茄(Solanum lycopersicum)是一种典型的冷敏感蔬菜作物,在生产中极易遭受低温的伤害。wrky转录因子在植物的生物及非生物胁迫响应中发挥着重要作用,但其低温响应机制并不清楚。本文着重分析了番茄wrky家族在低温胁迫下的表达模式和潜在的作用机制。研究发现,番茄wrky家族81个成员中有27个明显受低温诱导。其中Slwrky2、Slwrky50等基因的启动子区域存在CRT/DRE元件(CBFs结合位点),这预示着这些wrky转录因子可能参与了CBFs介导的低温响应途径。此外,我们预测并分析了低温响应wrky转录因子的互作蛋白,并以此整合、搭建了蛋白互作网络,为研究wrky转录因子在低温胁迫下的功能及作用机制提供重要参考。

关键词： wrky 低温胁迫番茄 CBF 互作蛋白

参与连翘苯丙烷合成途径的wrky转录因子的筛选与鉴定

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中草药 2023年第18期54卷 6055-6064页

作者：张佳琪刘晓冉陈佳茜郭广洋谭新杰赵杏利胥华伟刘浩侯典云河南科技大学农学院河南洛阳471023 洛阳市道地药材繁育与创新利用工程技术研究中心河南洛阳471023

目的筛选出参与连翘Forsythia suspensa苯丙烷合成途径的wrky转录因子并进行生物信息学分析。方法通过对从连翘转录组数据中筛选出的62条连翘wrky基因序列进行鉴定;通过采用蛋白理化性质和基序分析、蛋白结构分析、系统进化分析、功能... 详细信息

目的筛选出参与连翘Forsythia suspensa苯丙烷合成途径的wrky转录因子并进行生物信息学分析。方法通过对从连翘转录组数据中筛选出的62条连翘wrky基因序列进行鉴定;通过采用蛋白理化性质和基序分析、蛋白结构分析、系统进化分析、功能注释、蛋白互作分析、外源激素处理后实时荧光定量分析等方式进行相关分析。结果最终筛选出52条具有wrky结构域的连翘wrky转录因子。wrky转录因子编码蛋白的氨基酸数目在105~728,相对分子质量在12277.95~80321.99。蛋白基序分析显示其均有wrky结构域,与拟南芥wrky转录因子构建系统进化树将连翘52个wrky转录因子进一步分为3大类;筛选出5个可能参与连翘苯丙烷合成途径的连翘wrky转录因子,并推测其可能以被MAPK级联反应所调控的方式介导连翘中苯丙烷合成途径。结论通过分析转录组测序结果,从52个连翘wrky转录因子中筛选出5个可能参与连翘苯丙烷合成途径的转录因子,其表现出组织特异性表达,且对不同浓度茉莉酸甲脂表现出不同的响应,为进一步研究其作用机制提供研究方向。

关键词：连翘次生代谢产物 wrky 转录因子苯丙烷合成途径

藜麦wrky基因的进化与多胁迫条件下的转录应答

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草业学报 2022年第9期31卷 168-182页

作者：侯丽媛贾举庆姜晓东王育川赵菁陈禺怀黄胜雄吴慎杰董艳辉山西农业大学生命科学学院山西太原030031 山西农业大学农学院山西晋中030801 华中师范大学数学与统计学院湖北武汉430079 合肥工业大学食品与生物工程学院安徽合肥230009

wrky转录因子参与调控植物生长发育和多种胁迫应答,是一类非常重要的植物转录因子。为解析藜麦wrky基因的进化特征及挖掘响应胁迫的wrky基因,本研究利用系统的生物信息学方法在全基因组水平对wrky基因进行了鉴定,并对其染色体定位、分... 详细信息

wrky转录因子参与调控植物生长发育和多种胁迫应答,是一类非常重要的植物转录因子。为解析藜麦wrky基因的进化特征及挖掘响应胁迫的wrky基因,本研究利用系统的生物信息学方法在全基因组水平对wrky基因进行了鉴定,并对其染色体定位、分组、系统进化、共线性分析以及多胁迫条件下的表达模式进行了分析。藜麦基因组中鉴定得到90个wrky基因;划分为3组:Ⅰ组(18个)、Ⅱ组(46个)和Ⅲ组(12个),其中Ⅱ组成员进一步被划分为5个亚组:Ⅱ-a(9个),Ⅱ-b(4个),Ⅱ-c(13个),Ⅱ-d(10个)和Ⅱ-e(10个)。另外,14个wrky成员因为wrkyGQK短肽的缺失,以及锌指结构变异较大而未划分到任何分组。本研究分组与藜麦wrky基因进化树中家族成员的聚类结果完全一致,进一步支持了成员分组的可靠性。此外,不同分组的wrky成员的蛋白序列呈现出小组特异的氨基酸保守域组成。藜麦和祖先二倍体苍白茎藜、瑞典藜的同源基因组模块分析表明,藜麦wrky基因数目的增加主要来自全基因组倍增。在干旱、高温、盐、低磷胁迫和花生褪绿扇形斑病毒(GCFSV)侵染下,大量wrky基因的表达水平被显著性诱导或抑制,说明这些wrky基因很可能参与了调控藜麦的逆境应答反应。研究结果可为藜麦的抗逆研究提供优良的候选wrky基因,为藜麦的抗逆研究提供参考依据。

关键词：藜麦 wrky 进化胁迫转录应答

wrky转录因子参与植物抗盐性调控的研究进展

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基因组学与应用生物学 2019年第12期38卷 5596-5602页

作者：白雪张颖李玥莹马纯艳沈阳师范大学生命科学学院

盐胁迫是影响植物生长发育重要的环境因子之一,为了适应及抵御盐胁迫危害的逆境,作物自身会通过一系列变化来适应环境而作出相关性应激性改变,如宏观形态学、生理学改变、微观分子生物学变化等。转录调控是细胞内部调控网络中最重要的... 详细信息

盐胁迫是影响植物生长发育重要的环境因子之一,为了适应及抵御盐胁迫危害的逆境,作物自身会通过一系列变化来适应环境而作出相关性应激性改变,如宏观形态学、生理学改变、微观分子生物学变化等。转录调控是细胞内部调控网络中最重要的一个环节,wrky转录因子响应并参与多种植物的生物和非生物胁迫。本综述从盐胁迫下作物形态结构的变化、盐胁迫对作物生理代谢的影响以及wrky转录因子参与作物抗盐调控网络等方面文献,来汇总分析近年来拟南芥、水稻及其他种类植物应对胁迫的响应机制以及wrky转录因子的功能,为提高园艺作物抗盐性生理作用及分子机制提供帮助,同时为作物抗盐栽培提供新思路。

关键词： wrky 转录因子盐胁迫作物研究进展

8个wrky转录因子在水稻叶片生长和抗病过程中的表达分析

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植物病理学报 2014年第1期44卷 54-64页

作者：史佳楠李莉云徐文静关明俐李雪姣牛东东兰金苹窦世娟刘丽娟刘国振河北农业大学生命科学学院保定071001

wrky是植物体内最大的转录因子家族之一,其成员在植物生长发育和抗逆过程中发挥重要作用。为了解水稻wrky的功能,本研究利用蛋白质免疫印迹(w estern blotting,WB)技术,检测了8个wrky转录因子在水稻叶片生长和Xa21介导的抗白叶枯病过程... 详细信息

wrky是植物体内最大的转录因子家族之一,其成员在植物生长发育和抗逆过程中发挥重要作用。为了解水稻wrky的功能,本研究利用蛋白质免疫印迹(w estern blotting,WB)技术,检测了8个wrky转录因子在水稻叶片生长和Xa21介导的抗白叶枯病过程中的表达丰度变化。结果表明:Oswrky12、43、55和86在苗期表达量较低,随叶片的生长表达逐步增加;Oswrky50和84在苗期叶片中的表达量相对较高,成熟期下降;未检测到Oswrky40/64和52在叶片中的表达。在Xa21介导的白叶枯病抗性反应中,Oswrky40/64、50和52受白叶枯病菌诱导表达,Oswrky84受侵染后表达量上调,Oswrky12、43、55和86在抗病过程中没有检测到表达丰度的变化。进一步比较这些转录因子在抗、感和对照(Mock)反应中的表达,发现抗、感反应间蛋白质的表达变化是相似的。研究结果提示:Oswrky12、43、55和86可能在叶片正常生长中发挥作用;Oswrky40/64和52可能在水稻-白叶枯病菌互作过程中发挥作用;Oswrky50和84则在叶片生长和抗白叶枯病过程中都有一定的功能。

关键词： wrky 水稻免疫印迹白叶枯病转录因子

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植物wrky转录因子及其生物学功能

分子植物育种 2019年第21期17卷 7040-7046页

作者：赵楠楠刘立峰河北农业大学农学院

wrky转录因子家族是近年来研究比较广泛的转录因子家族之一。在植物的进化历程中,wrky转录因子因其结构域N-末端具有高度保守的wrkyGQK氨基酸序列而得名,且能与目标基因启动子中的W-box发生特异性结合并调控目的基因的表达,进而参与到... 详细信息

wrky转录因子家族是近年来研究比较广泛的转录因子家族之一。在植物的进化历程中,wrky转录因子因其结构域N-末端具有高度保守的wrkyGQK氨基酸序列而得名,且能与目标基因启动子中的W-box发生特异性结合并调控目的基因的表达,进而参与到植物的生命活动进程中。它们不仅参与调控植物对胁迫的应激反应,还参与了激素途径和整个发育过程。本综述回顾了有关植物wrky转录因子在生物和非生物胁迫、形态建成、生长发育和次生代谢等方面的生物学功能,并对该领域在未来的研究做出了展望。

关键词：转录因子 wrky 生物学功能

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茄科植物wrky转录因子的研究进展

园艺学报 2017年第1期44卷 170-178页

作者：李笑成玉富杨旭扬州大学园艺与植物保护学院江苏扬州225009

wrky蛋白是植物中最大的具有重要作用的转录因子家族之一,通过特异性结合启动子区域的W-Box来调控基因的表达,其成员参与了茄科(Solanaceae)植物的生长、发育、代谢、生物和非生物胁迫响应和激素信号的转导等进程。综述茄科植物wrky转... 详细信息

wrky蛋白是植物中最大的具有重要作用的转录因子家族之一,通过特异性结合启动子区域的W-Box来调控基因的表达,其成员参与了茄科(Solanaceae)植物的生长、发育、代谢、生物和非生物胁迫响应和激素信号的转导等进程。综述茄科植物wrky转录因子表达模式和在生物和非生物胁迫中调控作用的研究进展。

关键词：茄科植物 wrky 转录因子

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wrky同源基因的分离与表达分析

西北植物学报 2017年第8期37卷 1493-1499页

作者：蔡韡韡刘涛杨华丽许颖妍徐意瑾潘东明陈桂信福建农林大学园艺学院福州350002 福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所福州350002

以(Prunus salicina *** *** et al.)为试验材料,采用稀释池PCR法,筛选叶片全长均一化cDNA文库,获得了wrky同源基因的12个全长cDNA分别命名为Pswrky7、Pswrky14、Pswrky20、Pswrky21、Pswrky22、Pswrky29、Pswrky31、Pswrky32、Pswrky33、Pswrky40、Pswrky46和Pswrky75,长度分别为1 517、1 798、2 098、1 177、1 242、1 396、2 135、1 760、2 113、1 047、1 258和700bp,ORF长度分别为1 095、1 572、1 764、1 068、1 071、1 002、1 944、1 602、1 770、963、1 077和672bp,分别编码364、523、587、355、357、333、647、533、589、320、358、223个氨基酸。荧光定量结果显示,12个wrky同源基因在1.0mmol/L水杨酸处理后,所获得的Pswrky表达量均显著上调,表明wrky基因可能是水杨酸诱导防御反应的重要调控因子。

关键词：  wrky 基因荧光定量 PCR